Heatmap: Cluster_297 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000047.1_cds_GFH06610.1_1087 (GFH06610)	0.14	0.47	0.21	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.04	0.22	0.02	0.11	0.07	0.04	0.12	1.0	0.44	0.01	0.44	0.31	0.02	0.94	0.13	0.52	0.49	0.05
lcl\|BLLF01000052.1_cds_GFH06704.1_1181 (GFH06704)	0.25	0.09	0.0	0.53	0.1	0.07	0.14	0.03	0.13	0.31	0.09	0.03	0.09	0.02	0.04	1.0	0.7	0.36	0.43	0.47	0.28	0.34	0.59	0.33	0.22	0.16
lcl\|BLLF01000107.1_cds_GFH07652.1_2129 (GFH07652)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.24	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.12	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.3	0.06	0.06
lcl\|BLLF01000120.1_cds_GFH07843.1_2320 (GFH07843)	0.11	0.03	0.0	0.23	0.3	0.4	0.36	0.25	0.24	0.96	0.22	0.28	0.25	0.33	0.31	0.64	0.48	1.0	0.58	0.66	0.84	0.97	0.83	0.73	0.23	0.23
lcl\|BLLF01000128.1_cds_GFH07967.1_2444 (GFH07967)	0.61	0.79	0.73	0.31	0.38	0.33	0.31	0.26	0.35	0.36	0.39	0.29	0.32	0.31	0.36	0.88	1.0	0.93	0.55	0.52	0.94	0.95	0.85	0.55	0.31	0.28
lcl\|BLLF01000158.1_cds_GFH08391.1_2868 (GFH08391)	0.76	0.59	0.57	0.14	0.49	0.34	0.42	0.33	0.38	0.41	0.46	0.36	0.36	0.29	0.37	0.71	1.0	0.87	0.38	0.55	0.75	0.99	0.86	0.49	0.4	0.25
lcl\|BLLF01000162.1_cds_GFH08448.1_2925 (GFH08448)	0.31	0.11	0.17	0.05	0.11	0.11	0.1	0.09	0.09	0.49	0.09	0.07	0.09	0.07	0.09	0.47	0.54	0.62	0.2	0.27	0.64	1.0	0.58	0.32	0.1	0.14
lcl\|BLLF01000164.1_cds_GFH08482.1_2959 (GFH08482)	0.27	0.37	0.19	0.23	0.1	0.15	0.26	0.06	0.2	0.45	0.11	0.13	0.2	0.12	0.19	1.0	0.59	0.72	0.19	0.23	0.69	0.56	0.67	0.55	0.15	0.2
lcl\|BLLF01000164.1_cds_GFH08483.1_2960 (GFH08483)	0.28	0.21	0.07	0.13	0.2	0.23	0.18	0.12	0.17	0.39	0.16	0.14	0.16	0.11	0.13	1.0	0.38	0.46	0.08	0.17	0.55	0.28	0.39	0.44	0.17	0.33
lcl\|BLLF01000222.1_cds_GFH09284.1_3761 (GFH09284)	0.08	0.0	0.0	0.11	0.05	0.06	0.15	0.03	0.19	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.21	1.0	0.29	0.34	0.25	0.12	0.42	0.22	0.51	0.38	0.2	0.09
lcl\|BLLF01000239.1_cds_GFH09492.1_3969 (GFH09492)	0.41	0.26	0.1	0.28	0.06	0.18	0.14	0.1	0.12	0.34	0.05	0.09	0.09	0.19	0.08	0.79	0.25	0.44	0.26	0.09	0.73	0.9	1.0	0.48	0.07	0.1
lcl\|BLLF01000239.1_cds_GFH09503.1_3980 (GFH09503)	0.37	0.29	0.31	0.24	0.21	0.19	0.2	0.11	0.19	0.58	0.22	0.17	0.15	0.14	0.15	0.74	1.0	0.74	0.51	0.35	0.78	0.68	0.51	0.34	0.28	0.14
lcl\|BLLF01000262.1_cds_GFH09777.1_4254 (GFH09777)	0.32	0.54	0.0	0.08	0.2	0.17	0.2	0.18	0.21	0.64	0.17	0.14	0.2	0.14	0.18	0.86	0.79	0.51	0.43	0.44	0.41	1.0	0.73	0.68	0.35	0.17
