Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000029.1_cds_GFH06237.1_714 (GFH06237)	0.07	0.09	0.0	0.57	0.41	0.38	0.38	0.13	0.28	0.68	0.27	0.16	0.35	0.32	0.23	0.35	0.71	0.41	0.1	0.06	0.28	0.22	0.2	0.53	0.77	1.0
lcl\|BLLF01000070.1_cds_GFH07035.1_1512 (GFH07035)	0.03	0.0	0.0	0.25	0.16	0.16	0.27	0.27	0.41	0.07	0.14	0.16	0.19	0.18	0.4	1.0	0.35	0.18	0.06	0.07	0.04	0.14	0.43	0.36	0.59	0.87
lcl\|BLLF01000086.1_cds_GFH07305.1_1782 (GFH07305)	0.01	0.0	0.0	0.23	0.03	0.19	0.07	0.06	0.05	0.58	0.35	0.16	0.1	0.03	0.05	0.76	0.0	0.18	0.54	0.0	1.0	0.29	0.36	0.68	0.93	0.56
lcl\|BLLF01000103.1_cds_GFH07577.1_2054 (GFH07577)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.34	0.35	0.1	0.1	0.14	0.29	0.17	0.15	0.22	0.04	0.2	0.29	0.31	0.0	0.26	0.84	0.48	0.15	0.35	0.63	1.0
lcl\|BLLF01000150.1_cds_GFH08285.1_2762 (GFH08285)	0.33	0.18	0.14	0.14	0.32	0.54	0.6	0.51	0.42	0.66	0.39	0.65	0.64	0.87	0.56	0.59	0.78	0.62	0.32	0.06	0.63	0.2	1.0	0.62	0.6	0.8
lcl\|BLLF01000171.1_cds_GFH08598.1_3075 (GFH08598)	0.2	0.05	0.0	0.39	0.05	0.24	0.29	0.17	0.2	0.51	0.08	0.16	0.06	0.13	0.21	1.0	0.89	0.37	0.0	0.0	0.77	0.0	0.39	0.19	0.51	0.31
lcl\|BLLF01000177.1_cds_GFH08686.1_3163 (GFH08686)	0.31	0.11	0.0	0.21	0.7	0.45	0.63	0.27	0.68	0.36	0.53	0.42	0.48	0.35	0.45	0.13	0.19	0.4	0.15	0.25	0.28	0.16	0.3	1.0	0.74	0.58
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09598.1_4075 (GFH09598)	0.6	0.25	0.03	0.43	0.58	0.66	0.59	0.22	0.49	0.47	0.44	0.42	0.39	0.27	0.39	0.38	0.39	0.43	0.19	0.1	0.36	0.33	0.45	0.53	1.0	0.79
lcl\|BLLF01000354.1_cds_GFH10866.1_5343 (GFH10866)	0.19	0.18	0.31	0.2	0.32	0.71	0.48	0.39	0.33	0.05	0.45	0.58	0.5	0.52	0.24	0.39	0.55	0.63	0.45	0.41	1.0	0.91	0.75	0.74	0.59	0.42
lcl\|BLLF01000366.1_cds_GFH11012.1_5489 (GFH11012)	0.11	0.03	0.0	0.07	0.14	0.73	0.32	0.25	0.22	0.23	0.2	0.27	0.41	0.42	0.3	0.07	0.05	0.72	0.0	0.13	0.28	0.08	0.67	0.45	0.26	1.0
lcl\|BLLF01000388.1_cds_GFH11269.1_5746 (GFH11269)	0.11	0.0	0.0	0.1	0.37	0.81	0.47	0.22	0.26	0.55	0.57	0.42	0.58	0.56	0.11	0.62	0.92	0.6	0.0	0.41	1.0	0.57	0.36	0.71	0.56	0.28
lcl\|BLLF01000405.1_cds_GFH11452.1_5929 (GFH11452)	0.3	0.21	0.05	0.14	0.4	0.51	0.24	0.26	0.24	0.59	0.47	0.4	0.45	0.34	0.16	0.55	1.0	0.44	0.31	0.38	0.76	0.81	0.52	0.56	0.45	0.49
