Heatmap: Cluster_220 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000025.1_cds_GFH06168.1_645 (GFH06168)	0.12	0.0	0.0	0.22	0.37	0.24	0.15	0.18	0.15	0.14	0.23	0.13	0.2	0.08	0.14	0.42	0.48	1.0	0.23	0.55	0.76	0.08	0.6	0.12	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000028.1_cds_GFH06213.1_690 (GFH06213)	0.31	0.12	0.0	0.22	0.42	0.39	0.24	0.32	0.22	0.25	0.4	0.24	0.26	0.39	0.19	0.7	0.55	1.0	0.62	0.67	0.81	0.19	0.58	0.25	0.24	0.21
lcl\|BLLF01000063.1_cds_GFH06922.1_1399 (GFH06922)	0.44	0.04	0.06	0.09	0.33	0.31	0.32	0.17	0.29	0.3	0.33	0.25	0.22	0.2	0.25	0.4	0.45	1.0	0.43	0.68	0.96	0.57	0.76	0.23	0.3	0.35
lcl\|BLLF01000079.1_cds_GFH07181.1_1658 (GFH07181)	0.58	0.2	0.0	0.31	0.08	0.1	0.11	0.04	0.17	0.56	0.08	0.09	0.15	0.06	0.09	0.34	0.19	1.0	0.18	0.38	0.73	0.37	0.62	0.07	0.18	0.13
lcl\|BLLF01000115.1_cds_GFH07772.1_2249 (GFH07772)	0.05	0.01	0.0	0.52	0.08	0.07	0.08	0.06	0.04	0.0	0.17	0.22	0.2	0.3	0.1	0.77	0.7	0.49	0.62	0.35	0.84	0.72	1.0	0.37	0.06	0.06
lcl\|BLLF01000116.1_cds_GFH07795.1_2272 (GFH07795)	0.5	0.13	0.0	0.26	0.26	0.28	0.31	0.18	0.29	0.49	0.35	0.23	0.26	0.22	0.19	0.39	0.58	0.85	0.2	0.24	1.0	0.29	0.64	0.26	0.25	0.25
lcl\|BLLF01000135.1_cds_GFH08066.1_2543 (GFH08066)	0.52	0.08	0.0	0.18	0.1	0.14	0.15	0.07	0.23	0.54	0.13	0.1	0.12	0.11	0.12	0.4	0.37	0.85	0.22	0.13	1.0	0.23	0.81	0.11	0.19	0.21
lcl\|BLLF01000170.1_cds_GFH08580.1_3057 (GFH08580)	0.15	0.16	0.07	0.33	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.0	0.07	0.06	0.07	0.12	0.03	1.0	0.44	0.58	0.42	0.52	0.54	0.31	0.66	0.35	0.05	0.12
lcl\|BLLF01000263.1_cds_GFH09793.1_4270 (GFH09793)	0.52	0.18	0.06	0.13	0.37	0.28	0.2	0.16	0.18	0.48	0.3	0.21	0.2	0.19	0.14	0.52	0.64	0.83	0.37	1.0	0.8	0.45	0.66	0.3	0.22	0.26
lcl\|BLLF01000271.1_cds_GFH09872.1_4349 (GFH09872)	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.08	0.08	0.02	0.04	0.26	0.12	0.04	0.13	0.15	0.06	0.0	0.41	0.86	0.43	0.73	0.79	0.0	1.0	0.06	0.03	0.1
lcl\|BLLF01000276.1_cds_GFH09941.1_4418 (GFH09941)	0.33	0.19	0.0	0.21	0.25	0.14	0.07	0.04	0.08	0.19	0.1	0.04	0.12	0.08	0.08	0.53	0.32	0.77	0.6	1.0	0.8	0.36	1.0	0.27	0.08	0.14
lcl\|BLLF01000308.1_cds_GFH10339.1_4816 (GFH10339)	0.23	0.21	0.0	0.21	0.13	0.32	0.16	0.17	0.08	0.39	0.29	0.2	0.34	0.22	0.08	0.55	0.56	1.0	0.65	0.5	0.78	0.36	0.81	0.11	0.32	0.38
lcl\|BLLF01000364.1_cds_GFH10994.1_5471 (GFH10994)	0.21	0.0	0.0	0.21	0.1	0.1	0.1	0.22	0.16	0.53	0.1	0.09	0.2	0.22	0.14	0.1	0.26	1.0	0.5	0.57	1.0	0.43	0.52	0.07	0.18	0.16
