Heatmap: Cluster_218 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000025.1_cds_GFH06177.1_654 (GFH06177)	0.5	0.29	0.11	0.07	0.04	0.17	0.16	0.16	0.07	0.28	0.02	0.37	0.19	0.08	0.35	0.36	0.08	0.0	0.02	0.62	0.0	0.81	0.0	0.43	1.0	0.51
lcl\|BLLF01000060.1_cds_GFH06859.1_1336 (GFH06859)	0.31	0.39	0.24	0.41	0.45	0.57	0.56	0.65	0.66	1.0	0.39	0.45	0.5	0.4	0.61	0.32	0.37	0.57	0.68	0.71	0.52	0.39	0.51	0.36	0.49	0.41
lcl\|BLLF01000061.1_cds_GFH06890.1_1367 (GFH06890)	0.11	0.15	0.0	0.38	0.23	0.21	0.26	0.29	0.29	0.68	0.17	0.23	0.26	0.23	0.22	0.63	0.07	0.44	0.21	0.63	0.68	0.67	0.42	0.4	0.26	1.0
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07905.1_2382 (GFH07905)	0.23	0.32	0.43	0.19	0.46	0.46	0.47	0.56	0.7	1.0	0.42	0.39	0.57	0.38	0.68	0.36	0.51	0.87	0.68	0.86	0.84	0.33	0.77	0.46	0.8	0.61
lcl\|BLLF01000132.1_cds_GFH08030.1_2507 (GFH08030)	0.58	0.21	0.32	0.54	0.69	0.46	0.54	0.34	0.46	0.57	0.55	0.43	0.39	0.42	0.47	0.76	1.0	0.62	0.39	0.37	0.7	0.5	0.59	0.41	0.68	0.6
lcl\|BLLF01000185.1_cds_GFH08794.1_3271 (GFH08794)	0.08	0.0	0.0	0.16	0.42	0.55	0.48	0.55	0.82	1.0	0.58	0.43	0.72	0.46	0.6	0.12	0.03	0.36	0.73	0.98	0.82	0.23	0.52	0.28	0.95	0.97
lcl\|BLLF01000255.1_cds_GFH09708.1_4185 (GFH09708)	0.14	0.04	0.0	0.0	0.39	0.48	0.37	0.12	0.32	0.67	0.38	0.33	0.22	0.19	0.15	0.09	0.03	0.33	0.21	0.58	0.63	1.0	0.37	0.52	0.41	0.68
lcl\|BLLF01000266.1_cds_GFH09829.1_4306 (GFH09829)	0.07	0.02	0.0	0.09	0.53	0.57	0.45	0.36	0.47	1.0	0.43	0.33	0.55	0.36	0.45	0.39	0.24	0.43	0.43	0.54	0.41	0.22	0.36	0.39	0.37	0.31
lcl\|BLLF01000343.1_cds_GFH10750.1_5227 (GFH10750)	0.17	0.01	0.0	0.04	0.47	0.49	0.41	0.41	0.56	1.0	0.33	0.28	0.48	0.28	0.45	0.24	0.38	0.52	0.46	0.77	0.59	0.47	0.42	0.35	0.58	0.63
lcl\|BLLF01000430.1_cds_GFH11733.1_6210 (GFH11733)	0.87	0.31	0.21	0.31	0.62	0.52	0.57	0.28	0.56	0.78	0.52	0.48	0.39	0.33	0.44	0.84	1.0	0.44	0.46	0.56	0.45	0.67	0.44	0.55	0.91	0.66
lcl\|BLLF01000470.1_cds_GFH12118.1_6595 (GFH12118)	0.21	0.13	0.0	0.11	0.2	0.35	0.11	0.09	0.21	0.9	0.16	0.14	0.17	0.11	0.11	0.35	0.17	0.54	0.14	0.23	1.0	0.72	0.27	0.53	0.4	0.97
lcl\|BLLF01000491.1_cds_GFH12326.1_6803 (GFH12326)	0.47	0.51	0.51	0.3	0.33	0.33	0.33	0.4	0.33	1.0	0.38	0.44	0.36	0.37	0.31	0.4	0.36	0.31	0.26	0.31	0.28	0.94	0.31	0.36	0.55	0.47
