Heatmap: Cluster_210 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000027.1_cds_GFH06209.1_686 (GFH06209)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.29
lcl\|BLLF01000067.1_cds_GFH06977.1_1454 (GFH06977)	0.1	0.0	0.0	0.0	0.29	0.16	0.18	0.06	0.28	0.33	0.0	0.14	0.24	0.05	0.1	0.99	0.0	1.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.51	0.2	0.43	0.39
lcl\|BLLF01000101.1_cds_GFH07539.1_2016 (GFH07539)	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.11	0.0	0.29	0.17	0.0	0.5	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000272.1_cds_GFH09891.1_4368 (GFH09891)	0.0	0.5	0.32	0.75	0.49	0.46	0.8	0.06	1.0	0.0	0.09	0.12	0.6	0.28	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.15	0.0
lcl\|BLLF01000391.1_cds_GFH11305.1_5782 (GFH11305)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.28	0.28	0.13	0.0	0.0	0.44	0.0	0.44	0.42	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000603.1_cds_GFH13358.1_7835 (GFH13358)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.22	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.13	0.07	0.0	0.11	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.66	0.19
lcl\|BLLF01000682.1_cds_GFH14065.1_8542 (GFH14065)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0
lcl\|BLLF01000814.1_cds_GFH15160.1_9637 (GFH15160)	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29
lcl\|BLLF01000885.1_cds_GFH15693.1_10170 (GFH15693)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.06	0.05	0.0	0.0	0.06	0.06	0.06	0.0	0.4	0.56	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.37	0.2
lcl\|BLLF01000929.1_cds_GFH15986.1_10463 (GFH15986)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.2	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.41	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000969.1_cds_GFH16256.1_10733 (GFH16256)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.02	0.0	0.06	0.15	0.0	0.06	0.11	0.0	0.28	1.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.95	0.36
lcl\|BLLF01000992.1_cds_GFH16399.1_10876 (GFH16399)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001039.1_cds_GFH16707.1_11184 (GFH16707)	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.13	0.57	0.0	0.09	0.0	0.16	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
lcl\|BLLF01001070.1_cds_GFH16918.1_11395 (GFH16918)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.22	0.1	0.05	0.35	0.17	0.06	0.13	0.15	0.05	1.0	0.0	0.39	0.0	0.33	0.54	0.0	0.39	0.07	0.72	0.18
lcl\|BLLF01001172.1_cds_GFH17593.1_12070 (GFH17593)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.19	0.05	0.1	0.0	0.0	0.89	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.45	0.0
lcl\|BLLF01001434.1_cds_GFH19276.1_13753 (GFH19276)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.26	0.49	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44
lcl\|BLLF01001481.1_cds_GFH19539.1_14016 (GFH19539)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
lcl\|BLLF01001515.1_cds_GFH19747.1_14224 (GFH19747)	0.49	0.0	0.0	0.31	0.36	0.77	0.46	0.19	0.59	1.0	0.42	0.26	0.22	0.3	0.89	0.94	0.35	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.08	0.77
lcl\|BLLF01001568.1_cds_GFH20068.1_14545 (GFH20068)	0.0	0.0	0.0	0.62	0.42	0.2	0.85	0.0	0.8	0.0	0.41	0.2	0.68	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.34
lcl\|BLLF01001670.1_cds_GFH20626.1_15103 (GFH20626)	0.52	0.0	0.0	0.0	0.16	0.27	0.17	0.15	0.37	0.71	0.17	0.11	0.24	0.32	0.89	0.0	0.37	0.78	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.1	0.72	1.0
lcl\|BLLF01001671.1_cds_GFH20634.1_15111 (GFH20634)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.08	0.17	0.21	0.35	0.18	0.48	0.22	0.21	0.25	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.14	0.82	0.14
lcl\|BLLF01001806.1_cds_GFH21325.1_15802 (GFH21325)	0.44	0.0	0.0	0.98	0.15	0.11	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.94	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.44	0.0	0.18
lcl\|BLLF01001940.1_cds_GFH21965.1_16442 (GFH21965)	0.16	0.0	0.0	1.0	0.06	0.07	0.17	0.0	0.41	0.57	0.04	0.0	0.18	0.19	0.58	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.1	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001943.1_cds_GFH21983.1_16460 (GFH21983)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.58	0.23	0.2	0.5	0.33	0.0	0.3	0.42	0.27	0.29	0.3	0.0	0.0	0.0	0.13	0.07	0.0	0.0	0.0	0.17	0.49	0.97
