Heatmap: Cluster_245 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05661.1_138 (GFH05661)	0.37	0.04	0.0	0.07	0.25	0.22	0.25	0.11	0.26	0.27	0.24	0.25	0.27	0.13	0.2	0.63	1.0	0.83	0.46	0.45	0.75	0.7	0.88	0.51	0.25	0.25
lcl\|BLLF01000058.1_cds_GFH06816.1_1293 (GFH06816)	0.14	0.52	0.2	0.25	0.34	0.23	0.22	0.32	0.21	0.15	0.45	0.31	0.33	0.35	0.25	0.91	1.0	0.48	0.39	0.34	0.46	0.42	0.54	0.71	0.35	0.24
lcl\|BLLF01000065.1_cds_GFH06953.1_1430 (GFH06953)	0.1	0.25	0.19	0.24	0.32	0.25	0.19	0.2	0.2	0.34	0.21	0.22	0.22	0.17	0.2	0.87	0.78	0.3	0.28	1.0	0.24	0.7	0.18	0.17	0.12	0.21
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07912.1_2389 (GFH07912)	0.19	0.0	0.0	0.72	0.06	0.04	0.04	0.0	0.01	0.37	0.02	0.15	0.01	0.0	0.02	0.72	1.0	0.0	0.31	0.96	0.0	0.56	0.0	0.13	0.11	0.12
lcl\|BLLF01000148.1_cds_GFH08247.1_2724 (GFH08247)	0.31	0.0	0.0	0.15	0.16	0.11	0.08	0.07	0.04	0.03	0.14	0.08	0.08	0.09	0.02	0.98	1.0	0.6	0.7	0.84	0.52	0.83	0.54	0.65	0.09	0.05
lcl\|BLLF01000155.1_cds_GFH08357.1_2834 (GFH08357)	0.25	0.0	0.0	0.07	0.18	0.16	0.17	0.08	0.26	0.66	0.23	0.13	0.18	0.15	0.2	0.37	0.59	0.53	0.36	0.66	0.4	1.0	0.34	0.21	0.21	0.26
lcl\|BLLF01000165.1_cds_GFH08500.1_2977 (GFH08500)	0.49	0.05	0.0	0.13	0.07	0.1	0.03	0.06	0.04	0.06	0.06	0.06	0.11	0.07	0.02	0.68	0.7	0.3	1.0	0.71	0.18	0.58	0.23	0.42	0.16	0.11
lcl\|BLLF01000200.1_cds_GFH08991.1_3468 (GFH08991)	0.55	0.12	0.0	0.11	0.4	0.34	0.24	0.24	0.27	0.11	0.4	0.18	0.31	0.3	0.26	0.93	1.0	0.52	0.39	0.54	0.9	0.75	0.81	0.59	0.33	0.25
lcl\|BLLF01000276.1_cds_GFH09950.1_4427 (GFH09950)	0.44	0.2	0.45	0.3	0.38	0.33	0.33	0.18	0.25	0.44	0.37	0.35	0.36	0.26	0.25	0.56	0.53	0.64	0.42	1.0	0.52	0.71	0.78	0.67	0.42	0.36
lcl\|BLLF01000290.1_cds_GFH10138.1_4615 (GFH10138)	0.49	0.13	0.0	0.43	0.14	0.13	0.17	0.1	0.18	0.21	0.05	0.06	0.11	0.04	0.12	1.0	0.96	0.53	0.24	0.56	0.44	0.77	0.48	0.51	0.1	0.11
lcl\|BLLF01000303.1_cds_GFH10295.1_4772 (GFH10295)	0.23	0.1	0.11	0.11	0.14	0.19	0.23	0.11	0.26	0.1	0.02	0.02	0.06	0.02	0.1	0.65	0.39	0.56	0.72	0.38	0.61	1.0	0.58	0.5	0.15	0.06
