Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000033.1_cds_GFH06331.1_808 (GFH06331)	0.08	0.0	0.0	0.1	0.16	0.14	0.16	0.1	0.15	0.33	0.35	0.2	0.44	0.34	0.26	0.1	0.19	1.0	0.12	0.08	0.86	0.05	0.76	0.05	0.13	0.1
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06901.1_1378 (GFH06901)	0.2	0.19	0.0	0.06	0.19	0.2	0.19	0.17	0.2	0.08	0.23	0.12	0.22	0.34	0.15	0.02	0.26	0.85	0.6	0.09	1.0	0.0	0.74	0.01	0.07	0.09
lcl\|BLLF01000086.1_cds_GFH07292.1_1769 (GFH07292)	0.03	0.15	0.0	0.01	0.23	0.2	0.14	0.24	0.15	0.24	0.32	0.14	0.17	0.33	0.1	0.05	0.25	1.0	0.11	0.03	0.9	0.03	0.63	0.0	0.13	0.2
lcl\|BLLF01000086.1_cds_GFH07293.1_1770 (GFH07293)	0.04	0.08	0.0	0.02	0.24	0.2	0.15	0.27	0.14	0.22	0.3	0.15	0.21	0.3	0.12	0.14	0.5	1.0	0.12	0.04	0.92	0.05	0.64	0.01	0.16	0.2
lcl\|BLLF01000120.1_cds_GFH07848.1_2325 (GFH07848)	0.13	0.12	0.06	0.25	0.32	0.26	0.29	0.34	0.28	0.29	0.41	0.22	0.28	0.42	0.26	0.25	0.44	1.0	0.19	0.13	0.89	0.15	0.68	0.18	0.13	0.26
lcl\|BLLF01000429.1_cds_GFH11722.1_6199 (GFH11722)	0.07	0.14	0.01	0.0	0.14	0.15	0.11	0.13	0.09	0.1	0.17	0.09	0.13	0.18	0.07	0.07	0.35	0.67	0.11	0.04	1.0	0.06	0.63	0.01	0.12	0.18
lcl\|BLLF01000429.1_cds_GFH11728.1_6205 (GFH11728)	0.3	0.12	0.0	0.0	0.3	0.23	0.17	0.3	0.17	0.01	0.37	0.19	0.24	0.38	0.13	0.04	0.11	0.92	0.34	0.15	1.0	0.05	0.67	0.02	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000429.1_cds_GFH11729.1_6206 (GFH11729)	0.18	0.04	0.0	0.01	0.31	0.25	0.16	0.33	0.19	0.03	0.32	0.19	0.24	0.38	0.14	0.05	0.08	0.99	0.19	0.12	1.0	0.04	0.9	0.04	0.07	0.06
lcl\|BLLF01000478.1_cds_GFH12209.1_6686 (GFH12209)	0.08	0.29	0.11	0.09	0.29	0.31	0.26	0.23	0.22	0.21	0.35	0.25	0.25	0.36	0.15	0.15	0.22	0.94	0.17	0.08	1.0	0.16	0.68	0.1	0.19	0.24
lcl\|BLLF01000478.1_cds_GFH12211.1_6688 (GFH12211)	0.11	0.62	0.41	0.14	0.28	0.33	0.24	0.24	0.3	0.34	0.33	0.28	0.34	0.43	0.22	0.13	0.18	0.91	0.31	0.13	1.0	0.2	0.63	0.04	0.21	0.34
lcl\|BLLF01000482.1_cds_GFH12252.1_6729 (GFH12252)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.45	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.5	0.09	0.12	0.0
lcl\|BLLF01000600.1_cds_GFH13338.1_7815 (GFH13338)	0.22	0.23	0.0	0.02	0.14	0.17	0.05	0.15	0.08	0.48	0.23	0.12	0.1	0.19	0.09	0.43	0.15	1.0	0.17	0.16	0.66	0.18	0.48	0.12	0.13	0.08
lcl\|BLLF01000625.1_cds_GFH13551.1_8028 (GFH13551)	0.12	0.02	0.03	0.02	0.26	0.28	0.21	0.23	0.21	0.15	0.31	0.22	0.27	0.38	0.15	0.26	0.35	0.87	0.22	0.09	1.0	0.12	0.68	0.06	0.19	0.28
