Heatmap: Cluster_234 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000006.1_cds_GFH05717.1_194 (GFH05717)	0.58	0.95	0.54	0.84	0.51	0.37	0.71	0.23	0.73	0.79	0.38	0.38	0.46	0.29	0.65	0.59	0.34	1.0	0.7	0.71	0.96	0.69	0.86	0.25	0.42	0.3
lcl\|BLLF01000039.1_cds_GFH06455.1_932 (GFH06455)	0.05	0.54	0.0	0.06	0.08	0.14	0.09	0.04	0.04	0.13	0.1	0.08	0.11	0.13	0.06	0.37	0.41	0.58	0.22	0.74	1.0	0.0	0.72	0.08	0.3	0.27
lcl\|BLLF01000044.1_cds_GFH06551.1_1028 (GFH06551)	0.73	0.67	0.04	0.3	0.84	0.69	1.0	0.27	0.65	0.61	0.42	0.46	0.56	0.18	0.58	0.54	0.0	0.72	0.06	0.2	0.57	0.54	0.68	0.12	0.23	0.23
lcl\|BLLF01000062.1_cds_GFH06899.1_1376 (GFH06899)	0.19	0.51	0.16	0.69	0.27	0.21	0.16	0.16	0.18	0.22	0.22	0.12	0.16	0.11	0.19	0.31	1.0	0.55	0.11	0.52	0.52	0.31	0.41	0.15	0.18	0.19
lcl\|BLLF01000073.1_cds_GFH07091.1_1568 (GFH07091)	0.43	0.78	0.38	0.64	0.44	0.33	0.31	0.3	0.36	0.78	0.43	0.3	0.37	0.29	0.47	0.25	0.31	1.0	0.76	0.9	0.89	0.35	0.58	0.11	0.6	0.31
lcl\|BLLF01000159.1_cds_GFH08415.1_2892 (GFH08415)	0.28	0.7	0.0	0.88	0.5	0.46	0.29	0.34	0.33	0.37	0.39	0.43	0.4	0.39	0.37	0.25	0.72	1.0	0.26	0.68	0.89	0.25	0.99	0.28	0.04	0.22
lcl\|BLLF01000160.1_cds_GFH08425.1_2902 (GFH08425)	0.16	0.69	0.0	0.03	0.44	0.08	0.06	0.06	0.07	0.5	0.14	0.02	0.02	0.15	0.13	0.32	0.08	0.78	0.35	1.0	0.76	0.12	0.08	0.04	0.04	0.04
lcl\|BLLF01000184.1_cds_GFH08784.1_3261 (GFH08784)	0.2	1.0	0.0	0.3	0.03	0.14	0.05	0.05	0.01	0.36	0.14	0.1	0.15	0.18	0.01	0.2	0.15	0.4	0.36	0.87	0.69	0.13	0.08	0.02	0.46	0.52
lcl\|BLLF01000196.1_cds_GFH08944.1_3421 (GFH08944)	0.03	0.62	0.57	0.49	0.31	0.22	0.36	0.23	0.43	0.55	0.32	0.24	0.4	0.28	0.39	0.66	0.7	0.68	1.0	0.57	0.56	0.23	0.35	0.32	0.28	0.25
lcl\|BLLF01000213.1_cds_GFH09164.1_3641 (GFH09164)	1.0	0.73	0.28	0.27	0.62	0.54	0.65	0.58	0.7	0.57	0.59	0.41	0.55	0.45	0.51	0.4	0.41	0.71	0.27	0.68	0.69	0.61	0.72	0.33	0.37	0.29
lcl\|BLLF01000288.1_cds_GFH10121.1_4598 (GFH10121)	0.18	0.35	0.16	0.09	0.32	0.29	0.26	0.12	0.22	0.23	0.39	0.26	0.26	0.17	0.19	0.0	0.07	0.33	0.7	1.0	0.32	0.15	0.49	0.1	0.19	0.17
lcl\|BLLF01000297.1_cds_GFH10225.1_4702 (GFH10225)	0.58	1.0	0.6	0.42	0.58	0.52	0.75	0.42	0.81	0.64	0.44	0.51	0.74	0.37	0.68	0.62	0.49	0.93	0.23	0.45	0.96	0.66	0.81	0.07	0.11	0.12
