Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000014.1_cds_GFH05932.1_409 (GFH05932)	0.19	0.55	0.29	0.07	0.46	0.38	0.35	0.44	0.28	0.56	0.5	0.27	0.29	0.39	0.26	0.44	0.72	0.76	0.27	0.34	1.0	0.25	0.29	0.2	0.44	0.48
lcl\|BLLF01000031.1_cds_GFH06289.1_766 (GFH06289)	0.24	0.44	0.42	0.21	0.45	0.39	0.28	0.28	0.25	0.12	0.38	0.4	0.25	0.26	0.27	0.62	1.0	0.19	0.17	0.39	0.19	0.75	0.2	0.17	0.43	0.22
lcl\|BLLF01000031.1_cds_GFH06291.1_768 (GFH06291)	0.27	0.35	0.26	0.26	0.32	0.23	0.19	0.15	0.2	0.15	0.29	0.26	0.18	0.18	0.19	0.56	1.0	0.19	0.13	0.32	0.22	0.39	0.16	0.07	0.29	0.16
lcl\|BLLF01000066.1_cds_GFH06958.1_1435 (GFH06958)	0.06	1.0	0.69	0.27	0.4	0.57	0.53	0.29	0.54	0.83	0.45	0.3	0.59	0.32	0.53	0.63	0.77	0.4	0.05	0.23	0.46	0.17	0.41	0.33	0.81	0.92
lcl\|BLLF01000081.1_cds_GFH07212.1_1689 (GFH07212)	0.16	0.95	0.76	0.44	0.54	0.53	0.5	0.89	0.6	0.91	0.52	0.54	0.6	0.59	0.55	0.88	1.0	0.7	0.4	0.42	0.67	0.6	0.71	0.49	0.21	0.2
lcl\|BLLF01000095.1_cds_GFH07459.1_1936 (GFH07459)	0.12	0.97	0.61	0.58	0.24	0.16	0.15	0.13	0.15	0.32	0.2	0.14	0.18	0.17	0.14	1.0	0.89	0.1	0.11	0.07	0.09	0.08	0.09	0.05	0.42	0.39
lcl\|BLLF01000095.1_cds_GFH07460.1_1937 (GFH07460)	0.13	0.9	0.43	0.54	0.53	0.29	0.25	0.58	0.26	0.33	0.54	0.39	0.41	0.43	0.27	0.68	1.0	0.57	0.32	0.7	0.49	0.35	0.38	0.32	0.4	0.48
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08043.1_2520 (GFH08043)	0.12	0.82	0.25	0.22	0.63	0.49	0.37	0.6	0.27	0.19	0.64	0.3	0.44	0.57	0.16	0.17	1.0	0.87	0.28	0.12	0.72	0.03	0.71	0.12	0.12	0.15
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08047.1_2524 (GFH08047)	0.23	1.0	0.72	0.27	0.58	0.61	0.53	0.45	0.43	0.94	0.61	0.43	0.46	0.41	0.28	0.37	0.5	0.67	0.08	0.08	0.5	0.17	0.52	0.06	0.32	0.5
lcl\|BLLF01000139.1_cds_GFH08122.1_2599 (GFH08122)	0.03	0.84	0.49	0.06	0.27	0.49	0.42	0.28	0.27	0.48	0.33	0.33	0.34	0.32	0.25	0.63	1.0	0.35	0.23	0.12	0.88	0.11	0.54	0.29	0.34	0.31
lcl\|BLLF01000159.1_cds_GFH08405.1_2882 (GFH08405)	0.29	0.67	0.0	0.31	0.71	0.63	0.57	0.35	0.35	1.0	0.41	0.49	0.69	0.51	0.5	0.16	0.93	0.49	0.09	0.26	0.51	0.29	0.55	0.18	0.47	0.37
lcl\|BLLF01000176.1_cds_GFH08662.1_3139 (GFH08662)	0.08	1.0	0.6	0.26	0.61	0.63	0.36	0.44	0.33	0.23	0.47	0.57	0.24	0.25	0.32	0.72	0.43	0.1	0.44	0.4	0.1	0.78	0.27	0.25	0.48	0.44
