Heatmap: Cluster_258 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000013.1_cds_GFH05910.1_387 (GFH05910)	0.26	0.19	0.2	0.12	0.15	0.1	0.14	0.13	0.23	1.0	0.11	0.09	0.15	0.11	0.22	0.27	0.21	0.28	0.15	0.2	0.31	0.27	0.29	0.21	0.24	0.21
lcl\|BLLF01000035.1_cds_GFH06370.1_847 (GFH06370)	0.26	0.0	0.0	0.04	0.21	0.31	0.19	0.15	0.24	0.88	0.24	0.32	0.18	0.23	0.25	1.0	0.56	0.49	0.0	0.58	0.13	0.62	0.58	0.49	0.43	0.41
lcl\|BLLF01000039.1_cds_GFH06453.1_930 (GFH06453)	0.03	0.15	0.0	0.0	0.21	0.39	0.21	0.08	0.17	1.0	0.48	0.29	0.32	0.25	0.16	0.12	0.0	0.55	0.0	0.31	0.51	0.73	0.37	0.44	0.57	0.39
lcl\|BLLF01000049.1_cds_GFH06653.1_1130 (GFH06653)	0.27	0.03	0.0	0.03	0.16	0.15	0.1	0.18	0.22	0.59	0.37	0.16	0.15	0.19	0.08	0.0	0.05	1.0	0.14	0.52	0.85	0.24	0.86	0.23	0.23	0.38
lcl\|BLLF01000145.1_cds_GFH08200.1_2677 (GFH08200)	0.0	0.24	0.0	0.04	0.2	0.14	0.17	0.15	0.23	1.0	0.11	0.12	0.18	0.14	0.16	0.11	0.06	0.36	0.08	0.19	0.26	0.35	0.44	0.28	0.67	0.37
lcl\|BLLF01000155.1_cds_GFH08341.1_2818 (GFH08341)	0.45	0.4	0.0	0.22	0.4	0.23	0.6	0.28	0.53	0.91	0.34	0.25	0.38	0.18	0.32	0.17	0.32	0.47	0.0	0.45	0.64	0.21	0.53	0.62	1.0	0.87
lcl\|BLLF01000161.1_cds_GFH08436.1_2913 (GFH08436)	0.99	0.0	0.0	0.15	0.41	0.45	0.55	0.19	0.47	1.0	0.39	0.31	0.45	0.2	0.51	0.9	0.68	0.35	0.0	0.11	0.0	0.22	0.43	0.11	0.32	0.39
lcl\|BLLF01000170.1_cds_GFH08588.1_3065 (GFH08588)	0.28	0.0	0.0	0.0	0.33	0.22	0.27	0.21	0.25	1.0	0.5	0.28	0.29	0.21	0.12	0.33	0.24	0.76	0.13	0.07	0.7	0.54	0.17	0.45	0.7	0.52
lcl\|BLLF01000174.1_cds_GFH08641.1_3118 (GFH08641)	0.29	0.07	0.02	0.72	0.63	0.64	0.37	0.49	0.55	0.96	0.6	0.39	0.33	0.47	0.26	0.34	0.41	0.92	0.1	0.11	1.0	0.26	0.92	0.83	0.67	0.61
lcl\|BLLF01000199.1_cds_GFH08982.1_3459 (GFH08982)	0.15	0.06	0.0	0.08	0.21	0.2	0.14	0.14	0.22	1.0	0.17	0.21	0.13	0.19	0.23	0.32	0.19	0.5	0.35	0.21	0.76	0.0	0.43	0.32	0.24	0.34
lcl\|BLLF01000235.1_cds_GFH09444.1_3921 (GFH09444)	1.0	0.15	0.0	0.14	0.38	0.32	0.42	0.3	0.4	0.49	0.35	0.35	0.32	0.42	0.55	0.68	0.81	0.45	0.06	0.13	0.35	0.85	0.27	0.37	0.51	0.84
lcl\|BLLF01000246.1_cds_GFH09584.1_4061 (GFH09584)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.1	0.15	0.15	0.01	0.09	1.0	0.09	0.06	0.05	0.06	0.16	0.0	0.0	0.1	0.15	0.0	0.0	0.16	0.2	0.24	0.51	0.21
lcl\|BLLF01000258.1_cds_GFH09735.1_4212 (GFH09735)	0.05	0.03	0.0	0.13	0.47	0.46	0.41	0.18	0.55	0.79	0.35	0.33	0.53	0.34	0.39	0.23	0.26	0.63	0.13	0.25	0.65	0.6	1.0	0.6	0.59	0.6
