Heatmap: Cluster_214 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000027.1_cds_GFH06196.1_673 (GFH06196)	0.0	0.05	0.21	0.57	0.29	0.04	0.01	0.02	0.01	0.17	0.17	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.0	0.02	1.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.04	0.29
lcl\|BLLF01000064.1_cds_GFH06935.1_1412 (GFH06935)	0.29	0.13	0.0	0.16	0.2	0.15	0.12	0.14	0.12	0.56	0.2	0.14	0.19	0.16	0.12	0.35	0.3	0.24	0.22	1.0	0.22	0.1	0.3	0.05	0.1	0.2
lcl\|BLLF01000075.1_cds_GFH07122.1_1599 (GFH07122)	0.02	0.0	0.0	0.1	0.12	0.02	0.02	0.0	0.01	0.12	0.04	0.04	0.01	0.0	0.01	0.34	0.3	0.02	0.03	1.0	0.01	0.04	0.03	0.0	0.01	0.06
lcl\|BLLF01000104.1_cds_GFH07591.1_2068 (GFH07591)	0.23	0.02	0.04	0.35	0.22	0.09	0.06	0.03	0.06	0.12	0.11	0.06	0.03	0.03	0.01	0.19	0.39	0.21	0.12	1.0	0.2	0.02	0.21	0.08	0.05	0.23
lcl\|BLLF01000119.1_cds_GFH07838.1_2315 (GFH07838)	0.15	0.0	0.0	0.13	0.37	0.14	0.08	0.17	0.07	0.13	0.32	0.14	0.11	0.17	0.07	0.21	0.22	0.18	0.06	1.0	0.15	0.02	0.09	0.06	0.19	0.17
lcl\|BLLF01000140.1_cds_GFH08131.1_2608 (GFH08131)	0.06	0.04	0.16	0.28	0.27	0.14	0.11	0.14	0.14	0.37	0.19	0.1	0.09	0.12	0.07	0.12	0.37	0.22	0.22	1.0	0.14	0.17	0.16	0.12	0.06	0.16
lcl\|BLLF01000274.1_cds_GFH09911.1_4388 (GFH09911)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.12	0.08	0.0	0.01	0.02	0.09	0.03	0.0	0.01	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.11
lcl\|BLLF01000293.1_cds_GFH10179.1_4656 (GFH10179)	0.17	0.0	0.0	0.19	0.31	0.08	0.03	0.05	0.03	0.26	0.19	0.08	0.03	0.02	0.04	0.27	0.1	0.16	0.0	1.0	0.07	0.12	0.08	0.03	0.08	0.15
lcl\|BLLF01000360.1_cds_GFH10946.1_5423 (GFH10946)	0.34	0.08	0.0	0.26	0.01	0.0	0.02	0.0	0.02	0.19	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.18	0.07	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0	0.07	0.08	0.0	0.03
lcl\|BLLF01000400.1_cds_GFH11408.1_5885 (GFH11408)	0.12	0.04	0.0	0.17	0.17	0.07	0.15	0.06	0.12	0.27	0.15	0.13	0.06	0.04	0.1	0.1	0.09	0.1	0.07	1.0	0.19	0.11	0.0	0.09	0.07	0.14
lcl\|BLLF01000476.1_cds_GFH12176.1_6653 (GFH12176)	0.06	0.01	0.0	0.17	0.21	0.05	0.03	0.02	0.01	0.15	0.08	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.0	0.02	1.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.05	0.09
lcl\|BLLF01000492.1_cds_GFH12329.1_6806 (GFH12329)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.14	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
lcl\|BLLF01000492.1_cds_GFH12330.1_6807 (GFH12330)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000517.1_cds_GFH12573.1_7050 (GFH12573)	0.04	0.13	0.0	0.06	0.16	0.06	0.03	0.02	0.01	0.13	0.07	0.08	0.02	0.02	0.01	0.37	0.11	0.1	0.0	1.0	0.17	0.0	0.05	0.04	0.1	0.08
