Heatmap: Cluster_116 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000030.1_cds_GFH06267.1_744 (GFH06267)	0.36	0.11	0.64	0.31	0.76	0.71	0.58	0.35	0.63	0.28	0.78	0.55	0.43	0.43	0.36	0.46	0.63	0.67	1.0	0.72	0.49	0.77	0.75	0.47	0.3	0.37
lcl\|BLLF01000174.1_cds_GFH08646.1_3123 (GFH08646)	0.22	0.15	0.35	0.19	0.27	0.33	0.2	0.22	0.23	1.0	0.3	0.25	0.12	0.26	0.22	0.5	0.31	0.71	0.19	0.28	0.63	0.1	0.32	0.06	0.28	0.41
lcl\|BLLF01000233.1_cds_GFH09428.1_3905 (GFH09428)	0.45	0.38	0.6	0.12	0.29	0.27	0.32	0.31	0.47	1.0	0.3	0.16	0.22	0.23	0.39	0.21	0.21	0.43	0.33	0.38	0.5	0.36	0.42	0.3	0.32	0.27
lcl\|BLLF01000245.1_cds_GFH09577.1_4054 (GFH09577)	0.02	0.13	0.38	0.01	0.11	0.05	0.02	0.06	0.05	1.0	0.06	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.09	0.18	0.0	0.04	0.09	0.0	0.09	0.01	0.09	0.15
lcl\|BLLF01000250.1_cds_GFH09641.1_4118 (GFH09641)	0.03	0.0	0.29	0.12	0.11	0.07	0.1	0.04	0.15	1.0	0.09	0.05	0.07	0.08	0.13	0.11	0.12	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.2	0.16
lcl\|BLLF01000287.1_cds_GFH10102.1_4579 (GFH10102)	0.11	0.31	1.0	0.15	0.07	0.08	0.12	0.05	0.37	0.67	0.11	0.08	0.27	0.08	0.44	0.6	0.33	0.27	0.56	0.11	0.36	0.25	0.19	0.17	0.39	0.29
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10314.1_4791 (GFH10314)	0.3	0.2	0.32	0.12	0.31	0.24	0.19	0.23	0.2	1.0	0.32	0.26	0.2	0.17	0.26	0.24	0.15	0.0	0.04	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000377.1_cds_GFH11132.1_5609 (GFH11132)	0.27	0.41	0.78	0.36	0.26	0.13	0.12	0.22	0.15	1.0	0.22	0.16	0.17	0.15	0.18	0.26	0.72	0.38	0.05	0.26	0.43	0.27	0.27	0.07	0.21	0.11
lcl\|BLLF01000387.1_cds_GFH11255.1_5732 (GFH11255)	0.5	0.27	0.46	0.37	0.45	0.41	0.36	0.4	0.5	1.0	0.35	0.33	0.36	0.28	0.46	0.22	0.35	0.49	0.48	0.55	0.38	0.49	0.47	0.31	0.39	0.36
lcl\|BLLF01000437.1_cds_GFH11807.1_6284 (GFH11807)	0.2	0.14	0.42	0.01	0.13	0.09	0.1	0.12	0.11	1.0	0.11	0.06	0.09	0.08	0.15	0.1	0.16	0.0	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.0	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000441.1_cds_GFH11845.1_6322 (GFH11845)	0.36	0.09	0.37	0.11	0.21	0.3	0.24	0.12	0.25	1.0	0.27	0.28	0.29	0.26	0.23	0.33	0.12	0.51	0.24	0.54	0.49	0.33	0.41	0.16	0.33	0.37
lcl\|BLLF01000459.1_cds_GFH12012.1_6489 (GFH12012)	0.32	0.29	0.31	0.2	0.29	0.19	0.22	0.2	0.29	0.83	0.18	0.15	0.25	0.17	0.19	0.41	0.24	0.64	0.29	0.32	1.0	0.4	0.8	0.11	0.39	0.36
