Heatmap: Cluster_248 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000036.1_cds_GFH06390.1_867 (GFH06390)	0.08	0.03	0.0	0.17	0.15	0.12	0.06	0.04	0.09	1.0	0.1	0.06	0.09	0.07	0.04	0.81	0.86	0.46	0.17	0.25	0.88	0.55	0.6	0.06	0.31	0.12
lcl\|BLLF01000061.1_cds_GFH06888.1_1365 (GFH06888)	0.19	0.0	0.0	0.0	0.26	0.34	0.14	0.22	0.18	0.8	0.15	0.15	0.22	0.18	0.2	0.98	0.63	0.92	0.56	0.32	0.87	0.65	1.0	0.24	0.42	0.42
lcl\|BLLF01000083.1_cds_GFH07250.1_1727 (GFH07250)	0.31	0.19	0.0	0.12	0.12	0.14	0.22	0.08	0.18	0.74	0.15	0.12	0.16	0.09	0.18	0.91	0.69	1.0	0.26	0.58	0.87	0.44	0.73	0.21	0.25	0.2
lcl\|BLLF01000106.1_cds_GFH07635.1_2112 (GFH07635)	0.15	0.15	0.0	0.03	0.09	0.2	0.15	0.07	0.15	1.0	0.11	0.14	0.15	0.08	0.06	0.64	0.44	0.72	0.21	0.13	0.75	0.29	0.91	0.07	0.13	0.18
lcl\|BLLF01000112.1_cds_GFH07741.1_2218 (GFH07741)	0.21	0.14	0.0	0.06	0.26	0.23	0.16	0.14	0.18	0.72	0.27	0.14	0.15	0.18	0.09	0.6	0.66	0.78	0.17	0.27	1.0	0.68	0.53	0.19	0.24	0.25
lcl\|BLLF01000165.1_cds_GFH08490.1_2967 (GFH08490)	0.07	0.25	0.04	0.04	0.25	0.22	0.16	0.22	0.13	0.91	0.32	0.19	0.17	0.27	0.07	0.97	1.0	0.93	0.25	0.37	0.88	0.76	0.98	0.25	0.17	0.35
lcl\|BLLF01000191.1_cds_GFH08881.1_3358 (GFH08881)	0.41	0.2	0.06	0.16	0.32	0.22	0.26	0.33	0.33	0.75	0.33	0.24	0.3	0.3	0.2	0.65	0.41	0.75	0.22	0.44	1.0	0.49	0.52	0.19	0.21	0.26
lcl\|BLLF01000218.1_cds_GFH09228.1_3705 (GFH09228)	0.19	0.13	0.08	0.01	0.16	0.17	0.16	0.15	0.14	0.86	0.18	0.14	0.12	0.12	0.1	1.0	0.98	0.67	0.22	0.49	0.86	0.96	0.54	0.29	0.36	0.31
lcl\|BLLF01000260.1_cds_GFH09761.1_4238 (GFH09761)	0.22	0.1	0.0	0.1	0.26	0.22	0.16	0.21	0.21	0.68	0.26	0.15	0.22	0.2	0.16	0.74	0.73	0.81	0.33	0.93	0.96	1.0	0.66	0.24	0.27	0.15
lcl\|BLLF01000269.1_cds_GFH09853.1_4330 (GFH09853)	0.2	0.2	0.0	0.0	0.02	0.1	0.06	0.04	0.1	0.22	0.02	0.18	0.13	0.1	0.03	0.46	0.11	0.6	0.23	0.0	1.0	0.0	0.12	0.08	0.17	0.23
lcl\|BLLF01000285.1_cds_GFH10071.1_4548 (GFH10071)	0.37	0.0	0.0	0.16	0.29	0.14	0.27	0.14	0.31	0.81	0.2	0.09	0.2	0.22	0.21	0.71	0.58	0.78	0.5	0.66	1.0	0.44	0.55	0.18	0.12	0.1
lcl\|BLLF01000286.1_cds_GFH10096.1_4573 (GFH10096)	0.13	0.13	0.0	0.01	0.16	0.2	0.12	0.13	0.12	0.68	0.18	0.19	0.19	0.16	0.07	0.69	0.35	0.74	0.3	0.31	0.84	0.7	1.0	0.17	0.25	0.28
