Heatmap: Cluster_283 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000012.1_cds_GFH05887.1_364 (GFH05887)	0.18	0.32	0.29	0.39	0.46	0.64	0.46	0.2	0.32	0.21	0.52	0.38	0.29	0.37	0.22	0.8	1.0	0.44	0.36	0.5	0.47	0.16	0.55	0.24	0.24	0.18
lcl\|BLLF01000034.1_cds_GFH06339.1_816 (GFH06339)	0.18	0.13	0.17	0.51	0.87	0.72	0.51	0.44	0.44	0.37	0.8	0.49	0.37	0.42	0.26	0.89	1.0	0.37	0.39	0.34	0.3	0.28	0.38	0.35	0.4	0.49
lcl\|BLLF01000065.1_cds_GFH06947.1_1424 (GFH06947)	0.54	0.18	0.2	0.07	0.45	0.56	0.64	0.37	0.68	0.61	0.86	0.73	0.7	0.76	0.56	0.59	1.0	0.67	0.22	0.29	0.52	0.39	0.57	0.28	0.7	0.87
lcl\|BLLF01000180.1_cds_GFH08723.1_3200 (GFH08723)	0.05	0.0	0.0	0.32	0.36	0.36	0.2	0.08	0.12	0.14	0.36	0.11	0.17	0.23	0.04	0.58	1.0	0.3	0.23	0.0	0.0	0.0	0.3	0.06	0.28	0.56
lcl\|BLLF01000212.1_cds_GFH09140.1_3617 (GFH09140)	0.0	0.33	0.0	0.39	0.55	0.62	0.44	0.25	0.38	0.86	0.49	0.4	0.6	0.37	0.33	0.99	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0
lcl\|BLLF01000212.1_cds_GFH09145.1_3622 (GFH09145)	0.13	0.0	0.0	0.12	0.67	0.53	0.13	0.03	0.01	0.19	0.35	0.0	0.0	0.0	0.01	0.72	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.03	0.0	0.36
lcl\|BLLF01000227.1_cds_GFH09349.1_3826 (GFH09349)	0.08	0.03	0.0	0.36	0.83	0.64	0.66	0.42	0.68	0.62	0.66	0.49	0.35	0.7	0.29	0.87	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	1.0	0.88
lcl\|BLLF01000246.1_cds_GFH09591.1_4068 (GFH09591)	0.04	0.0	0.0	0.33	0.61	0.55	0.64	0.34	0.39	0.53	0.52	0.42	0.52	0.47	0.36	1.0	0.68	0.0	0.0	0.17	0.09	0.0	0.06	0.07	0.55	0.53
lcl\|BLLF01000265.1_cds_GFH09804.1_4281 (GFH09804)	0.16	0.0	0.0	0.0	0.43	0.39	0.14	0.02	0.16	0.11	0.33	0.18	0.24	0.13	0.08	0.94	1.0	0.23	0.18	0.1	0.16	0.0	0.12	0.03	0.11	0.33
lcl\|BLLF01000285.1_cds_GFH10075.1_4552 (GFH10075)	0.1	0.02	0.0	0.16	0.21	0.17	0.34	0.3	0.3	0.48	0.31	0.24	0.42	0.42	0.31	0.9	1.0	0.38	0.0	0.05	0.18	0.0	0.25	0.06	0.21	0.28
lcl\|BLLF01000309.1_cds_GFH10360.1_4837 (GFH10360)	0.05	0.2	0.0	0.04	0.23	0.45	0.15	0.19	0.15	0.41	0.19	0.19	0.26	0.18	0.08	0.79	1.0	0.06	0.0	0.0	0.16	0.0	0.21	0.0	0.13	0.24
lcl\|BLLF01000346.1_cds_GFH10777.1_5254 (GFH10777)	0.11	0.07	0.18	0.49	1.0	0.76	0.45	0.64	0.31	0.23	0.79	0.62	0.43	0.46	0.43	0.75	0.71	0.42	0.45	0.68	0.36	0.54	0.37	0.19	0.59	0.44
