Heatmap: Cluster_108 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000069.1_cds_GFH07013.1_1490 (GFH07013)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.16	0.31	0.16	0.0	0.17	0.16	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.82	0.0
lcl\|BLLF01000086.1_cds_GFH07296.1_1773 (GFH07296)	0.0	0.19	0.06	0.37	0.47	0.26	0.2	0.3	0.39	0.18	0.36	0.17	0.24	0.29	0.19	0.24	0.61	0.41	0.08	0.61	0.41	0.45	0.26	1.0	0.65	0.62
lcl\|BLLF01000144.1_cds_GFH08181.1_2658 (GFH08181)	0.31	0.0	0.0	0.43	0.39	0.22	0.41	0.1	0.45	0.23	0.39	0.07	0.35	0.31	0.17	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.35	0.0	0.25	1.0	0.35	0.6
lcl\|BLLF01000150.1_cds_GFH08267.1_2744 (GFH08267)	0.04	0.1	0.0	0.48	0.31	0.14	0.15	0.29	0.14	0.19	0.11	0.11	0.21	0.12	0.33	0.0	0.0	0.06	0.0	0.01	0.28	0.05	0.34	1.0	0.75	0.62
lcl\|BLLF01000173.1_cds_GFH08635.1_3112 (GFH08635)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000262.1_cds_GFH09774.1_4251 (GFH09774)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.43	0.0
lcl\|BLLF01000266.1_cds_GFH09817.1_4294 (GFH09817)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000301.1_cds_GFH10263.1_4740 (GFH10263)	0.04	0.12	0.0	0.04	0.21	0.17	0.18	0.21	0.24	0.14	0.21	0.19	0.18	0.19	0.22	0.5	0.56	0.08	0.16	0.08	0.04	0.09	0.13	0.86	1.0	0.64
lcl\|BLLF01000351.1_cds_GFH10836.1_5313 (GFH10836)	0.08	0.03	0.0	0.21	0.2	0.37	0.23	0.35	0.42	0.11	0.42	0.16	0.28	0.5	0.19	0.32	0.48	0.13	0.19	0.32	0.17	0.0	0.25	1.0	0.38	0.65
lcl\|BLLF01000362.1_cds_GFH10961.1_5438 (GFH10961)	0.0	0.08	0.0	0.62	0.37	0.31	0.13	0.31	0.32	0.25	0.33	0.32	0.31	0.38	0.59	0.23	0.09	0.55	0.0	0.16	0.38	0.15	0.09	1.0	0.82	0.49
lcl\|BLLF01000380.1_cds_GFH11171.1_5648 (GFH11171)	0.01	0.48	0.37	1.0	0.36	0.27	0.18	0.39	0.24	0.08	0.29	0.26	0.22	0.29	0.19	0.07	0.11	0.2	0.14	0.32	0.19	0.27	0.18	0.63	0.32	0.26
lcl\|BLLF01000395.1_cds_GFH11346.1_5823 (GFH11346)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000427.1_cds_GFH11693.1_6170 (GFH11693)	0.0	0.0	0.0	0.17	0.17	0.0	0.13	0.1	0.0	0.0	0.32	0.06	0.36	0.17	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.09	0.19
lcl\|BLLF01000479.1_cds_GFH12224.1_6701 (GFH12224)	0.0	0.0	0.0	0.35	0.39	0.5	0.59	0.29	0.28	0.0	0.46	0.44	0.3	0.27	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34	0.34
lcl\|BLLF01000574.1_cds_GFH13093.1_7570 (GFH13093)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000722.1_cds_GFH14405.1_8882 (GFH14405)	0.43	0.55	0.41	1.0	0.43	0.36	0.29	0.27	0.22	0.13	0.38	0.34	0.29	0.32	0.23	0.54	0.53	0.56	0.28	0.29	0.48	0.51	0.51	0.72	0.37	0.34