lcl\|BLLF01000194.1_cds_GFH08920.1_3397 (GFH08920)	0.15	0.81	0.76	0.43	0.65	0.53	0.51	0.47	0.43	0.39	0.8	0.56	0.47	0.63	0.31	0.86	1.0	0.7	0.33	0.44	0.76	0.52	0.73	0.24	0.53	0.63
lcl\|BLLF01000246.1_cds_GFH09590.1_4067 (GFH09590)	0.13	0.71	0.54	0.16	0.57	0.39	0.44	0.65	0.42	1.0	0.36	0.2	0.32	0.33	0.43	0.83	0.94	0.44	0.26	0.39	0.46	0.24	0.34	0.16	0.44	0.41
lcl\|BLLF01000249.1_cds_GFH09635.1_4112 (GFH09635)	0.02	1.0	0.42	0.41	0.75	0.46	0.23	0.78	0.27	0.51	0.68	0.36	0.3	0.45	0.2	0.71	0.99	0.49	0.27	0.28	0.57	0.23	0.46	0.11	0.3	0.32
lcl\|BLLF01000296.1_cds_GFH10218.1_4695 (GFH10218)	0.04	1.0	0.6	0.35	0.38	0.26	0.21	0.53	0.3	0.83	0.36	0.29	0.31	0.41	0.33	0.72	0.61	0.47	0.22	0.25	0.46	0.4	0.34	0.19	0.37	0.41
lcl\|BLLF01000309.1_cds_GFH10355.1_4832 (GFH10355)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.37	0.1	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000425.1_cds_GFH11679.1_6156 (GFH11679)	0.58	1.0	0.58	0.55	0.77	0.77	0.64	0.4	0.53	0.72	0.71	0.58	0.56	0.4	0.38	0.66	0.86	0.72	0.36	0.35	0.64	0.48	0.82	0.31	0.82	0.43
lcl\|BLLF01000449.1_cds_GFH11919.1_6396 (GFH11919)	0.04	0.4	0.54	0.16	0.27	0.38	0.19	0.29	0.2	0.32	0.32	0.23	0.21	0.24	0.12	0.63	1.0	0.94	0.06	0.09	0.91	0.0	0.37	0.02	0.19	0.28
lcl\|BLLF01000449.1_cds_GFH11923.1_6400 (GFH11923)	0.1	0.74	0.51	0.1	0.6	0.45	0.32	0.33	0.35	0.47	0.57	0.37	0.27	0.37	0.16	0.73	1.0	0.46	0.05	0.2	0.63	0.34	0.32	0.06	0.37	0.58
lcl\|BLLF01000476.1_cds_GFH12184.1_6661 (GFH12184)	0.0	0.53	0.0	0.14	0.02	0.14	0.14	0.04	0.27	0.48	0.07	0.07	0.28	0.05	0.13	0.99	1.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.14	0.34	0.0	0.71	0.33
lcl\|BLLF01000499.1_cds_GFH12391.1_6868 (GFH12391)	0.0	0.35	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.04	0.0	0.29	0.04	0.0	0.04	0.01	0.06	0.3	1.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
lcl\|BLLF01000519.1_cds_GFH12605.1_7082 (GFH12605)	0.55	0.51	0.4	0.77	0.69	0.45	0.43	0.47	0.4	0.39	0.71	0.4	0.44	0.48	0.33	0.52	0.61	1.0	0.19	0.13	0.81	0.23	0.87	0.33	0.23	0.27
lcl\|BLLF01000575.1_cds_GFH13101.1_7578 (GFH13101)	0.06	1.0	0.57	0.6	0.4	0.4	0.32	0.34	0.29	0.63	0.34	0.42	0.37	0.34	0.37	0.95	0.68	0.22	0.12	0.57	0.2	0.84	0.16	0.3	0.52	0.47
lcl\|BLLF01000606.1_cds_GFH13394.1_7871 (GFH13394)	0.13	1.0	0.42	0.01	0.52	0.4	0.48	0.54	0.35	0.57	0.33	0.25	0.26	0.32	0.4	0.71	0.58	0.35	0.4	0.11	0.49	0.25	0.43	0.16	0.17	0.15
