Heatmap: Cluster_228 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.78 -1.12 -1.45 0.22 0.05 0.45 -0.23 -0.33 -0.19 0.43 0.57 -0.4 -0.01 0.18 -0.3 -1.4 -0.83 0.57 0.15 -0.25 0.88 -1.35 0.24 -2.9 0.68 0.37
1.23 - - 0.54 -0.39 0.08 0.46 -1.21 0.2 0.25 0.6 -0.32 -0.97 0.1 0.38 -0.66 0.49 -0.02 -2.02 0.62 0.18 -0.94 0.19 0.7 -0.82 0.3
0.81 -5.31 -1.82 -0.71 0.19 0.97 0.64 -0.72 0.86 0.31 0.22 0.07 0.1 -0.05 0.35 -1.87 0.19 0.58 -2.37 -1.78 0.51 -2.88 0.35 -0.25 0.54 -0.06
-0.45 0.43 - -4.25 0.2 0.31 0.09 -0.16 0.11 -1.12 0.29 0.02 0.11 0.3 -0.77 -0.93 0.44 0.36 1.2 0.28 -0.48 - -0.39 -1.81 0.87 1.37
0.45 -1.67 -1.5 -0.97 0.75 0.28 0.11 0.18 0.29 0.5 0.48 0.22 -0.22 -0.13 0.08 -1.02 -0.65 -0.67 1.05 0.77 -0.4 -0.05 -0.24 -1.06 -0.0 -0.46
-0.75 -2.23 -1.81 -0.52 0.14 0.9 0.42 -0.8 0.1 0.95 0.24 0.33 -0.35 -0.25 -0.36 -0.04 -0.3 0.44 0.03 -0.35 -0.45 -0.1 0.05 -0.5 0.26 0.94
0.58 -3.4 - -0.86 0.3 0.24 0.34 -0.78 0.1 -0.47 0.1 -0.11 -0.18 -0.8 -0.4 0.16 -0.56 0.56 0.84 0.16 0.81 -0.99 0.42 -0.46 0.36 0.86
0.23 -0.75 - -0.59 0.8 0.32 0.42 -0.29 0.54 0.93 0.42 0.08 -0.12 0.04 0.26 - -2.0 -0.34 0.98 0.16 0.12 -1.26 -1.94 -1.77 0.54 0.93
-0.19 -1.04 -3.09 -1.26 -0.65 0.2 0.42 -0.58 0.05 1.12 -0.12 0.22 -0.27 0.32 0.17 0.55 0.1 0.1 -0.83 -0.02 0.54 0.13 0.64 -0.91 -0.65 0.47
0.89 -0.06 -0.19 0.24 0.64 -0.18 0.0 -0.33 -0.06 -1.52 0.13 -0.49 -0.88 -1.01 -0.27 1.46 0.65 -0.42 0.37 -1.89 -0.3 -1.28 -0.59 0.62 0.41 -0.94
0.37 -0.14 -4.37 -1.15 0.2 0.67 0.76 0.17 0.9 0.26 0.24 0.25 0.35 -0.09 0.2 -0.22 -1.69 -0.28 -0.59 -0.6 -0.01 -0.28 -0.15 -1.06 -0.37 0.74
1.2 - - -1.47 -0.06 0.4 0.49 0.3 -0.21 0.64 0.48 0.51 -0.61 -0.47 -1.31 - -1.3 0.36 0.36 - -0.76 0.44 0.77 -3.2 0.98 1.43
0.14 -1.71 -3.73 0.54 0.41 0.37 0.12 -0.56 0.06 0.49 0.41 -0.1 -0.25 -0.23 -0.19 -1.36 -0.73 0.35 1.21 0.62 0.36 -0.2 0.08 -1.19 -0.42 -0.22
-0.59 -3.55 - -3.88 0.62 0.81 0.04 -0.12 -0.36 0.03 0.5 -0.06 -0.18 -0.38 -0.83 -2.28 -0.12 -0.63 1.27 1.78 -0.17 -0.97 -0.64 -0.89 0.64 0.85
-0.81 -1.41 -3.17 -2.62 0.0 0.93 0.54 -1.01 0.16 1.3 0.2 -0.16 -0.27 -0.68 -0.08 -0.56 0.33 -0.09 -1.19 -0.06 0.88 -0.11 0.89 -1.09 -0.56 0.9