lcl\|BLLF01000330.1_cds_GFH10600.1_5077 (GFH10600)	0.33	0.7	0.67	0.42	0.29	0.29	0.28	0.15	0.23	0.08	0.34	0.24	0.27	0.31	0.23	0.85	0.89	0.93	0.84	0.36	1.0	0.33	0.78	0.2	0.06	0.13
lcl\|BLLF01000391.1_cds_GFH11296.1_5773 (GFH11296)	0.28	0.0	0.26	0.27	0.65	0.39	0.21	0.15	0.27	0.53	0.44	0.22	0.23	0.22	0.33	0.34	0.57	1.0	0.0	0.82	0.33	0.61	0.61	0.22	0.09	0.19
lcl\|BLLF01000535.1_cds_GFH12737.1_7214 (GFH12737)	0.3	0.56	0.41	0.8	0.37	0.29	0.39	0.16	0.38	0.53	0.38	0.28	0.32	0.25	0.34	1.0	0.92	0.53	0.82	0.58	0.64	0.55	0.51	0.22	0.38	0.36
lcl\|BLLF01000640.1_cds_GFH13684.1_8161 (GFH13684)	0.4	0.49	0.52	0.77	0.53	0.35	0.28	0.16	0.26	0.21	0.48	0.2	0.15	0.22	0.16	0.79	0.95	0.71	1.0	0.71	0.53	0.48	0.25	0.12	0.71	0.37
lcl\|BLLF01000668.1_cds_GFH13927.1_8404 (GFH13927)	0.36	0.83	0.13	0.62	0.29	0.42	0.45	0.35	0.44	0.46	0.39	0.43	0.53	0.43	0.55	0.45	0.55	0.65	0.53	0.92	1.0	0.37	0.75	0.33	0.44	0.32
lcl\|BLLF01000773.1_cds_GFH14844.1_9321 (GFH14844)	0.0	0.66	0.0	0.0	0.23	0.14	0.07	0.03	0.01	0.2	0.24	0.11	0.13	0.08	0.06	0.14	0.11	0.22	1.0	0.85	0.46	0.18	0.33	0.04	0.13	0.21
lcl\|BLLF01000818.1_cds_GFH15194.1_9671 (GFH15194)	0.22	1.0	0.39	0.51	0.48	0.21	0.16	0.22	0.1	0.18	0.44	0.19	0.2	0.25	0.06	0.5	0.61	0.47	0.13	0.41	0.34	0.21	0.34	0.22	0.3	0.39
lcl\|BLLF01000992.1_cds_GFH16398.1_10875 (GFH16398)	0.54	0.74	0.33	1.0	0.32	0.32	0.36	0.18	0.33	0.6	0.26	0.18	0.21	0.17	0.31	0.46	0.49	0.57	0.75	0.43	0.39	0.28	0.3	0.06	0.35	0.29
lcl\|BLLF01001057.1_cds_GFH16829.1_11306 (GFH16829)	0.6	0.47	0.71	0.73	0.88	0.67	0.49	0.35	0.46	0.49	0.67	0.49	0.5	0.34	0.41	0.49	0.5	0.98	0.56	0.88	0.92	0.53	1.0	0.44	0.2	0.33
lcl\|BLLF01001114.1_cds_GFH17220.1_11697 (GFH17220)	0.05	0.92	0.18	0.49	0.45	0.29	0.36	0.19	0.36	0.5	0.42	0.31	0.51	0.19	0.36	0.35	0.62	0.67	0.26	0.47	1.0	0.08	0.63	0.12	0.14	0.23
lcl\|BLLF01001145.1_cds_GFH17423.1_11900 (GFH17423)	0.07	0.9	0.0	0.06	0.17	0.32	0.12	0.12	0.17	0.41	0.13	0.19	0.05	0.08	0.04	0.61	1.0	0.23	0.6	0.83	0.31	0.12	0.22	0.12	0.54	0.53
lcl\|BLLF01001307.1_cds_GFH18481.1_12958 (GFH18481)	0.36	0.72	0.51	0.44	0.39	0.24	0.4	0.24	0.32	0.28	0.35	0.23	0.22	0.25	0.48	0.26	0.61	0.94	0.45	1.0	0.9	0.2	0.69	0.02	0.15	0.15