lcl\|BLLF01000493.1_cds_GFH12343.1_6820 (GFH12343)	0.36	0.62	0.0	0.38	0.08	0.3	0.2	0.06	0.05	0.22	0.09	0.6	0.21	0.09	0.2	0.62	0.57	0.06	0.27	0.92	0.0	0.76	0.0	0.52	1.0	0.22
lcl\|BLLF01000575.1_cds_GFH13106.1_7583 (GFH13106)	0.58	0.09	0.0	0.16	0.02	0.06	0.19	0.06	0.16	0.87	0.03	0.34	0.2	0.14	0.31	0.53	0.05	0.0	0.24	0.71	0.0	1.0	0.01	0.31	0.72	0.95
lcl\|BLLF01000589.1_cds_GFH13235.1_7712 (GFH13235)	0.59	0.17	0.09	0.57	0.43	0.36	0.37	0.3	0.2	0.5	0.41	0.41	0.42	0.25	0.5	0.75	1.0	0.41	0.1	0.32	0.33	0.52	0.39	0.43	0.66	0.57
lcl\|BLLF01000672.1_cds_GFH13971.1_8448 (GFH13971)	0.22	0.0	0.0	0.15	0.1	0.16	0.31	0.42	0.21	0.34	0.19	0.18	0.41	0.53	0.41	0.06	0.02	0.26	0.73	0.24	0.61	0.55	0.48	0.35	0.24	1.0
lcl\|BLLF01000707.1_cds_GFH14272.1_8749 (GFH14272)	0.07	0.11	0.0	0.0	0.2	0.25	0.19	0.37	0.22	0.0	0.34	0.19	0.34	0.33	0.33	0.07	0.14	0.24	0.62	0.41	0.35	0.58	0.36	0.22	0.52	1.0
lcl\|BLLF01000753.1_cds_GFH14678.1_9155 (GFH14678)	0.0	0.18	0.0	0.15	0.45	0.38	0.2	0.36	0.33	0.39	0.34	0.31	0.31	0.3	0.27	0.19	0.17	0.2	0.35	0.64	0.55	1.0	0.31	0.36	0.64	0.69
lcl\|BLLF01000975.1_cds_GFH16286.1_10763 (GFH16286)	0.85	0.09	0.0	0.14	0.17	0.37	0.58	0.08	0.46	0.18	0.15	0.24	0.23	0.14	0.45	1.0	0.79	0.55	0.43	0.67	0.59	0.58	0.44	0.27	0.79	0.85
lcl\|BLLF01001047.1_cds_GFH16756.1_11233 (GFH16756)	0.37	0.32	0.15	0.08	0.05	0.08	0.09	0.08	0.12	0.46	0.06	0.1	0.08	0.06	0.11	0.5	0.13	0.23	0.12	0.2	0.29	0.07	0.21	0.22	1.0	0.66
lcl\|BLLF01001081.1_cds_GFH16994.1_11471 (GFH16994)	1.0	0.41	0.56	0.36	0.67	0.65	0.61	0.42	0.59	0.48	0.44	0.5	0.44	0.35	0.46	0.74	0.7	0.56	0.49	0.56	0.55	0.96	0.59	0.72	0.86	0.72
lcl\|BLLF01001321.1_cds_GFH18567.1_13044 (GFH18567)	0.38	0.0	0.0	0.43	0.22	0.4	0.39	0.02	0.19	0.6	0.12	0.3	0.34	0.11	0.15	0.97	1.0	0.0	0.0	0.08	0.11	0.16	0.23	0.19	0.72	0.51
lcl\|BLLF01001341.1_cds_GFH18700.1_13177 (GFH18700)	0.45	0.13	0.0	0.25	0.24	0.38	0.38	0.12	0.24	0.3	0.25	0.32	0.28	0.22	0.27	1.0	0.44	0.36	0.26	0.46	0.49	0.91	0.39	0.42	0.59	0.86
lcl\|BLLF01001468.1_cds_GFH19468.1_13945 (GFH19468)	0.68	0.23	0.0	0.04	0.23	0.46	0.43	0.14	0.33	0.55	0.23	0.32	0.33	0.28	0.3	0.61	0.24	0.37	0.43	0.4	0.5	0.72	0.62	0.39	0.63	1.0
lcl\|BLLF01001529.1_cds_GFH19840.1_14317 (GFH19840)	0.16	0.01	0.0	0.09	0.01	0.02	0.05	0.06	0.08	0.13	0.02	0.06	0.07	0.03	0.31	0.69	0.08	0.01	0.12	0.58	0.0	0.47	0.06	0.49	1.0	0.71
