Heatmap: Cluster_272 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000035.1_cds_GFH06367.1_844 (GFH06367)	0.3	0.11	0.81	0.18	0.29	0.31	0.25	0.34	0.17	0.11	0.33	0.26	0.32	0.34	0.16	0.7	1.0	0.66	0.2	0.59	0.63	0.3	0.52	0.39	0.51	0.26
lcl\|BLLF01000043.1_cds_GFH06528.1_1005 (GFH06528)	0.28	0.0	0.0	0.19	0.25	0.08	0.14	0.32	0.29	1.0	0.2	0.28	0.15	0.34	0.28	0.96	0.16	0.3	0.0	0.18	0.47	0.11	0.18	0.85	0.2	0.39
lcl\|BLLF01000114.1_cds_GFH07763.1_2240 (GFH07763)	0.45	0.25	0.65	0.11	0.11	0.17	0.11	0.06	0.12	0.79	0.12	0.09	0.07	0.07	0.08	1.0	0.48	0.58	0.07	0.5	0.63	0.21	0.63	0.49	0.13	0.15
lcl\|BLLF01000124.1_cds_GFH07911.1_2388 (GFH07911)	0.42	0.41	0.49	0.39	0.54	0.4	0.34	0.6	0.32	0.44	0.63	0.53	0.45	0.61	0.23	0.58	1.0	0.46	0.37	0.34	0.46	0.54	0.4	0.74	0.7	0.69
lcl\|BLLF01000186.1_cds_GFH08818.1_3295 (GFH08818)	1.0	0.0	0.72	0.39	0.09	0.05	0.07	0.11	0.12	0.07	0.07	0.08	0.1	0.09	0.16	0.14	0.26	0.19	0.13	0.26	0.29	0.37	0.15	0.42	0.22	0.17
lcl\|BLLF01000292.1_cds_GFH10165.1_4642 (GFH10165)	0.14	0.42	0.78	0.74	0.88	0.53	0.44	0.8	0.5	0.19	1.0	0.61	0.66	0.59	0.55	0.23	0.51	0.29	0.45	0.59	0.76	0.3	0.35	0.89	1.0	0.87
lcl\|BLLF01000332.1_cds_GFH10632.1_5109 (GFH10632)	0.86	0.24	0.93	0.28	0.56	0.37	0.34	0.34	0.44	0.29	0.51	0.35	0.4	0.39	0.4	0.62	1.0	0.51	0.33	0.6	0.53	0.44	0.52	0.59	0.48	0.38
lcl\|BLLF01000394.1_cds_GFH11343.1_5820 (GFH11343)	0.61	0.18	0.55	0.28	0.95	0.94	0.49	0.8	0.66	0.16	0.69	0.52	0.66	0.43	0.5	0.63	1.0	0.73	0.18	0.4	0.74	0.97	0.78	0.98	0.69	0.63
lcl\|BLLF01000435.1_cds_GFH11786.1_6263 (GFH11786)	0.03	0.0	0.73	0.0	0.7	0.59	0.55	0.45	0.53	0.08	0.42	0.61	0.4	0.51	0.44	0.23	0.25	0.0	0.27	0.61	0.0	0.0	0.27	0.66	0.54	1.0
lcl\|BLLF01000552.1_cds_GFH12900.1_7377 (GFH12900)	0.86	0.37	1.0	0.38	0.27	0.4	0.29	0.23	0.43	0.19	0.23	0.36	0.36	0.2	0.33	0.75	0.31	0.75	0.16	0.18	0.52	0.17	0.69	0.59	0.38	0.61
lcl\|BLLF01000639.1_cds_GFH13670.1_8147 (GFH13670)	0.25	0.31	1.0	0.27	0.7	0.54	0.42	0.42	0.33	0.68	0.6	0.52	0.31	0.52	0.2	0.72	0.84	0.66	0.28	0.34	0.66	0.76	0.5	0.53	0.55	0.65
