Heatmap: Cluster_244 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000050.1_cds_GFH06666.1_1143 (GFH06666)	0.37	0.02	0.31	0.3	0.79	0.28	0.2	0.14	0.12	0.22	0.59	0.18	0.08	0.18	0.07	0.54	1.0	0.93	0.28	0.73	0.88	0.22	0.67	0.3	0.07	0.41
lcl\|BLLF01000068.1_cds_GFH07002.1_1479 (GFH07002)	0.16	0.12	0.0	0.12	0.46	0.3	0.31	0.23	0.24	0.13	0.41	0.2	0.16	0.19	0.12	0.96	1.0	0.5	0.47	0.55	0.52	0.21	0.41	0.11	0.35	0.11
lcl\|BLLF01000100.1_cds_GFH07516.1_1993 (GFH07516)	0.75	0.4	0.45	0.18	0.63	0.5	0.44	0.32	0.46	0.25	0.52	0.37	0.44	0.29	0.54	0.83	1.0	0.49	0.46	0.53	0.55	0.69	0.44	0.3	0.48	0.37
lcl\|BLLF01000115.1_cds_GFH07782.1_2259 (GFH07782)	0.53	0.15	0.3	0.21	0.51	0.24	0.28	0.2	0.27	0.37	0.46	0.18	0.17	0.18	0.23	1.0	0.83	0.4	0.31	0.35	0.43	0.2	0.34	0.08	0.45	0.2
lcl\|BLLF01000184.1_cds_GFH08781.1_3258 (GFH08781)	0.0	0.03	0.0	0.13	0.06	0.38	0.07	0.13	0.03	0.67	0.14	0.19	0.24	0.23	0.0	0.94	1.0	0.53	0.16	0.18	0.29	0.0	0.31	0.42	0.24	0.44
lcl\|BLLF01000202.1_cds_GFH09011.1_3488 (GFH09011)	0.47	0.03	0.0	0.15	0.44	0.42	0.51	0.21	0.42	0.21	0.42	0.3	0.45	0.27	0.44	0.66	1.0	0.89	0.6	0.5	0.69	0.39	0.67	0.28	0.3	0.26
lcl\|BLLF01000267.1_cds_GFH09832.1_4309 (GFH09832)	0.23	0.29	0.11	0.21	0.59	0.56	0.42	0.33	0.45	0.16	0.53	0.44	0.35	0.33	0.33	0.91	1.0	0.34	0.32	0.43	0.33	0.29	0.36	0.31	0.44	0.43
lcl\|BLLF01000298.1_cds_GFH10238.1_4715 (GFH10238)	0.82	0.61	0.43	0.49	0.58	0.38	0.37	0.23	0.36	0.42	0.52	0.35	0.38	0.28	0.33	0.8	1.0	0.64	0.46	0.29	0.53	0.57	0.48	0.26	0.49	0.35
lcl\|BLLF01000309.1_cds_GFH10363.1_4840 (GFH10363)	0.0	0.07	0.0	0.15	0.63	0.32	0.27	0.25	0.35	0.05	0.44	0.12	0.14	0.17	0.2	1.0	0.74	0.36	0.0	0.1	0.25	0.19	0.18	0.02	0.24	0.31
lcl\|BLLF01000335.1_cds_GFH10660.1_5137 (GFH10660)	0.36	0.13	0.1	0.22	0.55	0.37	0.29	0.35	0.27	0.47	0.5	0.4	0.33	0.34	0.28	0.93	1.0	0.59	0.68	0.47	0.73	0.48	0.61	0.22	0.4	0.21
lcl\|BLLF01000384.1_cds_GFH11216.1_5693 (GFH11216)	0.74	0.18	0.25	0.08	0.51	0.46	0.29	0.44	0.34	0.33	0.49	0.42	0.35	0.5	0.32	0.6	1.0	0.85	0.53	0.38	0.75	0.45	0.47	0.4	0.35	0.38
lcl\|BLLF01000439.1_cds_GFH11824.1_6301 (GFH11824)	0.49	0.29	0.38	0.32	0.66	0.38	0.34	0.38	0.34	0.43	0.66	0.38	0.32	0.38	0.39	1.0	0.87	0.45	0.42	0.26	0.45	0.45	0.45	0.15	0.46	0.3
