Heatmap: Cluster_65 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000001.1_cds_GFH05537.1_14 (GFH05537)	0.27	0.07	0.0	0.19	0.31	0.32	0.4	0.13	0.39	0.4	0.25	0.23	0.23	0.2	0.27	1.0	0.67	0.26	0.33	0.13	0.41	0.47	0.22	0.34	0.39	0.23
lcl\|BLLF01000061.1_cds_GFH06893.1_1370 (GFH06893)	0.0	0.09	0.0	0.26	0.3	0.33	0.41	0.36	0.33	0.35	0.26	0.27	0.18	0.31	0.24	1.0	0.49	0.17	0.0	0.15	0.36	0.27	0.3	0.62	0.31	0.98
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06911.1_1388 (GFH06911)	0.24	0.05	0.0	0.0	0.06	0.17	0.31	0.07	0.41	0.28	0.12	0.17	0.31	0.24	0.38	1.0	0.4	0.1	0.23	0.22	0.14	0.25	0.26	0.29	0.44	0.28
lcl\|BLLF01000076.1_cds_GFH07143.1_1620 (GFH07143)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.15	0.44	0.0	0.35	0.0	0.0	0.11	0.16	0.04	0.63	1.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.18
lcl\|BLLF01000157.1_cds_GFH08376.1_2853 (GFH08376)	0.15	0.1	0.0	0.22	0.27	0.2	0.33	0.12	0.29	0.49	0.19	0.17	0.15	0.09	0.42	0.69	1.0	0.26	0.15	0.31	0.14	0.53	0.08	0.18	0.17	0.13
lcl\|BLLF01000268.1_cds_GFH09848.1_4325 (GFH09848)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.23	0.24	0.32	0.04	0.3	0.08	0.12	0.11	0.19	0.01	0.42	1.0	0.49	0.0	0.13	0.15	0.0	0.14	0.0	0.0	0.1	0.12
lcl\|BLLF01000289.1_cds_GFH10126.1_4603 (GFH10126)	0.38	0.14	0.0	0.31	0.33	0.51	0.42	0.17	0.45	0.37	0.23	0.35	0.32	0.17	0.33	0.82	1.0	0.23	0.37	0.27	0.24	0.34	0.32	0.3	0.49	0.4
lcl\|BLLF01000306.1_cds_GFH10317.1_4794 (GFH10317)	0.09	0.0	0.0	0.0	0.08	0.21	0.58	0.03	0.52	0.47	0.22	0.14	0.11	0.11	0.27	1.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.3	0.0
lcl\|BLLF01000458.1_cds_GFH12005.1_6482 (GFH12005)	0.14	0.01	0.0	0.01	0.22	0.31	0.26	0.15	0.19	0.03	0.21	0.21	0.19	0.11	0.22	1.0	0.74	0.28	0.42	0.2	0.42	0.17	0.44	0.28	0.48	0.4
lcl\|BLLF01000509.1_cds_GFH12488.1_6965 (GFH12488)	0.13	0.14	0.1	0.07	0.25	0.16	0.25	0.2	0.3	0.44	0.37	0.22	0.22	0.3	0.37	1.0	0.68	0.32	0.11	0.1	0.38	0.2	0.42	0.25	0.44	0.15
lcl\|BLLF01000571.1_cds_GFH13072.1_7549 (GFH13072)	0.19	0.32	0.0	0.26	0.24	0.28	0.41	0.14	0.43	0.23	0.24	0.21	0.33	0.17	0.46	1.0	0.63	0.23	0.28	0.18	0.28	0.12	0.18	0.29	0.41	0.24
lcl\|BLLF01000594.1_cds_GFH13284.1_7761 (GFH13284)	0.32	0.03	0.0	0.11	0.26	0.47	0.39	0.31	0.47	0.0	0.3	0.19	0.23	0.4	0.24	1.0	0.9	0.33	0.15	0.18	0.23	0.29	0.61	0.42	0.34	0.91
lcl\|BLLF01000597.1_cds_GFH13307.1_7784 (GFH13307)	0.0	0.11	0.0	0.12	0.04	0.14	0.33	0.02	0.33	0.0	0.0	0.26	0.22	0.04	0.1	0.9	1.0	0.24	0.22	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.17
