Heatmap: Cluster_225 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
-0.01 -0.1 - -0.48 0.97 0.47 -0.31 0.07 0.44 1.01 0.18 -1.23 -0.27 -0.43 -0.54 -2.19 -0.04 -2.55 0.03 0.02 -1.09 1.11 -0.98 -1.09 1.48 0.21
- 0.19 - -0.5 0.24 0.14 0.08 -0.56 -0.15 1.3 0.13 -0.14 -0.2 -0.33 -0.74 -1.04 -2.47 0.77 -1.3 -0.77 0.45 -0.17 0.59 -0.27 1.01 1.34
0.79 -0.02 -0.11 -0.26 0.36 -0.16 -0.41 0.5 0.19 0.49 -0.16 -0.48 -0.62 -0.47 0.11 -0.62 0.06 -0.75 -0.28 -0.81 -0.89 0.28 -0.69 0.07 1.22 0.21
- -3.75 - -3.09 0.47 0.18 0.52 -0.04 0.66 0.35 0.29 -0.77 -0.11 -0.98 0.55 0.84 - -0.83 -0.25 0.52 1.44 - 0.15 -0.22 1.05 0.97
- - - -2.51 -0.64 -0.71 0.29 -0.82 -0.05 -0.08 -0.01 -0.72 -0.87 -0.38 -0.91 0.54 -0.34 1.54 0.32 -0.18 1.37 -1.6 1.19 -0.27 1.17 0.89
-0.87 - - -2.34 0.25 -0.1 0.63 -1.11 0.11 1.29 -0.47 -0.84 -0.32 -1.55 0.18 0.31 -1.24 1.41 0.41 -0.11 1.64 - -1.18 -0.68 0.88 0.54
0.57 -0.89 0.01 -0.41 -0.43 -0.21 0.26 -1.38 0.74 0.31 -0.35 -0.15 0.08 -0.79 0.54 -0.45 -1.23 0.11 0.83 -0.46 0.37 -0.86 0.53 -0.88 0.63 0.31
-0.11 -1.21 - -2.65 -0.53 0.44 -0.68 -0.27 -0.56 0.19 -0.22 -1.59 -0.44 -0.21 -0.64 -1.53 -0.06 1.66 -0.82 0.78 1.48 0.26 0.81 -0.49 0.35 0.34
-0.97 -1.49 - -2.47 -0.18 0.21 0.36 -0.5 0.3 1.44 -0.32 -0.41 0.42 -0.94 0.27 -0.86 -1.88 0.89 1.24 0.54 1.12 -2.14 -0.01 -2.25 -0.02 0.34
-0.41 - - -0.08 0.15 0.34 0.18 -1.48 0.53 0.03 0.39 -0.67 -0.52 -0.66 -1.41 -0.47 1.42 1.5 - -0.06 1.96 - - -0.43 -0.14 0.66
-5.19 - - -2.72 0.94 -0.31 0.46 -0.3 0.13 0.24 -0.22 -0.07 0.66 -0.44 0.26 - - 0.53 -2.14 -21.07 1.42 1.66 1.03 -0.6 0.66 0.6
-1.48 - - -1.15 0.27 -0.41 -2.73 -0.05 -0.79 1.55 0.32 -0.13 -2.64 -0.16 0.66 - 1.62 1.69 - - - 1.77 - -0.2 1.31 -0.41
-0.44 - - -0.06 -0.17 0.22 0.58 -1.12 0.12 -2.12 0.29 0.04 -0.43 0.7 -0.24 -0.62 2.03 0.34 0.19 -0.63 -0.52 - 0.33 -0.51 0.36 0.83
-2.01 -0.65 - - 0.08 0.51 -0.11 -0.04 0.13 0.74 -0.39 -0.04 -0.02 -0.25 -0.64 -0.08 -0.29 1.07 -0.85 -0.09 0.9 -0.36 1.06 -0.52 1.07 -0.21
