Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000002.1_cds_GFH05570.1_47 (GFH05570)	0.37	0.6	0.0	0.02	0.2	0.19	0.18	0.31	0.21	0.54	0.18	0.15	0.16	0.19	0.17	0.25	0.31	0.98	0.41	0.78	1.0	0.71	0.81	0.24	0.17	0.2
lcl\|BLLF01000011.1_cds_GFH05864.1_341 (GFH05864)	0.34	0.58	0.26	0.52	0.25	0.33	0.47	0.21	0.52	0.91	0.26	0.3	0.45	0.23	0.41	0.33	0.49	1.0	0.42	0.24	0.83	0.38	0.68	0.28	0.15	0.17
lcl\|BLLF01000071.1_cds_GFH07051.1_1528 (GFH07051)	0.3	0.78	0.41	0.23	0.65	0.53	0.56	0.77	0.81	1.0	0.64	0.38	0.52	0.52	0.63	0.4	0.23	0.82	0.57	0.58	0.78	0.3	0.69	0.34	0.98	0.77
lcl\|BLLF01000140.1_cds_GFH08144.1_2621 (GFH08144)	0.43	0.45	0.0	0.34	0.14	0.14	0.27	0.3	0.4	1.0	0.42	0.41	0.49	0.54	0.59	0.12	0.22	0.47	0.2	0.89	0.38	0.09	0.35	0.03	0.49	0.54
lcl\|BLLF01000166.1_cds_GFH08512.1_2989 (GFH08512)	0.8	0.78	0.57	0.53	0.93	0.7	0.63	0.83	0.78	1.0	0.71	0.62	0.57	0.54	0.7	0.72	0.91	0.7	0.46	0.7	0.66	0.64	0.62	0.44	0.64	0.62
lcl\|BLLF01000176.1_cds_GFH08666.1_3143 (GFH08666)	0.32	0.51	0.0	0.02	0.25	0.29	0.22	0.46	0.26	0.56	0.28	0.26	0.23	0.32	0.26	0.28	0.33	0.76	0.34	0.62	1.0	0.55	0.71	0.43	0.29	0.44
lcl\|BLLF01000203.1_cds_GFH09028.1_3505 (GFH09028)	0.26	1.0	0.0	0.19	0.5	0.43	0.36	0.41	0.32	0.94	0.42	0.48	0.35	0.37	0.3	0.4	0.43	0.66	0.1	0.59	0.67	0.49	0.65	0.44	0.45	0.32
lcl\|BLLF01000260.1_cds_GFH09760.1_4237 (GFH09760)	0.67	0.3	0.17	0.35	0.31	0.25	0.26	0.49	0.3	0.59	0.42	0.3	0.18	0.39	0.35	0.2	0.34	0.87	0.34	0.62	1.0	0.46	0.75	0.51	0.36	0.58
lcl\|BLLF01000282.1_cds_GFH10045.1_4522 (GFH10045)	1.0	0.97	0.0	0.24	0.37	0.16	0.3	0.41	0.23	0.78	0.35	0.28	0.54	0.2	0.5	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.13	0.07
lcl\|BLLF01000296.1_cds_GFH10217.1_4694 (GFH10217)	0.45	0.99	0.59	0.21	0.41	0.33	0.21	0.49	0.31	1.0	0.37	0.33	0.32	0.4	0.31	0.28	0.33	0.69	0.43	0.49	0.69	0.47	0.53	0.17	0.21	0.27
lcl\|BLLF01000356.1_cds_GFH10886.1_5363 (GFH10886)	0.58	0.68	0.16	0.18	0.4	0.36	0.35	0.51	0.52	1.0	0.42	0.4	0.59	0.41	0.57	0.3	0.19	0.53	0.54	0.57	0.67	0.62	0.51	0.33	0.5	0.43
lcl\|BLLF01000389.1_cds_GFH11270.1_5747 (GFH11270)	0.46	1.0	0.35	0.07	0.45	0.3	0.34	0.52	0.37	0.65	0.39	0.33	0.31	0.32	0.29	0.68	0.63	0.21	0.12	0.23	0.22	0.12	0.18	0.3	0.42	0.41
lcl\|BLLF01000394.1_cds_GFH11341.1_5818 (GFH11341)	0.19	1.0	0.0	0.48	0.51	0.31	0.29	0.26	0.22	0.92	0.29	0.12	0.13	0.28	0.27	0.15	0.22	0.88	0.0	0.8	0.62	0.22	0.81	0.26	0.74	0.16
lcl\|BLLF01000565.1_cds_GFH13011.1_7488 (GFH13011)	0.75	0.89	0.41	0.41	0.56	0.55	0.39	0.61	0.52	0.76	0.55	0.48	0.49	0.53	0.44	0.36	0.45	1.0	0.6	0.54	0.87	0.37	0.88	0.46	0.34	0.41
