Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
- - - - -1.33 -2.31 -1.23 -0.44 -0.06 0.37 -0.21 - - -0.08 - - - 1.51 1.1 2.28 1.98 - - 1.64 1.39 -0.58
-0.26 -4.28 - -0.68 -0.11 -0.54 -0.27 0.03 0.45 -0.08 -0.35 -0.22 -0.08 -0.51 0.35 -0.31 0.04 0.45 0.81 0.81 0.26 0.25 0.3 0.77 0.35 -0.25
-0.08 -5.26 -2.9 0.34 -1.1 -1.08 -0.31 -2.07 0.28 -0.14 -0.43 -0.84 -0.42 -1.24 0.38 -0.54 0.57 1.06 0.48 -0.74 0.95 -0.35 1.04 0.96 0.61 0.32
-0.54 - - -0.8 -0.06 -0.59 0.69 -0.1 0.69 1.12 -1.16 -1.79 -0.28 -0.42 0.91 0.81 -1.62 1.04 0.62 -0.2 0.92 0.12 -0.56 0.95 -3.67 -1.33
1.35 -0.17 - -2.82 -0.76 -0.72 -0.67 -0.0 -0.21 1.69 -0.98 -1.08 -0.39 -0.53 -0.58 -2.48 -4.07 -0.03 -1.18 0.8 0.25 -0.5 0.44 1.25 1.06 0.36
-2.69 -1.53 - -1.95 -0.02 -0.17 -0.16 -0.38 -0.35 1.07 0.36 -0.25 0.04 -0.13 -0.17 0.24 -0.02 1.06 -0.3 0.74 0.98 -0.57 0.65 0.49 -0.35 -0.44
-0.96 -0.18 -0.83 -1.42 -0.17 -0.35 -0.33 0.12 -0.23 -0.36 -0.0 -0.42 -0.09 0.01 -0.3 0.88 1.02 0.15 -0.2 0.68 0.34 -0.81 0.14 0.68 0.07 -0.07
0.05 -2.96 - 0.3 0.69 -0.02 -0.09 0.61 0.02 -0.59 0.42 -0.48 -1.02 -0.17 0.5 - 0.75 -1.98 -1.45 1.05 0.01 -0.23 0.54 0.83 0.71 -0.13
-4.42 -0.11 -1.4 -1.85 -1.32 -0.23 0.56 -0.42 0.75 1.4 -1.93 -0.61 -0.05 -0.86 0.56 0.24 0.52 -0.51 -0.25 1.33 -0.5 1.01 0.44 0.56 -2.08 -2.44
-0.92 -2.97 - -0.41 0.1 0.06 0.54 0.14 0.29 1.5 0.24 0.27 0.32 -0.12 0.71 -0.52 -0.43 -0.1 -2.1 -0.92 0.48 -1.02 0.01 -0.14 0.67 0.19
-0.21 -1.06 0.12 -1.55 -0.6 -0.29 0.2 -0.53 0.5 1.24 -0.67 -0.49 -0.23 -0.75 0.2 0.08 0.78 0.34 0.02 0.48 0.01 0.3 0.02 -0.14 -0.34 -0.35
-2.74 -3.61 - -2.2 -0.82 -1.6 -0.99 -0.77 0.6 -0.1 -1.45 0.26 0.62 -1.7 0.98 0.25 0.46 0.53 -1.11 1.44 -1.23 0.19 -1.29 1.19 1.49 0.55
0.2 - - 0.74 -0.42 -0.2 -0.44 0.01 0.17 1.41 -0.42 -0.33 -0.06 -0.45 -0.21 -0.73 0.4 0.22 0.33 0.44 0.06 -0.13 -0.01 0.65 -0.2 -0.22
0.18 - - -1.33 -0.12 -0.67 0.06 0.15 0.17 0.88 0.35 0.07 -0.15 0.15 0.19 0.16 0.95 0.39 0.5 0.38 -0.32 -0.53 0.3 0.09 -0.44 -0.46
-0.4 -2.48 - -0.11 0.33 -0.01 0.0 -0.31 -0.13 1.51 0.04 0.08 -0.15 -0.76 -0.6 -0.06 0.37 -0.24 0.17 1.0 0.22 -0.05 -0.25 0.67 -0.46 -0.84