lcl\|BLLF01000539.1_cds_GFH12778.1_7255 (GFH12778)	0.12	0.0	0.0	0.14	0.13	0.09	0.04	0.01	0.07	0.32	0.12	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.26	0.34	0.1	1.0	0.14	0.16	0.1	0.03	0.05	0.13
lcl\|BLLF01000566.1_cds_GFH13015.1_7492 (GFH13015)	0.1	0.04	0.01	0.09	0.18	0.13	0.05	0.05	0.04	0.24	0.07	0.1	0.04	0.04	0.03	0.03	0.09	0.07	0.08	1.0	0.09	0.14	0.07	0.02	0.05	0.05
lcl\|BLLF01000650.1_cds_GFH13767.1_8244 (GFH13767)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.34	0.06	0.02	0.0	0.0	0.13	0.14	0.08	0.0	0.01	0.02	0.09	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.09
lcl\|BLLF01000650.1_cds_GFH13771.1_8248 (GFH13771)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.42	0.07	0.03	0.01	0.0	0.07	0.2	0.09	0.0	0.02	0.02	0.04	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.14
lcl\|BLLF01000780.1_cds_GFH14902.1_9379 (GFH14902)	0.02	0.0	0.0	0.05	0.12	0.07	0.07	0.11	0.06	0.34	0.07	0.08	0.05	0.07	0.04	0.05	0.06	0.09	0.04	1.0	0.3	0.15	0.17	0.15	0.05	0.03
lcl\|BLLF01000800.1_cds_GFH15058.1_9535 (GFH15058)	0.02	0.0	0.0	0.13	0.23	0.09	0.02	0.01	0.03	0.45	0.22	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.24	0.07	0.0	1.0	0.0	0.04	0.02	0.01	0.03	0.1
lcl\|BLLF01000818.1_cds_GFH15196.1_9673 (GFH15196)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.1	0.06	0.0	0.0	0.07	0.04	0.18	0.0	0.01	0.06	0.1	0.07	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.1
lcl\|BLLF01000837.1_cds_GFH15331.1_9808 (GFH15331)	0.04	0.06	0.12	0.18	0.2	0.09	0.05	0.05	0.07	0.18	0.12	0.05	0.06	0.05	0.03	0.16	0.27	0.19	0.37	1.0	0.22	0.08	0.11	0.03	0.05	0.19
lcl\|BLLF01001169.1_cds_GFH17572.1_12049 (GFH17572)	0.01	0.0	0.0	0.05	0.18	0.08	0.05	0.08	0.03	0.12	0.11	0.08	0.06	0.11	0.04	0.02	0.1	0.03	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.04	0.07
lcl\|BLLF01001394.1_cds_GFH19026.1_13503 (GFH19026)	0.14	0.05	0.0	0.1	0.23	0.08	0.06	0.04	0.05	0.31	0.17	0.05	0.05	0.04	0.05	0.24	0.4	0.08	0.05	1.0	0.08	0.11	0.11	0.08	0.04	0.23
lcl\|BLLF01001436.1_cds_GFH19284.1_13761 (GFH19284)	0.05	0.04	0.0	0.06	0.15	0.11	0.06	0.04	0.06	0.23	0.14	0.09	0.07	0.05	0.05	0.13	0.27	0.15	0.34	1.0	0.2	0.05	0.14	0.02	0.04	0.08
lcl\|BLLF01001495.1_cds_GFH19638.1_14115 (GFH19638)	0.05	0.0	0.0	0.48	0.3	0.05	0.03	0.01	0.02	0.31	0.12	0.04	0.0	0.01	0.02	0.04	0.09	0.0	0.01	1.0	0.05	0.05	0.01	0.01	0.12	0.19
lcl\|BLLF01001759.1_cds_GFH21083.1_15560 (GFH21083)	0.29	0.04	0.01	0.23	0.23	0.14	0.12	0.09	0.12	0.16	0.19	0.16	0.08	0.06	0.1	0.22	0.32	0.06	0.03	1.0	0.1	0.09	0.12	0.09	0.17	0.21
lcl\|BLLF01002020.1_cds_GFH22347.1_16824 (GFH22347)	0.18	0.04	0.28	0.15	0.23	0.13	0.08	0.08	0.1	0.23	0.17	0.12	0.07	0.06	0.1	0.06	0.05	0.23	0.15	1.0	0.16	0.11	0.15	0.07	0.17	0.25
