Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000016.1_cds_GFH05973.1_450 (GFH05973)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.31	0.42	0.17	0.38	0.38	0.09	0.45	0.39	0.13	0.39	0.07	0.13	0.06	0.1	0.0	0.15	0.41	0.08	1.0	0.74	0.41
lcl\|BLLF01000018.1_cds_GFH06004.1_481 (GFH06004)	0.33	0.45	0.3	0.57	0.6	0.36	0.39	0.65	0.37	0.62	0.5	0.34	0.32	0.39	0.45	0.88	0.96	0.61	0.32	0.38	0.53	0.56	0.59	1.0	0.86	0.46
lcl\|BLLF01000020.1_cds_GFH06043.1_520 (GFH06043)	0.35	0.05	0.04	0.18	0.35	0.51	0.83	0.19	0.82	0.45	0.47	0.52	0.52	0.29	0.8	0.55	0.48	0.38	0.3	0.26	0.43	0.37	0.47	1.0	0.71	0.71
lcl\|BLLF01000063.1_cds_GFH06926.1_1403 (GFH06926)	0.25	0.03	0.0	0.02	0.34	0.34	0.41	0.16	0.4	0.07	0.51	0.36	0.37	0.28	0.37	0.66	0.99	0.38	0.27	0.25	0.35	0.45	0.52	0.97	1.0	0.38
lcl\|BLLF01000083.1_cds_GFH07243.1_1720 (GFH07243)	0.16	0.03	0.14	0.22	0.23	0.18	0.24	0.04	0.14	0.15	0.11	0.32	0.16	0.02	0.18	0.33	0.45	0.01	0.02	0.12	0.01	0.41	0.04	0.87	1.0	0.15
lcl\|BLLF01000122.1_cds_GFH07878.1_2355 (GFH07878)	0.4	0.29	0.24	0.48	0.22	0.27	0.36	0.23	0.28	0.06	0.53	0.45	0.39	0.5	0.5	0.97	0.3	0.38	0.99	0.41	0.45	0.37	0.49	1.0	0.56	0.59
lcl\|BLLF01000138.1_cds_GFH08119.1_2596 (GFH08119)	0.23	0.45	0.48	0.29	0.47	0.43	0.35	0.3	0.25	0.05	0.4	0.44	0.34	0.37	0.23	1.0	0.85	0.21	0.59	0.31	0.24	0.82	0.36	0.98	0.25	0.21
lcl\|BLLF01000152.1_cds_GFH08301.1_2778 (GFH08301)	0.16	0.03	0.15	0.03	0.08	0.08	0.18	0.07	0.27	0.05	0.08	0.04	0.06	0.04	0.16	0.13	0.14	0.07	0.46	0.11	0.14	0.23	0.08	1.0	0.29	0.5
lcl\|BLLF01000152.1_cds_GFH08302.1_2779 (GFH08302)	0.17	0.02	0.01	0.16	0.19	0.18	0.23	0.06	0.42	0.02	0.16	0.16	0.09	0.04	0.3	0.16	0.29	0.03	0.82	0.14	0.07	0.34	0.06	1.0	0.52	0.63
lcl\|BLLF01000152.1_cds_GFH08303.1_2780 (GFH08303)	0.56	0.0	0.16	0.26	0.02	0.01	0.04	0.01	0.11	0.17	0.0	0.04	0.04	0.0	0.07	0.1	0.0	0.0	0.62	0.07	0.1	0.2	0.0	1.0	0.61	0.3
lcl\|BLLF01000167.1_cds_GFH08540.1_3017 (GFH08540)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.41
lcl\|BLLF01000217.1_cds_GFH09216.1_3693 (GFH09216)	0.72	0.42	0.19	0.53	0.43	0.33	0.32	0.32	0.38	0.64	0.36	0.3	0.27	0.27	0.36	0.82	0.9	0.31	0.36	0.22	0.27	0.33	0.26	1.0	0.76	0.48
