Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000007.1_cds_GFH05740.1_217 (GFH05740)	0.06	0.62	1.0	0.21	0.06	0.04	0.06	0.16	0.1	0.05	0.05	0.07	0.1	0.16	0.11	0.15	0.19	0.16	0.09	0.09	0.1	0.06	0.11	0.24	0.11	0.08
lcl\|BLLF01000010.1_cds_GFH05827.1_304 (GFH05827)	0.15	0.31	1.0	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.1	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.19	0.06	0.16	0.07	0.12	0.03	0.07	0.16	0.04	0.07	0.07
lcl\|BLLF01000122.1_cds_GFH07883.1_2360 (GFH07883)	0.0	0.05	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01000161.1_cds_GFH08435.1_2912 (GFH08435)	0.05	0.04	1.0	0.07	0.01	0.0	0.02	0.03	0.02	0.17	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.0	0.02	0.05	0.0	0.02	0.02	0.0	0.08	0.0	0.05	0.03
lcl\|BLLF01000207.1_cds_GFH09084.1_3561 (GFH09084)	0.0	0.29	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.06	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.07	0.0	0.0	0.46	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.02	0.05	0.05
lcl\|BLLF01000220.1_cds_GFH09262.1_3739 (GFH09262)	0.0	0.51	1.0	0.0	0.03	0.01	0.06	0.0	0.04	0.0	0.03	0.05	0.02	0.0	0.07	0.0	0.0	0.19	0.23	0.0	0.04	0.0	0.08	0.0	0.09	0.07
lcl\|BLLF01000255.1_cds_GFH09706.1_4183 (GFH09706)	0.0	0.33	1.0	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.09	0.02	0.01	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.05	0.07	0.0	0.07	0.08	0.0	0.03	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000341.1_cds_GFH10732.1_5209 (GFH10732)	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01000384.1_cds_GFH11225.1_5702 (GFH11225)	0.02	0.38	1.0	0.6	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.0	0.2	0.0	0.06	0.15	0.16	0.13	0.06	0.11	0.04
lcl\|BLLF01000428.1_cds_GFH11716.1_6193 (GFH11716)	0.03	0.0	1.0	0.02	0.0	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0
lcl\|BLLF01000442.1_cds_GFH11856.1_6333 (GFH11856)	0.0	0.09	1.0	0.0	0.01	0.08	0.09	0.04	0.1	0.06	0.04	0.02	0.05	0.0	0.18	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.19	0.27
lcl\|BLLF01000446.1_cds_GFH11898.1_6375 (GFH11898)	0.04	0.11	1.0	0.08	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.17	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.15	0.08	0.09	0.15	0.12	0.18	0.14	0.05	0.01	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000511.1_cds_GFH12505.1_6982 (GFH12505)	0.0	0.0	1.0	0.02	0.07	0.04	0.03	0.05	0.04	0.25	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.0	0.13	0.0	0.0	0.17	0.0	0.11	0.01	0.0	0.01
lcl\|BLLF01000619.1_cds_GFH13497.1_7974 (GFH13497)	0.05	0.46	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000687.1_cds_GFH14110.1_8587 (GFH14110)	0.04	0.03	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000768.1_cds_GFH14799.1_9276 (GFH14799)	0.0	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07
lcl\|BLLF01000801.1_cds_GFH15061.1_9538 (GFH15061)	0.06	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.32	0.02	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.13	0.06	0.19	0.0	0.0	0.03	0.06	0.05
lcl\|BLLF01000864.1_cds_GFH15529.1_10006 (GFH15529)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001024.1_cds_GFH16618.1_11095 (GFH16618)	0.14	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.0	0.04	0.02	0.02	0.1	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.01	0.02	0.0
lcl\|BLLF01001025.1_cds_GFH16624.1_11101 (GFH16624)	0.06	0.12	1.0	0.08	0.14	0.07	0.07	0.06	0.1	0.42	0.11	0.15	0.16	0.1	0.08	0.0	0.09	0.0	0.0	0.3	0.13	0.29	0.18	0.08	0.08	0.07
lcl\|BLLF01001109.1_cds_GFH17188.1_11665 (GFH17188)	0.0	0.45	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.2	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.14	0.06	0.0	0.06	0.14	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0
lcl\|BLLF01001152.1_cds_GFH17466.1_11943 (GFH17466)	0.0	0.23	1.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.04	0.02	0.01	0.02	0.0	0.01	0.03	0.05	0.04
