Heatmap: Cluster_270 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
- - - -0.53 1.13 0.61 0.62 -0.07 0.6 -0.16 1.43 1.09 0.52 0.37 0.31 -1.24 0.33 0.99 - -0.83 -1.13 - -1.61 0.1 0.37 -0.88
-0.39 - - -4.11 1.21 0.45 0.27 0.08 0.52 0.22 0.8 0.3 0.71 -0.23 0.19 -0.18 -0.93 0.88 -0.21 -0.76 0.62 -0.21 -0.84 -0.51 0.03 -0.66
0.21 - - -0.38 1.11 1.2 0.77 -0.27 0.14 -1.21 0.31 0.55 0.35 -0.53 0.19 0.08 1.29 -0.11 -0.26 -3.89 -1.19 0.31 -0.2 -0.19 -1.05 -0.95
0.33 -0.05 - -1.19 1.11 1.0 0.65 0.06 0.32 -0.08 0.82 0.53 0.47 0.31 0.19 -0.59 -0.28 -0.07 -1.36 -0.76 -0.06 -2.86 -0.73 -0.65 -0.03 -0.58
-2.04 -0.62 - -0.17 0.84 0.35 0.68 -0.16 0.54 -0.18 0.65 0.28 -0.06 0.09 0.13 0.55 0.39 0.15 -1.51 -0.96 0.57 -0.65 0.04 -0.11 -0.11 -0.54
- - - -2.37 1.36 0.84 1.04 0.22 1.2 - 0.46 1.03 0.78 0.42 1.02 -0.76 -1.61 1.2 -1.16 -2.63 0.13 - -1.19 -0.97 -0.19 -0.56
- - - 0.64 1.21 1.15 0.68 0.53 0.78 - 1.51 0.33 0.6 1.0 0.28 - - 0.67 -0.33 -0.15 -0.45 - -0.93 -0.33 -1.03 -1.02
-0.98 -1.17 - 0.67 1.52 0.85 -0.59 0.1 -1.71 - 1.09 -1.64 -0.28 0.31 -0.99 1.54 -0.47 - - -0.64 0.06 1.26 0.68 -1.2 -0.85 0.51
-0.52 -0.74 - -0.11 0.88 0.64 0.73 0.3 0.19 -1.01 0.61 -0.1 0.0 0.26 0.02 0.89 0.82 -0.4 -0.11 -0.64 0.19 -0.39 -0.7 -1.08 -0.49 -0.84
1.05 -0.51 -0.43 -0.31 -0.18 -0.3 0.23 -0.12 0.52 0.05 -0.25 -0.28 -0.11 -0.44 0.5 -0.81 -0.65 0.59 -0.62 0.16 0.39 -0.46 0.44 0.35 -0.17 -0.65
-0.0 -3.61 -1.14 -0.91 0.93 0.89 0.52 0.47 0.04 0.27 1.05 0.06 0.97 0.86 -1.34 -0.27 1.02 -0.56 -2.36 -2.6 0.56 - -1.05 -3.93 -0.51 0.3
-1.2 -6.12 -0.44 -0.9 1.18 1.11 0.55 0.6 0.56 0.32 1.28 0.47 0.98 1.03 -0.82 -1.53 0.1 -0.7 -3.18 -2.58 -0.49 -3.68 -1.19 -3.69 -0.7 0.6
-0.22 -1.57 - -6.01 1.12 0.83 0.38 0.77 0.12 -0.5 0.48 0.52 0.07 -0.07 -0.54 0.71 0.68 -0.9 -1.53 -1.53 0.04 -0.01 -0.47 0.0 0.45 -0.11
-2.0 - - -0.67 0.96 0.23 0.99 -0.37 0.73 -0.56 1.18 0.26 0.83 0.23 0.63 -2.06 -1.49 0.58 - -2.65 0.63 -0.75 -0.11 0.03 0.71 -0.06