lcl\|BLLF01001577.1_cds_GFH20116.1_14593 (GFH20116)	0.15	0.04	0.26	0.07	0.18	0.2	0.14	0.04	0.15	0.14	0.12	0.12	0.11	0.05	0.15	1.0	0.49	0.05	0.16	0.66	0.14	0.66	0.05	0.17	0.29	0.67
lcl\|BLLF01001608.1_cds_GFH20279.1_14756 (GFH20279)	0.36	0.0	0.0	0.0	0.6	0.49	0.43	0.42	0.33	1.0	0.3	0.28	0.42	0.24	0.23	0.32	0.67	0.4	0.83	0.34	0.35	0.0	0.15	0.36	0.28	0.22
lcl\|BLLF01001667.1_cds_GFH20613.1_15090 (GFH20613)	0.54	0.17	0.14	0.3	0.23	0.23	0.23	0.15	0.21	0.58	0.27	0.24	0.28	0.29	0.22	0.8	0.77	0.28	0.19	0.25	0.44	0.15	0.4	0.43	1.0	0.3
lcl\|BLLF01001801.1_cds_GFH21296.1_15773 (GFH21296)	0.35	0.11	0.0	0.18	0.15	0.18	0.3	0.06	0.21	0.68	0.2	0.23	0.19	0.12	0.25	0.73	0.35	0.3	0.15	0.4	0.38	0.67	0.39	0.39	1.0	0.59
lcl\|BLLF01001838.1_cds_GFH21478.1_15955 (GFH21478)	0.97	0.45	0.46	0.39	0.69	0.6	0.58	0.46	0.53	0.59	0.53	0.63	0.54	0.35	0.57	0.65	0.78	0.4	0.3	0.56	0.38	1.0	0.45	0.94	0.77	0.55
lcl\|BLLF01001866.1_cds_GFH21616.1_16093 (GFH21616)	0.41	0.31	0.44	0.44	0.32	0.29	0.3	0.34	0.34	0.91	0.32	0.33	0.34	0.31	0.4	0.88	0.5	0.54	0.5	0.76	0.51	1.0	0.6	0.37	0.57	0.6
lcl\|BLLF01001920.1_cds_GFH21866.1_16343 (GFH21866)	0.4	0.2	0.0	0.31	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.56	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.5	0.11	0.09	0.33	0.46	0.18	1.0	0.07	0.06	0.17	0.33
lcl\|BLLF01001937.1_cds_GFH21951.1_16428 (GFH21951)	0.26	0.14	0.0	0.02	0.08	0.08	0.05	0.03	0.05	0.24	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.27	0.03	0.05	0.28	0.2	0.33	1.0	0.05	0.15	0.27	0.04
lcl\|BLLF01002173.1_cds_GFH23006.1_17483 (GFH23006)	0.26	0.26	0.0	0.28	0.23	0.29	0.3	0.21	0.37	0.36	0.24	0.14	0.29	0.2	0.21	0.86	0.31	0.68	0.81	0.78	0.68	1.0	0.68	0.54	0.88	0.86
lcl\|BLLF01002232.1_cds_GFH23269.1_17746 (GFH23269)	0.55	0.1	0.0	0.17	0.19	0.35	0.42	0.19	0.22	0.42	0.14	0.38	0.2	0.26	0.24	1.0	0.63	0.09	0.18	0.3	0.13	0.35	0.23	0.22	0.96	0.87
lcl\|BLLF01002292.1_cds_GFH23517.1_17994 (GFH23517)	0.41	0.09	0.1	0.13	0.03	0.05	0.15	0.06	0.13	0.62	0.04	0.3	0.18	0.12	0.3	0.77	0.06	0.0	0.07	0.27	0.0	1.0	0.01	0.42	0.64	0.82
lcl\|BLLF01002377.1_cds_GFH23843.1_18320 (GFH23843)	0.64	0.08	0.0	0.04	0.02	0.04	0.3	0.15	0.13	0.09	0.09	0.09	0.09	0.15	0.3	0.12	0.0	0.0	0.0	0.24	0.13	1.0	0.09	0.18	0.44	0.93