lcl\|BLLF01001197.1_cds_GFH17764.1_12241 (GFH17764)	0.07	0.04	1.0	0.11	0.19	0.18	0.17	0.09	0.17	0.11	0.15	0.09	0.12	0.08	0.2	0.16	0.1	0.06	0.22	0.09	0.09	0.13	0.04	0.03	0.03	0.08
lcl\|BLLF01001298.1_cds_GFH18415.1_12892 (GFH18415)	0.0	0.59	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01001327.1_cds_GFH18611.1_13088 (GFH18611)	0.0	0.01	1.0	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02	0.04	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.14	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02
lcl\|BLLF01001488.1_cds_GFH19590.1_14067 (GFH19590)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001489.1_cds_GFH19599.1_14076 (GFH19599)	0.0	0.41	1.0	0.15	0.03	0.02	0.05	0.01	0.0	0.05	0.01	0.01	0.0	0.03	0.01	0.0	0.12	0.19	0.0	0.0	0.43	0.0	0.11	0.07	0.03	0.02
lcl\|BLLF01001540.1_cds_GFH19907.1_14384 (GFH19907)	0.02	0.19	1.0	0.03	0.05	0.1	0.05	0.08	0.13	0.23	0.06	0.07	0.07	0.06	0.08	0.1	0.12	0.1	0.0	0.04	0.09	0.03	0.05	0.03	0.09	0.11
lcl\|BLLF01001551.1_cds_GFH19977.1_14454 (GFH19977)	0.0	0.03	1.0	0.08	0.1	0.12	0.14	0.08	0.14	0.0	0.1	0.14	0.16	0.08	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.02	0.14	0.17
lcl\|BLLF01001612.1_cds_GFH20307.1_14784 (GFH20307)	0.05	0.22	1.0	0.04	0.14	0.06	0.06	0.09	0.12	0.41	0.09	0.06	0.14	0.11	0.11	0.11	0.04	0.08	0.21	0.23	0.05	0.21	0.03	0.04	0.05	0.11
lcl\|BLLF01001752.1_cds_GFH21047.1_15524 (GFH21047)	0.13	0.42	1.0	0.02	0.08	0.05	0.18	0.08	0.18	0.16	0.13	0.05	0.08	0.06	0.12	0.23	0.06	0.06	0.0	0.0	0.16	0.1	0.12	0.1	0.08	0.06
lcl\|BLLF01001924.1_cds_GFH21885.1_16362 (GFH21885)	0.08	0.12	1.0	0.05	0.13	0.13	0.05	0.03	0.05	0.19	0.08	0.1	0.09	0.04	0.03	0.0	0.08	0.12	0.06	0.07	0.23	0.07	0.12	0.03	0.14	0.07
lcl\|BLLF01001943.1_cds_GFH21977.1_16454 (GFH21977)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.05
lcl\|BLLF01002196.1_cds_GFH23118.1_17595 (GFH23118)	0.09	0.06	1.0	0.0	0.05	0.06	0.05	0.02	0.03	0.15	0.12	0.04	0.06	0.02	0.04	0.0	0.04	0.04	0.13	0.14	0.12	0.13	0.17	0.04	0.05	0.13
lcl\|BLLF01002235.1_cds_GFH23281.1_17758 (GFH23281)	0.02	0.02	1.0	0.22	0.0	0.01	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01002584.1_cds_GFH24613.1_19090 (GFH24613)	0.06	0.26	1.0	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.02
lcl\|BLLF01002648.1_cds_GFH24847.1_19324 (GFH24847)	0.06	0.24	1.0	0.0	0.04	0.08	0.09	0.02	0.04	0.16	0.12	0.04	0.05	0.03	0.02	0.15	0.11	0.09	0.06	0.13	0.13	0.07	0.1	0.03	0.04	0.03
lcl\|BLLF01002661.1_cds_GFH24896.1_19373 (GFH24896)	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01
lcl\|BLLF01002743.1_cds_GFH25182.1_19659 (GFH25182)	0.19	0.07	1.0	0.08	0.02	0.03	0.07	0.03	0.07	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.02	0.29	0.04	0.03	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.01	0.04	0.06
lcl\|BLLF01002965.1_cds_GFH25933.1_20410 (GFH25933)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003010.1_cds_GFH26064.1_20541 (GFH26064)	0.24	0.38	1.0	0.25	0.19	0.19	0.09	0.13	0.13	0.05	0.19	0.12	0.15	0.16	0.1	0.31	0.34	0.13	0.13	0.19	0.28	0.03	0.22	0.09	0.13	0.11
lcl\|BLLF01003090.1_cds_GFH26313.1_20790 (GFH26313)	0.09	0.02	1.0	0.0	0.1	0.07	0.09	0.06	0.08	0.0	0.07	0.05	0.13	0.02	0.02	0.14	0.0	0.0	0.0	0.2	0.11	0.0	0.08	0.02	0.05	0.07
lcl\|BLLF01003294.1_cds_GFH26937.1_21414 (GFH26937)	0.03	0.14	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.0	0.09	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01003316.1_cds_GFH27005.1_21482 (GFH27005)	0.11	0.54	1.0	0.51	0.12	0.16	0.13	0.13	0.12	0.08	0.18	0.07	0.13	0.1	0.13	0.18	0.18	0.17	0.07	0.04	0.24	0.07	0.13	0.07	0.2	0.18
lcl\|BLLF01003383.1_cds_GFH27190.1_21667 (GFH27190)	0.01	0.1	1.0	0.07	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.16	0.03	0.03	0.01	0.04	0.05	0.0	0.08	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0