lcl\|BLLF01000722.1_cds_GFH14406.1_8883 (GFH14406)	0.0	0.0	0.0	0.67	0.39	0.51	0.45	0.49	0.58	0.0	0.43	0.47	0.31	0.59	0.52	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34	0.42
lcl\|BLLF01000752.1_cds_GFH14665.1_9142 (GFH14665)	0.0	0.0	0.0	0.41	0.27	0.05	0.33	0.15	0.1	0.0	0.23	0.16	0.36	0.15	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.62	0.72
lcl\|BLLF01000846.1_cds_GFH15400.1_9877 (GFH15400)	0.0	0.0	0.0	0.35	0.04	0.39	0.24	0.17	0.57	0.0	0.0	0.25	0.21	0.08	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.52	0.49
lcl\|BLLF01000851.1_cds_GFH15439.1_9916 (GFH15439)	0.08	0.0	0.0	0.3	0.1	0.54	0.73	0.15	0.36	0.65	0.49	0.1	0.32	0.31	0.32	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.28	0.67
lcl\|BLLF01000864.1_cds_GFH15533.1_10010 (GFH15533)	0.08	1.0	0.0	0.7	0.07	0.17	0.1	0.22	0.29	0.0	0.13	0.1	0.11	0.03	0.19	0.31	0.0	0.24	0.0	0.2	0.33	0.0	0.24	0.84	0.16	0.11
lcl\|BLLF01001202.1_cds_GFH17798.1_12275 (GFH17798)	0.0	0.0	0.0	0.45	0.33	0.29	0.39	0.31	0.37	0.05	0.37	0.37	0.44	0.48	0.36	0.07	0.16	0.09	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	1.0	0.72	0.56
lcl\|BLLF01001204.1_cds_GFH17807.1_12284 (GFH17807)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.01	0.01	0.17	0.02	0.0	0.05	0.0	0.07	0.15	0.1	0.0	0.04	0.18	0.27	0.08	0.25	0.0	0.0	0.31	0.02	0.0
lcl\|BLLF01001225.1_cds_GFH17933.1_12410 (GFH17933)	0.0	0.0	0.0	0.83	0.21	0.07	0.42	0.13	0.13	0.0	0.07	0.0	0.07	0.06	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.46	0.23
lcl\|BLLF01001226.1_cds_GFH17948.1_12425 (GFH17948)	0.0	0.0	0.0	0.11	0.36	0.32	0.37	0.21	0.37	0.25	0.17	0.28	0.37	0.2	0.36	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.72	0.95
lcl\|BLLF01001366.1_cds_GFH18841.1_13318 (GFH18841)	0.0	0.02	0.0	0.16	0.2	0.17	0.3	0.66	0.42	0.05	0.3	0.18	0.34	0.55	0.57	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34	0.43
lcl\|BLLF01001446.1_cds_GFH19347.1_13824 (GFH19347)	0.3	0.31	0.0	0.3	0.37	0.37	0.38	0.68	0.5	0.11	0.3	0.55	0.45	0.38	0.45	0.09	0.08	0.12	0.14	0.07	0.17	0.26	0.3	1.0	0.45	0.36
lcl\|BLLF01001816.1_cds_GFH21374.1_15851 (GFH21374)	0.02	0.0	0.0	0.69	0.39	0.5	0.25	0.46	0.33	0.07	0.32	0.31	0.31	0.31	0.22	0.29	0.33	0.17	0.3	0.08	0.17	0.04	0.3	1.0	0.25	0.88
lcl\|BLLF01001844.1_cds_GFH21514.1_15991 (GFH21514)	0.0	0.0	0.0	0.12	0.34	0.3	0.26	0.36	0.37	0.0	0.22	0.23	0.22	0.2	0.37	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.22	0.21
lcl\|BLLF01001910.1_cds_GFH21813.1_16290 (GFH21813)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002276.1_cds_GFH23455.1_17932 (GFH23455)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.08	0.08	0.38	0.24	0.0	0.5	0.08	0.19	0.56	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.41	0.42
