Heatmap: Cluster_293 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000013.1_cds_GFH05906.1_383 (GFH05906)	1.0	0.53	0.66	0.29	0.14	0.11	0.15	0.08	0.24	0.86	0.19	0.08	0.14	0.1	0.22	0.82	0.46	0.58	0.64	0.41	0.25	0.31	0.42	0.2	0.47	0.38
lcl\|BLLF01000017.1_cds_GFH05989.1_466 (GFH05989)	0.96	0.31	0.99	0.64	0.25	0.32	0.3	0.11	0.39	0.51	0.26	0.18	0.2	0.16	0.31	0.68	0.87	1.0	0.13	0.18	0.81	0.33	0.79	0.2	0.33	0.23
lcl\|BLLF01000106.1_cds_GFH07634.1_2111 (GFH07634)	0.22	0.22	0.62	0.86	0.1	0.05	0.15	0.11	0.18	0.59	0.11	0.05	0.13	0.06	0.17	0.3	0.16	1.0	0.58	0.29	0.48	0.37	0.81	0.43	0.39	0.35
lcl\|BLLF01000225.1_cds_GFH09332.1_3809 (GFH09332)	0.51	0.01	0.8	0.27	0.0	0.07	0.05	0.11	0.1	0.38	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.0	0.5	1.0	0.88	0.7	0.29	0.25	0.7	0.21	0.07	0.0
lcl\|BLLF01000295.1_cds_GFH10198.1_4675 (GFH10198)	0.29	0.02	0.44	0.57	0.19	0.14	0.18	0.02	0.26	0.8	0.18	0.08	0.12	0.09	0.19	0.66	0.51	1.0	0.23	0.44	0.89	0.22	0.58	0.06	0.19	0.25
lcl\|BLLF01000295.1_cds_GFH10206.1_4683 (GFH10206)	1.0	0.13	0.53	0.02	0.09	0.21	0.05	0.1	0.08	0.08	0.09	0.18	0.12	0.09	0.01	0.0	0.0	0.04	0.47	0.3	0.08	0.06	0.21	0.01	0.14	0.1
lcl\|BLLF01000315.1_cds_GFH10448.1_4925 (GFH10448)	0.92	0.95	0.79	0.04	0.2	0.11	0.2	0.15	0.29	0.78	0.14	0.12	0.16	0.12	0.31	0.94	0.36	0.97	0.12	0.51	0.77	0.13	1.0	0.29	0.38	0.27
lcl\|BLLF01000331.1_cds_GFH10624.1_5101 (GFH10624)	1.0	0.22	0.57	0.21	0.26	0.22	0.15	0.21	0.16	0.23	0.23	0.18	0.19	0.19	0.13	0.32	0.5	0.77	0.58	0.46	0.63	0.56	0.57	0.35	0.18	0.16
lcl\|BLLF01000375.1_cds_GFH11113.1_5590 (GFH11113)	0.66	0.61	0.66	0.63	0.34	0.3	0.51	0.26	0.47	0.42	0.37	0.32	0.33	0.22	0.43	0.37	0.33	0.84	0.45	0.69	0.88	0.85	1.0	0.84	0.52	0.29
lcl\|BLLF01000395.1_cds_GFH11350.1_5827 (GFH11350)	0.9	0.15	0.49	0.81	0.24	0.3	0.4	0.15	0.43	0.64	0.22	0.23	0.3	0.19	0.41	0.76	1.0	0.83	0.45	0.56	0.8	0.48	0.75	0.16	0.2	0.17
lcl\|BLLF01000427.1_cds_GFH11695.1_6172 (GFH11695)	0.16	0.16	0.12	0.41	0.12	0.17	0.17	0.15	0.15	0.41	0.26	0.13	0.15	0.12	0.06	0.52	0.4	0.75	0.39	0.31	0.37	0.36	1.0	0.32	0.43	0.26
lcl\|BLLF01000443.1_cds_GFH11867.1_6344 (GFH11867)	0.5	0.86	0.43	0.09	0.37	0.33	0.22	0.24	0.2	0.09	0.25	0.25	0.19	0.19	0.22	0.68	0.44	0.59	0.08	0.13	1.0	0.08	0.48	0.35	0.32	0.28
lcl\|BLLF01000514.1_cds_GFH12547.1_7024 (GFH12547)	1.0	0.3	0.49	0.37	0.19	0.24	0.21	0.11	0.18	0.3	0.27	0.24	0.33	0.18	0.26	0.34	0.44	0.62	0.47	0.4	0.55	0.54	0.57	0.09	0.41	0.37
lcl\|BLLF01000518.1_cds_GFH12592.1_7069 (GFH12592)	0.97	0.46	1.0	0.24	0.35	0.43	0.44	0.23	0.42	0.75	0.32	0.34	0.32	0.23	0.33	0.68	0.84	0.49	0.22	0.4	0.48	0.28	0.51	0.2	0.69	0.61