0.58 -0.22 - 0.04 1.04 1.12 0.42 -1.0 0.47 -0.21 0.64 0.45 0.09 -0.64 -0.18 -0.88 0.5 -0.43 -0.33 -1.47 0.23 -0.99 -0.08 -0.45 -0.89 0.06
-1.15 0.01 -0.37 -0.68 0.69 0.43 0.03 0.53 0.09 0.4 0.5 0.22 0.08 0.14 -0.17 -0.11 0.8 0.08 -0.97 -0.1 -0.16 -0.03 -0.25 -0.27 -0.87 -1.15
-1.46 -0.14 - -0.6 0.22 0.62 0.18 -1.03 -0.14 - 0.4 -0.83 -0.19 -0.21 -0.2 1.01 0.24 0.16 -0.57 -0.07 0.89 1.51 0.54 -2.77 -0.19 0.33
-5.24 -1.62 -2.25 -0.56 0.25 0.32 0.68 -0.36 0.63 -0.42 0.71 0.42 0.64 0.14 0.61 0.4 0.74 0.05 -0.8 -0.91 -0.05 -0.16 -0.32 -0.06 -0.11 -0.33
-0.8 -0.81 - 0.31 0.97 0.08 -0.11 -0.34 0.05 -0.17 0.78 0.03 -0.0 0.15 -0.08 1.04 1.22 0.27 -0.9 -0.92 0.62 -3.82 0.09 -1.25 -0.8 -0.25
-0.9 -1.39 -2.46 -0.95 0.94 0.44 0.52 0.61 0.07 -0.44 0.68 0.65 0.32 0.24 -0.65 -0.09 0.62 -0.55 -1.09 -1.24 -0.28 -0.01 -0.17 0.53 -0.01 -0.11
-1.26 -0.26 -5.28 -0.21 0.95 0.31 0.2 -0.22 -0.01 -0.04 0.68 -0.11 0.13 0.2 -0.5 0.87 0.86 0.08 -2.62 -1.53 0.6 -0.65 0.64 -0.24 -0.7 -0.25
-0.67 -1.5 - -0.56 0.62 1.15 -0.36 -0.49 -1.79 - 0.05 -1.18 - -1.12 -0.48 2.21 0.78 -0.73 - -0.55 1.47 1.94 - -1.35 -0.34 -0.5
-1.13 -3.98 - 0.24 0.82 0.23 0.58 -0.61 0.5 -1.2 1.16 0.24 0.76 -0.19 -0.03 -0.7 0.19 0.45 -2.06 -1.88 0.41 -1.39 -0.19 0.26 0.39 0.73
-0.74 0.36 -1.85 -0.2 0.76 0.37 -0.12 0.25 -0.1 -0.17 0.73 0.21 0.04 0.32 -0.33 0.55 0.72 0.45 -0.74 -0.92 -0.02 -0.28 0.09 -0.31 -1.07 -1.27
-1.32 -1.14 - 0.98 0.94 0.36 0.52 0.06 0.54 -1.62 0.91 -0.19 0.51 0.46 0.26 -2.12 -0.55 -0.48 -0.3 -0.71 0.57 0.19 -0.16 -0.57 0.16 -0.77
-1.41 -1.5 -2.89 -0.54 0.71 0.62 0.49 -0.37 0.45 -1.53 0.83 0.38 0.15 -0.02 0.16 0.17 0.36 0.25 -0.1 -0.73 -0.05 0.25 -0.22 -0.15 0.17 -0.1
0.12 -1.33 -1.47 -1.32 0.72 0.24 -0.08 0.38 -0.09 -0.01 1.04 0.47 0.54 0.63 -0.15 0.22 0.96 0.0 -1.46 -1.32 -0.31 -0.8 -0.49 -1.66 0.11 0.08
0.02 -0.36 -0.93 -2.01 0.35 0.56 0.36 0.26 0.62 0.67 0.08 0.23 0.13 -0.23 0.17 -2.9 -1.49 -0.1 -0.01 0.13 -0.07 0.07 0.04 -0.35 0.25 0.34
