Heatmap: Cluster_136 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
-1.38 -1.25 - -0.33 -0.38 -0.24 -0.41 -0.58 -0.8 -0.9 -0.51 -0.25 -0.35 -0.34 -1.66 1.67 1.81 0.83 -0.91 -1.31 0.2 -0.41 0.61 0.41 1.04 -0.72
-1.09 -0.3 - -0.59 -0.53 0.27 -1.47 -0.55 -0.31 -1.08 0.13 -0.32 -0.01 -0.23 -0.38 1.59 1.16 1.2 -0.81 -14.84 0.36 - 0.06 1.34 0.23 0.24
- - - 0.42 -0.57 -1.69 -0.35 -2.57 0.46 0.63 -0.97 -0.68 -0.25 -2.5 0.3 2.38 1.17 -0.07 - 0.7 -1.19 -0.99 -0.66 1.98 -0.6 -2.17
-3.05 -1.11 - -1.06 -0.78 -0.35 -0.98 -1.46 -0.88 0.43 -0.59 -0.62 -1.02 -1.2 -1.02 2.06 1.51 -0.12 0.19 -0.41 0.29 0.27 0.69 1.01 -0.16 0.37
-0.26 -0.62 -2.73 -0.73 0.1 0.02 -0.32 -0.64 -1.04 -0.37 0.22 -0.48 0.13 -0.13 -0.86 1.24 1.7 0.46 -0.8 -1.24 0.58 -0.62 0.76 0.41 -0.55 -0.53
-0.56 -0.73 -2.6 -0.45 0.07 -0.2 0.24 -1.43 0.07 0.16 -0.08 -0.35 -0.38 -1.0 -0.16 1.28 1.26 0.05 -0.84 -0.27 0.28 0.58 0.21 0.63 -0.06 -0.62
-2.02 - - -4.75 -1.54 -1.52 -1.31 -0.73 -1.52 -2.42 -1.07 -1.12 -1.39 -0.79 -0.96 2.29 2.13 0.37 0.63 0.07 0.81 -0.33 0.71 1.33 -0.94 -0.51
-0.21 -1.01 -1.08 -0.2 -0.27 -0.19 -0.39 -1.68 -0.1 -0.07 -0.13 -0.59 -0.22 -1.05 -0.57 1.01 1.16 0.85 -0.42 -0.37 0.24 0.81 0.34 0.63 -0.3 -0.15
0.06 -0.4 -0.56 0.17 -0.03 -0.76 -0.68 -0.81 -0.58 -0.03 -0.31 -0.88 -0.58 -0.92 -0.87 1.31 1.32 0.16 -0.6 -0.32 0.22 0.33 0.3 0.53 0.07 0.26
-0.82 -2.22 -3.2 -0.55 0.21 -0.09 -0.33 -0.42 -0.01 -0.64 0.18 -0.39 -0.37 -0.72 0.08 1.29 1.18 0.06 0.43 -0.08 0.38 -0.32 0.05 1.11 -0.32 -0.57
-1.41 -1.86 - -2.66 -0.28 -0.14 -0.93 -0.85 -0.95 0.31 -0.36 -0.64 -0.97 -0.75 -1.72 2.03 1.9 0.59 -1.51 -0.98 0.91 -0.01 0.53 0.46 -0.01 -0.09
-1.01 -0.7 -0.19 -0.5 -0.4 -0.83 -0.98 -1.83 -0.82 0.03 -0.67 -1.14 -0.86 -1.89 -0.93 0.79 1.6 1.43 -0.24 -0.39 0.89 0.84 0.81 0.69 -0.88 -0.88
0.18 -2.88 - -0.6 -0.25 -0.42 -0.12 -1.18 -1.07 -1.22 0.39 -0.53 -0.44 -0.07 -0.48 1.5 1.51 0.65 -0.28 -0.44 0.12 -0.68 0.85 0.56 0.26 -0.27