lcl\|BLLF01000547.1_cds_GFH12858.1_7335 (GFH12858)	1.0	0.3	0.38	0.31	0.29	0.2	0.2	0.17	0.19	0.27	0.21	0.29	0.26	0.24	0.27	0.59	0.59	0.77	0.08	0.52	0.62	0.92	0.77	0.26	0.35	0.4
lcl\|BLLF01000560.1_cds_GFH12976.1_7453 (GFH12976)	0.56	0.17	0.86	0.15	0.1	0.1	0.12	0.09	0.17	0.5	0.09	0.06	0.05	0.05	0.2	0.14	0.2	0.76	0.47	0.47	0.63	0.27	1.0	0.13	0.18	0.12
lcl\|BLLF01000561.1_cds_GFH12987.1_7464 (GFH12987)	0.75	0.32	0.93	0.32	0.12	0.31	0.34	0.17	0.18	0.38	0.18	0.35	0.15	0.22	0.22	0.56	0.37	1.0	0.17	0.39	0.77	0.39	0.86	0.48	0.41	0.3
lcl\|BLLF01000661.1_cds_GFH13868.1_8345 (GFH13868)	0.6	0.64	0.89	0.63	0.34	0.42	0.44	0.22	0.5	0.97	0.32	0.32	0.4	0.26	0.34	0.9	0.76	1.0	0.4	0.33	0.94	0.34	0.96	0.45	0.51	0.65
lcl\|BLLF01000766.1_cds_GFH14784.1_9261 (GFH14784)	0.71	0.15	0.54	0.6	0.21	0.24	0.34	0.12	0.36	0.29	0.23	0.2	0.22	0.14	0.3	0.62	1.0	0.7	0.49	0.14	0.64	0.27	0.49	0.24	0.17	0.14
lcl\|BLLF01000783.1_cds_GFH14924.1_9401 (GFH14924)	0.2	0.6	0.36	0.16	0.32	0.29	0.38	0.23	0.39	0.57	0.3	0.21	0.27	0.14	0.25	0.75	1.0	0.68	0.33	0.56	0.85	0.65	0.44	0.36	0.56	0.33
lcl\|BLLF01000793.1_cds_GFH15005.1_9482 (GFH15005)	0.03	0.54	0.76	0.05	0.23	0.27	0.28	0.15	0.28	1.0	0.36	0.22	0.43	0.32	0.2	0.53	0.0	0.78	0.29	0.36	0.63	0.18	0.72	0.3	0.24	0.1
lcl\|BLLF01000921.1_cds_GFH15929.1_10406 (GFH15929)	1.0	0.22	0.4	0.45	0.22	0.13	0.14	0.08	0.15	0.4	0.18	0.09	0.14	0.14	0.15	0.42	0.57	0.37	0.32	0.39	0.43	0.65	0.33	0.18	0.28	0.16
lcl\|BLLF01000986.1_cds_GFH16369.1_10846 (GFH16369)	0.3	0.24	0.14	0.29	0.15	0.19	0.12	0.07	0.04	0.04	0.14	0.18	0.13	0.15	0.05	0.65	0.7	0.41	0.41	0.62	0.32	0.65	1.0	0.25	0.24	0.14
lcl\|BLLF01001086.1_cds_GFH17037.1_11514 (GFH17037)	1.0	0.41	0.84	0.37	0.36	0.33	0.31	0.18	0.47	0.61	0.32	0.34	0.31	0.18	0.41	0.52	0.75	0.76	0.46	0.67	0.87	0.76	0.76	0.33	0.59	0.43
lcl\|BLLF01001561.1_cds_GFH20033.1_14510 (GFH20033)	0.87	0.59	1.0	0.01	0.06	0.06	0.08	0.04	0.07	0.9	0.04	0.03	0.01	0.03	0.09	0.31	0.21	0.46	0.0	0.17	0.0	0.3	0.54	0.05	0.07	0.03
lcl\|BLLF01001574.1_cds_GFH20099.1_14576 (GFH20099)	0.92	0.34	1.0	0.37	0.34	0.3	0.29	0.37	0.47	0.64	0.26	0.23	0.27	0.27	0.31	0.5	0.48	0.65	0.61	0.64	0.58	0.63	0.76	0.44	0.27	0.24
lcl\|BLLF01001577.1_cds_GFH20111.1_14588 (GFH20111)	0.39	0.62	0.41	0.62	0.34	0.29	0.28	0.25	0.25	0.36	0.35	0.23	0.26	0.25	0.25	0.72	0.63	0.65	0.42	0.51	0.64	0.61	1.0	0.5	0.49	0.41
lcl\|BLLF01001658.1_cds_GFH20565.1_15042 (GFH20565)	1.0	0.0	0.51	0.31	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.68	0.5	0.35	0.3	0.0	0.49	0.05	0.08	0.14
lcl\|BLLF01001670.1_cds_GFH20627.1_15104 (GFH20627)	0.57	0.48	0.39	0.03	0.09	0.07	0.17	0.05	0.16	0.63	0.11	0.06	0.12	0.09	0.17	0.25	0.25	0.48	0.28	0.25	1.0	0.3	0.52	0.25	0.2	0.15