lcl\|BLLF01001334.1_cds_GFH18656.1_13133 (GFH18656)	0.32	1.0	0.57	0.72	0.64	0.41	0.35	0.33	0.35	0.35	0.56	0.35	0.37	0.28	0.36	0.29	0.43	0.2	0.24	0.39	0.42	0.41	0.36	0.37	0.53	0.53
lcl\|BLLF01001336.1_cds_GFH18673.1_13150 (GFH18673)	0.25	0.35	0.02	0.25	0.27	0.18	0.08	0.05	0.13	0.34	0.19	0.14	0.13	0.11	0.1	0.38	1.0	0.34	0.13	0.32	0.52	0.0	0.5	0.07	0.18	0.16
lcl\|BLLF01001445.1_cds_GFH19336.1_13813 (GFH19336)	0.41	0.93	0.49	0.71	0.47	0.46	0.37	0.43	0.31	0.44	0.55	0.54	0.43	0.57	0.34	0.59	0.71	0.86	1.0	0.69	0.75	0.67	0.84	0.21	0.26	0.34
lcl\|BLLF01001477.1_cds_GFH19519.1_13996 (GFH19519)	0.47	0.61	0.34	0.47	0.56	0.44	0.41	0.43	0.46	0.21	0.55	0.38	0.46	0.42	0.38	0.42	0.38	0.64	0.98	1.0	0.6	0.25	0.53	0.25	0.48	0.54
lcl\|BLLF01001542.1_cds_GFH19917.1_14394 (GFH19917)	0.09	0.29	0.0	0.03	0.29	0.23	0.15	0.32	0.16	0.38	0.26	0.21	0.2	0.22	0.14	0.13	0.11	0.35	0.11	1.0	0.47	0.48	0.37	0.17	0.2	0.22
lcl\|BLLF01001543.1_cds_GFH19927.1_14404 (GFH19927)	0.33	1.0	0.45	0.51	0.35	0.37	0.42	0.18	0.4	0.41	0.31	0.29	0.28	0.22	0.33	0.66	0.36	0.41	0.65	0.35	0.54	0.7	0.32	0.26	0.69	0.61
lcl\|BLLF01001655.1_cds_GFH20543.1_15020 (GFH20543)	0.14	0.72	0.1	0.07	0.28	0.31	0.12	0.18	0.16	0.38	0.19	0.19	0.2	0.1	0.1	0.18	0.15	0.52	0.35	1.0	0.74	0.5	0.55	0.06	0.22	0.23
lcl\|BLLF01001657.1_cds_GFH20555.1_15032 (GFH20555)	0.27	0.64	0.07	1.0	0.33	0.09	0.16	0.22	0.16	0.62	0.2	0.02	0.07	0.11	0.09	0.32	0.55	0.44	0.38	0.74	0.52	0.4	0.37	0.01	0.27	0.07
lcl\|BLLF01001697.1_cds_GFH20791.1_15268 (GFH20791)	0.63	0.74	0.24	0.48	0.58	0.57	0.39	0.22	0.36	0.64	0.55	0.41	0.39	0.34	0.24	0.52	0.59	0.66	0.9	1.0	0.78	0.37	0.6	0.41	0.44	0.54
lcl\|BLLF01001730.1_cds_GFH20942.1_15419 (GFH20942)	0.18	0.58	0.37	0.08	0.18	0.24	0.19	0.17	0.12	0.35	0.24	0.17	0.17	0.15	0.15	0.35	0.3	0.8	0.65	1.0	0.58	0.18	0.32	0.15	0.6	0.94
lcl\|BLLF01001772.1_cds_GFH21166.1_15643 (GFH21166)	0.04	0.48	0.72	0.17	0.19	0.22	0.23	0.21	0.46	0.0	0.22	0.1	0.34	0.23	0.38	0.34	0.21	0.21	0.14	0.13	1.0	0.47	0.54	0.12	0.32	0.37
lcl\|BLLF01001790.1_cds_GFH21255.1_15732 (GFH21255)	0.18	0.4	0.27	0.46	0.26	0.13	0.11	0.13	0.13	0.3	0.18	0.07	0.1	0.18	0.07	0.34	0.19	0.46	0.05	0.2	1.0	0.16	0.26	0.02	0.15	0.16
lcl\|BLLF01001821.1_cds_GFH21399.1_15876 (GFH21399)	0.22	0.7	0.0	0.01	0.32	0.44	0.28	0.27	0.34	0.23	0.32	0.29	0.27	0.24	0.23	0.45	0.23	0.5	0.85	1.0	0.54	0.31	0.65	0.12	0.42	0.87
