Heatmap: Cluster_252 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000002.1_cds_GFH05576.1_53 (GFH05576)	1.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.04	0.0	0.0	0.03	0.04	0.36	0.53	0.28	0.0	0.24	0.0	0.44	0.56	0.05	0.0	0.13
lcl\|BLLF01000008.1_cds_GFH05763.1_240 (GFH05763)	1.0	0.01	0.0	0.03	0.14	0.19	0.18	0.14	0.3	0.56	0.23	0.2	0.16	0.13	0.19	0.3	0.19	0.4	0.11	0.17	0.2	0.08	0.34	0.12	0.44	0.48
lcl\|BLLF01000054.1_cds_GFH06742.1_1219 (GFH06742)	0.77	0.37	0.0	0.16	0.17	0.32	0.32	0.13	0.21	0.47	0.23	0.16	0.28	0.21	0.21	0.76	0.47	0.77	1.0	0.48	0.85	0.23	0.93	0.09	0.36	0.34
lcl\|BLLF01000084.1_cds_GFH07272.1_1749 (GFH07272)	1.0	0.09	0.1	0.24	0.17	0.21	0.21	0.19	0.27	0.56	0.19	0.13	0.16	0.17	0.23	0.44	0.75	0.72	0.15	0.51	0.51	0.12	0.71	0.23	0.45	0.49
lcl\|BLLF01000094.1_cds_GFH07437.1_1914 (GFH07437)	1.0	0.15	0.35	0.14	0.13	0.29	0.32	0.17	0.13	0.34	0.13	0.25	0.08	0.23	0.12	0.69	0.46	0.57	0.25	0.32	0.4	0.21	0.53	0.06	0.13	0.1
lcl\|BLLF01000099.1_cds_GFH07497.1_1974 (GFH07497)	1.0	0.28	0.59	0.64	0.47	0.55	0.47	0.3	0.5	0.37	0.44	0.42	0.39	0.26	0.35	0.92	0.48	0.68	0.66	0.71	0.77	0.6	0.71	0.66	0.24	0.43
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08048.1_2525 (GFH08048)	1.0	0.64	0.02	0.18	0.06	0.07	0.14	0.04	0.11	0.44	0.09	0.06	0.09	0.06	0.12	0.75	0.34	0.4	0.31	0.31	0.28	0.23	0.54	0.07	0.14	0.16
lcl\|BLLF01000259.1_cds_GFH09752.1_4229 (GFH09752)	1.0	0.05	0.12	0.24	0.15	0.16	0.31	0.07	0.25	0.33	0.16	0.14	0.13	0.11	0.37	0.48	0.32	0.49	0.21	0.43	0.49	0.27	0.48	0.09	0.31	0.17
lcl\|BLLF01000266.1_cds_GFH09826.1_4303 (GFH09826)	0.74	0.18	0.34	0.23	0.42	0.32	0.17	0.31	0.22	0.11	0.35	0.33	0.28	0.26	0.22	0.76	1.0	0.56	0.28	0.41	0.6	0.69	0.56	0.41	0.67	0.43
lcl\|BLLF01000322.1_cds_GFH10519.1_4996 (GFH10519)	0.73	0.06	0.35	0.01	0.09	0.16	0.19	0.14	0.12	0.19	0.1	0.21	0.11	0.14	0.09	0.49	0.13	0.51	0.25	0.15	1.0	0.26	0.67	0.07	0.06	0.08
lcl\|BLLF01000327.1_cds_GFH10574.1_5051 (GFH10574)	1.0	0.0	0.02	0.24	0.08	0.01	0.19	0.09	0.2	0.21	0.04	0.06	0.06	0.08	0.2	0.56	0.23	0.2	0.0	0.54	0.32	0.14	0.34	0.17	0.16	0.21
lcl\|BLLF01000445.1_cds_GFH11882.1_6359 (GFH11882)	1.0	0.4	0.11	0.45	0.05	0.03	0.0	0.05	0.04	0.12	0.03	0.02	0.02	0.05	0.08	0.95	0.14	0.08	0.12	0.31	0.17	0.26	0.27	0.1	0.33	0.21
lcl\|BLLF01000472.1_cds_GFH12142.1_6619 (GFH12142)	0.94	0.05	0.0	0.06	0.02	0.07	0.1	0.02	0.19	0.76	0.03	0.04	0.03	0.01	0.11	0.06	0.13	0.44	0.27	0.26	0.12	0.07	0.22	0.02	1.0	0.66