lcl\|BLLF01000410.1_cds_GFH11508.1_5985 (GFH11508)	0.13	0.26	0.15	0.06	0.29	0.27	0.26	0.2	0.21	0.73	0.29	0.27	0.18	0.26	0.11	0.58	0.54	0.78	0.14	0.26	1.0	0.98	0.69	0.25	0.44	0.58
lcl\|BLLF01000411.1_cds_GFH11524.1_6001 (GFH11524)	0.06	0.19	0.0	0.03	0.12	0.19	0.14	0.06	0.19	0.82	0.1	0.16	0.13	0.11	0.08	1.0	0.74	0.8	0.19	0.14	0.91	0.25	0.95	0.07	0.14	0.17
lcl\|BLLF01000420.1_cds_GFH11632.1_6109 (GFH11632)	0.07	0.0	0.0	0.19	0.06	0.11	0.19	0.04	0.17	0.93	0.09	0.11	0.22	0.09	0.14	1.0	0.77	0.57	0.18	0.23	0.62	0.24	0.45	0.14	0.13	0.17
lcl\|BLLF01000453.1_cds_GFH11959.1_6436 (GFH11959)	0.39	0.0	0.0	0.15	0.05	0.0	0.0	0.06	0.11	0.32	0.0	0.0	0.02	0.1	0.09	0.3	0.11	0.42	0.17	0.37	1.0	0.0	0.35	0.08	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000459.1_cds_GFH12013.1_6490 (GFH12013)	0.56	0.24	0.0	0.2	0.32	0.21	0.15	0.22	0.25	0.87	0.23	0.16	0.16	0.14	0.18	0.83	0.45	0.95	0.34	0.35	0.88	0.39	1.0	0.12	0.37	0.35
lcl\|BLLF01000537.1_cds_GFH12762.1_7239 (GFH12762)	0.4	0.22	0.0	0.01	0.16	0.19	0.14	0.15	0.14	1.0	0.19	0.26	0.3	0.14	0.13	0.46	0.74	0.85	0.27	0.43	0.82	0.59	0.95	0.07	0.16	0.12
lcl\|BLLF01000553.1_cds_GFH12905.1_7382 (GFH12905)	0.15	0.05	0.16	0.03	0.23	0.27	0.2	0.25	0.19	0.59	0.21	0.22	0.17	0.18	0.11	0.68	0.56	0.61	0.52	0.28	0.83	1.0	0.51	0.21	0.13	0.15
lcl\|BLLF01000553.1_cds_GFH12906.1_7383 (GFH12906)	0.18	0.1	0.0	0.05	0.28	0.32	0.2	0.26	0.25	0.99	0.28	0.23	0.18	0.25	0.13	1.0	0.77	0.74	0.84	0.39	0.94	0.63	0.57	0.14	0.21	0.25
lcl\|BLLF01000553.1_cds_GFH12907.1_7384 (GFH12907)	0.19	0.23	0.08	0.07	0.39	0.51	0.43	0.52	0.48	0.73	0.36	0.42	0.5	0.37	0.46	0.7	0.61	0.73	0.48	0.41	0.89	1.0	0.76	0.26	0.42	0.27
lcl\|BLLF01000875.1_cds_GFH15623.1_10100 (GFH15623)	0.02	0.07	0.09	0.04	0.08	0.15	0.14	0.08	0.13	0.96	0.12	0.07	0.17	0.11	0.07	0.85	0.85	1.0	0.2	0.17	0.76	0.29	0.81	0.14	0.24	0.28
lcl\|BLLF01000985.1_cds_GFH16366.1_10843 (GFH16366)	0.43	0.15	0.0	0.08	0.15	0.14	0.17	0.15	0.2	0.58	0.13	0.14	0.14	0.14	0.1	0.39	0.3	0.61	0.17	0.17	1.0	0.31	0.33	0.12	0.09	0.12
lcl\|BLLF01001070.1_cds_GFH16914.1_11391 (GFH16914)	0.06	0.04	0.0	0.0	0.09	0.13	0.11	0.08	0.1	0.61	0.16	0.12	0.12	0.13	0.08	1.0	0.29	0.53	0.14	0.19	0.7	0.47	0.69	0.18	0.15	0.21