-1.21 -0.67 - -3.95 -1.0 -0.41 -0.67 -1.42 -0.69 -0.03 -0.6 -0.58 -0.81 -0.83 -3.01 1.98 1.75 0.3 -2.11 -0.25 1.23 -0.45 0.61 1.56 -1.11 -0.34
- - - 0.67 -2.33 - -2.58 -1.43 -2.39 -0.23 -3.92 -3.94 -2.15 -2.0 -0.52 1.86 1.84 0.5 0.5 1.27 0.97 - 1.71 1.53 -1.2 -1.6
-1.04 0.07 - -0.94 -0.06 0.01 -0.3 -0.75 -0.1 -0.2 -0.06 -0.32 -0.45 -0.85 -0.17 1.59 1.76 -0.17 -1.59 -2.25 0.91 0.27 -0.48 0.33 -0.03 -0.05
0.18 -1.2 -5.05 0.32 -0.31 0.21 -0.46 -0.93 -0.51 -0.06 -0.31 -0.49 -0.76 -0.8 -1.27 0.44 1.03 1.2 -0.33 -0.5 0.55 0.33 1.13 0.65 -0.1 -0.79
-0.87 -1.49 -1.63 -1.3 -1.19 -1.09 -1.01 -1.91 -1.37 0.06 -0.95 -1.15 -1.08 -1.25 -1.98 1.87 1.9 1.07 -0.9 -0.25 1.07 -0.09 1.01 0.76 -0.67 -0.14
-0.34 -4.94 - 0.36 -0.76 -0.3 -0.43 -1.88 -0.48 -1.8 -0.7 -0.23 -0.37 -0.72 -0.31 1.16 1.64 1.1 -1.07 -0.99 0.61 0.09 1.09 1.15 -0.15 -1.0
-0.09 -0.74 -2.17 -0.32 -1.64 -0.84 -1.01 -1.1 -1.31 -1.57 -1.08 -1.04 -0.38 -0.4 -1.48 1.58 1.59 1.11 0.44 0.4 0.86 -0.44 0.77 0.18 0.19 -0.63
0.25 -1.3 -1.58 -1.11 0.28 -0.49 -0.47 -0.23 -0.9 -1.49 0.56 0.15 -0.36 0.35 -0.65 1.33 1.15 -0.65 0.11 -0.62 -0.54 0.67 -0.02 1.08 -0.34 -0.55
-0.02 - - -0.45 -3.04 -2.77 -1.49 -1.54 -1.8 -1.12 -2.99 -2.94 -1.91 -1.76 -1.95 2.18 2.39 1.31 0.28 -0.42 1.2 -0.11 1.12 0.51 -2.73 -1.67
-1.82 - - 0.56 -1.02 -1.63 -0.8 -2.16 -0.52 -0.54 -1.06 -1.4 -0.56 -1.44 -2.21 1.86 2.14 1.71 -2.25 - 1.17 -0.97 1.43 0.82 -3.32 -1.77
-0.74 - - -0.54 -1.66 -3.13 -2.25 -0.58 -1.17 -1.43 -2.31 -2.31 -1.45 -2.96 -1.01 2.25 2.2 0.46 1.28 1.12 0.18 -1.34 0.62 1.29 -2.08 -3.39
-0.55 - - 0.1 -0.99 -0.27 -0.28 -3.39 -0.46 0.7 -0.48 -0.72 -0.18 -1.04 0.13 1.87 1.36 0.43 -2.15 0.2 -1.27 -0.08 1.06 1.27 -0.86 -0.93
-0.16 -1.29 -1.31 -0.46 -0.74 -0.42 -0.78 -1.07 -0.45 -0.41 -0.71 -0.98 -0.68 -0.89 -1.33 1.74 1.92 0.37 -1.19 -0.28 0.49 -0.83 0.72 0.23 0.17 0.49
0.05 -1.17 -1.4 -0.1 0.44 0.23 -0.29 -0.61 -0.37 -0.03 0.19 -0.08 -0.47 -0.74 -1.24 1.65 1.08 -0.31 -0.31 -0.67 -0.52 -0.06 -0.58 0.98 -0.24 -0.05