lcl\|BLLF01000475.1_cds_GFH12174.1_6651 (GFH12174)	0.99	0.09	0.31	0.19	0.28	0.21	0.22	0.3	0.27	0.1	0.23	0.15	0.2	0.33	0.2	0.37	0.5	1.0	0.27	0.25	0.77	0.6	0.76	0.2	0.37	0.43
lcl\|BLLF01000514.1_cds_GFH12546.1_7023 (GFH12546)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.1	0.09	0.07	0.16	0.57	0.09	0.07	0.02	0.1	0.17	0.32	0.12	0.25	0.38	0.32	0.17	0.2	0.5	0.08	0.32	0.03
lcl\|BLLF01000589.1_cds_GFH13237.1_7714 (GFH13237)	0.95	0.71	0.34	0.42	0.86	0.58	0.43	0.56	0.43	0.45	0.59	0.54	0.61	0.47	0.5	0.75	0.9	0.52	0.27	0.29	0.59	0.71	0.62	0.63	1.0	0.71
lcl\|BLLF01000615.1_cds_GFH13458.1_7935 (GFH13458)	1.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.61	0.02	0.0	0.01	0.0	0.04	0.39	0.17	0.46	0.11	0.22	0.45	0.63	0.61	0.01	0.51	0.43
lcl\|BLLF01000616.1_cds_GFH13466.1_7943 (GFH13466)	1.0	0.11	0.0	0.04	0.27	0.3	0.24	0.16	0.19	0.3	0.35	0.17	0.2	0.17	0.13	0.93	0.76	0.55	0.0	0.31	0.76	0.53	0.76	0.57	0.18	0.38
lcl\|BLLF01000674.1_cds_GFH13996.1_8473 (GFH13996)	0.75	0.87	0.22	0.11	0.29	0.21	0.22	0.13	0.21	0.74	0.21	0.19	0.19	0.11	0.19	1.0	0.88	0.6	0.33	0.37	0.58	0.38	0.5	0.13	0.2	0.27
lcl\|BLLF01000740.1_cds_GFH14549.1_9026 (GFH14549)	1.0	0.24	0.31	0.76	0.42	0.36	0.28	0.38	0.36	0.78	0.37	0.29	0.38	0.29	0.35	0.16	0.22	0.21	0.18	0.13	0.27	0.17	0.36	0.18	0.5	0.45
lcl\|BLLF01000821.1_cds_GFH15217.1_9694 (GFH15217)	1.0	0.12	0.28	0.38	0.21	0.27	0.34	0.11	0.37	0.45	0.26	0.24	0.31	0.17	0.32	0.53	0.67	0.9	0.54	0.47	0.81	0.21	0.87	0.15	0.46	0.44
lcl\|BLLF01000870.1_cds_GFH15578.1_10055 (GFH15578)	1.0	0.1	0.36	0.56	0.46	0.51	0.44	0.27	0.4	0.54	0.44	0.36	0.34	0.34	0.31	0.46	0.67	0.77	0.53	0.5	0.78	0.48	0.73	0.37	0.56	0.56
lcl\|BLLF01000921.1_cds_GFH15930.1_10407 (GFH15930)	1.0	0.06	0.0	0.01	0.38	0.31	0.29	0.29	0.24	0.39	0.42	0.25	0.24	0.28	0.22	0.58	0.89	0.58	0.18	0.34	0.52	0.39	0.38	0.42	0.67	0.58
lcl\|BLLF01000953.1_cds_GFH16141.1_10618 (GFH16141)	1.0	0.0	0.0	0.27	0.11	0.11	0.12	0.08	0.08	0.05	0.05	0.06	0.09	0.03	0.03	0.91	0.27	0.83	0.28	0.42	0.18	0.31	0.41	0.4	0.07	0.2
lcl\|BLLF01001026.1_cds_GFH16630.1_11107 (GFH16630)	1.0	0.51	0.0	0.19	0.1	0.17	0.25	0.12	0.21	0.83	0.13	0.12	0.12	0.09	0.26	0.25	0.27	0.38	0.24	0.26	0.43	0.36	0.3	0.15	0.13	0.06
lcl\|BLLF01001167.1_cds_GFH17557.1_12034 (GFH17557)	1.0	0.52	0.0	0.38	0.06	0.07	0.05	0.08	0.03	0.47	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.27	0.29	0.56	0.13	0.26	0.39	0.2	0.64	0.05	0.05	0.02