lcl\|BLLF01000385.1_cds_GFH11231.1_5708 (GFH11231)	0.24	0.17	0.08	0.05	0.08	0.1	0.12	0.08	0.2	1.0	0.08	0.08	0.11	0.06	0.17	0.28	0.18	0.41	0.35	0.37	0.38	0.14	0.33	0.25	0.14	0.12
lcl\|BLLF01000410.1_cds_GFH11511.1_5988 (GFH11511)	0.0	0.07	0.0	0.26	0.52	0.25	0.41	0.33	0.26	0.72	0.41	0.38	0.34	0.37	0.23	0.22	1.0	0.96	0.0	0.0	0.24	0.0	0.44	0.83	0.67	0.47
lcl\|BLLF01000417.1_cds_GFH11591.1_6068 (GFH11591)	0.0	0.0	0.0	0.32	0.07	0.18	0.0	0.41	0.19	1.0	0.12	0.13	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.46	0.0
lcl\|BLLF01000423.1_cds_GFH11655.1_6132 (GFH11655)	0.87	0.15	0.09	0.18	0.57	0.58	0.69	0.38	0.6	0.81	0.52	0.53	0.45	0.51	0.56	0.5	0.52	0.56	0.48	0.45	0.69	0.77	0.67	1.0	0.69	0.77
lcl\|BLLF01000473.1_cds_GFH12150.1_6627 (GFH12150)	0.22	0.42	0.12	0.06	0.5	0.43	0.38	0.46	0.46	0.92	0.53	0.43	0.52	0.44	0.32	0.07	0.1	0.91	0.43	0.46	1.0	0.54	0.92	0.51	0.64	0.7
lcl\|BLLF01000490.1_cds_GFH12316.1_6793 (GFH12316)	0.62	0.1	0.0	0.37	0.26	0.17	0.24	0.16	0.27	1.0	0.22	0.14	0.22	0.19	0.42	0.53	0.61	0.26	0.12	0.13	0.14	0.16	0.41	0.06	0.13	0.08
lcl\|BLLF01000614.1_cds_GFH13451.1_7928 (GFH13451)	0.79	0.0	0.0	0.05	0.24	0.19	0.39	0.3	0.36	1.0	0.24	0.21	0.39	0.25	0.36	0.19	0.41	0.44	0.07	0.15	0.47	0.34	0.55	0.63	0.33	0.37
lcl\|BLLF01000614.1_cds_GFH13456.1_7933 (GFH13456)	1.0	0.5	0.06	0.29	0.41	0.33	0.46	0.33	0.42	0.58	0.4	0.32	0.41	0.36	0.39	0.6	0.5	0.76	0.14	0.35	0.64	0.5	0.73	0.72	0.57	0.55
lcl\|BLLF01000637.1_cds_GFH13660.1_8137 (GFH13660)	0.08	0.11	0.16	0.04	0.29	0.27	0.26	0.37	0.21	1.0	0.28	0.25	0.25	0.33	0.23	0.45	0.42	0.44	0.22	0.47	0.58	0.1	0.55	0.5	0.77	0.72
lcl\|BLLF01000643.1_cds_GFH13711.1_8188 (GFH13711)	0.52	0.01	0.36	0.23	0.39	0.24	0.27	0.22	0.32	1.0	0.48	0.17	0.21	0.19	0.24	0.22	0.2	0.59	0.47	0.4	0.28	0.23	0.31	0.18	0.31	0.23
lcl\|BLLF01000643.1_cds_GFH13714.1_8191 (GFH13714)	0.15	0.14	0.02	0.01	0.43	0.39	0.44	0.43	0.51	1.0	0.39	0.32	0.4	0.29	0.43	0.39	0.37	0.58	0.19	0.36	0.48	0.36	0.59	0.65	0.91	0.76
lcl\|BLLF01000672.1_cds_GFH13967.1_8444 (GFH13967)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.28	0.57	0.16	0.36	0.9	0.09	0.14	0.24	0.19	0.36	0.0	0.32	0.0	0.0	0.28	0.46	0.0	0.0	0.86	0.23	0.08
lcl\|BLLF01000674.1_cds_GFH13994.1_8471 (GFH13994)	0.15	0.0	0.06	0.0	0.22	0.13	0.07	0.08	0.08	1.0	0.1	0.02	0.1	0.1	0.08	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.43	0.0	0.16	0.04	0.29	0.29
lcl\|BLLF01000691.1_cds_GFH14139.1_8616 (GFH14139)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.25	0.0