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10324.1_4801 (GFH10324)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.14	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.06	0.0	0.6	0.21	0.32	0.89	0.29	1.0	0.21	0.2	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000307.1_cds_GFH10329.1_4806 (GFH10329)	0.34	0.07	0.0	0.03	0.17	0.25	0.35	0.26	0.23	0.21	0.22	0.23	0.27	0.26	0.19	0.96	0.39	1.0	0.67	0.6	0.8	0.44	1.0	0.34	0.17	0.11
lcl\|BLLF01000321.1_cds_GFH10505.1_4982 (GFH10505)	0.73	0.0	0.0	0.05	0.14	0.16	0.0	0.04	0.09	0.2	0.05	0.06	0.07	0.03	0.05	1.0	0.64	0.11	0.67	0.76	0.15	0.35	0.11	0.4	0.0	0.13
lcl\|BLLF01000350.1_cds_GFH10816.1_5293 (GFH10816)	0.31	0.0	0.0	0.03	0.1	0.12	0.12	0.08	0.06	0.08	0.07	0.06	0.07	0.05	0.06	0.82	0.7	0.36	0.54	1.0	0.2	0.74	0.33	0.73	0.19	0.09
lcl\|BLLF01000360.1_cds_GFH10945.1_5422 (GFH10945)	0.08	0.1	0.0	0.29	0.12	0.26	0.14	0.11	0.19	0.48	0.18	0.15	0.18	0.05	0.16	0.9	1.0	0.18	0.13	0.67	0.12	0.42	0.17	0.36	0.24	0.41
lcl\|BLLF01000408.1_cds_GFH11488.1_5965 (GFH11488)	0.22	0.1	0.05	0.26	0.18	0.12	0.15	0.12	0.14	0.56	0.18	0.14	0.19	0.1	0.18	0.72	0.64	0.37	0.73	0.71	0.46	1.0	0.39	0.14	0.27	0.22
lcl\|BLLF01000505.1_cds_GFH12458.1_6935 (GFH12458)	0.06	0.06	0.0	0.07	0.2	0.14	0.16	0.09	0.15	0.16	0.1	0.25	0.16	0.13	0.18	0.81	0.76	0.23	0.43	0.98	0.48	1.0	0.28	0.08	0.13	0.11
lcl\|BLLF01000533.1_cds_GFH12725.1_7202 (GFH12725)	0.41	0.12	0.31	0.08	0.07	0.12	0.16	0.09	0.12	0.33	0.1	0.08	0.09	0.1	0.13	0.53	0.4	0.31	0.44	0.74	0.44	1.0	0.36	0.36	0.14	0.08
lcl\|BLLF01000584.1_cds_GFH13175.1_7652 (GFH13175)	0.22	0.01	0.0	0.07	0.08	0.19	0.25	0.13	0.2	0.08	0.08	0.13	0.23	0.17	0.17	1.0	0.7	0.76	0.7	0.19	0.78	0.78	0.96	0.65	0.11	0.12
lcl\|BLLF01000589.1_cds_GFH13231.1_7708 (GFH13231)	0.23	0.35	0.01	0.25	0.27	0.12	0.13	0.11	0.19	0.41	0.19	0.15	0.21	0.08	0.24	0.24	0.6	0.13	0.17	1.0	0.24	0.71	0.26	0.99	0.23	0.12
lcl\|BLLF01000750.1_cds_GFH14649.1_9126 (GFH14649)	0.38	0.11	0.07	0.12	0.29	0.33	0.22	0.16	0.16	0.21	0.22	0.31	0.23	0.18	0.17	0.94	0.72	0.64	0.39	0.49	0.81	0.99	1.0	0.5	0.27	0.17
lcl\|BLLF01000785.1_cds_GFH14935.1_9412 (GFH14935)	0.28	0.0	0.0	0.13	0.16	0.06	0.1	0.12	0.15	0.07	0.09	0.02	0.11	0.07	0.11	0.79	0.59	1.0	0.23	0.65	0.64	0.73	0.61	0.31	0.04	0.02
lcl\|BLLF01000828.1_cds_GFH15270.1_9747 (GFH15270)	0.3	0.0	0.0	0.0	0.12	0.11	0.09	0.04	0.07	0.07	0.14	0.12	0.08	0.06	0.07	0.48	0.53	0.49	0.58	1.0	0.37	0.82	0.34	0.8	0.09	0.07