lcl\|BLLF01001270.1_cds_GFH18242.1_12719 (GFH18242)	0.84	0.19	0.12	0.18	0.35	0.38	0.39	0.17	0.41	0.45	0.27	0.23	0.14	0.13	0.31	0.49	0.33	0.29	0.2	0.27	0.51	0.35	0.33	0.23	1.0	0.57
lcl\|BLLF01001351.1_cds_GFH18757.1_13234 (GFH18757)	1.0	0.31	0.45	0.17	0.36	0.27	0.26	0.41	0.38	0.42	0.33	0.23	0.27	0.37	0.28	0.15	0.32	0.44	0.25	0.28	0.7	0.37	0.58	0.23	0.61	0.71
lcl\|BLLF01001369.1_cds_GFH18859.1_13336 (GFH18859)	1.0	0.85	0.07	0.27	0.21	0.22	0.19	0.18	0.2	0.4	0.19	0.11	0.19	0.11	0.17	0.7	0.9	0.68	0.16	0.4	0.4	0.11	0.43	0.14	0.36	0.22
lcl\|BLLF01001606.1_cds_GFH20270.1_14747 (GFH20270)	1.0	0.07	0.12	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0	0.13	0.0	0.28	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001637.1_cds_GFH20451.1_14928 (GFH20451)	0.81	0.12	0.0	0.19	0.25	0.42	0.31	0.22	0.25	0.25	0.25	0.36	0.39	0.31	0.21	0.89	0.57	0.96	1.0	0.91	0.94	0.2	0.78	0.3	0.2	0.18
lcl\|BLLF01001682.1_cds_GFH20699.1_15176 (GFH20699)	1.0	0.44	0.1	0.2	0.12	0.07	0.17	0.09	0.13	0.71	0.07	0.08	0.05	0.06	0.19	0.85	0.22	0.4	0.12	0.19	0.57	0.28	0.43	0.11	0.15	0.23
lcl\|BLLF01001878.1_cds_GFH21673.1_16150 (GFH21673)	1.0	0.28	0.23	0.36	0.17	0.11	0.15	0.14	0.2	0.86	0.15	0.13	0.16	0.1	0.25	0.53	0.43	0.54	0.32	0.33	0.49	0.36	0.53	0.18	0.46	0.42
lcl\|BLLF01001892.1_cds_GFH21722.1_16199 (GFH21722)	1.0	0.44	0.3	0.23	0.49	0.4	0.36	0.48	0.47	0.28	0.44	0.36	0.48	0.43	0.44	0.36	0.69	0.56	0.23	0.32	0.69	0.34	0.44	0.46	0.81	0.69
lcl\|BLLF01001984.1_cds_GFH22176.1_16653 (GFH22176)	1.0	0.4	0.15	0.22	0.19	0.02	0.23	0.2	0.2	0.43	0.18	0.02	0.2	0.24	0.25	0.52	0.31	0.4	0.26	0.43	0.49	0.7	0.23	0.07	0.09	0.09
lcl\|BLLF01002010.1_cds_GFH22305.1_16782 (GFH22305)	1.0	0.32	0.31	0.75	0.51	0.42	0.29	0.3	0.33	0.64	0.48	0.29	0.3	0.32	0.3	0.12	0.73	0.76	0.64	0.54	0.86	0.11	0.63	0.18	0.54	0.33
lcl\|BLLF01002031.1_cds_GFH22397.1_16874 (GFH22397)	1.0	0.31	0.25	0.04	0.09	0.01	0.01	0.08	0.01	0.6	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.53	0.32	0.47	0.3	0.15	0.36	0.0	0.2	0.03
lcl\|BLLF01002189.1_cds_GFH23086.1_17563 (GFH23086)	1.0	0.18	0.26	0.22	0.26	0.31	0.31	0.16	0.48	0.96	0.29	0.3	0.34	0.23	0.34	0.25	0.28	0.39	0.19	0.21	0.25	0.23	0.32	0.17	0.62	0.73
lcl\|BLLF01002492.1_cds_GFH24287.1_18764 (GFH24287)	1.0	0.27	0.0	0.14	0.22	0.18	0.17	0.27	0.11	0.86	0.22	0.15	0.15	0.2	0.17	0.0	0.25	0.82	0.21	0.29	0.59	0.11	0.78	0.05	0.06	0.11
lcl\|BLLF01002870.1_cds_GFH25635.1_20112 (GFH25635)	1.0	0.21	0.32	0.17	0.37	0.46	0.42	0.19	0.39	0.5	0.34	0.39	0.36	0.28	0.29	0.48	0.6	0.68	0.24	0.53	0.82	0.71	0.56	0.29	0.39	0.32