lcl\|BLLF01000608.1_cds_GFH13411.1_7888 (GFH13411)	0.37	0.05	0.04	0.08	0.3	0.4	0.81	0.19	0.75	0.15	0.21	0.14	0.16	0.12	0.18	1.0	0.91	0.22	0.5	0.24	0.23	0.79	0.33	0.32	0.13	0.06
lcl\|BLLF01000612.1_cds_GFH13435.1_7912 (GFH13435)	0.0	0.25	0.0	0.02	0.03	0.12	0.45	0.02	0.22	0.08	0.06	0.08	0.19	0.04	0.14	1.0	0.2	0.09	0.0	0.06	0.03	0.04	0.02	0.02	0.15	0.24
lcl\|BLLF01000631.1_cds_GFH13599.1_8076 (GFH13599)	0.26	0.18	0.0	0.17	0.3	0.26	0.38	0.16	0.34	0.13	0.25	0.26	0.29	0.14	0.4	1.0	0.59	0.31	0.46	0.14	0.39	0.16	0.46	0.23	0.3	0.13
lcl\|BLLF01000640.1_cds_GFH13678.1_8155 (GFH13678)	0.03	0.04	0.0	0.07	0.05	0.22	0.46	0.04	0.71	0.33	0.05	0.05	0.19	0.02	0.28	0.96	1.0	0.15	0.03	0.02	0.08	0.07	0.09	0.04	0.07	0.04
lcl\|BLLF01000655.1_cds_GFH13816.1_8293 (GFH13816)	0.18	0.18	0.21	0.15	0.22	0.21	0.3	0.12	0.28	0.26	0.33	0.25	0.28	0.21	0.33	1.0	0.49	0.25	0.18	0.23	0.41	0.18	0.38	0.22	0.35	0.23
lcl\|BLLF01000703.1_cds_GFH14236.1_8713 (GFH14236)	0.18	0.2	0.09	0.25	0.23	0.34	0.55	0.13	0.63	0.43	0.31	0.27	0.37	0.22	0.58	0.92	1.0	0.51	0.46	0.35	0.56	0.28	0.27	0.48	0.35	0.23
lcl\|BLLF01000735.1_cds_GFH14514.1_8991 (GFH14514)	0.19	0.03	0.06	0.09	0.17	0.21	0.32	0.08	0.38	0.24	0.24	0.25	0.29	0.17	0.35	1.0	0.63	0.28	0.25	0.13	0.25	0.21	0.46	0.31	0.41	0.17
lcl\|BLLF01000736.1_cds_GFH14515.1_8992 (GFH14515)	0.12	0.07	0.0	0.11	0.17	0.36	0.51	0.08	0.38	0.21	0.12	0.28	0.22	0.12	0.47	1.0	0.92	0.25	0.06	0.23	0.41	0.77	0.23	0.28	0.25	0.2
lcl\|BLLF01000984.1_cds_GFH16356.1_10833 (GFH16356)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.16	0.31	0.35	0.11	0.48	0.14	0.2	0.22	0.2	0.09	0.21	1.0	0.74	0.16	0.23	0.1	0.16	0.74	0.23	0.38	0.04	0.03
lcl\|BLLF01001013.1_cds_GFH16550.1_11027 (GFH16550)	0.22	0.12	0.13	0.17	0.39	0.29	0.34	0.19	0.51	0.27	0.31	0.27	0.31	0.18	0.47	1.0	0.35	0.23	0.14	0.13	0.42	0.2	0.32	0.39	0.43	0.28
lcl\|BLLF01001165.1_cds_GFH17544.1_12021 (GFH17544)	0.27	0.09	0.29	0.17	0.32	0.33	0.56	0.12	0.39	0.29	0.23	0.15	0.21	0.13	0.23	1.0	0.44	0.27	0.21	0.2	0.25	0.35	0.38	0.23	0.35	0.23
lcl\|BLLF01001232.1_cds_GFH17980.1_12457 (GFH17980)	0.16	0.0	0.0	0.37	0.06	0.01	0.16	0.0	0.14	0.18	0.0	0.03	0.01	0.04	0.22	1.0	0.65	0.29	0.0	0.0	0.13	0.62	0.1	0.06	0.58	0.27
lcl\|BLLF01001358.1_cds_GFH18789.1_13266 (GFH18789)	0.21	0.18	0.04	0.26	0.28	0.31	0.44	0.16	0.4	0.27	0.35	0.28	0.28	0.23	0.45	1.0	0.78	0.21	0.22	0.24	0.21	0.3	0.18	0.37	0.51	0.67
lcl\|BLLF01001374.1_cds_GFH18888.1_13365 (GFH18888)	0.03	0.29	0.0	0.04	0.11	0.16	0.71	0.09	0.57	0.62	0.12	0.17	0.47	0.11	0.53	1.0	0.3	0.13	0.09	0.08	0.21	0.15	0.11	0.08	0.29	0.7
lcl\|BLLF01001407.1_cds_GFH19106.1_13583 (GFH19106)	0.23	0.16	0.21	0.33	0.39	0.53	0.43	0.28	0.42	0.19	0.39	0.26	0.24	0.31	0.22	1.0	0.59	0.31	0.18	0.17	0.33	0.31	0.35	0.65	0.23	0.94