lcl\|BLLF01000834.1_cds_GFH15311.1_9788 (GFH15311)	0.16	0.17	0.18	0.15	0.06	0.09	0.09	0.13	0.11	0.14	0.07	0.09	0.1	0.11	0.12	0.47	0.34	0.35	0.48	0.52	0.37	1.0	0.38	0.25	0.11	0.12
lcl\|BLLF01000992.1_cds_GFH16397.1_10874 (GFH16397)	0.55	0.21	0.33	0.61	0.28	0.36	0.3	0.12	0.21	0.35	0.32	0.31	0.33	0.22	0.16	0.71	0.72	0.56	0.47	0.64	0.45	1.0	0.76	0.77	0.6	0.39
lcl\|BLLF01001037.1_cds_GFH16692.1_11169 (GFH16692)	0.56	0.06	0.08	0.14	0.44	0.3	0.27	0.25	0.26	0.36	0.37	0.24	0.23	0.22	0.23	0.69	1.0	0.75	0.54	0.44	0.77	0.46	0.7	0.54	0.18	0.17
lcl\|BLLF01001219.1_cds_GFH17896.1_12373 (GFH17896)	0.2	0.08	0.11	0.0	0.03	0.05	0.05	0.05	0.07	0.39	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	1.0	0.27	0.34	0.42	0.82	0.44	0.66	0.2	0.28	0.14	0.28
lcl\|BLLF01001242.1_cds_GFH18047.1_12524 (GFH18047)	0.32	0.03	0.0	0.11	0.05	0.04	0.07	0.05	0.12	0.23	0.03	0.03	0.06	0.06	0.06	0.59	0.21	0.17	0.38	1.0	0.29	0.53	0.22	0.41	0.04	0.08
lcl\|BLLF01001325.1_cds_GFH18596.1_13073 (GFH18596)	0.23	0.0	0.0	0.13	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.72	0.45	0.24	1.0	0.63	0.16	0.32	0.23	0.42	0.06	0.07
lcl\|BLLF01001351.1_cds_GFH18759.1_13236 (GFH18759)	0.23	0.0	0.0	0.37	0.31	0.27	0.17	0.15	0.14	0.28	0.26	0.21	0.13	0.13	0.11	0.86	0.61	0.6	1.0	0.78	0.59	0.77	0.58	0.6	0.19	0.16
lcl\|BLLF01001406.1_cds_GFH19101.1_13578 (GFH19101)	0.24	0.19	0.0	0.0	0.09	0.14	0.11	0.09	0.1	0.23	0.07	0.14	0.07	0.07	0.1	0.69	0.72	0.27	0.4	1.0	0.38	0.33	0.28	0.18	0.15	0.08
lcl\|BLLF01001408.1_cds_GFH19115.1_13592 (GFH19115)	0.56	0.18	0.0	0.11	0.13	0.12	0.15	0.1	0.1	0.43	0.1	0.18	0.18	0.12	0.15	0.9	0.6	0.24	0.55	1.0	0.38	0.65	0.23	0.4	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001462.1_cds_GFH19432.1_13909 (GFH19432)	0.46	0.05	0.0	0.0	0.02	0.02	0.07	0.08	0.07	0.51	0.02	0.0	0.06	0.03	0.05	0.77	0.52	0.13	0.65	1.0	0.0	0.66	0.0	0.1	0.12	0.03
lcl\|BLLF01001620.1_cds_GFH20357.1_14834 (GFH20357)	0.79	0.01	0.0	0.27	0.37	0.38	0.26	0.21	0.23	0.12	0.31	0.31	0.2	0.23	0.15	0.84	0.77	0.82	0.82	0.9	0.84	1.0	0.85	0.65	0.27	0.23
lcl\|BLLF01001679.1_cds_GFH20681.1_15158 (GFH20681)	0.38	0.1	0.06	0.32	0.27	0.33	0.38	0.22	0.34	0.17	0.24	0.22	0.19	0.24	0.2	0.78	0.67	0.96	1.0	0.52	0.87	0.9	1.0	0.81	0.2	0.24