-0.03 -1.04 - -1.18 0.8 0.53 0.62 0.22 0.44 -0.34 0.58 0.16 0.24 0.2 -0.04 0.48 0.46 -0.03 -0.81 -0.53 -0.37 -1.32 -0.04 0.12 -0.07 -0.05
- - - 0.34 0.93 0.84 0.96 0.3 1.05 -1.13 1.24 0.53 0.88 0.34 0.6 - -2.06 0.59 - -1.23 0.79 - -0.0 0.02 -0.65 -1.51
1.02 -0.33 -0.69 -0.85 0.55 0.74 0.33 -0.41 0.37 -0.72 0.26 0.38 -0.19 -0.63 -0.22 -0.88 0.35 -0.13 -0.99 -0.63 -0.32 -0.36 -0.37 0.51 0.35 0.2
- - - - 0.9 0.97 0.31 0.17 0.43 - 0.75 0.98 0.64 0.64 0.89 1.08 0.19 - - 0.4 - 0.5 0.95 -0.26 -0.67 -1.12
0.79 -7.6 - -1.46 0.87 0.82 0.48 0.04 0.96 0.12 0.83 0.39 0.43 0.21 0.27 - -1.81 -0.06 0.22 -3.22 -3.13 -0.1 -0.72 -0.28 0.66 0.58
-3.1 0.23 - -3.06 1.48 1.21 0.51 0.69 -0.48 -2.82 -0.41 -0.76 -1.27 -0.56 -0.88 0.76 0.16 0.14 -1.0 0.56 0.6 0.97 0.3 0.1 -0.91 -1.29
-1.4 -1.84 -3.08 -0.25 0.8 0.42 0.35 -0.21 -0.16 -0.84 0.98 0.42 0.42 0.51 -0.25 -0.13 0.26 0.83 -0.85 -1.05 0.52 -0.98 0.08 0.23 -0.29 -0.16
-1.36 -3.4 - 0.37 0.83 0.45 0.54 -0.38 0.21 -2.43 1.17 0.49 0.72 0.54 -0.15 -0.35 -0.04 0.62 -0.12 -0.94 0.08 -1.04 0.22 -0.38 -0.36 -0.22
0.53 -0.91 -1.27 -0.42 0.37 0.54 0.56 0.27 0.6 -0.02 0.26 0.33 0.06 0.12 0.43 -3.17 -0.76 0.05 -1.46 -0.5 -0.43 -0.38 -0.47 0.11 0.7 0.34
-3.96 -1.05 - 0.54 0.74 0.78 -0.22 -0.09 -0.47 -2.52 0.01 0.1 -0.68 -0.64 -0.52 0.97 0.35 -0.8 -0.8 0.7 1.25 1.45 0.19 -1.05 -1.33 -0.48
0.04 -0.73 -1.86 -1.06 0.67 0.56 0.22 -0.05 0.24 -0.83 0.46 -0.04 -0.23 -0.37 -0.49 0.48 -0.02 0.51 -0.78 -0.81 0.75 0.6 0.04 0.12 -0.58 0.07
-0.52 0.0 -0.2 -0.35 0.67 0.38 0.29 0.55 0.43 -0.25 0.4 0.1 0.26 0.02 0.16 0.08 0.11 -0.39 -0.15 -0.7 -0.51 0.01 -0.53 -0.17 -0.5 -0.41
-1.08 0.04 -1.68 -1.29 0.66 0.37 0.82 0.38 0.46 -0.24 0.65 0.23 -0.03 0.4 0.04 0.41 0.41 0.04 -0.59 -0.67 0.01 -0.58 -0.54 -0.1 -0.75 -0.57
-1.24 -4.03 - -0.49 0.85 0.91 0.27 0.21 0.29 -0.56 0.82 0.67 0.4 0.52 0.66 0.7 -0.93 -0.42 -1.19 -1.09 -0.31 0.31 -0.05 0.27 -0.77 -0.85