lcl\|BLLF01000579.1_cds_GFH13128.1_7605 (GFH13128)	0.54	1.0	0.2	0.05	0.39	0.26	0.18	0.34	0.17	0.7	0.26	0.23	0.17	0.28	0.17	0.28	0.64	0.49	0.36	0.57	0.63	0.12	0.4	0.08	0.37	0.37
lcl\|BLLF01000643.1_cds_GFH13712.1_8189 (GFH13712)	0.16	1.0	0.2	0.33	0.44	0.34	0.23	0.41	0.26	0.4	0.45	0.33	0.36	0.36	0.2	0.08	0.22	0.54	0.17	0.32	0.59	0.2	0.38	0.13	0.1	0.1
lcl\|BLLF01000680.1_cds_GFH14047.1_8524 (GFH14047)	0.43	0.79	0.0	0.02	0.75	0.62	0.41	0.6	0.45	1.0	0.57	0.39	0.52	0.45	0.3	0.27	0.29	0.77	0.73	0.28	0.65	0.33	0.62	0.25	0.38	0.35
lcl\|BLLF01000702.1_cds_GFH14224.1_8701 (GFH14224)	0.69	0.48	0.27	0.47	0.34	0.29	0.23	0.55	0.34	0.57	0.28	0.26	0.35	0.41	0.35	0.24	0.16	0.98	0.61	0.51	1.0	0.1	0.72	0.31	0.44	0.24
lcl\|BLLF01000739.1_cds_GFH14547.1_9024 (GFH14547)	0.18	1.0	0.21	0.08	0.34	0.39	0.21	0.48	0.27	0.22	0.32	0.41	0.32	0.4	0.25	0.16	0.14	0.24	0.32	0.45	0.22	0.09	0.23	0.16	0.15	0.13
lcl\|BLLF01000764.1_cds_GFH14772.1_9249 (GFH14772)	0.34	1.0	0.02	0.15	0.32	0.54	0.66	0.26	0.68	0.81	0.32	0.32	0.5	0.24	0.56	0.53	0.57	0.61	0.33	0.36	0.91	0.45	0.64	0.18	0.3	0.3
lcl\|BLLF01000874.1_cds_GFH15610.1_10087 (GFH15610)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.26	0.37	0.47	0.15	0.46	0.23	0.37	0.23	0.47	0.27	0.38	0.13	0.2	0.42	0.13	0.0	0.7	0.27	0.25	0.0	0.14	0.21
lcl\|BLLF01000950.1_cds_GFH16125.1_10602 (GFH16125)	0.06	1.0	0.0	0.0	0.32	0.32	0.2	0.36	0.18	0.61	0.2	0.15	0.23	0.14	0.22	0.44	0.16	0.48	0.51	0.35	0.62	0.2	0.39	0.41	0.99	0.28
lcl\|BLLF01000950.1_cds_GFH16126.1_10603 (GFH16126)	0.07	1.0	0.2	0.0	0.17	0.17	0.14	0.17	0.12	1.0	0.11	0.07	0.1	0.1	0.13	0.32	0.15	0.25	0.92	0.03	0.5	0.06	0.31	0.2	0.48	0.21
lcl\|BLLF01001101.1_cds_GFH17131.1_11608 (GFH17131)	0.47	0.89	0.42	0.29	0.51	0.5	0.44	0.69	0.55	1.0	0.49	0.52	0.56	0.48	0.49	0.41	0.28	0.7	0.29	0.51	0.82	0.54	0.6	0.35	0.77	0.93
lcl\|BLLF01001138.1_cds_GFH17376.1_11853 (GFH17376)	0.43	0.95	0.21	0.18	0.42	0.26	0.24	0.5	0.3	1.0	0.32	0.41	0.29	0.3	0.35	0.45	0.15	0.29	0.1	0.25	0.35	0.49	0.32	0.18	0.3	0.26
lcl\|BLLF01001139.1_cds_GFH17382.1_11859 (GFH17382)	0.2	0.85	0.0	0.01	0.28	0.29	0.5	0.45	0.64	0.41	0.29	0.23	0.56	0.3	0.5	0.62	0.4	0.69	0.26	0.25	1.0	0.44	0.75	0.1	0.27	0.31
lcl\|BLLF01001141.1_cds_GFH17393.1_11870 (GFH17393)	0.35	0.26	0.0	0.16	0.4	0.36	0.21	0.41	0.28	0.33	0.4	0.19	0.21	0.26	0.22	0.35	0.36	0.78	0.72	0.83	0.89	0.55	1.0	0.42	0.06	0.16
