Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
-1.4 -3.23 1.36 0.58 -0.82 -0.57 -0.04 -2.19 0.01 2.14 -0.94 -1.24 -0.94 -1.31 -0.12 0.09 1.68 -1.89 0.29 0.11 -1.0 - -0.04 -4.59 0.39 0.2
-0.0 -2.96 -0.08 -0.37 -1.33 -0.42 -0.34 -1.2 -0.09 1.58 -1.91 -1.25 0.28 -1.82 -0.33 1.16 1.37 1.16 - -2.01 0.91 -0.7 -0.37 -1.01 0.47 0.49
1.53 -2.68 -1.69 0.58 -1.4 -0.63 0.37 -1.6 0.37 0.12 -1.63 -0.03 -0.27 -1.36 0.82 0.76 0.7 -0.42 -1.28 -0.7 -0.62 0.27 -0.35 0.46 0.29 0.58
-0.25 -2.79 1.5 -0.54 1.09 0.56 -0.09 -2.14 0.61 0.45 0.75 -0.39 -0.62 -0.89 -0.45 1.29 1.64 -2.87 -2.29 -1.11 -2.41 -0.62 -1.88 -2.17 -0.67 0.2
-0.11 -0.52 -0.5 0.17 0.24 0.29 0.22 -0.5 0.23 0.67 0.2 -0.21 -0.07 -0.38 -0.32 -0.4 0.66 0.49 -0.34 -0.18 -0.03 -1.51 0.32 -0.81 0.25 0.29
0.44 - 0.92 0.49 -0.23 -0.26 0.01 -0.82 0.33 0.26 -0.09 -0.36 -0.24 -0.93 0.19 -1.95 -1.79 1.5 - -2.54 -0.03 -1.64 0.01 0.17 1.36 0.88
1.26 -2.11 -0.26 -0.32 -0.68 -0.56 -0.28 -0.64 0.61 1.0 -0.98 -1.33 -0.53 -1.04 0.31 -0.15 0.06 -0.36 -0.53 -1.04 -0.38 0.3 0.12 0.97 0.51 0.79
-1.16 -3.65 1.08 0.21 -0.76 -0.07 -0.22 -0.69 0.13 1.74 0.08 -0.58 -0.32 -0.02 -0.31 0.71 1.14 0.84 - -1.38 - -0.48 0.42 -1.35 0.2 -0.24
-0.71 -2.54 0.22 0.31 -0.75 -0.51 0.44 -1.2 0.19 0.67 -0.53 -0.89 0.05 -0.54 0.14 1.05 0.79 0.71 -1.29 -0.77 0.28 0.17 0.14 -0.79 0.53 0.06
- -0.14 0.92 -1.21 0.59 -0.02 -0.06 -1.04 0.25 0.83 0.27 -0.41 -0.11 -0.62 -1.16 0.06 1.73 -0.23 0.16 -1.7 -0.12 -1.75 0.66 -3.2 -0.08 0.46
0.41 -2.66 -0.03 -0.49 0.4 0.41 0.71 -0.71 0.58 -0.2 0.22 -0.12 0.27 -0.47 0.38 -0.33 0.4 0.74 -0.7 -1.42 0.57 -3.16 0.46 -3.21 0.45 0.05
-0.94 0.87 - 1.71 - 0.38 -0.5 - 1.55 0.49 -1.09 -1.23 - - 0.32 1.99 - - 1.32 1.4 - - 0.62 -0.91 -0.48 -
0.08 -0.69 1.01 -0.93 0.66 0.47 0.14 -0.07 0.35 0.63 0.44 -0.12 -0.48 -0.69 -0.2 1.23 0.29 -0.54 -2.56 -1.64 -1.4 -0.4 -0.33 -0.58 -0.03 0.17
-1.23 -0.47 0.45 0.99 0.51 0.41 0.32 -0.31 0.41 -0.54 0.16 -0.05 -0.05 -0.77 -0.18 -0.74 -0.7 0.49 -0.2 0.16 0.3 -0.82 -0.18 0.17 -0.22 -0.19