lcl\|BLLF01000806.1_cds_GFH15095.1_9572 (GFH15095)	0.25	0.9	0.51	0.69	0.51	0.44	0.47	0.32	0.38	0.67	0.55	0.4	0.37	0.4	0.39	0.81	1.0	0.48	0.16	0.16	0.49	0.11	0.38	0.07	0.35	0.46
lcl\|BLLF01000806.1_cds_GFH15096.1_9573 (GFH15096)	0.04	1.0	0.42	0.44	0.29	0.34	0.4	0.14	0.32	0.47	0.35	0.24	0.23	0.2	0.3	0.88	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.47	0.33
lcl\|BLLF01000812.1_cds_GFH15152.1_9629 (GFH15152)	0.0	1.0	0.68	0.53	0.24	0.31	0.25	0.18	0.22	0.4	0.29	0.23	0.24	0.28	0.2	0.69	0.47	0.37	0.27	0.19	0.2	0.4	0.08	0.14	0.38	0.43
lcl\|BLLF01000908.1_cds_GFH15843.1_10320 (GFH15843)	0.12	0.52	0.0	0.0	0.43	0.51	0.28	0.23	0.27	0.44	0.44	0.22	0.4	0.27	0.23	0.23	1.0	0.57	0.24	0.15	0.67	0.13	0.34	0.09	0.22	0.28
lcl\|BLLF01000982.1_cds_GFH16340.1_10817 (GFH16340)	0.03	0.42	0.0	0.16	0.22	0.46	0.11	0.25	0.03	0.0	0.29	0.38	0.29	0.38	0.03	1.0	0.35	0.61	0.0	0.0	0.65	0.31	0.28	0.05	0.14	0.09
lcl\|BLLF01001029.1_cds_GFH16650.1_11127 (GFH16650)	0.0	0.32	0.26	0.29	0.29	0.14	0.22	0.41	0.31	1.0	0.23	0.2	0.28	0.29	0.34	0.32	0.43	0.47	0.21	0.23	0.38	0.33	0.38	0.2	0.15	0.14
lcl\|BLLF01001110.1_cds_GFH17196.1_11673 (GFH17196)	0.53	1.0	0.67	0.0	0.47	0.5	0.46	0.46	0.46	0.83	0.51	0.32	0.23	0.41	0.38	0.71	0.79	0.14	0.0	0.11	0.24	0.16	0.17	0.09	0.36	0.37
lcl\|BLLF01001185.1_cds_GFH17674.1_12151 (GFH17674)	0.2	0.43	0.0	0.02	0.47	0.39	0.36	0.33	0.35	0.61	0.46	0.4	0.45	0.37	0.26	0.2	1.0	0.26	0.09	0.46	0.51	0.45	0.19	0.08	0.42	0.36
lcl\|BLLF01001202.1_cds_GFH17792.1_12269 (GFH17792)	0.18	0.41	0.75	0.18	0.38	0.43	0.29	0.33	0.32	0.48	0.45	0.41	0.31	0.3	0.19	1.0	0.58	0.85	0.2	0.48	0.85	0.39	0.61	0.23	0.28	0.43
lcl\|BLLF01001445.1_cds_GFH19337.1_13814 (GFH19337)	0.28	0.81	0.54	0.56	0.61	0.55	0.46	0.51	0.42	0.38	0.7	0.6	0.56	0.69	0.4	1.0	0.91	0.66	0.35	0.32	0.53	0.54	0.55	0.35	0.34	0.37
lcl\|BLLF01001483.1_cds_GFH19549.1_14026 (GFH19549)	0.26	1.0	0.19	0.04	0.5	0.49	0.35	0.44	0.3	0.17	0.51	0.51	0.32	0.43	0.24	0.76	0.98	0.32	0.34	0.4	0.28	0.27	0.33	0.3	0.45	0.27
lcl\|BLLF01001533.1_cds_GFH19871.1_14348 (GFH19871)	0.15	0.58	0.45	0.32	0.69	0.45	0.3	0.57	0.29	0.28	0.47	0.39	0.3	0.34	0.28	0.83	1.0	0.56	0.45	0.68	0.55	0.59	0.48	0.29	0.33	0.28
lcl\|BLLF01001568.1_cds_GFH20071.1_14548 (GFH20071)	0.32	1.0	0.48	0.24	0.52	0.44	0.29	0.28	0.3	0.72	0.49	0.35	0.32	0.32	0.17	0.08	0.09	0.3	0.09	0.2	0.32	0.21	0.34	0.13	0.46	0.47
