Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
-2.17 -3.08 -3.1 -3.61 -1.18 -0.46 -0.97 -1.41 -1.21 1.13 -0.9 -0.46 -1.3 -1.05 -1.7 1.95 0.88 0.31 -1.05 -0.57 0.75 1.11 0.86 0.7 0.33 0.77
-1.45 -4.06 - -4.88 -2.09 -0.66 -1.15 -1.67 -1.03 0.09 -1.24 -0.91 -1.43 -2.17 -1.63 2.6 1.78 -0.57 -1.58 -0.36 0.53 0.27 0.4 0.7 0.68 0.99
-0.29 -1.65 - - -0.6 -0.07 -0.54 -0.39 -0.26 0.54 0.23 -0.57 -0.51 -1.74 -0.59 1.81 0.44 -0.82 - -0.84 0.87 - 1.14 1.75 0.69 -0.02
-0.46 - - -3.43 -0.55 0.36 -0.71 -1.09 -0.21 0.85 -0.31 0.36 -0.42 -1.14 -0.86 -0.23 -0.08 0.52 -1.59 -2.41 -0.39 0.66 0.4 1.91 0.92 1.37
-1.81 -0.33 - -2.36 -1.24 -2.36 -0.84 -0.15 -0.75 - -0.64 -1.04 -0.91 -0.09 -0.1 2.06 0.63 1.59 -1.52 0.47 1.17 - 0.69 1.57 -1.05 -0.4
-0.51 -1.02 - -2.5 -0.92 -1.28 1.02 -3.17 -0.06 0.61 -0.94 -2.08 -0.1 -2.13 -0.25 0.69 -0.32 0.75 -2.05 0.1 0.21 - -1.26 0.03 1.8 2.26
-1.11 -1.74 -2.44 -1.99 -0.15 -0.35 -0.07 -0.16 0.02 -0.37 -0.15 -0.36 -0.05 0.09 -0.14 0.4 0.71 0.76 -1.34 -0.64 0.57 0.45 0.83 0.77 0.67 0.32
- - - -1.99 0.43 0.12 -0.09 -1.68 -1.31 0.11 0.49 -0.42 -1.81 -1.63 -0.65 1.61 -0.82 0.26 - 1.61 - 1.5 0.25 1.49 -0.05 0.62
- - - 0.27 -2.31 -0.0 -0.62 -1.43 -1.38 - -1.32 -0.33 -2.07 -0.29 -0.07 - 0.45 0.52 - 0.29 0.98 1.18 - 2.6 1.86 -0.0
- - - - -2.03 0.75 - -1.18 -0.51 1.66 - -1.07 0.09 - -2.12 3.48 - - - - - - 0.79 1.44 -1.32 1.02
-1.93 -3.0 - -1.28 -0.14 -0.05 -0.12 -0.25 -0.0 0.6 -0.48 -0.39 -0.29 -0.46 -0.95 2.15 -0.02 -0.53 -1.21 -0.18 -0.19 1.0 0.33 0.9 -1.07 0.7
-1.14 -2.15 - -6.72 -0.11 -0.14 -0.19 -0.16 -0.04 0.45 -0.27 -0.42 -0.28 -0.71 -0.14 2.11 1.2 -0.08 -2.04 -0.9 0.28 -1.35 -0.2 0.68 0.76 0.43
-0.23 -4.02 - -1.27 -1.1 -0.15 -0.21 -1.23 -0.46 -0.4 -0.27 -0.24 -0.35 -0.93 -0.34 1.64 1.06 0.82 -0.85 -0.79 0.62 0.35 0.73 1.08 0.17 -0.06
-1.11 -0.07 - -3.36 -2.15 -1.24 -1.65 -2.44 -2.53 0.85 -0.59 -0.54 -0.94 -0.98 -2.76 1.78 -0.09 -0.85 -0.27 -1.09 1.87 0.63 0.4 0.77 0.96 1.29
-0.82 -1.27 - -1.76 0.22 -0.56 -0.05 -0.62 0.04 1.31 0.06 -0.59 -0.25 -0.5 -0.24 1.99 0.55 0.29 - -1.11 0.56 -1.12 0.57 0.09 -0.12 0.15
