Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000019.1_cds_GFH06037.1_514 (GFH06037)	0.34	0.19	0.32	0.09	0.13	0.12	0.23	0.16	0.24	1.0	0.2	0.15	0.22	0.21	0.27	0.44	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.28	0.18
lcl\|BLLF01000084.1_cds_GFH07257.1_1734 (GFH07257)	0.66	0.64	0.88	0.13	0.43	0.19	0.2	0.36	0.2	1.0	0.27	0.24	0.12	0.18	0.2	0.16	0.25	0.15	0.07	0.3	0.17	0.14	0.09	0.09	0.41	0.33
lcl\|BLLF01000203.1_cds_GFH09023.1_3500 (GFH09023)	0.44	0.12	1.0	0.16	0.44	0.18	0.24	0.35	0.35	0.39	0.35	0.16	0.13	0.15	0.21	0.28	0.53	0.17	0.0	0.19	0.12	0.21	0.04	0.06	0.69	0.31
lcl\|BLLF01000245.1_cds_GFH09578.1_4055 (GFH09578)	0.3	0.57	1.0	0.34	0.42	0.45	0.4	0.44	0.61	0.81	0.41	0.42	0.48	0.37	0.54	0.21	0.14	0.41	0.26	0.46	0.37	0.3	0.39	0.33	0.69	0.64
lcl\|BLLF01000248.1_cds_GFH09619.1_4096 (GFH09619)	0.59	0.79	1.0	0.4	0.8	0.41	0.26	0.47	0.3	0.54	0.51	0.27	0.22	0.2	0.21	0.25	0.48	0.15	0.19	0.21	0.15	0.26	0.1	0.02	0.76	0.51
lcl\|BLLF01000344.1_cds_GFH10760.1_5237 (GFH10760)	0.16	0.23	0.62	0.1	0.3	0.25	0.21	0.26	0.2	0.08	0.2	0.18	0.12	0.15	0.14	0.04	0.18	0.13	0.19	1.0	0.13	0.25	0.08	0.26	0.1	0.14
lcl\|BLLF01000363.1_cds_GFH10981.1_5458 (GFH10981)	0.22	0.16	0.91	0.1	0.18	0.18	0.26	0.14	0.3	1.0	0.18	0.18	0.16	0.34	0.19	0.34	0.26	0.24	0.74	0.21	0.17	0.0	0.97	0.12	0.16	0.77
lcl\|BLLF01000409.1_cds_GFH11494.1_5971 (GFH11494)	0.44	0.92	0.88	0.65	0.8	0.51	0.22	0.42	0.24	0.44	0.6	0.39	0.37	0.31	0.21	0.16	0.39	0.24	0.1	0.88	0.21	0.23	0.13	0.09	0.57	1.0
lcl\|BLLF01000440.1_cds_GFH11832.1_6309 (GFH11832)	0.27	0.71	0.62	0.15	0.32	0.23	0.21	0.44	0.22	1.0	0.35	0.31	0.33	0.39	0.28	0.32	0.36	0.22	0.37	0.35	0.22	0.35	0.22	0.16	0.37	0.35
lcl\|BLLF01000493.1_cds_GFH12348.1_6825 (GFH12348)	0.81	1.0	0.93	0.56	0.46	0.42	0.46	0.4	0.49	0.82	0.27	0.17	0.28	0.24	0.46	0.32	0.05	0.25	0.53	0.34	0.49	0.4	0.45	0.11	0.69	0.94
lcl\|BLLF01000516.1_cds_GFH12570.1_7047 (GFH12570)	0.35	0.09	0.57	0.01	0.33	0.14	0.13	0.19	0.21	1.0	0.25	0.12	0.12	0.13	0.24	0.23	0.14	0.2	0.08	0.2	0.19	0.13	0.1	0.06	0.35	0.35
lcl\|BLLF01000577.1_cds_GFH13120.1_7597 (GFH13120)	0.31	0.42	1.0	0.21	0.18	0.26	0.19	0.14	0.19	0.59	0.16	0.14	0.13	0.09	0.15	0.28	0.26	0.31	0.19	0.18	0.33	0.16	0.32	0.08	0.36	0.42
