Heatmap: Cluster_127 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000004.1_cds_GFH05648.1_125 (GFH05648)	0.46	1.0	0.25	0.35	0.73	0.8	0.5	0.78	0.54	0.3	0.64	0.86	0.56	0.61	0.74	0.41	0.75	0.16	0.73	0.78	0.17	0.71	0.18	0.4	0.75	0.6
lcl\|BLLF01000007.1_cds_GFH05751.1_228 (GFH05751)	0.26	0.79	0.85	0.23	0.76	0.8	0.48	1.0	0.53	0.13	0.93	0.62	0.62	0.89	0.38	0.49	0.52	0.23	0.15	0.13	0.28	0.22	0.23	0.58	0.62	0.98
lcl\|BLLF01000025.1_cds_GFH06176.1_653 (GFH06176)	0.15	0.4	1.0	0.63	0.5	0.3	0.3	0.6	0.45	0.16	0.4	0.26	0.36	0.33	0.47	0.16	0.16	0.12	0.4	0.21	0.13	0.15	0.15	0.2	0.47	0.2
lcl\|BLLF01000028.1_cds_GFH06222.1_699 (GFH06222)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.91	0.58	1.0	0.71	0.0	0.39	0.18	0.68	0.54	0.71	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.79	0.22
lcl\|BLLF01000030.1_cds_GFH06257.1_734 (GFH06257)	0.41	0.44	0.53	1.0	0.57	0.49	0.47	0.88	0.84	0.2	0.56	0.44	0.44	0.59	0.6	0.19	0.42	0.13	0.37	0.14	0.21	0.12	0.29	0.22	0.97	0.81
lcl\|BLLF01000046.1_cds_GFH06593.1_1070 (GFH06593)	1.0	0.53	0.98	0.32	0.61	0.68	0.6	0.75	0.9	0.57	0.49	0.49	0.56	0.46	0.61	0.36	0.53	0.41	0.53	0.66	0.43	0.41	0.37	0.23	0.61	0.55
lcl\|BLLF01000054.1_cds_GFH06756.1_1233 (GFH06756)	0.29	0.8	1.0	0.27	0.61	0.56	0.56	0.85	0.56	0.75	0.64	0.54	0.49	0.54	0.57	0.6	0.7	0.56	0.68	0.69	0.7	0.66	0.67	0.9	0.18	0.14
lcl\|BLLF01000086.1_cds_GFH07303.1_1780 (GFH07303)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.2	0.23	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
lcl\|BLLF01000087.1_cds_GFH07322.1_1799 (GFH07322)	0.56	0.29	0.89	0.3	0.49	0.37	0.31	0.83	0.39	0.47	0.45	0.38	0.42	0.5	0.39	0.25	0.28	0.32	0.18	0.24	0.32	0.22	0.3	0.22	0.9	1.0
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08042.1_2519 (GFH08042)	0.38	0.73	0.95	0.42	0.64	0.53	0.42	0.84	0.65	0.34	0.56	0.49	0.54	0.53	0.58	0.27	0.3	0.34	0.34	0.24	0.25	0.16	0.28	0.22	0.55	1.0
lcl\|BLLF01000224.1_cds_GFH09316.1_3793 (GFH09316)	0.0	0.88	0.0	0.11	0.65	1.0	0.72	0.92	0.91	0.41	0.35	0.63	0.41	0.46	0.5	0.13	0.09	0.27	0.07	0.08	0.07	0.07	0.1	0.71	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000226.1_cds_GFH09341.1_3818 (GFH09341)	0.14	1.0	0.38	0.47	0.48	0.61	0.5	0.71	0.45	0.0	0.57	0.66	0.65	0.83	0.45	0.55	0.53	0.1	0.61	0.49	0.12	0.3	0.17	0.22	0.52	0.7
lcl\|BLLF01000249.1_cds_GFH09632.1_4109 (GFH09632)	0.26	0.57	1.0	0.51	0.42	0.58	0.56	0.49	0.78	0.4	0.43	0.49	0.47	0.49	0.52	0.16	0.24	0.27	0.54	0.46	0.25	0.41	0.3	0.77	0.45	0.43