-0.38 -1.78 - 0.45 0.75 0.85 0.31 -0.69 -0.02 -1.99 0.74 0.3 -0.05 -0.03 -0.43 0.3 0.77 -0.05 -0.71 -0.24 -0.07 -0.53 0.26 -0.51 0.25 0.38
-1.1 - - - 1.0 0.38 0.17 -0.27 -0.62 -0.41 0.31 -0.07 -0.5 -0.75 -1.5 -0.5 0.96 -0.12 0.92 0.13 1.48 1.39 -1.23 0.1 -0.24 -0.54
0.64 -1.14 -3.54 -0.92 0.83 0.69 0.39 0.21 0.57 -0.01 0.25 0.06 -0.13 -0.37 0.21 -0.47 -0.37 -0.38 -0.64 -0.3 -0.07 -0.7 0.05 0.22 0.43 0.17
0.47 -1.7 0.63 -2.98 0.79 -0.53 0.24 0.55 0.19 -0.45 1.47 0.51 0.87 0.94 0.16 0.4 0.83 -0.72 -3.7 -2.66 -0.09 -4.77 -0.95 -2.61 -1.09 -0.85
1.31 -3.31 -2.54 -2.4 -0.11 0.52 0.58 -0.36 0.62 -0.51 -0.01 0.31 0.17 -0.4 0.1 -0.05 0.37 0.37 -0.72 -1.44 -0.17 -1.25 0.28 0.51 0.42 0.25
-0.17 -0.48 -0.0 -0.77 0.04 0.24 0.08 0.4 0.56 0.23 0.03 0.07 0.06 -0.06 0.5 -1.25 -1.52 -0.15 0.41 0.42 -0.14 -0.28 -0.19 -0.51 0.24 0.32
-1.51 -3.32 -6.46 0.13 0.45 0.44 0.87 -0.26 0.98 -0.96 0.72 0.53 0.42 -0.04 0.9 -0.85 0.1 -0.05 -1.24 -1.24 0.08 -0.44 0.19 -0.06 0.32 -0.45
-1.49 - - 0.96 1.13 0.31 0.12 -0.93 -0.09 -1.93 0.47 0.04 -0.6 -0.3 -0.37 1.27 -0.33 0.28 -1.2 -0.04 0.78 0.2 0.31 -0.32 -0.2 0.25
-1.63 -3.96 - 0.16 0.62 0.12 0.05 -0.3 0.15 0.14 0.36 0.25 -1.76 -0.29 -0.36 - 0.69 -0.05 0.54 -0.69 0.74 1.79 0.94 -0.14 -0.84 -1.82
0.47 -1.17 -2.39 -1.09 0.95 0.84 0.34 0.14 0.39 -1.7 0.52 0.16 0.09 -0.03 -0.06 -0.36 0.24 -0.15 -1.32 -0.7 0.35 0.06 -0.18 0.09 -0.31 0.4
- - - -2.13 1.39 1.7 1.03 -0.3 0.03 -0.21 1.17 1.2 -0.11 0.12 -0.35 0.29 2.0 - - -1.3 - - -1.08 -0.3 -0.86 -1.58
-0.09 -1.69 - -0.23 0.58 -0.34 0.62 -0.27 0.6 0.54 0.39 -0.32 0.47 0.27 0.51 0.82 0.98 -0.25 -1.31 -1.48 0.15 -2.46 -0.26 -0.89 0.19 0.02
-0.8 -0.38 - -1.61 0.81 0.38 0.53 0.46 0.3 -2.04 0.81 0.32 0.09 0.06 -0.32 0.73 0.63 -0.25 -0.19 -0.52 0.01 -0.14 -0.38 -0.46 0.3 -0.28
-1.92 -1.47 -3.08 0.35 0.98 0.98 0.43 -0.59 0.02 -1.09 1.02 0.64 -0.37 0.05 0.03 -0.36 0.56 0.5 -1.65 -0.57 -0.58 0.18 0.41 -0.15 -0.49 -0.47
