Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000027.1_cds_GFH06200.1_677 (GFH06200)	1.0	0.24	0.02	0.18	0.45	0.27	0.2	0.19	0.22	0.76	0.28	0.21	0.17	0.13	0.23	0.71	0.76	0.32	0.49	0.45	0.43	0.18	0.36	0.4	0.22	0.24
lcl\|BLLF01000048.1_cds_GFH06645.1_1122 (GFH06645)	0.77	0.08	0.01	0.0	0.14	0.13	0.17	0.17	0.14	0.45	0.19	0.13	0.13	0.19	0.15	1.0	0.37	0.33	0.51	0.41	0.69	0.24	0.4	0.52	0.19	0.22
lcl\|BLLF01000058.1_cds_GFH06829.1_1306 (GFH06829)	0.49	0.08	0.05	0.65	0.23	0.25	0.3	0.11	0.25	0.34	0.21	0.17	0.15	0.11	0.29	1.0	0.57	0.47	0.16	0.3	0.47	0.18	0.42	0.16	0.23	0.2
lcl\|BLLF01000067.1_cds_GFH06993.1_1470 (GFH06993)	0.55	0.13	0.07	0.07	0.14	0.11	0.15	0.08	0.2	0.42	0.12	0.12	0.13	0.08	0.26	1.0	0.64	0.32	0.38	0.56	0.31	0.22	0.3	0.22	0.18	0.13
lcl\|BLLF01000099.1_cds_GFH07504.1_1981 (GFH07504)	0.64	0.47	0.0	0.27	0.24	0.27	0.27	0.17	0.29	0.4	0.26	0.19	0.29	0.23	0.33	0.41	0.5	0.89	0.3	0.41	0.67	0.13	1.0	0.56	0.35	0.38
lcl\|BLLF01000137.1_cds_GFH08108.1_2585 (GFH08108)	0.43	0.1	0.01	0.34	0.09	0.12	0.14	0.06	0.19	0.21	0.07	0.07	0.11	0.08	0.18	1.0	0.5	0.18	0.09	0.16	0.32	0.09	0.15	0.08	0.12	0.21
lcl\|BLLF01000171.1_cds_GFH08599.1_3076 (GFH08599)	0.9	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.07	0.12	0.12	0.13	0.07	0.01	0.14	0.11	0.14	0.09	0.0	1.0	0.32	0.67	0.39	0.11	0.71	0.44	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000185.1_cds_GFH08803.1_3280 (GFH08803)	0.21	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.16	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.44	0.15	0.12	0.22	0.3	0.2	0.14	0.14	0.02	0.03
lcl\|BLLF01000189.1_cds_GFH08855.1_3332 (GFH08855)	0.88	0.02	0.0	0.08	0.02	0.01	0.04	0.06	0.02	0.11	0.01	0.07	0.07	0.05	0.07	0.96	0.85	0.44	0.4	0.65	0.43	0.05	0.5	1.0	0.03	0.01
lcl\|BLLF01000214.1_cds_GFH09168.1_3645 (GFH09168)	0.81	0.0	0.0	0.0	0.09	0.19	0.13	0.16	0.18	0.52	0.52	0.22	0.17	0.13	0.39	0.66	0.43	0.87	0.0	0.63	1.0	0.0	0.63	0.1	0.1	0.22
lcl\|BLLF01000372.1_cds_GFH11076.1_5553 (GFH11076)	0.31	0.0	0.0	0.2	0.05	0.04	0.13	0.13	0.16	0.09	0.04	0.07	0.18	0.13	0.1	1.0	0.84	0.42	0.47	0.09	0.57	0.08	0.31	0.21	0.06	0.04
lcl\|BLLF01000378.1_cds_GFH11148.1_5625 (GFH11148)	0.26	0.0	0.0	0.18	0.03	0.03	0.02	0.03	0.05	0.06	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	1.0	0.85	0.07	0.27	0.3	0.53	0.36	0.41	0.14	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000478.1_cds_GFH12214.1_6691 (GFH12214)	1.0	0.09	0.0	0.09	0.08	0.11	0.12	0.04	0.1	0.28	0.1	0.09	0.07	0.06	0.15	0.19	0.2	0.7	0.13	0.23	0.36	0.27	0.39	0.47	0.07	0.06
lcl\|BLLF01000484.1_cds_GFH12265.1_6742 (GFH12265)	0.93	0.08	0.0	0.48	0.01	0.0	0.29	0.01	0.5	0.25	0.03	0.04	0.04	0.04	0.66	0.48	0.71	0.11	1.0	0.38	0.21	0.12	0.0	0.08	0.02	0.0