lcl\|BLLF01001195.1_cds_GFH17743.1_12220 (GFH17743)	0.11	0.15	0.0	0.05	0.19	0.17	0.11	0.16	0.11	0.79	0.2	0.12	0.1	0.17	0.06	0.63	0.58	0.9	0.22	0.33	1.0	0.79	0.89	0.21	0.16	0.21
lcl\|BLLF01001243.1_cds_GFH18066.1_12543 (GFH18066)	0.14	0.01	0.0	0.0	0.29	0.36	0.27	0.23	0.26	0.61	0.31	0.29	0.3	0.34	0.21	0.99	0.7	1.0	0.65	0.32	0.81	0.97	0.87	0.3	0.1	0.14
lcl\|BLLF01001380.1_cds_GFH18922.1_13399 (GFH18922)	0.46	0.26	0.12	0.18	0.22	0.31	0.29	0.21	0.24	1.0	0.25	0.31	0.28	0.29	0.18	0.53	0.41	0.66	0.34	0.21	0.71	0.39	0.71	0.24	0.22	0.26
lcl\|BLLF01001433.1_cds_GFH19270.1_13747 (GFH19270)	0.25	0.25	0.0	0.04	0.22	0.25	0.23	0.14	0.26	0.77	0.26	0.23	0.3	0.24	0.19	1.0	0.54	0.83	0.27	0.33	0.7	0.61	0.82	0.2	0.38	0.42
lcl\|BLLF01001480.1_cds_GFH19534.1_14011 (GFH19534)	0.04	0.16	0.0	0.0	0.28	0.21	0.15	0.23	0.18	0.92	0.3	0.18	0.11	0.15	0.11	1.0	0.36	0.6	0.36	0.43	0.85	0.33	0.8	0.28	0.28	0.24
lcl\|BLLF01001532.1_cds_GFH19866.1_14343 (GFH19866)	0.09	0.01	0.0	0.02	0.22	0.14	0.11	0.08	0.13	0.54	0.2	0.13	0.14	0.09	0.1	0.73	0.7	0.84	0.25	0.38	0.94	1.0	0.46	0.32	0.11	0.16
lcl\|BLLF01001621.1_cds_GFH20370.1_14847 (GFH20370)	0.12	0.17	0.0	0.25	0.15	0.17	0.15	0.09	0.13	1.0	0.21	0.13	0.2	0.21	0.11	0.54	0.94	0.71	0.44	0.31	0.97	0.32	0.62	0.13	0.23	0.3
lcl\|BLLF01001767.1_cds_GFH21134.1_15611 (GFH21134)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.84	0.04	0.03	0.01	0.03	0.05	0.71	0.64	0.67	0.16	0.25	1.0	0.17	0.57	0.09	0.02	0.02
lcl\|BLLF01001792.1_cds_GFH21263.1_15740 (GFH21263)	0.28	0.12	0.0	0.05	0.22	0.24	0.26	0.18	0.28	0.81	0.28	0.25	0.23	0.23	0.29	0.99	0.56	1.0	0.17	0.51	0.99	0.69	0.78	0.3	0.25	0.24
lcl\|BLLF01001918.1_cds_GFH21854.1_16331 (GFH21854)	0.71	0.51	0.27	0.65	0.6	0.49	0.47	0.4	0.56	0.98	0.58	0.48	0.5	0.38	0.5	0.97	0.79	1.0	0.49	0.66	0.99	0.77	0.98	0.41	0.62	0.72
lcl\|BLLF01001925.1_cds_GFH21889.1_16366 (GFH21889)	0.51	0.43	0.12	0.32	0.33	0.29	0.36	0.27	0.37	1.0	0.36	0.28	0.29	0.29	0.34	0.69	0.79	0.91	0.34	0.62	0.8	0.64	0.77	0.3	0.33	0.29
lcl\|BLLF01002086.1_cds_GFH22639.1_17116 (GFH22639)	0.3	0.19	0.0	0.14	0.22	0.2	0.19	0.1	0.13	0.85	0.23	0.23	0.16	0.12	0.14	1.0	0.45	0.86	0.2	0.3	0.67	0.29	0.72	0.16	0.27	0.52