-0.73 -0.13 -5.47 -0.43 0.3 0.35 -0.12 -0.48 0.31 0.58 0.01 -0.26 -0.22 -0.69 -0.37 -0.04 0.05 0.59 -1.01 0.02 0.55 0.2 0.53 -0.86 0.96 0.21
-1.63 - - -2.81 -0.03 0.27 -0.39 -0.76 0.36 0.62 -0.02 -0.55 -0.63 -1.92 -0.6 - - 1.14 1.2 1.12 1.23 0.91 0.43 -1.17 0.33 0.99
- - - -1.29 -2.87 -0.29 0.91 0.17 1.32 -0.18 0.56 0.12 0.39 -0.93 0.64 - - -0.04 0.55 -0.27 1.43 - 0.95 0.06 0.84 0.67
-0.18 - - -0.84 0.26 0.64 -0.4 -0.97 -0.19 0.55 -0.32 -0.71 -0.49 -0.87 -0.17 -2.5 -0.4 1.48 -0.74 0.44 1.25 -0.67 1.32 -1.17 0.46 0.71
-1.71 -3.17 - - -0.27 -0.07 -0.77 -0.36 -0.39 0.42 -0.33 -0.53 -0.54 0.04 -0.42 0.43 0.01 1.15 -0.66 0.34 0.8 -1.58 1.2 -0.38 1.18 1.33
- - - - 1.15 0.66 0.03 -0.14 0.25 1.64 -0.1 -0.85 -0.07 -0.77 -2.8 - - 0.86 - -1.81 1.39 - -1.01 0.05 1.63 1.78
-3.22 - - - -0.78 -0.31 0.3 -0.6 0.05 1.39 0.27 -0.09 -1.4 -1.16 0.82 - 0.87 0.94 0.94 0.11 -0.18 -0.98 0.83 -1.44 1.49 0.17
-1.33 -1.28 - -0.54 0.56 0.41 -0.17 -1.09 0.35 0.94 0.33 -0.45 -0.6 -0.38 -0.21 -1.47 0.97 1.44 - -0.67 1.0 -1.62 -0.76 -2.75 0.31 1.54
-3.73 -3.21 - -0.4 -1.39 -0.25 -0.0 -2.17 -0.46 -0.87 -0.54 -1.03 -0.59 -0.49 0.62 0.71 0.44 1.4 -2.15 -0.51 1.59 -1.07 1.01 -0.8 1.3 1.09
-1.37 -2.56 - -1.04 0.38 0.62 0.16 -2.16 -0.52 -0.35 0.49 -0.64 0.21 -0.81 -1.11 -0.44 -0.87 1.01 -0.21 0.78 1.84 0.46 -0.8 -2.07 0.9 0.63
-0.04 -1.64 -0.09 -0.69 -0.43 -0.74 -0.21 -1.3 0.17 1.23 0.18 -0.08 0.04 -0.13 -0.35 -0.11 -0.29 0.59 -0.05 -1.06 0.5 -1.97 0.33 -1.02 1.56 0.25
-1.1 - - - 0.26 0.16 0.35 -0.4 0.52 0.63 0.16 -0.23 0.13 -0.24 0.37 0.25 -0.11 0.79 -0.2 -0.22 0.73 -0.75 0.82 -1.55 0.71 0.52
- - - - 0.4 0.36 0.29 -0.52 0.75 -1.74 0.15 -0.22 0.3 -0.18 0.3 - - 0.87 0.82 0.65 0.6 1.23 0.35 -1.46 1.21 0.28
-0.46 -0.04 -1.06 -0.42 -0.37 -0.37 0.16 -1.48 0.17 0.55 -0.06 -0.65 -0.73 -0.83 -0.03 1.01 0.6 0.34 0.95 -0.17 -0.13 0.33 -0.2 -1.07 0.61 0.09
-0.45 -1.33 -3.54 -0.51 0.36 -0.22 -0.32 -0.02 -0.09 0.82 0.24 -0.05 -0.24 -0.15 -0.1 -0.82 0.2 0.55 -0.21 -0.27 0.78 0.11 0.49 -0.17 0.59 0.22
-0.75 -0.14 - -1.32 0.47 0.36 0.04 -0.48 0.26 0.18 0.63 -0.04 -0.07 -0.38 -0.12 -0.38 -1.22 0.27 -1.15 -0.47 0.54 -1.66 0.37 -0.94 1.4 1.26