lcl\|BLLF01000463.1_cds_GFH12051.1_6528 (GFH12051)	0.0	0.12	1.0	0.21	0.31	0.39	0.21	0.25	0.19	0.84	0.27	0.2	0.27	0.2	0.3	0.56	0.0	0.09	0.0	0.01	0.11	0.02	0.12	0.0	0.33	0.08
lcl\|BLLF01000463.1_cds_GFH12054.1_6531 (GFH12054)	0.06	0.31	0.82	0.54	0.46	0.31	0.18	0.17	0.23	1.0	0.39	0.2	0.29	0.23	0.12	0.0	0.0	0.24	0.0	0.16	0.3	0.0	0.0	0.06	0.24	0.18
lcl\|BLLF01000466.1_cds_GFH12075.1_6552 (GFH12075)	0.35	0.23	0.57	0.45	0.13	0.12	0.17	0.11	0.2	1.0	0.13	0.11	0.18	0.19	0.21	0.21	0.04	0.04	0.06	0.03	0.06	0.06	0.16	0.06	0.18	0.12
lcl\|BLLF01000495.1_cds_GFH12357.1_6834 (GFH12357)	0.45	0.38	1.0	0.25	0.2	0.21	0.41	0.2	0.47	0.96	0.21	0.19	0.26	0.21	0.6	0.33	0.3	0.5	0.29	0.44	0.68	0.13	0.53	0.21	0.36	0.27
lcl\|BLLF01000551.1_cds_GFH12888.1_7365 (GFH12888)	0.43	0.1	0.2	0.2	0.45	0.27	0.28	0.35	0.34	1.0	0.37	0.26	0.3	0.26	0.33	0.15	0.14	0.49	0.23	0.42	0.51	0.83	0.33	0.2	0.36	0.31
lcl\|BLLF01000551.1_cds_GFH12889.1_7366 (GFH12889)	0.4	0.11	0.47	0.29	0.6	0.33	0.35	0.43	0.39	1.0	0.49	0.36	0.36	0.35	0.29	0.36	0.48	0.41	0.46	0.37	0.51	0.85	0.38	0.2	0.23	0.22
lcl\|BLLF01000586.1_cds_GFH13193.1_7670 (GFH13193)	0.34	0.05	0.54	0.24	0.72	0.43	0.32	0.45	0.47	0.19	0.55	0.33	0.4	0.25	0.45	0.39	0.68	0.38	1.0	0.44	0.57	0.24	0.2	0.24	0.1	0.15
lcl\|BLLF01000586.1_cds_GFH13197.1_7674 (GFH13197)	0.55	0.0	0.76	0.27	0.22	0.55	0.29	0.03	0.44	0.47	0.34	0.26	0.28	0.1	0.26	1.0	0.49	0.39	0.78	0.77	0.18	0.41	0.65	0.42	0.21	0.24
lcl\|BLLF01000590.1_cds_GFH13243.1_7720 (GFH13243)	0.45	0.03	0.59	0.09	0.41	0.48	0.34	0.33	0.3	0.78	0.5	0.37	0.36	0.29	0.29	0.61	0.56	0.47	0.37	0.36	0.25	1.0	0.38	0.5	0.31	0.24
lcl\|BLLF01000592.1_cds_GFH13269.1_7746 (GFH13269)	0.2	0.0	1.0	0.13	0.04	0.02	0.06	0.04	0.05	0.52	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.0	0.0	0.06	0.42	0.66	0.08	0.12	0.09	0.08	0.02	0.02
lcl\|BLLF01000681.1_cds_GFH14051.1_8528 (GFH14051)	0.23	0.04	0.92	0.73	0.76	0.88	0.78	0.31	0.6	0.56	0.8	0.44	0.52	0.32	0.48	0.84	0.97	1.0	0.49	0.54	0.76	0.44	0.74	0.42	0.15	0.29
lcl\|BLLF01000688.1_cds_GFH14125.1_8602 (GFH14125)	0.41	0.11	0.71	0.03	0.23	0.21	0.22	0.21	0.2	1.0	0.27	0.14	0.24	0.19	0.18	0.69	0.55	0.1	0.02	0.23	0.32	0.02	0.17	0.04	0.16	0.13
lcl\|BLLF01000870.1_cds_GFH15576.1_10053 (GFH15576)	0.2	0.01	0.68	0.0	0.11	0.18	0.12	0.16	0.17	1.0	0.19	0.07	0.11	0.14	0.12	0.14	0.22	0.27	0.0	0.14	0.22	0.09	0.21	0.13	0.07	0.05