lcl\|BLLF01000791.1_cds_GFH14990.1_9467 (GFH14990)	0.0	0.05	0.0	0.0	0.16	0.14	0.03	0.0	0.04	0.88	0.16	0.03	0.06	0.03	0.08	1.0	0.37	0.71	0.0	0.62	0.0	0.0	0.39	0.37	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000793.1_cds_GFH14998.1_9475 (GFH14998)	0.07	0.04	0.0	0.22	0.23	0.16	0.13	0.19	0.19	1.0	0.14	0.1	0.09	0.14	0.15	0.19	0.36	0.27	0.23	0.32	0.58	0.0	0.53	0.31	0.31	0.21
lcl\|BLLF01000797.1_cds_GFH15034.1_9511 (GFH15034)	0.2	0.08	0.0	0.0	0.06	0.1	0.4	0.05	0.44	0.72	0.07	0.05	0.36	0.08	0.31	0.67	1.0	0.2	0.3	0.5	0.27	0.31	0.22	0.4	0.45	0.54
lcl\|BLLF01000882.1_cds_GFH15671.1_10148 (GFH15671)	0.59	0.02	0.0	0.4	0.25	0.24	0.31	0.11	0.35	1.0	0.27	0.17	0.15	0.17	0.29	0.38	0.6	0.39	0.13	0.25	0.25	0.24	0.38	0.22	0.23	0.41
lcl\|BLLF01001082.1_cds_GFH17000.1_11477 (GFH17000)	0.29	0.09	0.04	0.05	0.3	0.32	0.32	0.23	0.36	1.0	0.33	0.25	0.29	0.29	0.32	0.32	0.2	0.34	0.17	0.19	0.38	0.22	0.41	0.46	0.52	0.39
lcl\|BLLF01001141.1_cds_GFH17397.1_11874 (GFH17397)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.12	0.0	0.05	0.05	1.0	0.1	0.0	0.11	0.2	0.1	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.51	0.58	0.0	0.19	0.25	0.0
lcl\|BLLF01001243.1_cds_GFH18064.1_12541 (GFH18064)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.03	0.07	0.06	0.13	0.88	0.18	0.07	0.0	0.03	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	1.0	0.0	0.48	0.27	0.5	0.73
lcl\|BLLF01001280.1_cds_GFH18299.1_12776 (GFH18299)	0.62	0.15	0.14	0.13	0.37	0.41	0.57	0.21	0.62	1.0	0.55	0.52	0.51	0.41	0.52	0.79	0.77	0.3	0.1	0.45	0.35	0.52	0.27	0.5	0.54	0.71
lcl\|BLLF01001321.1_cds_GFH18570.1_13047 (GFH18570)	1.0	0.07	0.0	0.2	0.08	0.19	0.14	0.22	0.16	0.28	0.17	0.18	0.17	0.15	0.21	0.33	0.56	0.43	0.16	0.04	0.67	0.0	0.75	0.78	0.26	0.29
lcl\|BLLF01001480.1_cds_GFH19536.1_14013 (GFH19536)	0.04	0.0	0.0	0.09	0.39	0.44	0.29	0.3	0.4	1.0	0.38	0.31	0.33	0.2	0.25	0.19	0.07	0.66	0.11	0.25	0.51	0.35	0.58	0.55	0.51	0.65
lcl\|BLLF01001487.1_cds_GFH19588.1_14065 (GFH19588)	0.14	0.0	0.0	0.12	0.08	0.08	0.12	0.08	0.09	1.0	0.08	0.04	0.1	0.06	0.06	0.43	0.12	0.11	0.06	0.05	0.44	0.07	0.42	0.36	0.24	0.25
lcl\|BLLF01001500.1_cds_GFH19673.1_14150 (GFH19673)	0.81	0.01	0.0	0.26	0.37	0.37	0.43	0.34	0.42	1.0	0.53	0.37	0.58	0.59	0.39	0.53	0.45	0.78	0.31	0.23	0.7	0.43	0.8	0.57	0.27	0.45
lcl\|BLLF01001588.1_cds_GFH20173.1_14650 (GFH20173)	0.33	0.11	0.0	0.49	0.27	0.3	0.18	0.16	0.31	0.66	0.2	0.15	0.2	0.22	0.22	0.29	0.16	0.67	0.33	0.43	1.0	0.0	0.44	0.3	0.49	0.53
