Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 0.83 -0.75 1.57 1.37 -0.87 0.77 - 1.41 -0.78 0.91 1.92 -0.8 - - - - - - - - 1.78 0.96 -0.01
- - - 1.5 -1.07 0.49 0.94 -0.2 -1.15 - -1.09 -0.12 - 0.86 - - 1.67 1.75 - 1.51 - - 1.74 -0.86 - 0.64
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - 1.85 1.82 - 1.66 - - - - - - 2.77 - - - - - - - - 3.15 - -
- - - - -0.16 -0.14 -0.16 1.3 - - -0.16 - - 2.22 -0.2 - - 3.68 - - - - - 0.66 - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - 3.46 -17.2 -
- - - 2.27 - - 1.77 - 2.63 - 0.9 0.65 0.74 - 2.2 - - - - - - - - 0.91 - -
- - - 2.57 - -0.62 - -0.65 - - 0.51 0.38 -0.35 0.47 0.35 - - 2.24 - 2.01 - - - 1.46 - 0.13
- - - 3.18 -1.39 0.17 0.73 -1.52 -0.46 - 0.59 -0.43 - 0.58 0.11 - - - - - - - - 1.5 1.32 1.33
0.33 - - -0.35 -2.94 -2.92 -2.96 -1.4 -2.99 -0.24 -1.94 -2.9 -1.76 -0.94 -2.0 0.33 1.49 1.49 1.49 -0.33 1.95 0.57 0.89 1.61 - -
- - - - 1.93 3.49 - - - - - - 2.01 - - - - - - - - - - 2.79 - -
- - - - - - - 0.59 1.22 3.11 - - - - - - - - - 2.36 - - - 3.07 - -
- - - - - - - - - 4.35 - - - - - - - - - - - - - 2.47 - -
- - - 0.02 -1.57 -0.58 0.01 -1.62 -1.63 - - -0.56 -0.51 -0.73 -1.61 1.63 - - 1.86 - 2.74 - 1.26 2.09 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - 3.33
- - - - 1.3 1.83 0.14 0.01 0.87 - - - -0.1 - -0.27 - - - - - - - - 2.69 2.11 1.8
- - - - - - 1.13 2.28 0.07 - - - 1.38 1.19 - - - - - - - 3.63 - -0.66 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 2.5 - 0.89 - -0.2 -0.15 - 1.02 -0.11 - 0.97 - - - - - - - - - 2.47 0.63 2.23
- - - - - - 2.38 - 2.35 - 2.41 - - - - - - - - - - - - 3.38 - -
0.78 1.32 - 0.41 -0.24 0.03 -0.57 0.65 0.1 -1.07 0.19 -0.6 0.86 -0.1 -0.3 1.24 -0.49 -0.53 0.66 - 0.77 0.24 - -1.3 -0.91 -1.93
- - - 2.47 -0.58 -1.13 0.26 0.71 -0.61 - -0.1 -0.54 -0.61 0.1 1.49 - 0.8 - - -0.27 - - - 0.88 1.11 1.63
- - - - 1.61 - - - - - 1.59 - - - 1.53 - - - - - - - - 2.81 - 3.32
- - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - 4.29 - -
- - - 2.61 0.03 - 0.02 - -0.03 - 0.24 - - - - - - 2.86 - - - - 2.85 0.26 - -
- - - -0.7 -0.69 0.29 0.55 0.62 -0.34 - -0.23 0.88 0.88 0.7 0.46 - - - - - 2.02 2.21 - 0.58 0.02 0.04
-2.88 - - 1.84 0.04 0.11 0.33 -1.05 0.62 - 0.75 -0.06 -1.11 0.41 0.05 -0.94 0.21 0.7 -0.71 - -0.83 - 1.69 0.34 0.17 0.41
- - - - 2.65 - - 2.53 - - - - - 2.62 - - - - - - - - - 2.96 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
1.05 - - 0.9 - - 1.17 -0.86 -0.74 2.01 - - 0.49 - -1.91 - - -18.6 - 0.87 -13.42 - 2.83 2.01 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
-0.65 - - - -0.89 -0.32 0.06 - - 2.37 0.93 0.08 -0.24 0.44 -0.98 2.29 - - - - 1.4 - 0.92 -1.01 0.4 -0.17
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - -1.87 -1.91 -1.71 -0.4 0.86 - -0.31 -0.86 0.22 0.91 1.36 - - - - 0.71 1.41 2.61 0.94 -0.67 0.83 -0.16
- - - - - - 2.49 - - - 2.71 - - - - - - - - - - - - 3.79 - -
- - - - - - 2.4 - 2.37 - 2.42 - - - - - - - - - - - - 3.35 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.92 - - - - - - - - 2.05 - 2.75
