Heatmap: Cluster_121 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000001.1_cds_GFH05538.1_15 (GFH05538)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.05	0.08	0.0	0.0	0.04	0.04	0.05	0.04	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.94
lcl\|BLLF01000005.1_cds_GFH05675.1_152 (GFH05675)	0.06	0.0	0.0	0.13	0.13	0.13	0.28	0.06	0.48	0.28	0.1	0.06	0.11	0.11	0.15	0.65	0.36	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.85	1.0
lcl\|BLLF01000053.1_cds_GFH06730.1_1207 (GFH06730)	0.02	0.0	0.0	0.03	0.14	0.12	0.11	0.09	0.07	0.16	0.08	0.05	0.06	0.03	0.1	0.19	0.06	0.0	0.09	0.1	0.04	0.0	0.06	0.05	1.0	0.55
lcl\|BLLF01000056.1_cds_GFH06788.1_1265 (GFH06788)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.2	0.12	0.14	0.27	0.85	0.09	0.13	0.17	0.13	0.24	0.62	0.42	0.08	0.0	0.03	0.17	0.0	0.16	0.15	1.0	0.73
lcl\|BLLF01000102.1_cds_GFH07546.1_2023 (GFH07546)	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1	0.11	0.02	0.11	1.0	0.08	0.04	0.04	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.49
lcl\|BLLF01000140.1_cds_GFH08139.1_2616 (GFH08139)	0.09	0.0	0.0	0.58	0.08	0.26	0.04	0.07	0.27	0.5	0.24	0.04	0.04	0.19	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	1.0
lcl\|BLLF01000140.1_cds_GFH08140.1_2617 (GFH08140)	0.13	0.0	0.0	0.21	0.05	0.18	0.19	0.02	0.1	0.23	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	1.0
lcl\|BLLF01000169.1_cds_GFH08579.1_3056 (GFH08579)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.12	0.16	0.05	0.09	0.17	0.09	0.24	0.1	0.07	0.06	0.25	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.14	1.0	0.9
lcl\|BLLF01000298.1_cds_GFH10234.1_4711 (GFH10234)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.07	0.06	0.03	0.0	0.0	0.13	0.15	0.12	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.53
lcl\|BLLF01000311.1_cds_GFH10383.1_4860 (GFH10383)	0.04	0.05	0.06	0.68	0.03	0.04	0.02	0.09	0.03	0.15	0.03	0.01	0.01	0.07	0.01	0.1	0.0	0.0	0.03	0.14	0.03	0.01	0.02	0.0	0.53	1.0
lcl\|BLLF01000363.1_cds_GFH10978.1_5455 (GFH10978)	0.24	0.13	0.0	0.03	0.38	0.36	0.33	0.35	0.37	0.72	0.28	0.37	0.31	0.21	0.37	0.81	0.64	0.3	0.09	0.28	0.17	0.32	0.23	0.33	1.0	1.0
lcl\|BLLF01000427.1_cds_GFH11696.1_6173 (GFH11696)	0.0	0.08	0.0	0.03	0.26	0.31	0.14	0.19	0.28	0.27	0.2	0.23	0.19	0.17	0.21	1.0	0.29	0.06	0.18	0.15	0.0	0.1	0.0	0.18	0.79	0.66
lcl\|BLLF01000474.1_cds_GFH12165.1_6642 (GFH12165)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.76
lcl\|BLLF01000476.1_cds_GFH12181.1_6658 (GFH12181)	0.13	0.08	0.06	0.01	0.03	0.06	0.04	0.04	0.04	0.19	0.03	0.13	0.03	0.03	0.04	0.37	0.11	0.05	0.08	0.12	0.07	0.1	0.04	0.03	1.0	0.8
lcl\|BLLF01000619.1_cds_GFH13495.1_7972 (GFH13495)	0.26	0.03	0.0	0.06	0.08	0.03	0.05	0.07	0.04	0.63	0.06	0.04	0.08	0.06	0.09	0.04	0.39	0.21	0.04	0.52	0.13	0.05	0.11	0.1	0.98	1.0
lcl\|BLLF01000668.1_cds_GFH13925.1_8402 (GFH13925)	0.27	0.01	0.03	0.03	0.29	0.25	0.17	0.31	0.19	0.32	0.34	0.26	0.19	0.29	0.18	0.4	0.23	0.1	0.06	0.11	0.12	0.05	0.09	0.08	1.0	0.96
