Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
4.76 0.0 0.0 8.97 2.01 17.8 3.11 11.93 0.95 0.0 9.09 12.91 12.37 10.43 0.94 0.0 13.52 7.11 10.67 6.05 9.82 11.27 35.3 9.07 4.92 5.01
0.0 0.0 0.0 20.7 6.89 3.43 0.0 0.0 26.48 0.0 7.45 6.77 7.68 9.23 13.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19.35 11.35 5.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.17 11.04 19.67 0.0 12.94 8.02 4.26 8.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.19 13.48 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.1 0.0 6.07 0.0 3.16 3.12 3.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.24 3.32 0.0 7.45 6.79 10.84 3.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 2.24 1.71 2.88 0.73 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 5.39 0.0 0.0 7.43 0.0 0.0 1.81 0.0 2.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 1.19 1.26 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 1.58 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 1.96 5.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.79 0.0 5.94
0.0 0.0 0.0 1.83 0.0 0.0 0.6 0.54 2.33 3.94 0.0 0.0 1.26 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 28.14 0.0 6.67 32.16 19.64 20.03 27.92 13.2 0.0 40.58 26.54 41.71 19.0 32.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.04 0.0 0.0 15.58 22.6 5.09
6.14 0.0 0.0 11.57 24.49 11.62 14.35 12.62 22.21 8.32 21.57 11.41 19.84 15.06 27.03 0.0 0.0 27.52 0.0 0.0 0.0 14.54 0.0 24.31 12.69 6.44
5.77 0.0 0.0 24.55 12.47 31.33 9.02 10.06 11.6 15.65 18.98 10.79 9.6 15.18 11.57 11.06 8.21 17.26 0.0 7.34 0.0 0.0 25.71 12.42 9.95 16.14
0.0 0.0 0.0 0.0 2.63 2.59 21.68 19.17 35.03 0.0 21.64 10.25 20.56 20.68 14.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 37.71 21.43 17.36
0.0 0.0 0.0 0.51 0.4 0.22 0.22 0.21 0.22 0.0 0.06 0.11 0.3 0.17 0.16 0.0 0.38 0.4 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.28 0.19 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.4 8.27 7.58 4.02 0.0 4.18 4.1 18.02 8.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.89 6.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.9 0.0 0.0 0.0 0.0 11.53 0.0 3.87 3.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.43 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 9.57 18.17 15.33 1.61 8.35 5.62 10.83 5.19 13.5 7.1 4.2 0.0 0.0 0.0 0.0 5.27 8.56 0.0 0.0 1.64 8.58 21.69
0.0 0.0 0.0 16.2 35.13 64.7 25.11 39.92 59.55 0.0 54.22 45.52 27.77 28.19 33.5 0.0 18.32 19.27 0.0 0.0 0.0 30.52 0.0 15.9 35.52 53.95
0.0 1.88 0.0 7.7 3.15 3.41 5.56 4.07 7.8 7.38 4.1 4.12 5.57 3.27 3.55 0.0 7.0 4.18 6.1 1.73 2.81 1.69 3.03 2.82 2.81 2.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.85 0.0 3.62 0.0 0.0 3.89 7.7 4.17 0.0 3.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.43 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.03 0.08 0.02 0.08 0.17 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 10.12 13.46 7.14 2.97 22.56 0.0 21.75 3.29 6.97 15.99 3.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.97 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.13 0.19 0.24 0.0 0.19 0.0 0.13 0.07 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 24.24 0.49 2.16 10.49 5.07 0.0 24.26 37.73 10.2 2.47 25.01 0.0 0.0 0.0 0.0 16.94 0.0 63.17 0.0 1.55 5.98 9.34
0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 1.44 0.0 1.38 0.0 0.0 0.0 0.0 1.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 13.76 3.43 3.38 12.89 6.61 0.0 0.0 0.0 7.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.71
