Heatmap: Cluster_118 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000039.1_cds_GFH06447.1_924 (GFH06447)	0.1	0.01	0.0	0.22	0.16	0.08	0.07	0.03	0.08	0.16	0.08	0.04	0.06	0.05	0.04	1.0	0.41	0.15	0.11	0.33	0.1	0.01	0.1	0.14	0.04	0.11
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06906.1_1383 (GFH06906)	0.23	0.01	0.02	0.08	0.03	0.03	0.05	0.08	0.01	0.0	0.03	0.08	0.04	0.08	0.1	1.0	0.19	0.2	0.0	0.21	0.07	0.23	0.34	0.26	0.06	0.03
lcl\|BLLF01000080.1_cds_GFH07191.1_1668 (GFH07191)	0.49	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.72	0.06	0.07	0.07	0.01	0.08	0.04	0.1	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01000112.1_cds_GFH07726.1_2203 (GFH07726)	0.36	0.01	0.0	0.24	0.12	0.11	0.19	0.08	0.14	0.15	0.12	0.12	0.17	0.14	0.26	1.0	0.57	0.08	0.0	0.08	0.08	0.0	0.21	0.03	0.05	0.04
lcl\|BLLF01000130.1_cds_GFH07993.1_2470 (GFH07993)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000182.1_cds_GFH08754.1_3231 (GFH08754)	0.43	0.32	0.09	0.13	0.33	0.32	0.3	0.28	0.33	0.49	0.22	0.25	0.32	0.24	0.2	0.76	0.43	0.47	0.24	1.0	0.49	0.05	0.42	0.1	0.44	0.99
lcl\|BLLF01000196.1_cds_GFH08947.1_3424 (GFH08947)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.13	0.02	0.1	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.0	1.0	0.35	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.09
lcl\|BLLF01000240.1_cds_GFH09519.1_3996 (GFH09519)	0.36	0.0	0.0	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.03	0.03	0.05	0.0	0.03	1.0	0.2	0.3	0.0	0.24	0.0	0.2	0.0	0.08	0.05	0.0
lcl\|BLLF01000299.1_cds_GFH10247.1_4724 (GFH10247)	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.08
lcl\|BLLF01000444.1_cds_GFH11870.1_6347 (GFH11870)	0.46	0.0	0.0	0.03	0.04	0.07	0.14	0.07	0.1	0.15	0.09	0.09	0.16	0.21	0.2	1.0	0.53	0.07	0.05	0.06	0.15	0.05	0.12	0.04	0.1	0.08
lcl\|BLLF01000453.1_cds_GFH11964.1_6441 (GFH11964)	0.31	0.03	0.0	1.0	0.02	0.03	0.25	0.03	0.25	0.0	0.02	0.06	0.05	0.02	0.28	0.9	0.11	0.14	0.06	0.06	0.0	0.18	0.07	0.02	0.04	0.05
lcl\|BLLF01000474.1_cds_GFH12166.1_6643 (GFH12166)	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.72	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000551.1_cds_GFH12891.1_7368 (GFH12891)	0.23	0.35	0.32	0.29	0.22	0.36	0.21	0.2	0.22	0.62	0.14	0.13	0.05	0.07	0.17	1.0	0.94	0.24	0.58	0.99	0.15	0.35	0.28	0.05	0.36	0.58
lcl\|BLLF01000628.1_cds_GFH13570.1_8047 (GFH13570)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000628.1_cds_GFH13578.1_8055 (GFH13578)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.04	0.09	0.08	0.0	0.27	0.04	0.0	0.09	0.04	0.0	0.75	0.56	0.29	0.0	1.0	0.0	0.0	0.58	0.13	0.41	0.14