- - - -0.27 1.75 1.67 0.81 0.65 0.78 - 1.17 1.07 0.91 0.71 -0.07 - -1.8 - - -1.96 - -2.06 -1.73 0.83 0.07 -0.24
-0.23 -1.4 - -1.93 0.81 0.58 0.57 0.59 0.32 -0.99 1.06 0.13 0.48 0.68 -0.03 -0.17 0.24 -0.15 -3.27 -2.09 1.07 -1.6 -0.06 -0.62 -0.16 0.16
-1.56 - - 0.56 0.21 0.77 0.75 -0.84 0.61 -1.27 0.42 0.49 0.53 0.29 0.65 -0.77 1.02 0.28 -1.55 -0.37 0.21 -3.05 0.08 0.07 0.02 -0.23
-0.66 -0.26 -0.97 -0.52 0.78 0.44 0.3 0.31 0.07 -0.65 0.59 0.53 0.24 0.45 0.18 0.56 0.44 -0.48 -0.91 -0.68 -0.73 0.39 -0.61 -0.48 -0.19 -0.79
- -1.33 -0.68 -0.85 0.45 0.48 0.45 -0.36 0.04 -1.12 0.69 0.62 0.44 -0.1 0.55 0.13 0.9 -0.85 -0.66 0.08 -0.33 0.72 -0.06 -0.27 -0.08 -0.46
1.55 -3.25 - -1.06 -0.01 -0.16 0.11 -0.78 0.4 0.23 -0.14 0.24 0.48 -0.21 0.66 -2.28 -0.86 0.22 0.27 0.57 -0.32 -0.83 0.12 0.56 0.21 -0.27
-0.29 -5.15 - -1.59 1.08 0.92 0.64 0.38 0.05 -0.73 0.69 0.95 0.23 0.52 0.2 0.54 0.59 -1.43 -0.58 -1.12 -1.55 -0.77 -0.6 0.37 -0.03 -0.51
-0.26 -1.78 - -0.25 0.95 1.53 0.52 -0.24 0.16 -0.62 0.81 0.64 0.22 0.28 -0.02 0.39 0.5 -0.2 -0.7 -1.35 -1.82 0.19 -0.97 0.04 -1.54 -0.77
- - - - 1.4 0.13 0.81 -0.26 0.79 - 1.29 0.82 0.93 -0.15 0.02 0.25 -0.32 0.49 -0.25 -2.07 0.21 0.41 -0.85 -0.26 -0.78 -0.02
-0.82 -1.88 - -2.23 0.68 0.37 0.97 -0.22 0.67 -0.02 0.49 0.1 0.11 0.18 0.71 0.74 -1.27 0.46 -1.2 -2.02 0.77 -0.32 0.01 -0.0 -0.23 -0.24
0.35 -2.35 -2.05 -1.42 0.83 0.57 0.71 0.29 0.57 -1.31 0.67 0.61 0.32 -0.02 0.48 -0.59 0.08 -0.23 -1.85 -0.6 -0.97 -0.63 -0.24 0.46 0.16 0.21
-3.14 - - -0.49 1.04 0.74 0.93 -0.42 0.52 -0.9 1.25 0.22 0.26 0.06 0.14 -0.04 0.89 0.34 -0.98 -1.8 0.36 -2.9 0.01 0.4 -0.64 -0.62
-4.49 - - -0.57 0.89 1.02 0.98 -0.02 0.69 0.41 1.06 0.08 0.2 0.65 0.44 -0.23 0.34 0.8 -2.32 -1.14 -0.86 -0.66 -1.92 0.52 -0.93 -1.54
-1.73 -0.89 -1.72 -0.44 0.68 0.3 0.68 -0.24 0.67 0.11 0.68 -0.06 0.4 0.23 0.34 0.39 0.65 -0.5 -1.38 -1.47 0.03 -0.89 -0.45 -0.23 0.37 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.