lcl\|BLLF01000439.1_cds_GFH11825.1_6302 (GFH11825)	0.45	0.33	0.56	0.38	0.66	0.4	0.36	0.36	0.34	0.42	0.67	0.38	0.31	0.39	0.41	0.9	1.0	0.58	0.61	0.39	0.61	0.49	0.5	0.29	0.63	0.4
lcl\|BLLF01000495.1_cds_GFH12364.1_6841 (GFH12364)	0.43	0.28	0.0	0.15	0.69	0.44	0.47	0.31	0.32	0.05	0.54	0.41	0.26	0.31	0.31	1.0	0.89	0.52	0.55	0.84	0.36	0.16	0.31	0.18	0.4	0.34
lcl\|BLLF01000579.1_cds_GFH13133.1_7610 (GFH13133)	0.41	0.23	0.2	0.27	0.45	0.38	0.4	0.23	0.35	0.34	0.45	0.37	0.31	0.3	0.31	0.43	1.0	0.52	0.42	0.49	0.49	0.2	0.51	0.31	0.3	0.26
lcl\|BLLF01000587.1_cds_GFH13213.1_7690 (GFH13213)	0.67	0.37	0.28	0.25	0.52	0.46	0.2	0.34	0.36	0.5	0.42	0.29	0.32	0.35	0.26	0.84	0.75	0.76	0.78	0.85	1.0	0.66	0.82	0.37	0.37	0.55
lcl\|BLLF01000607.1_cds_GFH13401.1_7878 (GFH13401)	0.26	0.04	0.0	0.14	0.31	0.32	0.41	0.16	0.37	0.43	0.38	0.27	0.25	0.35	0.35	1.0	0.86	0.83	0.42	0.73	0.59	0.34	0.65	0.13	0.43	0.17
lcl\|BLLF01000609.1_cds_GFH13412.1_7889 (GFH13412)	0.43	0.05	0.15	0.24	0.37	0.36	0.38	0.16	0.36	0.58	0.42	0.27	0.27	0.25	0.3	0.71	1.0	0.73	0.45	0.61	0.62	0.25	0.72	0.27	0.46	0.47
lcl\|BLLF01000631.1_cds_GFH13602.1_8079 (GFH13602)	0.0	0.12	0.0	0.12	0.16	0.52	0.16	0.16	0.08	0.38	0.21	0.3	0.19	0.23	0.02	0.72	1.0	0.56	0.32	0.24	0.68	0.11	0.35	0.26	0.18	0.21
lcl\|BLLF01000716.1_cds_GFH14359.1_8836 (GFH14359)	0.26	0.14	0.18	0.14	0.27	0.3	0.32	0.19	0.33	0.47	0.27	0.27	0.35	0.26	0.33	0.88	0.62	1.0	0.54	0.73	0.46	0.43	0.66	0.13	0.29	0.25
lcl\|BLLF01000755.1_cds_GFH14688.1_9165 (GFH14688)	0.4	0.04	0.0	0.32	0.39	0.41	0.35	0.17	0.28	0.21	0.42	0.32	0.3	0.21	0.27	0.69	1.0	0.46	0.16	0.66	0.34	0.64	0.33	0.15	0.21	0.14
lcl\|BLLF01000776.1_cds_GFH14868.1_9345 (GFH14868)	0.71	0.11	0.09	0.1	0.82	0.5	0.42	0.57	0.33	0.13	0.57	0.5	0.37	0.29	0.36	1.0	0.84	0.4	0.5	0.9	0.55	0.4	0.3	0.27	0.2	0.25
lcl\|BLLF01001019.1_cds_GFH16592.1_11069 (GFH16592)	0.24	0.02	0.05	0.13	0.49	0.29	0.21	0.09	0.19	0.13	0.44	0.2	0.14	0.11	0.16	1.0	0.92	0.44	0.25	0.59	0.36	0.24	0.29	0.04	0.18	0.12
lcl\|BLLF01001317.1_cds_GFH18550.1_13027 (GFH18550)	0.58	0.33	0.26	0.21	0.69	0.57	0.41	0.48	0.39	0.24	0.54	0.44	0.34	0.38	0.27	0.8	0.9	0.85	0.49	0.56	0.87	0.24	1.0	0.43	0.17	0.2