-1.77 -2.43 - - 0.4 0.48 0.39 -1.06 0.2 -0.66 0.36 0.78 0.24 0.3 -0.66 -0.57 - 0.29 1.24 1.5 0.95 - 0.06 -1.52 -0.11 0.88
0.49 -0.87 - -0.77 0.27 0.4 0.13 -1.52 -0.5 1.06 0.07 -0.18 -0.31 -0.62 -0.68 -0.98 -0.99 0.68 0.97 1.37 0.88 -0.31 0.29 -0.99 -0.93 -0.68
-0.68 -1.56 - -0.89 0.21 0.16 0.26 -0.8 0.35 0.77 0.22 0.09 0.49 -0.28 -0.69 -1.2 -0.09 0.13 1.28 0.67 0.2 -1.01 -0.1 -1.06 0.6 0.42
0.92 - - -1.11 0.57 0.63 -0.03 -0.06 0.82 -0.81 0.5 0.37 -0.02 0.05 -0.07 -2.31 - -0.66 0.92 0.56 -0.61 0.32 -1.67 -2.23 0.43 1.43
-0.44 - - - 0.18 1.1 1.16 -1.09 0.66 2.0 -0.96 0.61 -1.55 -2.3 -0.75 -0.09 0.48 - - - - 0.22 - 0.11 1.34 1.77
-2.53 - - -1.27 -0.56 -0.83 -1.39 -1.77 -1.07 -2.96 0.11 0.93 0.12 0.2 -0.62 -1.88 -1.09 1.18 1.62 1.75 1.69 -2.16 0.56 -2.18 -0.08 0.58
0.44 -1.38 - -0.65 0.27 0.76 0.27 -0.5 -0.32 -0.68 0.76 0.65 0.31 0.17 -0.92 -0.91 -1.93 -0.53 0.82 0.08 0.52 -0.38 0.53 -1.68 0.52 0.63
-0.88 -0.79 - -0.53 0.31 0.34 0.01 -0.62 0.14 0.24 0.43 0.3 0.06 -0.29 -0.25 -0.4 -1.45 -0.01 0.99 0.39 0.07 0.26 -0.29 -0.11 0.7 0.52
0.94 - - -2.59 -0.17 0.18 -0.56 -0.59 -0.59 0.84 0.22 0.07 -0.69 -0.31 -2.24 0.02 -0.41 -0.34 1.05 2.13 0.12 -0.68 0.65 -1.13 -0.76 -0.12
-0.65 - - -0.48 0.36 0.51 0.26 -0.06 0.8 0.77 0.41 0.51 -0.07 0.38 -0.54 -1.28 -0.04 -0.41 -0.38 1.02 0.09 -1.3 -0.42 -2.71 0.47 0.97
-0.79 0.29 - -0.77 -0.03 0.07 0.1 -0.84 0.2 0.2 0.16 -0.13 0.16 -0.39 -0.22 -1.44 0.43 -0.38 1.24 0.76 -0.68 0.02 -0.22 -0.56 0.73 0.59
-0.19 -3.94 - -3.69 0.8 0.78 0.05 -0.39 0.32 -0.25 0.65 -0.01 -0.07 -0.19 -0.42 0.17 0.14 0.27 0.47 1.11 0.03 -0.6 0.01 -0.84 -0.57 0.69
-1.18 -2.24 - -0.94 0.66 0.55 -0.09 0.17 0.06 1.08 0.75 0.37 0.1 -0.09 -0.12 -0.61 -0.68 -0.78 0.51 0.57 -0.31 0.06 0.12 -0.66 -0.22 0.53
0.09 - -1.58 -1.14 0.83 0.48 0.21 -0.08 0.12 0.98 0.56 0.31 0.45 0.29 -0.24 -1.47 0.16 -0.7 0.51 -0.12 -0.28 -0.57 -0.4 -0.79 0.12 0.39
1.04 -1.58 - 0.78 0.67 0.84 0.57 -0.14 0.5 -0.43 0.71 0.39 -0.49 -0.2 -0.11 -1.03 -0.36 -1.39 0.39 0.15 -1.15 -1.21 -1.21 -0.9 0.08 0.6
-0.36 -0.86 - -3.31 0.6 0.1 -0.06 0.08 -0.04 0.8 0.6 0.22 0.11 0.01 0.09 0.3 0.19 -0.47 0.53 0.03 0.41 - -1.07 -1.86 0.83 1.01
