Heatmap: Cluster_174 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000008.1_cds_GFH05761.1_238 (GFH05761)	0.28	0.05	0.07	0.47	0.66	0.75	0.76	0.48	0.67	0.53	0.63	0.6	0.6	0.64	0.54	0.92	0.62	1.0	0.64	0.77	0.85	0.44	0.94	0.66	0.37	0.38
lcl\|BLLF01000020.1_cds_GFH06062.1_539 (GFH06062)	0.16	0.24	0.21	0.4	0.53	0.59	0.63	0.37	0.41	0.7	0.54	0.4	0.37	0.47	0.3	0.69	1.0	0.71	0.33	0.26	0.84	0.98	0.75	0.49	0.36	0.32
lcl\|BLLF01000074.1_cds_GFH07107.1_1584 (GFH07107)	0.02	0.01	0.0	0.02	0.34	0.44	0.42	0.36	0.25	1.0	0.42	0.43	0.4	0.27	0.22	0.68	0.46	0.72	0.43	0.33	0.79	0.53	0.57	0.26	0.12	0.08
lcl\|BLLF01000089.1_cds_GFH07350.1_1827 (GFH07350)	0.28	0.45	0.26	0.35	0.54	0.52	0.48	0.51	0.57	0.86	0.59	0.43	0.58	0.51	0.5	1.0	0.73	0.68	0.65	0.68	0.77	0.53	0.84	0.73	0.5	0.47
lcl\|BLLF01000272.1_cds_GFH09895.1_4372 (GFH09895)	0.3	0.04	0.0	0.31	0.49	0.56	0.54	0.29	0.52	0.47	0.54	0.42	0.41	0.39	0.34	0.75	0.84	0.7	0.44	0.48	1.0	0.68	0.9	0.56	0.22	0.36
lcl\|BLLF01000285.1_cds_GFH10072.1_4549 (GFH10072)	0.24	0.02	0.0	0.25	1.0	0.52	0.68	0.54	0.77	0.41	0.53	0.54	0.59	0.48	0.71	0.5	0.31	0.65	0.1	0.17	0.81	0.52	0.58	0.25	0.3	0.2
lcl\|BLLF01000311.1_cds_GFH10382.1_4859 (GFH10382)	0.04	0.04	0.0	0.11	0.25	0.16	0.31	0.19	0.24	0.23	0.38	0.23	0.4	0.28	0.17	0.81	0.72	0.63	0.19	0.21	0.87	0.0	1.0	0.46	0.17	0.15
lcl\|BLLF01000379.1_cds_GFH11160.1_5637 (GFH11160)	0.0	0.08	0.0	0.14	0.88	0.66	0.68	0.7	0.6	0.17	0.75	0.58	0.69	0.72	0.59	0.8	0.57	1.0	0.2	0.38	0.85	0.62	0.83	0.65	0.37	0.19
lcl\|BLLF01000411.1_cds_GFH11517.1_5994 (GFH11517)	0.15	0.0	0.0	0.21	0.14	0.14	0.26	0.15	0.72	0.74	0.23	0.33	0.24	0.11	0.44	0.49	0.45	0.41	0.0	0.34	1.0	0.0	0.88	0.25	0.56	0.78
lcl\|BLLF01000451.1_cds_GFH11949.1_6426 (GFH11949)	0.29	0.26	0.27	0.5	0.96	0.92	0.7	0.48	0.56	0.18	0.83	0.62	0.52	0.65	0.37	0.98	1.0	1.0	0.4	0.19	0.92	0.15	0.61	0.56	0.9	0.54
lcl\|BLLF01000514.1_cds_GFH12545.1_7022 (GFH12545)	0.03	0.0	0.0	0.07	0.51	0.51	0.52	0.34	0.44	0.31	0.56	0.59	0.85	0.26	0.52	1.0	0.41	0.09	0.26	0.07	0.0	0.0	0.78	0.76	0.96	0.34
lcl\|BLLF01000546.1_cds_GFH12845.1_7322 (GFH12845)	0.07	0.06	0.0	0.64	0.32	0.27	0.35	0.19	0.26	0.17	0.34	0.29	0.33	0.34	0.19	0.52	0.49	1.0	0.33	0.16	0.41	0.0	0.74	0.39	0.46	0.38