lcl\|BLLF01000407.1_cds_GFH11464.1_5941 (GFH11464)	0.06	0.0	0.0	0.07	0.12	0.59	0.24	0.19	0.14	0.46	0.2	0.16	0.44	0.36	0.05	0.0	0.16	0.67	0.25	0.29	0.93	0.0	1.0	0.59	0.89	0.47
lcl\|BLLF01000428.1_cds_GFH11710.1_6187 (GFH11710)	0.21	0.0	0.0	0.53	0.28	0.31	0.44	0.18	0.3	1.0	0.36	0.34	0.41	0.39	0.32	0.0	0.3	0.42	0.24	0.04	0.58	0.5	0.37	0.66	0.52	0.8
lcl\|BLLF01000474.1_cds_GFH12163.1_6640 (GFH12163)	0.42	0.16	0.0	0.24	0.4	0.47	0.39	0.27	0.45	1.0	0.49	0.41	0.5	0.4	0.35	0.25	0.55	0.53	0.65	0.29	0.6	0.46	0.57	0.27	0.51	0.66
lcl\|BLLF01000522.1_cds_GFH12626.1_7103 (GFH12626)	0.39	0.1	0.0	0.37	0.26	0.34	0.51	0.23	0.41	0.61	0.29	0.31	0.3	0.24	0.27	0.72	0.78	0.59	0.16	0.39	0.62	0.46	0.6	0.38	1.0	0.62
lcl\|BLLF01000598.1_cds_GFH13316.1_7793 (GFH13316)	0.38	0.2	0.0	0.0	0.25	0.29	0.21	0.23	0.24	0.08	0.25	0.12	0.29	0.31	0.19	0.46	0.0	0.18	0.27	0.45	0.74	0.28	0.0	0.37	0.74	1.0
lcl\|BLLF01000723.1_cds_GFH14419.1_8896 (GFH14419)	0.44	0.12	0.34	0.18	0.34	0.55	0.3	0.34	0.28	0.52	0.53	0.5	0.56	0.57	0.21	0.54	0.34	1.0	0.2	0.36	0.77	0.62	0.81	0.57	0.57	0.61
lcl\|BLLF01000729.1_cds_GFH14460.1_8937 (GFH14460)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.18	0.32	0.12	0.34	0.0	0.65	0.18	0.19	0.37	0.21	0.4	0.0	0.63	0.0	0.27	0.87	1.0	0.31	0.47	0.73	0.22
lcl\|BLLF01000758.1_cds_GFH14720.1_9197 (GFH14720)	0.16	0.23	0.17	0.35	0.47	0.34	0.49	0.14	0.59	0.21	0.47	0.34	0.35	0.17	0.69	0.53	0.48	0.56	0.39	0.28	0.48	0.36	0.41	0.55	1.0	0.47
lcl\|BLLF01000775.1_cds_GFH14864.1_9341 (GFH14864)	0.23	0.23	0.0	0.64	0.42	0.5	0.33	0.22	0.42	0.66	0.45	0.47	0.4	0.28	0.23	1.0	0.16	0.18	0.0	0.46	0.42	0.19	0.18	0.81	0.67	0.37
lcl\|BLLF01000795.1_cds_GFH15013.1_9490 (GFH15013)	0.04	0.0	0.0	0.21	0.16	0.76	0.52	0.24	0.27	0.34	0.15	0.7	0.46	0.41	0.41	0.32	0.24	0.76	0.19	0.54	0.87	1.0	0.75	0.61	0.38	0.59
lcl\|BLLF01000799.1_cds_GFH15046.1_9523 (GFH15046)	0.68	0.61	0.0	0.74	0.56	0.8	0.6	0.15	0.43	0.74	0.32	0.49	0.25	0.29	0.36	0.12	0.26	0.27	0.41	0.23	0.5	0.43	0.27	1.0	0.98	0.74
lcl\|BLLF01000815.1_cds_GFH15174.1_9651 (GFH15174)	0.66	0.0	0.0	0.0	0.67	0.57	0.58	0.27	0.55	0.39	0.61	0.66	0.71	0.46	0.62	0.93	0.69	0.58	0.22	0.37	1.0	0.46	0.43	0.54	0.94	0.95