lcl\|BLLF01003621.1_cds_GFH27792.1_22269 (GFH27792)	0.07	0.07	1.0	0.13	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.12	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02
lcl\|BLLF01003635.1_cds_GFH27823.1_22300 (GFH27823)	0.03	0.06	1.0	0.0	0.03	0.02	0.04	0.07	0.05	0.1	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.06	0.24	0.09	0.0	0.11	0.07	0.37	0.16
lcl\|BLLF01003680.1_cds_GFH27937.1_22414 (GFH27937)	0.0	0.05	1.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.04	0.0	0.0	0.11	0.0	0.09	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.08	0.04	0.02
lcl\|BLLF01003734.1_cds_GFH28081.1_22558 (GFH28081)	0.0	0.0	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003989.1_cds_GFH28681.1_23158 (GFH28681)	0.04	0.14	1.0	0.02	0.07	0.07	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.09	0.1	0.06	0.03	0.0	0.0	0.04	0.02	0.06	0.07
lcl\|BLLF01004189.1_cds_GFH29114.1_23591 (GFH29114)	0.0	0.53	1.0	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.09	0.1	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.02	0.02	0.03	0.02	0.13	0.06	0.02	0.03	0.03	0.04
lcl\|BLLF01004719.1_cds_GFH30127.1_24604 (GFH30127)	0.05	0.03	1.0	0.28	0.15	0.07	0.02	0.01	0.06	0.09	0.1	0.02	0.04	0.02	0.03	0.06	0.11	0.0	0.0	0.27	0.1	0.0	0.09	0.0	0.01	0.07
lcl\|BLLF01004876.1_cds_GFH30391.1_24868 (GFH30391)	0.06	0.02	1.0	0.1	0.01	0.02	0.04	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03
lcl\|BLLF01004903.1_cds_GFH30440.1_24917 (GFH30440)	0.0	0.41	1.0	0.0	0.05	0.07	0.07	0.06	0.03	0.0	0.11	0.14	0.1	0.1	0.02	0.0	0.16	0.13	0.19	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.26
lcl\|BLLF01005005.1_cds_GFH30590.1_25067 (GFH30590)	0.0	0.57	1.0	0.09	0.08	0.08	0.1	0.05	0.16	0.13	0.05	0.08	0.1	0.08	0.12	0.0	0.0	0.02	0.34	0.27	0.04	0.01	0.0	0.0	0.32	0.3
lcl\|BLLF01005440.1_cds_GFH31204.1_25681 (GFH31204)	0.06	0.31	1.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.07	0.02	0.02	0.02	0.05	0.0	0.04	0.34	0.11	0.0	0.07	0.23	0.09	0.02	0.04	0.04
lcl\|BLLF01005587.1_cds_GFH31389.1_25866 (GFH31389)	0.03	0.18	1.0	0.0	0.07	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02
lcl\|BLLF01005991.1_cds_GFH31840.1_26317 (GFH31840)	0.02	0.01	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.14	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
lcl\|BLLF01006096.1_cds_GFH31944.1_26421 (GFH31944)	0.1	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006886.1_cds_GFH32627.1_27104 (GFH32627)	0.27	0.42	1.0	0.05	0.18	0.13	0.15	0.22	0.17	0.18	0.23	0.19	0.13	0.13	0.29	0.1	0.03	0.22	0.16	0.37	0.04	0.05	0.22	0.23	0.31	0.1
lcl\|BLLF01007590.1_cds_GFH33018.1_27495 (GFH33018)	0.06	0.04	1.0	0.0	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.05	0.03	0.0	0.07	0.0	0.0	0.06	0.29	0.0	0.21	0.01	0.16	0.13
lcl\|BLLF01007677.1_cds_GFH33062.1_27539 (GFH33062)	0.01	0.35	1.0	0.11	0.1	0.05	0.08	0.06	0.03	0.32	0.08	0.09	0.08	0.01	0.06	0.03	0.08	0.2	0.12	0.52	0.18	0.0	0.1	0.01	0.04	0.06
lcl\|BLLF01008203.1_cds_GFH33285.1_27762 (GFH33285)	0.0	0.02	1.0	0.1	0.06	0.08	0.07	0.05	0.12	0.0	0.07	0.09	0.06	0.04	0.08	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.11	0.13	0.0	0.02	0.11	0.09
lcl\|BLLF01008205.1_cds_GFH33287.1_27764 (GFH33287)	0.07	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.04	0.0	0.08	0.01	0.04	0.03	0.07	0.1	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.02
lcl\|BLLF01008804.1_cds_GFH33527.1_28004 (GFH33527)	0.04	0.46	1.0	0.03	0.19	0.07	0.08	0.14	0.03	0.05	0.07	0.04	0.12	0.06	0.08	0.0	0.0	0.06	0.15	0.16	0.16	0.0	0.0	0.06	0.13	0.26
lcl\|BLLF01009281.1_cds_GFH33669.1_28146 (GFH33669)	0.0	0.21	1.0	0.01	0.1	0.11	0.04	0.03	0.12	0.1	0.06	0.07	0.1	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.17
lcl\|BLLF01009620.1_cds_GFH33777.1_28254 (GFH33777)	0.02	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)