lcl\|BLLF01000311.1_cds_GFH10393.1_4870 (GFH10393)	0.0	0.29	0.0	0.14	0.23	0.22	0.21	0.19	0.2	0.04	0.15	0.32	0.2	0.19	0.14	0.55	1.0	0.3	0.04	0.26	0.39	0.19	0.38	0.56	0.6	0.46
lcl\|BLLF01000330.1_cds_GFH10613.1_5090 (GFH10613)	0.03	0.04	0.12	0.42	0.22	0.17	0.28	0.08	0.33	0.28	0.24	0.22	0.19	0.09	0.43	0.32	0.26	0.31	0.48	0.27	0.26	0.34	0.19	1.0	0.58	0.21
lcl\|BLLF01000368.1_cds_GFH11030.1_5507 (GFH11030)	0.37	0.67	0.46	0.4	0.74	0.64	0.53	0.36	0.72	0.12	0.65	0.56	0.34	0.34	0.92	0.61	0.82	0.28	0.16	0.2	0.2	0.32	0.29	1.0	0.74	0.5
lcl\|BLLF01000432.1_cds_GFH11754.1_6231 (GFH11754)	0.1	0.12	0.0	0.14	0.28	0.32	0.48	0.14	0.44	0.28	0.45	0.35	0.45	0.25	0.61	0.58	1.0	0.23	0.34	0.75	0.12	0.45	0.23	0.74	0.4	0.18
lcl\|BLLF01000432.1_cds_GFH11755.1_6232 (GFH11755)	0.28	0.19	0.12	0.13	0.23	0.37	0.46	0.1	0.36	0.29	0.37	0.32	0.37	0.22	0.4	0.64	1.0	0.3	0.2	0.42	0.27	0.23	0.23	0.67	0.65	0.19
lcl\|BLLF01000443.1_cds_GFH11858.1_6335 (GFH11858)	0.13	0.0	0.18	0.08	0.22	0.42	0.48	0.35	0.41	0.19	0.12	0.26	0.28	0.13	0.16	0.81	1.0	0.09	0.07	0.08	0.18	0.37	0.23	0.91	0.24	0.29
lcl\|BLLF01000457.1_cds_GFH11997.1_6474 (GFH11997)	0.28	0.34	0.34	0.65	0.3	0.38	0.6	0.25	0.59	0.44	0.27	0.31	0.36	0.25	0.68	0.94	0.94	0.45	0.26	0.28	0.48	0.36	0.57	1.0	0.78	0.81
lcl\|BLLF01000472.1_cds_GFH12139.1_6616 (GFH12139)	0.37	0.0	0.0	0.39	0.52	0.57	0.65	0.28	0.74	0.42	0.53	0.4	0.32	0.29	0.83	0.44	0.44	0.17	0.52	0.15	0.56	0.27	0.4	1.0	0.97	0.4
lcl\|BLLF01000505.1_cds_GFH12456.1_6933 (GFH12456)	0.42	0.03	0.04	0.21	0.27	0.55	0.71	0.1	0.55	0.32	0.26	0.46	0.43	0.13	0.45	0.98	0.9	0.06	0.35	0.48	0.15	0.75	0.17	1.0	0.87	0.71
lcl\|BLLF01000544.1_cds_GFH12830.1_7307 (GFH12830)	0.12	0.06	0.01	0.02	0.09	0.07	0.25	0.05	0.68	0.14	0.08	0.06	0.1	0.05	0.33	0.24	0.2	0.11	0.29	0.09	0.09	0.09	0.11	1.0	0.6	0.5
lcl\|BLLF01000636.1_cds_GFH13656.1_8133 (GFH13656)	0.2	0.21	0.0	0.33	0.46	0.32	0.35	0.19	0.51	0.48	0.42	0.34	0.35	0.23	0.47	0.85	1.0	0.55	0.22	0.25	0.38	0.23	0.57	0.95	0.88	0.47
lcl\|BLLF01000657.1_cds_GFH13837.1_8314 (GFH13837)	0.1	0.08	0.0	0.07	0.1	0.11	0.3	0.17	0.41	0.59	0.05	0.23	0.26	0.06	0.45	0.24	0.43	0.16	0.41	0.27	0.19	0.51	0.25	1.0	0.25	0.12