lcl\|BLLF01000650.1_cds_GFH13773.1_8250 (GFH13773)	0.1	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.04	0.03	0.3	0.0	0.03	0.03	0.08	0.09	0.0	0.0	1.0	0.35	0.08	0.65	0.31	0.43	0.02	0.06	0.06
lcl\|BLLF01000684.1_cds_GFH14083.1_8560 (GFH14083)	0.0	0.08	0.0	0.02	0.04	0.13	0.09	0.04	0.07	0.26	0.12	0.12	0.28	0.11	0.04	0.04	0.02	0.93	0.02	0.03	1.0	0.05	0.36	0.01	0.02	0.08
lcl\|BLLF01000684.1_cds_GFH14084.1_8561 (GFH14084)	0.0	0.04	0.0	0.01	0.03	0.13	0.14	0.04	0.07	0.2	0.14	0.14	0.27	0.12	0.04	0.06	0.03	0.93	0.01	0.01	1.0	0.01	0.29	0.01	0.02	0.07
lcl\|BLLF01000757.1_cds_GFH14713.1_9190 (GFH14713)	0.15	0.09	0.1	0.13	0.2	0.26	0.12	0.2	0.1	0.21	0.27	0.12	0.22	0.31	0.05	0.13	0.42	1.0	0.23	0.2	0.94	0.09	0.77	0.01	0.17	0.12
lcl\|BLLF01000757.1_cds_GFH14715.1_9192 (GFH14715)	0.24	0.09	0.0	0.16	0.29	0.27	0.25	0.27	0.29	0.15	0.33	0.18	0.2	0.36	0.25	0.04	0.27	0.85	0.13	0.07	1.0	0.03	0.84	0.01	0.17	0.37
lcl\|BLLF01000883.1_cds_GFH15678.1_10155 (GFH15678)	0.05	0.07	0.0	0.01	0.23	0.2	0.13	0.24	0.14	0.1	0.3	0.13	0.17	0.29	0.1	0.07	0.39	0.97	0.06	0.04	1.0	0.0	0.74	0.02	0.18	0.23
lcl\|BLLF01000904.1_cds_GFH15811.1_10288 (GFH15811)	0.01	0.23	0.0	0.02	0.01	0.12	0.06	0.02	0.04	0.04	0.02	0.06	0.31	0.04	0.02	0.08	0.02	0.66	0.19	0.05	1.0	0.33	0.51	0.0	0.04	0.13
lcl\|BLLF01000958.1_cds_GFH16183.1_10660 (GFH16183)	0.01	0.33	0.0	0.04	0.1	0.06	0.02	0.07	0.05	0.2	0.1	0.02	0.03	0.1	0.03	0.04	0.34	1.0	0.08	0.09	0.78	0.0	0.44	0.0	0.09	0.15
lcl\|BLLF01000958.1_cds_GFH16185.1_10662 (GFH16185)	0.04	0.34	0.0	0.05	0.21	0.14	0.11	0.18	0.11	0.13	0.23	0.08	0.13	0.27	0.05	0.12	0.37	1.0	0.11	0.11	1.0	0.01	0.71	0.03	0.15	0.25
lcl\|BLLF01000993.1_cds_GFH16401.1_10878 (GFH16401)	0.05	0.15	0.0	0.01	0.14	0.17	0.11	0.14	0.08	0.16	0.18	0.11	0.12	0.2	0.04	0.14	0.4	0.95	0.06	0.07	1.0	0.04	0.62	0.02	0.05	0.12
lcl\|BLLF01000993.1_cds_GFH16402.1_10879 (GFH16402)	0.05	0.2	0.0	0.01	0.19	0.18	0.14	0.19	0.16	0.18	0.21	0.12	0.14	0.28	0.07	0.18	0.45	0.91	0.07	0.1	1.0	0.05	0.68	0.01	0.08	0.17
lcl\|BLLF01000993.1_cds_GFH16404.1_10881 (GFH16404)	0.15	0.33	0.0	0.05	0.42	0.27	0.19	0.33	0.18	0.33	0.47	0.15	0.21	0.51	0.08	0.38	0.52	1.0	0.22	0.19	0.96	0.03	0.64	0.02	0.19	0.37
lcl\|BLLF01001107.1_cds_GFH17174.1_11651 (GFH17174)	0.07	0.46	0.16	0.01	0.21	0.2	0.14	0.18	0.12	0.21	0.26	0.13	0.15	0.26	0.07	0.1	0.44	1.0	0.11	0.09	0.94	0.06	0.58	0.01	0.13	0.25