-0.35 -5.49 0.4 0.19 0.21 0.28 -0.15 0.15 0.47 -1.87 -0.15 -0.38 -0.5 -0.26 -0.03 -2.37 -0.63 1.08 0.03 -0.15 0.74 -2.06 0.59 1.13 0.2 -0.21
-2.93 -4.0 - 0.79 -0.67 -0.28 -0.45 -0.66 0.58 -0.29 -0.64 -0.38 0.29 -0.8 0.87 -2.41 -3.1 0.43 0.69 1.63 0.11 -0.17 0.22 1.41 0.06 -0.52
-2.87 0.06 - 1.05 -4.13 -1.54 -0.93 -0.67 -1.38 1.15 -1.81 -1.33 -0.5 -2.55 -2.18 - -1.36 -0.29 1.3 0.48 2.63 -0.63 0.29 1.72 -2.41 -2.39
0.68 0.1 - -1.26 -0.19 -0.5 -0.81 -0.05 -0.12 0.4 -0.27 -0.34 -0.49 -0.48 -0.15 0.19 -0.32 0.35 -0.12 0.92 0.22 0.54 0.02 0.77 0.42 -0.14
0.0 -0.31 0.47 -1.26 0.31 -0.13 -0.45 -0.4 -0.54 -0.23 0.44 -0.13 -0.16 -0.27 -0.59 -0.18 -0.12 0.55 0.16 0.26 0.68 -1.93 0.69 0.6 0.36 -0.52
-0.94 -2.81 - -0.72 -0.09 -0.12 0.36 -1.63 0.42 0.89 0.13 -0.48 -0.64 -0.46 0.09 -0.57 -0.54 0.72 -0.76 -0.35 0.45 0.06 0.82 1.25 0.64 0.42
-0.04 - - -0.15 0.21 -0.01 -0.03 0.41 0.62 0.42 0.12 0.22 0.17 -0.26 0.18 0.22 0.24 -0.04 -0.14 -0.27 -0.11 -0.06 -0.58 0.67 0.39 -0.09
0.26 -2.44 - -0.33 0.11 0.08 0.21 -0.75 0.28 -1.11 -0.35 -0.78 -0.58 -0.75 -0.3 0.83 1.4 0.85 -2.09 -0.09 0.14 -0.94 0.41 0.59 0.76 0.34
0.01 -1.24 - -3.2 -0.26 -0.51 0.34 0.24 0.48 1.23 -0.23 -0.58 0.09 0.08 -0.33 0.4 0.56 0.51 0.95 -0.19 1.1 -0.29 -1.38 -0.1 -0.68 -1.47
0.42 -1.78 -1.7 -2.05 0.04 -0.29 0.29 -0.13 0.26 1.48 -0.16 -0.09 0.34 -0.55 0.07 -1.16 -0.9 -0.32 0.07 0.42 -0.41 -0.07 -0.31 0.82 0.45 0.26
0.13 -1.38 -0.53 0.04 -0.49 -0.22 -0.22 -1.2 -0.05 -0.88 -0.14 -0.23 -0.14 -0.47 -0.37 -0.84 0.05 0.85 -2.03 -0.26 1.22 -1.21 1.04 1.07 0.7 0.32
-1.04 -2.3 - -5.96 -0.24 -0.95 -0.4 0.19 0.1 -0.02 -0.6 -0.72 0.37 -0.39 0.55 0.73 0.72 0.55 -0.13 1.07 0.4 -0.8 0.34 0.94 0.46 -0.09
-0.93 -0.46 - -2.77 -0.18 -0.45 -0.46 0.36 0.02 0.53 -0.46 -0.62 -0.28 -0.11 -0.35 0.42 -0.84 0.43 0.59 0.75 1.27 0.19 0.83 0.91 -0.9 -1.24
-1.37 - - 0.97 -1.05 0.29 -1.7 -0.74 -2.69 2.54 -0.03 -1.24 0.8 -0.49 -1.95 - 0.31 0.92 0.65 - 0.83 - - 1.8 -0.83 -1.14
-0.54 -7.46 - - -0.86 -0.9 -0.47 -0.18 0.85 0.34 -0.69 -0.67 -0.08 -0.42 1.02 -0.56 -0.69 0.84 0.02 -0.74 0.54 -1.6 0.68 1.58 1.14 0.37
-0.75 -1.94 - 0.79 -0.68 -0.42 -0.51 -0.52 0.34 0.9 -1.03 -1.2 -0.54 -0.72 -0.16 0.15 0.01 0.61 -0.35 0.14 1.25 -1.43 -0.25 0.84 0.92 0.66