lcl\|BLLF01001970.1_cds_GFH22104.1_16581 (GFH22104)	0.15	1.0	0.64	0.72	0.41	0.22	0.1	0.26	0.13	0.28	0.25	0.13	0.13	0.13	0.09	0.47	0.73	0.47	0.22	0.99	0.43	0.19	0.33	0.17	0.24	0.51
lcl\|BLLF01002231.1_cds_GFH23265.1_17742 (GFH23265)	0.32	0.3	0.86	0.5	0.23	0.33	0.37	0.33	0.36	0.26	0.28	0.38	0.31	0.37	0.31	0.04	0.06	0.7	0.47	0.18	0.75	0.33	1.0	0.15	0.26	0.23
lcl\|BLLF01002251.1_cds_GFH23347.1_17824 (GFH23347)	0.83	0.68	0.46	0.94	0.37	0.29	0.21	0.16	0.22	0.47	0.38	0.21	0.17	0.2	0.18	0.63	0.65	0.72	1.0	0.9	0.7	0.33	0.56	0.19	0.36	0.43
lcl\|BLLF01002279.1_cds_GFH23466.1_17943 (GFH23466)	0.83	0.81	0.38	0.32	0.46	0.63	0.42	0.34	0.45	0.2	0.57	0.45	0.46	0.52	0.41	0.57	0.91	1.0	0.97	0.57	0.95	0.73	0.86	0.2	0.24	0.28
lcl\|BLLF01002333.1_cds_GFH23681.1_18158 (GFH23681)	0.06	0.52	0.64	0.07	0.24	0.28	0.24	0.16	0.23	0.18	0.27	0.21	0.29	0.28	0.19	0.57	0.11	0.36	0.18	0.24	1.0	0.13	0.52	0.14	0.35	0.53
lcl\|BLLF01002370.1_cds_GFH23817.1_18294 (GFH23817)	0.0	0.7	0.37	0.0	0.22	0.16	0.18	0.19	0.21	0.06	0.25	0.14	0.18	0.22	0.14	0.36	0.44	0.19	0.39	1.0	0.21	0.11	0.28	0.05	0.04	0.06
lcl\|BLLF01002655.1_cds_GFH24872.1_19349 (GFH24872)	0.16	0.85	0.06	0.26	0.33	0.21	0.11	0.13	0.09	0.39	0.29	0.15	0.15	0.19	0.05	0.16	0.59	0.72	0.54	1.0	0.68	0.25	0.44	0.02	0.07	0.19
lcl\|BLLF01002784.1_cds_GFH25336.1_19813 (GFH25336)	0.4	0.64	0.81	0.78	0.58	0.57	0.44	0.25	0.43	0.63	0.52	0.42	0.59	0.37	0.4	0.24	0.23	0.74	1.0	0.83	0.85	0.57	0.99	0.34	0.31	0.36
lcl\|BLLF01003134.1_cds_GFH26453.1_20930 (GFH26453)	0.3	0.7	0.56	0.5	0.5	0.56	0.34	0.51	0.35	0.33	0.42	0.5	0.4	0.32	0.32	0.3	0.35	0.32	0.63	1.0	0.35	0.49	0.31	0.34	0.28	0.4
lcl\|BLLF01003323.1_cds_GFH27028.1_21505 (GFH27028)	0.13	0.41	0.08	0.31	0.25	0.23	0.14	0.15	0.19	0.11	0.32	0.28	0.29	0.32	0.23	0.1	0.35	1.0	0.3	0.72	0.66	0.17	0.52	0.17	0.21	0.23
lcl\|BLLF01003547.1_cds_GFH27617.1_22094 (GFH27617)	0.97	0.73	0.75	0.96	0.63	0.53	0.41	0.63	0.39	0.87	0.6	0.59	0.51	0.56	0.4	0.87	0.96	0.98	1.0	0.84	0.88	0.56	0.95	0.62	0.72	0.73
lcl\|BLLF01004285.1_cds_GFH29315.1_23792 (GFH29315)	0.73	0.43	0.3	1.0	0.4	0.35	0.35	0.21	0.34	0.47	0.43	0.29	0.28	0.25	0.3	0.65	0.82	0.4	0.74	0.63	0.32	0.5	0.36	0.17	0.47	0.42