0.01 -0.77 0.7 -2.77 0.19 0.34 0.33 -0.46 0.51 0.62 0.2 -0.02 0.31 -0.2 0.53 0.04 -0.05 0.12 -1.29 -1.41 0.35 -1.28 -0.01 -1.37 0.79 -0.1
-1.09 -0.98 0.22 -1.52 -0.04 0.07 0.1 -1.0 -0.02 0.91 0.24 0.21 -0.04 -0.23 -0.08 0.88 1.34 -0.03 0.41 -0.44 -0.72 -0.54 -0.19 -2.02 -0.12 0.25
-1.13 -1.37 -0.51 -0.82 -0.21 -0.31 -0.19 -0.34 -0.13 0.6 -0.16 -0.71 -0.16 -0.39 -0.08 1.45 1.01 0.45 -0.76 -1.25 -0.05 -0.2 0.35 -0.53 0.34 0.87
- 1.07 - 1.91 -0.99 -0.41 - -0.08 0.54 0.7 -1.77 - -1.9 - 0.95 2.2 1.77 - 1.43 - - - - - 0.31 -1.25
0.27 -0.67 -0.63 -0.24 -0.27 0.15 0.38 -0.48 0.26 0.19 0.11 -0.33 -0.09 0.03 -0.15 0.66 0.68 0.37 -0.95 -1.42 0.35 -0.92 0.44 -0.88 0.26 0.46
0.05 -1.54 -0.49 -0.6 -0.56 -1.04 -0.29 -1.6 -0.06 1.02 -0.27 -0.32 -0.2 -0.38 -0.81 0.88 0.51 0.81 -0.01 -0.4 1.05 -0.24 0.23 -2.1 1.06 -0.11
-2.25 -1.13 0.48 -1.39 0.46 0.24 0.5 0.36 0.69 -0.35 0.09 0.17 0.14 -0.18 1.02 0.34 1.22 -0.38 -0.53 -0.39 -0.86 -0.96 -0.28 -0.57 -0.45 -0.75
-0.17 -2.73 0.76 -0.84 0.07 -0.55 -0.04 -0.39 -0.72 0.43 -0.1 -0.72 -1.16 -1.02 -0.82 1.51 0.77 -0.55 0.4 0.33 0.03 -0.88 0.56 -2.01 1.14 -0.1
-0.09 -0.78 0.3 -0.46 0.36 -0.19 0.61 -0.71 0.06 -1.23 -0.43 -0.11 0.29 -1.02 -0.08 1.03 1.31 0.6 -1.53 -0.5 -0.46 -1.87 -0.52 -0.75 0.64 0.58
-2.78 -0.48 1.5 -4.9 0.82 1.5 0.83 0.13 1.21 -2.38 0.54 0.22 0.17 0.16 0.75 0.36 1.68 -3.65 -3.65 -3.44 -2.77 -4.57 -3.25 -5.47 -2.71 -0.84
-0.27 -1.63 0.8 1.28 0.26 0.09 0.5 -0.9 -0.06 0.64 -0.16 -0.1 -0.75 -0.82 -0.12 -1.1 0.68 0.63 - -1.45 -0.27 -1.29 0.54 -0.2 0.25 0.38
-0.73 - - - 1.19 -0.99 -0.22 0.74 0.77 2.71 -1.99 0.8 -0.89 -0.36 0.53 - 2.36 0.85 - - - - - -2.77 - -
-0.6 -2.36 0.11 1.12 0.92 0.21 -0.42 -0.84 -0.87 -0.58 0.73 -1.19 -0.83 -0.6 -1.64 0.5 2.01 0.73 -1.85 -2.67 -0.39 - 0.72 -0.54 -0.75 0.55
0.13 -1.1 -0.72 -0.02 -0.17 -0.05 -0.18 -1.0 0.1 0.61 -0.22 -0.31 -0.18 -0.85 0.1 1.01 1.14 0.15 -0.45 -0.1 0.08 0.28 -0.03 0.17 -0.34 -0.56