lcl\|BLLF01000278.1_cds_GFH09973.1_4450 (GFH09973)	0.12	0.73	0.76	0.21	0.8	0.76	0.43	1.0	0.54	0.18	0.63	0.52	0.45	0.62	0.54	0.46	0.45	0.0	0.04	0.02	0.04	0.04	0.0	0.0	0.19	0.72
lcl\|BLLF01000284.1_cds_GFH10058.1_4535 (GFH10058)	0.73	0.42	0.76	0.71	0.61	0.58	0.45	0.81	0.69	0.79	0.58	0.42	0.4	0.58	0.42	0.44	0.29	0.38	0.46	0.53	0.39	0.41	0.32	0.27	0.76	1.0
lcl\|BLLF01000287.1_cds_GFH10110.1_4587 (GFH10110)	0.95	0.34	0.78	0.21	0.5	0.89	0.57	0.65	0.86	0.54	0.54	0.61	0.75	0.59	0.88	0.3	0.28	0.58	0.38	0.61	0.44	0.52	0.43	1.0	0.75	0.57
lcl\|BLLF01000296.1_cds_GFH10222.1_4699 (GFH10222)	0.94	0.57	0.66	0.07	0.45	0.4	0.52	0.57	0.8	0.43	0.5	0.38	0.63	0.38	1.0	0.27	0.38	0.34	0.27	0.16	0.26	0.11	0.27	0.68	0.82	0.38
lcl\|BLLF01000310.1_cds_GFH10378.1_4855 (GFH10378)	0.05	0.09	1.0	0.03	0.11	0.14	0.26	0.19	0.33	0.45	0.17	0.18	0.21	0.14	0.21	0.08	0.09	0.03	0.0	0.11	0.04	0.0	0.06	0.1	0.14	0.17
lcl\|BLLF01000327.1_cds_GFH10570.1_5047 (GFH10570)	0.34	0.54	1.0	0.36	0.69	0.59	0.59	0.78	0.8	0.28	0.51	0.45	0.53	0.53	0.64	0.26	0.31	0.43	0.16	0.19	0.55	0.2	0.46	0.64	0.36	0.41
lcl\|BLLF01000361.1_cds_GFH10955.1_5432 (GFH10955)	0.32	0.52	1.0	0.22	0.43	0.38	0.53	0.86	0.72	0.49	0.45	0.39	0.51	0.6	0.71	0.36	0.36	0.23	0.09	0.08	0.2	0.13	0.23	0.26	0.58	0.55
lcl\|BLLF01000373.1_cds_GFH11098.1_5575 (GFH11098)	0.23	0.68	1.0	0.23	0.71	0.56	0.53	0.77	0.62	0.42	0.61	0.5	0.54	0.57	0.56	0.31	0.32	0.46	0.32	0.34	0.63	0.33	0.4	0.65	0.13	0.09
lcl\|BLLF01000400.1_cds_GFH11409.1_5886 (GFH11409)	0.12	0.72	0.0	0.0	0.51	0.91	0.72	0.52	0.93	0.66	0.63	0.48	0.56	0.15	1.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.18	0.37	0.04	0.0
lcl\|BLLF01000407.1_cds_GFH11474.1_5951 (GFH11474)	0.81	0.54	1.0	0.41	0.64	0.54	0.6	0.95	0.73	0.65	0.62	0.56	0.63	0.58	0.75	0.4	0.38	0.54	0.38	0.58	0.49	0.64	0.48	0.36	0.62	0.42
lcl\|BLLF01000613.1_cds_GFH13443.1_7920 (GFH13443)	0.34	0.93	1.0	0.45	0.74	0.86	0.7	0.88	0.73	0.25	0.71	0.83	0.62	0.8	0.76	0.4	0.42	0.7	0.45	0.56	0.38	0.65	0.87	0.66	0.72	0.59
lcl\|BLLF01000655.1_cds_GFH13819.1_8296 (GFH13819)	0.21	0.79	1.0	0.26	0.66	0.5	0.53	0.79	0.6	0.39	0.46	0.38	0.59	0.47	0.62	0.12	0.24	0.23	0.26	0.13	0.28	0.3	0.3	0.24	0.18	0.2
lcl\|BLLF01000727.1_cds_GFH14449.1_8926 (GFH14449)	0.18	0.92	0.41	0.23	0.61	0.78	0.47	0.79	0.4	0.33	0.65	0.85	0.57	1.0	0.39	0.34	0.32	0.29	0.23	0.14	0.2	0.15	0.3	0.21	0.28	0.37
lcl\|BLLF01000738.1_cds_GFH14539.1_9016 (GFH14539)	0.11	0.07	1.0	0.37	0.57	0.42	0.64	0.5	0.59	0.15	0.37	0.38	0.41	0.34	0.48	0.1	0.16	0.27	0.11	0.1	0.16	0.28	0.2	0.46	0.35	0.1