lcl\|BLLF01000882.1_cds_GFH15672.1_10149 (GFH15672)	0.17	0.19	0.37	0.24	0.28	0.21	0.19	0.18	0.18	1.0	0.27	0.23	0.26	0.18	0.23	0.03	0.33	0.07	0.02	0.06	0.06	0.02	0.05	0.01	0.1	0.11
lcl\|BLLF01000951.1_cds_GFH16134.1_10611 (GFH16134)	0.5	0.48	0.39	0.3	0.31	0.25	0.26	0.41	0.35	1.0	0.29	0.28	0.29	0.27	0.37	0.3	0.39	0.62	0.43	0.51	0.58	0.48	0.53	0.27	0.34	0.31
lcl\|BLLF01000958.1_cds_GFH16189.1_10666 (GFH16189)	0.21	0.32	1.0	0.11	0.21	0.17	0.32	0.31	0.32	0.64	0.32	0.12	0.36	0.35	0.36	0.98	0.78	0.0	0.08	0.23	0.15	0.0	0.05	0.26	0.26	0.19
lcl\|BLLF01000999.1_cds_GFH16454.1_10931 (GFH16454)	0.54	0.21	0.55	0.22	0.75	0.58	0.51	0.56	0.5	1.0	0.68	0.6	0.5	0.55	0.44	0.36	0.58	0.73	0.92	0.91	0.96	0.86	0.56	0.69	0.39	0.38
lcl\|BLLF01001063.1_cds_GFH16867.1_11344 (GFH16867)	0.17	0.07	0.46	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	1.0	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.12	0.08	0.13	0.25	0.29	0.2	0.25	0.14	0.05	0.21	0.2
lcl\|BLLF01001144.1_cds_GFH17412.1_11889 (GFH17412)	0.2	0.13	0.3	0.01	0.23	0.15	0.13	0.13	0.18	1.0	0.17	0.12	0.17	0.12	0.18	0.13	0.11	0.26	0.44	0.29	0.42	0.24	0.34	0.16	0.4	0.42
lcl\|BLLF01001149.1_cds_GFH17449.1_11926 (GFH17449)	0.13	0.34	0.58	0.27	0.18	0.2	0.19	0.22	0.29	1.0	0.2	0.11	0.13	0.14	0.24	0.24	0.26	0.39	0.16	0.29	0.46	0.09	0.24	0.07	0.2	0.29
lcl\|BLLF01001252.1_cds_GFH18133.1_12610 (GFH18133)	0.1	0.13	1.0	0.17	0.11	0.04	0.01	0.07	0.03	0.79	0.07	0.02	0.02	0.02	0.07	0.0	0.0	0.17	0.05	0.03	0.05	0.05	0.1	0.03	0.29	0.01
lcl\|BLLF01001253.1_cds_GFH18141.1_12618 (GFH18141)	0.19	0.29	0.28	0.28	0.19	0.15	0.17	0.22	0.19	1.0	0.17	0.15	0.19	0.16	0.17	0.1	0.17	0.28	0.18	0.29	0.25	0.22	0.21	0.1	0.16	0.13
lcl\|BLLF01001263.1_cds_GFH18210.1_12687 (GFH18210)	0.45	0.19	0.34	0.0	0.21	0.16	0.14	0.14	0.15	1.0	0.15	0.12	0.11	0.11	0.03	0.33	0.06	0.52	0.1	0.05	0.27	0.1	0.35	0.13	0.03	0.07
lcl\|BLLF01001615.1_cds_GFH20328.1_14805 (GFH20328)	0.4	0.16	0.43	0.09	0.2	0.13	0.17	0.26	0.23	1.0	0.21	0.17	0.24	0.19	0.26	0.23	0.19	0.46	0.26	0.22	0.37	0.61	0.37	0.15	0.26	0.24
lcl\|BLLF01001659.1_cds_GFH20568.1_15045 (GFH20568)	0.2	0.17	0.36	0.31	0.19	0.14	0.12	0.27	0.16	0.93	0.21	0.25	0.27	0.32	0.17	0.17	0.39	0.5	0.48	0.3	1.0	0.35	0.53	0.12	0.15	0.32
lcl\|BLLF01001770.1_cds_GFH21154.1_15631 (GFH21154)	0.34	0.09	0.7	0.21	0.27	0.49	0.51	0.18	0.23	0.08	0.23	0.29	0.19	0.19	0.26	1.0	0.79	0.6	0.14	0.04	0.38	0.15	0.5	0.43	0.33	0.24
