Heatmap: Cluster_157 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000059.1_cds_GFH06836.1_1313 (GFH06836)	1.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.16	0.21	0.03	0.07	0.05	0.02	0.11	0.08	0.0	0.1	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
lcl\|BLLF01000063.1_cds_GFH06925.1_1402 (GFH06925)	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.08	0.0	0.08	0.36	0.01	0.02	0.01	0.01	0.1	0.0	0.05	0.08	0.1	0.04	0.04	0.08	0.06	0.02	0.02	0.01
lcl\|BLLF01000085.1_cds_GFH07279.1_1756 (GFH07279)	1.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.04	0.04	0.1	0.06	0.06	0.03	0.05	0.02	0.09	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.25	0.08
lcl\|BLLF01000101.1_cds_GFH07537.1_2014 (GFH07537)	1.0	0.0	0.0	0.2	0.01	0.01	0.04	0.01	0.12	0.3	0.02	0.02	0.02	0.03	0.14	0.12	0.0	0.05	0.15	0.0	0.0	0.13	0.0	0.01	0.07	0.02
lcl\|BLLF01000101.1_cds_GFH07538.1_2015 (GFH07538)	1.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.16	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
lcl\|BLLF01000102.1_cds_GFH07563.1_2040 (GFH07563)	1.0	0.0	0.04	0.09	0.02	0.02	0.11	0.03	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.03	0.04
lcl\|BLLF01000201.1_cds_GFH09001.1_3478 (GFH09001)	1.0	0.01	0.0	0.03	0.14	0.15	0.21	0.08	0.23	0.07	0.13	0.11	0.13	0.07	0.23	0.04	0.05	0.17	0.08	0.07	0.15	0.08	0.17	0.06	0.13	0.13
lcl\|BLLF01000211.1_cds_GFH09133.1_3610 (GFH09133)	1.0	0.0	0.02	0.73	0.02	0.01	0.11	0.0	0.22	0.05	0.04	0.0	0.04	0.01	0.1	0.07	0.05	0.05	0.08	0.05	0.0	0.52	0.11	0.0	0.25	0.11
lcl\|BLLF01000361.1_cds_GFH10957.1_5434 (GFH10957)	1.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.17	0.0	0.08	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.04	0.13	0.1	0.15	0.0	0.0	0.14	0.0	0.2	0.03	0.0	0.01
lcl\|BLLF01000361.1_cds_GFH10958.1_5435 (GFH10958)	1.0	0.0	0.03	0.1	0.01	0.01	0.1	0.01	0.08	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.15	0.15	0.11	0.03	0.02	0.06	0.04	0.09	0.01	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000418.1_cds_GFH11615.1_6092 (GFH11615)	1.0	0.0	0.0	0.09	0.01	0.01	0.14	0.0	0.11	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.18	0.01	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000418.1_cds_GFH11616.1_6093 (GFH11616)	1.0	0.03	0.0	0.2	0.04	0.06	0.11	0.02	0.14	0.18	0.05	0.03	0.05	0.02	0.15	0.1	0.07	0.06	0.08	0.02	0.04	0.07	0.07	0.01	0.1	0.08
lcl\|BLLF01000418.1_cds_GFH11617.1_6094 (GFH11617)	1.0	0.0	0.0	0.16	0.04	0.05	0.15	0.03	0.18	0.34	0.06	0.04	0.06	0.02	0.15	0.12	0.22	0.16	0.17	0.11	0.04	0.16	0.09	0.05	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000438.1_cds_GFH11809.1_6286 (GFH11809)	1.0	0.01	0.03	0.13	0.03	0.04	0.09	0.06	0.26	0.12	0.04	0.05	0.07	0.05	0.21	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.12	0.21	0.15
lcl\|BLLF01000539.1_cds_GFH12780.1_7257 (GFH12780)	1.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.02	0.03	0.0	0.18	0.06	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.39	0.16
lcl\|BLLF01000636.1_cds_GFH13651.1_8128 (GFH13651)	1.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.02	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01000733.1_cds_GFH14503.1_8980 (GFH14503)	1.0	0.03	0.0	0.62	0.0	0.02	0.05	0.0	0.14	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.12	0.06	0.0	0.28	0.16	0.09	0.39	0.03	0.0	0.19	0.04
lcl\|BLLF01000839.1_cds_GFH15349.1_9826 (GFH15349)	1.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.13	0.03	0.1	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000843.1_cds_GFH15383.1_9860 (GFH15383)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000898.1_cds_GFH15772.1_10249 (GFH15772)	1.0	0.0	0.06	0.2	0.01	0.0	0.06	0.0	0.09	0.05	0.0	0.01	0.01	0.0	0.09	0.04	0.05	0.06	0.02	0.01	0.06	0.4	0.06	0.0	0.09	0.02
lcl\|BLLF01001098.1_cds_GFH17111.1_11588 (GFH17111)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.07	0.27	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02
lcl\|BLLF01001192.1_cds_GFH17731.1_12208 (GFH17731)	1.0	0.0	0.01	0.11	0.0	0.0	0.09	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.17	0.09	0.17	0.09	0.0	0.02	0.02	0.07	0.02	0.0	0.02	0.0
lcl\|BLLF01001218.1_cds_GFH17883.1_12360 (GFH17883)	1.0	0.03	0.03	0.88	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.03	0.01
lcl\|BLLF01001405.1_cds_GFH19097.1_13574 (GFH19097)	1.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.05	0.03	0.0
lcl\|BLLF01001484.1_cds_GFH19561.1_14038 (GFH19561)	1.0	0.01	0.21	0.28	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.01	0.19	0.04
lcl\|BLLF01001724.1_cds_GFH20915.1_15392 (GFH20915)	1.0	0.09	0.24	0.43	0.07	0.05	0.05	0.02	0.1	0.11	0.04	0.02	0.01	0.03	0.08	0.06	0.11	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.01	0.03	0.02