2.23 - - 0.31 -2.19 -1.66 0.44 -3.5 1.17 1.73 -1.8 -1.79 -1.45 -2.53 0.96 - -1.54 -2.52 -0.35 -0.8 -1.73 0.46 -0.21 1.55 -0.18 0.29
0.3 -1.61 0.57 0.85 0.27 -0.64 -0.24 -1.86 0.07 0.85 -0.17 -1.22 -0.81 -1.26 -0.91 0.97 1.46 0.87 - -0.62 0.08 -0.05 -0.4 -1.08 0.53 -0.72
0.21 -1.94 -0.37 0.36 -0.26 -0.05 0.18 -0.79 0.7 -0.15 -0.19 -0.4 -0.47 -0.34 -0.22 0.46 0.39 -0.54 0.05 0.06 -0.66 -0.46 -0.4 0.34 0.92 0.82
0.39 -1.17 0.47 0.95 -0.77 -0.6 -0.58 -0.67 0.11 0.91 -0.96 -0.81 -0.13 -0.84 -0.2 -0.12 1.07 0.43 -1.08 -0.39 -0.2 -0.23 -0.09 0.23 0.38 0.35
1.95 -1.3 0.41 -1.08 -0.62 0.59 0.71 -0.18 0.62 -1.18 -0.81 -0.52 -0.75 -0.09 -0.25 -0.35 -2.33 -1.06 -0.34 -2.19 -0.7 -0.31 -0.95 1.32 -0.43 1.0
-2.45 -0.86 1.47 0.41 0.13 0.24 0.15 -0.26 -0.34 0.49 0.08 -0.28 -0.13 -0.53 -0.95 1.19 0.43 -1.45 -2.04 -0.16 0.03 0.56 -0.29 -2.56 0.39 -0.27
-0.69 0.4 1.13 0.68 -0.36 -0.57 0.02 -1.09 -0.03 0.35 0.21 -0.16 -0.17 -0.11 0.02 0.85 0.61 -0.27 -0.42 -2.24 0.04 -0.12 -0.02 -1.22 0.04 -0.56
1.43 - 1.51 2.62 -1.28 -3.29 -2.19 -0.6 0.98 - -1.7 -1.3 -1.16 -0.71 -0.19 1.49 2.29 - - - - - - -4.06 -2.57 -1.56
-0.71 -2.23 0.69 -1.03 -0.17 0.15 0.2 -0.73 0.55 0.61 0.36 -0.17 0.44 0.41 -0.04 1.0 -0.43 0.06 -1.36 -2.18 1.43 -2.28 0.37 -2.11 0.19 -0.87
-0.09 -0.97 -0.51 0.74 -0.7 -0.36 -0.01 -1.33 -0.08 1.0 -0.73 -0.45 -0.81 -1.38 -0.28 1.31 1.25 -0.03 -0.82 -0.09 0.19 -0.07 -0.71 -0.2 0.54 -0.04
-2.05 -4.02 0.43 -1.85 -0.24 -0.05 0.54 0.33 1.18 -1.28 -0.24 -1.23 -0.1 -0.79 1.13 -0.26 -0.42 0.75 0.34 -0.48 0.25 -1.0 0.68 0.15 0.25 0.11
-1.07 -0.75 0.27 -0.87 0.18 -0.1 0.13 -0.48 0.1 0.52 0.21 0.47 0.21 -0.12 -0.29 0.84 1.13 -0.0 -0.13 -1.23 0.16 -1.18 0.13 -1.81 0.67 -0.97
0.22 0.32 - 2.12 -0.42 -0.89 -1.08 -0.09 -0.52 1.28 -0.26 0.16 -0.59 -1.01 -0.61 1.53 1.87 - - - 0.0 - -1.47 -1.46 -0.22 -0.95
-0.89 -0.19 0.54 0.21 0.99 0.52 0.41 -1.31 0.21 0.3 0.44 -0.06 -0.29 -0.84 -0.25 0.59 1.3 -1.97 -3.26 -0.02 -1.73 -1.98 -2.09 -1.69 0.97 0.63
-0.58 -1.31 0.41 -4.34 0.39 -0.02 -1.07 0.09 -0.22 2.2 0.28 0.42 -0.56 0.24 -0.71 2.29 0.81 -0.97 - -1.74 -0.51 - - -1.58 -1.05 -1.89