lcl\|BLLF01000484.1_cds_GFH12270.1_6747 (GFH12270)	1.0	0.32	0.0	0.36	0.03	0.01	0.28	0.01	0.57	0.05	0.0	0.01	0.01	0.0	0.46	0.62	0.69	0.0	0.27	0.45	0.0	0.45	0.0	0.27	0.09	0.11
lcl\|BLLF01000488.1_cds_GFH12298.1_6775 (GFH12298)	1.0	0.06	0.3	0.25	0.28	0.31	0.38	0.18	0.48	0.33	0.22	0.23	0.25	0.12	0.53	0.79	0.97	0.38	0.4	0.42	0.28	0.53	0.29	0.48	0.34	0.24
lcl\|BLLF01000701.1_cds_GFH14215.1_8692 (GFH14215)	0.56	0.04	0.0	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.74	1.0	0.45	0.25	0.37	0.53	0.15	0.47	0.61	0.01	0.03
lcl\|BLLF01000769.1_cds_GFH14810.1_9287 (GFH14810)	0.34	0.22	0.01	0.23	0.09	0.08	0.09	0.08	0.12	0.11	0.08	0.05	0.08	0.1	0.14	1.0	0.57	0.35	0.23	0.35	0.27	0.23	0.33	0.55	0.25	0.21
lcl\|BLLF01001010.1_cds_GFH16524.1_11001 (GFH16524)	0.29	0.06	0.0	0.1	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.26	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	1.0	0.66	0.28	0.05	0.41	0.24	0.1	0.42	0.42	0.02	0.03
lcl\|BLLF01001039.1_cds_GFH16700.1_11177 (GFH16700)	0.4	0.08	0.0	0.05	0.04	0.11	0.1	0.03	0.05	0.07	0.07	0.06	0.1	0.09	0.08	0.96	1.0	0.38	0.45	0.29	0.47	0.48	0.63	0.48	0.02	0.05
lcl\|BLLF01001121.1_cds_GFH17272.1_11749 (GFH17272)	0.82	0.49	0.39	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.08	0.17	0.09	0.1	0.1	0.1	0.1	1.0	0.67	0.4	0.37	0.69	0.5	0.26	0.56	0.27	0.23	0.19
lcl\|BLLF01001191.1_cds_GFH17725.1_12202 (GFH17725)	0.4	0.21	0.0	0.45	0.1	0.19	0.1	0.21	0.15	0.49	0.08	0.14	0.26	0.15	0.08	1.0	0.74	0.3	0.0	0.15	0.41	0.1	0.36	0.17	0.28	0.37
lcl\|BLLF01001353.1_cds_GFH18770.1_13247 (GFH18770)	0.92	0.27	0.0	0.02	0.27	0.36	0.26	0.2	0.4	0.42	0.23	0.12	0.21	0.15	0.3	0.0	0.05	0.91	0.19	0.33	1.0	0.08	0.85	0.81	0.37	0.22
lcl\|BLLF01001387.1_cds_GFH18976.1_13453 (GFH18976)	0.66	0.14	0.0	0.42	0.05	0.0	0.04	0.06	0.06	0.16	0.06	0.11	0.1	0.04	0.04	1.0	0.33	0.38	0.13	0.72	0.0	0.0	0.25	0.99	0.29	0.11
lcl\|BLLF01001410.1_cds_GFH19125.1_13602 (GFH19125)	0.26	0.04	0.0	0.18	0.17	0.07	0.19	0.13	0.2	0.13	0.13	0.11	0.14	0.19	0.2	1.0	0.6	0.29	0.22	0.25	0.81	0.23	0.39	0.23	0.1	0.08
lcl\|BLLF01001656.1_cds_GFH20552.1_15029 (GFH20552)	0.26	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16
lcl\|BLLF01001699.1_cds_GFH20799.1_15276 (GFH20799)	0.39	0.06	0.0	0.56	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.12	0.07	0.03	0.04	0.06	0.04	1.0	0.96	0.33	0.1	0.19	0.45	0.1	0.26	0.2	0.02	0.02
lcl\|BLLF01001778.1_cds_GFH21201.1_15678 (GFH21201)	0.6	0.18	0.34	0.21	0.21	0.16	0.25	0.16	0.21	0.19	0.2	0.14	0.14	0.16	0.17	0.26	0.36	1.0	0.27	0.51	0.91	0.14	0.84	0.54	0.24	0.18
