Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000012.1_cds_GFH05888.1_365 (GFH05888)	0.0	0.01	1.0	0.01	0.0	0.01	0.34	0.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.1	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000014.1_cds_GFH05928.1_405 (GFH05928)	0.0	0.14	1.0	0.26	0.03	0.41	0.24	0.12	0.2	0.25	0.13	0.32	0.27	0.22	0.09	0.21	0.56	0.22	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.01	0.2	0.13
lcl\|BLLF01000016.1_cds_GFH05969.1_446 (GFH05969)	1.0	0.72	0.68	0.6	0.14	0.18	0.87	0.07	0.85	0.09	0.16	0.17	0.38	0.09	0.9	0.29	0.36	0.41	0.26	0.15	0.3	0.49	0.31	0.11	0.22	0.25
lcl\|BLLF01000021.1_cds_GFH06085.1_562 (GFH06085)	0.16	0.09	1.0	0.26	0.04	0.12	0.39	0.01	0.37	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.01	0.37	0.07	0.04	0.16	0.05	0.1	0.02	0.01	0.05	0.01
lcl\|BLLF01000064.1_cds_GFH06927.1_1404 (GFH06927)	0.17	0.09	1.0	0.71	0.01	0.01	0.24	0.0	0.41	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.58	0.15	0.11	0.07	0.15	0.04	0.07	0.12	0.13	0.0	0.18	0.07
lcl\|BLLF01000085.1_cds_GFH07286.1_1763 (GFH07286)	0.63	0.0	1.0	0.78	0.03	0.02	0.28	0.0	0.44	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.58	0.0	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.04	0.01	0.0	0.22	0.11
lcl\|BLLF01000114.1_cds_GFH07770.1_2247 (GFH07770)	0.48	0.11	0.86	0.73	0.01	0.02	0.48	0.01	0.92	0.0	0.01	0.04	0.06	0.01	1.0	0.69	0.12	0.02	0.26	0.04	0.02	0.25	0.03	0.0	0.3	0.13
lcl\|BLLF01000160.1_cds_GFH08421.1_2898 (GFH08421)	0.59	0.01	1.0	0.56	0.04	0.05	0.44	0.02	0.69	0.21	0.03	0.05	0.09	0.02	0.9	0.03	0.11	0.03	0.17	0.04	0.02	0.07	0.03	0.22	0.36	0.14
lcl\|BLLF01000225.1_cds_GFH09324.1_3801 (GFH09324)	0.24	0.03	1.0	0.28	0.01	0.02	0.25	0.01	0.34	0.0	0.01	0.02	0.03	0.01	0.46	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.07	0.03
lcl\|BLLF01000266.1_cds_GFH09821.1_4298 (GFH09821)	0.13	0.2	1.0	0.02	0.38	0.22	0.42	0.18	0.37	0.32	0.28	0.16	0.19	0.15	0.24	0.28	0.49	0.0	0.0	0.04	0.18	0.0	0.12	0.05	0.13	0.1
lcl\|BLLF01000358.1_cds_GFH10917.1_5394 (GFH10917)	0.36	0.03	1.0	0.22	0.02	0.03	0.27	0.02	0.52	0.0	0.04	0.04	0.05	0.02	0.78	0.01	0.1	0.02	0.1	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.1	0.1
lcl\|BLLF01000378.1_cds_GFH11153.1_5630 (GFH11153)	0.0	0.03	0.97	0.07	0.01	0.04	1.0	0.0	0.31	0.01	0.0	0.05	0.03	0.0	0.79	0.03	0.05	0.02	0.34	0.02	0.01	0.69	0.02	0.01	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000392.1_cds_GFH11315.1_5792 (GFH11315)	0.25	0.01	1.0	0.25	0.01	0.0	0.09	0.01	0.34	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.18	0.34	0.27	0.07	0.06	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02	0.09	0.03
