Heatmap: Cluster_233 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000014.1_cds_GFH05934.1_411 (GFH05934)	0.21	0.18	0.31	0.06	0.17	0.13	0.15	0.17	0.22	0.34	0.16	0.14	0.18	0.14	0.33	1.0	0.66	0.82	0.39	0.61	0.92	0.21	0.7	0.34	0.23	0.14
lcl\|BLLF01000038.1_cds_GFH06431.1_908 (GFH06431)	0.07	0.35	0.0	0.07	0.3	0.23	0.2	0.16	0.21	0.31	0.26	0.18	0.15	0.18	0.09	1.0	0.78	0.54	0.21	0.21	0.73	0.22	0.49	0.28	0.27	0.39
lcl\|BLLF01000046.1_cds_GFH06605.1_1082 (GFH06605)	0.13	0.12	0.0	0.0	0.07	0.09	0.06	0.06	0.08	0.17	0.07	0.04	0.05	0.04	0.03	1.0	0.39	0.26	0.08	0.17	0.4	0.24	0.19	0.24	0.17	0.21
lcl\|BLLF01000103.1_cds_GFH07573.1_2050 (GFH07573)	0.15	0.16	0.12	0.12	0.13	0.16	0.1	0.07	0.1	0.27	0.19	0.13	0.11	0.11	0.07	1.0	0.5	0.64	0.29	0.41	0.76	0.33	0.37	0.32	0.26	0.28
lcl\|BLLF01000107.1_cds_GFH07637.1_2114 (GFH07637)	0.09	0.16	0.0	0.03	0.13	0.15	0.1	0.08	0.09	0.41	0.15	0.07	0.08	0.11	0.04	1.0	0.5	0.6	0.14	0.18	0.75	0.21	0.38	0.22	0.12	0.28
lcl\|BLLF01000107.1_cds_GFH07643.1_2120 (GFH07643)	0.13	0.21	0.1	0.06	0.18	0.2	0.16	0.11	0.17	0.59	0.18	0.11	0.14	0.13	0.1	1.0	0.29	0.5	0.17	0.21	0.74	0.19	0.46	0.17	0.17	0.33
lcl\|BLLF01000107.1_cds_GFH07648.1_2125 (GFH07648)	0.07	0.02	0.0	0.02	0.1	0.11	0.08	0.08	0.07	0.17	0.12	0.09	0.07	0.08	0.04	1.0	0.42	0.51	0.11	0.09	0.59	0.18	0.3	0.19	0.08	0.13
lcl\|BLLF01000107.1_cds_GFH07653.1_2130 (GFH07653)	0.15	0.03	0.0	0.01	0.07	0.18	0.13	0.03	0.07	0.36	0.04	0.13	0.08	0.05	0.03	1.0	0.22	0.41	0.0	0.48	0.45	0.09	0.38	0.32	0.14	0.25
lcl\|BLLF01000144.1_cds_GFH08190.1_2667 (GFH08190)	0.11	0.33	0.12	0.11	0.38	0.29	0.24	0.23	0.18	0.46	0.39	0.24	0.21	0.26	0.12	1.0	0.5	0.47	0.12	0.16	0.64	0.21	0.42	0.36	0.18	0.3
lcl\|BLLF01000189.1_cds_GFH08856.1_3333 (GFH08856)	0.22	0.08	0.0	0.02	0.06	0.04	0.05	0.11	0.13	0.13	0.07	0.07	0.1	0.07	0.16	1.0	0.54	0.45	0.21	0.53	0.51	0.13	0.5	0.23	0.15	0.08
lcl\|BLLF01000193.1_cds_GFH08909.1_3386 (GFH08909)	0.13	0.05	0.01	0.02	0.1	0.11	0.1	0.07	0.12	0.06	0.07	0.09	0.08	0.06	0.09	1.0	0.12	0.08	0.04	0.14	0.11	0.09	0.07	0.25	0.18	0.21
lcl\|BLLF01000202.1_cds_GFH09015.1_3492 (GFH09015)	0.04	0.11	0.0	0.02	0.14	0.16	0.15	0.14	0.15	0.13	0.1	0.11	0.07	0.1	0.09	1.0	0.11	0.08	0.02	0.06	0.09	0.1	0.1	0.21	0.2	0.48
lcl\|BLLF01000240.1_cds_GFH09513.1_3990 (GFH09513)	0.0	0.15	0.0	0.0	0.02	0.0	0.08	0.02	0.05	0.16	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0	0.52	0.18	0.0	0.15	0.49	0.0	0.18	0.13	0.08	0.13
lcl\|BLLF01000270.1_cds_GFH09862.1_4339 (GFH09862)	0.26	0.17	0.01	0.09	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.32	0.03	0.04	0.04	0.03	0.12	1.0	0.41	0.41	0.03	0.12	0.39	0.06	0.24	0.13	0.05	0.08
lcl\|BLLF01000288.1_cds_GFH10114.1_4591 (GFH10114)	0.11	0.18	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	1.0	0.27	0.18	0.11	0.28	0.32	0.21	0.17	0.2	0.07	0.14
