Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000003.1_cds_GFH05599.1_76 (GFH05599)	0.32	0.44	0.21	0.92	0.09	0.16	0.25	0.19	0.3	0.28	0.13	0.2	0.22	0.22	0.3	0.57	0.22	0.81	0.51	0.42	0.89	0.37	0.72	1.0	0.24	0.26
lcl\|BLLF01000042.1_cds_GFH06504.1_981 (GFH06504)	0.53	0.0	0.0	0.28	0.22	0.22	0.22	0.22	0.29	0.33	0.24	0.21	0.44	0.25	0.32	0.41	0.24	0.57	0.38	0.66	0.44	0.87	0.55	1.0	0.19	0.17
lcl\|BLLF01000071.1_cds_GFH07050.1_1527 (GFH07050)	0.82	0.0	0.0	1.0	0.14	0.1	0.16	0.18	0.19	0.19	0.12	0.1	0.11	0.13	0.26	0.31	0.28	0.24	0.27	0.45	0.24	0.38	0.29	0.42	0.28	0.16
lcl\|BLLF01000167.1_cds_GFH08534.1_3011 (GFH08534)	0.05	0.0	0.0	0.19	0.17	0.41	0.37	0.13	0.37	0.33	0.23	0.48	0.27	0.24	0.15	0.76	0.65	0.41	0.27	0.62	0.19	0.72	0.72	1.0	0.16	0.19
lcl\|BLLF01000178.1_cds_GFH08695.1_3172 (GFH08695)	0.5	0.0	0.0	0.96	0.31	0.26	0.21	0.18	0.3	0.06	0.21	0.16	0.21	0.15	0.23	0.47	0.35	0.49	0.28	0.42	0.6	0.29	0.55	1.0	0.28	0.14
lcl\|BLLF01000205.1_cds_GFH09048.1_3525 (GFH09048)	0.47	0.18	0.0	0.14	0.37	0.43	0.25	0.25	0.25	0.22	0.47	0.42	0.4	0.32	0.15	0.51	0.35	0.53	0.12	0.23	0.62	0.34	0.58	1.0	0.27	0.51
lcl\|BLLF01000212.1_cds_GFH09142.1_3619 (GFH09142)	0.57	0.04	0.0	0.37	0.07	0.11	0.12	0.07	0.17	0.07	0.06	0.05	0.11	0.1	0.09	1.0	0.55	0.57	0.12	0.22	0.44	0.37	0.36	0.85	0.07	0.11
lcl\|BLLF01000367.1_cds_GFH11019.1_5496 (GFH11019)	0.92	0.08	0.0	1.0	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.34	0.04	0.02	0.07	0.03	0.13	0.19	0.21	0.3	0.78	0.19	0.31	0.47	0.37	0.58	0.09	0.03
lcl\|BLLF01000368.1_cds_GFH11040.1_5517 (GFH11040)	0.12	0.16	0.0	0.02	0.26	0.21	0.26	0.24	0.19	0.19	0.3	0.25	0.24	0.24	0.22	0.31	0.48	0.3	0.08	0.08	0.54	0.15	0.3	1.0	0.43	0.34
lcl\|BLLF01000377.1_cds_GFH11133.1_5610 (GFH11133)	0.6	0.09	0.0	0.94	0.31	0.32	0.36	0.49	0.46	0.12	0.32	0.21	0.44	0.36	0.49	0.32	0.34	0.63	0.58	0.49	0.87	0.13	0.79	1.0	0.2	0.13
lcl\|BLLF01000380.1_cds_GFH11167.1_5644 (GFH11167)	0.14	0.0	0.0	1.0	0.21	0.13	0.2	0.27	0.24	0.19	0.19	0.17	0.18	0.2	0.19	0.4	0.43	0.53	0.24	0.36	0.53	0.53	0.51	0.94	0.37	0.3
lcl\|BLLF01000407.1_cds_GFH11479.1_5956 (GFH11479)	0.44	0.25	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.01	0.02	0.03	0.0	0.09	0.69	0.75	0.47	0.72	0.3	0.51	0.53	0.61	0.6	0.06	0.02
lcl\|BLLF01000444.1_cds_GFH11871.1_6348 (GFH11871)	0.46	0.0	0.0	0.42	0.03	0.03	0.21	0.08	0.19	0.18	0.06	0.06	0.06	0.06	0.11	0.0	0.0	0.81	0.3	0.69	0.0	0.0	0.27	1.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000444.1_cds_GFH11879.1_6356 (GFH11879)	0.62	0.0	0.0	0.25	0.3	0.51	0.28	0.24	0.28	0.88	0.19	0.27	0.38	0.31	0.18	0.57	0.92	0.64	0.42	0.51	1.0	0.77	0.6	0.9	0.4	0.39