0.37 0.06 -2.42 -0.99 0.29 0.01 -0.34 -0.37 -0.33 0.45 0.41 -0.13 -0.18 -0.14 -0.26 -0.51 -0.31 0.61 0.82 0.42 0.49 -0.08 0.35 -0.93 0.05 -0.28
0.46 - - -0.62 0.45 0.41 0.14 -0.92 -0.45 -0.55 0.24 0.68 0.18 -0.22 -0.62 -1.93 -1.47 0.61 1.41 0.59 0.7 -0.51 0.64 -0.52 -0.12 -0.01
0.17 -0.12 - -0.47 -0.73 -0.18 -0.79 -1.76 -1.53 0.86 0.09 -0.47 0.51 -0.08 -2.38 - - 0.78 1.78 0.55 1.25 -1.14 0.99 -2.37 0.54 0.35
0.21 -1.15 -1.56 -1.86 0.44 0.63 0.42 -0.56 -0.18 0.5 0.13 0.3 0.11 -0.09 -0.02 -0.74 -1.28 0.29 1.43 0.65 0.25 -0.67 0.46 -1.37 -1.04 -0.6
0.66 -1.13 -0.43 -1.51 0.47 0.89 0.42 -0.35 0.56 0.36 0.32 0.25 0.3 -0.38 -0.36 -0.73 -1.35 0.1 0.18 -0.86 -0.2 -0.05 -0.55 -0.89 -0.06 0.8
-0.73 -2.93 -0.73 -0.93 0.34 0.39 0.3 -1.14 0.36 -0.59 0.38 0.07 -0.27 -0.76 -0.19 0.34 0.14 0.27 -0.5 1.5 -0.91 -0.18 -0.46 0.13 0.32 0.74
-2.8 -1.01 - -4.94 0.84 0.78 -0.4 -0.18 -0.55 0.9 0.61 0.9 -0.49 -0.36 -1.13 -1.33 0.15 -0.3 0.75 0.72 0.1 0.56 -0.79 -0.84 0.69 0.42
0.43 -1.82 - 0.04 0.31 0.69 0.22 -0.13 0.31 0.63 0.35 -0.01 -0.11 -0.52 0.16 -0.51 -0.94 0.13 0.41 0.51 -0.25 -0.79 0.2 -0.86 0.17 0.37
-1.15 -1.53 -3.67 -1.45 0.1 0.87 0.68 -0.34 0.36 0.95 -0.23 0.49 0.11 -0.35 0.14 -4.89 -2.98 -0.68 0.26 -0.08 -0.51 0.85 -0.08 0.08 0.95 0.73
0.43 - -2.84 1.57 -0.35 0.42 -0.79 -0.78 -1.5 -0.11 -0.46 0.74 -0.16 -0.18 -1.11 0.18 0.23 -0.1 0.26 -0.37 0.39 1.77 0.45 -1.83 -1.32 -1.53
-1.31 -0.03 -1.44 -0.87 0.71 0.72 0.15 -0.0 0.09 -0.78 0.64 0.64 0.06 -0.08 -0.03 -0.83 0.49 -0.74 0.5 -0.05 -0.87 0.76 -0.75 -0.55 -0.01 0.19
0.6 -1.27 - -0.81 0.12 0.49 0.01 -1.08 0.15 0.45 0.21 0.02 -0.16 -0.59 -0.34 0.15 0.1 0.76 0.31 0.08 0.43 -0.37 0.11 0.14 0.15 -0.08
-0.9 -1.04 - -5.03 0.49 1.15 0.15 -0.73 0.21 -0.53 -0.15 0.38 -0.7 -0.95 -0.59 0.67 -0.72 -1.02 -0.06 1.29 -0.56 -0.16 -0.75 0.1 0.76 1.46
0.65 -0.63 -0.34 -1.0 0.13 0.66 0.1 -0.27 0.03 -0.64 0.03 0.52 -0.29 -0.31 -0.5 -0.48 -0.57 -0.14 0.91 0.95 -0.3 -0.14 0.09 -1.3 -0.05 0.28
-1.33 -2.0 - -0.47 0.5 0.25 0.1 -0.27 0.66 0.75 0.2 0.21 0.34 -0.49 0.47 - -1.94 -0.06 0.81 0.15 0.3 -0.61 -0.41 -0.01 0.57 0.99
-2.92 - - -0.27 0.36 1.46 1.11 0.22 -0.15 2.22 0.6 0.38 -0.01 0.31 -1.24 - - -0.34 - - - - -1.35 -1.94 1.35 1.41
