Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000003.1_cds_GFH05619.1_96 (GFH05619)	0.0	0.0	1.0	0.11	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.58	0.24	0.0	0.62	0.29	0.21	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000029.1_cds_GFH06235.1_712 (GFH06235)	0.05	0.0	1.0	0.45	0.28	0.16	0.26	0.09	0.17	0.6	0.2	0.18	0.09	0.16	0.09	0.01	0.28	0.88	0.44	0.25	0.45	0.46	0.13	0.16	0.81	0.59
lcl\|BLLF01000038.1_cds_GFH06422.1_899 (GFH06422)	0.62	0.24	1.0	0.86	0.15	0.13	0.17	0.13	0.15	0.29	0.2	0.07	0.12	0.12	0.15	0.33	0.25	0.81	0.32	0.8	0.33	0.0	0.93	0.15	0.11	0.21
lcl\|BLLF01000067.1_cds_GFH06976.1_1453 (GFH06976)	0.29	0.18	1.0	0.0	0.09	0.18	0.2	0.1	0.25	0.59	0.13	0.1	0.14	0.15	0.13	0.45	0.31	0.2	0.0	0.13	0.34	0.32	0.32	0.34	0.08	0.08
lcl\|BLLF01000101.1_cds_GFH07532.1_2009 (GFH07532)	0.23	0.66	1.0	0.26	0.19	0.29	0.18	0.19	0.37	0.68	0.24	0.25	0.16	0.15	0.17	0.27	0.6	0.12	0.04	0.12	0.36	0.08	0.31	0.14	0.46	0.6
lcl\|BLLF01000120.1_cds_GFH07855.1_2332 (GFH07855)	0.16	0.09	1.0	0.08	0.08	0.03	0.1	0.01	0.12	0.5	0.06	0.1	0.02	0.05	0.08	0.51	0.13	0.55	0.62	0.33	0.23	0.43	0.23	0.16	0.04	0.05
lcl\|BLLF01000197.1_cds_GFH08960.1_3437 (GFH08960)	0.06	0.06	1.0	0.08	0.3	0.12	0.1	0.06	0.08	0.29	0.17	0.01	0.16	0.13	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.38
lcl\|BLLF01000363.1_cds_GFH10975.1_5452 (GFH10975)	0.17	0.09	1.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.22	0.39	0.16	0.16	0.51	0.52	0.26	0.21	0.02	0.05	0.06
lcl\|BLLF01000368.1_cds_GFH11027.1_5504 (GFH11027)	0.54	0.41	0.94	0.36	0.37	0.31	0.43	0.27	0.36	1.0	0.48	0.33	0.32	0.34	0.42	0.45	0.48	0.55	0.53	0.17	0.62	0.24	0.5	0.58	0.6	0.54
lcl\|BLLF01000413.1_cds_GFH11549.1_6026 (GFH11549)	0.51	0.43	1.0	0.24	0.35	0.22	0.23	0.28	0.3	0.91	0.27	0.19	0.25	0.24	0.22	0.85	0.49	0.56	0.37	0.61	0.66	0.62	0.41	0.26	0.51	0.55
lcl\|BLLF01000474.1_cds_GFH12169.1_6646 (GFH12169)	0.33	0.08	1.0	0.4	0.06	0.23	0.1	0.2	0.06	0.65	0.19	0.14	0.16	0.27	0.05	0.25	0.46	0.34	0.0	0.33	0.4	0.3	0.52	0.03	0.57	0.36
lcl\|BLLF01000518.1_cds_GFH12586.1_7063 (GFH12586)	0.05	0.14	1.0	0.0	0.22	0.09	0.19	0.14	0.23	0.42	0.07	0.11	0.16	0.07	0.12	0.2	0.44	0.62	0.0	0.0	0.42	0.24	0.31	0.06	0.18	0.18
lcl\|BLLF01000552.1_cds_GFH12898.1_7375 (GFH12898)	0.23	0.14	1.0	0.39	0.23	0.29	0.29	0.1	0.27	0.46	0.25	0.11	0.19	0.09	0.1	0.09	0.05	0.21	0.15	0.09	0.0	0.0	0.15	0.06	0.22	0.38
lcl\|BLLF01000600.1_cds_GFH13336.1_7813 (GFH13336)	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.62	0.04	0.04	0.0	0.0	0.05	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.02	0.16	0.01
