Heatmap: Cluster_129 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000008.1_cds_GFH05779.1_256 (GFH05779)	0.0	0.52	0.0	0.54	0.4	0.48	1.0	0.33	0.73	0.56	0.4	0.4	0.74	0.33	0.53	0.12	0.09	0.18	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.1	0.68	0.81
lcl\|BLLF01000028.1_cds_GFH06224.1_701 (GFH06224)	0.0	0.12	0.0	0.01	0.06	0.21	0.7	0.03	1.0	0.37	0.06	0.1	0.49	0.01	0.57	0.02	0.01	0.01	0.09	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.15	0.24
lcl\|BLLF01000028.1_cds_GFH06225.1_702 (GFH06225)	0.01	0.23	0.0	0.01	0.09	0.22	0.87	0.05	1.0	0.71	0.08	0.12	0.58	0.02	0.57	0.05	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.15	0.22
lcl\|BLLF01000041.1_cds_GFH06480.1_957 (GFH06480)	0.05	0.08	0.0	0.05	0.19	0.18	0.65	0.29	1.0	0.45	0.18	0.18	0.55	0.23	0.7	0.35	0.42	0.1	0.1	0.07	0.08	0.11	0.11	0.21	0.53	0.42
lcl\|BLLF01000082.1_cds_GFH07237.1_1714 (GFH07237)	0.04	0.55	0.0	0.08	0.25	0.35	0.82	0.27	1.0	0.58	0.27	0.37	0.63	0.2	0.64	0.12	0.18	0.08	0.19	0.09	0.07	0.08	0.08	0.09	0.51	0.4
lcl\|BLLF01000085.1_cds_GFH07284.1_1761 (GFH07284)	0.23	0.0	0.0	0.01	0.09	0.08	1.0	0.17	0.38	0.01	0.17	0.27	0.6	0.3	0.62	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.71	0.62
lcl\|BLLF01000100.1_cds_GFH07524.1_2001 (GFH07524)	0.29	0.37	0.09	0.29	0.56	0.59	1.0	0.45	0.99	0.6	0.5	0.46	0.65	0.38	0.77	0.36	0.52	0.35	0.16	0.26	0.33	0.28	0.4	0.41	0.54	0.58
lcl\|BLLF01000197.1_cds_GFH08956.1_3433 (GFH08956)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.09	0.29	1.0	0.05	1.0	0.23	0.22	0.19	0.66	0.09	0.59	0.04	0.0	0.0	0.25	0.02	0.0	0.04	0.0	0.01	0.33	0.49
lcl\|BLLF01000278.1_cds_GFH09976.1_4453 (GFH09976)	0.03	0.05	0.0	0.01	0.06	0.06	0.94	0.03	1.0	0.0	0.02	0.04	0.12	0.01	0.71	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.25	0.06
lcl\|BLLF01000342.1_cds_GFH10739.1_5216 (GFH10739)	0.0	0.65	0.0	0.0	0.17	0.69	1.0	0.06	0.9	0.29	0.18	0.28	0.97	0.05	0.43	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.12	0.28
lcl\|BLLF01000342.1_cds_GFH10741.1_5218 (GFH10741)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.53	0.86	0.14	0.87	0.01	0.17	0.24	1.0	0.04	0.53	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000418.1_cds_GFH11611.1_6088 (GFH11611)	0.22	0.21	0.22	0.1	0.26	0.43	1.0	0.13	0.8	0.1	0.25	0.3	0.46	0.12	0.71	0.04	0.16	0.19	0.19	0.11	0.16	0.07	0.11	0.12	0.48	0.87
lcl\|BLLF01000459.1_cds_GFH12011.1_6488 (GFH12011)	0.0	0.64	0.0	0.09	0.09	0.31	1.0	0.08	0.66	0.38	0.09	0.14	0.42	0.03	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.04	0.7	0.62
lcl\|BLLF01000544.1_cds_GFH12821.1_7298 (GFH12821)	0.27	0.31	0.03	0.37	0.21	0.28	0.97	0.09	1.0	0.99	0.16	0.17	0.5	0.07	0.71	0.22	0.3	0.22	0.26	0.18	0.25	0.12	0.26	0.09	0.34	0.34
lcl\|BLLF01000544.1_cds_GFH12822.1_7299 (GFH12822)	0.28	0.25	0.0	0.52	0.2	0.28	1.0	0.11	0.83	0.65	0.18	0.19	0.44	0.07	0.54	0.26	0.4	0.32	0.18	0.13	0.25	0.13	0.25	0.21	0.46	0.42