- - - - - 1.93 0.9 0.81 - - 2.04 0.9 1.17 - 1.86 - - - - - - - - 2.75 - -
- - - - - - - 3.16 - - - - 3.52 - - - - - - - - - - 2.5 - -
- - - -1.45 -0.22 0.42 0.91 0.3 -1.09 1.98 -0.13 -1.05 0.06 1.32 -0.51 - -0.27 0.8 - -0.44 1.26 0.46 - -0.02 0.0 0.28
- -0.13 - - -2.43 -0.38 - - -0.52 0.11 -2.42 -1.81 - -0.55 -2.83 0.6 - 2.42 - 1.55 1.73 1.38 - 1.86 - 0.79
-0.91 - - 0.26 - 0.54 0.63 -0.25 0.49 - -2.91 -0.34 0.03 0.08 -0.39 - 1.44 1.93 0.51 0.69 0.39 - -0.08 -0.79 -0.19 0.99
-0.34 -0.87 - -1.42 -1.49 -0.42 0.53 -1.13 0.55 1.56 0.11 -0.68 0.39 -0.78 -0.22 - -0.83 1.05 - -0.99 0.71 0.49 1.4 0.87 -0.05 -0.28
1.09 - - 1.42 -1.15 0.41 -0.2 0.34 0.2 - - - -1.08 -0.52 -0.25 - - - - 2.43 - - 1.66 1.63 0.55 0.03
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.75 4.27 -
- - - - - - - - - 2.06 - - - - - - 2.13 - - - - 2.87 - 3.18 - 0.11
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 3.99 - - - - 1.61 - - - - - 1.01 - - - - - - - - 2.35 - -
- - - - 0.21 - 1.17 - 0.14 - 0.2 - 0.29 - 0.12 - - - - - - - 3.03 3.31 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - 3.1 - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - -
2.66 - - 2.25 - 0.68 - 1.52 - - - 2.22 - 0.8 - - - - - - - - - 2.01 - -
-0.34 -1.56 - 1.48 -0.67 -0.25 -0.03 -0.21 0.47 -1.36 -0.59 -1.61 -0.04 -0.91 0.13 - -0.3 1.24 0.36 -0.87 0.83 -0.56 1.57 0.12 0.18 -0.42
- - - - 1.24 - -0.38 0.5 0.58 2.34 - 0.62 -0.11 - 1.9 - - - - 2.25 - - - 0.45 - 1.37
- - - 0.69 - - -12.91 - 1.32 - - -8.18 3.65 - - - - - - - - - - 3.02 -3.27 0.19
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.43 1.43 -0.18 1.43 0.67 -0.21 - - -0.18 1.0 - -0.22 - - - - - - - - 1.16 2.56 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - 1.02 - - - - - 2.04 - - - - - - - - 3.61 - - - 2.94 - -
-0.94 - - 2.39 -0.62 0.14 0.15 - -0.26 1.5 -0.61 - -0.47 -2.06 0.54 - - - - 0.4 1.1 1.3 - 1.13 0.11 0.54
- - - - - - 2.31 0.64 0.7 - 0.75 - - - - - - - - 3.35 - - - 2.58 - -
- - - 3.4 1.81 - - - - - 1.82 - 1.91 - - - - - - - - - - 2.21 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - 4.03 - - - - - - - - - 3.27 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - - - - - 3.53 - -
- - - - 0.85 - -0.17 -0.28 -0.22 2.53 - - 0.08 - - - - - 3.26 - - - - 1.2 0.55 0.56
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - 2.88 - -
- - - - - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - - - 4.34 - -
- - - 4.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.85 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - 2.93 - - - 3.08 - - - - - - - - - - 3.31 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - -1.38 -1.96 -2.8 -0.79 -0.72 3.58 -0.52 -0.32 -0.31 -0.43 -1.04 0.21 -0.22 -0.14 0.44 - 0.72 - -0.15 0.58 - -2.25
- - - - -20.26 - -15.84 -21.71 -14.16 - - -25.38 -9.06 2.94 - -14.0 - - -19.63 -20.22 -18.99 - - 4.2 -10.39 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 2.44 0.27 0.85 1.31 0.19 0.8 - 1.69 0.87 0.33 -0.74 -0.77 - - - - - - - - -0.52 0.99 1.0