lcl\|BLLF01000472.1_cds_GFH12138.1_6615 (GFH12138)	0.08	0.25	0.0	0.46	0.1	0.22	0.25	0.11	0.08	0.11	0.07	0.23	0.2	0.1	0.1	0.0	0.23	0.36	0.0	0.1	1.0	0.57	0.36	0.95	0.14	0.08
lcl\|BLLF01000480.1_cds_GFH12234.1_6711 (GFH12234)	0.72	0.05	0.0	0.86	0.15	0.12	0.11	0.15	0.04	0.21	0.1	0.21	0.09	0.31	0.19	1.0	0.84	0.28	0.49	0.71	0.65	0.49	0.74	0.67	0.06	0.11
lcl\|BLLF01000502.1_cds_GFH12432.1_6909 (GFH12432)	0.16	0.12	0.0	0.84	0.05	0.05	0.08	0.07	0.07	0.25	0.06	0.03	0.05	0.05	0.08	1.0	0.53	0.51	0.29	0.32	0.43	0.12	0.32	0.32	0.06	0.1
lcl\|BLLF01000527.1_cds_GFH12657.1_7134 (GFH12657)	0.1	0.0	0.0	0.08	0.27	0.14	0.17	0.38	0.18	0.12	0.21	0.28	0.29	0.36	0.1	0.69	0.83	0.4	0.4	0.28	0.74	0.42	0.33	1.0	0.29	0.09
lcl\|BLLF01000580.1_cds_GFH13144.1_7621 (GFH13144)	0.88	0.0	0.0	1.0	0.17	0.09	0.13	0.18	0.29	0.54	0.12	0.13	0.15	0.13	0.26	0.84	0.74	0.53	0.61	0.57	0.57	0.11	0.76	0.89	0.19	0.13
lcl\|BLLF01000624.1_cds_GFH13541.1_8018 (GFH13541)	0.82	0.01	0.0	1.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.1	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.17	0.06	0.02	0.35	0.09	0.4	0.23	0.74	0.3	0.27	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000625.1_cds_GFH13548.1_8025 (GFH13548)	0.84	0.04	0.0	0.0	0.13	0.11	0.16	0.09	0.19	0.22	0.13	0.16	0.18	0.13	0.22	0.0	0.13	0.39	0.54	0.31	0.58	0.59	0.3	1.0	0.16	0.22
lcl\|BLLF01000841.1_cds_GFH15362.1_9839 (GFH15362)	0.24	0.09	0.0	0.81	0.32	0.12	0.19	0.26	0.3	0.4	0.26	0.22	0.22	0.26	0.35	0.82	0.62	0.8	0.36	0.44	0.44	0.32	0.48	1.0	0.28	0.21
lcl\|BLLF01000853.1_cds_GFH15456.1_9933 (GFH15456)	0.66	0.15	0.0	0.23	0.4	0.26	0.43	0.32	0.53	0.18	0.53	0.35	0.33	0.37	0.37	0.21	0.25	0.26	0.25	0.14	0.45	0.31	0.26	1.0	0.54	0.28
lcl\|BLLF01000899.1_cds_GFH15780.1_10257 (GFH15780)	0.79	0.3	0.0	0.36	0.29	0.5	0.41	0.63	0.8	0.24	0.22	0.21	0.4	0.51	0.51	0.17	0.25	0.59	0.4	0.45	0.64	0.63	0.33	1.0	0.18	0.29
lcl\|BLLF01000914.1_cds_GFH15875.1_10352 (GFH15875)	0.44	0.0	0.0	0.71	0.21	0.08	0.24	0.13	0.29	0.31	0.23	0.25	0.24	0.13	0.33	0.29	0.11	0.34	0.17	0.29	0.31	0.0	0.56	1.0	0.31	0.24
lcl\|BLLF01000921.1_cds_GFH15926.1_10403 (GFH15926)	0.68	0.08	0.13	0.33	0.5	0.51	0.38	0.35	0.45	0.55	0.54	0.39	0.4	0.34	0.39	0.77	0.66	0.81	0.65	0.73	1.0	0.55	0.68	0.98	0.36	0.33
lcl\|BLLF01000929.1_cds_GFH15982.1_10459 (GFH15982)	0.31	0.0	0.0	0.14	0.32	0.48	0.34	0.16	0.18	0.04	0.33	0.31	0.3	0.3	0.16	0.73	0.7	0.41	0.06	0.28	0.73	0.32	0.57	1.0	0.42	0.34