lcl\|BLLF01000323.1_cds_GFH10533.1_5010 (GFH10533)	0.08	0.01	0.0	0.01	0.11	0.17	0.14	0.07	0.12	0.25	0.12	0.11	0.12	0.09	0.07	1.0	0.44	0.34	0.13	0.09	0.44	0.13	0.36	0.37	0.13	0.15
lcl\|BLLF01000430.1_cds_GFH11734.1_6211 (GFH11734)	0.19	0.03	0.0	0.07	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.14	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	1.0	0.43	0.14	0.0	0.29	0.19	0.15	0.16	0.17	0.01	0.02
lcl\|BLLF01000461.1_cds_GFH12031.1_6508 (GFH12031)	0.36	0.05	0.0	0.0	0.02	0.02	0.05	0.06	0.02	0.24	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	1.0	0.17	0.5	0.06	0.16	0.59	0.21	0.18	0.17	0.04	0.1
lcl\|BLLF01000540.1_cds_GFH12793.1_7270 (GFH12793)	0.03	0.03	0.0	0.15	0.0	0.11	0.02	0.03	0.02	0.09	0.04	0.05	0.1	0.04	0.03	1.0	0.34	0.33	0.1	0.17	0.45	0.26	0.45	0.32	0.19	0.3
lcl\|BLLF01000582.1_cds_GFH13157.1_7634 (GFH13157)	0.1	0.14	0.04	0.05	0.1	0.16	0.12	0.15	0.15	0.18	0.1	0.09	0.08	0.1	0.09	1.0	0.27	0.24	0.14	0.15	0.3	0.18	0.32	0.23	0.08	0.19
lcl\|BLLF01000590.1_cds_GFH13249.1_7726 (GFH13249)	0.1	0.16	0.0	0.0	0.05	0.02	0.03	0.03	0.07	0.45	0.08	0.06	0.13	0.04	0.11	1.0	0.54	0.29	0.0	0.12	0.2	0.0	0.21	0.1	0.11	0.11
lcl\|BLLF01000810.1_cds_GFH15131.1_9608 (GFH15131)	0.27	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.04	0.06	0.01	0.21	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	1.0	0.36	0.69	0.17	0.17	0.51	0.33	0.35	0.28	0.03	0.02
lcl\|BLLF01000836.1_cds_GFH15320.1_9797 (GFH15320)	0.17	0.07	0.0	0.11	0.05	0.11	0.09	0.05	0.12	0.51	0.08	0.05	0.1	0.06	0.1	1.0	0.45	0.42	0.02	0.2	0.53	0.16	0.23	0.23	0.05	0.07
lcl\|BLLF01000843.1_cds_GFH15386.1_9863 (GFH15386)	0.04	0.02	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	1.0	0.3	0.26	0.08	0.38	0.43	0.06	0.23	0.11	0.02	0.01
lcl\|BLLF01000852.1_cds_GFH15455.1_9932 (GFH15455)	0.09	0.05	0.0	0.08	0.07	0.07	0.08	0.05	0.11	0.13	0.06	0.05	0.05	0.03	0.05	1.0	0.16	0.5	0.15	0.24	0.67	0.27	0.62	0.33	0.15	0.35
lcl\|BLLF01001103.1_cds_GFH17144.1_11621 (GFH17144)	0.39	0.02	0.0	0.04	0.05	0.04	0.04	0.09	0.05	0.08	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	1.0	0.21	0.08	0.02	0.08	0.21	0.05	0.03	0.18	0.17	0.11
lcl\|BLLF01001104.1_cds_GFH17150.1_11627 (GFH17150)	0.07	0.07	0.21	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.03	0.23	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	1.0	0.44	0.26	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.09	0.07	0.06
lcl\|BLLF01001164.1_cds_GFH17537.1_12014 (GFH17537)	0.0	0.1	0.17	0.17	0.12	0.16	0.11	0.07	0.13	0.15	0.13	0.12	0.08	0.07	0.1	1.0	0.31	0.7	0.09	0.21	0.63	0.3	0.34	0.27	0.12	0.19
lcl\|BLLF01001412.1_cds_GFH19140.1_13617 (GFH19140)	0.02	0.26	0.24	0.05	0.07	0.04	0.04	0.04	0.04	0.1	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	1.0	0.7	0.27	0.16	0.48	0.25	0.16	0.23	0.11	0.08	0.07
