Heatmap: Cluster_142 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000024.1_cds_GFH06134.1_611 (GFH06134)	0.02	0.03	0.0	0.01	0.1	0.06	0.07	0.07	0.1	1.0	0.12	0.07	0.1	0.07	0.17	0.12	0.08	0.22	0.15	0.18	0.23	0.1	0.18	0.11	0.36	0.22
lcl\|BLLF01000053.1_cds_GFH06738.1_1215 (GFH06738)	0.21	0.05	0.0	0.01	0.12	0.13	0.15	0.14	0.15	1.0	0.08	0.1	0.15	0.09	0.15	0.28	0.29	0.2	0.38	0.17	0.19	0.12	0.19	0.1	0.22	0.2
lcl\|BLLF01000058.1_cds_GFH06821.1_1298 (GFH06821)	0.06	0.01	0.0	0.0	0.07	0.08	0.09	0.1	0.13	1.0	0.07	0.08	0.14	0.09	0.16	0.11	0.03	0.13	0.13	0.26	0.25	0.28	0.16	0.19	0.34	0.13
lcl\|BLLF01000070.1_cds_GFH07033.1_1510 (GFH07033)	0.04	0.05	0.08	0.04	0.07	0.06	0.09	0.06	0.11	1.0	0.08	0.04	0.06	0.08	0.12	0.35	0.2	0.22	0.06	0.04	0.13	0.09	0.18	0.06	0.04	0.05
lcl\|BLLF01000082.1_cds_GFH07224.1_1701 (GFH07224)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0	0.13	1.0	0.05	0.0	0.03	0.02	0.05	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000109.1_cds_GFH07682.1_2159 (GFH07682)	0.09	0.13	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	1.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.17	0.1	0.23	0.11	0.07	0.2	0.06	0.17	0.02	0.12	0.18
lcl\|BLLF01000113.1_cds_GFH07752.1_2229 (GFH07752)	0.19	0.06	0.0	0.09	0.19	0.11	0.13	0.12	0.22	1.0	0.09	0.07	0.1	0.09	0.07	0.04	0.03	0.17	0.1	0.2	0.09	0.05	0.07	0.06	0.14	0.17
lcl\|BLLF01000187.1_cds_GFH08828.1_3305 (GFH08828)	0.06	0.06	0.19	0.0	0.08	0.08	0.06	0.1	0.07	1.0	0.07	0.05	0.08	0.08	0.08	0.07	0.17	0.12	0.17	0.18	0.17	0.2	0.13	0.19	0.14	0.13
lcl\|BLLF01000250.1_cds_GFH09642.1_4119 (GFH09642)	0.01	0.0	0.03	0.0	0.12	0.09	0.12	0.1	0.13	1.0	0.14	0.12	0.09	0.12	0.15	0.17	0.04	0.04	0.07	0.15	0.24	0.14	0.04	0.16	0.26	0.26
lcl\|BLLF01000287.1_cds_GFH10112.1_4589 (GFH10112)	0.03	0.08	0.0	0.02	0.29	0.11	0.08	0.09	0.04	1.0	0.21	0.09	0.08	0.09	0.04	0.17	0.24	0.27	0.11	0.1	0.23	0.04	0.15	0.05	0.18	0.07
lcl\|BLLF01000350.1_cds_GFH10821.1_5298 (GFH10821)	0.02	0.0	0.0	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	1.0	0.03	0.03	0.04	0.03	0.07	0.29	0.23	0.18	0.34	0.14	0.16	0.05	0.16	0.03	0.06	0.04
lcl\|BLLF01000413.1_cds_GFH11551.1_6028 (GFH11551)	0.02	0.01	0.0	0.12	0.1	0.07	0.09	0.11	0.12	1.0	0.11	0.06	0.09	0.16	0.1	0.12	0.18	0.26	0.03	0.12	0.16	0.05	0.31	0.17	0.25	0.27
lcl\|BLLF01000413.1_cds_GFH11552.1_6029 (GFH11552)	0.03	0.16	0.0	0.04	0.0	0.05	0.01	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.12	0.09	0.15	0.04	0.0	0.0	0.04	0.14	0.05	0.0	0.17
lcl\|BLLF01000435.1_cds_GFH11787.1_6264 (GFH11787)	0.14	0.01	0.0	0.01	0.13	0.04	0.02	0.08	0.04	1.0	0.06	0.09	0.04	0.02	0.08	0.05	0.09	0.14	0.12	0.25	0.05	0.21	0.13	0.2	0.34	0.03