-3.45 - - -2.12 -1.12 -1.25 0.13 0.3 0.09 0.31 0.09 -1.4 0.29 0.02 0.72 -1.52 0.38 0.45 -1.29 0.21 1.18 -0.21 1.82 1.24 -0.41 -0.98
0.43 -1.64 - -0.57 0.56 0.19 0.25 0.27 0.34 -0.18 0.07 -0.14 0.73 -0.13 0.11 -2.14 -0.32 0.55 -0.32 -0.34 0.43 -2.24 -0.26 1.04 0.27 0.19
1.44 0.52 - - - -1.79 -1.28 -1.91 0.9 1.13 -1.63 -1.75 -0.65 -1.74 1.09 - 0.41 0.66 - 2.03 -0.07 0.13 -0.53 0.11 -0.27 0.61
-0.57 -6.43 - - -0.41 -0.5 0.04 0.37 0.41 0.76 -0.37 -0.57 0.3 -0.26 0.73 0.37 0.78 0.4 0.4 0.32 0.24 0.22 0.58 0.62 -0.7 -1.16
0.37 -1.83 -2.82 -0.47 -0.13 -0.53 -0.01 -0.39 0.03 -1.44 -0.24 -0.62 -0.09 -0.59 0.06 0.51 0.75 0.63 -0.18 -0.09 0.62 0.54 0.37 0.31 0.59 0.2
-0.07 -2.89 -2.12 -2.06 0.18 0.02 0.32 0.34 0.37 1.2 0.18 0.01 0.25 -0.03 0.2 -1.33 -0.96 0.12 -0.25 0.06 -0.17 0.11 -0.04 0.42 0.3 0.44
0.33 -8.17 - -0.23 -0.54 -0.91 -0.52 -0.0 -0.14 0.57 -0.37 -0.54 -0.32 -0.44 0.01 0.22 0.14 0.75 -0.24 0.46 0.28 0.81 0.5 0.59 0.37 0.29
-0.71 - - -1.38 -2.97 -0.96 -1.87 0.71 -0.7 1.32 -0.55 -2.93 -0.54 -0.51 -0.45 - - -0.13 0.46 0.64 2.34 0.54 0.86 1.66 -2.24 -0.23
-4.29 -1.76 - -2.66 -0.53 0.04 0.14 -0.53 0.25 1.84 -0.12 -0.59 0.29 -1.56 0.24 -2.08 -1.31 0.07 1.35 1.8 0.21 0.02 -0.24 0.62 -1.37 -2.12
-0.54 -0.35 - 0.51 -0.3 -0.24 -0.32 0.17 0.18 0.25 -0.31 -0.14 -0.22 -0.15 -0.08 -1.52 -0.57 0.76 -1.61 -0.04 1.17 -1.21 0.04 0.77 0.72 0.77
-0.54 - - -1.17 -0.56 -0.29 0.25 0.2 0.96 0.42 -0.17 -0.72 -0.03 -0.29 0.42 -0.94 -0.71 0.48 0.34 0.31 0.88 0.5 -0.06 0.55 0.31 0.23
-0.24 -1.78 - 1.01 0.02 -0.64 0.05 -0.43 0.41 -5.23 -0.44 -0.28 -0.76 -0.66 0.32 0.64 1.36 -0.79 - 0.55 -0.32 0.27 -5.21 1.25 1.03 0.48
-0.86 -5.7 - 0.73 -0.07 0.26 0.25 -0.53 0.5 -0.07 0.06 -0.29 0.04 -0.24 0.01 0.02 -1.41 0.72 -1.02 -1.35 0.24 -1.26 0.59 1.43 0.76 0.29
-1.35 - - -1.19 -0.05 -0.74 -0.34 0.6 -0.34 -0.46 -0.39 -0.25 0.74 -0.18 0.43 0.49 0.79 -0.63 -3.14 0.34 -1.38 0.63 0.13 0.82 1.47 0.64
0.01 0.09 0.15 -0.17 0.01 -0.28 0.0 -1.44 0.02 -0.72 0.11 -0.05 -0.17 -0.44 -0.1 -0.64 0.35 0.16 -0.41 -0.08 0.76 -0.33 0.73 0.67 0.13 -0.09
- - - 1.87 -0.13 -0.92 0.22 -0.64 -0.19 -0.02 -0.15 -1.41 -1.98 -0.13 -1.46 1.07 1.64 -0.88 - -0.11 - -0.21 0.11 1.66 0.81 -0.17