lcl\|BLLF01000964.1_cds_GFH16229.1_10706 (GFH16229)	0.12	0.16	0.05	1.0	0.13	0.12	0.16	0.06	0.2	0.18	0.17	0.13	0.15	0.12	0.18	0.53	0.71	0.52	0.58	0.27	0.42	0.53	0.68	0.86	0.5	0.23
lcl\|BLLF01001002.1_cds_GFH16468.1_10945 (GFH16468)	0.16	0.09	0.14	1.0	0.13	0.14	0.18	0.14	0.2	0.09	0.13	0.13	0.15	0.13	0.22	0.17	0.26	0.4	0.17	0.34	0.41	0.28	0.28	0.47	0.21	0.19
lcl\|BLLF01001018.1_cds_GFH16580.1_11057 (GFH16580)	0.25	0.0	0.0	0.0	0.19	0.03	0.16	0.05	0.0	0.17	0.09	0.13	0.03	0.06	0.0	0.0	0.36	0.38	0.85	0.16	0.26	0.3	0.0	1.0	0.17	0.09
lcl\|BLLF01001338.1_cds_GFH18686.1_13163 (GFH18686)	0.26	0.14	0.19	0.33	0.5	0.35	0.37	0.41	0.32	0.33	0.46	0.36	0.41	0.44	0.25	0.3	0.58	0.61	0.1	0.24	0.53	0.02	0.56	1.0	0.32	0.31
lcl\|BLLF01001520.1_cds_GFH19784.1_14261 (GFH19784)	0.72	0.04	0.0	0.07	0.43	0.52	0.46	0.24	0.49	0.77	0.41	0.38	0.37	0.29	0.44	0.76	1.0	0.48	0.91	0.56	0.68	0.33	0.73	0.92	0.4	0.36
lcl\|BLLF01001522.1_cds_GFH19804.1_14281 (GFH19804)	0.64	0.16	0.25	0.44	0.36	0.5	0.57	0.42	0.65	0.16	0.49	0.54	0.6	0.5	0.64	0.38	0.62	1.0	0.18	0.26	0.76	0.51	0.74	0.86	0.71	0.51
lcl\|BLLF01001573.1_cds_GFH20088.1_14565 (GFH20088)	0.41	0.18	0.27	0.2	0.23	0.18	0.19	0.37	0.23	0.48	0.19	0.24	0.15	0.16	0.18	0.3	0.3	0.33	0.22	1.0	0.18	0.39	0.38	0.92	0.33	0.31
lcl\|BLLF01002044.1_cds_GFH22457.1_16934 (GFH22457)	0.1	0.0	0.0	0.15	0.4	0.36	0.27	0.54	0.29	0.04	0.43	0.38	0.3	0.5	0.21	0.21	0.22	0.36	0.15	0.12	0.29	0.05	0.28	1.0	0.26	0.35
lcl\|BLLF01002209.1_cds_GFH23179.1_17656 (GFH23179)	1.0	0.13	0.01	0.7	0.18	0.2	0.25	0.04	0.2	0.5	0.19	0.13	0.16	0.11	0.23	0.6	0.84	0.57	0.95	0.48	0.38	0.31	0.38	0.73	0.11	0.11
lcl\|BLLF01002218.1_cds_GFH23211.1_17688 (GFH23211)	0.81	0.31	0.53	0.08	0.13	0.21	0.25	0.37	0.26	0.33	0.14	0.21	0.24	0.26	0.33	0.39	0.3	0.67	0.22	0.35	0.67	1.0	0.76	0.55	0.29	0.31
lcl\|BLLF01002422.1_cds_GFH24024.1_18501 (GFH24024)	1.0	0.07	0.0	0.25	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.32	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.04	0.1	0.24	0.05	0.62	0.19	0.33	0.31	0.87	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002435.1_cds_GFH24073.1_18550 (GFH24073)	0.26	0.42	0.31	0.65	0.23	0.16	0.31	0.3	0.31	0.42	0.26	0.16	0.33	0.41	0.35	1.0	0.36	0.57	0.51	0.48	0.5	0.55	0.51	0.94	0.19	0.27
lcl\|BLLF01002489.1_cds_GFH24277.1_18754 (GFH24277)	0.62	0.34	0.09	0.44	0.51	0.5	0.54	0.5	0.52	0.44	0.46	0.51	0.43	0.42	0.42	0.35	0.6	0.72	0.36	0.2	0.76	0.33	0.55	1.0	0.39	0.37
