Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.04 0.0 0.0 1.0 0.17 0.04 0.01 0.02 0.01 0.08 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.06 0.07 0.2 0.09 0.1 0.09 0.05 0.25 0.32
0.0 0.0 0.0 0.96 0.36 0.54 0.25 0.17 0.0 0.0 0.3 0.14 0.06 0.0 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.48 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.27 0.02 0.04 0.0
0.0 0.05 0.0 1.0 0.07 0.05 0.12 0.07 0.27 0.46 0.06 0.07 0.23 0.09 0.21 0.87 0.32 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.67 0.22 0.12 0.28
0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.17 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.39 0.41 0.12 0.06 0.1 0.14 0.08 0.12 0.05 0.14 0.15
0.0 0.0 0.0 0.61 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.1 0.0 0.0 1.0 0.07 0.08 0.1 0.06 0.08 0.07 0.13 0.11 0.09 0.13 0.07 0.09 0.23 0.32 0.0 0.04 0.12 0.07 0.2 0.03 0.0 0.0
0.06 0.01 0.07 1.0 0.05 0.09 0.14 0.14 0.08 0.28 0.05 0.15 0.19 0.13 0.16 0.45 0.3 0.21 0.77 0.97 0.27 0.77 0.5 0.61 0.18 0.12
0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.23 0.03 0.02 0.02 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.11 0.07 0.07 0.04
0.11 0.11 0.0 0.86 0.0 0.01 0.03 0.02 0.04 0.09 0.01 0.03 0.04 0.02 0.12 1.0 0.15 0.07 0.02 0.47 0.1 0.62 0.26 0.38 0.07 0.03
0.05 0.0 0.0 0.86 0.01 0.03 0.03 0.01 0.07 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.07 0.14 1.0 0.56 0.33 0.27 0.37 0.04 0.01 0.01
0.02 0.15 0.0 1.0 0.11 0.03 0.01 0.02 0.0 0.15 0.07 0.02 0.03 0.0 0.02 0.23 0.02 0.09 0.0 0.17 0.05 0.03 0.04 0.02 0.17 0.42
0.13 0.12 0.08 0.47 0.22 0.19 0.2 0.09 0.18 0.43 0.18 0.11 0.14 0.12 0.13 1.0 0.44 0.19 0.1 0.16 0.21 0.45 0.18 0.28 0.18 0.24
0.0 0.03 0.0 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.24 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.02 0.0 0.34 0.41 0.01 0.2 0.02 0.04 0.18 0.23
0.21 0.05 0.02 1.0 0.2 0.13 0.2 0.16 0.22 0.56 0.18 0.17 0.22 0.16 0.21 0.49 0.56 0.32 0.29 0.26 0.32 0.27 0.37 0.27 0.22 0.2
0.12 0.11 0.0 1.0 0.0 0.04 0.1 0.01 0.31 0.12 0.03 0.01 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0 0.43 0.57 0.44 0.26 0.79 0.15 0.43 0.05 0.07
0.06 0.13 0.0 1.0 0.11 0.18 0.16 0.12 0.12 0.13 0.17 0.16 0.17 0.2 0.1 0.18 0.19 0.33 0.05 0.14 0.44 0.19 0.24 0.05 0.09 0.11
0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.14 0.19 0.06 0.18 0.06 0.13 0.09 0.23 0.16 0.05 0.71 0.8 0.08 0.0 0.2 0.1 0.0 0.28 0.03 0.31 0.29
0.14 0.04 0.0 1.0 0.18 0.16 0.17 0.23 0.22 0.26 0.29 0.09 0.24 0.24 0.15 0.23 0.41 0.47 0.09 0.1 0.28 0.26 0.28 0.16 0.13 0.1
0.0 0.07 0.0 0.88 0.27 0.24 0.27 0.19 0.25 0.28 0.17 0.18 0.19 0.15 0.28 1.0 0.27 0.55 0.13 0.3 0.3 0.11 0.5 0.26 0.29 0.23
0.09 0.04 0.0 1.0 0.13 0.14 0.08 0.07 0.13 0.2 0.1 0.1 0.08 0.06 0.07 0.1 0.1 0.18 0.18 0.18 0.29 0.38 0.3 0.11 0.16 0.43
0.05 0.11 0.07 0.46 0.13 0.15 0.16 0.1 0.13 0.63 0.17 0.1 0.14 0.15 0.08 1.0 0.66 0.41 0.03 0.18 0.21 0.27 0.3 0.22 0.14 0.14
0.03 0.0 0.0 1.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.05 0.05 0.0 0.0 0.26 0.0 0.14 0.62 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.18
0.29 0.0 0.0 0.51 0.18 0.27 0.16 0.16 0.11 0.32 0.32 0.16 0.16 0.17 0.15 1.0 0.54 0.57 0.0 0.06 0.98 0.0 0.21 0.13 0.34 0.26
0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.54 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.4 0.44 0.25 0.07 0.23 0.12 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.88 0.04 0.28 0.2 0.04 0.23 0.0 0.08 0.04 0.0 0.04 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07