lcl\|BLLF01001893.1_cds_GFH21724.1_16201 (GFH21724)	0.07	0.25	0.44	0.27	0.18	0.17	0.19	0.26	0.27	1.0	0.2	0.19	0.31	0.26	0.37	0.14	0.15	0.14	0.07	0.06	0.15	0.05	0.09	0.03	0.13	0.15
lcl\|BLLF01001957.1_cds_GFH22049.1_16526 (GFH22049)	0.0	0.09	0.48	0.0	0.05	0.03	0.01	0.07	0.01	1.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.17	0.1
lcl\|BLLF01002281.1_cds_GFH23472.1_17949 (GFH23472)	0.11	0.01	1.0	0.0	0.12	0.04	0.04	0.13	0.01	0.52	0.03	0.03	0.01	0.04	0.05	0.0	0.05	0.19	0.36	0.1	0.11	0.23	0.14	0.06	0.08	0.13
lcl\|BLLF01002300.1_cds_GFH23553.1_18030 (GFH23553)	0.11	0.01	0.31	0.0	0.11	0.15	0.11	0.12	0.16	1.0	0.1	0.08	0.13	0.15	0.12	0.32	0.15	0.27	0.15	0.15	0.46	0.03	0.21	0.15	0.22	0.36
lcl\|BLLF01002323.1_cds_GFH23650.1_18127 (GFH23650)	0.18	0.53	0.82	0.23	0.28	0.24	0.27	0.22	0.34	1.0	0.18	0.13	0.14	0.15	0.31	0.43	0.39	0.59	0.21	0.38	0.54	0.13	0.4	0.09	0.19	0.2
lcl\|BLLF01002391.1_cds_GFH23894.1_18371 (GFH23894)	0.59	0.26	0.8	0.28	0.43	0.46	0.25	0.25	0.42	1.0	0.47	0.34	0.32	0.29	0.27	0.28	0.35	0.64	0.27	0.31	0.44	0.07	0.89	0.25	0.26	0.48
lcl\|BLLF01002405.1_cds_GFH23954.1_18431 (GFH23954)	0.32	0.09	0.26	0.0	0.05	0.01	0.17	0.05	0.2	1.0	0.18	0.09	0.18	0.13	0.2	0.13	0.05	0.02	0.0	0.0	0.02	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002493.1_cds_GFH24288.1_18765 (GFH24288)	0.52	0.09	0.5	0.3	0.22	0.21	0.36	0.1	0.37	1.0	0.14	0.11	0.13	0.1	0.41	0.39	0.48	0.47	0.2	0.37	0.84	0.21	0.67	0.18	0.26	0.32
lcl\|BLLF01002558.1_cds_GFH24524.1_19001 (GFH24524)	0.34	0.44	0.5	0.27	0.24	0.2	0.2	0.34	0.3	1.0	0.2	0.14	0.16	0.2	0.25	0.42	0.37	0.41	0.21	0.39	0.55	0.14	0.49	0.12	0.17	0.29
lcl\|BLLF01002879.1_cds_GFH25656.1_20133 (GFH25656)	0.72	0.32	0.35	0.15	0.35	0.27	0.23	0.48	0.25	1.0	0.28	0.23	0.3	0.3	0.27	0.33	0.4	0.63	0.49	0.58	0.74	0.75	0.64	0.23	0.37	0.27
lcl\|BLLF01003308.1_cds_GFH26983.1_21460 (GFH26983)	0.12	0.07	0.25	0.06	0.1	0.05	0.07	0.12	0.05	1.0	0.1	0.11	0.05	0.12	0.07	0.39	0.15	0.29	0.5	0.36	0.3	0.27	0.46	0.28	0.41	0.36
lcl\|BLLF01004264.1_cds_GFH29264.1_23741 (GFH29264)	0.78	0.19	0.81	0.58	0.74	0.77	0.73	0.6	0.66	0.64	0.65	0.49	0.47	0.47	0.57	1.0	0.98	0.46	0.4	0.47	0.42	0.42	0.4	0.76	0.3	0.34
lcl\|BLLF01004339.1_cds_GFH29430.1_23907 (GFH29430)	0.32	0.16	0.5	0.26	0.17	0.2	0.22	0.1	0.18	0.8	0.2	0.2	0.35	0.25	0.13	0.28	0.27	0.41	0.38	0.27	1.0	0.2	0.47	0.08	0.26	0.18