lcl\|BLLF01000276.1_cds_GFH09946.1_4423 (GFH09946)	0.3	0.0	0.0	0.74	0.19	0.22	0.19	0.11	0.18	0.29	0.18	0.1	0.2	0.12	0.17	0.4	0.37	0.58	0.58	0.62	0.54	1.0	0.66	0.6	0.19	0.13
lcl\|BLLF01000303.1_cds_GFH10290.1_4767 (GFH10290)	0.25	0.04	0.0	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.26	0.0	0.05	0.1	0.1	0.02	1.0	0.51	0.21	0.06	0.1	0.51	0.13	0.65	0.54	0.13	0.18
lcl\|BLLF01000303.1_cds_GFH10291.1_4768 (GFH10291)	0.03	0.02	0.0	0.11	0.0	0.02	0.03	0.01	0.01	0.18	0.0	0.03	0.07	0.05	0.02	1.0	0.19	0.2	0.17	0.24	0.35	0.35	0.47	0.45	0.12	0.06
lcl\|BLLF01000325.1_cds_GFH10553.1_5030 (GFH10553)	0.21	0.36	0.47	0.3	0.15	0.21	0.21	0.12	0.17	0.33	0.13	0.16	0.16	0.09	0.24	0.59	0.47	0.4	0.4	0.35	0.36	1.0	0.46	0.42	0.15	0.08
lcl\|BLLF01000409.1_cds_GFH11502.1_5979 (GFH11502)	0.14	0.07	0.0	0.03	0.01	0.05	0.03	0.02	0.02	0.11	0.02	0.04	0.09	0.03	0.02	1.0	0.48	0.21	0.21	0.24	0.19	0.48	0.24	0.3	0.31	0.11
lcl\|BLLF01000532.1_cds_GFH12719.1_7196 (GFH12719)	0.19	0.12	0.0	0.24	0.16	0.15	0.09	0.06	0.05	0.04	0.19	0.14	0.12	0.12	0.02	1.0	0.8	0.39	0.37	0.5	0.23	0.36	0.29	0.34	0.12	0.1
lcl\|BLLF01000631.1_cds_GFH13598.1_8075 (GFH13598)	0.53	0.36	0.84	0.05	0.19	0.23	0.18	0.11	0.15	0.27	0.17	0.19	0.12	0.12	0.15	0.94	0.96	0.94	0.7	0.52	1.0	0.58	0.6	0.59	0.25	0.15
lcl\|BLLF01000694.1_cds_GFH14164.1_8641 (GFH14164)	0.14	0.17	0.09	0.24	0.23	0.21	0.18	0.11	0.19	0.08	0.18	0.15	0.17	0.17	0.14	1.0	0.71	0.46	0.27	0.45	0.57	0.43	0.46	0.43	0.14	0.25
lcl\|BLLF01000701.1_cds_GFH14217.1_8694 (GFH14217)	0.28	0.06	0.35	0.25	0.06	0.05	0.14	0.08	0.1	0.45	0.11	0.07	0.16	0.08	0.14	1.0	0.51	0.41	0.47	0.32	0.38	0.65	0.45	0.46	0.05	0.02
lcl\|BLLF01000704.1_cds_GFH14243.1_8720 (GFH14243)	0.53	0.0	0.11	0.69	0.1	0.1	0.22	0.07	0.21	0.61	0.1	0.09	0.2	0.14	0.33	0.81	0.56	0.62	0.42	0.4	0.55	1.0	0.76	0.62	0.31	0.24
lcl\|BLLF01000750.1_cds_GFH14648.1_9125 (GFH14648)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.12	0.08	0.03	1.0	0.0	0.04	0.01	0.02	0.03	0.75	0.0	0.45	0.29	0.22	0.63	0.62	0.58	0.39	0.07	0.0
lcl\|BLLF01000852.1_cds_GFH15451.1_9928 (GFH15451)	0.3	0.1	0.01	0.24	0.08	0.09	0.14	0.04	0.11	0.62	0.07	0.07	0.1	0.05	0.13	1.0	0.36	0.34	0.2	0.64	0.5	0.71	0.81	0.44	0.16	0.09
lcl\|BLLF01000927.1_cds_GFH15968.1_10445 (GFH15968)	0.44	0.37	0.65	0.32	0.4	0.27	0.23	0.28	0.22	0.12	0.29	0.18	0.2	0.2	0.21	1.0	0.68	0.5	0.68	0.4	0.5	0.65	0.45	0.55	0.24	0.32
lcl\|BLLF01001181.1_cds_GFH17641.1_12118 (GFH17641)	0.31	0.0	0.0	0.13	0.08	0.03	0.12	0.07	0.09	0.28	0.08	0.09	0.11	0.08	0.11	0.6	0.44	0.77	0.23	0.2	0.32	0.86	1.0	0.33	0.08	0.04
lcl\|BLLF01001372.1_cds_GFH18871.1_13348 (GFH18871)	0.11	0.0	0.0	0.0	0.24	0.13	0.13	0.06	0.08	0.02	0.3	0.2	0.16	0.07	0.07	1.0	0.98	0.42	0.46	0.4	0.66	0.48	0.4	0.57	0.1	0.11