lcl\|BLLF01000700.1_cds_GFH14208.1_8685 (GFH14208)	0.0	0.09	0.03	0.13	0.26	0.25	0.26	0.25	0.22	0.18	0.22	0.17	0.23	0.12	0.17	1.0	0.13	0.41	0.06	0.0	0.21	0.12	0.11	0.07	0.55	0.34
lcl\|BLLF01000797.1_cds_GFH15036.1_9513 (GFH15036)	0.02	0.15	0.0	0.17	0.16	0.2	0.33	0.03	0.29	0.21	0.14	0.16	0.31	0.07	0.18	0.08	0.17	0.18	0.26	0.1	0.08	0.09	0.47	0.09	0.87	1.0
lcl\|BLLF01000956.1_cds_GFH16164.1_10641 (GFH16164)	0.0	0.0	0.0	0.15	0.08	0.08	0.15	0.15	0.14	0.0	0.16	0.13	0.12	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.91	1.0
lcl\|BLLF01000959.1_cds_GFH16199.1_10676 (GFH16199)	0.03	0.41	0.21	0.05	0.3	0.42	0.35	0.25	0.4	0.12	0.33	0.35	0.27	0.3	0.25	0.43	0.32	0.27	0.05	0.13	0.32	0.14	0.35	0.32	0.91	1.0
lcl\|BLLF01001145.1_cds_GFH17422.1_11899 (GFH17422)	0.54	0.12	0.26	0.16	0.27	0.14	0.21	0.51	0.27	0.64	0.31	0.16	0.35	0.37	0.33	0.87	1.0	0.06	0.0	0.17	0.11	0.08	0.16	0.2	0.81	0.54
lcl\|BLLF01001160.1_cds_GFH17511.1_11988 (GFH17511)	0.01	0.0	0.0	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03	0.0	0.05	0.18	0.07	0.06	0.05	0.0	0.43	1.0
lcl\|BLLF01001160.1_cds_GFH17512.1_11989 (GFH17512)	0.02	0.0	0.46	0.29	0.03	0.02	0.01	0.0	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.05	0.02	0.02	0.19	0.08	0.06	0.01	0.0	0.29	1.0
lcl\|BLLF01001293.1_cds_GFH18383.1_12860 (GFH18383)	0.0	0.0	0.0	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	1.0
lcl\|BLLF01001457.1_cds_GFH19402.1_13879 (GFH19402)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.1	0.18	0.16	0.02	0.17	0.12	0.1	0.15	0.07	0.03	0.16	0.49	0.36	0.13	0.06	0.25	0.12	0.07	0.08	0.06	1.0	0.6
lcl\|BLLF01001489.1_cds_GFH19601.1_14078 (GFH19601)	0.06	0.01	1.0	0.02	0.3	0.06	0.02	0.08	0.04	0.05	0.17	0.03	0.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.09	0.0	0.31	0.08	0.0	0.03	0.0	0.06	0.53
lcl\|BLLF01001610.1_cds_GFH20295.1_14772 (GFH20295)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.1	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34
lcl\|BLLF01001781.1_cds_GFH21212.1_15689 (GFH21212)	0.04	0.17	0.0	0.0	0.14	0.24	0.19	0.1	0.14	0.0	0.19	0.21	0.16	0.15	0.09	0.24	0.23	0.06	0.18	0.38	0.24	0.0	0.23	0.04	0.73	1.0
lcl\|BLLF01001887.1_cds_GFH21701.1_16178 (GFH21701)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.15	0.26	0.05	0.27	0.89	0.06	0.09	0.29	0.05	0.13	0.02	0.0	0.03	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.82	1.0
lcl\|BLLF01001887.1_cds_GFH21702.1_16179 (GFH21702)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.17	0.24	0.0	0.21	1.0	0.08	0.13	0.3	0.01	0.12	0.09	0.12	0.13	0.0	0.0	0.16	0.0	0.08	0.0	0.27	0.83
lcl\|BLLF01001891.1_cds_GFH21718.1_16195 (GFH21718)	0.1	0.22	0.0	0.0	0.11	0.14	0.19	0.07	0.17	0.05	0.24	0.28	0.34	0.11	0.16	0.06	0.13	0.24	0.0	0.04	0.19	0.27	0.24	0.09	0.76	1.0
