Heatmap: Cluster_282 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000052.1_cds_GFH06722.1_1199 (GFH06722)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.6	0.79	0.81	0.6	0.76	0.01	0.66	0.7	0.59	0.53	0.71	0.66	0.89	0.02	0.51	1.0	0.02	0.78	0.01	0.42	0.91	0.79
lcl\|BLLF01000052.1_cds_GFH06725.1_1202 (GFH06725)	0.0	0.33	0.04	0.14	0.36	0.56	0.66	0.31	0.85	0.0	0.61	0.51	0.43	0.45	0.82	0.94	0.83	0.0	0.47	0.28	0.0	0.57	0.0	0.36	0.49	1.0
lcl\|BLLF01000106.1_cds_GFH07624.1_2101 (GFH07624)	0.53	0.07	0.21	0.09	0.73	0.75	0.56	0.48	0.62	0.7	0.6	0.59	0.62	0.43	0.56	0.45	0.5	0.69	1.0	0.73	0.53	0.54	0.54	0.2	0.49	0.52
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07915.1_2392 (GFH07915)	0.56	0.06	0.25	0.42	0.6	0.75	0.99	0.28	0.86	0.42	0.61	0.48	0.41	0.35	0.49	0.74	0.63	0.65	0.91	1.0	0.45	0.84	0.5	0.65	0.61	0.69
lcl\|BLLF01000154.1_cds_GFH08337.1_2814 (GFH08337)	0.53	0.51	0.32	0.48	1.0	0.88	0.9	0.61	0.77	0.49	0.81	0.75	0.71	0.59	0.86	0.21	0.23	0.97	0.45	0.38	0.62	0.62	0.79	0.64	0.95	0.65
lcl\|BLLF01000179.1_cds_GFH08711.1_3188 (GFH08711)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.31	0.53	0.63	0.21	0.98	0.29	0.46	0.66	0.34	0.26	0.38	0.4	0.6	0.32	0.47	0.0	0.44	1.0	0.31	0.41	0.44	0.66
lcl\|BLLF01000238.1_cds_GFH09480.1_3957 (GFH09480)	0.32	0.36	0.0	0.75	1.0	0.75	0.75	0.37	0.68	0.52	0.58	0.43	0.7	0.39	0.82	0.52	0.66	0.46	0.69	0.49	0.48	0.18	0.69	0.22	0.48	0.47
lcl\|BLLF01000538.1_cds_GFH12766.1_7243 (GFH12766)	0.34	0.0	0.0	0.03	0.46	0.94	0.62	0.46	0.6	0.78	0.44	0.41	0.36	0.31	0.84	0.52	0.43	0.61	0.07	0.26	0.72	0.0	0.49	0.61	0.75	1.0
lcl\|BLLF01000540.1_cds_GFH12794.1_7271 (GFH12794)	0.32	0.08	0.03	0.2	0.86	0.61	0.43	0.45	0.55	0.71	0.55	0.34	0.23	0.28	0.47	0.23	0.13	0.35	0.5	0.93	0.22	0.25	0.25	0.05	1.0	0.64
lcl\|BLLF01000548.1_cds_GFH12866.1_7343 (GFH12866)	0.59	0.2	0.0	0.65	1.0	0.79	0.72	0.32	0.63	0.42	0.75	0.45	0.42	0.36	0.45	0.43	0.35	0.35	0.94	0.83	0.53	0.16	0.28	0.18	0.74	0.79
lcl\|BLLF01000554.1_cds_GFH12912.1_7389 (GFH12912)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.12	0.44	0.26	0.66	0.0	0.29	0.48	0.71	0.23	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.75
lcl\|BLLF01000568.1_cds_GFH13039.1_7516 (GFH13039)	0.48	0.14	0.39	0.18	0.48	0.54	0.43	0.54	0.57	0.42	0.33	0.45	0.43	0.37	0.49	0.32	0.34	0.37	1.0	0.77	0.32	0.42	0.35	0.47	0.65	0.51