-2.81 -4.18 -5.26 -2.34 -2.03 0.12 -0.67 -1.85 -1.58 -1.72 -2.05 -0.26 -1.08 -1.02 -2.22 2.01 0.93 0.8 -2.31 -0.68 1.52 -0.07 -0.1 2.08 0.46 0.67
-2.28 -2.1 -3.8 -0.44 -0.84 -0.28 -0.71 -2.68 -1.16 -2.58 -0.75 -1.16 -2.42 -1.98 -1.81 2.44 -0.05 0.37 -2.85 -1.09 1.11 -1.78 0.55 1.49 0.14 2.04
0.17 -1.14 - -0.62 -0.5 -0.35 -0.27 -0.32 -0.11 0.0 -0.57 -0.62 -0.34 -0.36 -0.49 0.73 -0.1 0.8 -0.4 0.03 0.06 0.58 0.36 0.65 0.68 1.02
-0.22 0.02 - -4.19 -1.39 -0.76 -0.93 -1.93 -0.91 -0.25 -1.41 -1.84 -1.5 -1.92 -1.97 1.84 -0.13 0.96 -0.89 -1.13 1.47 -0.82 0.91 1.39 0.67 1.37
-1.15 -3.02 - -1.06 0.02 -0.3 0.21 -0.76 -0.07 -0.95 -0.01 -0.37 -0.23 -0.55 -0.34 1.4 1.16 0.12 -0.96 -0.78 0.14 -0.01 0.22 1.02 0.91 0.68
-1.09 0.09 - 0.82 -0.15 -0.37 -0.23 -0.94 -0.47 0.64 -0.26 -0.88 -1.32 -1.65 -1.2 1.14 0.93 0.93 -0.8 -1.04 -0.6 -0.72 0.77 1.16 -0.08 0.68
-1.08 -1.89 - -2.06 -0.92 -0.52 -0.79 -1.77 -0.85 -1.17 -0.7 -0.73 -0.95 -1.19 -1.99 1.65 0.12 0.44 -1.29 -0.73 0.59 -0.08 0.52 0.81 1.7 2.01
-0.79 -1.83 - -1.35 0.22 -0.54 -0.4 -0.43 -0.41 -1.05 -0.02 -1.1 -0.73 -0.29 -0.38 0.91 -0.66 0.41 -0.32 0.94 1.02 0.34 0.54 0.97 0.68 0.72
-2.05 -2.84 - -1.46 -1.11 -0.46 -0.43 -1.57 -0.86 -0.89 -0.87 -0.9 -1.35 -1.45 -1.4 2.79 0.04 0.7 -3.62 -1.86 0.96 -0.74 0.64 1.76 -0.49 0.6
-2.15 -0.44 -3.42 -3.86 0.36 0.34 -0.21 0.07 -0.38 1.05 0.43 0.09 -0.19 0.16 -1.04 0.4 0.68 -0.15 -1.37 -0.97 0.45 -0.57 -0.15 0.61 0.75 0.87
0.07 0.67 - -2.28 -1.0 -0.48 -0.46 -1.68 -0.42 0.06 -1.25 -1.3 -1.48 -2.22 -1.46 2.52 0.5 -0.17 -1.74 -0.81 0.41 0.58 -0.58 1.15 -0.06 0.82
-1.09 0.35 -2.14 -2.07 -0.7 -0.33 0.02 -2.27 -0.36 0.69 -0.86 -0.89 -0.93 -1.59 -1.51 2.11 1.06 -0.2 -0.19 -0.8 0.62 -0.44 0.13 0.89 0.59 0.0
-1.86 -0.71 -0.51 -1.53 0.05 0.07 -0.25 0.0 -0.51 -0.53 -0.14 -0.21 -0.36 -0.36 -0.9 1.25 0.89 -0.11 -0.28 -0.94 -0.12 -0.01 -0.01 0.66 0.98 0.94
-2.16 0.05 - -1.25 -0.89 -0.94 -0.89 -0.67 -0.82 -0.51 -0.57 -0.23 -1.02 -0.48 -1.17 1.27 0.45 0.53 -2.59 -1.09 0.1 -0.51 0.71 1.94 0.64 1.57