lcl\|BLLF01004304.1_cds_GFH29349.1_23826 (GFH29349)	0.18	0.38	0.0	0.01	0.46	0.3	0.2	0.33	0.19	0.3	0.23	0.4	0.16	0.16	0.17	0.16	0.28	0.52	0.32	1.0	0.57	0.51	0.51	0.11	0.24	0.21
lcl\|BLLF01004452.1_cds_GFH29638.1_24115 (GFH29638)	0.33	0.68	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.88	1.0	0.81	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004489.1_cds_GFH29711.1_24188 (GFH29711)	0.0	0.65	0.0	0.08	0.29	0.22	0.19	0.14	0.17	0.16	0.21	0.15	0.09	0.17	0.16	0.12	0.09	0.27	0.54	0.62	1.0	0.14	0.0	0.14	0.08	0.11
lcl\|BLLF01004557.1_cds_GFH29846.1_24323 (GFH29846)	0.5	1.0	0.0	0.13	0.36	0.35	0.26	0.16	0.3	0.64	0.22	0.26	0.19	0.17	0.21	0.46	0.17	0.48	0.91	0.96	0.54	0.57	0.26	0.2	0.6	0.81
lcl\|BLLF01004587.1_cds_GFH29901.1_24378 (GFH29901)	0.63	0.51	0.81	0.59	0.59	0.57	0.28	0.42	0.38	0.23	0.55	0.37	0.49	0.37	0.29	0.45	0.54	0.78	0.93	0.45	0.81	0.25	1.0	0.13	0.1	0.23
lcl\|BLLF01005002.1_cds_GFH30584.1_25061 (GFH30584)	0.64	0.66	0.0	0.12	0.48	0.42	0.47	0.36	0.52	0.37	0.72	0.52	0.34	0.27	0.29	0.33	0.52	0.81	0.22	0.94	0.99	0.19	1.0	0.37	0.41	0.11
lcl\|BLLF01005215.1_cds_GFH30890.1_25367 (GFH30890)	0.5	0.49	0.4	0.52	0.21	0.1	0.15	0.2	0.3	0.67	0.14	0.09	0.18	0.07	0.33	0.0	0.11	0.8	0.38	0.51	1.0	0.09	0.79	0.03	0.34	0.24
lcl\|BLLF01006074.1_cds_GFH31927.1_26404 (GFH31927)	0.0	1.0	0.11	0.0	0.13	0.08	0.26	0.03	0.27	0.21	0.08	0.09	0.02	0.02	0.16	0.41	0.26	0.19	0.75	0.55	0.38	0.22	0.33	0.03	0.29	0.42
lcl\|BLLF01006405.1_cds_GFH32224.1_26701 (GFH32224)	0.24	0.51	0.18	0.16	0.24	0.23	0.17	0.15	0.15	0.11	0.25	0.19	0.27	0.13	0.21	0.15	0.39	0.45	0.32	1.0	0.33	0.54	0.45	0.03	0.19	0.22
lcl\|BLLF01006420.1_cds_GFH32235.1_26712 (GFH32235)	0.44	0.68	0.55	0.73	0.38	0.4	0.35	0.19	0.34	0.55	0.46	0.32	0.33	0.33	0.28	0.24	0.46	0.76	1.0	0.7	0.63	0.25	0.56	0.31	0.43	0.44
lcl\|BLLF01006686.1_cds_GFH32473.1_26950 (GFH32473)	0.48	0.71	0.2	0.73	0.35	0.37	0.26	0.26	0.41	0.46	0.3	0.32	0.35	0.3	0.33	0.2	0.34	0.82	0.66	1.0	0.77	0.4	0.69	0.17	0.22	0.18
lcl\|BLLF01009018.1_cds_GFH33591.1_28068 (GFH33591)	0.04	0.8	0.35	0.24	0.4	0.25	0.16	0.19	0.23	0.41	0.29	0.19	0.33	0.11	0.29	0.36	0.76	0.65	0.18	1.0	0.71	0.46	0.39	0.07	0.07	0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)