lcl\|BLLF01001978.1_cds_GFH22146.1_16623 (GFH22146)	1.0	0.02	0.0	0.38	0.04	0.05	0.05	0.04	0.23	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.0	0.08	0.0	0.01	0.12	0.12
lcl\|BLLF01002021.1_cds_GFH22351.1_16828 (GFH22351)	1.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.05	0.08	0.06	0.09	0.19	0.03	0.05	0.09	0.08	0.12	0.1	0.06	0.12	0.03	0.03	0.1	0.03	0.13	0.03	0.02	0.04
lcl\|BLLF01002021.1_cds_GFH22353.1_16830 (GFH22353)	1.0	0.01	0.04	0.1	0.01	0.01	0.05	0.01	0.11	0.16	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.04
lcl\|BLLF01002430.1_cds_GFH24056.1_18533 (GFH24056)	1.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.01	0.05	0.02	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.0	0.11	0.07
lcl\|BLLF01002470.1_cds_GFH24193.1_18670 (GFH24193)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.17	0.25	0.0	0.0	0.01	0.0	0.13	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01002491.1_cds_GFH24283.1_18760 (GFH24283)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.07	0.09	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.05	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.04	0.06	0.04	0.11	0.05
lcl\|BLLF01002619.1_cds_GFH24735.1_19212 (GFH24735)	1.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.02	0.0	0.09	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.13	0.05	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01
lcl\|BLLF01003050.1_cds_GFH26185.1_20662 (GFH26185)	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0	0.21	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.02
lcl\|BLLF01003050.1_cds_GFH26186.1_20663 (GFH26186)	1.0	0.0	0.02	0.11	0.0	0.01	0.05	0.01	0.11	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.18	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01003192.1_cds_GFH26651.1_21128 (GFH26651)	1.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003434.1_cds_GFH27323.1_21800 (GFH27323)	1.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.01	0.06	0.0	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.0	0.14	0.02	0.04	0.03	0.01
lcl\|BLLF01003749.1_cds_GFH28115.1_22592 (GFH28115)	1.0	0.01	0.0	0.18	0.07	0.1	0.1	0.04	0.23	0.3	0.06	0.06	0.05	0.03	0.12	0.05	0.07	0.05	0.01	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05
lcl\|BLLF01004018.1_cds_GFH28748.1_23225 (GFH28748)	1.0	0.12	0.0	0.48	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0
lcl\|BLLF01004118.1_cds_GFH28954.1_23431 (GFH28954)	1.0	0.01	0.24	0.52	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.12	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02
lcl\|BLLF01004456.1_cds_GFH29650.1_24127 (GFH29650)	1.0	0.0	0.0	0.07	0.01	0.0	0.03	0.01	0.15	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.0	0.0	0.04	0.18	0.03	0.0	0.06	0.0	0.01	0.1	0.03
lcl\|BLLF01004499.1_cds_GFH29732.1_24209 (GFH29732)	1.0	0.02	0.0	0.07	0.03	0.03	0.08	0.1	0.19	0.11	0.08	0.03	0.05	0.03	0.21	0.04	0.07	0.07	0.0	0.06	0.09	0.05	0.0	0.05	0.18	0.16
lcl\|BLLF01004506.1_cds_GFH29748.1_24225 (GFH29748)	1.0	0.2	0.0	0.63	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.05	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004649.1_cds_GFH30010.1_24487 (GFH30010)	1.0	0.0	0.0	0.26	0.01	0.01	0.12	0.0	0.14	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.24	0.01	0.02	0.01	0.08	0.0	0.02	0.05	0.01	0.0	0.05	0.02
lcl\|BLLF01004674.1_cds_GFH30045.1_24522 (GFH30045)	1.0	0.0	0.0	0.53	0.01	0.01	0.24	0.0	0.34	0.04	0.0	0.01	0.03	0.0	0.12	0.11	0.04	0.0	0.34	0.04	0.0	0.86	0.04	0.01	0.02	0.02
lcl\|BLLF01004674.1_cds_GFH30046.1_24523 (GFH30046)	1.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.05	0.0	0.08	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.01	0.31	0.06	0.02	0.43	0.01	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004961.1_cds_GFH30519.1_24996 (GFH30519)	1.0	0.01	0.2	0.23	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.0	0.16	0.01	0.01	0.15	0.06
lcl\|BLLF01005085.1_cds_GFH30709.1_25186 (GFH30709)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.05	0.02	0.16	0.05	0.01	0.03	0.03	0.0	0.06	0.18	0.1	0.0	0.16	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0
lcl\|BLLF01005293.1_cds_GFH31016.1_25493 (GFH31016)	1.0	0.0	0.0	0.33	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.04	0.02	0.12	0.03
lcl\|BLLF01006614.1_cds_GFH32410.1_26887 (GFH32410)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.27	0.0	0.15	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.14	0.0	0.08	0.0	0.73	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.02	0.0
lcl\|BLLF01006911.1_cds_GFH32647.1_27124 (GFH32647)	1.0	0.0	0.0	0.33	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.04	0.02	0.12	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)