0.0 0.0 0.0 0.0 6.83 5.41 1.8 6.52 8.02 0.0 1.36 2.83 0.0 0.0 2.58 0.0 0.0 19.47 0.0 0.0 13.43 0.0 0.0 0.79 4.49 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.64 0.0 1.29 1.16 3.76 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 1.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 5.71 3.36 5.77 1.09 0.0 0.0 1.13 3.34 3.54 2.24 2.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.84 0.0 3.59 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.42 0.84 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.84 2.33 0.0 0.99 0.0 2.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.72 1.33 0.0 0.0 0.0 1.36 2.68 0.0 2.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.61 1.54 0.0 1.47 4.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 8.68 9.48 6.1 11.29 1.67 0.0 3.76 4.31 6.39 5.08 9.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.19 1.43 4.37
2.54 0.0 0.0 0.0 0.0 9.51 3.15 3.89 0.0 0.0 5.66 10.59 8.24 6.91 5.12 9.73 7.22 0.0 0.0 25.84 10.49 0.0 15.09 8.81 3.5 0.0
0.0 0.0 0.0 7.26 2.4 0.0 0.0 4.47 13.91 0.0 2.41 0.0 5.03 11.02 2.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.6 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 20.09 55.68 37.54 4.06 43.61 0.0 41.1 30.48 50.21 28.77 23.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 31.08
0.39 0.0 0.0 0.0 0.49 0.49 1.04 0.48 0.32 0.21 1.22 1.28 1.09 0.83 0.02 0.0 0.0 2.33 0.0 0.99 1.71 1.84 0.0 1.06 0.0 0.55
1.34 1.64 0.0 0.31 0.0 0.06 0.17 0.73 1.02 0.0 0.89 0.92 1.35 0.72 1.2 0.0 2.53 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 1.95 0.06 1.3 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 6.16 0.0 0.0 2.72 2.94 0.0 0.0 0.0 0.0 2.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.17 2.32 1.9 0.0 13.27 4.09 8.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.0 0.45 0.16 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 10.04 0.59 0.0 1.63 3.04 3.88 0.0 3.07 0.0 3.68 2.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 16.76 22.43 0.0 11.04 20.77 29.51 0.0 3.25 0.0 8.78 8.59 5.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.29 0.0 4.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.63 3.92 0.0 0.0 0.0 0.0 3.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.75 0.47 0.0 0.72 0.0 0.75 0.3 0.81 0.61 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0 1.82 0.0 0.0 0.0 0.09 0.49 0.5
0.24 0.0 0.0 0.0 0.21 1.28 0.51 0.84 0.0 0.0 0.64 0.1 0.12 0.42 0.29 0.93 0.69 0.0 0.0 1.23 2.0 0.0 2.88 1.16 1.0 0.34
5.42 0.0 0.0 0.0 6.86 4.57 6.1 2.19 8.71 0.0 2.45 1.12 1.35 3.26 2.17 0.0 0.0 0.0 0.0 6.89 0.0 0.0 0.0 2.45 7.47 5.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.49 0.0 0.0 0.0 0.0 3.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.0 2.8 1.45 0.0 0.0 0.0 0.16 0.8 2.18 2.16 0.0 4.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.35 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.04 0.0 0.0 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.19 0.11 0.08 0.13 0.03 0.17 0.05 0.13 0.08 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 10.4 10.46 10.65 3.33 16.53 0.0 4.01 6.76 15.02 6.48 6.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19.27 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 7.4 25.75 26.81 31.02 7.15 0.0 43.35 25.97 68.08 26.69 17.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.1 6.13 6.17
0.0 0.0 0.0 0.0 32.09 24.03 8.52 26.07 38.38 0.0 27.94 0.0 4.16 8.36 15.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.71
0.0 0.0 0.0 0.0 1.83 1.82 0.0 2.27 1.75 0.0 0.61 0.0 0.0 1.34 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 23.02 0.0 12.45 3.87 6.03 0.0 12.86 16.47 2.48 4.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.56 0.0 6.93
6.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.46 2.42 0.0 0.0 5.01 9.87 2.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.4 0.88 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.88 0.0 0.76 0.0 0.68 0.0 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.45 0.0 1.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 7.14 0.0 4.34 0.0 0.0 0.0 3.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.85 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)