lcl\|BLLF01000717.1_cds_GFH14369.1_8846 (GFH14369)	0.03	0.0	0.0	0.23	0.64	0.5	0.46	0.33	0.8	0.11	0.44	0.6	0.46	0.32	0.6	0.09	0.46	0.0	0.2	0.87	0.31	1.0	0.41	0.27	0.72	0.62
lcl\|BLLF01000774.1_cds_GFH14851.1_9328 (GFH14851)	0.33	0.26	0.73	0.11	0.33	0.33	0.21	0.35	0.27	0.54	0.32	0.25	0.31	0.28	0.31	0.07	0.13	0.14	0.69	0.53	0.21	1.0	0.18	0.12	0.38	0.44
lcl\|BLLF01000793.1_cds_GFH15001.1_9478 (GFH15001)	0.43	0.21	0.42	0.26	1.0	0.69	0.46	0.42	0.38	0.49	0.93	0.65	0.4	0.48	0.35	0.17	0.13	0.45	0.7	0.83	0.37	0.54	0.35	0.09	0.86	0.75
lcl\|BLLF01000874.1_cds_GFH15612.1_10089 (GFH15612)	0.07	0.04	0.0	0.31	0.38	0.31	0.35	0.08	0.23	0.33	0.55	0.23	0.35	0.11	0.26	0.0	0.35	0.29	0.22	1.0	0.0	0.35	0.07	0.04	0.61	0.67
lcl\|BLLF01000905.1_cds_GFH15819.1_10296 (GFH15819)	0.46	0.51	0.0	0.19	0.57	0.56	0.51	0.29	0.68	0.03	0.53	0.56	0.65	0.5	0.74	1.0	0.85	0.44	0.87	0.55	0.41	0.62	0.41	0.55	0.9	0.43
lcl\|BLLF01000905.1_cds_GFH15820.1_10297 (GFH15820)	0.17	0.22	0.0	0.08	0.45	0.57	0.58	0.25	0.58	0.09	0.61	0.57	0.59	0.37	0.63	0.75	0.76	0.2	0.54	0.17	0.0	0.16	0.23	0.43	1.0	0.4
lcl\|BLLF01000934.1_cds_GFH16029.1_10506 (GFH16029)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.27	0.33	0.22	0.4	0.15	0.25	0.7	0.54	0.16	0.9	0.0	0.16	0.0	0.0	0.84	0.0	1.0	0.0	0.13	0.87	0.61
lcl\|BLLF01000943.1_cds_GFH16084.1_10561 (GFH16084)	0.06	0.02	0.0	0.02	0.59	0.74	0.55	0.4	0.78	0.46	0.49	0.55	0.44	0.31	0.75	0.74	0.81	0.62	0.77	0.86	0.51	0.29	0.3	0.47	0.91	1.0
lcl\|BLLF01000957.1_cds_GFH16176.1_10653 (GFH16176)	0.44	0.0	0.0	0.0	0.82	1.0	0.84	0.58	0.83	0.8	0.81	0.75	0.49	0.58	0.64	0.41	0.58	0.48	0.81	0.79	0.7	0.56	0.33	0.29	0.85	0.91
lcl\|BLLF01001051.1_cds_GFH16790.1_11267 (GFH16790)	0.23	0.2	0.0	0.59	0.72	0.49	0.57	0.35	0.71	0.31	0.55	0.4	0.43	0.34	0.68	0.02	0.18	0.18	1.0	0.6	0.39	0.14	0.23	0.13	0.56	0.47
lcl\|BLLF01001085.1_cds_GFH17023.1_11500 (GFH17023)	0.0	0.01	0.0	0.09	0.23	0.32	0.29	0.26	0.49	0.36	0.24	0.17	0.48	0.2	0.45	0.1	0.01	0.19	0.84	1.0	0.15	0.12	0.11	0.4	0.8	0.83
lcl\|BLLF01001412.1_cds_GFH19141.1_13618 (GFH19141)	0.71	0.0	0.0	0.16	0.59	0.71	0.62	0.57	0.71	0.32	0.57	0.42	0.58	0.45	0.6	0.65	1.0	0.6	0.63	0.67	0.32	0.22	0.43	0.41	0.68	0.91