lcl\|BLLF01000520.1_cds_GFH12610.1_7087 (GFH12610)	0.06	0.04	1.0	0.32	0.02	0.04	0.56	0.0	0.3	0.0	0.01	0.11	0.04	0.0	0.61	0.0	0.02	0.0	0.09	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.15	0.08
lcl\|BLLF01000536.1_cds_GFH12754.1_7231 (GFH12754)	0.27	0.1	1.0	0.25	0.05	0.06	0.35	0.05	0.28	0.02	0.06	0.08	0.11	0.07	0.24	0.03	0.03	0.03	0.02	0.0	0.02	0.07	0.03	0.02	0.09	0.05
lcl\|BLLF01000536.1_cds_GFH12755.1_7232 (GFH12755)	0.55	0.08	1.0	0.37	0.1	0.14	0.72	0.07	0.5	0.06	0.15	0.15	0.21	0.11	0.46	0.03	0.02	0.05	0.15	0.02	0.03	0.2	0.04	0.02	0.14	0.08
lcl\|BLLF01000569.1_cds_GFH13054.1_7531 (GFH13054)	0.12	0.21	1.0	0.17	0.07	0.13	0.56	0.07	0.33	0.08	0.07	0.13	0.13	0.05	0.5	0.12	0.15	0.19	0.17	0.1	0.24	0.23	0.21	0.06	0.08	0.05
lcl\|BLLF01000635.1_cds_GFH13640.1_8117 (GFH13640)	0.06	0.06	0.93	0.34	0.14	0.14	0.61	0.11	0.49	0.04	0.13	0.14	0.16	0.09	1.0	0.32	0.12	0.11	0.23	0.13	0.12	0.44	0.13	0.18	0.24	0.18
lcl\|BLLF01000698.1_cds_GFH14194.1_8671 (GFH14194)	0.4	0.01	1.0	0.7	0.03	0.04	0.64	0.02	0.57	0.2	0.02	0.06	0.08	0.01	0.81	0.08	0.14	0.02	0.05	0.02	0.0	0.14	0.0	0.0	0.13	0.04
lcl\|BLLF01000698.1_cds_GFH14195.1_8672 (GFH14195)	0.7	0.04	1.0	0.41	0.04	0.04	0.52	0.02	0.55	0.15	0.02	0.05	0.1	0.01	0.84	0.03	0.04	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.13	0.05
lcl\|BLLF01000714.1_cds_GFH14345.1_8822 (GFH14345)	0.0	0.0	1.0	0.73	0.28	0.24	0.17	0.21	0.25	0.69	0.18	0.28	0.27	0.22	0.29	0.4	0.64	0.0	0.18	0.17	0.08	0.0	0.1	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000800.1_cds_GFH15051.1_9528 (GFH15051)	0.24	0.03	1.0	0.04	0.04	0.02	0.14	0.04	0.49	0.3	0.05	0.04	0.07	0.05	0.97	0.08	0.13	0.07	0.2	0.24	0.11	0.25	0.13	0.01	0.09	0.07
lcl\|BLLF01000814.1_cds_GFH15159.1_9636 (GFH15159)	0.44	0.05	1.0	0.84	0.07	0.09	0.55	0.09	0.49	0.08	0.1	0.13	0.13	0.09	0.62	0.01	0.0	0.0	0.03	0.05	0.01	0.1	0.02	0.01	0.23	0.23
lcl\|BLLF01000829.1_cds_GFH15283.1_9760 (GFH15283)	0.34	0.16	1.0	0.32	0.12	0.26	0.4	0.14	0.42	0.1	0.26	0.17	0.17	0.31	0.43	0.06	0.06	0.05	0.03	0.04	0.07	0.12	0.04	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000905.1_cds_GFH15824.1_10301 (GFH15824)	0.19	0.17	1.0	0.25	0.04	0.06	0.42	0.02	0.32	0.01	0.03	0.05	0.12	0.03	0.38	0.17	0.07	0.01	0.05	0.02	0.01	0.11	0.01	0.0	0.11	0.07