lcl\|BLLF01000378.1_cds_GFH11146.1_5623 (GFH11146)	0.16	0.2	0.0	0.1	0.09	0.25	0.12	0.05	0.09	0.62	0.18	0.17	0.15	0.19	0.12	0.67	0.48	0.74	0.27	0.49	1.0	0.28	0.55	0.28	0.09	0.12
lcl\|BLLF01000431.1_cds_GFH11742.1_6219 (GFH11742)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.17	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.25	0.07	1.0	0.44	0.91	0.73	0.3	0.8	0.13	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000447.1_cds_GFH11900.1_6377 (GFH11900)	0.17	0.0	0.0	0.1	0.16	0.22	0.07	0.07	0.06	0.05	0.2	0.14	0.24	0.23	0.04	0.38	0.45	0.89	0.62	0.65	0.57	0.28	1.0	0.04	0.36	0.37
lcl\|BLLF01000447.1_cds_GFH11901.1_6378 (GFH11901)	0.88	0.34	0.32	0.41	0.43	0.3	0.26	0.23	0.28	0.53	0.38	0.22	0.22	0.19	0.19	0.77	0.91	0.98	0.74	0.97	0.88	0.48	1.0	0.43	0.63	0.5
lcl\|BLLF01000512.1_cds_GFH12520.1_6997 (GFH12520)	0.35	0.13	0.13	0.28	0.38	0.49	0.34	0.19	0.28	0.37	0.38	0.34	0.26	0.31	0.23	0.5	0.53	1.0	0.31	0.75	0.88	0.17	0.8	0.27	0.21	0.32
lcl\|BLLF01000541.1_cds_GFH12803.1_7280 (GFH12803)	0.49	0.0	0.0	0.23	0.08	0.07	0.1	0.05	0.13	0.51	0.06	0.07	0.11	0.07	0.16	0.13	0.18	0.96	0.73	0.8	1.0	0.31	0.78	0.11	0.11	0.17
lcl\|BLLF01000563.1_cds_GFH12995.1_7472 (GFH12995)	0.4	0.21	0.0	0.2	0.19	0.19	0.2	0.14	0.2	0.13	0.18	0.21	0.28	0.25	0.22	0.41	0.14	0.93	0.62	0.3	0.92	0.3	1.0	0.14	0.36	0.3
lcl\|BLLF01000640.1_cds_GFH13682.1_8159 (GFH13682)	0.26	0.06	0.0	0.27	0.15	0.15	0.17	0.11	0.16	0.31	0.21	0.13	0.11	0.21	0.12	0.54	1.0	0.99	0.22	0.25	0.83	0.37	0.84	0.07	0.22	0.2
lcl\|BLLF01000657.1_cds_GFH13838.1_8315 (GFH13838)	0.1	0.02	0.14	0.11	0.15	0.16	0.15	0.08	0.12	0.39	0.18	0.13	0.1	0.12	0.07	0.68	0.41	0.82	0.19	0.88	1.0	0.15	0.92	0.2	0.06	0.1
lcl\|BLLF01000860.1_cds_GFH15507.1_9984 (GFH15507)	0.41	0.09	0.0	0.05	0.21	0.11	0.07	0.06	0.12	0.45	0.2	0.12	0.1	0.16	0.11	0.4	0.22	1.0	0.25	0.51	0.87	0.41	0.78	0.07	0.14	0.21
lcl\|BLLF01000911.1_cds_GFH15863.1_10340 (GFH15863)	0.26	0.34	0.08	0.48	0.39	0.46	0.53	0.19	0.45	0.38	0.45	0.45	0.36	0.35	0.37	0.82	0.62	1.0	0.35	0.7	0.92	0.67	0.86	0.39	0.38	0.33
lcl\|BLLF01001045.1_cds_GFH16747.1_11224 (GFH16747)	0.0	0.0	0.0	0.15	0.09	0.1	0.11	0.12	0.1	0.29	0.1	0.07	0.09	0.1	0.07	0.11	0.31	1.0	0.53	0.6	0.73	0.23	0.93	0.07	0.09	0.06
lcl\|BLLF01001203.1_cds_GFH17800.1_12277 (GFH17800)	0.48	0.11	0.3	0.25	0.28	0.23	0.16	0.36	0.27	0.42	0.26	0.22	0.2	0.26	0.28	0.26	0.29	0.94	0.31	0.45	1.0	0.53	0.75	0.2	0.36	0.36
lcl\|BLLF01001278.1_cds_GFH18289.1_12766 (GFH18289)	0.4	0.05	0.04	0.01	0.28	0.26	0.19	0.1	0.14	0.69	0.28	0.19	0.19	0.15	0.12	0.51	0.81	1.0	0.3	0.23	0.84	0.37	0.76	0.09	0.18	0.16