lcl\|BLLF01001909.1_cds_GFH21809.1_16286 (GFH21809)	0.03	0.29	0.0	0.17	0.17	0.22	0.29	0.2	0.43	0.23	0.18	0.26	0.23	0.2	0.38	0.86	0.3	0.09	0.02	0.07	0.11	0.07	0.12	0.14	0.99	1.0
lcl\|BLLF01001994.1_cds_GFH22224.1_16701 (GFH22224)	0.32	0.02	0.0	0.0	0.05	0.19	0.16	0.11	0.14	0.0	0.18	0.12	0.13	0.22	0.02	0.0	0.0	0.09	0.0	0.39	0.14	0.58	0.19	0.01	1.0	0.82
lcl\|BLLF01002001.1_cds_GFH22261.1_16738 (GFH22261)	0.03	0.02	0.0	0.09	0.1	0.14	0.27	0.1	0.29	0.1	0.14	0.23	0.13	0.1	0.18	0.38	0.35	0.07	0.11	0.22	0.2	0.18	0.18	0.08	0.43	1.0
lcl\|BLLF01002002.1_cds_GFH22264.1_16741 (GFH22264)	0.04	0.18	0.0	0.02	0.22	0.27	0.18	0.26	0.18	1.0	0.22	0.2	0.16	0.2	0.14	0.16	0.09	0.12	0.02	0.06	0.09	0.08	0.09	0.07	0.48	0.75
lcl\|BLLF01002013.1_cds_GFH22316.1_16793 (GFH22316)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.16	0.33	0.3	0.08	0.44	1.0	0.29	0.22	0.29	0.14	0.31	0.25	0.13	0.17	0.08	0.05	0.3	0.0	0.06	0.14	0.84	0.8
lcl\|BLLF01002019.1_cds_GFH22344.1_16821 (GFH22344)	0.02	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.03	0.03	0.03	0.36	0.01	0.0	0.04	0.0	0.01	0.08	0.0	0.07	0.0	0.0	0.18	0.0	0.07	0.0	0.5	1.0
lcl\|BLLF01002019.1_cds_GFH22345.1_16822 (GFH22345)	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.03	0.0	0.06	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	1.0
lcl\|BLLF01002211.1_cds_GFH23187.1_17664 (GFH23187)	0.31	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.03	0.03	0.02	0.26	0.07	0.09	0.12	0.12	0.01	0.1	0.3	0.04	0.43	0.32	0.08	0.03	0.04	0.07	0.95	1.0
lcl\|BLLF01002328.1_cds_GFH23666.1_18143 (GFH23666)	0.14	0.06	0.06	0.0	0.06	0.15	0.13	0.09	0.11	1.0	0.18	0.17	0.28	0.26	0.13	0.12	0.19	0.09	0.03	0.05	0.1	0.09	0.13	0.04	0.68	0.94
lcl\|BLLF01002507.1_cds_GFH24339.1_18816 (GFH24339)	0.02	0.05	0.0	0.04	0.19	0.22	0.21	0.14	0.23	0.02	0.2	0.2	0.21	0.15	0.14	0.08	0.04	0.05	0.23	0.1	0.06	0.04	0.06	0.02	0.94	1.0
lcl\|BLLF01002537.1_cds_GFH24442.1_18919 (GFH24442)	0.0	0.0	0.0	0.37	0.04	0.04	0.11	0.11	0.12	0.0	0.1	0.19	0.18	0.17	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.92	1.0
lcl\|BLLF01002785.1_cds_GFH25340.1_19817 (GFH25340)	0.0	0.0	0.0	0.53	0.03	0.02	0.02	0.0	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.12	0.04	0.16	0.07	0.13	0.06	0.04	0.02	0.63	1.0
lcl\|BLLF01002785.1_cds_GFH25341.1_19818 (GFH25341)	0.02	0.01	0.0	0.6	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.03	0.09	0.11	0.03	0.03	0.04	0.0	0.38	1.0
lcl\|BLLF01002871.1_cds_GFH25636.1_20113 (GFH25636)	0.13	0.0	0.0	0.08	0.27	0.28	0.29	0.18	0.33	0.42	0.23	0.24	0.19	0.27	0.12	0.41	0.35	0.14	0.14	0.31	0.19	0.51	0.14	0.12	1.0	0.82
lcl\|BLLF01003505.1_cds_GFH27520.1_21997 (GFH27520)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.05	0.09	0.03	0.08	1.0	0.11	0.02	0.14	0.04	0.11	0.18	0.16	0.03	0.1	0.12	0.07	0.0	0.1	0.0	0.69	0.75
lcl\|BLLF01003578.1_cds_GFH27692.1_22169 (GFH27692)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.13	0.16	0.08	0.08	0.14	0.39	0.07	0.12	0.09	0.1	0.09	0.17	0.14	0.24	0.07	0.2	0.18	0.08	0.12	0.11	1.0	0.93