lcl\|BLLF01001823.1_cds_GFH21408.1_15885 (GFH21408)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.09	0.39	0.23	0.47	0.0	0.53	0.53	0.45	0.49	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.45
lcl\|BLLF01001967.1_cds_GFH22087.1_16564 (GFH22087)	0.0	0.0	0.0	0.36	0.45	0.42	0.66	0.04	0.76	0.0	0.84	0.34	0.44	0.2	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	1.0
lcl\|BLLF01002049.1_cds_GFH22484.1_16961 (GFH22484)	0.12	0.0	0.0	0.16	0.29	0.38	0.43	0.33	0.35	0.22	0.31	0.25	0.25	0.32	0.4	0.29	0.33	0.62	0.05	0.12	0.51	0.15	0.35	0.4	0.47	1.0
lcl\|BLLF01002203.1_cds_GFH23149.1_17626 (GFH23149)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.49	0.72	0.08	0.38	0.29	0.13	0.48	0.33	0.38	0.55	0.81	0.0	0.0	0.47	0.0	0.87	1.0	0.0	0.17	0.44	0.59
lcl\|BLLF01002205.1_cds_GFH23158.1_17635 (GFH23158)	0.14	0.03	0.0	0.07	0.58	0.66	0.48	0.43	0.54	0.31	0.31	0.39	0.33	0.33	0.26	0.37	0.17	0.46	0.17	0.25	0.8	0.0	0.8	0.44	0.49	1.0
lcl\|BLLF01002244.1_cds_GFH23311.1_17788 (GFH23311)	0.14	0.24	0.0	0.08	0.37	0.5	0.4	0.29	0.42	0.22	0.36	0.45	0.36	0.31	0.4	0.19	0.2	0.08	0.07	1.0	0.11	0.23	0.06	0.19	0.71	0.73
lcl\|BLLF01002284.1_cds_GFH23481.1_17958 (GFH23481)	0.38	0.09	0.17	0.28	1.0	0.57	0.42	0.41	0.43	0.14	0.75	0.38	0.29	0.28	0.37	0.28	0.66	0.47	0.67	0.91	0.28	0.21	0.35	0.09	0.73	0.39
lcl\|BLLF01002284.1_cds_GFH23483.1_17960 (GFH23483)	0.12	0.35	0.0	0.1	1.0	0.76	0.57	0.46	0.57	0.35	0.71	0.42	0.48	0.43	0.42	0.0	0.0	0.51	0.58	0.0	0.51	0.46	0.93	0.44	0.94	0.36
lcl\|BLLF01002584.1_cds_GFH24612.1_19089 (GFH24612)	0.12	0.05	0.14	0.27	0.4	0.41	0.42	0.1	0.43	0.17	0.28	0.38	0.36	0.17	0.26	0.27	0.16	0.17	0.2	0.31	0.13	1.0	0.17	0.17	0.23	0.21
lcl\|BLLF01002690.1_cds_GFH25006.1_19483 (GFH25006)	0.21	0.27	0.29	0.22	0.88	0.94	0.7	0.64	0.91	0.41	0.7	0.52	0.62	0.45	0.8	0.47	0.25	0.22	0.72	0.85	0.3	1.0	0.18	0.14	0.99	0.76
lcl\|BLLF01002926.1_cds_GFH25809.1_20286 (GFH25809)	0.58	0.2	0.0	0.18	0.67	0.99	0.88	0.43	1.0	0.82	0.88	0.8	0.72	0.7	0.92	0.41	0.2	0.48	0.64	0.32	0.56	0.51	0.37	0.24	0.94	0.85
lcl\|BLLF01003054.1_cds_GFH26201.1_20678 (GFH26201)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.75	0.66	0.35	1.0	0.61	0.39	0.41	0.44	0.19	1.0	0.29	0.43	0.68	0.34	0.0	0.62	0.0	0.45	0.41	0.99	0.68
lcl\|BLLF01003246.1_cds_GFH26800.1_21277 (GFH26800)	0.41	0.0	0.0	0.08	0.72	0.77	0.58	0.26	0.42	0.36	0.6	0.45	0.38	0.29	0.26	0.43	0.63	0.33	1.0	0.68	0.55	0.32	0.33	0.26	0.74	0.4