lcl\|BLLF01001117.1_cds_GFH17245.1_11722 (GFH17245)	0.1	0.39	0.06	0.04	0.31	0.27	0.15	0.39	0.21	0.34	0.36	0.19	0.25	0.44	0.17	0.07	0.16	0.86	0.16	0.2	1.0	0.19	0.67	0.07	0.21	0.25
lcl\|BLLF01001152.1_cds_GFH17465.1_11942 (GFH17465)	0.28	0.15	0.0	0.38	0.3	0.36	0.26	0.21	0.22	0.07	0.37	0.18	0.25	0.4	0.18	0.11	0.61	1.0	0.52	0.14	1.0	0.08	0.77	0.06	0.14	0.17
lcl\|BLLF01001176.1_cds_GFH17614.1_12091 (GFH17614)	0.29	0.0	0.06	0.1	0.23	0.15	0.22	0.19	0.2	0.2	0.36	0.21	0.27	0.36	0.17	0.14	0.25	1.0	0.19	0.24	0.89	0.13	0.69	0.16	0.07	0.17
lcl\|BLLF01001312.1_cds_GFH18517.1_12994 (GFH18517)	0.36	0.15	0.28	0.3	0.04	0.34	0.53	0.05	0.2	0.66	0.07	0.24	0.65	0.09	0.14	0.47	0.51	0.72	0.42	0.18	1.0	0.64	0.81	0.11	0.66	0.64
lcl\|BLLF01001312.1_cds_GFH18518.1_12995 (GFH18518)	0.31	0.56	0.0	0.48	0.04	0.27	0.32	0.04	0.11	0.78	0.11	0.21	0.69	0.08	0.1	0.58	0.54	0.92	0.77	0.43	0.79	1.0	0.84	0.09	0.81	0.87
lcl\|BLLF01001312.1_cds_GFH18519.1_12996 (GFH18519)	0.1	0.19	0.02	0.13	0.01	0.22	0.19	0.03	0.06	0.31	0.07	0.13	0.52	0.06	0.04	0.3	0.28	1.0	0.11	0.06	0.83	0.38	0.63	0.05	0.3	0.41
lcl\|BLLF01001312.1_cds_GFH18520.1_12997 (GFH18520)	0.07	0.18	0.0	0.09	0.01	0.17	0.19	0.03	0.05	0.2	0.04	0.13	0.5	0.09	0.06	0.09	0.22	0.41	0.27	0.12	0.5	1.0	0.39	0.04	0.29	0.44
lcl\|BLLF01001312.1_cds_GFH18521.1_12998 (GFH18521)	0.05	0.26	0.0	0.13	0.01	0.13	0.09	0.02	0.03	0.19	0.03	0.1	0.37	0.06	0.03	0.19	0.18	0.92	0.13	0.06	1.0	0.55	0.68	0.01	0.14	0.17
lcl\|BLLF01001312.1_cds_GFH18522.1_12999 (GFH18522)	0.03	0.05	0.0	0.13	0.02	0.13	0.04	0.01	0.03	0.18	0.02	0.06	0.28	0.05	0.02	0.1	0.12	0.72	0.06	0.05	1.0	0.37	0.53	0.02	0.07	0.21
lcl\|BLLF01001432.1_cds_GFH19261.1_13738 (GFH19261)	0.35	0.47	0.0	0.23	0.1	0.39	0.09	0.13	0.1	0.4	0.25	0.27	0.5	0.27	0.11	0.68	0.24	0.8	1.0	0.32	0.72	0.18	0.77	0.08	0.59	0.4
lcl\|BLLF01001566.1_cds_GFH20059.1_14536 (GFH20059)	0.08	0.42	0.0	0.0	0.34	0.33	0.23	0.36	0.19	0.72	0.39	0.26	0.31	0.4	0.18	0.2	0.24	0.93	0.4	0.25	1.0	0.23	0.76	0.05	0.28	0.3
lcl\|BLLF01001566.1_cds_GFH20062.1_14539 (GFH20062)	0.05	0.55	0.1	0.03	0.25	0.2	0.14	0.31	0.13	0.4	0.27	0.18	0.18	0.3	0.14	0.16	0.22	1.0	0.28	0.22	0.89	0.05	0.76	0.06	0.28	0.34
lcl\|BLLF01001584.1_cds_GFH20155.1_14632 (GFH20155)	0.16	0.05	0.0	0.0	0.25	0.28	0.19	0.19	0.13	0.3	0.28	0.25	0.16	0.25	0.1	0.11	0.43	1.0	0.03	0.16	0.86	0.15	0.58	0.02	0.12	0.29