lcl\|BLLF01000930.1_cds_GFH15989.1_10466 (GFH15989)	0.8	0.0	1.0	0.02	0.05	0.04	0.4	0.02	0.33	0.0	0.11	0.09	0.08	0.07	0.57	0.07	0.0	0.0	0.2	0.13	0.0	0.03	0.02	0.01	0.21	0.1
lcl\|BLLF01000936.1_cds_GFH16036.1_10513 (GFH16036)	0.58	0.1	0.72	0.36	0.06	0.2	0.59	0.05	0.56	0.02	0.04	0.13	0.12	0.01	0.4	0.27	0.33	0.27	0.04	0.0	0.37	0.04	1.0	0.0	0.18	0.09
lcl\|BLLF01000936.1_cds_GFH16038.1_10515 (GFH16038)	1.0	0.15	0.82	0.8	0.05	0.13	0.74	0.05	0.69	0.03	0.05	0.13	0.13	0.04	0.75	0.38	0.26	0.48	0.07	0.07	0.59	0.1	0.87	0.0	0.24	0.16
lcl\|BLLF01001138.1_cds_GFH17373.1_11850 (GFH17373)	0.15	0.01	1.0	0.26	0.08	0.13	0.46	0.05	0.3	0.09	0.06	0.12	0.14	0.05	0.44	0.0	0.1	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.0	0.13	0.09
lcl\|BLLF01001190.1_cds_GFH17717.1_12194 (GFH17717)	0.49	0.01	1.0	0.55	0.01	0.02	0.28	0.01	0.54	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.61	0.01	0.09	0.01	0.1	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.07	0.04
lcl\|BLLF01001194.1_cds_GFH17740.1_12217 (GFH17740)	0.22	0.0	1.0	0.43	0.01	0.0	0.11	0.01	0.34	0.09	0.0	0.01	0.02	0.0	0.29	0.0	0.03	0.02	0.19	0.14	0.06	0.04	0.1	0.0	0.16	0.07
lcl\|BLLF01001373.1_cds_GFH18877.1_13354 (GFH18877)	0.62	0.01	1.0	0.11	0.02	0.03	0.32	0.01	0.48	0.04	0.02	0.06	0.06	0.01	0.84	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.0	0.12	0.01	0.0	0.18	0.1
lcl\|BLLF01001484.1_cds_GFH19564.1_14041 (GFH19564)	0.56	0.02	0.92	0.43	0.09	0.09	0.62	0.06	0.7	0.05	0.07	0.13	0.23	0.05	1.0	0.04	0.04	0.03	0.08	0.04	0.02	0.11	0.01	0.02	0.17	0.08
lcl\|BLLF01001755.1_cds_GFH21063.1_15540 (GFH21063)	0.0	0.19	1.0	0.0	0.13	0.16	0.52	0.09	0.35	0.38	0.16	0.09	0.19	0.02	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.04	0.08	0.17
lcl\|BLLF01002096.1_cds_GFH22674.1_17151 (GFH22674)	0.5	0.24	1.0	0.53	0.03	0.09	0.55	0.02	0.43	0.04	0.01	0.07	0.1	0.0	0.57	0.01	0.0	0.04	0.02	0.0	0.02	0.11	0.01	0.0	0.14	0.08
lcl\|BLLF01002115.1_cds_GFH22752.1_17229 (GFH22752)	0.27	0.12	1.0	0.5	0.05	0.05	0.25	0.08	0.39	0.03	0.07	0.1	0.15	0.14	0.73	0.1	0.12	0.09	0.11	0.06	0.18	0.32	0.07	0.05	0.14	0.13
lcl\|BLLF01002152.1_cds_GFH22912.1_17389 (GFH22912)	0.14	0.17	1.0	0.14	0.34	0.34	0.36	0.29	0.21	0.29	0.46	0.31	0.3	0.33	0.21	0.34	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.08
lcl\|BLLF01002177.1_cds_GFH23027.1_17504 (GFH23027)	0.48	0.48	1.0	0.36	0.46	0.41	0.58	0.51	0.62	0.57	0.48	0.4	0.57	0.49	0.75	0.5	0.37	0.61	0.25	0.32	0.66	0.19	0.59	0.46	0.48	0.42