lcl\|BLLF01000855.1_cds_GFH15479.1_9956 (GFH15479)	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.13	0.94	0.0	0.0	0.03	0.37	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000889.1_cds_GFH15712.1_10189 (GFH15712)	0.06	0.6	0.35	0.21	0.27	0.48	0.29	0.79	0.28	0.15	0.4	0.64	0.49	1.0	0.33	0.03	0.02	0.1	0.17	0.11	0.09	0.12	0.13	0.04	0.29	0.42
lcl\|BLLF01000893.1_cds_GFH15738.1_10215 (GFH15738)	0.32	0.5	1.0	0.11	0.39	0.48	0.34	0.53	0.63	0.18	0.43	0.42	0.35	0.39	0.49	0.29	0.32	0.31	0.23	0.22	0.3	0.22	0.3	0.41	0.57	0.76
lcl\|BLLF01000932.1_cds_GFH16011.1_10488 (GFH16011)	0.59	0.73	0.97	0.69	0.39	0.52	0.68	0.75	1.0	0.37	0.34	0.37	0.62	0.46	0.86	0.26	0.21	0.32	0.36	0.22	0.34	0.71	0.42	0.87	0.4	0.4
lcl\|BLLF01000960.1_cds_GFH16204.1_10681 (GFH16204)	0.54	0.6	0.55	0.22	0.98	0.63	0.74	1.0	0.67	0.49	0.56	0.62	0.81	0.46	0.72	0.19	0.46	0.23	0.19	0.32	0.26	0.58	0.31	0.79	0.58	0.31
lcl\|BLLF01001086.1_cds_GFH17036.1_11513 (GFH17036)	0.26	1.0	0.93	0.39	0.95	0.64	0.65	0.71	0.61	0.55	0.83	0.69	0.52	0.62	0.6	0.89	0.98	0.33	0.18	0.22	0.31	0.23	0.29	0.7	0.53	0.38
lcl\|BLLF01001112.1_cds_GFH17210.1_11687 (GFH17210)	0.22	0.69	0.54	0.29	0.49	0.53	0.51	1.0	0.54	0.68	0.55	0.88	0.77	0.97	0.65	0.07	0.07	0.04	0.31	0.3	0.02	0.41	0.01	0.31	0.55	0.58
lcl\|BLLF01001186.1_cds_GFH17690.1_12167 (GFH17690)	0.03	0.3	1.0	0.3	0.2	0.2	0.24	0.28	0.38	0.31	0.18	0.15	0.17	0.2	0.28	0.03	0.07	0.04	0.03	0.03	0.02	0.11	0.04	0.07	0.28	0.37
lcl\|BLLF01001187.1_cds_GFH17694.1_12171 (GFH17694)	0.23	0.59	0.96	0.2	0.84	0.82	0.51	1.0	0.64	0.19	1.0	0.57	0.62	0.85	0.38	0.55	0.5	0.25	0.14	0.08	0.29	0.1	0.25	0.48	0.42	0.72
lcl\|BLLF01001371.1_cds_GFH18868.1_13345 (GFH18868)	0.68	0.29	1.0	0.36	0.55	0.41	0.46	0.84	0.71	0.18	0.63	0.43	0.5	0.55	0.82	0.31	0.57	0.82	0.74	0.42	0.75	0.37	0.72	0.87	0.44	0.43
lcl\|BLLF01001460.1_cds_GFH19416.1_13893 (GFH19416)	0.54	0.53	0.86	0.41	0.85	0.86	0.56	1.0	0.69	0.13	0.7	0.48	0.43	0.56	0.38	0.3	0.29	0.29	0.35	0.28	0.26	0.32	0.25	0.57	0.43	0.65
lcl\|BLLF01001529.1_cds_GFH19845.1_14322 (GFH19845)	0.47	0.54	0.69	0.22	0.33	0.36	0.45	0.97	0.47	0.28	0.38	0.35	0.45	0.65	0.5	0.38	0.49	0.31	0.13	0.18	0.22	0.18	0.26	0.07	0.68	1.0
lcl\|BLLF01001562.1_cds_GFH20034.1_14511 (GFH20034)	0.0	0.0	0.0	0.33	0.44	0.55	0.12	0.5	0.27	0.0	0.22	0.5	0.47	0.65	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	1.0	0.09