lcl\|BLLF01001677.1_cds_GFH20671.1_15148 (GFH20671)	0.11	0.01	0.0	0.07	0.12	0.13	0.12	0.16	0.28	1.0	0.09	0.04	0.16	0.13	0.2	0.13	0.03	0.3	0.0	0.06	0.37	0.11	0.33	0.14	0.4	0.36
lcl\|BLLF01002012.1_cds_GFH22312.1_16789 (GFH22312)	0.16	0.04	0.06	0.27	0.19	0.12	0.12	0.1	0.16	1.0	0.13	0.12	0.14	0.08	0.11	0.47	0.3	0.32	0.12	0.18	0.38	0.07	0.36	0.3	0.32	0.16
lcl\|BLLF01002069.1_cds_GFH22570.1_17047 (GFH22570)	0.46	0.0	0.0	0.0	0.27	0.11	0.13	0.04	0.11	1.0	0.14	0.04	0.07	0.11	0.04	0.4	0.15	0.63	0.0	0.13	0.0	0.0	0.31	0.11	0.25	0.18
lcl\|BLLF01002530.1_cds_GFH24415.1_18892 (GFH24415)	0.45	0.18	0.19	0.21	0.3	0.39	0.56	0.28	0.56	1.0	0.39	0.3	0.3	0.35	0.49	0.84	0.52	0.5	0.43	0.47	0.59	0.59	0.6	0.46	0.68	0.76
lcl\|BLLF01002632.1_cds_GFH24789.1_19266 (GFH24789)	0.17	0.15	0.0	0.0	0.35	0.17	0.22	0.13	0.25	1.0	0.37	0.11	0.21	0.29	0.12	0.0	0.39	0.48	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.32	0.76	0.49
lcl\|BLLF01002822.1_cds_GFH25466.1_19943 (GFH25466)	0.45	0.01	0.0	0.54	0.69	0.53	0.41	0.4	0.42	0.96	0.51	0.64	0.26	0.5	0.3	0.3	0.66	0.8	0.25	0.25	0.69	1.0	0.56	0.62	0.82	0.77
lcl\|BLLF01002876.1_cds_GFH25650.1_20127 (GFH25650)	0.53	0.0	0.0	0.25	0.31	0.24	0.31	0.18	0.33	1.0	0.27	0.19	0.27	0.22	0.3	0.25	0.19	0.61	0.07	0.19	0.24	0.08	0.37	0.35	0.4	0.32
lcl\|BLLF01002876.1_cds_GFH25651.1_20128 (GFH25651)	0.37	0.0	0.0	0.24	0.59	0.53	0.8	0.36	0.7	1.0	0.47	0.45	0.5	0.39	0.65	0.38	0.54	0.88	0.04	0.19	0.58	0.12	0.78	0.98	0.69	0.56
lcl\|BLLF01002922.1_cds_GFH25796.1_20273 (GFH25796)	0.53	0.0	0.0	0.45	0.55	0.3	0.36	0.2	0.29	1.0	0.43	0.23	0.28	0.28	0.18	0.32	0.66	0.77	0.22	0.3	0.53	0.51	0.78	0.77	0.55	0.72
lcl\|BLLF01003111.1_cds_GFH26381.1_20858 (GFH26381)	0.57	0.28	0.43	0.34	0.55	0.46	0.41	0.3	0.47	1.0	0.49	0.37	0.34	0.33	0.36	0.51	0.49	0.54	0.44	0.45	0.57	0.31	0.48	0.34	0.52	0.58
lcl\|BLLF01003182.1_cds_GFH26623.1_21100 (GFH26623)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.28	0.35	0.3	0.18	0.63	0.95	0.24	0.26	0.51	0.16	0.47	0.27	0.1	0.63	0.16	0.53	0.87	0.5	0.36	1.0	0.45	0.32
lcl\|BLLF01003241.1_cds_GFH26788.1_21265 (GFH26788)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.31	0.23	0.11	0.22	0.19	1.0	0.29	0.25	0.3	0.23	0.16	0.1	0.23	0.36	0.0	0.14	0.6	0.51	0.6	0.32	0.72	0.37
lcl\|BLLF01003426.1_cds_GFH27298.1_21775 (GFH27298)	0.22	0.15	0.1	0.05	0.12	0.14	0.16	0.22	0.18	1.0	0.14	0.2	0.18	0.17	0.22	0.27	0.27	0.15	0.1	0.31	0.22	0.09	0.24	0.19	0.29	0.17