lcl\|BLLF01001819.1_cds_GFH21390.1_15867 (GFH21390)	1.0	0.51	0.71	0.35	0.37	0.28	0.21	0.32	0.26	0.27	0.29	0.24	0.22	0.24	0.22	0.58	0.52	0.64	0.3	0.26	0.6	0.36	0.62	0.35	0.18	0.2
lcl\|BLLF01001921.1_cds_GFH21868.1_16345 (GFH21868)	0.34	0.59	0.67	0.25	0.21	0.31	0.26	0.12	0.29	0.63	0.24	0.21	0.2	0.17	0.28	0.97	1.0	0.66	0.25	0.18	0.53	0.65	0.94	0.46	0.41	0.4
lcl\|BLLF01001923.1_cds_GFH21882.1_16359 (GFH21882)	0.82	0.26	0.33	0.82	0.34	0.37	0.46	0.21	0.54	0.63	0.4	0.32	0.44	0.3	0.39	0.7	1.0	0.88	0.86	0.65	0.77	0.59	0.69	0.33	0.46	0.48
lcl\|BLLF01002047.1_cds_GFH22468.1_16945 (GFH22468)	0.5	0.29	0.65	0.75	0.13	0.2	0.24	0.07	0.27	0.49	0.19	0.13	0.18	0.12	0.21	0.39	0.55	1.0	0.36	0.57	0.38	0.38	0.84	0.32	0.2	0.25
lcl\|BLLF01002532.1_cds_GFH24421.1_18898 (GFH24421)	0.27	0.17	0.4	0.27	0.18	0.17	0.22	0.08	0.21	1.0	0.18	0.13	0.14	0.11	0.27	0.58	0.25	0.71	0.12	0.09	0.68	0.38	0.72	0.24	0.15	0.18
lcl\|BLLF01002548.1_cds_GFH24483.1_18960 (GFH24483)	0.53	0.58	0.98	0.52	0.33	0.36	0.27	0.25	0.39	1.0	0.25	0.18	0.32	0.25	0.2	0.56	0.56	0.96	0.81	0.94	0.68	0.78	0.73	0.33	0.44	0.56
lcl\|BLLF01002556.1_cds_GFH24519.1_18996 (GFH24519)	1.0	0.0	0.89	0.84	0.22	0.22	0.27	0.09	0.23	0.1	0.17	0.13	0.16	0.09	0.15	0.28	0.44	1.0	0.24	0.39	0.75	0.47	0.56	0.27	0.09	0.16
lcl\|BLLF01002752.1_cds_GFH25214.1_19691 (GFH25214)	0.3	0.08	0.23	0.37	0.38	0.31	0.37	0.13	0.44	0.69	0.36	0.29	0.38	0.2	0.34	0.63	0.84	0.77	0.48	0.4	1.0	0.31	0.66	0.22	0.23	0.33
lcl\|BLLF01002827.1_cds_GFH25480.1_19957 (GFH25480)	0.92	0.25	0.8	0.47	0.28	0.22	0.26	0.15	0.26	0.44	0.25	0.2	0.22	0.15	0.35	0.53	0.35	0.97	0.54	0.77	0.97	0.82	1.0	0.34	0.38	0.36
lcl\|BLLF01002827.1_cds_GFH25483.1_19960 (GFH25483)	0.74	0.5	1.0	0.51	0.09	0.07	0.11	0.06	0.14	0.76	0.07	0.06	0.07	0.05	0.14	0.76	0.37	0.75	0.45	0.41	0.73	0.66	0.47	0.17	0.2	0.18
lcl\|BLLF01003090.1_cds_GFH26312.1_20789 (GFH26312)	0.68	0.5	1.0	0.58	0.44	0.44	0.38	0.34	0.42	0.49	0.41	0.33	0.49	0.33	0.4	0.27	0.46	0.98	0.53	0.51	0.86	0.51	0.74	0.52	0.51	0.37
lcl\|BLLF01003619.1_cds_GFH27788.1_22265 (GFH27788)	0.28	0.3	0.65	0.49	0.06	0.16	0.5	0.02	0.39	0.07	0.11	0.16	0.15	0.07	0.3	0.93	1.0	0.66	0.26	0.6	0.77	0.43	0.94	0.34	0.2	0.17
lcl\|BLLF01004105.1_cds_GFH28928.1_23405 (GFH28928)	0.88	0.18	0.44	0.05	0.02	0.05	0.06	0.03	0.1	0.12	0.01	0.06	0.06	0.04	0.11	0.09	0.05	1.0	0.44	0.62	0.86	0.09	0.43	0.26	0.04	0.03
lcl\|BLLF01005087.1_cds_GFH30715.1_25192 (GFH30715)	0.95	0.95	0.7	0.14	0.17	0.2	0.26	0.11	0.25	0.88	0.19	0.16	0.12	0.13	0.17	0.8	0.44	0.71	0.56	0.38	0.98	0.33	0.74	1.0	0.12	0.13
lcl\|BLLF01005337.1_cds_GFH31059.1_25536 (GFH31059)	0.38	0.02	0.77	0.53	0.15	0.22	0.32	0.23	0.39	1.0	0.28	0.21	0.38	0.27	0.37	0.48	0.58	0.68	0.3	0.06	0.87	0.63	0.7	0.32	0.4	0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)