lcl\|BLLF01000568.1_cds_GFH13041.1_7518 (GFH13041)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.03	0.06	0.03	1.0	0.05	0.1	0.03	0.11	0.01	0.09	0.14	0.2	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.03	0.09	0.13
lcl\|BLLF01000644.1_cds_GFH13719.1_8196 (GFH13719)	0.08	0.0	0.15	0.01	0.12	0.05	0.08	0.12	0.11	1.0	0.09	0.07	0.08	0.11	0.12	0.08	0.17	0.05	0.14	0.1	0.12	0.05	0.09	0.02	0.07	0.03
lcl\|BLLF01000644.1_cds_GFH13720.1_8197 (GFH13720)	0.11	0.0	0.0	0.04	0.03	0.04	0.05	0.06	0.07	1.0	0.03	0.01	0.04	0.06	0.1	0.31	0.36	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.06
lcl\|BLLF01000653.1_cds_GFH13797.1_8274 (GFH13797)	0.1	0.15	0.0	0.11	0.45	0.39	0.3	0.31	0.17	1.0	0.48	0.38	0.22	0.36	0.13	0.19	0.45	0.48	0.22	0.19	0.3	0.06	0.44	0.21	0.34	0.11
lcl\|BLLF01000653.1_cds_GFH13798.1_8275 (GFH13798)	0.11	0.07	0.0	0.0	0.35	0.19	0.24	0.16	0.13	1.0	0.29	0.09	0.1	0.26	0.08	0.11	0.36	0.34	0.13	0.11	0.06	0.13	0.29	0.13	0.15	0.06
lcl\|BLLF01000653.1_cds_GFH13799.1_8276 (GFH13799)	0.05	0.05	0.0	0.01	0.16	0.11	0.08	0.08	0.06	1.0	0.14	0.07	0.08	0.13	0.04	0.11	0.13	0.13	0.13	0.07	0.13	0.08	0.15	0.03	0.06	0.08
lcl\|BLLF01000706.1_cds_GFH14267.1_8744 (GFH14267)	0.0	0.04	0.0	0.26	0.09	0.05	0.09	0.12	0.14	1.0	0.08	0.07	0.1	0.09	0.16	0.24	0.06	0.27	0.15	0.26	0.2	0.16	0.14	0.15	0.1	0.13
lcl\|BLLF01000966.1_cds_GFH16241.1_10718 (GFH16241)	0.11	0.06	0.0	0.03	0.14	0.09	0.13	0.11	0.11	1.0	0.1	0.04	0.11	0.1	0.19	0.13	0.06	0.26	0.09	0.19	0.14	0.23	0.18	0.09	0.28	0.27
lcl\|BLLF01001029.1_cds_GFH16653.1_11130 (GFH16653)	0.0	0.03	0.02	0.03	0.08	0.06	0.11	0.09	0.09	1.0	0.11	0.09	0.06	0.04	0.02	0.16	0.23	0.18	0.0	0.21	0.17	0.0	0.12	0.11	0.21	0.22
lcl\|BLLF01001029.1_cds_GFH16654.1_11131 (GFH16654)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.12	0.11	0.05	0.11	1.0	0.09	0.08	0.07	0.03	0.07	0.18	0.22	0.2	0.07	0.11	0.15	0.14	0.17	0.03	0.18	0.15
lcl\|BLLF01001094.1_cds_GFH17091.1_11568 (GFH17091)	0.02	0.01	0.0	0.0	0.15	0.1	0.08	0.1	0.09	1.0	0.13	0.09	0.11	0.09	0.08	0.2	0.21	0.33	0.18	0.14	0.23	0.12	0.23	0.09	0.2	0.18
lcl\|BLLF01001300.1_cds_GFH18435.1_12912 (GFH18435)	0.06	0.16	0.0	0.06	0.14	0.14	0.09	0.09	0.14	1.0	0.13	0.06	0.08	0.06	0.07	0.1	0.07	0.16	0.06	0.17	0.16	0.17	0.14	0.2	0.37	0.39
lcl\|BLLF01001448.1_cds_GFH19357.1_13834 (GFH19357)	0.19	0.13	0.0	0.01	0.11	0.12	0.08	0.1	0.12	1.0	0.09	0.08	0.1	0.07	0.08	0.11	0.1	0.1	0.01	0.06	0.1	0.04	0.1	0.03	0.22	0.16
lcl\|BLLF01001448.1_cds_GFH19359.1_13836 (GFH19359)	0.17	0.02	0.0	0.0	0.07	0.13	0.11	0.03	0.07	1.0	0.05	0.08	0.06	0.06	0.05	0.28	0.16	0.07	0.03	0.05	0.18	0.03	0.15	0.02	0.16	0.07
lcl\|BLLF01001520.1_cds_GFH19786.1_14263 (GFH19786)	0.05	0.14	0.0	0.01	0.14	0.13	0.12	0.1	0.13	1.0	0.11	0.09	0.12	0.08	0.11	0.03	0.08	0.23	0.14	0.14	0.28	0.2	0.15	0.03	0.14	0.18