-0.3 -2.48 - -1.78 0.24 0.04 -0.04 -0.93 -0.13 0.39 0.28 0.05 -0.46 -0.69 -0.76 1.36 1.37 0.51 -0.81 -0.4 0.91 -0.82 0.15 0.32 -0.26 0.09
-1.28 -0.56 -0.89 0.47 0.57 -0.01 0.05 -0.4 -0.3 -0.53 0.17 -0.48 -0.71 -0.56 -0.81 1.26 0.94 -0.14 0.41 0.01 -0.36 0.64 0.08 0.59 -0.96 -0.92
-0.28 -1.4 -3.15 0.16 -0.66 -0.38 -0.62 -1.46 -0.75 -0.18 -0.63 -0.71 -0.81 -0.82 -1.41 1.03 1.14 1.28 -0.46 -0.91 1.05 0.32 1.13 0.69 0.26 -0.61
-1.89 -2.96 -2.39 -2.06 0.3 0.03 -0.23 -0.88 -0.72 -1.01 0.12 -0.14 -0.51 -0.77 -0.31 1.78 1.71 0.25 -0.23 -0.39 -0.0 0.85 0.11 -0.12 0.31 -0.35
-1.67 -2.32 -7.09 -0.15 -0.45 -0.72 -0.51 -0.85 -0.78 -0.61 -0.51 -0.59 -0.34 -0.86 -1.31 2.03 2.22 -0.05 -1.38 -0.83 -0.27 0.29 0.28 1.24 -0.33 -0.82
0.03 -1.89 -1.99 -1.24 -0.26 -0.22 -0.42 -1.22 -0.59 -0.58 -0.59 -0.53 -0.52 -0.79 -0.82 1.79 1.42 0.74 -0.44 -0.53 0.64 0.53 0.79 0.29 -0.32 -0.66
-0.02 - - -0.14 -2.31 -0.58 -0.41 -1.7 -0.87 -2.21 -0.31 -1.1 -0.32 -0.63 -1.95 1.75 1.77 1.64 - -1.3 0.99 0.18 0.93 1.16 -1.01 -1.36
0.25 -2.15 -8.11 0.64 -0.3 -0.07 -0.48 -1.21 -0.68 0.17 -0.37 -0.53 -0.66 -0.91 -1.02 0.81 1.02 0.83 -0.24 -0.62 0.86 0.28 0.88 0.72 -0.38 -0.15
-1.83 -2.54 - 0.01 -0.25 -0.28 0.04 -1.1 0.08 -0.55 0.0 -0.1 -0.51 -0.64 -0.39 0.89 1.3 0.46 -0.26 -0.46 0.54 0.54 0.38 1.14 -0.1 0.0
0.26 -2.88 - -0.83 0.27 0.26 -0.36 -1.09 -0.07 0.13 -0.27 -0.58 -0.9 -1.13 -0.77 1.55 1.32 1.27 -0.41 -1.23 0.47 -0.6 -0.07 0.31 -0.34 0.36
-0.57 -4.76 - 0.67 0.44 0.2 -0.13 -0.7 -0.48 -0.39 0.01 -0.22 -0.62 -1.1 -1.03 0.98 0.79 0.75 0.75 0.39 0.21 -0.17 0.15 0.72 -0.49 -0.29
-2.87 -0.53 -0.12 0.38 0.29 -0.18 -0.08 -0.35 -0.38 0.16 0.38 -0.17 -0.28 -0.14 -0.19 1.68 1.34 0.41 -1.1 -0.56 -0.65 -0.42 -0.0 0.83 -4.48 -5.89
0.26 -5.62 - -3.58 -0.52 -0.44 -0.37 -0.79 -0.02 0.02 -0.41 -0.81 -0.46 -1.07 -0.53 1.55 1.84 0.25 0.01 -0.04 0.51 0.83 0.37 0.02 -0.59 -0.2
-1.12 -0.85 -1.1 -1.44 0.21 0.04 -0.13 -0.52 -0.08 -0.96 -0.12 -0.3 -0.26 -0.85 0.15 1.15 1.39 0.51 -0.78 -0.7 0.05 0.09 0.33 0.68 0.62 -0.49