lcl\|BLLF01000794.1_cds_GFH15008.1_9485 (GFH15008)	0.13	0.0	1.0	0.12	0.04	0.18	0.15	0.08	0.17	0.42	0.05	0.02	0.02	0.02	0.08	0.21	0.45	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.31	0.24	0.52	0.56
lcl\|BLLF01000913.1_cds_GFH15870.1_10347 (GFH15870)	0.46	0.15	1.0	0.35	0.48	0.09	0.16	0.12	0.14	0.5	0.2	0.15	0.1	0.12	0.1	0.09	0.49	0.45	0.2	0.35	0.19	0.7	0.24	0.03	0.38	0.33
lcl\|BLLF01000923.1_cds_GFH15936.1_10413 (GFH15936)	0.0	0.07	1.0	0.2	0.05	0.09	0.08	0.02	0.13	0.17	0.06	0.04	0.08	0.07	0.07	0.31	0.26	0.43	0.5	0.29	0.23	0.0	0.24	0.19	0.13	0.1
lcl\|BLLF01000936.1_cds_GFH16037.1_10514 (GFH16037)	0.45	0.03	1.0	0.41	0.03	0.12	0.33	0.02	0.33	0.03	0.03	0.04	0.06	0.02	0.24	0.14	0.2	0.4	0.06	0.02	0.41	0.11	0.91	0.0	0.15	0.04
lcl\|BLLF01000938.1_cds_GFH16054.1_10531 (GFH16054)	0.26	0.0	1.0	0.0	0.03	0.06	0.06	0.05	0.08	0.96	0.04	0.03	0.09	0.03	0.14	0.42	0.0	0.08	0.0	0.14	0.11	0.13	0.08	0.04	0.07	0.15
lcl\|BLLF01000968.1_cds_GFH16249.1_10726 (GFH16249)	0.27	0.64	1.0	0.23	0.26	0.44	0.28	0.13	0.2	0.94	0.24	0.2	0.17	0.16	0.07	0.73	0.76	0.61	0.18	0.28	0.83	0.3	0.51	0.12	0.33	0.38
lcl\|BLLF01001159.1_cds_GFH17509.1_11986 (GFH17509)	0.19	0.17	1.0	0.04	0.05	0.11	0.11	0.11	0.08	0.31	0.1	0.09	0.05	0.02	0.09	0.37	0.09	0.15	0.53	0.73	0.34	0.15	0.29	0.11	0.11	0.2
lcl\|BLLF01001332.1_cds_GFH18640.1_13117 (GFH18640)	0.0	0.0	1.0	0.04	0.13	0.17	0.14	0.08	0.06	0.57	0.17	0.03	0.08	0.04	0.01	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.27
lcl\|BLLF01001349.1_cds_GFH18750.1_13227 (GFH18750)	0.18	0.05	1.0	0.0	0.24	0.26	0.1	0.18	0.2	0.83	0.26	0.05	0.09	0.11	0.02	0.64	0.32	0.25	0.38	0.14	0.58	0.13	0.5	0.05	0.04	0.16
lcl\|BLLF01001404.1_cds_GFH19088.1_13565 (GFH19088)	0.21	0.36	1.0	0.11	0.21	0.16	0.26	0.22	0.13	0.41	0.27	0.12	0.17	0.23	0.12	0.08	0.2	0.27	0.25	0.32	0.55	0.23	0.28	0.08	0.91	0.47
lcl\|BLLF01001508.1_cds_GFH19712.1_14189 (GFH19712)	0.12	0.53	0.63	0.29	0.24	0.23	0.26	0.11	0.35	0.84	0.32	0.14	0.29	0.21	0.23	1.0	0.85	0.6	0.23	0.26	0.43	0.34	0.39	0.03	0.04	0.16
lcl\|BLLF01001573.1_cds_GFH20087.1_14564 (GFH20087)	0.31	0.52	1.0	0.17	0.32	0.25	0.31	0.27	0.39	0.96	0.33	0.26	0.35	0.23	0.4	0.28	0.46	0.52	0.33	0.28	0.44	0.36	0.64	0.3	0.67	0.62
lcl\|BLLF01001585.1_cds_GFH20160.1_14637 (GFH20160)	0.16	0.24	0.79	0.26	0.51	0.33	0.34	0.39	0.41	1.0	0.42	0.25	0.35	0.32	0.36	0.8	0.65	0.58	0.56	0.37	0.72	0.41	0.63	0.16	0.41	0.24