lcl\|BLLF01002156.1_cds_GFH22929.1_17406 (GFH22929)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.75	0.05	0.0	0.04	0.06	0.03	0.69	0.74	0.73	0.1	0.12	0.9	0.55	1.0	0.16	0.26	0.21
lcl\|BLLF01002236.1_cds_GFH23285.1_17762 (GFH23285)	0.19	0.01	0.0	0.01	0.19	0.28	0.19	0.15	0.3	0.86	0.22	0.25	0.2	0.15	0.13	0.76	0.52	0.96	0.23	0.3	1.0	0.79	0.94	0.22	0.25	0.33
lcl\|BLLF01002254.1_cds_GFH23361.1_17838 (GFH23361)	0.18	0.15	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.63	0.0	0.02	0.02	0.01	0.01	1.0	0.77	0.41	0.14	0.32	0.69	0.75	0.87	0.14	0.17	0.14
lcl\|BLLF01002451.1_cds_GFH24130.1_18607 (GFH24130)	0.41	0.12	0.0	0.17	0.26	0.34	0.32	0.18	0.26	0.71	0.34	0.32	0.3	0.25	0.24	0.63	0.32	0.93	0.19	0.22	1.0	0.76	0.77	0.19	0.42	0.41
lcl\|BLLF01002461.1_cds_GFH24166.1_18643 (GFH24166)	0.52	0.23	0.0	0.11	0.31	0.25	0.24	0.24	0.28	0.79	0.38	0.28	0.27	0.31	0.25	0.79	0.25	0.68	0.2	0.32	1.0	0.34	0.64	0.19	0.32	0.51
lcl\|BLLF01002629.1_cds_GFH24775.1_19252 (GFH24775)	0.27	0.16	0.16	0.11	0.26	0.31	0.29	0.19	0.28	1.0	0.26	0.26	0.23	0.21	0.27	0.69	0.86	0.72	0.37	0.2	0.74	0.35	0.63	0.15	0.26	0.22
lcl\|BLLF01002733.1_cds_GFH25147.1_19624 (GFH25147)	0.18	0.09	0.0	0.01	0.17	0.28	0.2	0.18	0.17	0.57	0.21	0.25	0.26	0.25	0.15	1.0	0.63	0.71	0.21	0.34	0.96	0.73	0.93	0.24	0.18	0.18
lcl\|BLLF01002736.1_cds_GFH25157.1_19634 (GFH25157)	0.33	0.16	0.0	0.01	0.2	0.39	0.25	0.21	0.25	1.0	0.33	0.29	0.26	0.23	0.16	0.67	0.5	0.86	0.25	0.26	0.77	0.72	0.94	0.07	0.2	0.22
lcl\|BLLF01002744.1_cds_GFH25184.1_19661 (GFH25184)	0.43	0.1	0.0	0.55	0.29	0.31	0.33	0.16	0.25	1.0	0.31	0.21	0.27	0.22	0.19	0.74	0.75	0.89	0.32	0.38	0.83	0.24	0.79	0.23	0.39	0.37
lcl\|BLLF01002929.1_cds_GFH25824.1_20301 (GFH25824)	0.4	0.22	0.05	0.08	0.34	0.39	0.4	0.27	0.34	0.61	0.42	0.31	0.37	0.39	0.32	0.89	0.71	0.85	0.54	0.39	0.83	1.0	0.71	0.43	0.33	0.44
lcl\|BLLF01002994.1_cds_GFH26024.1_20501 (GFH26024)	0.37	0.44	0.0	0.23	0.36	0.43	0.28	0.24	0.31	0.86	0.36	0.3	0.31	0.29	0.25	0.57	0.52	1.0	0.45	0.47	0.96	0.75	0.59	0.19	0.41	0.58
lcl\|BLLF01003159.1_cds_GFH26538.1_21015 (GFH26538)	0.11	0.42	0.0	0.0	0.05	0.17	0.13	0.1	0.09	0.62	0.12	0.12	0.22	0.14	0.06	0.83	0.56	0.8	0.13	0.36	0.97	0.37	1.0	0.11	0.13	0.21