lcl\|BLLF01000868.1_cds_GFH15560.1_10037 (GFH15560)	0.5	0.2	1.0	0.0	0.09	0.21	0.13	0.17	0.25	0.31	0.08	0.06	0.14	0.16	0.15	0.22	0.1	0.07	0.0	0.03	0.39	0.07	0.21	0.26	0.41	0.55
lcl\|BLLF01000909.1_cds_GFH15846.1_10323 (GFH15846)	0.43	0.44	0.63	0.54	0.51	0.45	0.44	0.72	0.48	1.0	0.53	0.41	0.44	0.57	0.41	0.79	0.81	0.8	0.55	0.47	0.78	0.74	0.76	0.67	0.27	0.28
lcl\|BLLF01000926.1_cds_GFH15959.1_10436 (GFH15959)	0.02	0.04	0.32	0.03	0.17	0.19	0.13	0.11	0.17	0.12	0.17	0.12	0.12	0.09	0.17	0.44	1.0	0.08	0.24	0.38	0.18	0.42	0.18	0.18	0.21	0.25
lcl\|BLLF01000943.1_cds_GFH16085.1_10562 (GFH16085)	0.86	0.08	1.0	0.61	0.28	0.26	0.26	0.14	0.16	0.41	0.18	0.15	0.23	0.14	0.17	0.43	0.57	0.31	0.36	0.33	0.47	0.23	0.29	0.34	0.24	0.17
lcl\|BLLF01000998.1_cds_GFH16438.1_10915 (GFH16438)	0.83	0.04	1.0	0.02	0.1	0.07	0.03	0.28	0.1	0.57	0.15	0.09	0.08	0.19	0.04	0.63	0.38	0.4	0.27	0.34	0.19	0.21	0.45	0.67	0.04	0.01
lcl\|BLLF01001219.1_cds_GFH17895.1_12372 (GFH17895)	0.3	0.46	0.62	0.34	0.83	0.93	0.71	0.32	0.69	0.07	1.0	0.72	0.51	0.46	0.38	0.3	0.75	0.65	0.22	0.53	0.55	0.97	0.92	0.88	0.62	0.62
lcl\|BLLF01001301.1_cds_GFH18437.1_12914 (GFH18437)	0.53	0.15	0.28	0.06	0.67	0.59	0.35	0.75	0.43	0.13	0.55	0.53	0.43	0.46	0.56	0.58	0.72	0.47	0.28	0.42	0.4	0.43	0.47	1.0	0.63	0.48
lcl\|BLLF01001360.1_cds_GFH18803.1_13280 (GFH18803)	1.0	0.35	0.87	0.1	0.69	0.57	0.52	0.64	0.54	0.29	0.61	0.52	0.51	0.57	0.44	0.66	0.75	0.43	0.33	0.46	0.45	0.81	0.62	0.78	0.69	0.58
lcl\|BLLF01001454.1_cds_GFH19389.1_13866 (GFH19389)	0.19	0.47	0.97	0.61	0.74	0.86	0.51	0.59	0.76	0.25	0.66	0.59	0.57	0.48	0.41	0.79	0.72	0.41	0.34	0.59	0.48	0.95	0.5	1.0	0.72	0.67
lcl\|BLLF01001506.1_cds_GFH19703.1_14180 (GFH19703)	0.24	0.35	0.31	0.4	0.26	0.17	0.2	0.44	0.36	1.0	0.26	0.22	0.29	0.34	0.4	0.49	0.44	0.43	0.05	0.13	0.36	0.08	0.3	0.68	0.55	0.41
lcl\|BLLF01001833.1_cds_GFH21460.1_15937 (GFH21460)	0.5	0.43	0.69	0.4	0.49	0.44	0.35	1.0	0.43	0.2	0.49	0.33	0.53	0.52	0.76	0.33	0.45	0.39	0.06	0.22	0.3	0.41	0.34	0.67	0.82	0.61