lcl\|BLLF01002537.1_cds_GFH24438.1_18915 (GFH24438)	0.43	0.31	0.0	0.37	0.21	0.15	0.16	0.1	0.12	0.3	0.16	0.23	0.12	0.12	0.12	0.6	0.31	0.18	0.31	0.5	0.33	1.0	0.21	0.23	0.39	0.24
lcl\|BLLF01002551.1_cds_GFH24498.1_18975 (GFH24498)	0.03	0.01	0.0	0.0	0.57	0.53	0.38	0.33	0.44	0.83	0.37	0.35	0.3	0.22	0.36	0.51	0.55	0.84	0.38	0.72	0.76	1.0	0.65	0.56	0.8	0.77
lcl\|BLLF01002733.1_cds_GFH25148.1_19625 (GFH25148)	0.48	0.04	0.0	0.23	0.29	0.37	0.49	0.27	0.4	0.6	0.35	0.47	0.45	0.41	0.52	1.0	0.26	0.24	0.23	0.77	0.25	0.76	0.42	0.48	0.55	0.83
lcl\|BLLF01002750.1_cds_GFH25205.1_19682 (GFH25205)	0.37	0.33	0.36	0.19	0.75	0.53	0.48	0.71	0.51	0.87	0.46	0.47	0.44	0.42	0.41	0.74	1.0	0.48	0.64	0.46	0.47	0.57	0.39	0.53	0.4	0.24
lcl\|BLLF01002944.1_cds_GFH25878.1_20355 (GFH25878)	0.41	0.4	0.08	0.15	0.39	0.43	0.35	0.23	0.37	0.55	0.32	0.35	0.32	0.23	0.32	0.48	0.47	0.55	0.24	0.48	0.69	1.0	0.54	0.54	0.64	0.65
lcl\|BLLF01003011.1_cds_GFH26069.1_20546 (GFH26069)	0.56	0.0	0.0	0.0	0.15	0.22	0.2	0.08	0.17	0.16	0.15	0.14	0.21	0.18	0.15	0.38	0.2	0.12	0.05	0.15	0.12	1.0	0.3	0.47	0.37	0.47
lcl\|BLLF01003100.1_cds_GFH26345.1_20822 (GFH26345)	0.17	0.11	0.0	0.04	0.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.21	0.01	0.1	0.07	0.02	0.13	0.82	0.09	0.01	0.22	0.74	0.04	1.0	0.06	0.29	0.38	0.53
lcl\|BLLF01003320.1_cds_GFH27017.1_21494 (GFH27017)	0.23	0.06	0.0	0.09	0.27	0.31	0.33	0.31	0.38	0.2	0.26	0.31	0.38	0.22	0.35	0.53	0.21	0.25	0.67	0.35	0.79	0.45	0.35	0.36	0.51	1.0
lcl\|BLLF01003323.1_cds_GFH27025.1_21502 (GFH27025)	0.78	0.0	0.0	0.51	0.12	0.06	0.18	0.1	0.08	0.19	0.29	0.05	0.07	0.13	0.09	0.0	0.0	0.21	0.0	0.18	0.0	1.0	0.84	0.41	0.15	0.3
lcl\|BLLF01003330.1_cds_GFH27042.1_21519 (GFH27042)	0.5	0.35	0.2	0.19	0.24	0.22	0.28	0.34	0.33	0.61	0.29	0.31	0.33	0.3	0.41	0.39	0.35	0.24	0.29	0.49	0.3	1.0	0.33	0.24	0.61	0.66
lcl\|BLLF01003520.1_cds_GFH27548.1_22025 (GFH27548)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.41	0.4	0.3	0.37	0.57	0.52	0.28	0.3	0.29	0.48	0.0	0.0	0.38	0.19	0.54	0.49	1.0	0.48	0.45	0.35	0.62
lcl\|BLLF01003647.1_cds_GFH27852.1_22329 (GFH27852)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.26	0.24	0.25	0.27	0.88	0.27	0.3	0.28	0.22	0.27	0.13	0.21	0.35	0.32	1.0	0.4	0.65	0.46	0.53	0.61	0.39
lcl\|BLLF01003796.1_cds_GFH28245.1_22722 (GFH28245)	0.8	0.0	0.0	0.01	0.23	0.21	0.25	0.28	0.26	0.27	0.25	0.19	0.16	0.15	0.25	0.76	0.46	0.2	0.24	0.39	0.17	1.0	0.17	0.44	0.57	0.87