lcl\|BLLF01002537.1_cds_GFH24441.1_18918 (GFH24441)	0.36	0.1	0.04	0.01	0.11	0.07	0.09	0.16	0.12	0.12	0.08	0.08	0.11	0.12	0.13	0.42	1.0	0.15	0.11	0.3	0.16	0.13	0.18	0.66	0.24	0.15
lcl\|BLLF01002544.1_cds_GFH24467.1_18944 (GFH24467)	0.52	0.0	0.0	0.28	0.33	0.32	0.33	0.33	0.35	0.04	0.41	0.35	0.29	0.36	0.37	0.29	0.49	0.68	0.12	0.16	0.76	0.13	0.33	1.0	0.57	0.28
lcl\|BLLF01002802.1_cds_GFH25392.1_19869 (GFH25392)	0.07	0.71	0.03	0.0	0.17	0.16	0.14	0.12	0.03	0.08	0.07	0.13	0.03	0.06	0.02	0.12	0.19	0.38	0.09	0.11	0.37	0.49	0.47	1.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01002806.1_cds_GFH25405.1_19882 (GFH25405)	1.0	0.0	0.23	0.24	0.07	0.02	0.02	0.08	0.1	0.58	0.02	0.05	0.09	0.05	0.05	0.51	0.76	0.45	0.39	0.59	0.43	0.63	0.58	0.89	0.18	0.03
lcl\|BLLF01002817.1_cds_GFH25447.1_19924 (GFH25447)	0.31	0.11	0.16	0.86	0.1	0.04	0.08	0.18	0.12	0.09	0.09	0.06	0.13	0.13	0.1	0.62	0.47	0.54	0.13	0.27	0.67	0.23	0.66	1.0	0.16	0.18
lcl\|BLLF01002891.1_cds_GFH25693.1_20170 (GFH25693)	1.0	0.0	0.0	0.94	0.06	0.0	0.15	0.29	0.34	0.55	0.18	0.06	0.28	0.14	0.46	0.78	0.39	0.2	0.0	0.35	0.84	0.0	0.2	0.54	0.05	0.05
lcl\|BLLF01003298.1_cds_GFH26953.1_21430 (GFH26953)	0.45	0.0	0.0	0.09	0.46	0.37	0.27	0.65	0.29	0.05	0.35	0.36	0.35	0.45	0.27	0.31	0.55	0.59	0.54	0.46	0.53	0.52	0.51	1.0	0.33	0.35
lcl\|BLLF01003349.1_cds_GFH27103.1_21580 (GFH27103)	0.35	0.01	0.0	1.0	0.1	0.08	0.11	0.05	0.13	0.19	0.11	0.1	0.11	0.06	0.12	0.67	0.72	0.66	0.26	0.39	0.54	0.27	0.5	0.59	0.11	0.12
lcl\|BLLF01003565.1_cds_GFH27659.1_22136 (GFH27659)	0.1	0.12	0.0	0.0	0.2	0.06	0.18	0.2	0.26	0.28	0.12	0.11	0.18	0.08	0.19	0.14	0.2	0.62	0.31	0.17	0.28	0.82	0.31	1.0	0.26	0.1
lcl\|BLLF01003888.1_cds_GFH28462.1_22939 (GFH28462)	0.84	0.28	0.0	0.69	0.16	0.14	0.2	0.09	0.3	0.34	0.16	0.21	0.17	0.15	0.23	0.48	0.67	0.8	0.14	0.4	0.52	0.45	0.56	1.0	0.49	0.37
lcl\|BLLF01004020.1_cds_GFH28752.1_23229 (GFH28752)	0.34	0.0	0.0	0.8	0.04	0.04	0.14	0.09	0.28	0.1	0.07	0.06	0.09	0.1	0.3	0.14	0.05	0.79	0.24	0.36	0.15	0.33	0.42	1.0	0.34	0.3
lcl\|BLLF01004103.1_cds_GFH28920.1_23397 (GFH28920)	0.89	0.02	0.06	0.2	0.31	0.4	0.33	0.34	0.46	0.05	0.35	0.41	0.3	0.33	0.38	0.36	0.55	0.87	0.35	0.47	0.77	0.7	0.73	1.0	0.34	0.28
lcl\|BLLF01004164.1_cds_GFH29067.1_23544 (GFH29067)	0.2	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.36	0.0	0.31	1.0	0.0	0.36	0.71	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004424.1_cds_GFH29581.1_24058 (GFH29581)	0.33	0.24	0.25	1.0	0.31	0.24	0.31	0.15	0.35	0.32	0.28	0.27	0.34	0.24	0.3	0.49	0.82	0.7	0.33	0.33	0.85	0.3	0.64	0.66	0.4	0.33