lcl\|BLLF01001895.1_cds_GFH21733.1_16210 (GFH21733)	0.46	0.24	0.67	0.47	0.4	0.38	0.37	0.54	0.66	0.06	0.36	0.49	0.47	0.26	1.0	0.11	0.09	0.07	0.1	0.22	0.0	0.62	0.09	0.51	0.2	0.07
lcl\|BLLF01001979.1_cds_GFH22154.1_16631 (GFH22154)	0.23	0.3	0.0	0.0	0.54	0.44	0.33	0.76	0.38	0.16	0.43	0.76	0.5	0.64	1.0	0.11	0.42	0.0	0.13	0.07	0.36	0.14	0.44	0.25	0.67	0.59
lcl\|BLLF01002177.1_cds_GFH23032.1_17509 (GFH23032)	0.0	0.05	0.0	0.7	0.41	0.23	0.16	0.46	0.14	0.2	0.28	0.23	0.25	0.34	0.08	0.0	0.0	0.41	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.1
lcl\|BLLF01002211.1_cds_GFH23185.1_17662 (GFH23185)	0.0	0.0	0.0	0.8	0.22	0.2	0.0	0.84	0.43	0.0	0.33	0.26	0.48	0.55	0.73	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.34
lcl\|BLLF01002257.1_cds_GFH23374.1_17851 (GFH23374)	0.0	0.47	1.0	0.4	0.5	0.48	0.39	0.52	0.45	0.23	0.59	0.48	0.34	0.54	0.44	0.84	0.66	0.47	0.33	0.26	0.42	0.16	0.42	0.56	0.33	0.3
lcl\|BLLF01002359.1_cds_GFH23777.1_18254 (GFH23777)	0.4	0.92	0.75	0.01	0.41	0.45	0.44	1.0	0.7	0.42	0.51	0.57	0.59	0.8	0.83	0.08	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.69	0.86
lcl\|BLLF01002408.1_cds_GFH23968.1_18445 (GFH23968)	0.07	0.41	1.0	0.39	0.3	0.25	0.25	0.58	0.45	0.54	0.33	0.3	0.45	0.47	0.68	0.19	0.25	0.02	0.11	0.14	0.05	0.05	0.03	0.03	0.6	0.5
lcl\|BLLF01002502.1_cds_GFH24319.1_18796 (GFH24319)	0.06	0.14	0.77	0.05	0.07	0.24	0.26	0.3	0.29	0.13	0.08	0.22	0.24	0.17	0.13	0.21	0.08	0.08	1.0	0.21	0.15	0.44	0.17	0.59	0.16	0.14
lcl\|BLLF01002553.1_cds_GFH24505.1_18982 (GFH24505)	0.89	0.75	0.75	0.38	0.83	0.95	0.79	1.0	1.0	0.26	0.62	0.71	0.66	0.64	0.69	0.19	0.39	0.32	0.38	0.43	0.31	0.39	0.27	0.84	0.66	0.55
lcl\|BLLF01002653.1_cds_GFH24861.1_19338 (GFH24861)	0.83	0.41	0.48	0.67	0.82	0.55	0.5	1.0	0.57	0.61	0.62	0.45	0.58	0.63	0.47	0.21	0.34	0.62	0.35	0.31	0.42	0.19	0.33	0.23	0.62	0.45
lcl\|BLLF01002774.1_cds_GFH25293.1_19770 (GFH25293)	0.75	0.69	0.93	0.31	0.95	0.8	0.75	0.99	0.67	0.34	0.84	0.53	0.62	0.68	0.61	1.0	0.72	0.6	0.61	0.35	0.58	0.47	0.51	0.9	0.32	0.7
lcl\|BLLF01002804.1_cds_GFH25402.1_19879 (GFH25402)	0.55	0.0	0.0	0.74	0.34	0.24	0.47	0.18	0.52	0.64	0.23	0.15	0.27	0.14	0.8	0.45	1.0	0.35	0.0	0.6	0.48	0.0	0.7	0.42	0.4	0.08
lcl\|BLLF01002817.1_cds_GFH25448.1_19925 (GFH25448)	0.1	0.0	0.0	0.07	0.94	0.62	0.58	0.7	0.29	0.28	0.25	0.44	0.29	0.39	1.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.45	0.26	0.0	0.17	0.26	0.85	0.53
lcl\|BLLF01003089.1_cds_GFH26311.1_20788 (GFH26311)	0.0	0.88	0.53	0.18	0.47	0.62	0.59	1.0	0.54	0.3	0.48	0.54	0.55	0.71	0.68	0.32	0.5	0.2	0.4	0.44	0.11	0.33	0.2	0.05	0.24	0.41