lcl\|BLLF01001656.1_cds_GFH20553.1_15030 (GFH20553)	0.67	0.3	1.0	0.41	0.33	0.29	0.31	0.22	0.29	0.83	0.36	0.26	0.23	0.26	0.18	0.5	0.61	0.65	0.56	0.41	0.65	0.61	0.42	0.26	0.54	0.48
lcl\|BLLF01001661.1_cds_GFH20578.1_15055 (GFH20578)	0.3	0.04	1.0	0.06	0.26	0.14	0.14	0.12	0.08	0.25	0.18	0.09	0.05	0.13	0.18	0.36	0.3	0.09	0.2	0.39	0.2	0.0	0.39	0.08	0.12	0.16
lcl\|BLLF01001886.1_cds_GFH21700.1_16177 (GFH21700)	0.14	0.0	1.0	0.16	0.05	0.2	0.13	0.11	0.08	0.77	0.07	0.15	0.17	0.17	0.06	0.31	0.35	0.49	0.18	0.1	0.67	0.0	0.48	0.1	0.11	0.08
lcl\|BLLF01002031.1_cds_GFH22394.1_16871 (GFH22394)	0.3	0.0	0.91	0.09	0.11	0.16	0.09	0.07	0.09	0.28	0.15	0.13	0.11	0.07	0.05	1.0	0.39	0.12	0.18	0.4	0.34	0.0	0.27	0.01	0.06	0.09
lcl\|BLLF01002071.1_cds_GFH22578.1_17055 (GFH22578)	0.23	0.23	0.94	0.09	0.2	0.18	0.28	0.13	0.28	1.0	0.14	0.13	0.16	0.08	0.22	0.38	0.33	0.32	0.12	0.75	0.37	0.21	0.19	0.14	0.13	0.16
lcl\|BLLF01002084.1_cds_GFH22631.1_17108 (GFH22631)	0.25	0.37	1.0	0.09	0.4	0.27	0.19	0.25	0.28	0.94	0.26	0.21	0.25	0.17	0.22	0.45	0.56	0.84	0.57	0.84	0.66	0.33	0.89	0.17	0.61	0.68
lcl\|BLLF01002093.1_cds_GFH22661.1_17138 (GFH22661)	0.32	0.4	0.97	0.08	0.5	0.46	0.34	0.33	0.36	0.95	0.35	0.32	0.31	0.24	0.33	0.48	0.6	0.74	0.31	0.59	1.0	0.27	0.72	0.05	0.49	0.28
lcl\|BLLF01002094.1_cds_GFH22668.1_17145 (GFH22668)	0.0	0.14	1.0	0.0	0.11	0.17	0.12	0.1	0.15	0.8	0.15	0.05	0.15	0.15	0.09	0.0	0.06	0.27	0.0	0.17	0.56	0.11	0.27	0.04	0.14	0.13
lcl\|BLLF01002104.1_cds_GFH22702.1_17179 (GFH22702)	0.3	0.0	1.0	0.48	0.13	0.11	0.11	0.09	0.07	0.39	0.05	0.06	0.13	0.06	0.13	0.2	0.29	0.49	0.34	0.34	0.35	0.09	0.26	0.07	0.1	0.07
lcl\|BLLF01002171.1_cds_GFH23001.1_17478 (GFH23001)	0.28	0.21	0.92	1.0	0.37	0.16	0.09	0.16	0.18	0.82	0.22	0.1	0.1	0.13	0.16	0.42	0.31	0.56	0.74	0.86	0.6	0.17	0.39	0.24	0.15	0.36
lcl\|BLLF01002345.1_cds_GFH23724.1_18201 (GFH23724)	0.43	0.14	0.71	0.33	0.09	0.14	0.1	0.05	0.11	1.0	0.08	0.19	0.1	0.08	0.1	0.11	0.16	0.7	0.47	0.52	0.49	0.07	0.48	0.14	0.23	0.3
lcl\|BLLF01002483.1_cds_GFH24253.1_18730 (GFH24253)	0.35	0.09	1.0	0.0	0.15	0.02	0.15	0.29	0.13	0.0	0.42	0.04	0.03	0.3	0.02	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.37	0.0	0.62	0.0	0.61	0.25
lcl\|BLLF01002606.1_cds_GFH24694.1_19171 (GFH24694)	0.4	0.39	0.74	0.41	0.55	0.62	0.53	0.41	0.61	0.99	0.5	0.41	0.41	0.37	0.39	1.0	0.63	0.8	0.26	0.46	0.63	0.55	0.55	0.38	0.54	0.75
lcl\|BLLF01002740.1_cds_GFH25170.1_19647 (GFH25170)	0.3	0.1	1.0	0.37	0.11	0.04	0.06	0.06	0.08	0.12	0.12	0.05	0.05	0.06	0.03	0.12	0.24	0.36	0.34	0.89	0.34	0.14	0.27	0.05	0.0	0.04