lcl\|BLLF01004597.1_cds_GFH29922.1_24399 (GFH29922)	0.25	0.31	0.0	1.0	0.23	0.17	0.18	0.23	0.26	0.22	0.2	0.19	0.25	0.24	0.25	0.3	0.45	0.38	0.0	0.44	0.26	0.08	0.09	0.46	0.12	0.14
lcl\|BLLF01004729.1_cds_GFH30144.1_24621 (GFH30144)	0.1	0.12	0.0	0.0	0.2	0.06	0.18	0.2	0.26	0.28	0.12	0.11	0.18	0.08	0.19	0.14	0.2	0.62	0.31	0.17	0.28	0.82	0.31	1.0	0.26	0.1
lcl\|BLLF01004758.1_cds_GFH30191.1_24668 (GFH30191)	0.3	0.06	0.0	0.35	0.32	0.28	0.28	0.22	0.28	0.07	0.35	0.32	0.28	0.28	0.23	0.67	0.85	0.58	0.11	0.18	0.53	0.52	0.65	1.0	0.28	0.32
lcl\|BLLF01004785.1_cds_GFH30239.1_24716 (GFH30239)	0.07	0.0	0.0	0.09	0.01	0.16	0.07	0.01	0.1	0.0	0.18	0.0	0.06	0.06	0.06	0.27	0.9	0.63	0.0	0.18	0.58	0.33	0.21	1.0	0.19	0.32
lcl\|BLLF01005086.1_cds_GFH30711.1_25188 (GFH30711)	0.57	0.17	0.27	0.94	0.18	0.14	0.19	0.16	0.22	0.19	0.18	0.15	0.17	0.17	0.22	0.62	0.74	0.6	0.29	0.68	0.76	0.35	0.58	1.0	0.25	0.18
lcl\|BLLF01005158.1_cds_GFH30811.1_25288 (GFH30811)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.22	0.47	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.05	0.0
lcl\|BLLF01005323.1_cds_GFH31046.1_25523 (GFH31046)	0.96	0.32	0.41	0.21	0.35	0.37	0.51	0.49	0.57	0.16	0.32	0.31	0.45	0.42	0.5	0.34	0.58	0.83	0.47	0.67	0.65	1.0	0.7	0.8	0.55	0.5
lcl\|BLLF01005391.1_cds_GFH31128.1_25605 (GFH31128)	0.28	0.0	0.0	1.0	0.04	0.02	0.07	0.15	0.09	0.42	0.02	0.02	0.09	0.09	0.08	0.32	0.29	0.49	0.21	0.51	0.38	0.35	0.54	0.41	0.01	0.01
lcl\|BLLF01006810.1_cds_GFH32567.1_27044 (GFH32567)	0.4	0.41	0.0	0.19	0.17	0.14	0.14	0.07	0.09	1.0	0.1	0.01	0.13	0.07	0.13	0.9	0.34	0.83	0.11	0.09	0.2	0.5	0.37	0.91	0.29	0.45
lcl\|BLLF01007643.1_cds_GFH33043.1_27520 (GFH33043)	0.32	0.0	0.0	1.0	0.06	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.79	0.41	0.34	0.17	0.28	0.25	0.15	0.35	0.38	0.05	0.02
lcl\|BLLF01007815.1_cds_GFH33124.1_27601 (GFH33124)	0.65	0.12	0.0	0.18	0.22	0.2	0.19	0.24	0.22	0.48	0.15	0.21	0.26	0.16	0.33	0.97	0.28	0.56	0.15	0.22	0.59	0.52	0.55	1.0	0.38	0.34
lcl\|BLLF01007845.1_cds_GFH33142.1_27619 (GFH33142)	0.03	0.0	0.0	0.12	0.06	0.0	0.12	0.0	0.03	0.39	0.03	0.0	0.07	0.0	0.09	0.07	0.0	0.39	0.0	0.42	0.0	0.74	0.61	1.0	0.1	0.0
lcl\|BLLF01009136.1_cds_GFH33627.1_28104 (GFH33627)	0.34	0.2	0.27	1.0	0.14	0.11	0.09	0.22	0.11	0.27	0.13	0.11	0.13	0.17	0.13	0.29	0.36	0.54	0.33	0.59	0.46	0.23	0.47	0.72	0.24	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)