lcl\|BLLF01001556.1_cds_GFH20003.1_14480 (GFH20003)	0.17	0.03	0.0	0.05	0.04	0.09	0.12	0.04	0.09	0.22	0.05	0.07	0.07	0.07	0.05	1.0	0.2	0.27	0.13	0.16	0.3	0.3	0.32	0.47	0.28	0.34
lcl\|BLLF01001676.1_cds_GFH20662.1_15139 (GFH20662)	0.32	0.16	0.0	0.23	0.14	0.2	0.2	0.13	0.24	1.0	0.08	0.15	0.11	0.06	0.12	0.53	0.26	0.34	0.62	0.35	0.67	0.66	0.55	0.28	0.38	0.26
lcl\|BLLF01001755.1_cds_GFH21064.1_15541 (GFH21064)	0.28	0.14	0.02	0.16	0.04	0.04	0.07	0.02	0.01	0.41	0.07	0.04	0.02	0.03	0.02	0.66	0.27	0.81	0.79	0.2	0.82	0.93	1.0	0.31	0.15	0.11
lcl\|BLLF01001770.1_cds_GFH21152.1_15629 (GFH21152)	0.1	0.28	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.66	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.34	0.12	0.01	0.16	0.18	0.02	1.0	0.06	0.26	0.18	0.02
lcl\|BLLF01001795.1_cds_GFH21275.1_15752 (GFH21275)	0.2	0.16	0.2	0.67	0.22	0.2	0.23	0.22	0.27	1.0	0.22	0.15	0.14	0.21	0.23	0.48	0.46	0.44	0.45	0.51	0.65	0.91	0.63	0.24	0.36	0.35
lcl\|BLLF01001803.1_cds_GFH21307.1_15784 (GFH21307)	0.26	0.66	0.11	0.04	0.05	0.06	0.03	0.04	0.06	0.38	0.07	0.04	0.03	0.01	0.08	0.82	0.05	0.39	0.37	0.04	0.7	0.84	0.4	1.0	0.13	0.08
lcl\|BLLF01001969.1_cds_GFH22097.1_16574 (GFH22097)	0.1	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.44	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.6	0.15	0.57	0.42	0.24	0.32	1.0	0.54	0.24	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002089.1_cds_GFH22651.1_17128 (GFH22651)	0.48	0.0	0.1	0.64	0.11	0.15	0.24	0.15	0.25	1.0	0.23	0.13	0.14	0.11	0.17	0.9	0.92	0.73	0.21	0.45	0.54	0.88	0.81	0.41	0.32	0.2
lcl\|BLLF01002093.1_cds_GFH22662.1_17139 (GFH22662)	0.03	0.12	0.0	0.19	0.24	0.3	0.26	0.21	0.23	0.94	0.29	0.23	0.18	0.25	0.16	1.0	0.27	0.55	0.43	0.42	0.84	0.5	0.78	0.35	0.19	0.47
lcl\|BLLF01002165.1_cds_GFH22972.1_17449 (GFH22972)	0.54	0.02	0.0	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.44	0.04	0.38	0.32	0.08	1.0	0.98	0.42	0.43	0.01	0.0
lcl\|BLLF01002226.1_cds_GFH23245.1_17722 (GFH23245)	0.08	0.35	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.44	0.15	0.03	0.27	0.18	0.08	1.0	0.29	0.33	0.16	0.02
lcl\|BLLF01002395.1_cds_GFH23914.1_18391 (GFH23914)	0.41	0.07	0.0	0.16	0.02	0.03	0.01	0.0	0.04	0.19	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.32	0.22	0.58	0.12	0.25	0.39	1.0	0.78	0.03	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002504.1_cds_GFH24326.1_18803 (GFH24326)	0.06	0.0	0.14	0.33	0.2	0.19	0.08	0.08	0.15	0.15	0.19	0.13	0.16	0.09	0.07	0.51	0.42	0.53	0.57	1.0	0.55	0.66	0.32	0.41	0.09	0.1