0.3 -5.29 - -1.3 -0.18 0.62 0.47 -0.83 -0.74 -0.34 0.39 -0.15 -0.36 -0.06 -0.95 -0.43 -0.45 1.27 1.46 0.3 -0.32 0.1 -0.21 -1.46 0.68 0.64
0.46 - - -0.98 0.21 0.13 -0.33 -0.43 0.05 0.32 0.35 -0.27 -0.53 -0.07 -0.23 -0.77 -0.85 0.27 0.86 1.67 0.27 -0.34 0.16 -2.21 0.22 0.7
0.05 -1.02 - -0.8 0.42 0.32 0.11 -0.61 -0.18 1.22 0.8 -0.08 0.45 0.31 -0.78 -2.09 -1.58 0.0 1.04 0.89 0.03 -0.17 -0.28 -2.05 -0.47 0.41
-2.28 -0.03 - -1.6 0.53 0.35 -0.21 -0.58 0.29 0.57 0.08 0.08 0.06 -0.62 -0.3 -0.57 -1.0 -0.23 0.24 0.88 -0.47 -1.27 0.45 0.34 1.2 0.85
1.31 - - - 0.19 0.2 -0.06 -0.28 -0.2 0.43 -0.05 -0.56 -0.87 -0.38 -0.27 0.28 -2.96 0.81 -2.3 -0.12 1.48 -1.22 0.1 0.65 0.24 1.12
0.17 - - -2.09 -0.02 1.05 0.47 -0.46 0.02 -0.4 0.33 -0.36 0.06 -0.63 -1.74 0.52 1.09 -0.25 - 1.73 -0.37 - -0.85 -2.36 -0.63 1.92
0.78 -3.0 - 0.32 -0.56 0.18 0.04 -1.46 0.07 -0.96 -0.27 -0.42 -0.83 -1.45 -0.91 0.86 0.11 0.5 1.09 0.41 0.65 -2.15 1.17 0.43 -0.18 0.09
0.3 -2.37 -0.74 - 0.31 -0.08 -0.14 -0.63 0.45 0.2 0.55 0.05 -0.27 -0.44 -0.04 -0.98 0.48 0.13 0.85 0.4 0.07 -0.62 -0.7 -1.14 0.74 1.1
0.37 -1.05 -2.26 -3.15 0.83 0.79 0.14 -0.67 0.5 - 0.42 0.75 0.78 -0.55 -0.89 -1.54 -1.97 -1.9 -1.31 -0.48 0.37 - 0.68 -3.2 1.45 1.84
0.84 -1.69 - 0.4 0.76 0.12 -0.39 0.0 0.23 -0.42 0.58 0.02 -1.04 -0.05 -1.18 0.93 -1.09 0.57 -0.43 -0.03 0.45 -1.94 0.39 0.67 -0.07 -0.61
0.47 -2.89 - -0.19 0.49 0.04 -0.32 -0.23 -0.56 1.3 0.45 -0.36 -0.19 -0.22 -0.95 -1.63 -0.74 0.72 0.99 1.61 -0.06 -1.0 0.17 -2.38 -0.89 0.07
1.23 - - -0.1 0.41 0.71 0.27 -0.7 0.13 -0.31 0.89 0.01 -0.06 -0.33 -0.01 - -0.51 0.41 -0.59 -0.41 0.71 -2.09 0.04 0.41 0.8 0.0
1.41 - - - 0.13 -0.61 0.25 -1.17 0.45 -0.5 0.48 0.38 0.01 -0.58 -0.25 -1.0 0.15 0.64 0.22 0.4 -0.9 -0.7 -0.37 0.75 1.28 -0.0
0.14 - - -0.6 0.49 0.4 0.04 -0.44 -0.11 0.02 0.18 0.07 -0.25 -0.88 -0.34 -0.38 -0.11 0.96 0.93 0.35 0.89 -1.08 0.95 0.05 -1.0 -0.26
-0.2 -1.51 - -0.51 0.05 0.59 -0.07 -0.77 -0.88 0.51 0.04 -0.03 0.15 0.02 -1.92 -0.78 0.58 0.09 1.23 0.5 -0.38 -0.06 -0.07 -3.0 0.83 1.1
-0.33 -3.19 -2.35 -0.58 0.27 0.88 0.15 -0.95 0.06 0.79 0.26 0.24 -0.28 -0.81 -0.6 -0.62 -0.29 0.35 0.97 1.02 0.01 -0.4 0.44 -0.42 -0.54 0.1