lcl\|BLLF01000737.1_cds_GFH14528.1_9005 (GFH14528)	0.21	0.22	0.21	0.86	0.14	0.06	0.1	0.13	0.07	0.21	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.59	0.29	0.25	0.5	1.0	0.41	0.17	0.26	0.11	0.25	0.24
lcl\|BLLF01000854.1_cds_GFH15461.1_9938 (GFH15461)	0.23	0.07	0.0	0.16	0.36	0.3	0.28	0.07	0.21	0.81	0.22	0.2	0.12	0.1	0.11	0.9	0.16	0.1	0.03	1.0	0.22	0.08	0.14	0.29	0.29	0.31
lcl\|BLLF01000969.1_cds_GFH16254.1_10731 (GFH16254)	0.03	0.21	0.0	0.96	0.04	0.15	0.13	0.04	0.15	0.26	0.1	0.11	0.07	0.04	0.09	0.15	0.76	0.24	0.0	1.0	0.0	0.15	0.39	0.17	0.16	0.28
lcl\|BLLF01001104.1_cds_GFH17148.1_11625 (GFH17148)	0.1	0.2	0.12	0.06	0.2	0.22	0.19	0.08	0.17	0.6	0.14	0.11	0.17	0.08	0.12	0.73	0.28	0.31	0.04	1.0	0.1	0.15	0.31	0.08	0.17	0.6
lcl\|BLLF01001108.1_cds_GFH17179.1_11656 (GFH17179)	0.44	0.04	0.0	0.44	0.11	0.22	0.51	0.06	0.33	0.11	0.15	0.16	0.17	0.2	0.3	1.0	0.55	0.29	0.45	0.46	0.33	0.28	0.3	0.14	0.18	0.23
lcl\|BLLF01001123.1_cds_GFH17280.1_11757 (GFH17280)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001234.1_cds_GFH17999.1_12476 (GFH17999)	0.0	0.12	0.0	0.35	0.0	0.06	0.03	0.13	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.06	0.27	1.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.1	0.12	0.05
lcl\|BLLF01001309.1_cds_GFH18500.1_12977 (GFH18500)	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001389.1_cds_GFH18985.1_13462 (GFH18985)	0.26	0.02	0.0	0.27	0.19	0.11	0.19	0.15	0.21	0.17	0.19	0.15	0.12	0.23	0.2	1.0	0.49	0.12	0.0	0.14	0.16	0.07	0.19	0.07	0.07	0.07
lcl\|BLLF01001500.1_cds_GFH19669.1_14146 (GFH19669)	0.08	0.0	0.0	0.17	0.0	0.18	0.03	0.0	0.03	0.0	0.07	0.05	0.0	0.04	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.0
lcl\|BLLF01001561.1_cds_GFH20031.1_14508 (GFH20031)	0.04	0.07	0.0	0.11	0.22	0.07	0.12	0.1	0.14	0.24	0.0	0.04	0.1	0.11	0.23	1.0	0.52	0.13	0.0	0.66	0.0	0.21	0.26	0.18	0.06	0.06
lcl\|BLLF01001592.1_cds_GFH20191.1_14668 (GFH20191)	0.25	0.08	0.0	0.09	0.07	0.11	0.11	0.1	0.11	0.87	0.13	0.08	0.08	0.11	0.09	0.84	0.18	0.08	0.0	1.0	0.08	0.0	0.0	0.07	0.3	0.35
lcl\|BLLF01001770.1_cds_GFH21150.1_15627 (GFH21150)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002029.1_cds_GFH22380.1_16857 (GFH22380)	0.44	0.02	0.13	0.28	0.49	0.16	0.13	0.04	0.11	0.05	0.35	0.1	0.08	0.03	0.11	1.0	0.82	0.14	0.07	0.34	0.03	0.2	0.08	0.04	0.2	0.51
lcl\|BLLF01002029.1_cds_GFH22381.1_16858 (GFH22381)	0.4	0.09	0.03	0.33	0.39	0.35	0.17	0.08	0.1	0.0	0.49	0.11	0.06	0.08	0.1	0.92	1.0	0.07	0.0	0.3	0.0	0.0	0.07	0.07	0.2	0.69