lcl\|BLLF01000365.1_cds_GFH10998.1_5475 (GFH10998)	0.1	0.04	0.11	0.19	0.98	0.55	0.22	0.43	0.16	0.02	0.73	0.34	0.25	0.33	0.14	0.89	1.0	0.42	0.88	0.43	0.41	0.11	0.31	0.13	0.21	0.19
lcl\|BLLF01000365.1_cds_GFH10999.1_5476 (GFH10999)	0.27	0.24	0.28	0.14	0.72	0.36	0.17	0.31	0.12	0.05	0.55	0.24	0.23	0.27	0.11	0.68	0.79	0.77	1.0	0.5	0.59	0.28	0.5	0.09	0.19	0.21
lcl\|BLLF01000400.1_cds_GFH11412.1_5889 (GFH11412)	0.13	0.18	0.04	0.13	0.53	0.42	0.32	0.32	0.24	0.15	0.43	0.37	0.23	0.23	0.21	0.46	1.0	0.19	0.33	0.32	0.27	0.09	0.22	0.17	0.1	0.12
lcl\|BLLF01000555.1_cds_GFH12926.1_7403 (GFH12926)	0.39	0.6	0.0	0.0	0.97	0.8	0.89	0.45	0.58	0.36	1.0	0.43	0.57	0.53	0.5	0.86	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.53
lcl\|BLLF01000676.1_cds_GFH14007.1_8484 (GFH14007)	0.0	0.03	0.0	0.42	0.38	0.29	0.15	0.06	0.12	0.63	0.34	0.07	0.07	0.09	0.21	1.0	0.69	0.12	0.23	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.07	0.27
lcl\|BLLF01000772.1_cds_GFH14840.1_9317 (GFH14840)	0.18	0.24	0.0	0.04	0.34	0.42	0.31	0.2	0.25	0.34	0.25	0.25	0.23	0.21	0.27	0.68	1.0	0.13	0.12	0.26	0.15	0.08	0.23	0.18	0.34	0.26
lcl\|BLLF01001090.1_cds_GFH17059.1_11536 (GFH17059)	0.63	0.19	0.01	0.18	0.51	0.45	0.69	0.45	0.67	0.64	0.61	0.47	0.55	0.5	0.54	1.0	0.62	0.77	0.17	0.33	0.91	0.32	0.68	0.24	0.47	0.61
lcl\|BLLF01001112.1_cds_GFH17211.1_11688 (GFH17211)	0.13	0.0	0.0	0.11	0.55	0.53	0.31	0.3	0.5	0.18	0.65	0.41	0.48	0.3	0.26	1.0	0.93	0.0	0.49	0.22	0.18	0.21	0.0	0.18	0.33	0.44
lcl\|BLLF01001136.1_cds_GFH17359.1_11836 (GFH17359)	0.01	0.1	0.0	0.11	0.53	0.57	0.23	0.19	0.27	0.1	0.55	0.41	0.22	0.36	0.12	0.54	1.0	0.5	0.16	0.18	0.54	0.17	0.34	0.18	0.16	0.22
lcl\|BLLF01001153.1_cds_GFH17474.1_11951 (GFH17474)	0.08	0.32	0.15	0.17	0.22	0.37	0.26	0.19	0.28	0.63	0.27	0.29	0.31	0.24	0.25	0.8	1.0	0.19	0.0	0.15	0.21	0.07	0.17	0.05	0.3	0.26
lcl\|BLLF01001172.1_cds_GFH17590.1_12067 (GFH17590)	0.26	0.02	0.16	0.24	0.36	0.53	0.35	0.19	0.29	0.15	0.38	0.41	0.33	0.3	0.25	0.63	1.0	0.33	0.27	0.45	0.21	0.17	0.25	0.13	0.09	0.16
lcl\|BLLF01001200.1_cds_GFH17781.1_12258 (GFH17781)	0.02	0.03	0.0	0.02	0.59	0.78	0.55	0.34	0.3	0.47	0.53	0.81	0.4	0.35	0.1	1.0	0.9	0.49	0.1	0.04	0.61	0.21	0.29	0.23	0.41	0.19
lcl\|BLLF01001244.1_cds_GFH18068.1_12545 (GFH18068)	0.34	0.33	0.19	0.55	0.44	0.6	0.4	0.18	0.26	0.17	0.42	0.46	0.33	0.27	0.16	0.83	1.0	0.73	0.33	0.33	0.46	0.36	0.54	0.25	0.32	0.36