lcl\|BLLF01003859.1_cds_GFH28400.1_22877 (GFH28400)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.23	0.24	0.17	0.14	0.22	1.0	0.19	0.23	0.22	0.15	0.2	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.69	0.67
lcl\|BLLF01003920.1_cds_GFH28529.1_23006 (GFH28529)	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.05	0.1	0.0	0.04	0.05	0.08	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.72
lcl\|BLLF01004472.1_cds_GFH29684.1_24161 (GFH29684)	0.1	0.0	0.0	0.0	0.07	0.12	0.21	0.02	0.26	1.0	0.07	0.1	0.26	0.02	0.11	0.02	0.03	0.01	0.11	0.16	0.01	0.04	0.01	0.03	0.5	0.78
lcl\|BLLF01004472.1_cds_GFH29685.1_24162 (GFH29685)	0.1	0.27	0.0	0.0	0.1	0.29	0.32	0.03	0.3	0.94	0.13	0.17	0.34	0.02	0.12	0.02	0.03	0.06	0.02	0.09	0.07	0.07	0.07	0.03	0.75	1.0
lcl\|BLLF01004725.1_cds_GFH30140.1_24617 (GFH30140)	0.0	0.0	0.0	0.19	0.03	0.06	0.23	0.0	0.17	0.0	0.04	0.07	0.03	0.02	0.11	0.15	0.11	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.11	0.04	0.4	1.0
lcl\|BLLF01005005.1_cds_GFH30589.1_25066 (GFH30589)	0.15	0.0	0.0	0.18	0.18	0.17	0.15	0.0	0.28	0.38	0.06	0.35	0.06	0.17	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.62
lcl\|BLLF01005224.1_cds_GFH30903.1_25380 (GFH30903)	0.08	0.12	0.0	0.09	0.29	0.32	0.26	0.11	0.15	0.84	0.13	0.09	0.11	0.09	0.19	0.0	0.09	0.16	0.0	0.41	0.37	0.0	0.21	0.01	1.0	0.97
lcl\|BLLF01005529.1_cds_GFH31318.1_25795 (GFH31318)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.26	0.16	0.16	0.28	0.2	0.64	0.17	0.12	0.09	0.12	0.16	0.8	0.19	0.04	0.0	0.02	0.03	0.02	0.05	0.09	0.79	1.0
lcl\|BLLF01005751.1_cds_GFH31591.1_26068 (GFH31591)	0.2	0.0	0.89	0.36	0.12	0.04	0.01	0.0	0.02	0.07	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.14	0.17	0.03	0.0	0.01	0.0	0.22	1.0
lcl\|BLLF01005783.1_cds_GFH31627.1_26104 (GFH31627)	0.12	0.07	0.15	0.15	0.13	0.18	0.2	0.2	0.19	0.12	0.17	0.24	0.15	0.21	0.2	0.4	0.21	0.16	0.06	0.38	0.14	0.31	0.14	0.19	0.49	1.0
lcl\|BLLF01005809.1_cds_GFH31659.1_26136 (GFH31659)	0.39	0.13	0.0	0.0	0.3	0.25	0.28	0.49	0.36	0.78	0.32	0.24	0.32	0.34	0.36	1.0	0.54	0.14	0.03	0.25	0.16	0.15	0.1	0.33	0.78	0.62
lcl\|BLLF01007027.1_cds_GFH32719.1_27196 (GFH32719)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.17	0.12	0.09	0.22	0.12	0.23	0.2	0.16	0.14	0.1	0.13	0.0	0.17	0.2	0.23	0.11	0.39	0.12	0.18	0.04	1.0	0.72
lcl\|BLLF01008939.1_cds_GFH33569.1_28046 (GFH33569)	0.12	0.14	0.02	0.12	0.08	0.1	0.16	0.09	0.08	0.06	0.07	0.35	0.13	0.09	0.12	0.56	0.21	0.0	0.05	0.19	0.04	0.27	0.0	0.12	0.69	1.0
lcl\|BLLF01009086.1_cds_GFH33610.1_28087 (GFH33610)	0.0	0.0	0.0	0.11	0.11	0.25	0.15	0.03	0.24	0.0	0.04	0.14	0.08	0.06	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.54
lcl\|BLLF01009233.1_cds_GFH33659.1_28136 (GFH33659)	0.08	0.08	0.0	0.0	0.23	0.28	0.2	0.17	0.14	0.24	0.2	0.19	0.18	0.19	0.09	0.56	0.16	0.17	0.0	0.07	0.24	0.0	0.34	0.19	1.0	0.91

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)