-0.28 -0.14 -0.1 -0.26 -0.82 -0.45 -0.08 -1.39 0.05 0.48 -0.2 -0.35 -0.03 -0.47 0.25 0.11 0.12 0.35 0.5 -0.08 0.54 -0.18 0.67 -1.16 0.73 0.07
-1.56 -4.56 - -1.57 -0.39 0.04 -0.12 -0.42 0.13 0.91 -0.45 -0.95 -0.03 -0.28 -0.71 0.88 -1.72 1.16 1.26 -0.07 1.28 -0.98 0.15 -1.82 0.7 0.58
-1.65 -2.01 - -1.02 0.34 -0.17 -0.2 -0.15 -0.02 0.96 0.19 -0.3 -0.21 -0.19 -0.38 -0.44 -0.2 -0.12 -0.01 0.83 0.43 0.0 0.57 0.09 0.95 0.59
-1.14 -0.42 -2.02 -2.45 0.62 0.38 0.2 -0.2 0.09 0.2 0.47 -0.01 -0.14 -0.1 -0.43 -0.49 -0.34 0.44 -1.07 -0.8 0.68 -0.18 0.21 -0.28 1.12 0.85
-1.49 -1.68 - -1.69 0.35 0.5 0.43 -0.78 -0.2 0.64 0.07 0.08 0.08 0.24 -0.75 -1.83 1.68 0.66 -1.24 -1.19 1.0 -1.17 -0.29 -1.48 0.24 1.21
-2.44 - - -2.11 0.49 1.22 0.44 -2.22 0.25 - 0.11 -0.87 -0.53 -0.74 -0.94 -0.5 - 1.95 - -1.09 1.19 - 1.72 -1.89 0.2 1.85
-1.06 -2.63 -2.46 0.02 -0.92 -1.04 -0.6 -0.15 -0.12 -0.4 -0.77 -0.83 -0.59 -0.46 -0.19 -0.88 -0.42 1.33 0.2 0.44 1.3 -0.49 1.26 0.19 0.92 0.67
-0.13 -0.77 - -0.76 -0.17 0.23 0.32 -0.05 0.47 0.94 0.57 -0.54 -0.61 -0.75 0.43 -0.74 - 0.49 1.3 -0.74 -0.04 -0.43 0.48 -1.02 0.74 0.27
0.68 0.5 - 0.1 0.81 0.33 -0.56 0.22 0.56 -0.12 0.46 -0.86 -0.73 0.12 -0.39 -0.99 -0.42 -0.35 -1.77 -1.59 -0.89 -0.69 -0.27 -1.07 1.87 0.6
-0.66 -0.93 -1.5 -0.13 0.39 0.15 0.13 -0.72 -0.28 1.12 0.25 -0.14 -0.11 -0.19 0.0 -0.81 -0.61 0.66 -0.76 -0.37 0.42 0.33 0.7 -0.25 0.23 0.22
-0.76 - - -0.28 0.09 -1.41 -1.33 -0.36 -0.02 1.21 0.23 -0.91 -0.57 -0.84 0.12 - 1.04 1.7 0.7 0.47 - 0.78 0.69 -2.15 1.0 -0.39
-0.58 -6.82 - -2.87 -0.37 -0.66 0.16 -1.11 0.52 - 0.05 -0.31 0.11 -0.35 0.75 -1.51 0.78 0.76 0.84 -0.13 1.17 -0.25 0.34 -2.82 1.48 0.68
0.92 -2.08 - 0.82 0.75 0.12 -0.32 -0.19 -0.09 0.34 0.33 -0.68 -0.53 -1.0 -0.23 -1.97 -0.59 -0.16 -0.42 0.35 0.46 -1.08 -0.01 -1.31 1.75 0.13
-0.57 -0.84 -0.04 0.17 0.56 0.32 -0.33 -0.35 -0.16 0.09 0.18 -0.21 -0.26 -0.44 -0.53 -0.1 0.36 0.56 -1.6 -0.42 0.14 -0.23 -0.31 0.05 0.92 0.76