- - - -0.21 -1.47 -0.49 -0.76 -1.88 -0.68 1.22 -0.06 0.58 0.25 0.35 -1.54 - - 1.36 1.95 0.81 1.51 - 0.62 -4.59 0.25 0.26
- - - - 0.05 1.21 0.13 -3.13 -1.02 2.06 0.79 -0.39 -0.84 -2.82 -3.0 1.23 0.8 0.88 - 0.64 1.34 - - - -1.24 1.59
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-2.77 -1.59 - -2.27 1.02 1.59 0.43 0.36 0.61 -1.75 0.36 0.22 -0.06 -0.34 -0.98 0.07 0.13 -0.28 0.79 1.25 -2.14 0.06 -2.61 -1.87 -1.02 0.88
0.51 -0.52 -2.8 -1.29 0.82 0.64 0.45 -0.66 0.45 -2.14 1.13 0.8 0.36 0.3 0.35 -1.0 -0.68 -1.83 0.85 -0.95 -1.63 -1.87 -1.55 -0.51 0.88 0.54
0.43 -1.03 - -4.69 0.52 1.07 0.27 -0.55 0.26 -0.59 0.18 0.13 0.04 -0.86 -0.37 0.22 -1.72 -0.89 -0.05 0.91 0.4 - -0.21 -0.87 -0.12 1.9
-1.88 - - -0.26 0.43 0.42 0.13 0.0 0.37 0.75 0.36 0.37 0.32 -0.3 0.15 -0.7 -1.12 -0.26 0.3 0.42 -0.51 -1.2 0.3 -0.13 0.63 1.05
0.24 -0.05 0.63 -0.83 -0.44 0.54 -0.28 -1.44 -0.3 -0.83 0.08 0.06 0.18 -0.23 -0.81 -1.55 - 0.51 1.49 1.4 -1.03 0.17 0.67 -2.98 0.06 -0.46
0.83 - -3.38 0.73 0.1 0.4 -0.74 -0.48 -1.08 0.36 0.72 0.13 0.15 0.24 -1.06 -1.67 -0.93 0.5 -0.27 -0.01 0.03 1.17 0.61 -1.66 -0.12 0.48
- - - - 0.71 1.08 -0.49 0.27 0.49 1.08 0.44 0.53 0.38 0.35 -2.66 - - 1.22 - 1.57 0.68 - - -3.41 1.1 1.11
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-1.12 -0.98 - -1.6 0.19 0.22 -0.01 -0.67 -0.03 -0.63 0.06 -0.23 -0.15 -0.59 -0.59 0.68 -0.25 -0.06 1.04 0.84 -0.13 -0.19 0.02 0.23 0.79 1.05
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1.12 -3.07 - -0.92 -1.3 1.04 -0.56 -0.69 -1.14 - -0.06 0.22 0.44 0.18 -1.38 -1.44 -0.22 0.42 0.14 0.42 0.72 1.51 0.75 -1.92 0.74 -0.22
0.17 -1.29 - -0.81 0.36 1.09 -0.13 -0.55 0.41 0.45 0.28 0.5 0.26 -0.15 0.66 -0.05 -0.1 0.52 0.18 -0.64 0.55 -0.74 0.17 -1.75 -0.76 -0.54
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-0.0 - - - 0.3 1.23 -0.07 -0.31 0.83 -0.93 0.69 0.44 0.7 0.69 0.42 - 0.42 0.72 - - 1.99 - 1.41 -3.51 - -3.0
0.61 -1.19 -3.63 -2.14 0.7 0.16 0.39 -0.1 0.24 -0.36 0.68 0.28 0.31 0.16 0.04 -0.65 -0.53 -0.42 0.9 0.23 0.23 -0.43 -0.54 -0.75 0.19 0.15
1.07 0.31 -1.79 0.06 0.47 0.49 0.07 -1.08 -0.01 0.3 0.39 -0.23 0.25 -0.17 -0.17 -3.79 -1.05 0.17 0.02 -0.38 0.22 -0.68 -0.57 -0.93 0.68 0.69

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.