lcl\|BLLF01001335.1_cds_GFH18668.1_13145 (GFH18668)	0.41	0.1	0.07	0.44	0.21	0.3	0.25	0.1	0.27	0.12	0.22	0.21	0.27	0.14	0.24	0.83	1.0	0.58	0.24	0.38	0.5	0.5	0.36	0.14	0.26	0.35
lcl\|BLLF01001387.1_cds_GFH18974.1_13451 (GFH18974)	0.17	0.01	0.0	0.14	0.27	0.35	0.32	0.12	0.46	0.54	0.22	0.17	0.26	0.17	0.21	0.63	1.0	0.56	0.14	0.31	0.5	0.17	0.5	0.18	0.27	0.37
lcl\|BLLF01001421.1_cds_GFH19193.1_13670 (GFH19193)	0.3	0.0	0.0	0.2	0.32	0.31	0.33	0.15	0.39	0.26	0.37	0.27	0.33	0.21	0.25	0.54	1.0	0.65	0.42	0.52	0.7	0.22	0.66	0.14	0.27	0.32
lcl\|BLLF01001461.1_cds_GFH19422.1_13899 (GFH19422)	0.36	0.14	0.15	0.23	0.35	0.19	0.26	0.28	0.35	0.22	0.34	0.13	0.19	0.16	0.25	0.85	1.0	0.26	0.23	0.28	0.49	0.16	0.38	0.17	0.39	0.11
lcl\|BLLF01001510.1_cds_GFH19720.1_14197 (GFH19720)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.2	0.18	0.04	0.14	0.0	0.15	0.15	0.13	0.07	0.02	0.9	1.0	0.35	0.26	0.15	0.24	0.28	0.0	0.07	0.04	0.2
lcl\|BLLF01001579.1_cds_GFH20123.1_14600 (GFH20123)	0.67	0.3	0.13	0.41	0.61	0.51	0.44	0.41	0.42	0.31	0.57	0.37	0.44	0.43	0.35	0.81	1.0	0.79	0.59	0.67	0.84	0.18	0.68	0.37	0.23	0.22
lcl\|BLLF01001585.1_cds_GFH20158.1_14635 (GFH20158)	0.65	0.28	0.3	0.35	0.7	0.45	0.29	0.26	0.3	0.29	0.61	0.34	0.24	0.22	0.29	0.84	1.0	0.45	0.33	0.55	0.38	0.5	0.34	0.13	0.41	0.39
lcl\|BLLF01001610.1_cds_GFH20290.1_14767 (GFH20290)	0.05	0.23	0.01	0.0	0.33	0.33	0.21	0.24	0.19	0.02	0.22	0.17	0.16	0.13	0.13	0.94	1.0	0.19	0.46	0.31	0.27	0.24	0.33	0.11	0.16	0.18
lcl\|BLLF01001681.1_cds_GFH20694.1_15171 (GFH20694)	0.63	0.12	0.2	0.09	0.71	0.56	0.34	0.35	0.38	0.32	0.64	0.41	0.29	0.34	0.23	0.65	0.85	1.0	0.65	0.89	0.87	0.67	0.77	0.4	0.15	0.44
lcl\|BLLF01001776.1_cds_GFH21189.1_15666 (GFH21189)	0.34	0.05	0.0	0.09	0.22	0.42	0.33	0.18	0.25	0.16	0.36	0.4	0.28	0.34	0.12	0.56	1.0	0.48	0.72	0.56	0.6	0.14	0.48	0.14	0.21	0.24
lcl\|BLLF01001845.1_cds_GFH21517.1_15994 (GFH21517)	0.25	0.1	0.17	0.22	0.58	0.46	0.26	0.28	0.23	0.15	0.46	0.32	0.3	0.24	0.2	1.0	0.93	0.26	0.47	0.64	0.29	0.32	0.27	0.2	0.19	0.35
lcl\|BLLF01002038.1_cds_GFH22431.1_16908 (GFH22431)	0.72	0.46	0.52	0.4	0.71	0.55	0.5	0.46	0.53	0.31	0.57	0.48	0.49	0.37	0.54	0.6	1.0	0.6	0.45	0.45	0.56	0.52	0.44	0.32	0.34	0.32