1.88 - - - -0.95 0.61 -0.79 - -0.32 - -0.97 - -0.91 - 0.56 - - 1.87 - 2.64 2.34 - - -0.75 -0.24 -
-1.71 - - 2.24 -2.12 -4.69 -1.68 -0.9 -1.95 2.45 -1.09 -2.72 -1.58 -1.6 -0.6 0.07 0.38 0.45 0.3 0.48 -0.41 -1.21 0.44 1.73 - -
0.28 -1.62 -1.52 -0.42 0.0 -0.1 -0.05 -0.17 -0.01 -0.34 -0.05 -0.49 -0.49 -0.45 -0.26 0.82 0.79 0.57 -1.11 -0.85 0.66 0.34 0.31 0.31 0.57 0.03
0.25 -2.19 - -0.08 0.54 -0.15 0.51 0.11 0.71 -0.75 0.42 -0.26 0.21 -0.19 0.36 -0.6 -0.24 0.54 -0.83 -1.07 0.8 -0.17 0.53 0.81 -0.75 -0.58
-1.01 - - 0.24 -0.39 -0.51 0.1 -0.28 0.44 0.08 -0.24 -0.7 -0.17 -0.72 0.63 0.11 -3.04 0.72 0.8 0.35 1.25 0.18 0.53 0.61 -0.2 -0.26
-0.36 -1.91 0.38 -1.28 -0.05 0.13 -0.14 -0.43 -0.21 -2.04 -0.13 -0.52 -0.36 -0.42 -0.22 -0.04 0.25 0.64 -0.58 -0.47 0.68 -0.65 0.96 0.91 1.01 0.32
-0.56 -1.96 - -6.14 -0.6 -0.65 -0.59 -0.2 0.12 0.74 -0.65 -0.51 -0.32 -0.7 0.14 -0.14 -0.06 0.5 0.74 1.21 0.62 1.02 0.45 0.53 0.29 -0.41
0.12 -0.79 - -4.3 -0.15 -0.44 -0.29 -1.09 -0.18 1.45 -0.37 -0.52 -0.54 -1.06 -0.6 -1.18 -0.03 0.07 -0.35 1.12 0.56 0.35 0.02 1.09 0.94 0.27
-0.22 -0.86 -0.98 0.35 -0.18 -0.12 -0.1 -0.08 0.07 -2.18 -0.17 0.53 0.54 -0.08 0.6 0.34 -0.53 -0.43 -1.08 0.25 -1.04 0.57 0.07 0.45 0.97 -0.12
0.09 -0.82 - -2.23 0.34 0.06 -0.07 0.05 0.08 0.19 -0.04 -0.21 -0.29 -0.33 0.14 -1.82 -1.9 0.49 -0.63 1.05 1.3 0.7 0.21 1.14 -0.97 -1.13
-0.01 -0.51 - -0.66 0.47 0.32 0.44 -0.42 0.35 -0.84 0.5 -0.16 0.24 -0.16 -0.06 -0.93 0.23 0.77 -0.29 -0.52 0.76 -1.62 0.58 0.73 0.01 -0.61
-0.62 - - 1.13 -0.27 -0.01 0.47 -0.7 0.35 0.88 -0.08 -0.44 -0.73 -0.35 -0.58 -3.33 -1.43 1.27 -0.78 -2.33 0.95 -2.02 0.39 1.28 0.5 0.56
-3.33 - - - -0.2 -0.59 -0.21 -0.8 -0.3 -1.64 -0.5 1.98 1.67 -1.64 2.33 - 0.6 - -1.91 0.27 - 0.97 -2.51 1.54 -0.81 -
0.55 0.94 - -2.39 -1.5 -0.84 -0.64 -1.88 0.2 1.69 -1.72 -2.54 -1.23 -1.88 1.08 0.7 1.26 -0.11 -1.54 0.55 0.33 0.11 0.66 0.52 -1.45 -1.14
-0.41 -0.55 -0.83 -0.84 -0.34 -0.57 0.02 -0.38 0.67 -0.65 -0.03 -0.35 0.13 -0.53 0.88 0.21 0.16 -0.31 -0.45 -1.14 0.39 -0.28 0.24 1.33 0.65 -0.12
1.0 - -0.35 -0.65 -1.5 -0.28 0.3 -0.84 0.47 1.87 -1.05 -1.0 -2.33 -1.39 -0.45 -0.54 0.68 1.11 -0.31 0.75 0.31 -0.23 0.68 -0.31 -1.79 -0.88