lcl\|BLLF01001267.1_cds_GFH18229.1_12706 (GFH18229)	0.23	0.33	0.41	0.37	0.94	0.82	0.71	0.63	0.75	0.68	0.86	0.69	0.54	0.64	0.63	0.84	1.0	0.57	0.25	0.49	0.56	0.4	0.5	0.54	0.7	0.61
lcl\|BLLF01001342.1_cds_GFH18708.1_13185 (GFH18708)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.69	0.44	0.25	0.28	0.0	0.61	0.56	0.38	0.2	0.29	0.51	0.87	0.0	0.09	0.18	0.0	0.2	0.0	0.09	0.15	0.12
lcl\|BLLF01001416.1_cds_GFH19162.1_13639 (GFH19162)	0.13	0.11	0.0	0.14	0.35	0.48	0.37	0.34	0.29	0.53	0.48	0.4	0.46	0.4	0.27	1.0	0.77	0.2	0.12	0.07	0.52	0.35	0.28	0.06	0.23	0.15
lcl\|BLLF01001510.1_cds_GFH19719.1_14196 (GFH19719)	0.15	0.18	0.0	0.04	0.29	0.57	0.33	0.15	0.28	0.24	0.2	0.25	0.2	0.14	0.11	0.88	1.0	0.53	0.08	0.36	0.48	0.25	0.21	0.1	0.18	0.22
lcl\|BLLF01001510.1_cds_GFH19724.1_14201 (GFH19724)	0.1	0.05	0.0	0.01	0.46	0.41	0.27	0.2	0.21	0.3	0.31	0.41	0.32	0.22	0.08	1.0	0.92	0.33	0.05	0.04	0.46	0.16	0.3	0.14	0.3	0.12
lcl\|BLLF01001510.1_cds_GFH19725.1_14202 (GFH19725)	0.03	0.03	0.0	0.0	0.22	0.24	0.16	0.12	0.12	0.19	0.2	0.22	0.15	0.12	0.04	1.0	0.9	0.15	0.04	0.02	0.19	0.09	0.14	0.08	0.14	0.04
lcl\|BLLF01001663.1_cds_GFH20595.1_15072 (GFH20595)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.27	0.37	0.26	0.24	0.23	0.49	0.34	0.19	0.52	0.34	0.23	1.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.12	0.11
lcl\|BLLF01001692.1_cds_GFH20757.1_15234 (GFH20757)	0.03	0.0	0.0	0.17	0.86	0.63	0.42	0.28	0.4	0.23	0.69	0.65	0.31	0.3	0.34	0.58	1.0	0.25	0.23	0.38	0.28	0.08	0.15	0.18	0.22	0.28
lcl\|BLLF01001766.1_cds_GFH21125.1_15602 (GFH21125)	0.07	0.0	0.0	0.16	0.52	0.52	0.68	0.28	0.37	0.09	0.47	0.54	0.45	0.38	0.39	1.0	0.84	0.1	0.15	0.17	0.4	0.0	0.19	0.17	0.49	0.48
lcl\|BLLF01001877.1_cds_GFH21665.1_16142 (GFH21665)	0.0	0.35	0.0	0.0	0.67	0.52	0.41	0.44	0.46	0.4	0.46	0.46	0.4	0.38	0.34	1.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.39
lcl\|BLLF01002532.1_cds_GFH24420.1_18897 (GFH24420)	0.05	0.19	0.0	0.0	0.7	0.49	0.46	0.22	0.32	0.17	0.64	0.39	0.31	0.28	0.17	0.73	1.0	0.1	0.29	0.08	0.0	0.0	0.0	0.03	0.18	0.38
lcl\|BLLF01002699.1_cds_GFH25036.1_19513 (GFH25036)	0.06	0.0	0.0	0.02	0.38	0.58	0.36	0.23	0.27	0.5	0.34	0.37	0.31	0.2	0.07	0.94	1.0	0.23	0.09	0.05	0.16	0.09	0.11	0.12	0.07	0.2