- - - 0.99 0.42 - 0.58 -0.71 1.35 - 1.57 0.97 1.05 1.74 - - - - - - - - - 2.13 - 1.72
- - - - - - - -1.59 - 4.07 - - -0.52 - - - - 2.04 - - - - - 1.61 - -0.05
1.76 - - - 0.5 0.49 - -1.14 - 1.61 - -0.11 - -0.25 -1.15 - - - - 1.52 - - 2.74 1.13 - 1.23
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 2.47 - 0.29 -0.7 0.25 - - 0.88 1.32 - -0.56 - - - 2.14 - 1.9 - - - 0.29 0.02 1.03
2.27 - - - - - - - - 2.45 - -0.3 - - -0.13 - - 2.57 - - - - - 3.01 - -
- - - -1.03 -0.28 0.69 1.03 -0.16 -0.67 1.08 0.98 -1.06 1.38 1.26 -1.1 1.58 0.15 1.22 - - 0.68 - - 0.54 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
2.36 2.17 - - 1.62 - 1.61 - - - - - - 1.74 - - - - - - - - - 0.84 - 2.34
- - - 1.16 1.75 1.15 1.0 0.0 0.51 - 1.41 -1.45 -1.18 -0.52 0.84 - - - - - - - - 2.05 1.29 0.31
- - - 3.04 - 1.47 - 2.28 - - - - 1.51 - 1.38 - - - - - - - - 2.25 - -
- - - - 1.73 - - 2.59 - - 2.73 1.71 - - - - - - - - - - - 2.75 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - 1.01 3.04 0.77 - - - - 0.67 0.75 - - - - 3.43 - - - - - -
- - - - 1.02 - 0.23 - - - 2.14 0.53 - 0.98 1.15 - - - - - - - - 3.15 1.95 -
- - - 1.11 - - -1.26 - 0.01 -2.27 -2.12 - -1.1 -1.2 -1.21 - - - 2.5 -3.48 2.78 - 0.99 2.6 - -
- - - - - - 1.96 - - - 1.96 - 2.02 1.8 - - - - - - - - - 3.42 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 0.28 -1.14 - -0.31 - -1.37 1.38 -1.32 -1.34 -0.06 0.94 -1.16 - 1.45 - 2.11 2.29 - - - 1.64 -0.59 -0.57
- - - - - - - - - - 3.58 - - - - - - - - - - - - 3.81 - -
-1.75 -2.17 - 1.57 -0.18 0.48 -0.05 -0.47 -0.55 -0.16 0.53 0.21 -0.05 -0.1 -1.05 -0.6 -2.49 0.67 0.69 0.39 -0.04 -0.58 0.97 0.49 -0.11 -0.54
-1.81 - - 1.09 1.26 0.84 -0.18 -1.61 -0.55 - -2.56 -0.16 - -0.06 0.37 - - - - 1.11 - 2.01 1.33 0.43 1.39 0.61
- - - 0.68 - 0.1 1.14 -1.02 - 1.79 -0.91 0.1 -0.85 1.43 0.05 - - 1.93 - 1.7 - - - 0.64 - 1.41
- - - - -0.09 - - 1.87 -0.34 - 1.05 0.05 - 0.59 - - - - - 2.42 - - 2.58 -0.03 1.87 -
- - - 1.62 0.02 0.03 1.02 0.92 - - 0.03 1.01 0.12 - - - - - - - - - - 1.45 3.07 0.76
- - - - -1.24 -0.27 0.99 0.6 -0.71 - 0.6 -0.27 1.7 0.93 1.87 - - - - - - - - 2.58 0.07 1.3
- - - 1.61 - - 3.11 - 0.97 - - 0.06 0.08 1.65 1.55 - - - - - - - - 2.08 - -
- - - - - - - - - - 3.78 - - - - - - - - - - - - 3.62 - -
- - - - 1.64 1.61 - 0.58 0.58 - 1.63 1.67 - - - - - - - - - - - 2.46 2.35 -
- - - - - 2.38 - - - - 1.61 - 1.63 - - - - - - - - - - 2.59 3.11 -
- - - 3.64 - - - - -0.6 - - - 0.88 0.77 - - - - - - - - - 3.23 - -
-1.17 - - -0.84 -0.83 0.38 0.38 0.05 -1.49 1.85 0.38 -0.44 0.56 0.56 - 1.77 - 0.41 - 0.18 1.88 - - -0.76 -0.12 -0.33
3.22 - - - - - 0.21 - - - - - - - - - - - - - 3.52 - - 2.03 - -
- - - - - -13.46 - - 1.54 - - - - - - - - - - 3.6 - - - 3.45 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - -
- - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.53 - -
- - - - - - - 2.72 - - - - - 2.67 - - - - - - - - - 3.7 - -
- - - 1.9 0.31 -1.28 0.86 0.62 0.26 - 0.78 -1.29 1.45 2.14 0.98 - - - - - - - - 2.27 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.