0.05 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.05 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 1.0 0.84 0.13 0.2 0.11 0.18 0.64 0.12 0.06 0.0 0.07
0.03 0.14 0.0 1.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.07 0.07 0.03 0.04 0.03 0.02 0.05 0.51 0.33 0.18 0.05 0.03 0.08 0.13 0.06 0.07 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.74 0.25 0.09 0.24 0.0 0.03 0.0 0.26 0.06 0.22 0.13 0.09 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.47
0.14 0.13 0.1 1.0 0.2 0.06 0.06 0.02 0.07 0.42 0.24 0.06 0.04 0.04 0.05 0.19 0.18 0.23 0.57 0.57 0.14 0.24 0.19 0.17 0.26 0.33
0.23 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.06 0.09 0.19 0.32 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.9 1.0 0.0 0.0 0.89 0.97 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.04 0.03 0.0 1.0 0.11 0.14 0.18 0.03 0.17 0.44 0.17 0.05 0.11 0.14 0.1 0.49 0.33 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.05
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
0.07 0.1 0.13 1.0 0.05 0.06 0.03 0.12 0.04 0.18 0.06 0.06 0.03 0.05 0.02 0.36 0.19 0.15 0.45 0.57 0.25 0.21 0.23 0.32 0.07 0.09
0.41 0.23 0.15 1.0 0.27 0.33 0.29 0.24 0.34 0.5 0.27 0.29 0.29 0.24 0.25 0.38 0.49 0.4 0.52 0.67 0.38 0.78 0.32 0.52 0.33 0.3
0.23 0.0 0.0 0.73 0.08 0.02 0.07 0.05 0.09 0.2 0.07 0.02 0.01 0.03 0.03 0.38 1.0 0.23 0.23 0.06 0.21 0.12 0.22 0.13 0.05 0.0
0.33 0.21 0.28 0.72 0.25 0.18 0.14 0.17 0.17 0.36 0.23 0.22 0.23 0.18 0.2 0.41 0.55 0.29 0.6 0.81 0.3 1.0 0.28 0.36 0.24 0.14
0.09 0.03 0.0 0.94 0.05 0.09 0.09 0.04 0.06 0.1 0.02 0.03 0.06 0.07 0.05 1.0 0.27 0.17 0.46 0.19 0.19 0.4 0.47 0.28 0.13 0.14
0.03 0.0 0.0 1.0 0.03 0.04 0.05 0.02 0.02 0.14 0.0 0.01 0.06 0.01 0.06 0.19 0.36 0.15 0.68 0.32 0.21 0.12 0.15 0.21 0.02 0.05
0.02 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.05 0.0 0.09 0.09 0.01 0.01 0.04 0.0 0.06 0.1 0.0 0.25 0.0 0.26 0.1 0.33 0.17 0.09 0.05 0.04
0.18 0.0 0.0 0.83 0.22 0.15 0.12 0.02 0.11 0.33 0.1 0.05 0.03 0.05 0.09 1.0 0.71 0.45 0.0 0.26 0.62 0.13 0.42 0.15 0.13 0.29
0.0 0.03 0.0 1.0 0.01 0.05 0.01 0.14 0.03 0.25 0.01 0.0 0.0 0.14 0.04 0.58 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 0.0 1.0 0.07 0.13 0.02 0.17 0.07 0.11 0.04 0.02 0.04 0.13 0.05 0.8 0.38 0.15 0.0 0.0 0.33 0.23 0.66 0.42 0.14 0.22
0.1 0.0 0.0 1.0 0.03 0.04 0.13 0.02 0.1 0.0 0.04 0.01 0.04 0.01 0.06 0.26 0.52 0.1 0.15 0.09 0.07 0.16 0.0 0.11 0.43 0.15
0.02 0.08 0.0 0.54 0.01 0.0 0.2 0.01 0.19 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.17 0.22 0.21 0.45 0.42 1.0 0.46 0.62 0.5 0.58 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.06 0.0 1.0 0.07 0.11 0.07 0.01 0.14 0.36 0.08 0.05 0.03 0.07 0.07 0.22 0.22 0.11 0.85 0.63 0.16 0.09 0.17 0.08 0.13 0.17
0.07 0.24 0.0 1.0 0.17 0.01 0.07 0.04 0.09 0.39 0.05 0.08 0.12 0.1 0.12 0.97 0.1 0.54 0.16 0.18 0.3 0.0 0.32 0.13 0.1 0.05
0.17 0.1 0.0 1.0 0.23 0.27 0.3 0.11 0.24 0.59 0.24 0.17 0.24 0.22 0.21 0.68 0.73 0.23 0.09 0.2 0.12 0.23 0.17 0.41 0.37 0.36
0.03 0.03 0.3 1.0 0.15 0.0 0.03 0.01 0.05 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.52 0.0 0.27 0.54 0.0 0.14 0.0 0.02 0.02 0.15
0.08 0.07 0.0 0.79 0.1 0.11 0.09 0.06 0.09 0.24 0.1 0.11 0.09 0.07 0.09 0.13 0.11 0.16 1.0 0.65 0.2 0.14 0.15 0.25 0.15 0.08
0.0 0.15 0.0 1.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.04 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.35 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0