-1.13 -1.05 - -2.92 -0.4 -0.37 -0.8 -1.96 -1.13 0.22 -0.77 -1.0 -1.97 -1.64 -1.74 2.63 -0.93 0.04 -1.67 0.87 1.12 -1.13 0.23 0.86 -0.44 1.45
0.02 0.82 - -3.79 -0.72 -0.11 -0.42 -0.99 -0.27 0.16 -0.75 -1.01 -1.45 -1.25 -1.01 1.46 -0.44 -0.06 -2.3 -0.35 0.42 -0.21 -0.16 0.91 1.13 1.78
-1.48 -1.01 -1.34 -0.67 -0.57 0.21 -0.4 -1.42 -0.67 -0.52 -0.02 -0.1 -0.73 -0.5 -1.69 1.96 0.8 0.32 -0.98 -0.29 0.55 -0.54 0.2 0.14 0.82 0.95
-0.37 -3.71 - -2.14 -0.68 -0.42 -0.38 -1.17 -1.04 0.48 -0.32 -0.73 -0.79 -0.42 -1.35 1.01 0.83 0.7 -0.14 -0.24 1.0 -0.61 0.48 0.53 1.04 1.4
-0.82 -1.01 - -2.86 -1.03 -0.23 -0.05 -1.0 -0.75 -0.93 -0.48 -0.22 -0.23 -0.43 -0.89 1.9 1.24 0.44 -0.56 -0.34 0.58 0.05 0.51 0.83 -0.03 0.61
- - - - -1.28 -0.55 -0.97 -2.28 -0.81 -0.17 -0.44 -1.31 -2.74 -1.33 -2.93 1.33 1.48 0.97 -1.03 -0.85 0.85 -0.95 -0.04 2.09 0.97 1.64
0.2 -0.22 -1.75 -0.51 -0.48 0.03 -0.35 -1.67 -0.52 0.14 -0.35 -0.6 -0.51 -0.85 -1.66 1.34 1.07 -0.91 -0.32 0.64 0.66 -0.05 -0.27 0.46 0.72 0.49
-0.66 -1.44 - -0.45 -0.41 0.08 0.03 -0.73 -0.33 -0.1 -0.36 -1.01 -0.93 -0.75 -1.14 0.69 1.17 0.66 -0.27 -0.44 0.26 -0.41 0.79 1.6 0.2 0.48
-1.01 - - 1.52 -1.39 -1.81 -1.57 -0.51 -0.28 0.63 -2.28 -2.09 -0.94 -2.39 -0.07 0.8 -0.63 - 0.03 - -1.09 - -1.56 1.13 2.0 2.59
0.15 -1.64 - -0.58 -0.24 -0.66 -0.99 -1.09 -0.27 0.07 -0.48 -1.11 -1.29 -0.99 -0.95 1.49 1.21 1.05 -0.4 -0.58 -0.18 -0.13 0.33 0.41 0.81 1.14
-0.38 -1.25 -0.03 -3.04 0.05 0.24 -0.24 -0.89 -0.53 -1.25 -0.26 -0.29 -0.55 -0.37 -0.88 1.29 0.37 0.67 -1.36 -1.76 1.13 -0.13 0.3 1.11 0.5 0.51
-0.95 - - -0.36 -0.13 0.64 -0.56 -0.89 -0.36 1.07 0.08 -0.19 -0.59 -1.29 -0.61 -0.75 -1.18 0.21 -0.52 -0.02 0.94 - 0.47 1.2 0.9 1.65
-1.71 -1.53 - - -0.44 -0.13 -0.26 -0.65 -0.11 0.55 -0.93 -0.55 -1.0 -1.21 -1.03 1.76 -1.06 0.05 -2.43 -1.38 0.27 -0.77 0.26 1.72 1.23 1.63
-2.24 - - - -0.54 -0.2 -0.49 0.03 -0.39 -0.29 -0.24 -0.12 -0.61 0.11 -0.59 1.35 0.36 0.44 -0.56 0.47 1.24 0.52 0.69 0.64 0.39 0.29