lcl\|BLLF01001584.1_cds_GFH20156.1_14633 (GFH20156)	0.1	0.25	0.0	0.01	0.21	0.24	0.15	0.2	0.13	0.45	0.22	0.13	0.19	0.24	0.06	0.14	0.47	0.86	0.06	0.2	1.0	0.08	0.3	0.02	0.11	0.29
lcl\|BLLF01001584.1_cds_GFH20157.1_14634 (GFH20157)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.27	0.18	0.17	0.08	0.25	0.27	0.13	0.13	0.18	0.05	0.11	0.37	0.88	0.0	0.18	1.0	0.07	0.54	0.03	0.05	0.08
lcl\|BLLF01001731.1_cds_GFH20944.1_15421 (GFH20944)	0.16	0.12	0.02	0.0	0.25	0.23	0.08	0.23	0.08	0.19	0.15	0.23	0.09	0.28	0.13	0.07	0.09	0.95	0.25	0.22	1.0	0.12	0.63	0.09	0.01	0.02
lcl\|BLLF01001869.1_cds_GFH21627.1_16104 (GFH21627)	0.47	0.07	0.15	0.26	0.4	0.37	0.28	0.42	0.29	0.2	0.44	0.28	0.31	0.37	0.24	0.31	0.67	0.96	0.18	0.2	1.0	0.18	0.8	0.12	0.32	0.39
lcl\|BLLF01001945.1_cds_GFH21989.1_16466 (GFH21989)	0.05	0.4	0.05	0.04	0.12	0.16	0.11	0.23	0.15	0.18	0.14	0.1	0.17	0.31	0.11	0.03	0.09	0.59	0.09	0.09	1.0	0.04	0.43	0.01	0.07	0.11
lcl\|BLLF01001945.1_cds_GFH21990.1_16467 (GFH21990)	0.05	0.23	0.0	0.01	0.15	0.16	0.12	0.28	0.13	0.16	0.19	0.11	0.16	0.32	0.14	0.06	0.11	0.83	0.2	0.15	1.0	0.08	0.66	0.05	0.05	0.08
lcl\|BLLF01002178.1_cds_GFH23035.1_17512 (GFH23035)	0.11	0.71	0.0	0.03	0.3	0.27	0.17	0.45	0.19	0.37	0.33	0.18	0.26	0.49	0.13	0.24	0.19	0.85	0.19	0.2	1.0	0.35	0.75	0.14	0.17	0.17
lcl\|BLLF01002248.1_cds_GFH23330.1_17807 (GFH23330)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.09	0.03	0.05	0.23	0.06	0.02	0.12	0.04	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002352.1_cds_GFH23747.1_18224 (GFH23747)	0.09	0.01	0.17	0.03	0.05	0.11	0.11	0.05	0.08	0.7	0.08	0.12	0.1	0.17	0.03	0.49	0.18	1.0	0.17	0.16	0.37	0.18	0.38	0.09	0.12	0.12
lcl\|BLLF01002509.1_cds_GFH24345.1_18822 (GFH24345)	0.23	0.0	0.0	0.07	0.15	0.13	0.26	0.12	0.2	0.46	0.3	0.19	0.31	0.29	0.27	0.23	0.3	1.0	0.1	0.19	0.68	0.27	0.86	0.2	0.27	0.32
lcl\|BLLF01002702.1_cds_GFH25052.1_19529 (GFH25052)	0.11	0.0	0.0	0.25	0.21	0.05	0.21	0.18	0.2	0.11	0.22	0.05	0.17	0.26	0.17	0.05	0.4	1.0	0.09	0.04	0.57	0.03	0.5	0.15	0.0	0.01
lcl\|BLLF01002894.1_cds_GFH25702.1_20179 (GFH25702)	0.16	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.04	0.03	0.08	0.45	0.02	0.14	0.14	0.13	0.09	0.38	0.1	1.0	0.15	0.08	0.63	0.0	0.4	0.13	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003060.1_cds_GFH26221.1_20698 (GFH26221)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.04	0.1	0.08	0.42	0.02	0.01	0.12	0.07	0.06	0.11	0.28	1.0	0.25	0.21	0.58	0.07	0.41	0.1	0.04	0.04