lcl\|BLLF01003427.1_cds_GFH27302.1_21779 (GFH27302)	0.08	0.42	0.0	0.1	0.23	0.23	0.17	0.19	0.19	0.57	0.22	0.13	0.21	0.2	0.11	0.67	0.52	0.79	0.4	0.37	1.0	0.66	0.75	0.11	0.17	0.16
lcl\|BLLF01003441.1_cds_GFH27349.1_21826 (GFH27349)	0.3	0.18	0.0	0.06	0.24	0.22	0.22	0.14	0.4	0.89	0.24	0.16	0.23	0.18	0.31	0.73	0.51	0.65	0.24	0.37	1.0	0.23	0.73	0.1	0.16	0.21
lcl\|BLLF01003449.1_cds_GFH27371.1_21848 (GFH27371)	0.0	0.03	0.0	0.01	0.1	0.09	0.1	0.03	0.1	0.58	0.1	0.09	0.09	0.06	0.07	1.0	0.65	0.67	0.21	0.15	0.54	0.51	0.63	0.14	0.26	0.44
lcl\|BLLF01003611.1_cds_GFH27768.1_22245 (GFH27768)	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.58	0.0	0.54	0.41	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003653.1_cds_GFH27871.1_22348 (GFH27871)	0.23	0.04	0.0	0.14	0.24	0.22	0.24	0.12	0.22	0.85	0.25	0.18	0.17	0.18	0.16	0.93	0.52	0.64	0.28	0.44	1.0	0.21	0.79	0.14	0.17	0.2
lcl\|BLLF01003829.1_cds_GFH28320.1_22797 (GFH28320)	0.2	0.18	0.03	0.05	0.2	0.34	0.3	0.27	0.32	0.78	0.23	0.29	0.3	0.26	0.23	0.77	0.61	0.66	0.26	0.31	0.83	1.0	0.71	0.14	0.31	0.45
lcl\|BLLF01004111.1_cds_GFH28940.1_23417 (GFH28940)	0.22	0.28	0.0	0.02	0.16	0.16	0.1	0.32	0.2	0.81	0.17	0.15	0.21	0.23	0.17	0.53	0.36	0.77	0.26	0.24	1.0	0.83	0.68	0.22	0.23	0.47
lcl\|BLLF01004204.1_cds_GFH29147.1_23624 (GFH29147)	0.3	0.01	0.0	0.08	0.3	0.3	0.18	0.22	0.16	0.83	0.3	0.25	0.2	0.25	0.14	0.8	0.57	0.88	0.45	0.28	1.0	0.89	0.74	0.18	0.24	0.21
lcl\|BLLF01004874.1_cds_GFH30388.1_24865 (GFH30388)	0.0	0.33	0.0	0.03	0.16	0.16	0.14	0.25	0.17	0.58	0.2	0.15	0.08	0.1	0.11	0.65	0.23	0.9	0.16	0.29	0.82	0.85	1.0	0.21	0.35	0.35
lcl\|BLLF01005160.1_cds_GFH30815.1_25292 (GFH30815)	0.29	0.23	0.04	0.1	0.3	0.41	0.36	0.36	0.39	0.72	0.34	0.36	0.34	0.32	0.31	0.75	0.53	0.64	0.32	0.35	0.7	1.0	0.61	0.21	0.4	0.49
lcl\|BLLF01006225.1_cds_GFH32074.1_26551 (GFH32074)	0.22	0.32	0.07	0.18	0.35	0.28	0.26	0.33	0.33	0.79	0.29	0.25	0.38	0.37	0.3	0.6	0.77	0.75	0.43	0.49	1.0	0.95	0.61	0.3	0.2	0.32
lcl\|BLLF01007965.1_cds_GFH33195.1_27672 (GFH33195)	0.25	0.16	0.0	0.05	0.1	0.18	0.12	0.11	0.14	0.96	0.23	0.18	0.08	0.16	0.08	1.0	0.85	0.84	0.0	0.42	0.84	0.29	0.44	0.15	0.04	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)