lcl\|BLLF01000572.1_cds_GFH13077.1_7554 (GFH13077)	0.36	0.03	0.0	0.21	0.72	0.84	0.92	0.6	0.43	1.0	0.84	0.5	0.76	0.77	0.59	0.94	0.58	0.74	0.74	0.52	0.68	0.19	0.85	0.39	0.28	0.52
lcl\|BLLF01000681.1_cds_GFH14058.1_8535 (GFH14058)	0.1	0.0	0.1	0.31	0.41	0.38	0.41	0.28	0.33	1.0	0.48	0.36	0.29	0.33	0.25	0.68	0.89	0.52	0.47	0.51	0.85	0.77	0.65	0.47	0.06	0.02
lcl\|BLLF01000701.1_cds_GFH14218.1_8695 (GFH14218)	0.47	0.24	0.01	0.32	1.0	0.8	0.77	0.72	0.77	0.64	0.97	0.66	0.68	0.7	0.75	0.45	0.59	0.85	0.56	0.53	0.71	0.84	0.52	0.39	0.57	0.34
lcl\|BLLF01000718.1_cds_GFH14373.1_8850 (GFH14373)	0.64	0.19	0.07	0.57	0.98	0.94	0.95	0.55	0.87	0.83	0.96	0.77	0.65	0.69	0.85	0.4	0.55	1.0	0.32	0.44	0.71	0.97	0.76	0.59	0.58	0.43
lcl\|BLLF01000795.1_cds_GFH15020.1_9497 (GFH15020)	0.27	0.0	0.0	0.0	0.35	0.33	0.34	0.17	0.21	0.16	0.46	0.32	0.25	0.3	0.2	0.67	0.23	0.63	0.16	0.15	0.91	0.5	1.0	0.53	0.18	0.07
lcl\|BLLF01000831.1_cds_GFH15301.1_9778 (GFH15301)	0.68	0.1	0.0	0.2	0.46	0.6	0.39	0.24	0.48	0.64	0.5	0.42	0.32	0.36	0.3	0.42	0.37	1.0	0.57	0.67	0.99	0.71	0.84	0.7	0.16	0.23
lcl\|BLLF01001020.1_cds_GFH16598.1_11075 (GFH16598)	0.52	0.07	0.0	0.11	0.27	0.85	0.68	0.34	0.32	0.42	0.58	0.58	0.81	0.52	0.38	0.51	0.63	1.0	0.5	0.68	0.46	0.21	0.6	0.28	0.18	0.31
lcl\|BLLF01001028.1_cds_GFH16644.1_11121 (GFH16644)	0.02	0.0	0.0	0.28	0.39	0.4	0.44	0.24	0.25	0.55	0.4	0.35	0.44	0.47	0.15	0.95	0.45	0.74	0.1	0.0	0.65	0.11	1.0	0.46	0.59	0.49
lcl\|BLLF01001186.1_cds_GFH17685.1_12162 (GFH17685)	0.18	0.0	0.08	0.23	0.54	0.71	0.76	0.33	0.53	0.27	0.51	0.74	0.55	0.37	0.63	0.08	0.34	0.72	0.27	0.51	1.0	0.96	0.9	0.47	0.53	0.35
lcl\|BLLF01001203.1_cds_GFH17806.1_12283 (GFH17806)	0.15	0.2	0.0	0.28	0.55	0.54	0.47	0.23	0.37	0.19	0.69	0.54	0.38	0.51	0.27	1.0	0.35	0.73	0.16	0.31	0.65	0.08	0.47	0.37	0.42	0.41
lcl\|BLLF01001237.1_cds_GFH18015.1_12492 (GFH18015)	0.23	0.0	0.0	0.5	0.51	0.63	0.67	0.71	0.66	0.44	0.63	0.92	0.89	0.98	1.0	0.18	0.51	0.5	0.15	0.17	0.35	0.29	0.39	0.84	0.57	0.42
lcl\|BLLF01001272.1_cds_GFH18253.1_12730 (GFH18253)	0.14	0.01	0.0	0.14	0.2	0.45	0.3	0.2	0.15	0.05	0.33	0.39	0.38	0.45	0.11	1.0	0.87	0.62	0.23	0.15	0.58	0.23	0.79	0.46	0.26	0.23
lcl\|BLLF01001486.1_cds_GFH19574.1_14051 (GFH19574)	0.45	0.12	0.0	0.55	0.69	0.89	1.0	0.32	0.76	0.11	0.77	0.63	0.78	0.33	0.43	0.48	0.89	0.56	0.0	0.69	0.78	0.1	0.31	0.73	0.84	0.58