lcl\|BLLF01000828.1_cds_GFH15273.1_9750 (GFH15273)	0.45	0.05	0.0	0.44	0.5	0.53	0.57	0.3	0.6	0.52	0.59	0.59	0.52	0.41	0.54	0.79	0.58	0.57	0.33	0.41	0.67	0.14	0.74	0.54	1.0	0.68
lcl\|BLLF01000854.1_cds_GFH15468.1_9945 (GFH15468)	0.65	0.04	0.0	0.3	0.67	0.54	0.6	0.34	0.59	1.0	0.54	0.69	0.6	0.47	0.53	0.8	0.73	0.67	0.5	0.45	0.4	0.76	0.67	0.5	0.71	0.73
lcl\|BLLF01000905.1_cds_GFH15822.1_10299 (GFH15822)	0.26	0.33	0.0	0.13	0.39	0.54	0.41	0.21	0.43	0.4	0.46	0.38	0.4	0.29	0.44	0.39	0.37	0.5	0.19	0.21	0.39	0.37	0.42	0.53	1.0	0.49
lcl\|BLLF01000914.1_cds_GFH15876.1_10353 (GFH15876)	0.24	0.0	0.0	0.73	0.6	0.91	0.85	0.46	0.91	0.08	0.64	0.49	0.93	0.56	0.75	0.22	0.17	0.44	0.46	0.45	0.24	0.14	0.3	0.61	0.68	1.0
lcl\|BLLF01000923.1_cds_GFH15941.1_10418 (GFH15941)	0.26	0.02	0.0	0.09	0.4	0.39	0.36	0.48	0.51	0.92	0.34	0.42	0.33	0.29	0.46	0.21	0.18	0.01	0.15	0.14	0.04	0.21	0.09	1.0	0.8	0.32
lcl\|BLLF01001004.1_cds_GFH16488.1_10965 (GFH16488)	0.17	0.32	0.0	0.41	0.33	0.39	0.48	0.36	0.44	0.26	0.37	0.31	0.26	0.29	0.49	1.0	0.52	0.14	0.09	0.27	0.16	0.5	0.46	0.46	0.58	0.39
lcl\|BLLF01001024.1_cds_GFH16620.1_11097 (GFH16620)	0.34	0.18	0.19	0.12	0.25	0.33	0.37	0.18	0.45	0.41	0.45	0.39	0.43	0.34	0.45	0.32	0.41	0.5	0.37	0.21	0.48	0.26	0.53	0.49	1.0	0.6
lcl\|BLLF01001061.1_cds_GFH16860.1_11337 (GFH16860)	0.21	0.05	0.0	0.1	0.28	0.41	0.33	0.23	0.2	0.83	0.31	0.32	0.3	0.51	0.09	0.27	0.45	0.91	0.0	0.1	0.43	0.27	1.0	0.57	0.45	0.8
lcl\|BLLF01001351.1_cds_GFH18761.1_13238 (GFH18761)	0.07	0.0	0.0	0.35	0.43	0.17	0.35	0.16	0.57	0.56	0.42	0.3	0.35	0.26	0.5	0.53	0.1	0.72	0.15	0.0	0.43	0.16	0.31	0.64	1.0	0.94
lcl\|BLLF01001375.1_cds_GFH18889.1_13366 (GFH18889)	0.0	0.04	0.0	0.17	0.13	0.52	0.7	0.28	0.27	0.36	0.22	0.24	0.69	0.41	0.23	0.34	0.13	0.94	0.4	0.11	0.92	0.21	0.4	0.59	0.46	1.0
lcl\|BLLF01001543.1_cds_GFH19928.1_14405 (GFH19928)	0.2	0.23	0.0	0.53	0.51	0.41	0.63	0.35	0.51	0.29	0.49	0.35	0.38	0.35	0.33	1.0	0.51	0.25	0.06	0.32	0.26	0.31	0.23	0.69	0.7	0.64
lcl\|BLLF01001743.1_cds_GFH21010.1_15487 (GFH21010)	0.05	0.21	0.28	0.07	0.38	0.4	0.49	0.18	0.62	0.31	0.51	0.47	0.55	0.32	0.77	0.69	0.73	0.48	0.72	0.35	0.79	1.0	0.6	0.73	1.0	0.71
lcl\|BLLF01001887.1_cds_GFH21704.1_16181 (GFH21704)	0.19	0.07	0.0	0.46	0.58	0.42	0.55	0.37	0.59	1.0	0.53	0.52	0.42	0.33	0.51	0.34	0.1	0.26	0.16	0.13	0.29	0.0	0.16	0.82	0.84	0.72