lcl\|BLLF01001582.1_cds_GFH20141.1_14618 (GFH20141)	0.28	0.61	0.36	0.74	0.62	0.53	0.52	0.51	0.42	0.27	0.47	0.32	0.36	0.4	0.25	0.15	0.7	0.75	0.31	0.28	1.0	0.18	0.62	0.29	0.41	0.37
lcl\|BLLF01001583.1_cds_GFH20144.1_14621 (GFH20144)	0.06	0.72	0.61	0.4	0.13	0.25	0.29	0.16	0.34	0.77	0.19	0.41	0.51	0.37	0.33	1.0	0.63	0.11	0.07	0.05	0.07	0.06	0.18	0.01	0.23	0.4
lcl\|BLLF01001584.1_cds_GFH20151.1_14628 (GFH20151)	0.31	0.57	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.45	0.06	0.0	0.06	0.0	0.0	0.98	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.12
lcl\|BLLF01001710.1_cds_GFH20854.1_15331 (GFH20854)	0.17	0.73	0.33	0.19	0.6	0.47	0.37	0.45	0.38	0.26	0.56	0.43	0.46	0.36	0.34	0.63	1.0	0.44	0.11	0.17	0.54	0.23	0.42	0.16	0.18	0.2
lcl\|BLLF01001763.1_cds_GFH21104.1_15581 (GFH21104)	0.19	0.88	0.31	0.13	0.79	0.7	0.44	0.5	0.47	0.31	0.63	0.47	0.48	0.44	0.39	0.76	1.0	0.54	0.41	0.36	0.65	0.48	0.51	0.47	0.34	0.38
lcl\|BLLF01001789.1_cds_GFH21249.1_15726 (GFH21249)	0.1	0.7	0.72	0.26	0.1	0.15	0.23	0.34	0.24	0.49	0.11	0.35	0.29	0.22	0.38	1.0	0.34	0.03	0.05	0.06	0.04	0.14	0.06	0.02	0.59	0.44
lcl\|BLLF01001913.1_cds_GFH21832.1_16309 (GFH21832)	0.05	0.49	0.33	0.37	0.43	0.14	0.08	0.1	0.06	0.27	0.32	0.14	0.12	0.08	0.08	0.42	1.0	0.16	0.24	0.46	0.2	0.17	0.11	0.06	0.05	0.13
lcl\|BLLF01001955.1_cds_GFH22044.1_16521 (GFH22044)	0.13	1.0	0.57	0.33	0.36	0.34	0.34	0.36	0.37	0.74	0.35	0.33	0.34	0.27	0.36	0.56	0.67	0.15	0.04	0.05	0.14	0.05	0.14	0.02	0.31	0.32
lcl\|BLLF01002732.1_cds_GFH25143.1_19620 (GFH25143)	0.0	0.58	0.18	0.34	0.14	0.23	0.22	0.15	0.21	0.35	0.26	0.19	0.3	0.25	0.21	0.84	1.0	0.14	0.0	0.0	0.21	0.26	0.26	0.09	0.39	0.35
lcl\|BLLF01002847.1_cds_GFH25554.1_20031 (GFH25554)	0.02	0.39	0.25	0.0	0.16	0.04	0.07	0.06	0.04	0.2	0.12	0.07	0.08	0.12	0.04	0.46	1.0	0.0	0.12	0.02	0.08	0.04	0.07	0.04	0.16	0.18
lcl\|BLLF01002891.1_cds_GFH25692.1_20169 (GFH25692)	0.18	0.72	0.14	0.04	0.32	0.37	0.19	0.29	0.2	0.32	0.24	0.16	0.15	0.18	0.07	0.54	1.0	0.32	0.33	0.19	0.22	0.04	0.19	0.05	0.13	0.3
lcl\|BLLF01003107.1_cds_GFH26365.1_20842 (GFH26365)	0.22	0.66	0.0	0.17	0.86	0.56	0.43	0.36	0.48	0.53	0.72	0.41	0.37	0.67	0.28	0.19	0.75	0.43	0.0	1.0	0.64	0.16	0.48	0.02	0.67	0.44
lcl\|BLLF01003109.1_cds_GFH26374.1_20851 (GFH26374)	0.27	0.8	0.85	0.24	0.72	0.56	0.51	0.41	0.48	0.46	0.6	0.46	0.47	0.37	0.44	0.65	0.95	1.0	0.54	0.49	0.94	0.61	0.84	0.15	0.61	0.45