lcl\|BLLF01001464.1_cds_GFH19444.1_13921 (GFH19444)	0.09	0.04	0.0	0.4	0.18	0.13	0.44	0.06	0.38	0.4	0.1	0.18	0.17	0.07	0.29	0.94	1.0	0.57	0.38	0.24	0.66	0.1	0.44	0.36	0.18	0.1
lcl\|BLLF01001477.1_cds_GFH19521.1_13998 (GFH19521)	0.16	0.01	0.05	0.09	0.57	0.26	0.34	0.24	0.55	0.25	0.27	0.26	0.28	0.2	0.32	1.0	0.55	0.59	0.07	0.04	0.31	0.13	0.68	0.3	0.41	0.2
lcl\|BLLF01001653.1_cds_GFH20534.1_15011 (GFH20534)	0.45	0.0	0.0	0.13	0.07	0.3	0.45	0.1	0.37	0.19	0.19	0.27	0.32	0.25	0.31	1.0	0.54	0.78	0.23	0.13	0.07	0.16	0.57	0.29	0.53	0.3
lcl\|BLLF01001665.1_cds_GFH20604.1_15081 (GFH20604)	0.19	0.17	0.01	0.11	0.35	0.6	0.43	0.2	0.49	0.0	0.32	0.19	0.16	0.17	0.14	1.0	0.34	0.25	0.16	0.09	0.34	0.12	0.29	0.41	0.21	0.66
lcl\|BLLF01001717.1_cds_GFH20883.1_15360 (GFH20883)	0.25	0.08	0.12	0.1	0.24	0.3	0.44	0.15	0.29	0.2	0.24	0.3	0.18	0.19	0.28	1.0	0.57	0.23	0.22	0.19	0.34	0.39	0.3	0.32	0.5	0.55
lcl\|BLLF01001717.1_cds_GFH20884.1_15361 (GFH20884)	0.42	0.24	0.11	0.2	0.32	0.39	0.55	0.24	0.4	0.39	0.3	0.34	0.29	0.28	0.48	1.0	0.69	0.34	0.36	0.31	0.44	0.76	0.47	0.31	0.55	0.7
lcl\|BLLF01001764.1_cds_GFH21112.1_15589 (GFH21112)	0.65	0.0	0.0	0.35	0.23	0.35	0.37	0.18	0.5	0.47	0.33	0.26	0.31	0.24	0.51	1.0	0.59	0.62	0.16	0.31	0.43	0.0	0.62	0.31	0.42	0.6
lcl\|BLLF01002010.1_cds_GFH22298.1_16775 (GFH22298)	0.3	0.08	0.0	0.03	0.24	0.52	0.32	0.17	0.28	0.31	0.23	0.3	0.15	0.25	0.13	1.0	0.25	0.34	0.0	0.24	0.47	0.21	0.39	0.28	0.38	0.87
lcl\|BLLF01002015.1_cds_GFH22322.1_16799 (GFH22322)	0.25	0.07	0.01	0.38	0.11	0.1	0.24	0.02	0.47	0.09	0.11	0.14	0.2	0.14	0.42	1.0	0.8	0.36	0.32	0.11	0.33	0.34	0.22	0.29	0.14	0.05
lcl\|BLLF01002070.1_cds_GFH22573.1_17050 (GFH22573)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.11	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.12	0.77	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.21	0.04
lcl\|BLLF01002109.1_cds_GFH22722.1_17199 (GFH22722)	0.22	0.27	0.15	0.04	0.3	0.33	0.38	0.3	0.45	0.46	0.32	0.34	0.37	0.3	0.34	1.0	0.78	0.34	0.31	0.31	0.39	0.36	0.37	0.41	0.49	0.58
lcl\|BLLF01002188.1_cds_GFH23081.1_17558 (GFH23081)	0.13	0.04	0.12	0.17	0.15	0.07	0.18	0.14	0.18	0.06	0.08	0.11	0.1	0.1	0.24	1.0	0.68	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.12	0.28	0.15
lcl\|BLLF01002232.1_cds_GFH23267.1_17744 (GFH23267)	0.18	0.14	0.0	0.08	0.15	0.32	0.24	0.18	0.22	0.21	0.21	0.19	0.23	0.22	0.21	1.0	0.37	0.53	0.19	0.45	0.42	0.42	0.3	0.26	0.35	0.78