-0.1 -2.22 - -0.65 -0.1 -0.33 -0.13 -0.58 0.05 0.28 -0.15 -0.48 0.2 -0.84 0.07 -0.04 -0.24 0.76 0.56 -0.2 0.98 0.26 0.5 -0.58 0.78 0.52
0.18 - - -1.5 0.44 -0.36 0.48 -0.55 0.47 0.99 0.42 0.24 -0.59 -0.48 -0.71 - 0.53 0.89 - -1.22 -0.1 - 0.42 -0.35 1.73 1.22
-1.28 -1.45 -2.72 -2.64 0.38 0.08 -0.39 -0.31 -0.29 0.68 0.13 -0.27 -0.38 -0.17 -0.59 0.44 0.06 0.57 0.05 -0.01 0.94 -0.54 0.91 -0.11 0.6 0.57
0.31 -4.65 - -2.5 0.34 0.64 -0.03 -1.15 0.05 -0.17 0.07 -0.17 -0.92 -1.18 -0.59 -1.87 1.29 1.52 -3.22 0.27 1.07 -0.13 0.07 -2.16 0.42 1.18
-1.92 -1.84 -4.38 -1.01 0.62 0.17 -0.32 -0.54 -0.31 - 0.09 -0.63 -0.23 -1.13 -0.47 - - 0.33 1.62 0.89 0.56 0.17 1.16 -4.48 1.41 1.33
-4.51 -1.26 -1.92 - 0.6 0.55 0.22 -0.82 0.11 -2.38 0.24 -0.31 -0.25 -0.29 -0.04 - -3.16 0.81 0.3 0.72 1.32 -0.22 1.09 -2.62 1.1 1.09
-0.79 -0.56 -4.11 -1.82 0.07 -0.08 0.23 -0.58 0.17 0.75 0.01 -0.78 -0.49 -0.81 -0.54 0.85 0.03 0.17 -1.24 0.26 1.36 -1.16 0.84 -1.2 0.99 0.49
-1.33 -5.02 - -1.25 0.23 0.14 0.6 -0.65 0.59 -0.15 0.47 -0.05 0.39 -0.25 0.73 -0.73 -0.42 0.39 0.58 -0.58 0.38 -0.78 0.78 -1.13 0.58 0.82
-0.09 -3.31 -2.79 -0.32 -0.05 -0.16 0.14 -0.33 0.08 -2.08 0.06 -0.6 -0.78 0.1 -0.26 -0.33 0.12 1.53 -1.35 -1.23 1.22 -1.17 1.11 -0.38 0.71 0.88
-0.6 -6.46 -3.32 -0.47 0.01 -0.22 0.54 -0.68 0.32 0.93 0.05 -0.89 -0.58 0.17 0.0 -1.87 0.14 1.43 -1.15 -1.08 1.17 -1.88 1.15 -1.99 0.62 0.6
-1.5 -1.51 -1.22 -2.61 0.29 -0.05 -0.2 0.14 -0.28 0.63 0.06 -0.11 -0.22 -0.23 -0.47 -0.13 0.08 1.1 -0.72 0.11 1.01 -1.6 0.79 -0.13 0.71 0.43
-0.83 0.42 - -0.24 -0.6 0.17 -0.0 -0.95 0.44 1.75 -0.08 0.27 -0.02 -0.63 -0.66 -1.22 -1.65 0.43 -0.99 -0.81 0.89 - 0.42 -1.95 1.56 0.33
-0.25 - -4.53 0.49 -0.45 0.42 0.21 -0.66 -0.54 -0.99 -0.62 -0.1 -0.58 -0.57 -1.31 -0.81 1.56 0.64 -0.58 -0.23 1.2 0.3 0.63 -0.29 0.2 0.75
-1.04 -0.33 - -0.08 -0.2 -0.04 -0.04 -0.57 0.08 0.37 -0.14 -0.84 -0.25 -0.91 -0.65 -1.22 -1.65 1.23 0.33 0.89 0.89 0.08 1.32 -0.9 0.16 0.27
-0.72 0.13 -1.29 -0.99 0.37 0.16 -0.6 -0.21 0.08 0.65 0.42 0.31 -0.08 0.09 -0.23 -1.82 -0.98 0.31 -0.1 0.36 0.97 0.63 0.08 -0.62 0.02 -0.11