lcl\|BLLF01001847.1_cds_GFH21526.1_16003 (GFH21526)	0.55	0.0	0.48	0.0	0.31	0.22	0.3	0.11	0.32	0.15	0.3	0.2	0.13	0.11	0.15	0.95	1.0	0.13	0.39	0.53	0.32	0.42	0.23	0.4	0.56	0.4
lcl\|BLLF01001975.1_cds_GFH22129.1_16606 (GFH22129)	0.0	0.02	0.72	0.12	0.16	0.1	0.18	0.07	0.13	0.47	0.18	0.22	0.08	0.04	0.12	0.3	1.0	0.09	0.21	0.18	0.06	0.28	0.27	0.53	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001995.1_cds_GFH22228.1_16705 (GFH22228)	0.76	0.61	0.86	0.68	0.76	0.69	0.51	0.71	0.53	0.93	0.71	0.57	0.46	0.54	0.44	0.83	1.0	0.78	0.8	0.71	0.76	0.6	0.77	0.58	0.67	0.57
lcl\|BLLF01002029.1_cds_GFH22379.1_16856 (GFH22379)	0.29	0.05	0.39	0.07	0.39	0.2	0.13	0.07	0.14	0.0	0.31	0.17	0.09	0.05	0.14	0.44	1.0	0.16	0.09	0.52	0.13	0.4	0.06	0.1	0.25	0.52
lcl\|BLLF01002168.1_cds_GFH22989.1_17466 (GFH22989)	0.13	0.15	0.41	0.3	0.21	0.3	0.29	0.19	0.21	0.16	0.27	0.23	0.31	0.21	0.19	0.99	1.0	0.43	0.19	0.24	0.25	0.36	0.29	0.53	0.56	0.41
lcl\|BLLF01002285.1_cds_GFH23487.1_17964 (GFH23487)	0.04	0.0	0.67	0.2	0.38	0.2	0.19	0.17	0.22	0.14	0.36	0.21	0.23	0.17	0.2	0.6	1.0	0.16	0.35	0.23	0.48	0.31	0.19	0.48	0.47	0.27
lcl\|BLLF01002429.1_cds_GFH24049.1_18526 (GFH24049)	0.14	0.31	0.46	0.33	0.33	0.25	0.16	0.28	0.21	0.04	0.25	0.17	0.19	0.17	0.17	0.67	1.0	0.46	0.28	0.55	0.4	0.54	0.36	0.11	0.37	0.37
lcl\|BLLF01002431.1_cds_GFH24060.1_18537 (GFH24060)	0.26	0.42	0.98	0.27	0.56	0.52	0.47	0.5	0.49	0.69	0.5	0.35	0.58	0.44	0.51	0.84	1.0	0.63	0.36	0.31	0.65	0.92	0.57	0.61	0.61	0.6
lcl\|BLLF01002548.1_cds_GFH24485.1_18962 (GFH24485)	0.19	0.31	0.67	0.24	0.56	0.57	0.47	0.65	0.51	0.59	0.7	0.51	0.49	0.57	0.3	1.0	0.8	0.59	0.39	0.39	0.63	0.34	0.57	0.75	0.83	0.54
lcl\|BLLF01002550.1_cds_GFH24491.1_18968 (GFH24491)	0.31	0.17	0.23	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.09	0.36	0.04	0.05	0.05	0.05	0.07	1.0	0.7	0.11	0.04	0.07	0.09	0.24	0.27	0.4	0.3	0.22
lcl\|BLLF01002720.1_cds_GFH25106.1_19583 (GFH25106)	0.15	0.33	0.57	0.31	0.29	0.22	0.22	0.54	0.36	1.0	0.27	0.22	0.33	0.38	0.33	0.3	0.24	0.59	0.19	0.39	0.52	0.08	0.46	0.66	0.4	0.5