lcl\|BLLF01002816.1_cds_GFH25445.1_19922 (GFH25445)	0.0	0.1	0.0	0.06	0.05	0.19	0.12	0.04	0.07	0.13	0.16	0.15	0.11	0.09	0.05	1.0	0.45	0.14	0.38	0.07	0.15	0.0	0.11	0.16	0.33	0.36
lcl\|BLLF01003587.1_cds_GFH27709.1_22186 (GFH27709)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.07	0.42	0.36	0.22	0.3	0.0	0.23	0.0	0.16	0.16	0.44	0.96	1.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.02	0.17	0.12
lcl\|BLLF01003807.1_cds_GFH28260.1_22737 (GFH28260)	0.33	0.07	0.18	0.39	0.2	0.26	0.46	0.1	0.52	0.35	0.24	0.25	0.3	0.19	0.49	0.97	1.0	0.65	0.5	0.27	0.58	0.31	0.56	0.36	0.23	0.16
lcl\|BLLF01004090.1_cds_GFH28900.1_23377 (GFH28900)	0.0	0.33	0.0	0.0	0.08	0.2	0.66	0.02	0.36	0.47	0.12	0.16	0.32	0.06	0.25	1.0	0.35	0.43	0.11	0.08	0.32	0.0	0.15	0.04	0.3	0.43
lcl\|BLLF01004150.1_cds_GFH29033.1_23510 (GFH29033)	0.37	0.14	0.0	0.07	0.22	0.23	0.29	0.18	0.33	0.14	0.26	0.22	0.26	0.22	0.32	1.0	0.44	0.18	0.23	0.17	0.16	0.37	0.34	0.33	0.45	0.56
lcl\|BLLF01004563.1_cds_GFH29856.1_24333 (GFH29856)	0.25	0.03	0.0	0.13	0.14	0.15	0.14	0.17	0.32	0.12	0.11	0.14	0.19	0.13	0.46	1.0	0.85	0.14	0.06	0.09	0.1	0.03	0.12	0.14	0.21	0.15
lcl\|BLLF01004720.1_cds_GFH30132.1_24609 (GFH30132)	0.01	0.0	0.0	0.25	0.05	0.16	0.25	0.02	0.27	0.0	0.01	0.02	0.14	0.0	0.37	0.88	1.0	0.42	0.22	0.0	0.0	0.0	0.41	0.02	0.32	0.35
lcl\|BLLF01004729.1_cds_GFH30142.1_24619 (GFH30142)	0.1	0.0	0.0	0.0	0.14	0.15	0.26	0.06	0.22	0.0	0.12	0.22	0.1	0.07	0.26	1.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.36	0.26
lcl\|BLLF01004812.1_cds_GFH30285.1_24762 (GFH30285)	0.17	0.02	0.0	0.15	0.18	0.05	0.14	0.14	0.31	0.19	0.15	0.1	0.15	0.13	0.27	1.0	0.6	0.04	0.07	0.16	0.13	0.0	0.21	0.09	0.21	0.31
lcl\|BLLF01004822.1_cds_GFH30304.1_24781 (GFH30304)	0.11	0.26	0.0	0.05	0.19	0.27	0.25	0.15	0.34	0.0	0.14	0.16	0.12	0.27	0.42	1.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.27
lcl\|BLLF01005186.1_cds_GFH30849.1_25326 (GFH30849)	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.03	0.03	0.27	0.03	0.01	0.0	0.01	0.03	1.0	0.34	0.24	0.09	0.2	0.08	0.38	0.18	0.08	0.5	0.21
lcl\|BLLF01005391.1_cds_GFH31129.1_25606 (GFH31129)	0.19	0.0	0.0	0.08	0.03	0.14	0.49	0.03	0.64	0.63	0.03	0.04	0.11	0.04	0.2	1.0	0.3	0.17	0.4	0.08	0.18	0.11	0.25	0.27	0.23	0.19
lcl\|BLLF01005576.1_cds_GFH31373.1_25850 (GFH31373)	0.02	0.17	0.0	0.0	0.08	0.11	0.37	0.05	0.24	0.17	0.07	0.15	0.16	0.06	0.24	1.0	0.26	0.07	0.09	0.07	0.16	0.11	0.02	0.05	0.12	0.4
lcl\|BLLF01006163.1_cds_GFH32022.1_26499 (GFH32022)	0.11	0.0	0.0	0.04	0.14	0.33	0.69	0.08	1.0	0.73	0.15	0.14	0.28	0.1	0.38	0.88	0.74	0.29	0.22	0.21	0.27	0.46	0.19	0.23	0.16	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)