lcl\|BLLF01002146.1_cds_GFH22891.1_17368 (GFH22891)	0.18	0.26	0.0	0.44	0.11	0.13	0.12	0.04	0.11	0.3	0.11	0.15	0.11	0.03	0.06	0.93	1.0	0.07	0.2	0.61	0.0	0.52	0.13	0.53	0.18	0.2
lcl\|BLLF01002158.1_cds_GFH22938.1_17415 (GFH22938)	0.03	0.33	0.0	0.0	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.05	0.05	0.05	0.01	1.0	0.84	0.11	0.24	0.45	0.32	0.64	0.29	0.44	0.05	0.03
lcl\|BLLF01002291.1_cds_GFH23514.1_17991 (GFH23514)	0.13	0.0	0.0	0.29	0.1	0.08	0.07	0.02	0.03	0.03	0.11	0.11	0.08	0.04	0.04	0.72	0.51	0.16	1.0	0.88	0.23	0.56	0.19	0.54	0.1	0.08
lcl\|BLLF01002387.1_cds_GFH23882.1_18359 (GFH23882)	0.1	0.0	0.0	0.44	0.13	0.04	0.0	0.04	0.02	0.14	0.04	0.06	0.02	0.07	0.0	0.58	1.0	0.15	0.0	0.64	0.0	0.48	0.15	0.08	0.07	0.07
lcl\|BLLF01002514.1_cds_GFH24357.1_18834 (GFH24357)	0.3	0.19	0.68	0.45	0.52	0.41	0.36	0.27	0.34	0.61	0.32	0.35	0.33	0.26	0.22	0.43	0.66	0.79	0.3	0.88	0.53	1.0	0.81	0.93	0.34	0.48
lcl\|BLLF01002523.1_cds_GFH24386.1_18863 (GFH24386)	0.19	0.02	0.0	0.08	0.03	0.03	0.08	0.01	0.09	0.05	0.03	0.05	0.04	0.03	0.12	1.0	0.02	0.06	0.41	0.39	0.03	0.47	0.12	0.2	0.08	0.07
lcl\|BLLF01002794.1_cds_GFH25365.1_19842 (GFH25365)	0.36	0.01	0.0	0.17	0.03	0.13	0.08	0.05	0.07	0.19	0.17	0.14	0.17	0.09	0.03	0.93	0.53	1.0	0.29	0.8	0.53	0.98	0.61	0.36	0.08	0.08
lcl\|BLLF01003082.1_cds_GFH26285.1_20762 (GFH26285)	0.37	0.34	0.24	0.34	0.16	0.14	0.15	0.12	0.19	0.51	0.16	0.14	0.15	0.14	0.21	1.0	0.98	0.4	0.52	0.74	0.47	0.98	0.43	0.53	0.25	0.21
lcl\|BLLF01003108.1_cds_GFH26368.1_20845 (GFH26368)	0.31	0.0	0.0	1.0	0.25	0.09	0.17	0.14	0.11	0.43	0.18	0.18	0.14	0.06	0.16	0.34	0.56	0.14	0.02	0.89	0.22	0.39	0.1	0.16	0.41	0.27
lcl\|BLLF01003126.1_cds_GFH26430.1_20907 (GFH26430)	0.26	0.0	0.0	0.04	0.05	0.03	0.09	0.13	0.0	0.41	0.04	0.05	0.07	0.17	0.05	0.35	0.51	0.27	0.27	1.0	0.0	1.0	0.45	0.33	0.02	0.02
lcl\|BLLF01003149.1_cds_GFH26502.1_20979 (GFH26502)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08	0.23	0.26	0.1	0.31	0.31	0.07	0.13	0.18	0.11	0.15	1.0	0.79	0.65	0.59	0.23	0.69	0.67	0.74	0.63	0.13	0.13
lcl\|BLLF01003648.1_cds_GFH27854.1_22331 (GFH27854)	0.52	0.06	0.2	0.05	0.32	0.27	0.21	0.28	0.29	0.4	0.26	0.31	0.35	0.22	0.34	0.43	0.56	0.63	0.47	1.0	0.57	0.89	0.62	0.35	0.29	0.24