0.02 0.11 0.0 0.66 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.27 0.95 1.0 0.26 0.13 0.34 0.01 0.03 0.03
0.16 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.22 0.0
0.45 0.22 0.0 1.0 0.29 0.25 0.28 0.21 0.28 0.45 0.27 0.12 0.23 0.15 0.18 0.05 0.22 0.27 0.63 0.46 0.37 0.36 0.23 0.46 0.25 0.18
0.59 0.43 0.2 1.0 0.42 0.37 0.29 0.32 0.27 0.62 0.42 0.4 0.35 0.37 0.31 0.56 0.56 0.65 0.75 0.58 0.59 0.43 0.64 0.6 0.52 0.52
0.27 0.0 0.0 1.0 0.06 0.06 0.11 0.04 0.24 0.26 0.07 0.09 0.1 0.04 0.3 0.52 0.2 0.15 0.88 0.14 0.15 0.13 0.3 0.27 0.32 0.14
0.11 0.18 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.05 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 1.0 0.06 0.01 0.01 0.05 0.02 0.06 0.01 0.09 0.06 0.04 0.05 0.38 0.53 0.21 0.21 0.18 0.0 0.22 0.28 0.29 0.13 0.11
0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.03 0.04 0.08 0.06 0.19 0.03 0.0 0.01 0.02 0.05 0.15 0.43 0.12 0.1 0.48 0.44 0.0 0.06 0.18 0.0 0.0
0.04 0.35 0.0 0.91 0.11 0.07 0.1 0.09 0.13 0.27 0.08 0.1 0.06 0.04 0.05 0.1 0.13 0.12 0.33 1.0 0.3 0.37 0.11 0.62 0.2 0.18
0.05 0.11 0.0 0.79 0.31 0.3 0.2 0.11 0.15 0.08 0.23 0.26 0.26 0.17 0.1 1.0 0.52 0.18 0.14 0.59 0.25 0.44 0.23 0.14 0.28 0.27
0.09 0.07 0.0 1.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.13 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.44 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.03 0.09
0.0 0.1 0.0 1.0 0.08 0.08 0.0 0.09 0.07 0.0 0.19 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.38
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.67 1.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.04 0.02 0.02 0.15 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.77 0.78 0.2 0.08 0.0 0.21 0.06 0.13 0.04 0.05 0.04
0.06 0.07 0.0 1.0 0.16 0.13 0.09 0.09 0.1 0.12 0.1 0.06 0.05 0.05 0.07 0.06 0.13 0.02 0.03 0.46 0.06 0.07 0.0 0.02 0.28 0.13
0.34 0.0 0.0 0.71 0.02 0.11 0.14 0.02 0.02 0.22 0.03 0.09 0.15 0.08 0.03 1.0 0.51 0.3 0.09 0.1 0.41 0.19 0.3 0.3 0.36 0.45
0.12 0.0 0.0 0.61 0.12 0.44 0.16 0.11 0.35 0.0 0.25 0.32 0.18 0.28 0.17 0.9 1.0 0.18 0.26 0.15 0.24 0.0 0.17 0.01 0.16 0.33
0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.07 0.13 0.07 0.19 0.11 0.09 0.03 0.13 0.25 0.03 0.48 0.24 0.25 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.08 0.0 0.0
0.04 0.08 0.0 1.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.15 0.11 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.19 0.64
0.0 0.18 0.0 0.59 0.18 0.13 0.21 0.21 0.08 0.57 0.32 0.17 0.15 0.2 0.07 1.0 0.37 0.55 0.12 0.27 0.32 0.25 0.31 0.16 0.16 0.11
0.0 0.0 0.0 0.57 0.04 0.18 0.11 0.03 0.15 0.27 0.13 0.11 0.11 0.07 0.04 0.96 1.0 0.3 0.0 0.51 0.1 0.12 0.22 0.2 0.14 0.17
0.03 0.06 0.0 0.78 0.1 0.16 0.17 0.02 0.13 0.35 0.13 0.09 0.15 0.11 0.04 1.0 0.7 0.26 0.13 0.26 0.24 0.14 0.3 0.14 0.07 0.1
0.05 0.04 0.0 1.0 0.11 0.06 0.17 0.07 0.06 0.51 0.21 0.01 0.06 0.04 0.1 0.77 0.27 0.21 0.17 0.09 0.67 0.0 0.11 0.17 0.06 0.08
0.0 0.0 0.0 0.8 0.06 0.06 0.15 0.03 0.06 0.0 0.09 0.15 0.23 0.06 0.03 0.0 0.8 0.42 0.63 0.36 0.29 1.0 0.0 0.65 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.35 0.0 0.03 0.06 0.05 0.05 1.0 0.19 0.59 0.29 0.33 0.81 0.0 0.19 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.46 0.22 0.0 0.09 0.07 0.2 0.0 0.16 0.16 0.0 0.0
0.06 0.03 0.0 1.0 0.1 0.19 0.11 0.06 0.15 0.14 0.11 0.13 0.11 0.06 0.1 0.16 0.15 0.34 0.05 0.03 0.26 0.25 0.37 0.13 0.15 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)