lcl\|BLLF01002798.1_cds_GFH25375.1_19852 (GFH25375)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.41	0.05	0.06	0.11	0.76	0.18	0.11	0.05	0.09	0.0	1.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002884.1_cds_GFH25672.1_20149 (GFH25672)	0.13	0.08	0.22	0.03	0.36	0.45	0.41	0.34	0.36	0.45	0.5	0.31	0.45	0.37	0.37	1.0	0.66	0.34	0.21	0.11	0.16	0.29	0.36	0.24	0.4	0.26
lcl\|BLLF01003071.1_cds_GFH26251.1_20728 (GFH26251)	0.52	0.07	0.08	0.07	0.38	0.45	0.54	0.29	0.46	0.53	0.42	0.51	0.48	0.42	0.53	0.47	1.0	0.19	0.15	0.3	0.21	0.09	0.2	0.04	0.28	0.64
lcl\|BLLF01003719.1_cds_GFH28044.1_22521 (GFH28044)	0.0	0.11	0.0	0.02	0.35	0.59	0.45	0.31	0.35	0.15	0.53	0.38	0.33	0.38	0.33	0.84	1.0	0.48	0.45	0.14	0.5	0.06	0.41	0.02	0.3	0.21
lcl\|BLLF01003771.1_cds_GFH28172.1_22649 (GFH28172)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.11	0.0	0.0	0.11	0.0	0.22	0.11	0.0	0.0	0.0	1.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18
lcl\|BLLF01004588.1_cds_GFH29903.1_24380 (GFH29903)	0.46	0.04	0.11	0.06	0.38	0.43	0.6	0.34	0.45	0.36	0.44	0.33	0.47	0.54	0.49	0.94	1.0	0.3	0.12	0.09	0.55	0.11	0.57	0.02	0.2	0.56
lcl\|BLLF01004934.1_cds_GFH30480.1_24957 (GFH30480)	0.03	0.36	0.0	0.07	0.44	0.49	0.37	0.28	0.33	0.21	0.48	0.42	0.34	0.4	0.27	0.71	1.0	0.26	0.03	0.13	0.61	0.14	0.31	0.09	0.16	0.29
lcl\|BLLF01004934.1_cds_GFH30481.1_24958 (GFH30481)	0.13	0.05	0.0	0.05	0.45	0.45	0.35	0.32	0.25	0.35	0.37	0.36	0.4	0.42	0.22	0.82	1.0	0.45	0.05	0.19	0.48	0.1	0.16	0.13	0.21	0.36
lcl\|BLLF01005774.1_cds_GFH31616.1_26093 (GFH31616)	0.2	0.0	0.0	0.22	0.21	0.48	0.39	0.22	0.32	0.13	0.27	0.26	0.18	0.23	0.26	0.83	1.0	0.2	0.46	0.32	0.16	0.19	0.24	0.13	0.16	0.27
lcl\|BLLF01005917.1_cds_GFH31762.1_26239 (GFH31762)	0.08	0.03	0.0	0.03	0.42	0.51	0.4	0.4	0.35	0.34	0.44	0.47	0.32	0.33	0.21	0.85	1.0	0.29	0.15	0.22	0.24	0.34	0.37	0.11	0.17	0.26
lcl\|BLLF01007289.1_cds_GFH32882.1_27359 (GFH32882)	0.0	0.0	0.0	0.44	1.0	0.88	0.63	0.45	0.84	0.57	0.89	0.55	0.48	0.37	0.48	0.8	0.99	0.63	0.31	0.53	0.58	0.33	0.0	0.21	0.72	0.78
lcl\|BLLF01008099.1_cds_GFH33253.1_27730 (GFH33253)	0.04	0.0	0.0	0.16	0.95	0.68	0.49	0.33	0.58	0.22	0.6	0.32	0.23	0.21	0.29	0.79	1.0	0.74	0.28	0.32	0.17	0.29	0.37	0.14	0.16	0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)