lcl\|BLLF01001554.1_cds_GFH19992.1_14469 (GFH19992)	0.01	0.16	0.0	0.15	0.11	0.12	0.09	0.07	0.08	0.19	0.11	0.08	0.08	0.08	0.05	1.0	0.41	0.46	0.08	0.22	0.57	0.31	0.46	0.33	0.15	0.16
lcl\|BLLF01001641.1_cds_GFH20469.1_14946 (GFH20469)	0.19	0.21	0.0	0.14	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.13	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	1.0	0.34	0.19	0.12	0.15	0.32	0.08	0.19	0.2	0.0	0.02
lcl\|BLLF01001650.1_cds_GFH20514.1_14991 (GFH20514)	0.02	0.1	0.0	0.04	0.14	0.06	0.02	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.02	1.0	0.07	0.78	0.0	0.22	0.65	0.23	0.35	0.42	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001848.1_cds_GFH21532.1_16009 (GFH21532)	0.18	0.28	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.32	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	1.0	0.38	0.57	0.29	0.13	0.61	0.24	0.34	0.04	0.05	0.02
lcl\|BLLF01001980.1_cds_GFH22161.1_16638 (GFH22161)	0.09	0.05	0.0	0.11	0.13	0.18	0.12	0.09	0.1	0.08	0.11	0.11	0.11	0.11	0.08	1.0	0.46	0.37	0.26	0.22	0.41	0.26	0.35	0.29	0.1	0.11
lcl\|BLLF01002111.1_cds_GFH22728.1_17205 (GFH22728)	0.04	0.03	0.0	0.03	0.07	0.14	0.13	0.06	0.12	0.4	0.11	0.09	0.11	0.13	0.09	1.0	0.55	0.47	0.13	0.08	0.44	0.13	0.38	0.16	0.1	0.22
lcl\|BLLF01002196.1_cds_GFH23116.1_17593 (GFH23116)	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.07	0.0	1.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.12
lcl\|BLLF01002249.1_cds_GFH23338.1_17815 (GFH23338)	0.11	0.05	0.12	0.09	0.18	0.15	0.15	0.06	0.13	0.14	0.16	0.06	0.12	0.12	0.02	1.0	0.5	0.19	0.0	0.41	0.43	0.05	0.28	0.12	0.06	0.1
lcl\|BLLF01002419.1_cds_GFH24016.1_18493 (GFH24016)	0.0	0.14	0.01	0.09	0.05	0.07	0.04	0.03	0.04	0.07	0.06	0.04	0.05	0.03	0.02	1.0	0.6	0.63	0.06	0.09	0.62	0.0	0.3	0.08	0.09	0.26
lcl\|BLLF01002497.1_cds_GFH24302.1_18779 (GFH24302)	0.15	0.1	0.0	0.0	0.09	0.05	0.09	0.08	0.03	0.46	0.1	0.08	0.06	0.07	0.06	1.0	0.17	0.47	0.12	0.13	0.52	0.11	0.62	0.09	0.16	0.14
lcl\|BLLF01002532.1_cds_GFH24423.1_18900 (GFH24423)	0.09	0.14	0.0	0.09	0.03	0.09	0.07	0.02	0.03	0.45	0.1	0.01	0.06	0.04	0.02	1.0	0.35	0.49	0.06	0.07	0.85	0.13	0.65	0.17	0.09	0.08
lcl\|BLLF01002795.1_cds_GFH25366.1_19843 (GFH25366)	0.35	0.0	0.0	0.23	0.17	0.08	0.1	0.05	0.07	0.18	0.11	0.03	0.06	0.1	0.08	1.0	0.81	0.34	0.07	0.09	0.13	0.23	0.1	0.29	0.16	0.23
lcl\|BLLF01002859.1_cds_GFH25597.1_20074 (GFH25597)	0.08	0.06	0.0	0.02	0.11	0.13	0.1	0.08	0.09	0.14	0.12	0.11	0.11	0.11	0.04	1.0	0.62	0.43	0.03	0.11	0.49	0.15	0.48	0.36	0.11	0.16
lcl\|BLLF01003012.1_cds_GFH26072.1_20549 (GFH26072)	0.26	0.1	0.0	0.05	0.16	0.2	0.16	0.12	0.13	0.33	0.13	0.13	0.12	0.12	0.09	1.0	0.42	0.27	0.12	0.21	0.36	0.28	0.28	0.26	0.23	0.25