-0.64 -0.63 - - -0.08 -0.14 -0.14 -0.17 0.11 0.97 0.07 -0.03 0.27 0.08 -0.2 -1.62 -0.46 1.35 -0.81 -2.21 1.58 -1.31 1.1 -1.3 0.52 0.17
0.21 -0.44 - -1.1 0.54 -0.02 0.47 -3.37 0.48 1.01 0.88 -0.48 -0.2 -0.67 -0.12 -1.08 1.4 -0.44 0.15 0.14 -1.97 - -0.86 - 1.49 0.75
-1.12 -0.44 - -2.14 -0.22 -0.03 0.09 -1.11 0.22 1.47 -0.19 -0.52 -0.18 -0.84 -0.85 0.47 0.26 0.85 0.11 0.46 0.57 0.19 0.1 -2.73 1.11 -0.19
-0.72 -4.04 - -1.26 0.06 0.68 0.38 -1.04 -0.26 -0.39 0.45 0.3 0.24 -0.55 -0.31 -0.35 -0.32 1.15 -1.12 0.87 0.93 -2.04 0.93 -1.56 0.18 1.01
-0.79 - - -1.46 0.28 0.27 0.88 -1.42 0.7 -1.94 0.37 0.0 0.01 0.67 0.21 - 1.45 0.79 -1.21 - -0.33 - 0.78 -3.37 0.89 1.66
-2.06 -0.82 - 1.23 -0.65 1.02 0.14 -0.93 0.28 -1.36 0.06 -0.55 -0.23 0.1 -0.89 -0.86 -0.29 1.66 -0.63 -1.45 0.83 - 1.58 -1.07 -0.68 0.46
-1.34 - - -3.01 0.32 0.15 0.09 -0.37 0.17 0.6 0.24 -0.41 0.37 0.25 0.23 0.01 -0.61 1.61 -2.76 -1.26 1.37 -1.68 0.97 -0.92 0.56 -0.12
0.05 - - - -0.8 -0.47 -1.16 -0.9 -0.27 0.9 -0.06 0.2 0.11 -1.88 -0.05 - - 2.04 - -0.19 1.51 - 1.03 -2.56 1.63 1.27
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1.15 -4.97 -0.54 -0.53 0.34 0.1 -0.45 -0.37 -0.05 1.33 0.11 -0.37 -0.64 -0.57 -0.43 -1.28 0.04 -0.12 0.12 0.03 0.41 -0.17 -0.74 -3.8 1.38 0.23
-1.75 - - 0.4 -0.63 0.57 -0.31 -0.83 -1.24 -0.61 0.34 0.2 -0.47 -0.36 -2.15 -1.69 1.05 0.76 0.12 1.04 1.22 0.2 0.26 -1.35 0.53 0.94
-2.52 -2.38 - - 0.46 0.43 0.32 -0.75 -0.05 0.72 0.52 0.34 -0.21 -0.09 -0.1 -1.02 0.22 0.95 -0.77 -0.53 1.17 -0.14 0.95 -0.2 0.55 -0.52
-0.91 -0.05 - -1.47 0.2 -0.27 0.39 -0.37 0.34 0.22 0.49 -0.2 0.03 -0.07 -0.09 -1.19 0.49 0.43 -0.64 -0.15 0.5 -0.77 0.01 -1.2 1.31 0.84
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-1.1 -0.32 -2.32 -1.17 0.46 0.18 -0.06 -0.47 -0.0 0.16 0.24 0.12 -0.0 -0.67 -0.03 -0.06 -0.55 0.66 -0.62 -0.03 0.85 0.7 0.68 -0.29 0.35 -0.09
-0.73 -1.15 -4.18 -2.17 0.18 0.33 0.04 -0.69 -0.09 -0.04 -0.04 -0.06 -0.72 -0.84 -0.2 0.09 -0.89 0.92 0.05 -0.03 1.2 0.31 0.88 -0.03 0.68 0.37