lcl\|BLLF01003140.1_cds_GFH26472.1_20949 (GFH26472)	1.0	0.24	0.0	0.17	0.33	0.4	0.3	0.24	0.31	0.61	0.3	0.19	0.22	0.24	0.22	0.4	0.82	0.2	0.3	0.2	0.15	0.35	0.23	0.38	0.33	0.39
lcl\|BLLF01003161.1_cds_GFH26543.1_21020 (GFH26543)	1.0	0.35	0.38	0.18	0.38	0.35	0.38	0.34	0.29	0.33	0.45	0.34	0.45	0.39	0.27	0.5	0.61	0.87	0.53	0.44	0.98	0.75	0.85	0.34	0.23	0.18
lcl\|BLLF01003524.1_cds_GFH27559.1_22036 (GFH27559)	1.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.15	0.08	0.03	0.1	0.41	0.07	0.2	0.08	0.03	0.03	0.35	0.54	0.26	0.7	0.25	0.0	0.0	0.48	0.26	0.12	0.11
lcl\|BLLF01003889.1_cds_GFH28464.1_22941 (GFH28464)	0.58	0.55	0.22	0.3	0.41	0.28	0.38	0.2	0.45	0.56	0.26	0.18	0.15	0.13	0.37	0.42	0.49	0.27	0.16	0.43	0.79	0.41	0.69	0.26	1.0	0.54
lcl\|BLLF01003905.1_cds_GFH28502.1_22979 (GFH28502)	1.0	0.36	0.4	0.27	0.22	0.16	0.17	0.13	0.2	0.57	0.13	0.08	0.12	0.08	0.16	0.62	0.44	0.55	0.19	0.5	0.42	0.25	0.51	0.21	0.31	0.29
lcl\|BLLF01003910.1_cds_GFH28516.1_22993 (GFH28516)	1.0	0.16	0.0	0.09	0.24	0.24	0.27	0.2	0.27	0.7	0.18	0.22	0.24	0.19	0.16	0.38	0.21	0.34	0.0	0.31	0.65	0.17	0.4	0.12	0.66	0.42
lcl\|BLLF01004113.1_cds_GFH28942.1_23419 (GFH28942)	1.0	0.24	0.44	0.12	0.2	0.29	0.3	0.18	0.2	0.82	0.17	0.22	0.16	0.16	0.23	0.84	0.55	0.54	0.38	0.39	0.64	0.43	0.52	0.14	0.17	0.14
lcl\|BLLF01004284.1_cds_GFH29312.1_23789 (GFH29312)	0.8	0.06	0.0	0.01	0.16	0.15	0.34	0.19	0.22	0.26	0.23	0.23	0.07	0.22	0.18	0.65	0.33	0.98	0.9	0.35	1.0	0.15	0.84	0.04	0.02	0.04
lcl\|BLLF01004331.1_cds_GFH29407.1_23884 (GFH29407)	1.0	0.09	0.0	0.1	0.32	0.35	0.31	0.28	0.41	0.49	0.41	0.23	0.3	0.28	0.29	0.33	0.3	0.58	0.15	0.52	0.57	0.3	0.56	0.19	0.5	0.67
lcl\|BLLF01005737.1_cds_GFH31576.1_26053 (GFH31576)	1.0	0.58	0.0	0.34	0.29	0.18	0.3	0.11	0.21	0.64	0.16	0.18	0.21	0.13	0.15	0.92	0.85	0.78	0.43	0.36	0.67	0.16	0.47	0.16	0.41	0.32
lcl\|BLLF01007232.1_cds_GFH32841.1_27318 (GFH32841)	1.0	0.17	0.0	0.03	0.25	0.3	0.21	0.3	0.24	0.33	0.2	0.25	0.2	0.22	0.21	0.7	0.52	0.6	0.54	0.54	0.5	0.19	0.42	0.5	0.38	0.52
lcl\|BLLF01007687.1_cds_GFH33068.1_27545 (GFH33068)	1.0	0.22	0.24	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.16	0.01	0.02	0.03	0.02	0.09	0.62	0.33	0.03	0.18	0.12	0.03	0.02	0.04	0.0	0.28	0.28
lcl\|BLLF01008426.1_cds_GFH33374.1_27851 (GFH33374)	1.0	0.16	0.0	0.02	0.12	0.17	0.16	0.12	0.15	0.22	0.16	0.19	0.24	0.2	0.1	0.91	0.33	0.56	0.09	0.25	0.67	0.45	0.63	0.47	0.27	0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)