lcl\|BLLF01001322.1_cds_GFH18572.1_13049 (GFH18572)	0.49	0.99	0.04	0.13	0.35	0.32	0.26	0.58	0.39	1.0	0.37	0.32	0.44	0.42	0.36	0.38	0.33	0.8	0.28	0.45	0.86	0.24	0.66	0.1	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001505.1_cds_GFH19694.1_14171 (GFH19694)	1.0	0.77	0.0	0.11	0.38	0.07	0.36	0.39	0.26	0.0	0.52	0.34	0.33	0.31	0.36	0.35	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.02	0.06	0.0
lcl\|BLLF01001769.1_cds_GFH21147.1_15624 (GFH21147)	0.2	0.69	0.0	0.0	0.34	0.66	0.9	0.34	0.98	0.9	0.31	0.29	0.32	0.32	0.51	1.0	0.43	0.15	0.3	0.29	0.31	0.32	0.15	0.07	0.17	0.3
lcl\|BLLF01001987.1_cds_GFH22191.1_16668 (GFH22191)	0.15	0.87	0.05	0.19	0.56	0.32	0.36	0.53	0.34	1.0	0.52	0.29	0.37	0.47	0.26	0.09	0.23	0.64	0.2	0.34	0.3	0.04	0.53	0.15	0.54	0.44
lcl\|BLLF01002036.1_cds_GFH22421.1_16898 (GFH22421)	0.38	1.0	0.55	0.2	0.54	0.46	0.4	0.55	0.49	0.83	0.43	0.4	0.42	0.42	0.48	0.48	0.42	0.34	0.27	0.52	0.46	0.84	0.47	0.38	0.5	0.52
lcl\|BLLF01002036.1_cds_GFH22423.1_16900 (GFH22423)	0.56	0.68	0.0	0.1	0.47	0.5	0.42	0.5	0.47	0.89	0.44	0.44	0.41	0.4	0.32	0.4	0.34	0.67	0.53	0.94	0.54	1.0	0.35	0.3	0.43	0.42
lcl\|BLLF01002178.1_cds_GFH23033.1_17510 (GFH23033)	0.41	0.84	0.0	0.11	0.65	0.62	0.2	0.82	0.29	0.33	0.44	0.19	0.49	0.73	0.17	0.12	0.09	1.0	0.54	0.0	1.0	0.0	0.45	0.08	0.15	0.15
lcl\|BLLF01002252.1_cds_GFH23352.1_17829 (GFH23352)	0.49	0.42	0.0	0.18	0.41	0.3	0.25	0.44	0.37	0.82	0.32	0.24	0.3	0.31	0.29	0.47	0.53	0.99	0.58	0.97	1.0	0.53	0.6	0.45	0.33	0.33
lcl\|BLLF01002361.1_cds_GFH23784.1_18261 (GFH23784)	0.41	1.0	0.0	0.0	0.26	0.42	0.55	0.36	0.63	0.29	0.32	0.26	0.35	0.68	0.37	0.64	0.9	0.45	0.07	0.0	0.81	0.29	0.45	0.16	0.17	0.39
lcl\|BLLF01002472.1_cds_GFH24206.1_18683 (GFH24206)	0.14	0.66	0.0	0.09	0.43	0.67	0.86	0.23	0.79	0.71	0.45	0.4	0.59	0.28	0.49	1.0	0.74	0.39	0.26	0.48	0.78	0.14	0.43	0.08	0.32	0.28
lcl\|BLLF01002577.1_cds_GFH24589.1_19066 (GFH24589)	1.0	0.57	0.0	0.0	0.6	0.33	0.27	0.62	0.5	0.75	0.65	0.34	0.39	0.42	0.37	0.64	0.36	0.23	0.14	0.45	0.22	0.45	0.34	0.21	0.78	0.34
lcl\|BLLF01002751.1_cds_GFH25211.1_19688 (GFH25211)	0.25	1.0	0.0	0.29	0.33	0.25	0.15	0.47	0.26	0.97	0.48	0.34	0.29	0.35	0.28	0.24	0.12	0.74	0.3	0.47	0.74	0.2	0.61	0.37	0.39	0.24
lcl\|BLLF01002766.1_cds_GFH25263.1_19740 (GFH25263)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.44	0.77	0.08	0.37	0.8	0.1	0.27	0.49	0.03	0.22	0.19	0.35	0.59	0.77	0.12	0.41	0.12	0.36	0.01	0.39	0.27