-0.71 0.1 - 1.94 0.11 -1.48 -0.54 -0.33 -0.65 1.21 0.23 0.24 -0.69 0.26 -0.44 1.23 1.47 -0.45 -0.87 - -0.99 -0.79 0.12 -4.92 -0.99 -0.74
-5.38 -1.8 0.61 1.4 0.47 -0.63 -0.48 0.09 -0.07 0.97 -0.39 -0.86 -0.92 -0.08 -0.26 1.1 1.73 -1.04 -2.2 -1.74 -1.0 -0.88 0.41 -2.19 0.28 -0.14
-0.31 0.35 0.53 -0.65 0.12 -0.27 -0.01 -0.88 0.22 -0.03 -0.29 -0.51 -0.03 -0.46 -0.24 1.21 -0.26 0.27 -1.87 0.13 0.73 0.26 0.31 -1.22 0.13 -0.27
-1.14 -2.19 0.47 0.09 0.44 0.09 -0.05 -0.81 0.17 0.79 0.58 0.42 -0.31 -0.4 -0.33 -1.04 0.41 -0.17 0.41 -0.41 0.66 - 0.47 -0.17 0.52 -0.32
0.69 -0.1 -0.31 1.08 -0.05 -0.05 0.08 0.17 0.11 -2.6 0.03 -0.03 -0.01 0.13 0.02 1.37 1.1 -1.46 -0.88 0.23 -1.27 -0.44 -2.39 -0.38 -1.1 -0.56
- - - - -0.74 - 0.29 1.33 0.02 3.23 -0.94 1.08 0.04 - -0.39 - 1.3 - - 1.45 - - - -2.23 0.52 -
-1.93 -0.45 1.22 1.24 0.59 0.35 0.57 -0.78 0.22 0.68 0.37 -0.24 -0.3 -0.1 -0.12 0.6 -0.42 0.11 -2.76 -2.0 -0.3 - -1.03 -0.4 0.34 -0.28
0.32 -0.85 -0.02 1.37 0.03 0.04 -0.04 0.27 -0.16 0.62 -0.0 0.1 -0.14 0.03 -0.29 0.81 1.22 -0.42 -0.78 -0.79 -0.51 -2.01 -0.98 -0.97 -0.73 -0.78
0.73 -3.39 -0.01 0.49 -1.11 -0.34 -0.08 -1.04 0.68 0.34 -1.15 -0.93 -0.32 -0.81 0.31 -0.37 -0.25 0.57 -0.38 -1.08 1.08 -0.18 0.32 1.04 0.14 -0.04
-1.66 -2.56 -0.26 -1.95 -0.32 -0.45 -0.62 -1.46 -0.07 0.81 0.25 -0.53 -0.13 -0.45 0.15 1.27 1.66 1.0 - -1.93 0.58 -1.04 -0.65 -1.07 0.99 0.69
-0.71 -2.36 -0.22 -1.39 0.22 0.31 -0.01 -0.64 0.34 0.67 0.07 -0.04 -0.11 -0.28 -0.06 -1.79 0.31 0.94 -0.1 -0.29 0.57 -1.16 0.75 -0.27 0.57 0.25
0.57 -0.41 0.31 -0.04 0.92 -0.01 -0.11 -0.07 0.42 0.78 0.87 -0.33 -0.09 -0.45 -0.16 0.45 0.66 -1.27 -0.69 -0.85 -2.03 -3.41 -2.5 -3.55 0.9 0.62
-1.56 -2.32 1.08 -3.99 -0.11 -0.26 -0.47 -0.28 0.08 2.05 -0.79 -0.67 -0.81 -1.65 -0.8 1.7 1.15 -1.41 -0.43 -1.13 -0.92 -1.37 -0.18 -0.24 0.1 0.43
-1.3 -0.62 0.85 -0.58 0.5 0.14 0.15 -0.08 0.17 0.8 0.44 -0.02 -0.18 -0.17 0.32 1.01 0.98 -0.97 -0.83 -1.33 -0.73 -1.26 -0.64 -1.3 0.3 -0.13