lcl\|BLLF01001298.1_cds_GFH18422.1_12899 (GFH18422)	0.38	0.07	0.0	0.11	0.27	0.21	0.26	0.15	0.3	0.28	0.28	0.19	0.26	0.21	0.29	0.52	0.94	1.0	0.31	0.35	0.8	0.35	0.85	0.16	0.2	0.08
lcl\|BLLF01001309.1_cds_GFH18497.1_12974 (GFH18497)	0.54	0.55	0.28	0.49	0.43	0.27	0.3	0.26	0.29	0.47	0.41	0.26	0.35	0.26	0.35	0.77	0.87	1.0	0.69	0.64	0.92	0.96	0.93	0.63	0.62	0.38
lcl\|BLLF01001345.1_cds_GFH18727.1_13204 (GFH18727)	0.42	0.11	0.0	0.23	0.16	0.28	0.24	0.1	0.24	0.54	0.24	0.23	0.28	0.2	0.19	0.57	0.37	1.0	0.47	0.36	0.91	0.38	0.74	0.12	0.36	0.47
lcl\|BLLF01001392.1_cds_GFH19014.1_13491 (GFH19014)	0.1	0.04	0.08	0.27	0.22	0.24	0.23	0.12	0.2	0.52	0.26	0.2	0.32	0.25	0.13	0.81	0.6	0.81	0.38	0.4	1.0	0.37	0.63	0.45	0.23	0.23
lcl\|BLLF01001434.1_cds_GFH19272.1_13749 (GFH19272)	0.24	0.06	0.0	0.2	0.46	0.3	0.29	0.29	0.3	0.45	0.4	0.28	0.3	0.28	0.26	0.71	0.89	0.88	0.51	0.75	1.0	0.53	0.82	0.48	0.33	0.37
lcl\|BLLF01001453.1_cds_GFH19382.1_13859 (GFH19382)	0.4	0.0	0.0	0.09	0.33	0.39	0.25	0.12	0.25	0.66	0.32	0.2	0.23	0.2	0.2	0.54	0.79	0.95	0.36	0.66	1.0	0.15	0.88	0.18	0.18	0.21
lcl\|BLLF01001507.1_cds_GFH19709.1_14186 (GFH19709)	0.52	0.31	0.26	0.19	0.38	0.28	0.2	0.36	0.26	0.46	0.35	0.26	0.35	0.26	0.27	0.32	0.45	0.95	0.47	0.66	1.0	0.71	0.79	0.13	0.19	0.27
lcl\|BLLF01001526.1_cds_GFH19828.1_14305 (GFH19828)	0.09	0.04	0.13	0.28	0.35	0.24	0.33	0.22	0.36	0.22	0.42	0.34	0.31	0.31	0.39	1.0	0.62	0.72	0.52	0.18	0.9	0.38	0.45	0.3	0.24	0.26
lcl\|BLLF01001936.1_cds_GFH21946.1_16423 (GFH21946)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.08	0.02	0.0	0.02	0.02	1.0	0.25	0.39	0.54	0.31	0.36	0.2	0.76	0.43	0.03	0.0
lcl\|BLLF01001997.1_cds_GFH22234.1_16711 (GFH22234)	0.25	0.05	0.0	0.04	0.02	0.05	0.02	0.04	0.01	0.41	0.04	0.07	0.05	0.1	0.0	0.0	0.13	1.0	0.34	0.58	0.88	0.07	0.5	0.07	0.06	0.22
lcl\|BLLF01002100.1_cds_GFH22690.1_17167 (GFH22690)	0.43	0.3	0.01	0.52	0.23	0.18	0.13	0.06	0.13	0.27	0.24	0.12	0.18	0.15	0.13	0.74	0.59	0.9	0.24	0.78	1.0	0.52	0.97	0.5	0.14	0.19
lcl\|BLLF01002116.1_cds_GFH22756.1_17233 (GFH22756)	0.15	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.54	0.03	0.01	0.07	0.04	0.07	0.0	0.07	0.47	0.28	0.54	1.0	0.39	0.57	0.05	0.05	0.17
lcl\|BLLF01002268.1_cds_GFH23420.1_17897 (GFH23420)	0.45	0.0	0.0	0.0	0.08	0.32	0.19	0.11	0.09	0.26	0.12	0.16	0.06	0.2	0.04	0.51	0.52	0.91	0.38	0.43	1.0	0.17	0.61	0.06	0.23	0.35
lcl\|BLLF01002303.1_cds_GFH23568.1_18045 (GFH23568)	0.19	0.04	0.01	0.19	0.19	0.27	0.3	0.18	0.17	0.47	0.28	0.18	0.23	0.25	0.16	0.9	0.71	0.67	0.58	0.67	1.0	0.23	0.95	0.44	0.14	0.15