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-2.15 -2.73 - -5.58 -0.92 -0.23 0.27 -1.71 0.02 -2.2 -0.37 0.17 0.22 -0.8 0.73 0.44 -0.06 0.76 -1.19 -0.08 1.63 0.82 0.62 -1.09 0.79 1.12
- - - -1.22 0.44 -0.0 -0.36 -0.42 0.26 0.3 0.47 -0.28 0.32 0.18 0.05 -20.7 -0.18 0.75 - 0.44 1.0 1.2 0.88 -2.58 0.87 0.66
0.08 -0.28 -0.11 -4.33 -0.7 -0.43 0.5 -1.15 0.47 -0.37 -0.71 -0.63 0.2 -1.1 -0.11 0.15 -0.48 0.84 0.08 -0.51 1.16 0.08 0.69 -0.64 0.27 0.87
-3.3 0.07 - -0.57 -0.29 0.37 0.15 -0.12 0.52 -0.22 -0.2 0.0 0.39 -0.13 0.49 -1.98 -1.29 0.66 0.9 0.48 0.17 0.6 0.39 -1.18 0.21 0.25
- - - - -0.14 - 0.02 - -0.21 2.54 - -0.18 - -0.32 -0.2 - - - - 2.44 - - - -0.93 2.56 1.58
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-0.47 -3.98 - 0.12 0.28 0.13 -0.54 -0.36 0.65 0.23 0.17 -0.09 -0.68 -0.39 -0.59 0.14 1.04 1.25 -0.63 -0.86 1.06 - 0.58 -0.78 0.37 0.39
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-1.14 -2.15 - -2.5 -0.14 0.27 0.18 -0.65 0.27 0.72 0.3 0.08 -0.17 -0.02 -0.23 0.94 0.43 0.61 -1.14 -1.96 1.04 -0.22 0.75 -1.55 1.03 -0.13
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-2.7 -3.03 - -3.37 -0.19 -0.71 0.45 -1.61 0.55 1.44 0.5 -0.2 0.09 -0.24 0.34 -1.76 0.13 1.05 0.06 -0.76 1.81 - 0.87 -1.91 -0.06 0.18
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- - - - -0.18 0.51 0.53 -0.41 0.5 1.5 -0.14 -0.69 -0.56 -1.17 -1.47 - 0.85 0.84 -0.58 0.19 -0.7 1.09 1.64 -1.93 0.72 0.1
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-2.22 -4.67 - -4.02 -0.08 -0.25 -0.26 -0.86 -0.54 1.8 -0.51 0.01 -0.31 -1.0 -0.45 -0.91 -1.18 -0.27 0.13 1.5 0.24 -0.89 0.27 0.04 1.51 1.03
-2.4 - - -1.13 0.82 0.4 0.26 -0.39 0.31 1.14 0.12 0.3 -0.55 -0.21 -0.01 - 0.57 1.34 -2.45 - 1.01 0.62 0.17 -0.67 0.89 -0.67
-1.87 - - - -0.7 -0.25 -0.02 -0.51 0.09 0.98 -0.75 -0.13 0.21 0.11 -1.31 -1.52 0.37 1.59 - - 0.59 -1.21 1.12 -0.82 1.59 1.61
- - - - 0.97 0.81 - 0.03 - - 1.01 - -0.7 -0.81 0.14 - 2.97 - - - - 2.71 - -0.5 0.93 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.