lcl\|BLLF01000556.1_cds_GFH12936.1_7413 (GFH12936)	0.0	0.0	0.0	0.28	0.17	0.2	1.0	0.1	0.87	0.24	0.37	0.26	0.63	0.22	0.91	0.0	0.38	0.13	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.03	0.95	0.77
lcl\|BLLF01000725.1_cds_GFH14432.1_8909 (GFH14432)	0.16	0.26	0.14	0.25	0.28	0.44	1.0	0.27	0.96	0.34	0.29	0.32	0.46	0.23	0.7	0.55	0.63	0.28	0.21	0.12	0.24	0.3	0.26	0.25	0.5	0.35
lcl\|BLLF01000739.1_cds_GFH14545.1_9022 (GFH14545)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.28	0.78	0.03	1.0	0.6	0.07	0.13	0.93	0.01	0.73	0.1	0.02	0.0	0.16	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.16	0.27
lcl\|BLLF01000739.1_cds_GFH14546.1_9023 (GFH14546)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.1	0.27	0.79	0.06	1.0	0.32	0.12	0.14	0.75	0.01	0.57	0.06	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.11	0.11
lcl\|BLLF01000771.1_cds_GFH14828.1_9305 (GFH14828)	0.13	0.02	0.0	0.41	0.18	0.39	0.89	0.25	1.0	0.32	0.29	0.37	0.52	0.23	0.73	0.03	0.02	0.3	0.13	0.04	0.18	0.21	0.22	0.37	0.66	0.48
lcl\|BLLF01000865.1_cds_GFH15540.1_10017 (GFH15540)	0.02	0.5	0.0	0.31	0.12	0.19	1.0	0.03	0.61	0.66	0.18	0.17	0.38	0.04	0.54	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.01	0.0	0.58	0.58
lcl\|BLLF01001166.1_cds_GFH17551.1_12028 (GFH17551)	0.01	0.3	0.07	0.01	0.07	0.29	0.92	0.04	0.94	1.0	0.06	0.14	0.58	0.01	0.52	0.14	0.05	0.01	0.47	0.02	0.03	0.05	0.02	0.0	0.08	0.12
lcl\|BLLF01001166.1_cds_GFH17552.1_12029 (GFH17552)	0.0	0.1	0.0	0.0	0.05	0.19	0.92	0.04	1.0	0.53	0.05	0.09	0.44	0.01	0.62	0.05	0.03	0.01	0.36	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.08	0.12
lcl\|BLLF01001278.1_cds_GFH18293.1_12770 (GFH18293)	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.18	0.73	0.04	1.0	0.38	0.05	0.12	0.28	0.08	0.62	0.27	0.33	0.35	0.31	0.12	0.1	0.0	0.62	0.13	0.45	0.54
lcl\|BLLF01001598.1_cds_GFH20221.1_14698 (GFH20221)	0.03	0.0	0.0	0.02	0.08	0.27	0.71	0.03	0.77	0.15	0.08	0.15	1.0	0.02	0.65	0.15	0.08	0.02	0.2	0.03	0.0	0.05	0.05	0.02	0.15	0.22
lcl\|BLLF01001942.1_cds_GFH21972.1_16449 (GFH21972)	0.0	0.0	0.0	0.21	0.02	0.11	0.92	0.02	1.0	0.0	0.05	0.12	0.28	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.05	0.11	0.0
lcl\|BLLF01001975.1_cds_GFH22130.1_16607 (GFH22130)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.02	0.03	0.92	0.03	1.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05
lcl\|BLLF01002129.1_cds_GFH22814.1_17291 (GFH22814)	0.05	0.18	0.0	0.09	0.21	0.37	0.69	0.14	1.0	0.38	0.25	0.23	0.61	0.13	0.55	0.12	0.06	0.12	0.06	0.05	0.13	0.15	0.08	0.07	0.57	0.65
lcl\|BLLF01002324.1_cds_GFH23655.1_18132 (GFH23655)	0.03	0.04	0.0	0.0	0.04	0.22	1.0	0.05	0.99	0.0	0.05	0.09	0.32	0.02	0.53	0.0	0.0	0.0	0.12	0.07	0.0	0.0	0.0	0.1	0.11	0.06
lcl\|BLLF01002698.1_cds_GFH25033.1_19510 (GFH25033)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.07	0.89	0.04	1.0	0.12	0.03	0.07	0.21	0.01	0.59	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.07
lcl\|BLLF01002709.1_cds_GFH25074.1_19551 (GFH25074)	0.07	0.14	0.0	0.37	0.24	0.34	1.0	0.17	0.94	0.1	0.23	0.28	0.59	0.12	0.8	0.19	0.17	0.08	0.22	0.1	0.04	0.15	0.09	0.2	0.69	0.73