lcl\|BLLF01002031.1_cds_GFH22393.1_16870 (GFH22393)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.1	0.15	0.13	0.06	0.05	0.15	0.1	0.13	0.14	0.03	0.08	1.0	0.46	0.08	0.12	0.41	0.11	0.0	0.16	0.0	0.2	0.09
lcl\|BLLF01002031.1_cds_GFH22395.1_16872 (GFH22395)	0.07	0.0	0.0	0.05	0.08	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.08	0.04	0.07	0.03	0.04	1.0	0.35	0.22	0.11	0.44	0.05	0.12	0.04	0.0	0.04	0.03
lcl\|BLLF01002478.1_cds_GFH24230.1_18707 (GFH24230)	0.21	0.01	0.3	0.21	0.21	0.15	0.1	0.04	0.08	0.27	0.11	0.07	0.05	0.04	0.04	0.48	1.0	0.23	0.13	0.75	0.23	0.17	0.28	0.06	0.13	0.26
lcl\|BLLF01002571.1_cds_GFH24562.1_19039 (GFH24562)	0.15	0.03	0.0	0.3	0.21	0.17	0.13	0.06	0.17	0.31	0.13	0.09	0.12	0.08	0.17	1.0	0.4	0.19	0.17	0.65	0.26	0.09	0.27	0.21	0.11	0.06
lcl\|BLLF01003039.1_cds_GFH26149.1_20626 (GFH26149)	0.16	0.0	0.0	0.44	0.09	0.04	0.02	0.0	0.05	0.24	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	1.0	0.12	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.24
lcl\|BLLF01003163.1_cds_GFH26549.1_21026 (GFH26549)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003173.1_cds_GFH26585.1_21062 (GFH26585)	0.44	0.0	0.0	0.8	0.08	0.12	0.15	0.09	0.23	0.1	0.05	0.11	0.12	0.0	0.27	1.0	0.42	0.11	0.67	0.38	0.31	0.18	0.11	0.04	0.18	0.08
lcl\|BLLF01003194.1_cds_GFH26659.1_21136 (GFH26659)	0.16	0.21	0.0	0.25	0.34	0.13	0.13	0.01	0.15	0.0	0.2	0.07	0.13	0.16	0.06	0.54	1.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.29	0.04	0.11	0.38
lcl\|BLLF01003303.1_cds_GFH26966.1_21443 (GFH26966)	0.38	0.0	0.0	0.09	0.16	0.12	0.08	0.05	0.03	0.14	0.07	0.04	0.09	0.1	0.1	1.0	0.38	0.18	0.09	0.05	0.19	0.26	0.12	0.04	0.06	0.01
lcl\|BLLF01003312.1_cds_GFH26992.1_21469 (GFH26992)	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003589.1_cds_GFH27715.1_22192 (GFH27715)	0.18	0.03	0.0	0.0	0.14	0.14	0.16	0.16	0.17	0.31	0.13	0.08	0.1	0.12	0.12	1.0	0.45	0.33	0.09	0.4	0.22	0.08	0.14	0.05	0.19	0.18
lcl\|BLLF01003677.1_cds_GFH27933.1_22410 (GFH27933)	0.2	0.02	0.0	0.66	0.12	0.06	0.09	0.15	0.14	0.45	0.14	0.08	0.17	0.13	0.15	0.2	0.18	0.19	0.19	1.0	0.3	0.05	0.25	0.07	0.06	0.08
lcl\|BLLF01003791.1_cds_GFH28231.1_22708 (GFH28231)	0.26	0.0	0.0	0.05	0.13	0.07	0.02	0.03	0.0	0.0	0.08	0.02	0.0	0.05	0.09	1.0	0.12	0.13	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.03
lcl\|BLLF01003972.1_cds_GFH28639.1_23116 (GFH28639)	0.01	0.05	0.0	0.04	0.11	0.03	0.03	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	1.0	0.57	0.04	0.02	0.63	0.09	0.02	0.04	0.01	0.03	0.1
lcl\|BLLF01004185.1_cds_GFH29106.1_23583 (GFH29106)	0.33	0.02	0.0	0.04	0.25	0.21	0.18	0.08	0.18	0.44	0.21	0.11	0.12	0.09	0.1	1.0	0.43	0.16	0.06	0.98	0.13	0.08	0.18	0.05	0.38	0.85