lcl\|BLLF01001976.1_cds_GFH22135.1_16612 (GFH22135)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.85	0.0
lcl\|BLLF01002386.1_cds_GFH23880.1_18357 (GFH23880)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.09	0.21	0.12	0.0	0.09	0.0	0.15	0.14	0.05	0.12	0.02	0.43	0.32	1.0	0.0	0.14	0.23	0.0	0.17	0.25	0.42	0.04
lcl\|BLLF01002472.1_cds_GFH24205.1_18682 (GFH24205)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.09	0.92	0.22	0.59	0.49	0.08	0.69	0.34	0.99	0.0	0.59	0.6	0.0	0.49	1.0	0.0	0.0	0.3	0.13	0.93
lcl\|BLLF01002717.1_cds_GFH25092.1_19569 (GFH25092)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.14	0.15	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002745.1_cds_GFH25191.1_19668 (GFH25191)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0
lcl\|BLLF01003060.1_cds_GFH26220.1_20697 (GFH26220)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.08	0.0	0.56	0.09	0.09	0.0	0.0	0.08	0.79	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	1.0	0.29
lcl\|BLLF01003093.1_cds_GFH26324.1_20801 (GFH26324)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.11	0.12	0.0	0.23	0.92	0.16	0.0	0.12	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.43	0.52
lcl\|BLLF01003150.1_cds_GFH26506.1_20983 (GFH26506)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.44	0.0	0.2	0.0	0.0	0.2	0.22	0.19	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003187.1_cds_GFH26637.1_21114 (GFH26637)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	1.0	0.84	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003216.1_cds_GFH26719.1_21196 (GFH26719)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.96	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	1.0
lcl\|BLLF01003274.1_cds_GFH26888.1_21365 (GFH26888)	0.15	0.0	0.0	0.0	0.27	0.05	0.0	0.0	0.31	0.43	0.21	0.05	0.06	0.05	0.15	0.97	0.0	1.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.38	0.1	0.35	0.09
lcl\|BLLF01003376.1_cds_GFH27171.1_21648 (GFH27171)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
lcl\|BLLF01003534.1_cds_GFH27587.1_22064 (GFH27587)	0.16	0.0	0.0	1.0	0.13	0.07	0.7	0.0	0.58	0.0	0.34	0.07	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.88	0.67
lcl\|BLLF01003801.1_cds_GFH28251.1_22728 (GFH28251)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003933.1_cds_GFH28560.1_23037 (GFH28560)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.04	0.0	0.05	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0
lcl\|BLLF01004590.1_cds_GFH29907.1_24384 (GFH29907)	0.0	0.0	0.0	0.86	0.93	0.41	0.23	0.54	0.31	0.0	0.66	0.48	0.21	0.64	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.19	1.0	0.85
lcl\|BLLF01004639.1_cds_GFH29995.1_24472 (GFH29995)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004664.1_cds_GFH30032.1_24509 (GFH30032)	0.24	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.11	0.18	0.1	0.0	0.62	0.2	0.21	0.22	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004695.1_cds_GFH30083.1_24560 (GFH30083)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.17	0.33	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004976.1_cds_GFH30545.1_25022 (GFH30545)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.1	0.0	0.0	0.39	0.0	0.3	0.51	0.44	0.09	0.76	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68
lcl\|BLLF01005069.1_cds_GFH30689.1_25166 (GFH30689)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0
lcl\|BLLF01005346.1_cds_GFH31070.1_25547 (GFH31070)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005349.1_cds_GFH31075.1_25552 (GFH31075)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.29	0.0	0.11	0.32	0.0	0.06	0.19	0.0	0.0	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.18	0.34
lcl\|BLLF01005407.1_cds_GFH31156.1_25633 (GFH31156)	0.62	0.0	0.0	0.5	0.22	0.16	0.32	0.08	0.24	0.56	0.28	0.2	0.3	0.19	1.0	0.0	0.55	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.87	0.51
lcl\|BLLF01005780.1_cds_GFH31623.1_26100 (GFH31623)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.5	0.0	0.0	0.15	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005983.1_cds_GFH31831.1_26308 (GFH31831)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01008277.1_cds_GFH33315.1_27792 (GFH33315)	0.0	0.0	0.0	0.78	0.26	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)