0.29 - - -1.7 0.18 -0.08 -0.07 0.53 0.38 0.47 0.11 0.23 0.04 0.12 0.44 -0.03 0.03 0.25 -0.86 0.92 0.24 -1.04 0.09 0.6 0.14 -0.74
-0.93 - - 1.53 -1.22 -1.91 -1.94 -0.57 -1.04 1.12 -0.57 -0.2 -0.69 -0.52 -0.12 1.83 1.09 1.45 -0.74 - -0.45 -0.53 -0.94 1.39 -1.54 -0.82
0.22 -1.64 -2.58 -0.07 -0.47 -0.77 -0.36 -0.69 -0.03 0.45 -1.06 -0.91 -0.55 -1.14 0.15 -0.31 0.51 0.72 0.89 0.72 0.63 -0.55 0.5 0.75 0.26 0.23
0.15 -3.51 - -4.87 0.01 -0.36 -0.11 -0.29 0.33 0.05 -0.93 -1.05 -0.67 -1.44 -0.51 -1.26 -0.37 1.29 0.14 1.64 1.1 -0.37 0.37 1.22 0.27 -0.63
-0.19 - - -0.86 -2.45 -2.45 0.61 -1.5 0.3 2.25 - -2.41 - - 1.4 0.75 1.32 1.39 - - 0.86 1.06 0.38 -0.75 - -0.13
-1.61 -1.95 - - -1.87 -0.56 -2.87 0.46 -0.92 0.83 -2.65 -0.89 -1.62 -1.35 0.07 0.32 - 1.97 0.55 1.73 1.43 - -0.04 1.78 -0.56 -1.14
0.41 - - - -0.63 -0.65 -0.44 -0.51 -0.03 1.67 0.23 -0.09 -0.02 -1.08 0.3 0.05 -0.38 0.69 0.69 1.04 - 1.09 -0.9 0.73 0.08 -0.99
-0.58 -2.35 - -1.84 0.09 0.11 0.1 0.39 0.77 -3.05 0.06 -0.46 0.08 -0.5 1.0 0.62 -0.17 -0.32 -2.32 -3.14 0.37 -2.24 -0.11 1.75 1.15 0.52
-1.2 -2.12 -0.52 -0.11 0.0 -0.04 0.05 -0.28 0.56 0.21 -0.11 -0.05 0.02 -0.39 0.37 -0.15 0.01 0.19 0.31 0.49 0.15 -0.39 0.14 0.66 -0.0 0.05
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-0.35 -3.83 - -2.4 -0.14 -0.24 -0.42 -0.11 -0.24 0.11 -0.36 -0.15 -0.15 -0.71 -0.04 0.62 0.89 0.35 -0.35 0.52 0.67 0.36 0.49 1.01 0.22 0.13
- - - - 0.13 -0.82 -0.18 -0.78 -0.05 0.87 -0.36 -0.62 -0.14 -0.92 -1.26 0.67 -0.44 1.22 0.49 0.67 1.87 -0.44 0.63 0.58 0.06 -0.54
0.18 -3.39 - 0.87 0.38 -0.07 0.73 0.0 0.39 -0.72 -0.05 -0.05 -0.06 0.11 0.19 -0.65 -0.05 0.49 -0.7 -0.86 0.43 -0.87 0.61 0.97 -0.32 -0.64
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2.58 - - - - - - - - - - - - - 2.26 - - - - 3.93 - - - - - -
- -0.42 - -1.27 -0.85 -1.05 -2.51 0.16 -3.91 1.54 -0.8 -1.06 -1.02 0.28 -0.82 -1.66 -2.09 0.3 2.15 -0.67 1.62 -0.35 0.97 1.82 - -
-0.37 -3.12 - - -0.25 0.01 -0.14 0.48 0.1 1.58 0.03 -0.16 0.38 -0.15 0.38 -0.34 -0.03 0.31 -0.69 0.66 0.19 0.56 -0.12 0.01 -0.0 -0.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.