lcl\|BLLF01002046.1_cds_GFH22465.1_16942 (GFH22465)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.04	0.04	0.05	0.06	0.08	0.14	0.05	0.04	0.06	0.07	0.0	0.0	0.08	0.13	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.02	0.06
lcl\|BLLF01002099.1_cds_GFH22684.1_17161 (GFH22684)	0.06	0.0	0.0	0.4	0.28	0.0	0.05	0.0	0.1	0.0	0.11	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.42
lcl\|BLLF01002247.1_cds_GFH23327.1_17804 (GFH23327)	0.35	0.1	0.0	0.05	0.19	0.27	0.17	0.19	0.18	0.35	0.24	0.21	0.22	0.23	0.2	0.23	0.28	0.16	0.22	1.0	0.25	0.29	0.17	0.07	0.16	0.27
lcl\|BLLF01002695.1_cds_GFH25025.1_19502 (GFH25025)	0.05	0.01	0.0	0.03	0.31	0.05	0.04	0.02	0.02	0.13	0.15	0.04	0.01	0.01	0.02	0.12	0.28	0.02	0.04	1.0	0.02	0.06	0.01	0.0	0.07	0.27
lcl\|BLLF01002792.1_cds_GFH25357.1_19834 (GFH25357)	0.18	0.08	0.07	0.11	0.32	0.13	0.09	0.13	0.11	0.45	0.25	0.15	0.11	0.12	0.11	0.18	0.15	0.27	0.11	1.0	0.32	0.23	0.19	0.18	0.12	0.13
lcl\|BLLF01002839.1_cds_GFH25527.1_20004 (GFH25527)	0.06	0.05	0.0	0.21	0.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.09	0.08	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	1.0	0.12	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04
lcl\|BLLF01003735.1_cds_GFH28086.1_22563 (GFH28086)	0.07	0.0	0.0	0.16	0.3	0.08	0.04	0.03	0.03	0.18	0.16	0.04	0.02	0.03	0.01	0.13	0.05	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.01	0.03	0.17
lcl\|BLLF01003735.1_cds_GFH28087.1_22564 (GFH28087)	0.1	0.03	0.0	0.17	0.28	0.1	0.03	0.03	0.02	0.1	0.14	0.06	0.02	0.05	0.05	0.23	0.22	0.05	0.02	1.0	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17
lcl\|BLLF01003927.1_cds_GFH28546.1_23023 (GFH28546)	0.36	0.07	0.0	0.15	0.11	0.12	0.03	0.07	0.04	0.42	0.12	0.12	0.04	0.07	0.04	0.07	0.3	0.34	0.12	1.0	0.25	0.04	0.29	0.1	0.14	0.14
lcl\|BLLF01004008.1_cds_GFH28725.1_23202 (GFH28725)	0.06	0.16	0.0	0.09	0.22	0.09	0.08	0.01	0.04	0.15	0.11	0.13	0.01	0.01	0.02	0.19	0.11	0.02	0.0	1.0	0.1	0.03	0.0	0.01	0.13	0.26
lcl\|BLLF01004294.1_cds_GFH29331.1_23808 (GFH29331)	0.06	0.01	0.0	0.07	0.16	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.16	0.26	0.05	0.0	1.0	0.08	0.05	0.08	0.03	0.02	0.03
lcl\|BLLF01004852.1_cds_GFH30360.1_24837 (GFH30360)	0.27	0.08	0.31	0.39	0.34	0.17	0.1	0.24	0.15	0.35	0.28	0.13	0.14	0.2	0.15	0.14	0.23	0.32	0.07	1.0	0.24	0.15	0.2	0.05	0.1	0.36
lcl\|BLLF01005051.1_cds_GFH30665.1_25142 (GFH30665)	0.46	0.04	0.0	0.09	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.07	0.14	0.21	1.0	0.19	0.0	0.07	0.08	0.02	0.0
lcl\|BLLF01005794.1_cds_GFH31645.1_26122 (GFH31645)	0.1	0.03	0.05	0.07	0.17	0.12	0.09	0.05	0.08	0.29	0.15	0.09	0.06	0.06	0.05	0.12	0.17	0.09	0.09	1.0	0.05	0.05	0.09	0.03	0.08	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)