lcl\|BLLF01002337.1_cds_GFH23698.1_18175 (GFH23698)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.16	0.18	0.13	0.17	0.0	0.06	0.11	0.16	0.09	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	1.0	0.57
lcl\|BLLF01002590.1_cds_GFH24634.1_19111 (GFH24634)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.08	0.16	0.0	0.0	0.08	0.08	0.0	0.4	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.14	0.28
lcl\|BLLF01002622.1_cds_GFH24748.1_19225 (GFH24748)	0.4	0.0	0.0	1.0	0.25	0.0	0.08	0.16	0.24	0.54	0.17	0.0	0.26	0.08	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.41	0.42
lcl\|BLLF01002735.1_cds_GFH25154.1_19631 (GFH25154)	0.0	0.13	0.0	1.0	0.37	0.18	0.19	0.39	0.06	0.52	0.19	0.23	0.07	0.16	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.36	0.4	0.31
lcl\|BLLF01002882.1_cds_GFH25667.1_20144 (GFH25667)	0.04	0.0	0.0	0.23	0.27	0.26	0.23	0.15	0.47	0.1	0.14	0.12	0.09	0.06	0.22	0.0	0.05	0.11	0.08	0.18	0.15	0.26	0.11	1.0	0.12	0.15
lcl\|BLLF01003190.1_cds_GFH26645.1_21122 (GFH26645)	0.0	0.0	0.0	0.17	0.24	0.13	0.38	0.29	0.36	0.0	0.21	0.17	0.27	0.3	0.14	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.15	0.22
lcl\|BLLF01003238.1_cds_GFH26780.1_21257 (GFH26780)	0.04	0.03	0.11	1.0	0.15	0.18	0.29	0.08	0.25	0.05	0.08	0.12	0.14	0.12	0.2	0.2	0.32	0.25	0.08	0.05	0.29	0.01	0.14	0.64	0.31	0.24
lcl\|BLLF01003254.1_cds_GFH26830.1_21307 (GFH26830)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003286.1_cds_GFH26915.1_21392 (GFH26915)	0.0	0.0	0.0	0.5	0.38	0.17	0.21	0.15	0.12	0.0	0.47	0.12	0.04	0.17	0.08	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	1.0	0.34	0.35
lcl\|BLLF01003456.1_cds_GFH27386.1_21863 (GFH27386)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.56
lcl\|BLLF01003795.1_cds_GFH28242.1_22719 (GFH28242)	0.14	0.14	0.02	0.19	0.45	0.39	0.49	0.28	0.48	0.11	0.39	0.33	0.31	0.33	0.43	0.2	0.25	0.3	0.1	0.08	0.3	0.29	0.32	1.0	0.19	0.17
lcl\|BLLF01003901.1_cds_GFH28491.1_22968 (GFH28491)	0.0	0.0	0.0	0.39	0.24	0.44	0.54	0.22	0.63	0.0	0.24	0.22	0.24	0.37	0.31	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.4	0.54
lcl\|BLLF01003981.1_cds_GFH28658.1_23135 (GFH28658)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004542.1_cds_GFH29814.1_24291 (GFH29814)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004661.1_cds_GFH30028.1_24505 (GFH30028)	0.0	0.0	0.0	0.49	0.21	0.29	0.41	0.61	0.37	0.0	0.28	0.31	0.32	0.3	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.05
lcl\|BLLF01004826.1_cds_GFH30312.1_24789 (GFH30312)	0.03	0.07	0.15	0.51	0.45	0.38	0.42	0.58	0.56	0.16	0.45	0.42	0.4	0.4	0.59	0.09	0.21	0.28	0.21	0.25	0.25	0.11	0.19	1.0	0.65	0.49