lcl\|BLLF01004387.1_cds_GFH29506.1_23983 (GFH29506)	0.16	0.3	1.0	0.19	0.11	0.15	0.31	0.09	0.42	0.52	0.16	0.15	0.46	0.2	0.55	0.06	0.09	0.27	0.86	0.52	0.67	0.34	0.32	0.15	0.24	0.36
lcl\|BLLF01004470.1_cds_GFH29680.1_24157 (GFH29680)	0.05	0.29	0.63	0.11	0.23	0.16	0.16	0.24	0.22	1.0	0.22	0.14	0.16	0.19	0.22	0.2	0.12	0.48	0.21	0.3	0.52	0.16	0.36	0.09	0.17	0.16
lcl\|BLLF01004747.1_cds_GFH30176.1_24653 (GFH30176)	0.16	0.13	0.27	0.07	0.13	0.09	0.13	0.11	0.11	1.0	0.1	0.13	0.09	0.16	0.14	0.41	0.46	0.49	0.0	0.24	0.74	0.52	0.6	0.08	0.15	0.09
lcl\|BLLF01005081.1_cds_GFH30705.1_25182 (GFH30705)	0.09	0.2	0.56	0.09	0.36	0.18	0.1	0.12	0.25	1.0	0.35	0.18	0.14	0.19	0.24	0.0	0.2	0.14	0.1	0.06	0.38	0.0	0.34	0.05	0.24	0.23
lcl\|BLLF01005626.1_cds_GFH31436.1_25913 (GFH31436)	0.17	0.16	0.32	0.03	0.25	0.17	0.21	0.23	0.23	1.0	0.21	0.14	0.17	0.14	0.27	0.24	0.37	0.01	0.0	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02
lcl\|BLLF01005626.1_cds_GFH31437.1_25914 (GFH31437)	0.23	0.07	0.19	0.02	0.07	0.05	0.07	0.07	0.08	1.0	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.13	0.17	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01005727.1_cds_GFH31563.1_26040 (GFH31563)	0.1	0.04	0.88	0.01	0.13	0.18	0.17	0.18	0.23	1.0	0.16	0.12	0.15	0.15	0.16	0.13	0.1	0.15	0.11	0.1	0.17	0.08	0.16	0.13	0.09	0.08
lcl\|BLLF01006064.1_cds_GFH31916.1_26393 (GFH31916)	0.48	0.14	0.55	0.05	0.31	0.24	0.19	0.26	0.27	1.0	0.32	0.17	0.15	0.13	0.3	0.42	0.51	0.03	0.05	0.03	0.07	0.0	0.12	0.0	0.02	0.04
lcl\|BLLF01006845.1_cds_GFH32590.1_27067 (GFH32590)	0.08	0.1	0.25	0.11	0.2	0.12	0.14	0.12	0.22	1.0	0.19	0.11	0.1	0.12	0.14	0.11	0.12	0.16	0.13	0.1	0.07	0.08	0.07	0.04	0.09	0.08
lcl\|BLLF01007079.1_cds_GFH32757.1_27234 (GFH32757)	0.29	0.03	0.8	0.54	0.18	0.12	0.1	0.13	0.13	1.0	0.09	0.17	0.06	0.07	0.14	0.33	0.2	0.41	0.07	0.61	0.27	0.31	0.29	0.22	0.18	0.17
lcl\|BLLF01007587.1_cds_GFH33017.1_27494 (GFH33017)	0.21	0.0	1.0	0.0	0.22	0.21	0.18	0.06	0.09	0.64	0.23	0.24	0.08	0.11	0.03	0.2	0.07	0.39	0.12	0.86	0.32	0.25	0.15	0.08	0.07	0.07
lcl\|BLLF01008364.1_cds_GFH33343.1_27820 (GFH33343)	0.36	0.49	0.4	0.24	0.45	0.3	0.38	0.45	0.41	1.0	0.4	0.36	0.38	0.37	0.41	0.24	0.4	0.46	0.44	0.35	0.41	0.24	0.43	0.17	0.41	0.16
lcl\|BLLF01008849.1_cds_GFH33541.1_28018 (GFH33541)	0.09	0.11	0.6	0.05	0.12	0.16	0.17	0.13	0.13	1.0	0.16	0.16	0.1	0.14	0.09	0.21	0.11	0.43	0.18	0.35	0.54	0.26	0.4	0.19	0.53	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)