lcl\|BLLF01004260.1_cds_GFH29254.1_23731 (GFH29254)	0.48	0.0	0.01	0.74	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	1.0	0.12	0.06	0.02	0.01	0.07	0.04	0.1	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01004304.1_cds_GFH29350.1_23827 (GFH29350)	0.08	0.2	0.0	0.09	0.25	0.24	0.12	0.12	0.13	0.12	0.25	0.24	0.2	0.18	0.19	0.18	1.0	0.35	0.08	0.67	0.26	0.1	0.16	0.17	0.12	0.22
lcl\|BLLF01004331.1_cds_GFH29405.1_23882 (GFH29405)	0.02	0.0	0.0	0.18	0.08	0.08	0.04	0.04	0.15	1.0	0.08	0.0	0.0	0.07	0.04	0.73	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.06
lcl\|BLLF01004343.1_cds_GFH29436.1_23913 (GFH29436)	0.61	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.1	0.01	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004739.1_cds_GFH30161.1_24638 (GFH30161)	0.3	0.0	0.0	0.26	0.09	0.15	0.09	0.23	0.15	0.14	0.16	0.18	0.17	0.11	0.15	1.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.0
lcl\|BLLF01005002.1_cds_GFH30583.1_25060 (GFH30583)	0.4	0.19	0.0	0.38	0.27	0.32	0.4	0.11	0.32	0.21	0.3	0.2	0.31	0.14	0.32	1.0	0.45	0.49	0.66	0.58	0.47	0.41	0.31	0.13	0.15	0.1
lcl\|BLLF01005161.1_cds_GFH30818.1_25295 (GFH30818)	0.02	0.15	0.0	0.72	0.06	0.1	0.07	0.01	0.02	0.34	0.08	0.03	0.06	0.03	0.0	0.34	0.31	0.21	0.0	1.0	0.22	0.0	0.32	0.0	0.09	0.14
lcl\|BLLF01005246.1_cds_GFH30943.1_25420 (GFH30943)	0.03	0.3	0.0	0.56	0.32	0.31	0.28	0.18	0.35	0.42	0.34	0.26	0.42	0.24	0.21	0.2	0.63	0.26	0.08	1.0	0.35	0.32	0.2	0.21	0.13	0.29
lcl\|BLLF01005422.1_cds_GFH31182.1_25659 (GFH31182)	0.62	0.15	0.06	0.52	0.21	0.21	0.56	0.09	0.38	0.17	0.23	0.23	0.26	0.15	0.53	1.0	0.71	0.14	0.47	0.45	0.15	0.98	0.2	0.43	0.35	0.28
lcl\|BLLF01006365.1_cds_GFH32186.1_26663 (GFH32186)	0.37	0.0	0.0	0.38	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.11	0.0	1.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006486.1_cds_GFH32296.1_26773 (GFH32296)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	1.0	0.0	0.78	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006939.1_cds_GFH32662.1_27139 (GFH32662)	0.21	0.04	0.0	0.11	0.15	0.1	0.23	0.14	0.24	0.32	0.2	0.15	0.18	0.11	0.25	1.0	0.35	0.28	0.11	0.1	0.24	0.13	0.21	0.15	0.15	0.12
lcl\|BLLF01008402.1_cds_GFH33361.1_27838 (GFH33361)	0.36	0.0	0.0	0.0	0.33	0.05	0.05	0.05	0.05	0.0	0.12	0.0	0.06	0.05	0.16	1.0	0.37	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.09
lcl\|BLLF01008957.1_cds_GFH33572.1_28049 (GFH33572)	0.04	0.0	0.0	0.01	0.09	0.05	0.06	0.06	0.15	0.1	0.02	0.06	0.1	0.02	0.29	1.0	0.21	0.29	0.1	0.93	0.24	0.23	0.18	0.03	0.09	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)