lcl\|BLLF01002042.1_cds_GFH22447.1_16924 (GFH22447)	0.23	0.05	0.2	0.18	0.72	0.34	0.24	0.32	0.24	0.27	0.55	0.21	0.24	0.28	0.18	0.55	0.95	0.92	0.81	1.0	0.81	0.56	0.64	0.16	0.42	0.23
lcl\|BLLF01002059.1_cds_GFH22531.1_17008 (GFH22531)	0.05	0.0	0.0	0.53	0.93	0.22	0.27	0.32	0.38	0.0	0.81	0.33	0.18	0.24	0.13	1.0	0.67	0.16	0.23	0.33	0.11	0.0	0.31	0.03	0.18	0.26
lcl\|BLLF01002108.1_cds_GFH22719.1_17196 (GFH22719)	0.3	0.25	0.24	0.34	0.66	0.36	0.27	0.29	0.23	0.21	0.47	0.29	0.25	0.31	0.19	1.0	0.91	0.47	0.4	0.35	0.43	0.57	0.39	0.14	0.41	0.4
lcl\|BLLF01002185.1_cds_GFH23067.1_17544 (GFH23067)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.29	0.11	0.15	0.03	0.06	0.0	0.16	0.11	0.07	0.11	0.14	1.0	0.71	0.35	0.21	0.24	0.2	0.11	0.07	0.03	0.05	0.16
lcl\|BLLF01002194.1_cds_GFH23108.1_17585 (GFH23108)	0.08	0.1	0.11	0.12	0.33	0.2	0.21	0.09	0.13	0.39	0.27	0.16	0.17	0.14	0.16	1.0	0.86	0.33	0.05	0.54	0.26	0.07	0.18	0.14	0.15	0.15
lcl\|BLLF01002202.1_cds_GFH23145.1_17622 (GFH23145)	0.25	0.18	0.05	0.16	0.48	0.4	0.37	0.39	0.31	0.37	0.48	0.35	0.33	0.37	0.33	0.61	1.0	0.68	0.56	0.44	0.65	0.3	0.59	0.3	0.57	0.41
lcl\|BLLF01002230.1_cds_GFH23259.1_17736 (GFH23259)	0.23	0.04	0.01	0.1	0.44	0.34	0.22	0.15	0.19	0.07	0.36	0.28	0.21	0.22	0.15	0.6	1.0	0.23	0.25	0.5	0.24	0.35	0.23	0.1	0.15	0.09
lcl\|BLLF01002277.1_cds_GFH23456.1_17933 (GFH23456)	0.23	0.17	0.07	0.13	0.63	0.38	0.25	0.3	0.26	0.09	0.5	0.33	0.38	0.27	0.18	0.5	1.0	0.9	0.36	0.92	0.84	0.47	0.66	0.35	0.22	0.39
lcl\|BLLF01002302.1_cds_GFH23565.1_18042 (GFH23565)	0.49	0.32	0.0	0.25	0.36	0.25	0.38	0.21	0.39	0.47	0.37	0.28	0.31	0.34	0.42	1.0	0.94	0.98	0.72	0.87	0.96	0.51	0.46	0.18	0.36	0.24
lcl\|BLLF01002556.1_cds_GFH24520.1_18997 (GFH24520)	0.66	0.49	0.63	0.28	0.62	0.55	0.39	0.33	0.33	0.41	0.56	0.44	0.31	0.33	0.35	0.92	1.0	0.37	0.37	0.8	0.37	0.46	0.34	0.16	0.43	0.32
lcl\|BLLF01002706.1_cds_GFH25066.1_19543 (GFH25066)	0.16	0.03	0.0	0.15	0.15	0.2	0.4	0.11	0.37	0.36	0.19	0.16	0.2	0.15	0.31	0.6	1.0	0.4	0.14	0.19	0.52	0.14	0.34	0.21	0.18	0.15
lcl\|BLLF01002718.1_cds_GFH25096.1_19573 (GFH25096)	0.38	0.14	0.09	0.12	0.61	0.42	0.34	0.25	0.33	0.31	0.63	0.37	0.39	0.31	0.27	0.82	1.0	0.69	0.53	0.81	0.74	0.32	0.56	0.29	0.25	0.32