lcl\|BLLF01002850.1_cds_GFH25566.1_20043 (GFH25566)	0.0	0.15	0.06	0.87	0.59	0.52	0.3	0.6	0.41	0.0	0.52	0.55	0.42	0.46	0.32	0.67	1.0	0.27	0.34	0.26	0.15	0.57	0.21	0.85	0.74	0.71
lcl\|BLLF01002939.1_cds_GFH25862.1_20339 (GFH25862)	0.27	0.21	0.28	0.3	0.24	0.2	0.17	0.19	0.21	1.0	0.24	0.15	0.23	0.11	0.21	0.06	0.03	0.29	0.25	0.32	0.39	0.14	0.29	0.45	0.39	0.22
lcl\|BLLF01002941.1_cds_GFH25869.1_20346 (GFH25869)	0.27	0.09	0.77	0.69	0.49	0.8	0.58	0.72	1.0	0.7	0.6	0.65	0.63	0.52	0.67	0.17	0.22	0.5	0.15	0.37	0.37	0.21	0.57	0.61	0.4	0.92
lcl\|BLLF01003023.1_cds_GFH26106.1_20583 (GFH26106)	0.06	0.51	0.69	0.06	0.2	0.2	0.12	0.36	0.25	1.0	0.15	0.17	0.22	0.18	0.21	0.09	0.05	0.4	0.26	0.34	0.44	0.28	0.29	0.57	0.16	0.16
lcl\|BLLF01003031.1_cds_GFH26125.1_20602 (GFH26125)	0.74	0.28	1.0	0.05	0.41	0.36	0.27	0.46	0.35	0.26	0.37	0.41	0.33	0.31	0.35	0.46	0.64	0.48	0.25	0.37	0.52	0.25	0.42	0.56	0.45	0.49
lcl\|BLLF01003091.1_cds_GFH26317.1_20794 (GFH26317)	0.66	0.14	0.46	0.43	0.51	0.41	0.62	0.4	0.6	0.28	0.48	0.41	0.42	0.34	0.48	1.0	0.85	0.51	0.41	0.29	0.39	0.65	0.36	0.55	0.82	0.85
lcl\|BLLF01003447.1_cds_GFH27366.1_21843 (GFH27366)	0.11	0.06	0.23	0.23	0.16	0.12	0.17	0.15	0.18	0.05	0.17	0.12	0.14	0.14	0.14	0.41	1.0	0.16	0.13	0.14	0.15	0.35	0.16	0.33	0.12	0.13
lcl\|BLLF01003498.1_cds_GFH27502.1_21979 (GFH27502)	0.53	0.07	0.74	0.17	0.31	0.33	0.24	0.31	0.14	0.37	0.31	0.29	0.11	0.25	0.12	0.52	1.0	0.07	0.39	0.33	0.19	0.08	0.24	0.15	0.17	0.14
lcl\|BLLF01003546.1_cds_GFH27614.1_22091 (GFH27614)	0.32	0.03	0.44	0.26	0.12	0.07	0.06	0.13	0.07	0.04	0.13	0.11	0.09	0.18	0.09	1.0	0.37	0.26	0.2	0.11	0.54	0.07	0.26	0.51	0.13	0.1
lcl\|BLLF01003579.1_cds_GFH27694.1_22171 (GFH27694)	0.03	0.0	0.46	0.0	0.05	0.05	0.05	0.14	0.07	1.0	0.06	0.04	0.03	0.1	0.1	0.24	0.48	0.14	0.03	0.14	0.21	0.09	0.15	0.41	0.1	0.08
lcl\|BLLF01003596.1_cds_GFH27733.1_22210 (GFH27733)	0.46	0.42	0.42	0.39	0.26	0.28	0.36	0.18	0.24	0.44	0.29	0.28	0.34	0.18	0.19	1.0	0.83	0.44	0.21	0.25	0.39	0.53	0.42	0.67	0.47	0.53