lcl\|BLLF01003384.1_cds_GFH27193.1_21670 (GFH27193)	0.2	0.0	0.0	0.06	0.89	0.45	0.68	0.3	0.61	0.0	0.34	0.33	0.38	0.23	0.45	0.38	0.56	0.29	0.66	1.0	0.41	0.47	0.15	0.48	0.85	0.62
lcl\|BLLF01003385.1_cds_GFH27196.1_21673 (GFH27196)	0.11	0.0	0.0	0.16	0.5	0.18	0.61	0.19	0.53	0.46	0.56	0.41	0.39	0.36	0.52	0.0	0.0	0.25	0.0	0.11	0.35	1.0	0.13	0.09	0.76	0.71
lcl\|BLLF01003670.1_cds_GFH27913.1_22390 (GFH27913)	0.12	0.24	0.37	0.07	0.34	0.35	0.24	0.19	0.35	0.36	0.34	0.27	0.29	0.24	0.22	0.09	0.23	0.19	0.33	0.41	0.14	1.0	0.36	0.14	0.27	0.17
lcl\|BLLF01003803.1_cds_GFH28254.1_22731 (GFH28254)	0.41	0.05	0.35	0.22	0.89	0.67	0.7	0.75	0.67	0.32	0.73	0.66	0.56	0.47	0.63	0.16	0.29	0.6	0.49	0.33	0.46	0.54	0.68	0.25	1.0	0.82
lcl\|BLLF01003892.1_cds_GFH28472.1_22949 (GFH28472)	0.08	0.03	0.0	0.14	0.75	0.66	0.63	0.57	0.71	0.66	0.72	0.61	0.47	0.45	0.7	0.76	0.49	0.55	0.32	0.58	0.64	0.47	1.0	0.52	0.74	0.99
lcl\|BLLF01004356.1_cds_GFH29460.1_23937 (GFH29460)	0.69	0.02	0.0	0.2	0.95	0.86	0.78	0.49	0.78	0.85	0.74	0.76	0.74	0.4	0.68	0.45	1.0	0.53	0.44	0.84	0.89	0.28	0.58	0.73	0.96	0.86
lcl\|BLLF01004863.1_cds_GFH30375.1_24852 (GFH30375)	0.03	0.0	0.0	0.14	0.62	0.59	0.63	0.22	0.58	0.76	0.59	0.34	0.67	0.38	0.6	0.43	0.63	0.5	0.0	0.14	0.0	0.26	0.5	0.4	1.0	0.68
lcl\|BLLF01004868.1_cds_GFH30380.1_24857 (GFH30380)	0.09	0.0	0.0	0.44	0.24	0.51	0.49	0.14	0.45	0.29	0.25	0.61	0.68	0.39	0.44	0.4	0.2	0.11	0.32	0.36	0.44	1.0	0.1	0.38	0.44	0.32
lcl\|BLLF01005906.1_cds_GFH31751.1_26228 (GFH31751)	0.39	0.0	0.0	0.21	0.51	0.29	0.23	0.17	0.21	0.62	0.57	0.37	0.15	0.28	0.14	0.13	0.09	0.69	0.29	1.0	0.14	0.16	0.29	0.02	0.29	0.87
lcl\|BLLF01006241.1_cds_GFH32090.1_26567 (GFH32090)	0.03	0.0	0.0	0.35	0.5	0.7	1.0	0.27	0.68	0.4	0.67	0.43	0.71	0.48	0.84	0.19	0.19	0.15	0.96	0.92	0.41	0.47	0.29	0.27	0.63	0.82
lcl\|BLLF01006462.1_cds_GFH32272.1_26749 (GFH32272)	0.43	0.25	0.38	0.19	0.81	0.73	0.74	0.64	0.86	0.42	0.94	0.7	0.75	0.56	0.91	0.41	0.26	0.62	0.4	0.41	0.56	0.73	0.45	0.5	1.0	0.89
lcl\|BLLF01006628.1_cds_GFH32425.1_26902 (GFH32425)	0.16	0.21	0.08	0.31	0.34	0.32	0.33	0.34	0.49	0.74	0.27	0.36	0.31	0.22	0.43	0.16	0.23	0.34	0.72	1.0	0.28	0.33	0.39	0.35	0.64	0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)