lcl\|BLLF01005091.1_cds_GFH30721.1_25198 (GFH30721)	0.0	0.0	0.0	0.28	0.14	0.0	0.14	0.59	0.22	0.0	0.2	0.09	0.41	0.45	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.15	0.0
lcl\|BLLF01005290.1_cds_GFH31012.1_25489 (GFH31012)	0.09	0.0	0.0	0.39	0.32	0.25	0.26	0.44	0.5	0.38	0.33	0.28	0.39	0.37	0.48	0.16	0.54	0.44	0.19	0.15	0.55	0.12	0.32	1.0	0.28	0.32
lcl\|BLLF01005673.1_cds_GFH31491.1_25968 (GFH31491)	0.0	0.12	0.0	0.0	0.34	0.36	0.42	0.09	0.33	0.45	0.24	0.31	0.24	0.31	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.1	0.06	1.0	0.4	0.72
lcl\|BLLF01006029.1_cds_GFH31882.1_26359 (GFH31882)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.4	0.14	0.1	0.0	0.06	0.05	0.22	0.25	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006039.1_cds_GFH31892.1_26369 (GFH31892)	0.13	0.0	0.0	0.06	0.17	0.28	0.4	0.19	0.19	0.2	0.24	0.21	0.22	0.15	0.22	0.19	0.29	0.0	0.23	0.0	0.21	0.24	0.3	1.0	0.1	0.09
lcl\|BLLF01006364.1_cds_GFH32185.1_26662 (GFH32185)	0.04	0.0	0.0	1.0	0.03	0.03	0.05	0.02	0.06	0.12	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.18	0.17	0.13	0.1	0.01	0.11	0.03	0.11	0.44	0.03	0.04
lcl\|BLLF01006424.1_cds_GFH32240.1_26717 (GFH32240)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.37	0.1	0.18	0.29	0.3	0.0	0.26	0.15	0.28	0.22	0.36	0.0	0.0	0.28	0.0	0.36	0.0	0.0	0.42	0.84	0.48	0.23
lcl\|BLLF01006485.1_cds_GFH32294.1_26771 (GFH32294)	0.08	0.0	0.0	0.32	0.49	0.43	0.71	0.53	0.64	0.13	0.44	0.29	0.42	0.52	0.41	0.31	0.19	0.16	0.34	0.08	0.32	0.43	0.27	1.0	0.27	0.21
lcl\|BLLF01006863.1_cds_GFH32610.1_27087 (GFH32610)	0.31	0.55	0.36	1.0	0.28	0.26	0.23	0.37	0.25	0.6	0.27	0.27	0.24	0.27	0.26	0.35	0.35	0.32	0.22	0.27	0.28	0.07	0.3	0.7	0.34	0.28
lcl\|BLLF01007103.1_cds_GFH32771.1_27248 (GFH32771)	0.02	0.0	0.0	0.19	0.3	0.3	0.25	0.44	0.35	0.1	0.18	0.18	0.17	0.3	0.28	0.22	0.05	0.06	0.09	0.19	0.39	0.09	0.17	1.0	0.78	0.65
lcl\|BLLF01007263.1_cds_GFH32862.1_27339 (GFH32862)	0.09	0.0	0.0	0.1	0.16	0.26	0.11	0.2	0.29	0.0	0.25	0.21	0.21	0.33	0.3	0.0	0.15	0.15	0.0	0.13	0.21	0.12	0.08	1.0	0.25	0.31
lcl\|BLLF01007790.1_cds_GFH33112.1_27589 (GFH33112)	0.0	0.0	0.0	0.21	0.14	0.02	0.29	0.37	0.32	0.0	0.2	0.0	0.54	0.25	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.08
lcl\|BLLF01008595.1_cds_GFH33442.1_27919 (GFH33442)	0.0	0.0	0.0	0.12	0.14	0.04	0.14	0.57	0.27	0.0	0.08	0.04	0.24	0.31	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0
lcl\|BLLF01008659.1_cds_GFH33475.1_27952 (GFH33475)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.03	0.1	0.03	0.16	0.0	0.0	0.03	0.15	0.04	0.13	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)