lcl\|BLLF01000601.1_cds_GFH13342.1_7819 (GFH13342)	0.46	0.54	0.92	0.16	0.43	0.42	0.38	0.19	0.33	1.0	0.35	0.31	0.31	0.17	0.3	0.14	0.21	0.31	0.16	0.7	0.21	0.38	0.17	0.13	0.65	0.4
lcl\|BLLF01000616.1_cds_GFH13468.1_7945 (GFH13468)	1.0	0.15	0.73	0.15	0.2	0.19	0.31	0.16	0.24	1.0	0.2	0.14	0.19	0.25	0.11	0.13	0.16	0.42	0.11	0.14	0.2	0.0	0.31	0.1	0.3	0.25
lcl\|BLLF01000696.1_cds_GFH14181.1_8658 (GFH14181)	0.3	0.49	1.0	0.12	0.24	0.21	0.18	0.2	0.26	0.49	0.14	0.18	0.16	0.11	0.14	0.16	0.29	0.32	0.2	0.15	0.47	0.05	0.27	0.14	0.64	0.58
lcl\|BLLF01000751.1_cds_GFH14655.1_9132 (GFH14655)	1.0	0.56	0.53	0.95	0.4	0.34	0.5	0.37	0.61	0.47	0.6	0.46	0.57	0.42	0.78	0.85	0.52	0.36	0.31	0.28	0.26	0.11	0.24	0.22	0.62	0.95
lcl\|BLLF01000759.1_cds_GFH14724.1_9201 (GFH14724)	0.38	0.55	0.43	0.41	0.36	0.28	0.21	0.45	0.23	1.0	0.35	0.35	0.31	0.4	0.26	0.42	0.46	0.29	0.2	0.22	0.26	0.28	0.27	0.25	0.47	0.45
lcl\|BLLF01000759.1_cds_GFH14729.1_9206 (GFH14729)	1.0	0.5	0.79	0.57	0.6	0.49	0.36	0.73	0.52	0.96	0.61	0.49	0.57	0.57	0.47	0.34	0.6	0.51	0.56	0.46	0.46	0.41	0.34	0.3	0.37	0.49
lcl\|BLLF01000855.1_cds_GFH15473.1_9950 (GFH15473)	0.35	0.39	0.28	0.25	0.39	0.27	0.24	0.52	0.31	1.0	0.29	0.29	0.31	0.36	0.27	0.17	0.26	0.34	0.19	0.38	0.27	0.24	0.26	0.32	0.41	0.4
lcl\|BLLF01000866.1_cds_GFH15547.1_10024 (GFH15547)	0.69	0.5	0.86	0.56	0.82	0.51	0.49	0.64	0.64	0.93	0.78	0.59	0.61	0.59	0.74	0.54	0.81	0.55	0.49	0.56	0.39	0.56	0.38	0.48	1.0	0.87
lcl\|BLLF01000893.1_cds_GFH15745.1_10222 (GFH15745)	0.2	0.22	0.95	0.21	0.09	0.15	0.07	0.05	0.33	1.0	0.08	0.21	0.22	0.12	0.23	0.69	0.72	0.47	0.18	0.54	0.21	0.42	0.09	0.29	0.66	0.72
lcl\|BLLF01001026.1_cds_GFH16628.1_11105 (GFH16628)	0.8	0.55	0.35	0.37	0.1	0.14	0.34	0.17	0.26	1.0	0.12	0.12	0.13	0.12	0.26	0.12	0.17	0.43	0.11	0.11	0.35	0.19	0.35	0.06	0.14	0.09
lcl\|BLLF01001117.1_cds_GFH17242.1_11719 (GFH17242)	0.58	0.52	0.83	0.42	0.72	0.52	0.43	0.41	0.43	1.0	0.56	0.44	0.44	0.35	0.48	0.56	0.49	0.34	0.22	0.45	0.45	0.57	0.44	0.36	0.69	0.31
lcl\|BLLF01001134.1_cds_GFH17346.1_11823 (GFH17346)	0.32	0.25	0.31	0.14	0.15	0.11	0.15	0.25	0.32	1.0	0.2	0.24	0.14	0.16	0.29	0.06	0.04	0.05	0.03	0.0	0.03	0.04	0.05	0.0	0.48	0.27