lcl\|BLLF01002393.1_cds_GFH23901.1_18378 (GFH23901)	0.91	0.24	1.0	0.77	0.03	0.03	0.67	0.01	0.61	0.0	0.03	0.06	0.2	0.01	0.94	0.12	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.07	0.05	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002880.1_cds_GFH25660.1_20137 (GFH25660)	0.28	0.03	1.0	0.36	0.01	0.02	0.23	0.01	0.31	0.03	0.0	0.02	0.03	0.0	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.21	0.1
lcl\|BLLF01003048.1_cds_GFH26179.1_20656 (GFH26179)	0.0	0.02	1.0	0.79	0.3	0.15	0.15	0.1	0.3	0.4	0.48	0.21	0.25	0.21	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.1
lcl\|BLLF01003197.1_cds_GFH26666.1_21143 (GFH26666)	0.24	0.01	1.0	0.33	0.01	0.02	0.32	0.0	0.33	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.56	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.08	0.13
lcl\|BLLF01003989.1_cds_GFH28680.1_23157 (GFH28680)	0.18	0.1	1.0	0.0	0.14	0.05	0.41	0.05	0.61	0.2	0.06	0.06	0.13	0.02	0.39	0.18	0.37	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.11	0.07
lcl\|BLLF01004380.1_cds_GFH29492.1_23969 (GFH29492)	0.05	0.35	1.0	0.09	0.29	0.19	0.26	0.17	0.16	0.13	0.21	0.15	0.17	0.09	0.23	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.09	0.31
lcl\|BLLF01004435.1_cds_GFH29604.1_24081 (GFH29604)	0.2	0.03	1.0	0.41	0.04	0.07	0.43	0.01	0.3	0.1	0.02	0.07	0.06	0.02	0.32	0.05	0.09	0.06	0.18	0.08	0.07	0.07	0.05	0.03	0.05	0.02
lcl\|BLLF01004435.1_cds_GFH29606.1_24083 (GFH29606)	0.59	0.05	1.0	0.43	0.03	0.03	0.36	0.04	0.27	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.28	0.04	0.03	0.08	0.15	0.05	0.06	0.07	0.07	0.02	0.06	0.06
lcl\|BLLF01004532.1_cds_GFH29796.1_24273 (GFH29796)	0.93	0.2	1.0	0.42	0.04	0.17	0.61	0.02	0.51	0.02	0.06	0.13	0.12	0.03	0.74	0.08	0.02	0.0	0.06	0.02	0.03	0.32	0.0	0.01	0.17	0.14
lcl\|BLLF01005254.1_cds_GFH30958.1_25435 (GFH30958)	0.52	0.03	1.0	0.69	0.04	0.08	0.69	0.02	0.39	0.0	0.0	0.06	0.06	0.02	0.66	0.31	0.21	0.07	0.11	0.04	0.0	0.16	0.02	0.01	0.17	0.04
lcl\|BLLF01005872.1_cds_GFH31723.1_26200 (GFH31723)	0.41	0.0	0.99	0.0	0.02	0.09	0.28	0.03	0.54	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	1.0	0.04	0.03	0.06	0.21	0.03	0.1	0.31	0.17	0.0	0.29	0.15
lcl\|BLLF01007970.1_cds_GFH33199.1_27676 (GFH33199)	0.38	0.02	1.0	0.22	0.03	0.04	0.19	0.02	0.7	0.13	0.02	0.03	0.04	0.01	0.4	0.04	0.03	0.07	0.03	0.04	0.1	0.1	0.1	0.02	0.1	0.04
lcl\|BLLF01008608.1_cds_GFH33450.1_27927 (GFH33450)	0.34	0.01	1.0	0.41	0.01	0.02	0.37	0.0	0.29	0.0	0.01	0.04	0.03	0.0	0.38	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.04	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)