lcl\|BLLF01001922.1_cds_GFH21874.1_16351 (GFH21874)	0.0	0.0	0.0	0.2	0.76	0.55	0.5	0.41	0.61	0.06	0.38	0.49	0.42	0.21	0.62	0.09	0.26	0.21	0.1	0.23	0.19	0.11	0.07	0.93	1.0	0.77
lcl\|BLLF01001972.1_cds_GFH22113.1_16590 (GFH22113)	0.38	0.04	0.0	0.01	0.55	0.54	0.53	0.23	0.67	0.98	0.55	0.53	0.49	0.33	0.5	1.0	0.63	0.48	0.1	0.13	0.33	0.24	0.74	0.5	0.96	0.73
lcl\|BLLF01002074.1_cds_GFH22589.1_17066 (GFH22589)	0.29	0.09	0.03	0.07	0.35	0.34	0.44	0.29	0.57	0.48	0.42	0.31	0.37	0.36	0.48	0.38	0.3	0.34	0.26	0.1	0.44	0.04	0.43	0.44	1.0	0.91
lcl\|BLLF01002304.1_cds_GFH23573.1_18050 (GFH23573)	0.22	0.1	0.02	0.28	0.41	0.2	0.48	0.37	0.5	0.29	0.4	0.23	0.34	0.25	0.4	0.72	0.58	0.19	0.0	0.16	0.19	0.08	0.15	0.49	1.0	0.66
lcl\|BLLF01002337.1_cds_GFH23697.1_18174 (GFH23697)	0.38	0.0	0.0	0.1	0.41	0.28	0.47	0.53	0.45	0.3	0.39	0.41	0.43	0.39	0.46	0.72	0.6	0.31	0.25	0.13	0.41	0.2	0.45	0.47	1.0	0.92
lcl\|BLLF01002358.1_cds_GFH23766.1_18243 (GFH23766)	0.38	0.0	0.0	0.52	0.62	0.52	0.49	0.87	0.61	0.22	0.55	0.58	0.62	0.64	0.68	0.16	0.2	0.15	0.13	0.09	0.15	0.03	0.11	1.0	0.92	0.73
lcl\|BLLF01002664.1_cds_GFH24906.1_19383 (GFH24906)	0.29	0.02	0.01	0.38	0.45	0.49	0.56	0.65	0.61	0.34	0.38	0.5	0.65	0.37	0.56	0.29	0.31	0.34	0.57	0.2	0.54	0.46	0.43	0.84	1.0	0.72
lcl\|BLLF01002851.1_cds_GFH25572.1_20049 (GFH25572)	0.01	0.0	0.0	0.37	0.57	0.48	0.58	0.59	0.56	0.07	0.34	0.45	0.44	0.29	0.59	0.05	0.07	0.04	0.11	0.22	0.0	0.12	0.07	1.0	0.92	0.6
lcl\|BLLF01002962.1_cds_GFH25927.1_20404 (GFH25927)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.59	0.64	0.52	0.39	0.54	0.55	0.6	0.5	0.75	0.41	0.53	0.62	0.34	0.96	0.72	0.92	0.83	0.0	0.72	0.7	1.0	0.76
lcl\|BLLF01002963.1_cds_GFH25931.1_20408 (GFH25931)	0.32	0.41	0.01	0.33	0.23	0.47	0.7	0.34	0.56	0.49	0.25	0.26	0.51	0.31	0.37	0.8	0.73	0.83	0.07	0.21	0.69	0.15	0.51	0.28	1.0	0.74
lcl\|BLLF01003390.1_cds_GFH27203.1_21680 (GFH27203)	0.36	0.07	0.14	0.22	0.36	0.35	0.43	0.22	0.54	0.48	0.41	0.28	0.37	0.31	0.47	0.97	0.53	0.38	0.34	0.12	0.5	0.22	0.47	0.41	1.0	0.97
lcl\|BLLF01003390.1_cds_GFH27204.1_21681 (GFH27204)	0.34	0.02	0.0	0.26	0.28	0.22	0.36	0.13	0.49	0.68	0.3	0.19	0.28	0.25	0.53	0.82	0.34	0.41	0.54	0.19	0.7	0.37	0.51	0.71	1.0	0.8