lcl\|BLLF01001186.1_cds_GFH17689.1_12166 (GFH17689)	0.49	0.64	1.0	0.58	0.49	0.4	0.37	0.3	0.42	0.71	0.38	0.26	0.25	0.21	0.36	0.37	0.56	0.28	0.24	0.38	0.32	0.39	0.35	0.13	0.6	0.27
lcl\|BLLF01001327.1_cds_GFH18609.1_13086 (GFH18609)	0.0	0.66	0.7	0.01	0.08	0.06	0.07	0.17	0.08	1.0	0.04	0.03	0.06	0.08	0.08	0.05	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.14
lcl\|BLLF01001379.1_cds_GFH18918.1_13395 (GFH18918)	0.74	0.36	0.7	0.33	0.52	0.32	0.33	0.39	0.4	1.0	0.39	0.28	0.34	0.27	0.42	0.29	0.41	0.36	0.29	0.33	0.35	0.38	0.31	0.13	0.52	0.38
lcl\|BLLF01001428.1_cds_GFH19238.1_13715 (GFH19238)	0.97	0.2	0.57	0.29	0.28	0.19	0.27	0.1	0.27	1.0	0.17	0.09	0.12	0.05	0.21	0.26	0.1	0.41	0.05	0.09	0.14	0.48	0.22	0.01	0.53	0.47
lcl\|BLLF01001516.1_cds_GFH19759.1_14236 (GFH19759)	0.48	0.67	0.68	0.31	0.35	0.28	0.29	0.43	0.4	1.0	0.3	0.26	0.31	0.27	0.35	0.3	0.34	0.33	0.37	0.55	0.32	0.46	0.35	0.24	0.29	0.22
lcl\|BLLF01001556.1_cds_GFH20005.1_14482 (GFH20005)	0.79	0.11	0.52	0.16	0.34	0.36	0.27	0.37	0.43	1.0	0.32	0.21	0.26	0.34	0.37	0.16	0.3	0.17	0.13	0.15	0.26	0.08	0.23	0.18	0.67	0.82
lcl\|BLLF01001690.1_cds_GFH20748.1_15225 (GFH20748)	0.45	0.91	0.93	0.7	0.32	0.26	0.26	0.3	0.43	1.0	0.24	0.18	0.26	0.18	0.43	0.2	0.19	0.32	0.51	0.63	0.26	0.27	0.28	0.18	0.42	0.34
lcl\|BLLF01001695.1_cds_GFH20780.1_15257 (GFH20780)	0.87	0.49	0.76	0.14	0.19	0.14	0.12	0.19	0.19	1.0	0.18	0.14	0.23	0.16	0.14	0.15	0.29	0.09	0.08	0.09	0.11	0.06	0.12	0.06	0.18	0.17
lcl\|BLLF01001769.1_cds_GFH21148.1_15625 (GFH21148)	0.59	0.26	1.0	0.67	0.25	0.14	0.31	0.12	0.25	0.58	0.3	0.21	0.35	0.17	0.35	0.03	0.18	0.13	0.13	0.24	0.1	0.13	0.08	0.03	0.29	0.26
lcl\|BLLF01001791.1_cds_GFH21258.1_15735 (GFH21258)	0.63	0.59	1.0	0.35	0.6	0.42	0.39	0.52	0.47	0.89	0.56	0.37	0.41	0.4	0.44	0.48	0.63	0.58	0.26	0.33	0.45	0.34	0.52	0.27	0.61	0.38
lcl\|BLLF01001839.1_cds_GFH21484.1_15961 (GFH21484)	0.56	0.38	1.0	0.28	0.48	0.47	0.31	0.39	0.33	0.81	0.39	0.38	0.31	0.31	0.3	0.29	0.43	0.5	0.21	0.17	0.53	0.42	0.43	0.34	0.3	0.32
lcl\|BLLF01001873.1_cds_GFH21646.1_16123 (GFH21646)	0.83	0.25	0.44	0.18	0.45	0.19	0.14	0.05	0.21	0.75	0.18	0.08	0.08	0.1	0.03	1.0	0.1	0.07	0.0	0.0	0.17	0.0	0.08	0.01	0.45	0.93