lcl\|BLLF01003171.1_cds_GFH26578.1_21055 (GFH26578)	0.19	1.0	0.87	0.61	0.75	0.56	0.39	0.72	0.47	0.65	0.66	0.48	0.45	0.54	0.41	0.27	0.59	0.79	0.34	0.45	0.66	0.59	0.52	0.32	0.3	0.34
lcl\|BLLF01003342.1_cds_GFH27081.1_21558 (GFH27081)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.31	0.4	0.21	0.18	0.18	0.34	0.19	0.3	0.22	0.16	0.23	0.6	0.71	0.28	0.14	0.08	0.13	0.15	0.09	0.01	0.21	0.3
lcl\|BLLF01003375.1_cds_GFH27168.1_21645 (GFH27168)	0.55	0.55	0.0	0.2	0.25	0.13	0.04	0.1	0.21	0.41	0.14	0.04	0.09	0.05	0.06	1.0	0.73	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.02	0.05	0.05
lcl\|BLLF01003636.1_cds_GFH27825.1_22302 (GFH27825)	0.3	0.5	0.0	0.05	0.18	0.16	0.14	0.17	0.18	0.27	0.15	0.08	0.12	0.21	0.15	0.67	1.0	0.1	0.14	0.08	0.18	0.0	0.22	0.07	0.16	0.13
lcl\|BLLF01004075.1_cds_GFH28868.1_23345 (GFH28868)	0.41	1.0	0.96	0.47	0.63	0.59	0.62	0.81	0.78	0.93	0.68	0.55	0.81	0.57	0.74	0.48	0.75	0.59	0.72	0.71	0.6	0.64	0.54	0.61	0.61	0.63
lcl\|BLLF01004546.1_cds_GFH29826.1_24303 (GFH29826)	0.04	0.2	0.1	0.11	0.26	0.22	0.12	0.14	0.13	0.26	0.26	0.12	0.15	0.14	0.07	0.37	1.0	0.13	0.12	0.33	0.11	0.06	0.17	0.01	0.11	0.11
lcl\|BLLF01004796.1_cds_GFH30259.1_24736 (GFH30259)	0.57	0.87	0.0	0.22	0.04	0.13	0.18	0.01	0.08	0.49	0.02	0.05	0.09	0.1	0.21	1.0	0.85	0.09	0.0	0.2	0.37	0.0	0.0	0.08	0.29	0.17
lcl\|BLLF01004955.1_cds_GFH30508.1_24985 (GFH30508)	0.09	0.48	0.0	0.0	0.15	0.23	0.15	0.18	0.14	0.11	0.17	0.22	0.14	0.13	0.14	0.52	1.0	0.16	0.13	0.23	0.24	0.03	0.19	0.03	0.19	0.12
lcl\|BLLF01004955.1_cds_GFH30509.1_24986 (GFH30509)	0.19	0.26	0.0	0.0	0.17	0.16	0.13	0.21	0.17	0.18	0.14	0.23	0.16	0.15	0.18	0.53	1.0	0.18	0.2	0.34	0.24	0.31	0.17	0.13	0.19	0.12
lcl\|BLLF01005273.1_cds_GFH30992.1_25469 (GFH30992)	0.18	1.0	0.48	0.38	0.64	0.5	0.42	0.33	0.4	0.6	0.6	0.44	0.41	0.28	0.47	0.45	0.28	0.47	0.29	0.33	0.43	0.34	0.42	0.11	0.67	0.28
lcl\|BLLF01005377.1_cds_GFH31107.1_25584 (GFH31107)	0.37	1.0	0.75	0.34	0.49	0.5	0.47	0.4	0.46	0.42	0.33	0.39	0.43	0.29	0.48	0.59	0.52	0.37	0.52	0.16	0.25	0.15	0.55	0.15	0.48	0.38
lcl\|BLLF01007142.1_cds_GFH32793.1_27270 (GFH32793)	0.13	0.33	0.17	0.0	0.31	0.3	0.21	0.22	0.26	0.21	0.4	0.22	0.41	0.32	0.22	0.45	1.0	0.25	0.11	0.23	0.52	0.1	0.19	0.04	0.25	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)