lcl\|BLLF01001850.1_cds_GFH21544.1_16021 (GFH21544)	0.6	0.09	0.25	0.54	0.36	0.3	0.29	0.23	0.34	0.78	0.36	0.28	0.3	0.21	0.44	1.0	0.76	0.61	0.2	0.44	0.64	0.49	0.58	0.23	0.2	0.15
lcl\|BLLF01001906.1_cds_GFH21789.1_16266 (GFH21789)	0.24	0.19	0.0	0.0	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.27	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	1.0	0.38	0.1	0.29	0.31	0.21	0.24	0.0	0.04	0.02	0.0
lcl\|BLLF01002007.1_cds_GFH22280.1_16757 (GFH22280)	0.27	0.02	0.0	0.14	0.07	0.07	0.08	0.05	0.1	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.06	1.0	0.65	0.12	0.29	0.22	0.18	0.05	0.25	0.25	0.06	0.05
lcl\|BLLF01002030.1_cds_GFH22387.1_16864 (GFH22387)	1.0	0.36	0.0	0.49	0.05	0.04	0.06	0.11	0.09	0.26	0.05	0.03	0.08	0.1	0.08	0.73	0.84	0.41	0.18	0.48	0.52	0.16	0.43	0.39	0.07	0.07
lcl\|BLLF01002063.1_cds_GFH22546.1_17023 (GFH22546)	0.66	0.39	0.0	1.0	0.05	0.04	0.02	0.07	0.05	0.26	0.03	0.03	0.03	0.08	0.04	0.29	0.24	0.45	0.39	0.33	0.62	0.1	0.57	0.36	0.12	0.14
lcl\|BLLF01002066.1_cds_GFH22557.1_17034 (GFH22557)	0.51	0.26	0.14	0.51	0.26	0.22	0.18	0.17	0.2	0.18	0.24	0.14	0.18	0.15	0.12	1.0	0.79	0.42	0.09	0.14	0.51	0.07	0.4	0.28	0.26	0.29
lcl\|BLLF01002180.1_cds_GFH23043.1_17520 (GFH23043)	0.87	0.61	0.0	0.92	0.15	0.2	0.14	0.08	0.17	0.25	0.16	0.09	0.22	0.11	0.09	0.5	0.64	0.5	0.67	0.67	0.93	0.35	1.0	0.35	0.26	0.3
lcl\|BLLF01002303.1_cds_GFH23569.1_18046 (GFH23569)	0.55	0.0	0.0	0.32	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.44	0.54	0.17	1.0	0.0	0.18	0.28	0.04	0.0
lcl\|BLLF01002384.1_cds_GFH23871.1_18348 (GFH23871)	0.55	0.0	0.0	0.19	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	1.0	0.73	0.63	0.24	0.45	0.61	0.1	0.62	0.77	0.01	0.01
lcl\|BLLF01002413.1_cds_GFH23986.1_18463 (GFH23986)	0.98	0.2	0.0	0.32	0.11	0.08	0.25	0.15	0.23	0.23	0.13	0.12	0.14	0.13	0.43	0.32	0.24	0.92	0.63	0.5	0.7	0.13	1.0	0.47	0.14	0.08
lcl\|BLLF01002528.1_cds_GFH24408.1_18885 (GFH24408)	0.91	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.08	0.1	0.21	0.09	0.17	0.12	0.14	0.04	0.25	0.13	0.1	0.62	0.25	0.18	1.0	0.16	0.31	0.25	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002620.1_cds_GFH24739.1_19216 (GFH24739)	0.31	0.02	0.03	0.15	0.13	0.12	0.13	0.11	0.12	0.03	0.13	0.1	0.09	0.1	0.11	1.0	0.47	0.2	0.2	0.26	0.18	0.19	0.33	0.17	0.13	0.1
lcl\|BLLF01002624.1_cds_GFH24758.1_19235 (GFH24758)	0.09	0.0	0.0	0.12	0.11	0.04	0.11	0.14	0.11	0.24	0.04	0.15	0.12	0.07	0.14	1.0	0.74	0.52	0.39	0.0	0.72	0.41	0.26	0.11	0.0	0.12
lcl\|BLLF01002627.1_cds_GFH24768.1_19245 (GFH24768)	0.48	0.0	0.0	0.65	0.23	0.27	0.24	0.15	0.3	0.18	0.22	0.16	0.21	0.16	0.26	1.0	0.58	0.36	0.23	0.41	0.51	0.24	0.55	0.34	0.16	0.17