lcl\|BLLF01003578.1_cds_GFH27691.1_22168 (GFH27691)	0.31	0.05	0.0	0.19	0.2	0.31	0.26	0.14	0.34	1.0	0.2	0.21	0.27	0.17	0.29	0.16	0.27	0.31	0.18	0.14	0.28	0.06	0.28	0.26	0.45	0.43
lcl\|BLLF01004082.1_cds_GFH28881.1_23358 (GFH28881)	0.11	0.07	0.0	0.0	0.22	0.23	0.2	0.24	0.15	1.0	0.17	0.24	0.19	0.18	0.19	0.49	0.43	0.5	0.12	0.23	0.51	0.12	0.36	0.34	0.51	0.42
lcl\|BLLF01004289.1_cds_GFH29321.1_23798 (GFH29321)	0.21	0.03	0.0	0.25	0.18	0.11	0.18	0.09	0.29	1.0	0.18	0.13	0.16	0.12	0.14	0.22	0.21	0.53	0.3	0.27	0.2	0.17	0.4	0.34	0.27	0.28
lcl\|BLLF01004331.1_cds_GFH29408.1_23885 (GFH29408)	0.89	0.01	0.0	0.05	0.52	0.63	0.57	0.55	0.48	0.89	0.84	0.55	0.48	0.56	0.35	0.45	0.63	1.0	0.45	0.71	0.68	0.37	1.0	0.77	0.57	0.67
lcl\|BLLF01004439.1_cds_GFH29617.1_24094 (GFH29617)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.21	0.14	0.16	0.24	0.23	1.0	0.17	0.14	0.16	0.18	0.16	0.18	0.07	0.18	0.0	0.15	0.1	0.06	0.39	0.37	0.17	0.12
lcl\|BLLF01004686.1_cds_GFH30061.1_24538 (GFH30061)	0.21	0.17	0.0	0.05	0.14	0.08	0.09	0.05	0.09	1.0	0.18	0.08	0.1	0.08	0.15	0.77	0.1	0.9	0.15	0.17	0.14	0.32	0.5	0.48	0.23	0.07
lcl\|BLLF01004707.1_cds_GFH30107.1_24584 (GFH30107)	0.42	0.19	0.3	0.16	0.31	0.27	0.28	0.26	0.36	1.0	0.28	0.18	0.26	0.22	0.28	0.32	0.23	0.56	0.23	0.35	0.5	0.31	0.46	0.32	0.44	0.5
lcl\|BLLF01005173.1_cds_GFH30832.1_25309 (GFH30832)	0.58	0.38	0.34	0.23	0.82	0.84	0.54	0.69	0.54	0.73	0.68	0.57	0.51	0.67	0.44	0.45	0.83	0.81	0.23	0.71	0.89	0.63	0.74	0.68	1.0	0.92
lcl\|BLLF01005512.1_cds_GFH31295.1_25772 (GFH31295)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.06	0.18	0.16	1.0	0.03	0.05	0.13	0.06	0.13	0.45	0.2	0.21	0.0	0.18	0.29	0.0	0.38	0.14	0.19	0.26
lcl\|BLLF01005818.1_cds_GFH31673.1_26150 (GFH31673)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.07	0.06	0.06	1.0	0.05	0.01	0.11	0.07	0.1	0.48	0.09	0.66	0.14	0.16	0.13	0.3	0.42	0.36	0.32	0.2
lcl\|BLLF01006806.1_cds_GFH32564.1_27041 (GFH32564)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.26	0.19	0.13	0.3	0.14	1.0	0.25	0.13	0.15	0.21	0.15	0.01	0.01	0.47	0.16	0.45	0.46	0.15	0.38	0.26	0.41	0.49
lcl\|BLLF01007280.1_cds_GFH32877.1_27354 (GFH32877)	0.31	0.04	0.04	0.23	0.21	0.26	0.32	0.14	0.35	1.0	0.31	0.2	0.26	0.19	0.33	0.24	0.42	0.33	0.12	0.14	0.36	0.3	0.52	0.4	0.4	0.24
lcl\|BLLF01007782.1_cds_GFH33108.1_27585 (GFH33108)	0.58	0.03	0.0	0.26	0.28	0.22	0.34	0.12	0.45	1.0	0.38	0.29	0.31	0.27	0.35	0.79	0.65	0.52	0.1	0.36	0.27	0.26	0.42	0.38	0.37	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)