lcl\|BLLF01001711.1_cds_GFH20859.1_15336 (GFH20859)	0.18	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.23	0.46	0.04	0.07	0.19	0.06	0.07	0.04	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002173.1_cds_GFH23005.1_17482 (GFH23005)	0.12	0.01	0.0	0.0	0.21	0.18	0.13	0.17	0.11	1.0	0.14	0.08	0.09	0.21	0.16	0.07	0.26	0.24	0.12	0.05	0.3	0.13	0.19	0.08	0.14	0.19
lcl\|BLLF01002383.1_cds_GFH23870.1_18347 (GFH23870)	0.02	0.01	0.0	0.02	0.04	0.04	0.04	0.07	0.05	1.0	0.03	0.05	0.07	0.05	0.06	0.08	0.06	0.1	0.07	0.14	0.16	0.07	0.1	0.08	0.3	0.29
lcl\|BLLF01002621.1_cds_GFH24743.1_19220 (GFH24743)	0.2	0.08	0.0	0.01	0.07	0.11	0.1	0.08	0.08	1.0	0.1	0.05	0.09	0.08	0.08	0.33	0.31	0.06	0.03	0.03	0.07	0.02	0.08	0.04	0.11	0.13
lcl\|BLLF01002670.1_cds_GFH24923.1_19400 (GFH24923)	0.24	0.07	0.02	0.17	0.27	0.21	0.22	0.18	0.23	1.0	0.3	0.2	0.21	0.23	0.21	0.25	0.31	0.24	0.36	0.28	0.24	0.21	0.27	0.2	0.21	0.17
lcl\|BLLF01002681.1_cds_GFH24965.1_19442 (GFH24965)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.02	0.0	0.02	0.05	1.0	0.06	0.03	0.11	0.03	0.05	0.23	0.0	0.18	0.0	0.31	0.25	0.0	0.18	0.0	0.04	0.04
lcl\|BLLF01002719.1_cds_GFH25101.1_19578 (GFH25101)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.19	0.11	0.09	0.14	0.1	1.0	0.2	0.07	0.07	0.08	0.06	0.18	0.17	0.3	0.08	0.18	0.23	0.15	0.16	0.08	0.29	0.24
lcl\|BLLF01003094.1_cds_GFH26328.1_20805 (GFH26328)	0.07	0.0	0.0	0.2	0.06	0.08	0.11	0.08	0.15	1.0	0.06	0.04	0.05	0.03	0.1	0.05	0.08	0.11	0.15	0.41	0.3	0.04	0.13	0.04	0.14	0.19
lcl\|BLLF01003241.1_cds_GFH26787.1_21264 (GFH26787)	0.01	0.0	0.0	0.03	0.15	0.07	0.11	0.15	0.19	1.0	0.15	0.09	0.11	0.1	0.19	0.21	0.15	0.2	0.26	0.16	0.23	0.27	0.22	0.26	0.25	0.27
lcl\|BLLF01003351.1_cds_GFH27106.1_21583 (GFH27106)	0.13	0.15	0.0	0.04	0.22	0.13	0.07	0.11	0.12	1.0	0.11	0.06	0.05	0.06	0.1	0.04	0.12	0.1	0.1	0.28	0.09	0.06	0.11	0.06	0.17	0.17
lcl\|BLLF01003450.1_cds_GFH27374.1_21851 (GFH27374)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.14	0.17	0.15	1.0	0.06	0.0	0.22	0.2	0.17	0.18	0.13	0.0	0.0	0.12	0.19	0.0	0.14	0.12	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003695.1_cds_GFH27978.1_22455 (GFH27978)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	1.0	0.0	0.03	0.04	0.11	0.15	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.15	0.0	0.02	0.02
lcl\|BLLF01003722.1_cds_GFH28050.1_22527 (GFH28050)	0.09	0.04	0.0	0.04	0.12	0.05	0.06	0.1	0.13	1.0	0.1	0.07	0.1	0.1	0.08	0.16	0.24	0.14	0.06	0.12	0.12	0.11	0.08	0.01	0.31	0.27
lcl\|BLLF01003931.1_cds_GFH28555.1_23032 (GFH28555)	0.13	0.25	0.15	0.01	0.13	0.14	0.11	0.23	0.12	1.0	0.16	0.11	0.08	0.15	0.09	0.22	0.11	0.25	0.09	0.14	0.3	0.26	0.24	0.19	0.22	0.28
lcl\|BLLF01004019.1_cds_GFH28751.1_23228 (GFH28751)	0.05	0.01	0.0	0.01	0.06	0.06	0.06	0.05	0.08	1.0	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.08	0.07	0.18	0.09	0.51	0.15	0.17	0.15	0.17	0.27	0.22