lcl\|BLLF01002677.1_cds_GFH24953.1_19430 (GFH24953)	0.94	0.03	0.0	0.0	0.09	0.17	0.16	0.07	0.38	0.46	0.07	0.05	0.13	0.06	0.34	0.9	1.0	0.59	0.44	0.4	0.53	0.21	0.44	0.41	0.44	0.36
lcl\|BLLF01002947.1_cds_GFH25890.1_20367 (GFH25890)	0.56	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.03	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	1.0	0.48	0.43	0.2	0.42	0.47	0.15	0.52	0.35	0.04	0.0
lcl\|BLLF01003129.1_cds_GFH26442.1_20919 (GFH26442)	0.31	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16	0.03	0.03	0.09	0.19	0.09	0.06	0.03	0.07	0.18	0.15	0.12	0.54	0.33	0.69	1.0	0.18	0.55	0.37	0.05	0.09
lcl\|BLLF01003212.1_cds_GFH26708.1_21185 (GFH26708)	0.42	0.07	0.13	0.2	0.13	0.25	0.16	0.05	0.09	0.12	0.09	0.15	0.18	0.11	0.1	0.95	1.0	0.41	0.44	0.66	0.38	0.26	0.55	0.4	0.24	0.06
lcl\|BLLF01003481.1_cds_GFH27454.1_21931 (GFH27454)	0.0	0.0	0.0	0.2	0.03	0.1	0.0	0.0	0.13	0.0	0.04	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.23	0.72	0.0	0.41	1.0	0.0	0.72	0.46	0.06	0.23
lcl\|BLLF01003567.1_cds_GFH27663.1_22140 (GFH27663)	0.46	0.25	0.11	0.27	0.22	0.16	0.14	0.13	0.12	0.06	0.21	0.12	0.15	0.17	0.09	0.95	1.0	0.48	0.49	0.34	0.37	0.23	0.52	0.6	0.12	0.14
lcl\|BLLF01003575.1_cds_GFH27685.1_22162 (GFH27685)	1.0	0.24	0.0	0.16	0.44	0.38	0.36	0.36	0.39	0.57	0.47	0.31	0.36	0.25	0.42	0.97	0.84	0.7	0.35	0.66	0.86	0.36	0.8	0.46	0.57	0.46
lcl\|BLLF01003642.1_cds_GFH27843.1_22320 (GFH27843)	0.89	0.08	0.05	0.11	0.08	0.18	0.23	0.06	0.16	0.42	0.12	0.13	0.19	0.1	0.13	1.0	0.38	0.37	0.13	0.17	0.42	0.3	0.38	0.4	0.35	0.22
lcl\|BLLF01003788.1_cds_GFH28220.1_22697 (GFH28220)	0.98	0.0	0.0	0.29	0.15	0.1	0.1	0.16	0.31	0.0	0.2	0.12	0.25	0.11	0.29	0.53	1.0	0.7	0.79	0.6	0.97	0.0	0.35	0.74	0.19	0.33
lcl\|BLLF01003827.1_cds_GFH28313.1_22790 (GFH28313)	1.0	0.49	0.0	0.97	0.0	0.11	0.11	0.05	0.12	0.12	0.06	0.05	0.19	0.13	0.24	0.0	0.24	0.0	0.58	0.44	0.18	0.0	0.25	0.53	0.32	0.45
lcl\|BLLF01005143.1_cds_GFH30780.1_25257 (GFH30780)	0.23	0.0	0.0	0.15	0.0	0.02	0.08	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.09	0.67	1.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.17	0.21	0.04	0.0
lcl\|BLLF01005419.1_cds_GFH31176.1_25653 (GFH31176)	0.4	0.02	0.0	0.02	0.06	0.04	0.07	0.02	0.02	0.07	0.05	0.09	0.04	0.03	0.07	1.0	0.8	0.37	0.08	0.36	0.21	0.17	0.27	0.23	0.08	0.03
lcl\|BLLF01005435.1_cds_GFH31196.1_25673 (GFH31196)	0.71	0.14	0.11	0.23	0.15	0.13	0.19	0.07	0.22	0.28	0.13	0.11	0.14	0.1	0.24	1.0	0.63	0.39	0.26	0.27	0.32	0.09	0.39	0.1	0.31	0.22
lcl\|BLLF01005815.1_cds_GFH31664.1_26141 (GFH31664)	0.84	0.07	0.28	0.2	0.3	0.36	0.35	0.21	0.3	0.36	0.35	0.3	0.22	0.26	0.26	0.61	0.47	0.71	0.25	0.38	1.0	0.37	0.8	0.66	0.59	0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)