lcl\|BLLF01002671.1_cds_GFH24928.1_19405 (GFH24928)	0.02	0.02	0.0	0.04	0.12	0.09	0.07	0.18	0.07	0.54	0.17	0.06	0.05	0.15	0.04	0.34	0.5	0.92	0.6	0.86	1.0	0.17	0.85	0.08	0.07	0.13
lcl\|BLLF01002931.1_cds_GFH25832.1_20309 (GFH25832)	0.26	0.09	0.0	0.22	0.45	0.41	0.39	0.2	0.34	0.35	0.49	0.39	0.29	0.3	0.34	1.0	0.7	0.71	0.41	0.66	0.82	0.76	0.8	0.25	0.23	0.18
lcl\|BLLF01002931.1_cds_GFH25833.1_20310 (GFH25833)	0.46	0.24	0.05	0.24	0.47	0.35	0.52	0.24	0.38	0.38	0.51	0.36	0.35	0.38	0.38	0.79	0.72	0.71	0.64	0.99	0.87	1.0	0.85	0.27	0.39	0.2
lcl\|BLLF01003017.1_cds_GFH26086.1_20563 (GFH26086)	0.06	0.05	0.0	0.15	0.14	0.24	0.14	0.05	0.08	0.28	0.18	0.14	0.09	0.1	0.03	0.45	0.61	1.0	0.16	0.98	0.83	0.21	0.64	0.09	0.09	0.14
lcl\|BLLF01003106.1_cds_GFH26363.1_20840 (GFH26363)	0.32	0.29	0.3	0.22	0.19	0.17	0.2	0.1	0.27	0.63	0.17	0.16	0.26	0.12	0.26	0.29	0.4	0.97	0.87	1.0	0.99	0.52	0.9	0.12	0.15	0.2
lcl\|BLLF01003137.1_cds_GFH26461.1_20938 (GFH26461)	0.56	0.3	0.03	0.11	0.11	0.2	0.14	0.08	0.11	0.22	0.21	0.18	0.13	0.19	0.07	0.36	0.33	1.0	0.6	0.46	0.89	0.4	0.93	0.12	0.25	0.37
lcl\|BLLF01003175.1_cds_GFH26595.1_21072 (GFH26595)	0.7	0.6	0.23	0.44	0.42	0.34	0.31	0.21	0.3	0.53	0.32	0.37	0.28	0.23	0.29	0.67	0.95	0.99	0.73	1.0	0.84	1.0	0.82	0.73	0.65	0.58
lcl\|BLLF01003198.1_cds_GFH26671.1_21148 (GFH26671)	0.54	0.12	0.07	0.25	0.14	0.16	0.14	0.2	0.21	0.52	0.14	0.14	0.15	0.19	0.21	0.25	0.4	0.95	0.57	0.6	0.8	0.67	1.0	0.15	0.21	0.27
lcl\|BLLF01003591.1_cds_GFH27721.1_22198 (GFH27721)	0.31	0.43	0.0	0.24	0.28	0.44	0.31	0.27	0.34	0.73	0.3	0.36	0.26	0.3	0.25	0.82	0.68	0.88	0.5	0.7	1.0	0.44	0.87	0.37	0.26	0.33
lcl\|BLLF01003776.1_cds_GFH28190.1_22667 (GFH28190)	0.09	0.03	0.0	0.63	0.04	0.05	0.07	0.02	0.11	0.06	0.12	0.09	0.12	0.1	0.2	0.91	0.79	0.76	0.3	0.83	0.84	0.62	1.0	0.41	0.11	0.18
lcl\|BLLF01004193.1_cds_GFH29122.1_23599 (GFH29122)	0.34	0.02	0.0	0.22	0.2	0.26	0.21	0.14	0.18	0.38	0.18	0.18	0.15	0.14	0.15	0.2	0.31	0.88	0.03	0.01	1.0	0.08	0.45	0.06	0.09	0.2
lcl\|BLLF01004248.1_cds_GFH29234.1_23711 (GFH29234)	0.25	0.0	0.0	0.08	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.33	0.03	0.07	0.1	0.05	0.0	0.23	0.09	1.0	0.06	0.25	0.53	0.17	0.5	0.04	0.03	0.04
lcl\|BLLF01006515.1_cds_GFH32323.1_26800 (GFH32323)	0.09	0.06	0.0	0.14	0.28	0.15	0.09	0.25	0.12	0.45	0.16	0.12	0.12	0.24	0.19	0.3	0.68	0.8	0.47	0.64	1.0	0.06	0.54	0.15	0.13	0.1
lcl\|BLLF01006900.1_cds_GFH32635.1_27112 (GFH32635)	0.33	0.13	0.17	0.26	0.54	0.39	0.51	0.29	0.45	0.37	0.49	0.39	0.45	0.35	0.41	1.0	0.68	0.7	0.69	0.53	0.77	0.56	0.59	0.36	0.24	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)