lcl\|BLLF01003260.1_cds_GFH26846.1_21323 (GFH26846)	0.29	0.18	1.0	0.09	0.45	0.28	0.47	0.28	0.29	0.16	0.46	0.45	0.38	0.27	0.26	0.79	0.53	0.28	0.41	0.31	0.34	0.33	0.5	0.22	0.17	0.25
lcl\|BLLF01003301.1_cds_GFH26959.1_21436 (GFH26959)	0.27	0.07	1.0	0.0	0.02	0.1	0.07	0.02	0.02	0.59	0.0	0.09	0.0	0.04	0.01	0.12	0.06	0.34	0.33	0.42	0.11	0.34	0.31	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01003483.1_cds_GFH27461.1_21938 (GFH27461)	0.25	0.13	1.0	0.1	0.47	0.35	0.34	0.1	0.28	0.32	0.33	0.23	0.24	0.19	0.3	0.11	0.15	0.17	0.0	0.13	0.06	0.21	0.13	0.03	0.33	0.3
lcl\|BLLF01003547.1_cds_GFH27619.1_22096 (GFH27619)	0.56	0.53	1.0	0.16	0.22	0.18	0.19	0.22	0.18	0.93	0.32	0.27	0.28	0.28	0.35	0.4	0.75	0.43	0.06	0.19	0.53	0.63	0.43	0.07	0.27	0.43
lcl\|BLLF01004184.1_cds_GFH29103.1_23580 (GFH29103)	0.37	0.3	0.91	0.67	0.39	0.36	0.33	0.18	0.24	0.29	0.3	0.32	0.26	0.27	0.15	0.5	0.5	0.53	0.52	1.0	0.76	0.33	0.5	0.2	0.14	0.28
lcl\|BLLF01004439.1_cds_GFH29616.1_24093 (GFH29616)	0.04	0.0	0.72	0.23	0.12	0.08	0.08	0.05	0.04	1.0	0.11	0.05	0.12	0.08	0.02	0.1	0.15	0.3	0.12	0.11	0.21	0.0	0.23	0.05	0.22	0.17
lcl\|BLLF01004576.1_cds_GFH29877.1_24354 (GFH29877)	0.09	0.36	0.99	0.0	0.27	0.15	0.44	0.18	0.13	1.0	0.24	0.11	0.17	0.13	0.15	0.53	0.26	0.0	0.21	0.12	0.95	0.22	0.0	0.05	0.6	0.55
lcl\|BLLF01004676.1_cds_GFH30049.1_24526 (GFH30049)	0.02	0.2	0.8	0.0	0.25	0.21	0.24	0.22	0.24	0.85	0.2	0.14	0.23	0.25	0.28	1.0	0.46	0.71	0.07	0.13	0.38	0.21	0.39	0.05	0.21	0.24
lcl\|BLLF01004770.1_cds_GFH30217.1_24694 (GFH30217)	0.0	0.0	1.0	0.36	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.17	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.26	0.07	0.59	0.0	0.21	0.16	0.02	0.0	0.02
lcl\|BLLF01004805.1_cds_GFH30272.1_24749 (GFH30272)	0.45	0.27	0.86	0.2	0.13	0.16	0.14	0.09	0.11	0.79	0.13	0.11	0.15	0.08	0.12	0.38	1.0	0.45	0.21	0.34	0.52	0.24	0.57	0.22	0.23	0.34
lcl\|BLLF01005097.1_cds_GFH30727.1_25204 (GFH30727)	0.27	0.07	1.0	0.04	0.11	0.09	0.13	0.2	0.17	0.98	0.27	0.14	0.11	0.11	0.27	0.13	0.05	0.0	0.15	0.04	0.07	0.32	0.05	0.03	0.63	0.3
lcl\|BLLF01005427.1_cds_GFH31189.1_25666 (GFH31189)	0.21	0.1	1.0	0.13	0.27	0.08	0.05	0.02	0.04	0.06	0.21	0.03	0.03	0.04	0.01	0.25	0.2	0.0	0.06	0.79	0.07	0.13	0.12	0.01	0.02	0.05
lcl\|BLLF01005621.1_cds_GFH31431.1_25908 (GFH31431)	0.0	0.26	1.0	0.06	0.08	0.04	0.16	0.06	0.35	0.78	0.13	0.1	0.18	0.08	0.24	0.39	0.36	0.21	0.11	0.25	0.5	0.33	0.37	0.25	0.39	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)