lcl\|BLLF01001516.1_cds_GFH19753.1_14230 (GFH19753)	0.66	0.41	0.16	0.11	0.63	0.67	0.82	0.55	0.76	0.73	0.74	0.66	0.75	0.68	0.66	0.85	0.7	0.99	0.34	0.3	1.0	0.38	0.56	0.73	0.51	0.39
lcl\|BLLF01001661.1_cds_GFH20581.1_15058 (GFH20581)	0.07	0.0	0.0	0.05	0.09	0.44	0.52	0.22	0.77	0.61	0.51	0.48	0.43	0.54	0.34	0.14	0.96	0.56	0.0	0.76	0.46	0.0	1.0	0.13	0.72	0.86
lcl\|BLLF01001768.1_cds_GFH21137.1_15614 (GFH21137)	0.2	0.0	0.0	0.05	0.49	0.73	0.73	0.47	0.67	0.23	0.63	0.8	0.6	0.65	0.37	0.96	0.95	1.0	0.0	0.32	0.86	0.4	0.5	0.32	0.55	0.7
lcl\|BLLF01001800.1_cds_GFH21293.1_15770 (GFH21293)	0.26	0.05	0.0	0.02	0.45	0.93	0.57	0.41	0.46	0.87	0.68	0.92	0.79	0.85	0.29	1.0	0.64	0.92	0.66	0.47	0.86	0.58	0.8	0.41	0.51	0.24
lcl\|BLLF01001825.1_cds_GFH21420.1_15897 (GFH21420)	0.16	0.48	0.0	0.11	0.4	0.39	0.46	0.27	0.42	0.61	0.47	0.28	0.36	0.38	0.29	1.0	0.8	0.74	0.19	0.46	0.7	0.65	0.73	0.55	0.19	0.23
lcl\|BLLF01002155.1_cds_GFH22920.1_17397 (GFH22920)	0.07	0.03	0.0	0.11	0.27	0.22	0.3	0.26	0.36	0.71	0.49	0.23	0.21	0.39	0.18	1.0	0.68	0.85	0.1	0.28	0.45	0.21	0.97	0.53	0.3	0.26
lcl\|BLLF01002226.1_cds_GFH23244.1_17721 (GFH23244)	0.41	0.11	0.0	0.13	0.52	0.58	0.4	0.24	0.21	0.11	0.47	0.45	0.27	0.41	0.2	0.41	0.49	0.81	0.44	0.3	1.0	0.58	0.82	0.63	0.26	0.23
lcl\|BLLF01002407.1_cds_GFH23966.1_18443 (GFH23966)	0.19	0.0	0.0	0.31	0.36	0.64	0.37	0.16	0.2	0.85	0.35	0.25	0.26	0.21	0.13	0.86	0.8	0.81	0.1	0.17	0.74	0.58	1.0	0.45	0.19	0.13
lcl\|BLLF01002647.1_cds_GFH24845.1_19322 (GFH24845)	0.16	0.0	0.0	0.76	0.42	0.9	0.7	0.28	0.49	0.35	0.49	0.51	0.57	0.26	0.47	0.5	0.49	0.52	0.19	0.11	0.18	0.62	0.39	1.0	0.45	0.57
lcl\|BLLF01002659.1_cds_GFH24888.1_19365 (GFH24888)	0.46	0.26	0.32	0.29	0.76	0.93	0.93	0.4	0.71	0.42	0.7	0.7	0.67	0.52	0.67	0.84	0.6	0.8	0.36	0.51	1.0	0.51	0.82	0.74	0.57	0.5
lcl\|BLLF01002745.1_cds_GFH25190.1_19667 (GFH25190)	0.68	0.18	0.08	0.22	0.59	0.68	0.67	0.45	0.57	0.75	0.67	0.62	0.61	0.55	0.66	0.84	0.73	0.65	0.35	0.33	1.0	0.43	0.88	0.9	0.65	0.52
lcl\|BLLF01002800.1_cds_GFH25384.1_19861 (GFH25384)	0.22	0.0	0.0	0.29	0.27	0.23	0.37	0.32	0.35	0.51	0.24	0.13	0.3	0.42	0.18	0.71	0.9	0.72	0.42	0.09	1.0	0.88	0.5	0.33	0.08	0.01