lcl\|BLLF01003866.1_cds_GFH28414.1_22891 (GFH28414)	0.3	0.15	0.75	0.24	0.89	0.75	0.38	0.47	0.83	0.35	1.0	0.46	0.42	0.4	0.41	0.25	0.37	0.39	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.87	0.89	0.31
lcl\|BLLF01004335.1_cds_GFH29419.1_23896 (GFH29419)	0.65	0.14	1.0	0.1	0.59	0.53	0.41	0.78	0.55	0.19	0.59	0.61	0.33	0.54	0.34	0.31	0.42	0.71	0.81	0.31	0.63	0.72	0.49	0.52	0.43	0.35
lcl\|BLLF01004564.1_cds_GFH29858.1_24335 (GFH29858)	0.69	0.24	0.63	0.36	0.39	0.4	0.43	0.46	0.5	1.0	0.37	0.4	0.4	0.41	0.43	0.54	0.69	0.58	0.47	0.47	0.42	0.79	0.42	0.87	0.34	0.25
lcl\|BLLF01004665.1_cds_GFH30033.1_24510 (GFH30033)	0.49	0.13	0.86	0.42	0.21	0.18	0.18	0.18	0.16	0.37	0.16	0.15	0.16	0.16	0.24	0.53	1.0	0.09	0.51	0.54	0.13	0.04	0.07	0.34	0.2	0.12
lcl\|BLLF01004735.1_cds_GFH30156.1_24633 (GFH30156)	0.31	0.35	0.75	0.31	0.83	0.75	0.81	0.96	0.81	0.28	0.88	0.67	0.58	0.74	0.52	0.3	0.22	0.35	0.23	0.59	0.37	0.31	0.38	1.0	0.89	0.87
lcl\|BLLF01004972.1_cds_GFH30538.1_25015 (GFH30538)	0.55	0.3	0.53	0.4	0.33	0.23	0.2	0.31	0.17	0.24	0.23	0.22	0.22	0.18	0.15	0.66	1.0	0.13	0.21	0.15	0.09	0.37	0.15	0.18	0.11	0.07
lcl\|BLLF01005046.1_cds_GFH30655.1_25132 (GFH30655)	1.0	0.26	0.58	0.57	0.2	0.15	0.11	0.16	0.18	0.25	0.14	0.18	0.18	0.13	0.12	0.64	0.5	0.38	0.18	0.47	0.46	0.49	0.44	0.42	0.4	0.25
lcl\|BLLF01005443.1_cds_GFH31206.1_25683 (GFH31206)	0.3	0.04	0.54	0.36	0.13	0.21	0.16	0.18	0.28	0.17	0.19	0.2	0.26	0.13	0.22	0.64	1.0	0.47	0.26	0.39	0.74	0.52	0.5	0.41	0.23	0.28
lcl\|BLLF01006119.1_cds_GFH31968.1_26445 (GFH31968)	0.76	0.67	0.85	0.79	0.66	0.62	0.35	0.53	0.39	0.7	0.48	0.38	0.27	0.39	0.33	0.89	0.73	0.91	0.78	0.85	0.95	0.73	1.0	0.72	0.47	0.47
lcl\|BLLF01006307.1_cds_GFH32148.1_26625 (GFH32148)	0.06	0.1	1.0	0.03	0.83	0.43	0.35	0.47	0.27	0.4	0.68	0.47	0.37	0.44	0.23	0.26	0.34	0.64	0.18	0.27	0.5	0.32	0.6	0.61	0.9	0.77
lcl\|BLLF01006517.1_cds_GFH32324.1_26801 (GFH32324)	0.73	0.13	0.89	1.0	0.27	0.36	0.24	0.06	0.3	0.17	0.22	0.16	0.14	0.12	0.17	0.18	0.14	0.29	0.14	0.18	0.43	0.49	0.33	0.35	0.18	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)