lcl\|BLLF01000800.1_cds_GFH15053.1_9530 (GFH15053)	0.44	0.2	0.04	0.07	0.45	0.48	0.54	0.29	0.52	0.36	0.51	0.43	0.45	0.43	0.54	1.0	0.67	0.49	0.53	0.62	0.64	0.39	0.57	0.79	0.64	0.65
lcl\|BLLF01000910.1_cds_GFH15854.1_10331 (GFH15854)	0.0	0.0	0.0	0.17	0.28	0.26	0.24	0.07	0.15	0.15	0.23	0.11	0.17	0.15	0.22	0.52	1.0	0.16	0.0	0.0	0.11	0.13	0.16	0.52	0.48	0.32
lcl\|BLLF01000938.1_cds_GFH16058.1_10535 (GFH16058)	0.84	0.53	0.02	0.35	0.48	0.37	0.57	0.6	0.48	0.39	0.41	0.4	0.32	0.38	0.41	0.64	1.0	0.23	0.37	0.04	0.28	0.45	0.38	0.95	0.77	0.51
lcl\|BLLF01000950.1_cds_GFH16127.1_10604 (GFH16127)	0.16	0.04	0.16	0.3	0.13	0.13	0.59	0.14	1.0	0.22	0.22	0.19	0.4	0.16	0.66	0.34	0.9	0.04	0.18	0.03	0.03	0.03	0.1	0.92	0.65	0.37
lcl\|BLLF01001081.1_cds_GFH16995.1_11472 (GFH16995)	0.25	0.08	0.04	0.21	0.22	0.43	0.6	0.23	0.46	0.26	0.17	0.46	0.39	0.28	0.51	0.55	0.5	0.1	0.23	0.19	0.11	0.52	0.23	1.0	0.87	0.37
lcl\|BLLF01001108.1_cds_GFH17177.1_11654 (GFH17177)	0.25	0.09	0.41	0.54	0.3	0.41	0.65	0.28	0.64	0.36	0.43	0.39	0.48	0.42	0.59	1.0	0.94	0.68	0.22	0.16	0.77	0.23	0.72	1.0	0.8	0.71
lcl\|BLLF01001160.1_cds_GFH17518.1_11995 (GFH17518)	0.58	0.17	0.11	0.53	0.41	0.28	0.52	0.45	0.61	0.43	0.62	0.48	0.52	0.43	0.92	1.0	0.78	0.62	0.74	0.32	0.6	0.44	0.53	0.93	0.5	0.42
lcl\|BLLF01001219.1_cds_GFH17898.1_12375 (GFH17898)	0.07	0.0	0.0	0.02	0.07	0.05	0.16	0.04	0.45	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.2	0.09	0.06	0.08	0.39	0.07	0.05	0.1	0.11	1.0	0.44	0.22
lcl\|BLLF01001220.1_cds_GFH17904.1_12381 (GFH17904)	0.26	0.39	0.0	0.13	0.3	0.29	0.33	0.19	0.31	0.24	0.27	0.3	0.38	0.14	0.35	0.9	0.76	0.59	0.32	0.4	0.47	0.4	0.66	0.74	1.0	0.48
lcl\|BLLF01001243.1_cds_GFH18059.1_12536 (GFH18059)	0.13	0.0	0.02	0.04	0.19	0.23	0.3	0.15	0.14	0.07	0.09	0.2	0.25	0.12	0.21	0.4	1.0	0.14	0.16	0.18	0.09	0.17	0.15	0.36	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001299.1_cds_GFH18427.1_12904 (GFH18427)	0.14	0.0	0.0	0.34	0.27	0.51	0.66	0.13	0.61	0.33	0.33	0.38	0.48	0.37	1.0	0.33	0.31	0.51	0.23	0.22	0.57	0.0	0.56	0.63	0.48	0.28