lcl\|BLLF01002512.1_cds_GFH24353.1_18830 (GFH24353)	0.15	0.29	0.0	0.08	0.07	0.13	0.15	0.07	0.1	0.59	0.07	0.12	0.14	0.16	0.13	0.71	0.22	0.35	0.0	0.16	0.51	1.0	0.0	0.24	0.17	0.09
lcl\|BLLF01002708.1_cds_GFH25070.1_19547 (GFH25070)	0.02	0.14	0.06	0.01	0.15	0.14	0.18	0.15	0.22	1.0	0.19	0.16	0.17	0.15	0.23	0.66	0.4	0.45	0.34	0.56	0.59	0.38	0.45	0.23	0.18	0.23
lcl\|BLLF01002925.1_cds_GFH25807.1_20284 (GFH25807)	0.16	0.04	0.0	0.09	0.12	0.14	0.17	0.12	0.14	0.17	0.13	0.15	0.16	0.1	0.16	1.0	0.51	0.39	0.16	0.6	0.53	0.26	0.24	0.4	0.1	0.14
lcl\|BLLF01003134.1_cds_GFH26454.1_20931 (GFH26454)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.07	0.07	0.08	0.09	0.47	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	1.0	0.12	0.26	0.2	0.28	0.72	0.1	0.32	0.42	0.03	0.17
lcl\|BLLF01003527.1_cds_GFH27572.1_22049 (GFH27572)	0.15	0.0	0.14	0.16	0.03	0.03	0.04	0.02	0.07	0.37	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.31	0.12	0.09	0.21	0.44	0.33	1.0	0.41	0.17	0.05	0.04
lcl\|BLLF01003771.1_cds_GFH28171.1_22648 (GFH28171)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.28	0.33	0.29	0.16	0.32	0.93	0.23	0.12	0.21	0.23	0.17	1.0	0.51	0.25	0.18	0.41	0.77	0.61	0.36	0.36	0.15	0.28
lcl\|BLLF01003773.1_cds_GFH28180.1_22657 (GFH28180)	0.32	0.23	0.43	0.21	0.09	0.1	0.11	0.07	0.19	0.46	0.1	0.09	0.15	0.09	0.13	1.0	0.74	0.48	0.45	0.47	0.49	0.72	0.52	0.39	0.14	0.12
lcl\|BLLF01004138.1_cds_GFH29010.1_23487 (GFH29010)	0.19	0.13	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.2	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	1.0	0.08	0.12	0.1	0.03	0.68	0.6	0.15	0.5	0.04	0.03
lcl\|BLLF01004392.1_cds_GFH29514.1_23991 (GFH29514)	0.36	0.28	0.18	0.22	0.1	0.21	0.19	0.14	0.22	0.3	0.13	0.28	0.32	0.24	0.25	0.94	0.61	0.53	0.72	0.72	0.67	0.77	1.0	0.62	0.14	0.18
lcl\|BLLF01004490.1_cds_GFH29713.1_24190 (GFH29713)	0.19	0.27	0.19	0.25	0.24	0.22	0.22	0.11	0.16	0.2	0.28	0.22	0.21	0.2	0.16	0.86	1.0	0.44	0.52	0.27	0.3	0.28	0.34	0.31	0.18	0.17
lcl\|BLLF01005282.1_cds_GFH31001.1_25478 (GFH31001)	0.28	0.03	0.0	0.29	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.08	0.01	0.02	0.0	0.03	0.01	0.04	0.0	0.27	0.32	0.35	0.32	1.0	0.33	0.35	0.01	0.0
lcl\|BLLF01006067.1_cds_GFH31921.1_26398 (GFH31921)	0.22	0.0	0.0	0.35	0.04	0.07	0.17	0.06	0.21	0.85	0.05	0.1	0.16	0.06	0.31	1.0	0.19	0.48	0.11	0.08	0.21	0.68	0.58	0.62	0.33	0.36
lcl\|BLLF01009195.1_cds_GFH33647.1_28124 (GFH33647)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.04	0.21	0.2	1.0	0.1	0.0	0.0	0.02	0.03	0.24	0.09	0.86	0.0	0.28	0.51	0.87	0.53	0.38	0.07	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)