lcl\|BLLF01002999.1_cds_GFH26041.1_20518 (GFH26041)	0.5	0.23	0.18	0.11	0.51	0.59	0.37	0.37	0.42	0.71	0.58	0.45	0.42	0.44	0.31	0.82	0.81	1.0	0.55	0.8	0.97	0.6	0.93	0.67	0.18	0.32
lcl\|BLLF01003002.1_cds_GFH26051.1_20528 (GFH26051)	0.34	0.22	0.0	0.31	0.58	0.49	0.67	0.48	0.55	0.81	0.78	0.53	0.6	0.53	0.62	1.0	0.5	0.71	0.28	0.12	0.61	0.18	0.44	0.75	0.68	0.44
lcl\|BLLF01003020.1_cds_GFH26099.1_20576 (GFH26099)	0.54	0.0	0.0	0.27	0.71	0.69	0.84	0.51	0.62	0.33	0.7	0.7	0.61	0.63	0.71	0.56	0.66	0.71	0.56	0.44	1.0	0.66	0.77	0.57	0.48	0.33
lcl\|BLLF01003226.1_cds_GFH26748.1_21225 (GFH26748)	0.05	0.07	0.0	0.31	0.4	0.44	0.18	0.15	0.14	0.66	0.45	0.41	0.12	0.23	0.02	0.27	0.8	0.42	0.27	0.16	1.0	0.54	0.49	0.29	0.07	0.3
lcl\|BLLF01003335.1_cds_GFH27059.1_21536 (GFH27059)	0.1	0.0	0.0	0.39	0.71	0.5	0.67	0.86	0.69	0.22	0.92	0.62	1.0	0.8	0.88	0.76	0.82	0.55	0.43	0.33	0.74	0.83	0.47	0.9	0.35	0.14
lcl\|BLLF01003346.1_cds_GFH27090.1_21567 (GFH27090)	0.07	0.04	0.0	0.17	0.54	0.5	0.39	0.28	0.38	0.87	0.56	0.35	0.5	0.38	0.39	0.94	1.0	0.82	0.0	0.66	0.88	0.65	0.82	0.58	0.46	0.42
lcl\|BLLF01003483.1_cds_GFH27458.1_21935 (GFH27458)	0.16	0.0	0.0	0.23	0.69	0.61	0.71	0.5	0.5	0.49	0.56	1.0	0.97	0.78	0.71	0.7	0.78	0.2	0.0	0.06	0.28	0.43	0.2	0.64	0.41	0.43
lcl\|BLLF01003656.1_cds_GFH27878.1_22355 (GFH27878)	0.31	0.52	0.0	0.35	0.4	0.35	0.35	0.36	0.37	0.72	0.37	0.31	0.25	0.3	0.23	0.81	1.0	0.62	0.38	0.32	0.86	0.65	0.43	0.42	0.26	0.41
lcl\|BLLF01003667.1_cds_GFH27905.1_22382 (GFH27905)	0.23	0.03	0.01	0.29	0.66	0.75	0.89	0.48	0.67	0.84	0.74	0.79	0.54	0.66	0.77	1.0	0.72	0.63	0.51	0.56	0.64	0.43	0.87	0.66	0.61	0.54
lcl\|BLLF01003883.1_cds_GFH28449.1_22926 (GFH28449)	0.27	0.04	0.0	0.18	0.45	0.67	0.74	0.34	0.72	0.46	0.71	0.99	0.62	0.65	0.71	0.32	0.48	0.92	0.0	0.57	0.46	0.27	1.0	0.57	0.72	0.76
lcl\|BLLF01004093.1_cds_GFH28903.1_23380 (GFH28903)	0.08	0.0	0.0	0.23	0.22	0.59	0.48	0.43	0.51	0.0	0.33	1.0	0.45	0.98	0.63	0.0	0.41	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.2	0.33
lcl\|BLLF01004254.1_cds_GFH29243.1_23720 (GFH29243)	0.18	0.09	0.24	0.32	0.58	0.77	0.72	0.31	0.63	0.26	0.8	0.58	0.61	0.53	0.36	0.76	0.76	1.0	0.27	0.46	0.67	0.24	0.59	0.73	0.78	0.42