lcl\|BLLF01003123.1_cds_GFH26421.1_20898 (GFH26421)	0.46	0.41	1.0	0.29	0.48	0.4	0.42	0.66	0.58	0.15	0.43	0.4	0.54	0.47	0.57	0.21	0.26	0.51	0.77	0.81	0.42	0.35	0.45	0.67	0.34	0.33
lcl\|BLLF01003170.1_cds_GFH26574.1_21051 (GFH26574)	0.17	0.48	0.87	0.09	0.54	0.41	0.77	1.0	0.79	0.79	0.56	0.31	0.59	0.81	0.71	0.64	0.85	0.45	0.16	0.1	0.52	0.41	0.4	0.16	0.29	0.62
lcl\|BLLF01003172.1_cds_GFH26583.1_21060 (GFH26583)	0.95	0.37	0.96	0.69	1.0	0.63	0.74	0.99	0.83	0.35	0.73	0.46	0.61	0.58	0.72	0.22	0.49	0.75	0.54	0.54	0.6	0.27	0.49	0.1	0.61	0.41
lcl\|BLLF01003221.1_cds_GFH26731.1_21208 (GFH26731)	0.7	0.58	1.0	0.75	0.67	0.58	0.63	0.67	0.77	0.66	0.52	0.48	0.58	0.44	0.61	0.32	0.47	0.41	0.39	0.52	0.32	0.39	0.29	0.3	0.8	0.78
lcl\|BLLF01003780.1_cds_GFH28201.1_22678 (GFH28201)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.45	0.82	0.57	0.22	0.0	0.76	1.0	0.09	0.42	0.72	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.76	0.39
lcl\|BLLF01004071.1_cds_GFH28858.1_23335 (GFH28858)	0.41	0.31	0.0	0.26	0.37	0.28	0.43	0.66	0.57	0.34	0.42	0.53	0.63	0.57	0.72	0.56	0.3	0.35	0.14	0.29	0.35	0.4	0.47	0.38	1.0	0.39
lcl\|BLLF01004133.1_cds_GFH28994.1_23471 (GFH28994)	0.0	0.67	0.0	0.83	0.41	0.81	0.62	0.66	0.46	0.07	0.64	1.0	0.6	0.79	0.44	0.53	0.55	0.11	0.18	0.18	0.0	0.35	0.23	0.29	0.18	0.2
lcl\|BLLF01004419.1_cds_GFH29571.1_24048 (GFH29571)	0.09	0.94	0.0	0.45	1.0	0.71	0.67	0.83	0.98	0.3	0.69	0.65	0.37	0.6	0.55	0.18	0.68	0.88	0.0	0.12	0.29	0.21	0.34	0.92	0.74	0.47
lcl\|BLLF01004577.1_cds_GFH29878.1_24355 (GFH29878)	0.32	0.63	1.0	0.43	0.71	0.72	0.47	0.64	0.52	0.19	0.69	0.53	0.47	0.6	0.29	0.99	0.81	0.32	0.16	0.13	0.26	0.12	0.33	0.49	0.44	0.57
lcl\|BLLF01005090.1_cds_GFH30720.1_25197 (GFH30720)	0.91	0.67	0.69	0.5	0.59	0.43	0.42	1.0	0.54	0.58	0.54	0.38	0.55	0.55	0.64	0.09	0.17	0.46	0.27	0.52	0.35	0.2	0.37	0.18	0.92	0.88
lcl\|BLLF01006507.1_cds_GFH32317.1_26794 (GFH32317)	0.64	0.59	1.0	0.0	0.96	0.71	0.58	0.95	0.66	0.28	0.84	0.8	0.66	0.65	0.68	0.14	0.21	0.81	0.32	0.39	0.54	0.83	0.65	0.56	0.87	0.86
lcl\|BLLF01006685.1_cds_GFH32471.1_26948 (GFH32471)	0.0	0.36	1.0	0.22	0.38	0.23	0.34	0.48	0.45	0.52	0.25	0.2	0.3	0.28	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.26
lcl\|BLLF01009297.1_cds_GFH33675.1_28152 (GFH33675)	0.52	0.46	1.0	0.85	0.59	0.4	0.41	0.48	0.51	0.37	0.44	0.25	0.36	0.3	0.42	0.16	0.24	0.48	0.51	0.31	0.33	0.18	0.27	0.03	0.37	0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)