-0.88 -3.16 0.68 1.06 0.61 -0.21 -0.05 -1.3 -0.07 1.11 0.23 -1.28 -0.91 -1.36 -0.45 1.22 0.71 0.7 -1.8 -0.82 0.54 -1.72 -0.59 -1.61 0.2 0.27
0.64 -3.39 -0.63 -0.76 -0.65 -0.66 0.27 -1.3 0.38 -0.31 -0.47 -0.81 -0.48 -0.79 0.63 0.32 0.29 -0.13 -1.54 -0.27 0.29 0.67 0.51 0.79 0.85 0.73
-1.48 -1.66 0.12 0.64 0.6 -0.07 0.23 -0.57 -0.09 0.57 0.49 -0.05 0.04 -0.26 -0.15 0.96 1.53 -0.34 -3.46 -1.47 -0.26 -0.38 -0.25 -0.56 -0.28 -0.29
-4.19 -2.95 0.98 0.6 1.2 0.62 0.1 -0.02 0.58 -0.17 0.12 -1.47 -0.47 -1.56 0.43 -1.25 2.15 -2.61 - -1.26 -1.15 -0.95 -1.62 -5.06 0.73 0.81
-1.25 -0.49 1.14 0.97 0.35 -0.34 0.14 -1.35 -0.13 1.43 0.25 -1.05 -0.35 -0.34 -0.08 0.68 -0.83 0.44 -0.72 - 0.16 0.36 -0.15 -1.64 -0.33 -0.32
-2.52 0.04 1.91 -4.19 1.29 -0.03 0.15 0.89 0.34 - 0.62 -0.33 -0.7 -0.17 -0.19 1.74 2.16 -1.94 - - - -1.27 - -2.98 - -
1.51 -2.54 -0.0 - 0.56 0.38 0.33 -0.93 -1.67 -0.31 -0.03 0.27 -0.16 -0.54 -0.22 - -0.46 - - 0.58 -0.11 0.19 0.52 0.72 1.22 0.98
0.86 0.1 0.21 -1.0 -0.13 -0.22 -0.32 -0.42 0.01 1.0 -0.51 -0.33 -0.45 -0.66 -0.22 -0.65 0.04 -0.17 0.21 -0.0 -0.25 0.66 -0.33 0.73 -0.36 0.03
-0.37 -0.41 0.98 -0.06 0.22 0.13 0.28 -0.01 0.34 -1.41 -0.01 -0.15 -0.08 -0.37 0.08 0.68 1.25 -0.29 0.07 -0.08 -0.22 -1.16 -0.72 -1.38 -0.16 -0.37
- - -0.26 -1.74 0.56 0.41 0.99 0.97 0.93 1.55 0.03 0.51 -0.79 -0.63 0.47 -0.58 2.3 -2.07 -1.29 - - - -0.5 -0.45 -1.48 -2.48
-0.45 -0.17 -1.36 1.71 0.53 -0.04 -0.35 -0.26 -0.01 -0.03 0.1 -0.63 -0.63 -0.86 -0.34 1.87 1.34 -0.31 -0.9 -0.6 -0.28 -0.88 -0.19 -5.95 -1.5 -2.22
-2.59 -0.72 1.59 -0.98 0.48 0.19 0.2 0.53 0.41 0.38 -0.1 0.01 0.16 0.3 0.08 0.14 1.61 -1.13 -1.22 -2.32 -0.66 -2.46 -0.23 -1.95 -0.78 -0.2
1.77 - - - -1.68 -2.26 0.09 -0.18 0.01 -0.57 -3.27 -0.67 -0.82 -1.64 -0.73 -0.04 0.5 0.58 - -0.66 0.05 0.24 -0.43 1.51 1.27 1.8
0.7 0.41 0.89 1.93 0.03 -0.47 -0.7 -0.15 0.04 - 0.06 -0.44 -0.86 -0.33 0.33 1.53 0.99 -1.22 -1.58 - -1.69 -1.64 -0.03 -0.43 -1.3 -1.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.