lcl\|BLLF01003116.1_cds_GFH26399.1_20876 (GFH26399)	0.24	0.12	0.39	0.21	0.26	0.21	0.28	0.14	0.28	0.45	0.26	0.17	0.19	0.12	0.27	1.0	0.47	0.87	0.29	0.26	0.92	0.37	0.67	0.37	0.22	0.18
lcl\|BLLF01003595.1_cds_GFH27730.1_22207 (GFH27730)	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.04	0.09	0.16	0.03	0.0	0.03	0.05	0.05	1.0	0.18	0.36	0.0	0.36	0.52	0.07	0.52	0.15	0.01	0.01
lcl\|BLLF01003599.1_cds_GFH27745.1_22222 (GFH27745)	0.18	0.03	0.02	0.01	0.1	0.12	0.1	0.04	0.08	0.23	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05	1.0	0.22	0.43	0.19	0.43	0.52	0.19	0.5	0.32	0.1	0.16
lcl\|BLLF01003653.1_cds_GFH27869.1_22346 (GFH27869)	0.13	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	1.0	0.22	0.13	0.13	0.26	0.21	0.11	0.14	0.16	0.05	0.1
lcl\|BLLF01003893.1_cds_GFH28474.1_22951 (GFH28474)	0.23	0.06	0.04	0.02	0.01	0.03	0.07	0.06	0.06	0.04	0.07	0.04	0.13	0.08	0.03	1.0	0.36	0.41	0.0	0.11	0.61	0.13	0.41	0.13	0.11	0.05
lcl\|BLLF01003963.1_cds_GFH28622.1_23099 (GFH28622)	0.17	0.19	0.0	0.25	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.03	0.0	0.07	0.03	1.0	0.37	0.24	0.0	0.0	0.52	0.14	0.09	0.05	0.0	0.06
lcl\|BLLF01004843.1_cds_GFH30344.1_24821 (GFH30344)	0.14	0.14	0.0	0.14	0.13	0.1	0.1	0.07	0.08	0.16	0.11	0.1	0.08	0.07	0.05	1.0	0.41	0.46	0.14	0.2	0.54	0.21	0.42	0.53	0.19	0.23
lcl\|BLLF01005071.1_cds_GFH30692.1_25169 (GFH30692)	0.11	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.03	0.02	0.0	0.45	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	1.0	0.35	0.37	0.03	0.12	0.16	0.31	0.5	0.06	0.11	0.05
lcl\|BLLF01005113.1_cds_GFH30743.1_25220 (GFH30743)	0.24	0.3	0.28	0.1	0.3	0.42	0.36	0.2	0.28	0.83	0.4	0.28	0.33	0.38	0.2	0.99	0.85	0.87	0.24	0.32	1.0	0.16	0.57	0.38	0.29	0.59
lcl\|BLLF01005341.1_cds_GFH31064.1_25541 (GFH31064)	0.17	0.08	0.12	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	1.0	0.32	0.16	0.09	0.25	0.04	0.19	0.16	0.09	0.04	0.0
lcl\|BLLF01005572.1_cds_GFH31367.1_25844 (GFH31367)	0.2	0.0	0.0	0.1	0.02	0.02	0.0	0.02	0.03	0.63	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	1.0	0.53	0.28	0.0	0.07	0.21	0.0	0.44	0.2	0.05	0.03
lcl\|BLLF01005787.1_cds_GFH31636.1_26113 (GFH31636)	0.34	0.4	0.02	0.12	0.11	0.1	0.1	0.11	0.15	0.26	0.15	0.11	0.12	0.07	0.22	1.0	0.82	0.45	0.35	0.95	0.56	0.18	0.48	0.31	0.26	0.24
lcl\|BLLF01006804.1_cds_GFH32562.1_27039 (GFH32562)	0.37	0.02	0.0	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.54	0.08	0.03	0.08	0.08	0.01	1.0	0.2	0.22	0.0	0.11	0.52	0.42	0.2	0.09	0.06	0.08
lcl\|BLLF01007054.1_cds_GFH32740.1_27217 (GFH32740)	0.05	0.03	0.0	0.02	0.09	0.12	0.07	0.05	0.04	0.11	0.11	0.1	0.09	0.08	0.03	1.0	0.56	0.38	0.13	0.13	0.3	0.21	0.27	0.22	0.16	0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)