lcl\|BLLF01004355.1_cds_GFH29459.1_23936 (GFH29459)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.1	0.05	0.14	0.54	0.0	0.0	0.1	0.0	0.15	0.2	0.0	0.0	0.36	0.0	0.31	1.0	0.0	0.36	0.06	0.17	0.42
lcl\|BLLF01004662.1_cds_GFH30030.1_24507 (GFH30030)	0.66	0.38	0.37	0.39	0.71	0.74	0.52	0.28	0.37	0.63	0.65	0.59	0.56	0.44	0.35	0.73	0.8	0.79	0.46	0.62	0.96	0.82	1.0	0.92	0.47	0.34
lcl\|BLLF01004828.1_cds_GFH30316.1_24793 (GFH30316)	0.2	0.19	0.0	0.25	0.4	0.53	0.39	0.29	0.31	0.91	0.33	0.38	0.5	0.34	0.42	0.53	0.73	0.99	0.89	0.7	1.0	0.26	0.88	0.45	0.03	0.04
lcl\|BLLF01004877.1_cds_GFH30397.1_24874 (GFH30397)	0.13	0.08	0.0	0.18	0.44	0.66	0.35	0.13	0.19	0.54	0.55	0.51	0.6	0.35	0.16	0.55	0.78	0.7	0.18	0.29	0.79	0.38	1.0	0.45	0.39	0.38
lcl\|BLLF01005329.1_cds_GFH31052.1_25529 (GFH31052)	0.38	0.06	0.0	0.08	0.28	0.63	0.51	0.36	0.37	0.35	0.42	0.57	0.55	0.54	0.37	1.0	0.69	0.62	0.64	0.48	0.59	0.4	0.9	0.62	0.33	0.39
lcl\|BLLF01005565.1_cds_GFH31361.1_25838 (GFH31361)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.28	0.96	0.61	0.28	0.26	0.0	0.42	0.83	0.38	0.59	0.09	0.64	0.0	1.0	0.54	0.19	0.53	0.38	0.45	0.13	0.23	0.27
lcl\|BLLF01005866.1_cds_GFH31715.1_26192 (GFH31715)	0.07	0.02	0.0	0.11	0.25	0.51	0.44	0.2	0.32	0.29	0.28	0.44	0.55	0.39	0.22	0.59	0.66	0.66	0.13	0.17	0.83	0.14	1.0	0.43	0.49	0.36
lcl\|BLLF01005870.1_cds_GFH31719.1_26196 (GFH31719)	0.07	0.14	0.0	0.39	0.36	0.55	0.47	0.15	0.41	0.51	0.48	0.44	0.43	0.35	0.32	1.0	0.62	0.66	0.8	0.64	0.65	0.2	0.96	0.49	0.32	0.22
lcl\|BLLF01007487.1_cds_GFH32973.1_27450 (GFH32973)	0.2	0.0	0.0	0.18	0.53	1.0	0.85	0.25	0.45	0.19	0.68	0.57	0.61	0.53	0.44	0.67	0.5	0.53	0.16	0.09	0.44	0.17	0.63	0.9	0.78	0.44
lcl\|BLLF01007963.1_cds_GFH33193.1_27670 (GFH33193)	0.16	0.03	0.0	0.21	0.58	0.9	0.76	0.4	0.63	0.57	0.66	0.61	0.9	0.64	0.41	0.81	0.54	1.0	0.2	0.23	0.97	0.58	0.69	0.58	0.55	0.52
lcl\|BLLF01008660.1_cds_GFH33476.1_27953 (GFH33476)	0.49	0.13	0.28	0.55	0.95	1.0	0.7	0.59	0.75	0.96	1.0	0.95	0.64	0.67	0.86	0.76	0.86	0.69	0.36	0.38	0.47	0.6	0.32	0.6	0.7	0.75
lcl\|BLLF01009376.1_cds_GFH33706.1_28183 (GFH33706)	0.37	0.25	0.07	0.15	0.71	0.8	0.68	0.52	0.77	0.27	0.69	0.58	0.72	0.58	0.61	0.67	0.53	0.67	0.22	0.36	1.0	0.37	0.56	0.45	0.21	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)