-0.8 -3.99 - -2.96 -0.26 0.11 0.08 -1.02 -0.23 0.32 -0.18 -0.8 -1.05 -0.73 -1.02 2.23 0.39 -0.25 -1.12 -0.62 0.46 -0.72 -0.91 1.77 -0.18 0.89
-0.53 -1.33 - -1.69 -1.15 -0.26 -0.5 -0.78 -0.68 0.57 -1.04 -0.98 -0.34 -0.62 -0.85 1.83 0.14 0.99 -2.9 -0.82 0.5 0.24 0.55 0.82 0.8 1.0
-0.43 -0.17 -2.87 -2.29 -0.18 -0.21 -0.43 -0.17 -0.32 0.82 -0.23 -0.73 -0.79 -0.6 -0.97 1.99 0.31 -0.14 -0.97 0.23 0.41 -1.0 -0.03 0.79 -0.18 0.73
-2.27 -1.14 - -2.27 -1.76 -0.35 -0.16 -2.88 -0.59 1.45 -1.24 -1.61 -2.49 -1.74 -1.79 2.62 -1.28 -1.21 -0.63 -2.67 -0.23 -0.18 -0.86 1.07 0.62 2.12
-2.15 -0.76 - -2.52 -0.27 0.7 0.28 -0.17 0.08 0.98 0.03 0.06 -0.36 -0.1 -0.48 2.15 -0.76 -1.1 -3.69 -2.92 0.0 -0.61 -0.11 0.56 -0.14 1.17
-0.82 -0.61 - -0.99 0.02 -0.39 -0.9 -0.5 -0.36 0.27 -0.44 -0.8 -0.69 -0.66 -1.19 -0.38 0.97 0.79 -1.32 -1.33 0.81 0.56 1.08 0.96 0.89 0.89
-1.28 - - 0.93 0.47 0.05 -0.15 -0.43 0.15 - 0.79 -0.66 -0.28 0.44 -1.87 0.07 0.64 0.3 -0.7 -1.52 -0.82 - 0.29 2.08 0.99 -0.21
0.31 -0.31 - -0.23 -0.12 -0.67 -0.62 -0.54 -0.23 -1.56 -0.37 -0.56 -0.68 -0.63 -0.25 -0.78 -0.42 0.36 0.38 0.34 0.52 0.32 0.35 1.32 1.36 0.34
-0.33 -1.19 - -3.2 -0.17 -0.29 -0.13 -0.53 0.07 -1.51 -0.36 -0.25 -0.73 -0.86 -0.14 2.01 1.22 0.05 -1.37 -1.19 0.25 -0.17 0.54 1.0 0.49 0.13
-0.62 - -1.48 -2.59 -0.02 -0.24 -0.72 -0.32 -0.52 0.51 -0.21 -0.51 -0.79 -0.83 -1.34 1.56 0.16 0.32 -2.34 0.87 1.11 -0.17 0.15 0.9 0.6 0.58
-0.05 -0.32 -2.66 -1.3 -1.11 -0.55 -0.81 -0.8 -0.68 0.62 -1.23 -1.12 -0.83 -1.08 -1.28 1.31 0.55 0.78 -0.83 0.21 0.82 -0.09 0.1 0.86 0.74 1.17
0.11 -2.08 -1.55 -0.42 0.12 -0.23 -0.58 -0.04 -0.16 -1.08 -0.22 -0.31 -0.5 -0.48 -0.32 0.91 0.71 0.38 -1.23 -0.43 0.31 -1.04 0.42 0.81 1.04 0.92
-0.65 -0.23 -1.23 -0.96 0.13 0.1 0.06 -0.44 0.02 0.54 -0.18 -0.24 -0.13 -0.91 -0.04 1.53 0.06 -0.03 -1.42 -0.82 0.4 0.27 0.19 0.36 0.01 0.26
- - - - -0.92 -0.24 -0.14 -0.25 -0.17 1.36 -0.78 -0.69 -0.65 -0.03 -1.55 1.93 0.36 0.11 - -0.32 1.57 -1.23 1.49 -0.23 -0.61 0.65
-0.4 -0.65 -2.79 -2.39 0.04 0.2 -0.45 -1.0 -0.61 -0.04 -0.51 -0.28 -0.91 -0.53 -1.16 1.78 1.08 0.31 -1.21 -0.67 0.95 -0.03 0.6 0.3 0.3 0.37