-0.52 -1.74 -1.99 -0.88 0.04 -0.21 0.19 -0.0 -0.06 -0.87 0.1 -0.46 -0.05 0.08 -0.29 0.47 1.57 0.89 -0.14 -1.4 0.98 -0.81 0.87 -0.12 -0.44 -0.93
-4.48 -1.89 - -3.15 0.32 -0.17 -0.47 -0.64 -0.17 0.71 0.31 0.09 -0.23 -0.28 -1.01 1.74 2.11 1.01 -3.32 -1.81 0.73 -1.65 0.34 0.0 -1.63 -1.19
-1.27 -2.04 -3.78 -0.17 -0.09 -0.12 -0.12 -0.82 -0.18 -0.9 -0.1 -0.49 -0.47 -0.49 -0.35 1.23 0.92 0.81 0.48 0.21 0.53 -0.46 0.86 0.73 -0.34 -0.36
-1.74 -0.58 - -3.29 -0.81 -1.08 -0.93 -0.89 -0.07 -0.42 -0.88 -0.61 -0.22 -1.56 -0.01 1.2 2.05 0.49 0.39 0.57 0.68 -0.0 0.08 1.17 -0.31 -1.46
-1.39 -4.24 - -2.55 -0.71 -1.85 -2.34 -3.1 -1.62 0.01 -1.07 -2.36 -2.66 -2.51 -1.01 2.48 1.67 0.95 -0.19 0.28 1.18 -0.3 1.15 1.4 -2.38 -1.22
-0.73 -3.12 -1.42 -2.73 -0.65 -0.6 -0.3 -0.4 0.11 0.09 -0.53 -0.34 -0.47 -0.81 -0.51 1.27 1.6 0.37 -1.05 -0.1 0.15 1.13 0.39 0.9 -0.16 -0.4
-1.8 -0.96 - 0.0 -1.11 -1.54 -0.98 -2.01 -0.93 0.77 -0.68 -0.85 -0.28 -0.72 -0.76 2.2 1.88 -0.06 -3.28 -1.39 0.84 -0.95 1.14 0.97 -0.51 -1.65
-1.19 -0.82 -2.82 -2.4 0.68 0.18 -0.31 0.55 -0.19 -1.07 -0.06 0.06 -0.03 -0.56 -0.21 0.79 1.53 -0.52 -1.06 -1.16 -0.36 1.04 -0.5 1.31 -0.03 -0.93
0.24 -1.32 -0.68 -0.42 -0.08 -0.26 -0.24 -0.6 -0.11 -0.62 -0.12 -0.37 -0.63 -0.56 -0.41 1.34 1.46 0.16 -1.25 -0.68 0.12 -0.32 0.3 0.34 0.37 0.36
0.72 -2.81 -1.79 0.73 0.0 0.16 -0.51 -0.88 -0.62 -1.33 -0.21 -0.25 -1.01 -0.94 -1.09 0.9 1.28 0.53 -0.54 -0.16 0.31 0.64 0.39 0.78 -0.02 -0.91
-0.26 -2.55 - -2.4 0.31 0.24 -0.33 -0.27 -0.75 0.55 0.13 -0.04 -0.17 -0.19 -1.02 1.67 1.24 0.02 -1.34 -0.44 0.13 0.39 0.01 0.89 -0.58 -0.42
-1.37 -2.42 - -0.91 -0.6 -1.06 0.59 -1.73 -0.63 -3.23 -1.34 -0.74 -0.07 -1.74 0.06 1.72 1.82 0.4 -0.42 -0.15 0.62 0.53 0.99 1.37 -1.45 -2.24
-0.32 -1.31 - -1.46 -0.33 -0.05 -0.23 -0.61 -0.7 0.47 -0.49 -0.9 -0.92 -0.64 -0.44 1.95 1.39 -0.14 -1.21 0.12 -0.05 0.52 0.68 0.89 -1.02 -0.43
0.4 -1.65 -3.25 -1.26 -0.43 -0.1 -0.17 -1.21 -0.33 -0.49 -0.1 -0.92 -0.87 -1.01 -0.58 1.1 1.67 0.49 0.36 0.39 0.4 0.11 0.44 1.15 -1.21 -1.21