lcl\|BLLF01004179.1_cds_GFH29092.1_23569 (GFH29092)	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.07	0.08	1.0	0.05	0.06	0.11	0.11	0.07	0.07	0.09	0.09	0.03	0.05	0.12	0.03	0.06	0.14	0.19	0.15
lcl\|BLLF01004873.1_cds_GFH30386.1_24863 (GFH30386)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.04	0.1	0.11	1.0	0.08	0.06	0.13	0.08	0.08	0.14	0.07	0.23	0.08	0.08	0.15	0.04	0.29	0.07	0.15	0.1
lcl\|BLLF01004978.1_cds_GFH30548.1_25025 (GFH30548)	0.02	0.01	0.0	0.08	0.09	0.01	0.02	0.02	0.02	1.0	0.05	0.03	0.04	0.05	0.02	0.11	0.19	0.03	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.19
lcl\|BLLF01005132.1_cds_GFH30764.1_25241 (GFH30764)	0.01	0.14	0.1	0.02	0.14	0.14	0.09	0.12	0.14	1.0	0.14	0.13	0.12	0.1	0.14	0.11	0.18	0.21	0.1	0.19	0.28	0.24	0.22	0.19	0.45	0.26
lcl\|BLLF01005188.1_cds_GFH30854.1_25331 (GFH30854)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.04	0.06	0.06	1.0	0.04	0.03	0.1	0.03	0.08	0.1	0.0	0.28	0.4	0.14	0.09	0.23	0.26	0.12	0.2	0.11
lcl\|BLLF01005393.1_cds_GFH31132.1_25609 (GFH31132)	0.0	0.06	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	1.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.34	0.13	0.02	0.05	0.13	0.0	0.0	0.0	0.04	0.13	0.15
lcl\|BLLF01005548.1_cds_GFH31341.1_25818 (GFH31341)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.17	0.23	0.22	1.0	0.12	0.09	0.15	0.19	0.21	0.2	0.08	0.2	0.16	0.12	0.18	0.11	0.2	0.23	0.12	0.12
lcl\|BLLF01005695.1_cds_GFH31525.1_26002 (GFH31525)	0.18	0.0	0.0	0.11	0.11	0.11	0.08	0.09	0.11	1.0	0.17	0.03	0.08	0.05	0.08	0.25	0.19	0.15	0.22	0.27	0.03	0.04	0.0	0.1	0.01	0.01
lcl\|BLLF01006828.1_cds_GFH32578.1_27055 (GFH32578)	0.1	0.08	0.0	0.0	0.04	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006863.1_cds_GFH32609.1_27086 (GFH32609)	0.04	0.04	0.0	0.14	0.05	0.01	0.01	0.07	0.04	1.0	0.0	0.02	0.01	0.06	0.02	0.0	0.0	0.24	0.21	0.41	0.05	0.05	0.03	0.09	0.07	0.09
lcl\|BLLF01007368.1_cds_GFH32918.1_27395 (GFH32918)	0.1	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.13	0.11	0.13	1.0	0.08	0.08	0.1	0.15	0.09	0.25	0.12	0.15	0.04	0.17	0.2	0.04	0.12	0.03	0.08	0.12
lcl\|BLLF01008182.1_cds_GFH33279.1_27756 (GFH33279)	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	1.0	0.05	0.02	0.03	0.03	0.03	0.17	0.14	0.1	0.21	0.19	0.21	0.09	0.17	0.07	0.1	0.06
lcl\|BLLF01009588.1_cds_GFH33769.1_28246 (GFH33769)	0.12	0.07	0.0	0.0	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	1.0	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.1	0.03	0.0	0.23	0.05	0.11	0.0	0.0	0.21	0.1
lcl\|BLLF01009692.1_cds_GFH33800.1_28277 (GFH33800)	0.08	0.05	0.01	0.01	0.1	0.04	0.06	0.06	0.05	1.0	0.07	0.05	0.06	0.04	0.03	0.13	0.5	0.11	0.13	0.36	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)