lcl\|BLLF01001316.1_cds_GFH18542.1_13019 (GFH18542)	0.68	0.35	0.06	0.59	0.47	0.44	0.65	0.48	0.59	0.51	0.43	0.44	0.38	0.41	0.49	0.77	1.0	0.16	0.12	0.33	0.17	0.4	0.17	0.91	0.78	0.55
lcl\|BLLF01001386.1_cds_GFH18964.1_13441 (GFH18964)	0.03	0.0	0.0	0.36	0.19	0.17	0.28	0.08	0.45	0.07	0.17	0.24	0.11	0.14	0.41	0.2	0.22	0.0	0.12	0.0	0.0	0.12	0.16	0.84	1.0	0.42
lcl\|BLLF01001514.1_cds_GFH19742.1_14219 (GFH19742)	0.25	0.0	0.0	0.37	0.25	0.49	0.54	0.29	0.82	0.11	0.25	0.21	0.47	0.18	1.0	0.32	0.59	0.5	0.37	0.21	0.86	0.39	0.62	0.4	0.29	0.17
lcl\|BLLF01001560.1_cds_GFH20019.1_14496 (GFH20019)	0.22	0.13	0.34	0.22	0.21	0.39	0.35	0.15	0.13	0.02	0.16	0.32	0.28	0.16	0.19	0.61	1.0	0.12	0.32	0.27	0.1	0.65	0.18	0.73	0.11	0.08
lcl\|BLLF01001753.1_cds_GFH21051.1_15528 (GFH21051)	0.19	0.17	0.02	0.32	0.13	0.37	0.46	0.16	0.57	0.27	0.18	0.16	0.28	0.21	0.22	0.84	0.4	0.1	0.16	0.06	0.07	0.45	0.17	1.0	0.31	0.37
lcl\|BLLF01001803.1_cds_GFH21310.1_15787 (GFH21310)	0.05	0.08	0.0	0.22	0.29	0.49	0.61	0.23	0.52	0.34	0.29	0.37	0.4	0.18	0.31	0.67	0.78	0.15	0.22	0.32	0.26	1.0	0.37	0.76	0.51	0.4
lcl\|BLLF01002007.1_cds_GFH22285.1_16762 (GFH22285)	0.15	0.12	0.22	0.13	0.23	0.38	0.34	0.18	0.3	0.1	0.33	0.35	0.4	0.29	0.38	0.65	0.73	0.28	0.29	0.11	0.25	0.2	0.36	1.0	0.64	0.42
lcl\|BLLF01002185.1_cds_GFH23063.1_17540 (GFH23063)	0.0	0.0	0.0	0.18	0.08	0.08	0.16	0.06	0.15	0.02	0.01	0.15	0.14	0.05	0.27	0.03	0.0	0.02	0.1	0.1	0.0	0.98	0.02	0.77	1.0	0.27
lcl\|BLLF01002329.1_cds_GFH23667.1_18144 (GFH23667)	0.41	0.06	0.31	0.44	0.3	0.28	0.44	0.26	0.55	0.19	0.32	0.31	0.38	0.33	0.57	0.33	0.57	0.34	0.15	0.15	0.3	0.24	0.28	1.0	0.72	0.42
lcl\|BLLF01002542.1_cds_GFH24459.1_18936 (GFH24459)	0.04	0.04	0.0	0.17	0.22	0.14	0.23	0.11	0.36	0.0	0.1	0.14	0.07	0.05	0.22	0.22	0.06	0.12	0.14	0.11	0.25	0.15	0.07	1.0	0.36	0.34
lcl\|BLLF01002544.1_cds_GFH24466.1_18943 (GFH24466)	0.03	0.22	0.0	0.0	0.1	0.15	0.19	0.12	0.23	0.07	0.1	0.21	0.43	0.09	0.41	0.18	1.0	0.2	0.21	0.27	0.36	0.31	0.22	0.61	0.41	0.23
lcl\|BLLF01002603.1_cds_GFH24675.1_19152 (GFH24675)	0.06	0.0	0.0	0.21	0.24	0.26	0.77	0.1	1.0	0.08	0.38	0.36	0.42	0.21	0.85	0.7	0.26	0.14	0.88	0.12	0.06	0.0	0.22	0.88	0.83	0.41