-0.14 -2.38 - -4.95 -0.19 0.21 -0.42 -0.35 0.12 0.11 -0.3 -0.61 -0.54 -0.73 -0.45 0.82 -0.53 0.72 -1.8 -0.13 1.05 0.82 0.42 0.91 0.32 1.02
-1.49 - - -0.87 0.46 -0.92 0.04 0.26 0.3 -1.08 0.49 -0.09 0.21 0.15 -0.1 0.81 0.38 0.23 -2.35 -0.85 0.53 -0.27 0.44 1.16 1.01 -0.25
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-2.51 -1.8 - -0.23 -1.9 -1.14 -0.33 -1.66 0.57 - -1.4 -1.09 -1.01 -0.66 0.34 1.16 1.55 1.23 - 0.08 0.89 -1.02 1.36 0.99 0.64 0.16
-3.32 -3.66 - -1.67 -0.11 -0.26 -0.8 -1.0 -0.92 0.58 -0.16 -1.12 -1.27 -0.54 -1.32 1.2 0.53 1.26 -0.15 -0.97 1.56 0.81 -0.17 0.94 0.73 0.12
-2.78 - - -1.78 -5.53 -5.55 -3.32 -3.07 -4.01 0.16 -6.54 -6.56 -5.37 -3.48 -3.8 2.9 0.93 1.0 -0.53 -0.13 1.57 0.55 1.68 1.71 -5.82 -5.81
-3.25 - - -0.86 0.04 -0.09 -0.87 0.39 0.21 -0.24 0.47 -0.87 -1.56 -0.2 -0.99 0.94 0.68 0.75 -1.83 -0.65 1.22 -1.75 0.74 0.74 0.27 1.36
-0.1 0.42 -0.44 -0.51 -0.47 -0.33 -0.55 0.41 -0.01 0.06 -0.47 -0.48 -0.43 -0.02 -0.01 -0.66 -0.02 -0.2 -0.1 0.45 -0.22 1.45 -0.09 0.68 -0.2 -0.36
- - - -0.0 -0.22 -0.37 -0.62 -1.43 -0.81 - -0.45 -1.05 -1.23 -1.11 -0.99 1.85 1.32 1.91 - -1.06 0.12 -0.57 0.75 1.64 -0.69 0.71
-1.7 -1.8 -1.56 0.14 0.15 -0.12 0.14 0.08 -0.2 -0.49 -0.04 -0.33 -0.49 -0.29 -0.44 0.98 0.45 0.87 -1.18 -2.0 0.18 0.19 0.79 0.93 0.39 0.11
-0.38 -4.95 - -2.51 -2.97 -4.24 -2.49 -0.85 -2.08 0.42 -2.68 -3.46 -3.47 -2.11 -2.27 2.1 0.25 0.6 -0.81 1.33 1.68 1.47 0.79 1.93 -3.03 -4.24
-1.42 -1.19 -1.24 -2.09 -0.95 -0.95 -1.18 -1.38 -1.07 -0.44 -0.78 -0.81 -0.53 -1.07 -0.96 2.17 0.69 -0.14 -0.84 1.03 0.59 -0.85 -0.11 1.4 0.43 1.02
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-1.6 -2.01 - 0.9 0.52 -0.04 -0.11 -0.2 -0.68 1.08 0.62 -0.32 -0.58 0.1 -1.68 0.12 -0.31 -0.24 -1.65 - -1.78 0.01 0.07 1.35 0.34 1.59
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0.38 -0.18 - -0.1 -2.07 -1.68 -1.23 -2.41 -1.28 0.42 -1.79 -1.9 -1.98 -1.7 -1.88 2.19 0.46 0.05 -0.26 0.5 0.52 -0.29 0.09 1.13 0.37 1.36