-0.81 - - 0.46 -0.14 0.07 -0.03 -0.82 -0.11 -1.63 0.04 -0.31 -0.35 -0.47 -0.47 1.23 1.68 0.42 0.27 -0.77 0.02 -0.43 0.03 0.67 0.31 -0.05
-0.37 -5.11 -2.44 -4.58 -0.7 -0.93 -0.52 -1.31 -0.66 -0.53 -0.88 -1.02 -0.65 -1.02 -0.79 1.94 1.45 0.75 0.33 0.35 0.62 0.88 1.06 0.07 -0.29 -0.85
-1.09 -2.46 -0.12 0.29 -0.0 -0.29 -0.24 -1.42 -0.71 -0.87 -0.41 -0.88 -0.77 -1.14 -0.66 1.45 1.52 0.15 0.15 -0.14 0.49 -0.45 0.26 0.98 0.23 -0.26
-0.53 -4.39 - -0.27 -2.83 -1.21 -1.92 -2.47 -2.23 -0.61 -2.26 -2.27 -1.92 -1.62 -2.14 1.86 1.81 1.35 0.19 -0.05 1.25 -1.39 1.47 1.03 0.23 -0.37
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0.31 -0.84 -2.08 -0.96 -0.55 -0.47 -0.36 -1.1 -0.9 -0.03 -0.2 -0.63 -0.35 -0.93 -0.8 1.41 2.01 -1.27 -0.0 -0.36 -0.32 0.35 -0.23 0.93 0.12 0.11
-0.09 -1.14 -5.56 -0.36 -1.22 -0.88 0.03 -1.3 -0.08 -0.53 -0.74 -0.97 -0.54 -0.91 0.01 2.17 1.7 0.55 -0.45 -0.19 -0.51 -0.21 0.39 0.03 -0.13 -0.36
-0.32 -1.51 -4.22 -0.59 -0.13 -0.28 -0.13 -1.11 -0.63 -0.17 -0.02 -0.35 -0.38 -0.43 -0.76 1.02 1.0 0.85 -0.23 -0.34 0.79 0.12 0.86 1.0 -0.36 -0.45
-0.64 -1.56 -3.03 -0.68 -1.17 -0.37 0.07 -1.79 -0.34 -0.8 -0.64 -0.24 -0.54 -0.98 -0.34 1.47 1.86 0.68 -0.63 -0.38 0.31 -0.37 0.82 0.55 0.03 0.26
-0.27 -3.7 - -3.08 -0.1 -0.42 -0.65 -1.11 -0.61 -0.56 -0.44 -0.26 -0.77 -0.84 -0.43 1.64 1.37 -0.42 0.63 -0.06 0.37 0.57 0.27 0.88 0.22 0.53
-0.58 - - -0.17 -2.92 -0.94 -1.14 -2.72 -1.82 -0.65 -0.93 -0.84 -0.3 -0.73 -2.39 1.35 1.42 1.61 0.66 -0.52 1.18 0.16 1.29 1.05 -0.89 -0.73
-0.52 -1.22 -0.16 0.12 -0.01 -0.1 -0.21 -0.26 -0.54 -2.33 -0.22 -0.56 -0.61 -0.51 -0.88 1.57 1.78 0.68 -1.6 -2.07 0.07 -0.39 0.63 0.82 -0.72 -0.68
-0.42 -3.69 - -1.22 -0.25 0.09 -0.14 -1.74 -1.15 -1.55 0.09 -0.54 -0.36 -0.07 -1.56 1.57 1.04 1.07 -0.17 -0.64 0.71 0.54 1.02 0.97 -0.52 -0.76
0.04 -0.9 -0.52 0.42 0.73 0.39 0.06 -0.67 -0.5 -0.76 0.12 -0.0 -0.41 -0.45 -0.75 1.14 0.56 0.07 0.39 0.77 -1.53 -0.2 0.09 0.07 -0.95 -0.54

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.