lcl\|BLLF01002969.1_cds_GFH25950.1_20427 (GFH25950)	0.36	0.03	0.04	0.11	0.48	0.33	0.23	0.23	0.24	0.13	0.38	0.23	0.17	0.15	0.18	0.62	1.0	0.23	0.28	0.38	0.15	0.22	0.22	0.11	0.25	0.2
lcl\|BLLF01003195.1_cds_GFH26661.1_21138 (GFH26661)	0.42	0.0	0.0	0.02	0.24	0.68	0.41	0.22	0.22	0.2	0.38	0.59	0.27	0.33	0.17	1.0	0.92	0.61	0.56	0.45	0.81	0.32	0.61	0.35	0.25	0.28
lcl\|BLLF01003266.1_cds_GFH26867.1_21344 (GFH26867)	0.3	0.0	0.0	0.19	0.15	0.19	0.3	0.11	0.21	0.43	0.09	0.15	0.13	0.08	0.18	0.57	1.0	0.45	0.46	0.5	0.31	0.51	0.57	0.2	0.17	0.08
lcl\|BLLF01003597.1_cds_GFH27736.1_22213 (GFH27736)	0.36	0.02	0.0	0.24	0.27	0.3	0.54	0.16	0.35	0.46	0.3	0.33	0.26	0.21	0.38	0.59	1.0	0.66	0.63	0.54	0.85	0.54	0.68	0.19	0.43	0.18
lcl\|BLLF01003741.1_cds_GFH28098.1_22575 (GFH28098)	0.16	0.07	0.12	0.32	0.64	0.43	0.31	0.29	0.34	0.15	0.61	0.25	0.19	0.26	0.2	1.0	0.75	0.41	0.11	0.53	0.35	0.31	0.28	0.07	0.2	0.15
lcl\|BLLF01003887.1_cds_GFH28457.1_22934 (GFH28457)	0.67	0.34	0.33	0.27	0.64	0.32	0.32	0.29	0.34	0.42	0.53	0.31	0.31	0.33	0.32	0.78	1.0	0.46	0.35	0.45	0.42	0.57	0.4	0.26	0.67	0.43
lcl\|BLLF01004068.1_cds_GFH28852.1_23329 (GFH28852)	0.28	0.13	0.0	0.33	0.37	0.36	0.27	0.22	0.26	0.23	0.29	0.23	0.25	0.2	0.2	0.8	1.0	0.68	0.53	0.65	0.66	0.32	0.45	0.24	0.36	0.4
lcl\|BLLF01004447.1_cds_GFH29632.1_24109 (GFH29632)	0.03	0.01	0.07	0.16	0.47	0.21	0.15	0.19	0.33	0.07	0.27	0.1	0.11	0.07	0.3	0.75	1.0	0.3	0.17	0.11	0.29	0.06	0.22	0.04	0.26	0.26
lcl\|BLLF01004878.1_cds_GFH30398.1_24875 (GFH30398)	0.41	0.0	0.0	0.0	0.35	0.34	0.34	0.14	0.33	0.13	0.35	0.29	0.29	0.22	0.21	0.6	1.0	0.53	0.37	0.26	0.57	0.26	0.38	0.27	0.17	0.23
lcl\|BLLF01005359.1_cds_GFH31085.1_25562 (GFH31085)	0.25	0.32	0.09	0.13	0.64	0.57	0.45	0.25	0.31	0.32	0.58	0.54	0.37	0.32	0.31	1.0	0.99	0.25	0.22	0.41	0.28	0.51	0.24	0.25	0.22	0.24
lcl\|BLLF01005657.1_cds_GFH31474.1_25951 (GFH31474)	0.2	0.01	0.17	0.11	0.91	0.28	0.14	0.19	0.16	0.1	0.64	0.16	0.1	0.14	0.11	0.48	0.57	0.72	0.38	1.0	0.88	0.42	0.52	0.19	0.13	0.35
lcl\|BLLF01005713.1_cds_GFH31549.1_26026 (GFH31549)	0.18	0.09	0.08	0.06	0.33	0.25	0.13	0.11	0.12	0.25	0.29	0.2	0.17	0.12	0.07	0.57	1.0	0.44	0.09	0.48	0.3	0.26	0.27	0.03	0.16	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)