lcl\|BLLF01002747.1_cds_GFH25196.1_19673 (GFH25196)	0.45	0.17	0.0	0.3	0.39	0.48	0.57	0.34	0.48	0.39	0.44	0.35	0.53	0.45	0.49	1.0	0.74	0.57	0.21	0.36	0.69	0.22	0.56	0.73	0.57	0.93
lcl\|BLLF01002860.1_cds_GFH25601.1_20078 (GFH25601)	0.18	0.0	0.0	0.18	0.21	0.32	0.57	0.18	0.71	0.39	0.24	0.46	0.71	0.57	0.82	0.49	1.0	0.48	0.36	0.24	0.66	0.76	0.66	0.71	0.41	0.65
lcl\|BLLF01002919.1_cds_GFH25789.1_20266 (GFH25789)	0.14	0.01	0.0	0.32	0.28	0.49	0.64	0.26	0.37	0.05	0.23	0.39	0.35	0.16	0.31	0.54	1.0	0.29	0.18	0.12	0.2	0.12	0.21	0.92	0.59	0.46
lcl\|BLLF01003745.1_cds_GFH28106.1_22583 (GFH28106)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.04	0.1	0.21	0.12	0.28	0.48	0.12	0.09	0.2	0.17	0.36	0.15	0.61	0.23	0.23	0.13	0.42	0.12	0.64	1.0	0.24	0.31
lcl\|BLLF01003762.1_cds_GFH28152.1_22629 (GFH28152)	0.12	0.03	0.18	0.14	0.13	0.16	0.85	0.09	0.82	0.32	0.15	0.15	0.24	0.11	1.0	0.69	0.66	0.05	0.21	0.1	0.04	0.22	0.06	0.59	0.48	0.44
lcl\|BLLF01004055.1_cds_GFH28828.1_23305 (GFH28828)	0.27	0.07	0.24	0.32	0.18	0.26	0.33	0.15	0.09	0.03	0.11	0.17	0.27	0.14	0.17	0.57	1.0	0.14	0.16	0.18	0.13	0.17	0.14	0.42	0.1	0.11
lcl\|BLLF01004118.1_cds_GFH28955.1_23432 (GFH28955)	0.04	0.02	0.0	0.17	0.04	0.06	0.46	0.06	0.56	0.09	0.06	0.04	0.11	0.05	0.53	1.0	0.91	0.02	0.11	0.08	0.03	0.29	0.05	0.52	0.2	0.22
lcl\|BLLF01005003.1_cds_GFH30585.1_25062 (GFH30585)	0.65	0.41	0.49	0.57	0.61	0.49	0.53	0.63	0.95	0.31	0.53	0.44	0.57	0.49	0.93	0.72	0.52	0.58	0.94	0.55	0.6	0.37	0.82	0.87	1.0	0.67
lcl\|BLLF01006107.1_cds_GFH31952.1_26429 (GFH31952)	0.6	0.03	0.19	0.87	0.5	0.79	1.0	0.4	0.71	0.17	0.54	0.57	0.6	0.46	0.7	0.46	0.91	0.33	0.83	0.4	0.35	0.56	0.28	0.92	0.79	0.63
lcl\|BLLF01006394.1_cds_GFH32210.1_26687 (GFH32210)	0.24	0.03	0.0	0.03	0.03	0.02	0.14	0.03	0.21	0.05	0.04	0.05	0.07	0.03	0.14	0.42	1.0	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.25	0.08	0.04
lcl\|BLLF01006394.1_cds_GFH32211.1_26688 (GFH32211)	0.2	0.01	0.0	0.21	0.13	0.12	0.41	0.09	0.77	0.21	0.17	0.18	0.39	0.1	0.47	0.37	1.0	0.01	0.08	0.03	0.04	0.02	0.05	0.65	0.63	0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)