lcl\|BLLF01003933.1_cds_GFH28562.1_23039 (GFH28562)	0.18	0.0	0.0	0.25	0.02	0.06	0.0	0.0	0.02	0.35	0.02	0.02	0.0	0.0	0.05	0.27	0.65	0.27	0.0	1.0	0.42	0.95	0.24	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003957.1_cds_GFH28610.1_23087 (GFH28610)	0.18	0.32	0.0	0.01	0.12	0.16	0.15	0.11	0.15	0.2	0.17	0.18	0.18	0.13	0.17	0.37	1.0	0.43	0.29	0.61	0.49	0.81	0.45	0.23	0.26	0.22
lcl\|BLLF01004040.1_cds_GFH28796.1_23273 (GFH28796)	0.08	0.07	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.02	0.15	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.85	0.63	0.42	0.5	1.0	0.5	0.92	0.58	0.16	0.0	0.02
lcl\|BLLF01004372.1_cds_GFH29483.1_23960 (GFH29483)	0.41	0.11	0.0	0.07	0.26	0.33	0.31	0.24	0.29	0.09	0.24	0.33	0.32	0.33	0.25	0.92	0.79	0.65	0.66	0.52	0.72	0.83	1.0	0.39	0.2	0.25
lcl\|BLLF01004720.1_cds_GFH30130.1_24607 (GFH30130)	0.62	0.11	0.28	0.1	0.41	0.24	0.17	0.28	0.17	0.23	0.37	0.26	0.22	0.26	0.15	0.7	1.0	0.96	0.73	0.76	0.82	0.84	0.86	0.61	0.18	0.23
lcl\|BLLF01004723.1_cds_GFH30137.1_24614 (GFH30137)	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.21	0.48	0.19	0.3	0.6	0.48	1.0	0.27	0.08	0.03	0.02
lcl\|BLLF01004900.1_cds_GFH30434.1_24911 (GFH30434)	0.26	0.13	0.13	0.0	0.0	0.04	0.01	0.02	0.01	0.2	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	1.0	0.28	0.23	0.45	0.84	0.21	0.77	0.3	0.45	0.04	0.05
lcl\|BLLF01004995.1_cds_GFH30574.1_25051 (GFH30574)	0.43	0.03	0.08	0.2	0.09	0.15	0.19	0.06	0.17	0.09	0.16	0.18	0.2	0.1	0.27	0.5	1.0	0.64	0.29	0.67	0.55	0.77	0.56	0.25	0.21	0.21
lcl\|BLLF01005641.1_cds_GFH31453.1_25930 (GFH31453)	0.36	0.35	0.08	0.17	0.1	0.13	0.19	0.15	0.16	0.35	0.1	0.15	0.13	0.15	0.15	0.96	0.4	0.69	0.71	0.36	0.62	1.0	0.62	0.75	0.11	0.08
lcl\|BLLF01005721.1_cds_GFH31555.1_26032 (GFH31555)	0.46	0.09	0.1	0.09	0.33	0.25	0.32	0.18	0.24	0.1	0.33	0.22	0.2	0.18	0.32	1.0	0.64	0.41	0.95	0.45	0.43	0.64	0.32	0.55	0.17	0.09
lcl\|BLLF01007743.1_cds_GFH33093.1_27570 (GFH33093)	0.23	0.23	0.0	0.07	0.16	0.11	0.09	0.15	0.11	0.16	0.11	0.15	0.11	0.1	0.09	0.36	1.0	0.15	0.29	0.99	0.19	0.68	0.21	0.64	0.24	0.2
lcl\|BLLF01008638.1_cds_GFH33465.1_27942 (GFH33465)	0.52	0.14	0.48	0.19	0.31	0.35	0.27	0.18	0.2	0.2	0.33	0.23	0.15	0.17	0.15	0.98	0.81	0.85	0.28	0.58	1.0	0.59	0.75	0.54	0.17	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)