lcl\|BLLF01001978.1_cds_GFH22144.1_16621 (GFH22144)	0.59	0.52	0.87	0.4	0.86	0.39	0.38	0.29	0.32	0.55	0.58	0.34	0.29	0.22	0.34	0.33	0.44	0.31	0.19	0.34	0.19	0.17	0.32	0.04	1.0	0.34
lcl\|BLLF01002100.1_cds_GFH22689.1_17166 (GFH22689)	0.16	0.3	0.24	0.27	0.32	0.23	0.22	0.54	0.25	1.0	0.27	0.24	0.2	0.29	0.31	0.49	0.33	0.27	0.11	0.06	0.26	0.19	0.28	0.29	0.3	0.43
lcl\|BLLF01002195.1_cds_GFH23110.1_17587 (GFH23110)	0.68	0.38	0.86	0.45	0.78	0.45	0.49	0.31	0.39	0.78	0.31	0.38	0.15	0.1	0.37	0.42	0.18	0.5	0.12	0.26	0.33	1.0	0.18	0.1	0.6	0.13
lcl\|BLLF01002340.1_cds_GFH23708.1_18185 (GFH23708)	0.74	0.39	0.36	0.14	0.34	0.23	0.25	0.41	0.34	1.0	0.3	0.23	0.29	0.28	0.36	0.27	0.38	0.21	0.1	0.11	0.18	0.2	0.19	0.11	0.27	0.23
lcl\|BLLF01002583.1_cds_GFH24608.1_19085 (GFH24608)	0.28	0.48	0.84	0.18	0.57	0.55	0.38	0.26	0.38	0.81	0.47	0.47	0.36	0.28	0.23	0.07	0.15	0.31	0.66	1.0	0.31	0.33	0.25	0.23	0.66	0.7
lcl\|BLLF01002640.1_cds_GFH24820.1_19297 (GFH24820)	0.58	0.26	1.0	0.34	0.39	0.24	0.21	0.22	0.33	0.61	0.25	0.17	0.23	0.11	0.3	0.26	0.37	0.37	0.22	0.24	0.29	0.42	0.24	0.09	0.35	0.2
lcl\|BLLF01002640.1_cds_GFH24821.1_19298 (GFH24821)	1.0	0.72	0.94	0.42	0.82	0.44	0.44	0.48	0.72	0.38	0.53	0.32	0.46	0.23	0.7	0.3	0.37	0.3	0.33	0.55	0.32	0.69	0.28	0.25	0.91	0.44
lcl\|BLLF01002816.1_cds_GFH25443.1_19920 (GFH25443)	0.23	0.78	1.0	0.26	0.33	0.32	0.16	0.27	0.22	0.55	0.28	0.22	0.18	0.21	0.17	0.47	0.57	0.47	0.46	0.44	0.64	0.29	0.49	0.14	0.52	0.61
lcl\|BLLF01002834.1_cds_GFH25503.1_19980 (GFH25503)	0.38	0.47	0.56	0.73	0.4	0.31	0.25	0.49	0.25	1.0	0.38	0.36	0.35	0.4	0.3	0.19	0.23	0.31	0.31	0.31	0.29	0.44	0.31	0.16	0.31	0.31
lcl\|BLLF01003180.1_cds_GFH26612.1_21089 (GFH26612)	0.54	0.79	0.67	0.35	0.35	0.21	0.33	0.42	0.51	1.0	0.28	0.19	0.26	0.24	0.38	0.29	0.19	0.41	0.29	0.15	0.31	0.26	0.28	0.12	0.61	0.52
lcl\|BLLF01003267.1_cds_GFH26868.1_21345 (GFH26868)	0.37	0.42	0.73	0.07	0.54	0.44	0.53	0.54	0.78	1.0	0.44	0.57	0.5	0.3	0.75	0.12	0.16	0.32	0.52	0.41	0.47	0.1	0.31	0.38	0.98	0.94