lcl\|BLLF01003727.1_cds_GFH28064.1_22541 (GFH28064)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.13	0.12	0.1	0.12	0.0	0.25	0.06	0.13	0.15	0.03	0.06	0.17	1.0	0.07	0.15	0.6	0.07	0.39	0.01	0.14	0.27
lcl\|BLLF01004077.1_cds_GFH28872.1_23349 (GFH28872)	0.15	0.09	0.0	0.02	0.07	0.11	0.08	0.2	0.08	0.04	0.19	0.08	0.15	0.42	0.05	0.18	0.28	0.89	0.42	0.06	1.0	0.04	0.84	0.08	0.02	0.06
lcl\|BLLF01004437.1_cds_GFH29612.1_24089 (GFH29612)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.06	0.06	0.06	0.57	0.05	0.0	0.01	0.09	0.04	0.02	0.07	1.0	0.06	0.08	0.56	0.0	0.41	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005018.1_cds_GFH30607.1_25084 (GFH30607)	0.16	0.02	0.0	0.07	0.08	0.27	0.06	0.2	0.05	0.13	0.17	0.05	0.06	0.25	0.01	0.01	0.23	1.0	0.08	0.04	0.89	0.0	0.52	0.0	0.1	0.06
lcl\|BLLF01005134.1_cds_GFH30768.1_25245 (GFH30768)	0.07	0.0	0.0	0.05	0.01	0.09	0.01	0.04	0.0	0.04	0.07	0.02	0.02	0.06	0.0	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.16	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006248.1_cds_GFH32096.1_26573 (GFH32096)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.1	0.02	0.01	0.06	0.07	0.15	0.12	0.05	0.1	0.04	0.05	0.07	0.26	1.0	0.33	0.05	0.69	0.0	0.22	0.11	0.13	0.1
lcl\|BLLF01006352.1_cds_GFH32176.1_26653 (GFH32176)	0.0	0.02	0.0	0.03	0.06	0.07	0.03	0.06	0.05	0.18	0.17	0.11	0.15	0.06	0.07	0.28	0.18	0.77	0.22	0.13	1.0	0.13	0.39	0.03	0.15	0.0
lcl\|BLLF01006378.1_cds_GFH32196.1_26673 (GFH32196)	0.02	0.21	0.0	0.01	0.2	0.22	0.2	0.22	0.22	0.07	0.26	0.16	0.2	0.22	0.13	0.29	0.37	0.85	0.04	0.13	1.0	0.08	0.49	0.04	0.01	0.03
lcl\|BLLF01007120.1_cds_GFH32779.1_27256 (GFH32779)	0.27	0.02	0.0	0.14	0.07	0.41	0.11	0.08	0.07	0.0	0.16	0.11	0.19	0.32	0.01	0.0	0.58	1.0	0.0	0.0	0.92	0.0	0.55	0.0	0.14	0.1
lcl\|BLLF01007449.1_cds_GFH32957.1_27434 (GFH32957)	0.25	0.21	0.0	0.35	0.08	0.43	0.66	0.03	0.18	0.51	0.15	0.34	0.73	0.08	0.13	0.62	0.66	0.76	0.38	0.16	0.73	1.0	0.54	0.15	0.67	0.84
lcl\|BLLF01008256.1_cds_GFH33308.1_27785 (GFH33308)	0.06	0.1	0.0	0.0	0.17	0.09	0.07	0.32	0.07	0.0	0.16	0.01	0.07	0.25	0.06	0.12	0.0	0.54	0.54	0.08	1.0	0.0	0.63	0.0	0.08	0.04
lcl\|BLLF01009113.1_cds_GFH33619.1_28096 (GFH33619)	0.24	0.07	0.0	0.28	0.12	0.07	0.12	0.18	0.21	0.25	0.14	0.08	0.2	0.15	0.24	0.07	0.32	1.0	0.17	0.09	0.77	0.18	0.61	0.25	0.14	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)