lcl\|BLLF01002816.1_cds_GFH25442.1_19919 (GFH25442)	0.06	0.01	0.0	0.08	0.03	0.25	1.0	0.05	0.81	0.13	0.09	0.36	0.5	0.09	0.58	0.12	0.32	0.0	0.43	0.04	0.0	0.15	0.0	0.2	0.29	0.18
lcl\|BLLF01002908.1_cds_GFH25749.1_20226 (GFH25749)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.12	0.2	0.63	0.08	1.0	0.32	0.06	0.12	0.58	0.0	0.68	0.08	0.09	0.0	0.19	0.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.15	0.1
lcl\|BLLF01003227.1_cds_GFH26749.1_21226 (GFH26749)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.06	0.13	1.0	0.07	0.86	0.61	0.09	0.13	0.32	0.01	0.7	0.07	0.11	0.0	0.08	0.0	0.0	0.09	0.0	0.02	0.51	0.36
lcl\|BLLF01003614.1_cds_GFH27774.1_22251 (GFH27774)	0.15	0.39	0.0	0.01	0.27	0.36	0.97	0.18	0.78	0.32	0.2	0.3	0.47	0.2	0.62	0.57	0.36	0.1	0.05	0.03	0.18	0.1	0.16	0.04	0.79	1.0
lcl\|BLLF01003757.1_cds_GFH28137.1_22614 (GFH28137)	0.42	0.01	0.0	0.23	0.07	0.21	1.0	0.08	0.71	0.86	0.18	0.18	0.67	0.09	0.5	0.38	0.52	0.25	0.3	0.0	0.07	0.0	0.3	0.08	0.55	0.22
lcl\|BLLF01003757.1_cds_GFH28138.1_22615 (GFH28138)	0.26	0.2	0.07	0.2	0.14	0.3	1.0	0.07	0.77	0.92	0.2	0.26	0.61	0.12	0.44	0.15	0.2	0.29	0.06	0.04	0.26	0.07	0.17	0.05	0.54	0.41
lcl\|BLLF01003814.1_cds_GFH28279.1_22756 (GFH28279)	0.26	0.16	0.14	0.28	0.33	0.44	0.8	0.32	1.0	0.41	0.37	0.32	0.79	0.27	0.86	0.18	0.36	0.51	0.15	0.1	0.49	0.1	0.4	0.12	0.26	0.35
lcl\|BLLF01003819.1_cds_GFH28293.1_22770 (GFH28293)	0.26	0.01	0.0	0.0	0.14	0.14	0.94	0.07	0.83	1.0	0.1	0.16	0.59	0.06	0.69	0.0	0.02	0.09	0.52	0.08	0.1	0.07	0.09	0.04	0.58	0.55
lcl\|BLLF01003947.1_cds_GFH28593.1_23070 (GFH28593)	0.0	0.0	0.25	0.09	0.09	0.14	1.0	0.13	0.94	0.19	0.1	0.19	0.43	0.03	0.76	0.0	0.29	0.1	0.46	0.09	0.14	0.16	0.0	0.2	0.19	0.05
lcl\|BLLF01004252.1_cds_GFH29241.1_23718 (GFH29241)	0.31	0.51	0.0	0.19	0.35	0.38	0.99	0.3	1.0	0.93	0.5	0.3	0.87	0.27	0.68	0.6	0.49	0.59	0.33	0.22	0.49	0.28	0.53	0.21	0.38	0.65
lcl\|BLLF01004277.1_cds_GFH29295.1_23772 (GFH29295)	0.01	0.28	0.04	0.01	0.09	0.34	0.97	0.03	1.0	0.44	0.07	0.14	0.72	0.01	0.56	0.09	0.01	0.01	0.12	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.09	0.15
lcl\|BLLF01004494.1_cds_GFH29723.1_24200 (GFH29723)	0.29	0.04	0.02	0.33	0.06	0.14	1.0	0.06	0.91	0.57	0.06	0.1	0.26	0.03	0.71	0.02	0.02	0.02	0.21	0.08	0.02	0.06	0.01	0.03	0.47	0.29
lcl\|BLLF01005275.1_cds_GFH30996.1_25473 (GFH30996)	0.01	0.01	0.06	0.0	0.24	0.27	1.0	0.11	0.65	0.07	0.22	0.26	0.61	0.02	0.6	0.24	0.21	0.14	0.34	0.08	0.08	0.18	0.14	0.04	0.04	0.03
lcl\|BLLF01005400.1_cds_GFH31140.1_25617 (GFH31140)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.35	0.9	0.08	1.0	0.33	0.12	0.19	0.8	0.02	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.03	0.1	0.16
lcl\|BLLF01005400.1_cds_GFH31141.1_25618 (GFH31141)	0.07	0.08	0.0	0.05	0.17	0.36	0.93	0.12	0.84	1.0	0.17	0.16	0.68	0.09	0.67	0.11	0.2	0.18	0.16	0.14	0.17	0.15	0.13	0.05	0.28	0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)