lcl\|BLLF01003837.1_cds_GFH28340.1_22817 (GFH28340)	0.07	0.73	0.21	0.3	0.08	0.09	0.14	0.38	0.16	1.0	0.04	0.06	0.13	0.17	0.14	0.06	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.16
lcl\|BLLF01004071.1_cds_GFH28859.1_23336 (GFH28859)	0.35	0.33	0.54	0.28	0.35	0.51	0.46	0.47	0.7	1.0	0.34	0.48	0.51	0.37	0.55	0.21	0.27	0.28	0.6	0.56	0.24	0.41	0.31	0.27	0.63	0.67
lcl\|BLLF01004156.1_cds_GFH29049.1_23526 (GFH29049)	1.0	0.87	0.92	0.62	0.76	0.6	0.51	0.71	0.61	0.29	0.59	0.48	0.53	0.47	0.66	0.64	0.75	0.75	0.51	0.73	0.54	0.81	0.64	0.59	0.65	0.48
lcl\|BLLF01004599.1_cds_GFH29930.1_24407 (GFH29930)	0.03	0.53	0.83	0.08	0.04	0.07	0.17	0.17	0.27	1.0	0.14	0.1	0.18	0.18	0.25	0.17	0.05	0.16	0.12	0.45	0.0	0.12	0.18	0.31	0.59	0.52
lcl\|BLLF01004608.1_cds_GFH29947.1_24424 (GFH29947)	1.0	0.44	0.49	0.26	0.24	0.24	0.24	0.28	0.39	0.78	0.26	0.19	0.21	0.24	0.26	0.4	0.39	0.0	0.24	0.24	0.0	0.15	0.0	0.17	0.16	0.24
lcl\|BLLF01004948.1_cds_GFH30500.1_24977 (GFH30500)	0.01	0.17	0.68	0.03	0.1	0.1	0.1	0.08	0.18	1.0	0.06	0.11	0.13	0.11	0.18	0.29	0.14	0.49	0.51	0.84	0.21	0.12	0.34	0.33	0.29	0.71
lcl\|BLLF01005132.1_cds_GFH30763.1_25240 (GFH30763)	0.36	0.81	0.51	0.19	0.3	0.27	0.22	0.33	0.42	1.0	0.25	0.21	0.28	0.2	0.42	0.21	0.26	0.29	0.62	0.58	0.29	0.41	0.31	0.32	0.51	0.31
lcl\|BLLF01005248.1_cds_GFH30946.1_25423 (GFH30946)	0.3	0.12	0.1	0.12	0.3	0.16	0.2	0.47	0.3	1.0	0.24	0.22	0.27	0.31	0.25	0.19	0.24	0.29	0.23	0.29	0.37	0.21	0.25	0.32	0.53	0.55
lcl\|BLLF01005489.1_cds_GFH31261.1_25738 (GFH31261)	0.03	0.49	0.91	0.04	0.49	0.35	0.21	0.46	0.35	0.72	0.38	0.42	0.26	0.28	0.38	0.29	0.2	0.17	0.15	1.0	0.24	0.35	0.21	0.24	0.47	0.38
lcl\|BLLF01006013.1_cds_GFH31864.1_26341 (GFH31864)	0.41	0.41	1.0	0.67	0.43	0.21	0.19	0.41	0.34	0.95	0.34	0.18	0.25	0.2	0.26	0.06	0.08	0.32	0.27	0.56	0.33	0.18	0.29	0.03	0.31	0.24
lcl\|BLLF01006193.1_cds_GFH32048.1_26525 (GFH32048)	0.81	0.53	1.0	0.13	0.36	0.3	0.27	0.47	0.35	0.68	0.26	0.18	0.29	0.32	0.28	0.04	0.18	0.11	0.22	0.15	0.13	0.08	0.17	0.03	0.71	0.52
lcl\|BLLF01006634.1_cds_GFH32430.1_26907 (GFH32430)	1.0	0.57	0.66	0.67	0.41	0.39	0.46	0.47	0.59	0.63	0.37	0.38	0.42	0.34	0.56	0.52	0.62	0.52	0.31	0.39	0.49	0.5	0.47	0.42	0.74	0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)