lcl\|BLLF01002881.1_cds_GFH25663.1_20140 (GFH25663)	0.45	0.66	0.12	0.23	0.35	0.35	0.43	0.26	0.47	1.0	0.32	0.29	0.48	0.25	0.35	0.38	0.41	0.83	0.45	0.44	0.7	0.74	0.52	0.23	0.31	0.33
lcl\|BLLF01002905.1_cds_GFH25738.1_20215 (GFH25738)	0.76	0.87	0.0	0.26	0.67	0.46	0.36	0.59	0.46	1.0	0.57	0.5	0.43	0.42	0.47	0.45	0.82	0.55	0.42	0.47	0.51	0.46	0.55	0.28	0.41	0.22
lcl\|BLLF01003168.1_cds_GFH26563.1_21040 (GFH26563)	0.35	0.55	0.07	0.32	0.43	0.44	0.48	0.42	0.51	0.73	0.36	0.35	0.5	0.41	0.42	0.38	0.76	1.0	0.34	0.49	0.69	0.21	0.75	0.42	0.58	0.47
lcl\|BLLF01003497.1_cds_GFH27497.1_21974 (GFH27497)	0.48	1.0	0.01	0.2	0.22	0.27	0.37	0.28	0.45	0.38	0.32	0.38	0.34	0.35	0.59	0.79	0.39	0.62	0.14	0.52	0.74	0.42	0.59	0.2	0.46	0.64
lcl\|BLLF01003626.1_cds_GFH27805.1_22282 (GFH27805)	0.43	0.94	0.2	0.15	0.47	0.32	0.3	0.55	0.39	0.72	0.4	0.27	0.41	0.39	0.41	0.32	0.41	0.97	0.42	0.78	1.0	0.63	0.75	0.3	0.44	0.6
lcl\|BLLF01004243.1_cds_GFH29220.1_23697 (GFH29220)	0.36	0.68	0.0	0.38	0.24	0.27	0.28	0.25	0.43	0.63	0.42	0.25	0.27	0.27	0.2	0.0	0.38	1.0	0.0	0.42	0.83	0.16	0.89	0.27	0.83	0.7
lcl\|BLLF01004317.1_cds_GFH29375.1_23852 (GFH29375)	0.21	0.86	0.0	0.12	0.46	0.4	0.3	0.53	0.28	0.89	0.31	0.28	0.72	0.32	0.5	0.15	0.08	1.0	0.38	0.77	0.77	0.42	0.9	0.13	0.38	0.3
lcl\|BLLF01004422.1_cds_GFH29575.1_24052 (GFH29575)	0.46	1.0	0.55	0.21	0.58	0.39	0.37	0.53	0.43	0.8	0.5	0.41	0.49	0.37	0.36	0.46	0.56	0.62	0.4	0.39	0.77	0.22	0.65	0.25	0.31	0.46
lcl\|BLLF01005281.1_cds_GFH31000.1_25477 (GFH31000)	0.02	1.0	0.0	0.13	0.3	0.28	0.3	0.12	0.34	0.06	0.26	0.21	0.28	0.12	0.28	0.1	0.06	0.37	0.11	0.19	0.42	0.16	0.29	0.03	0.01	0.02
lcl\|BLLF01005452.1_cds_GFH31216.1_25693 (GFH31216)	0.35	1.0	0.0	0.1	0.44	0.5	0.3	0.45	0.3	0.97	0.4	0.41	0.45	0.36	0.3	0.15	0.13	0.81	0.22	0.36	0.68	0.4	0.5	0.13	0.21	0.82
lcl\|BLLF01006433.1_cds_GFH32251.1_26728 (GFH32251)	0.74	1.0	0.11	0.56	0.52	0.45	0.34	0.76	0.52	0.76	0.48	0.4	0.42	0.4	0.6	0.24	0.38	0.38	0.11	0.35	0.37	0.21	0.27	0.17	0.32	0.29
lcl\|BLLF01007411.1_cds_GFH32939.1_27416 (GFH32939)	0.95	1.0	0.0	0.0	0.18	0.47	0.49	0.3	0.31	0.0	0.44	0.31	0.33	0.3	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01007940.1_cds_GFH33186.1_27663 (GFH33186)	0.13	1.0	0.0	0.25	0.45	0.39	0.37	0.49	0.49	0.68	0.46	0.21	0.26	0.21	0.26	0.32	0.0	0.58	0.12	0.28	0.8	0.0	0.25	0.06	0.58	0.7
lcl\|BLLF01009365.1_cds_GFH33702.1_28179 (GFH33702)	0.12	0.64	0.0	0.03	0.39	0.25	0.12	0.39	0.1	1.0	0.28	0.22	0.25	0.25	0.13	0.16	0.23	0.39	0.04	0.34	0.47	0.4	0.36	0.09	0.38	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)