lcl\|BLLF01003597.1_cds_GFH27739.1_22216 (GFH27739)	0.18	0.0	0.0	0.18	0.63	0.48	0.62	0.29	0.63	0.53	0.61	0.52	0.62	0.4	0.49	0.65	0.14	0.29	0.11	0.19	0.0	0.23	0.36	0.7	0.87	1.0
lcl\|BLLF01003689.1_cds_GFH27962.1_22439 (GFH27962)	0.21	0.0	0.0	0.23	0.61	0.48	0.77	0.23	0.52	0.21	0.54	0.52	0.6	0.23	0.41	0.0	0.3	0.0	0.33	0.18	0.0	0.71	0.0	0.69	1.0	0.96
lcl\|BLLF01003802.1_cds_GFH28252.1_22729 (GFH28252)	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.33	0.15	0.26	0.0	0.3	0.0	0.37	0.25	0.66	0.0	0.0	0.32	0.34	0.0	0.29	0.46	0.53	1.0	0.11	0.46	0.47
lcl\|BLLF01004309.1_cds_GFH29357.1_23834 (GFH29357)	0.2	0.1	0.0	0.35	0.23	0.35	0.3	0.14	0.35	0.33	0.31	0.33	0.35	0.38	0.31	0.38	0.27	0.45	0.21	0.26	0.51	0.52	0.29	0.6	0.66	1.0
lcl\|BLLF01004557.1_cds_GFH29847.1_24324 (GFH29847)	0.49	0.13	0.0	0.17	0.37	0.44	0.53	0.24	0.53	0.56	0.38	0.4	0.45	0.31	0.38	0.97	0.48	0.54	0.09	0.16	0.54	0.42	0.67	0.46	0.83	1.0
lcl\|BLLF01005124.1_cds_GFH30756.1_25233 (GFH30756)	0.21	0.1	0.0	0.4	0.56	0.37	0.36	0.27	0.29	0.6	0.39	0.32	0.33	0.29	0.17	0.12	0.27	0.47	0.28	0.24	0.65	0.15	0.66	0.6	1.0	0.97
lcl\|BLLF01006827.1_cds_GFH32577.1_27054 (GFH32577)	0.11	0.23	0.0	0.0	0.21	0.46	0.41	0.35	0.18	1.0	0.33	0.37	0.76	0.49	0.44	0.63	0.58	0.25	0.18	0.31	0.51	0.0	0.61	0.3	0.42	0.95
lcl\|BLLF01007342.1_cds_GFH32909.1_27386 (GFH32909)	0.4	0.15	0.0	0.26	0.5	0.53	0.59	0.35	0.52	0.43	0.48	0.43	0.47	0.41	0.46	0.61	0.5	0.43	0.27	0.12	0.43	0.31	0.35	0.65	0.71	1.0
lcl\|BLLF01007550.1_cds_GFH33001.1_27478 (GFH33001)	0.52	0.0	0.0	0.95	0.69	0.52	0.76	0.75	0.96	0.25	0.68	0.58	0.76	0.67	0.79	0.1	0.12	0.4	0.54	0.28	0.25	0.1	0.46	0.98	1.0	0.96
lcl\|BLLF01007756.1_cds_GFH33099.1_27576 (GFH33099)	0.73	0.55	0.15	0.55	0.49	0.54	0.7	0.35	0.63	0.45	0.53	0.41	0.51	0.33	0.73	0.75	0.57	0.73	0.35	0.3	0.9	0.53	0.51	0.68	1.0	0.72
lcl\|BLLF01009395.1_cds_GFH33711.1_28188 (GFH33711)	0.33	0.55	0.0	0.44	0.44	0.38	0.63	0.16	0.42	0.19	0.15	0.58	0.36	0.42	0.17	0.27	0.6	0.21	0.0	0.89	0.87	0.0	0.21	1.0	0.87	0.83
lcl\|BLLF01009423.1_cds_GFH33719.1_28196 (GFH33719)	0.16	0.0	0.0	0.41	0.41	0.38	0.32	0.23	0.52	0.0	0.36	0.36	0.09	0.17	0.35	0.21	0.0	0.64	0.72	0.55	0.0	0.0	0.16	0.61	1.0	0.86

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)