lcl\|BLLF01003969.1_cds_GFH28633.1_23110 (GFH28633)	0.43	0.08	0.0	0.39	0.12	0.47	0.29	0.21	0.19	0.51	0.19	0.33	0.55	0.39	0.15	0.72	0.93	0.56	0.07	0.59	0.64	0.15	0.65	0.24	0.76	1.0
lcl\|BLLF01004398.1_cds_GFH29527.1_24004 (GFH29527)	0.22	0.18	0.0	0.06	0.48	0.39	0.36	0.23	0.36	0.68	0.38	0.5	0.39	0.21	0.41	1.0	0.73	0.45	0.24	0.49	0.53	0.98	0.48	0.47	0.75	0.61
lcl\|BLLF01004418.1_cds_GFH29567.1_24044 (GFH29567)	0.31	0.56	0.0	0.04	0.45	0.44	0.5	0.33	0.42	0.49	0.43	0.34	0.33	0.27	0.32	0.27	0.22	0.92	0.53	0.58	1.0	0.76	0.93	0.61	0.55	0.65
lcl\|BLLF01004930.1_cds_GFH30472.1_24949 (GFH30472)	0.38	0.42	0.07	0.02	0.05	0.09	0.08	0.04	0.09	0.36	0.04	0.13	0.07	0.03	0.08	0.14	0.07	0.04	0.37	0.5	0.12	0.49	0.07	0.06	1.0	0.63
lcl\|BLLF01005059.1_cds_GFH30676.1_25153 (GFH30676)	0.75	0.3	0.0	0.32	0.28	0.17	0.23	0.11	0.28	0.24	0.25	0.2	0.18	0.13	0.23	0.34	0.46	0.27	0.24	0.25	0.37	0.51	0.34	0.46	1.0	0.92
lcl\|BLLF01005358.1_cds_GFH31084.1_25561 (GFH31084)	0.21	0.07	0.08	0.02	0.07	0.11	0.13	0.22	0.14	0.0	0.07	0.25	0.2	0.14	0.24	0.5	0.24	0.12	0.22	0.24	0.19	0.64	0.26	0.2	1.0	0.69
lcl\|BLLF01006608.1_cds_GFH32405.1_26882 (GFH32405)	0.41	0.17	0.14	0.1	0.35	0.29	0.39	0.48	0.48	0.52	0.4	0.37	0.46	0.38	0.51	0.59	0.47	0.4	0.22	0.53	0.35	1.0	0.53	0.59	0.93	0.92
lcl\|BLLF01006817.1_cds_GFH32572.1_27049 (GFH32572)	0.64	0.27	0.37	0.25	0.35	0.48	0.36	0.21	0.29	0.52	0.34	0.42	0.33	0.26	0.3	0.78	1.0	0.36	0.58	0.48	0.26	0.62	0.37	0.4	0.67	0.49
lcl\|BLLF01007193.1_cds_GFH32822.1_27299 (GFH32822)	0.73	0.14	0.0	0.55	0.11	0.22	0.29	0.14	0.21	0.64	0.16	0.37	0.38	0.32	0.26	1.0	0.91	0.34	0.27	0.39	0.64	0.56	0.9	0.3	0.95	0.93
lcl\|BLLF01007653.1_cds_GFH33051.1_27528 (GFH33051)	0.35	0.0	0.0	0.09	0.2	0.32	0.29	0.24	0.26	1.0	0.31	0.22	0.32	0.23	0.25	0.37	0.37	0.69	0.27	0.89	0.49	0.57	0.39	0.59	0.48	0.65
lcl\|BLLF01007666.1_cds_GFH33059.1_27536 (GFH33059)	0.11	0.0	0.0	0.01	0.34	0.29	0.37	0.39	0.65	1.0	0.34	0.3	0.37	0.18	0.42	0.06	0.1	0.29	0.5	0.92	0.24	0.1	0.15	0.25	0.35	0.54
lcl\|BLLF01009214.1_cds_GFH33653.1_28130 (GFH33653)	0.35	0.08	0.0	0.02	0.15	0.13	0.19	0.23	0.24	0.43	0.16	0.19	0.16	0.14	0.21	0.32	0.25	0.29	0.24	0.43	0.29	1.0	0.27	0.34	0.41	0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)