-2.42 -0.72 0.35 -1.1 -0.8 -0.51 -0.89 -2.11 -0.88 -0.92 -0.85 -0.89 -1.01 -1.58 -1.48 2.01 0.65 -0.02 -0.63 -0.26 0.33 -0.32 0.16 0.76 0.89 1.72
-1.29 -0.87 - -3.05 -0.86 -0.19 -0.59 -0.14 0.08 0.5 -0.19 -0.36 -0.23 -0.25 -0.14 1.42 -0.51 -0.08 -1.02 0.11 0.38 -0.48 0.43 0.74 0.7 1.4
-2.85 -2.46 - -0.64 -0.54 -0.87 -0.44 0.29 -0.47 0.85 -0.66 -0.82 -1.11 -0.53 -0.49 1.08 -0.02 -0.03 - -2.51 -1.5 -1.61 0.25 0.52 2.03 2.2
-2.3 -0.95 - -4.45 -0.77 -0.62 -1.51 -0.02 -0.77 -0.74 -1.18 -1.47 -2.22 -1.2 -1.6 2.05 0.08 -0.96 -1.5 -0.38 0.3 -0.48 -0.59 0.66 1.55 2.52
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- -3.36 - -1.7 -1.28 -1.47 -1.26 -2.06 -1.53 -0.0 -1.2 -1.7 -0.62 -0.66 -2.02 1.23 1.29 0.88 -0.86 0.64 2.19 0.22 -0.46 1.19 0.9 0.26
-0.71 -0.92 - -3.17 -0.38 0.07 -0.12 -0.5 -0.65 0.2 -0.11 -0.11 -0.36 -0.31 -0.8 1.52 0.62 0.36 -2.17 -0.82 0.54 -0.36 0.46 0.76 0.7 1.08
-1.06 -0.34 - 0.42 -0.6 -1.4 -1.2 -0.24 -0.62 0.12 -0.79 -1.63 -1.27 -0.99 -0.9 2.32 0.56 0.29 0.28 0.69 0.51 0.16 -0.0 0.96 -0.68 -1.61
-0.73 -1.47 -2.91 -0.89 0.07 -0.05 -0.19 -0.72 -0.47 -1.07 -0.01 -0.52 -0.23 -0.52 -0.43 0.86 1.44 0.51 -0.1 -0.03 0.86 -0.32 0.47 0.71 0.24 0.04
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-4.46 -2.65 - -2.87 -1.2 -0.39 -0.48 -1.26 -0.12 -0.76 -1.52 -1.82 -1.69 -2.15 -1.39 2.65 0.87 -0.3 -0.71 -1.05 1.49 0.21 -0.63 1.46 0.21 0.8
0.15 -0.29 -0.9 -2.39 -0.73 -0.42 -0.33 0.15 -0.2 0.74 -1.01 -0.6 -0.68 -0.44 -0.73 1.49 -0.33 0.41 -2.31 -1.32 0.7 -0.71 0.43 0.75 0.28 1.27
-1.2 - - -4.53 -1.77 -0.95 -0.78 -1.59 0.06 -0.84 -1.05 -1.18 -0.82 -2.21 -0.52 -0.04 1.57 1.1 -1.11 -0.19 1.14 -0.03 1.08 0.93 1.67 0.99
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-0.43 - - -1.98 0.17 0.09 0.04 -1.6 -0.46 -0.14 -0.1 -0.44 -0.67 -0.1 -1.05 0.04 -0.8 0.49 - -0.23 0.73 -1.65 -0.33 1.53 1.54 1.87
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-4.04 -1.14 - -1.12 -0.38 -0.55 -0.24 -0.16 0.04 0.4 -0.6 -0.44 -0.47 -0.68 0.17 1.49 -0.94 -1.46 -1.87 -0.69 0.59 - -2.47 0.87 1.98 1.84

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.