Heatmap: Cluster_246 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000019.1_cds_GFH06035.1_512 (GFH06035)	0.23	1.0	0.0	0.05	0.14	0.32	0.38	0.1	0.5	0.49	0.09	0.11	0.36	0.05	0.25	0.2	0.07	0.06	0.21	0.02	0.12	0.04	0.08	0.04	0.29	0.88
lcl\|BLLF01000052.1_cds_GFH06709.1_1186 (GFH06709)	0.25	0.91	0.2	0.08	0.26	0.27	0.24	0.17	0.28	0.1	0.25	0.18	0.21	0.2	0.2	1.0	0.36	0.15	0.09	0.13	0.19	0.09	0.07	0.03	0.36	0.67
lcl\|BLLF01000090.1_cds_GFH07364.1_1841 (GFH07364)	0.83	1.0	0.0	0.13	0.12	0.29	0.37	0.13	0.12	0.81	0.15	0.0	0.17	0.14	0.15	0.34	0.52	0.27	0.0	0.0	0.35	0.44	0.54	0.12	0.25	0.32
lcl\|BLLF01000147.1_cds_GFH08223.1_2700 (GFH08223)	0.04	0.75	0.04	0.04	0.5	0.44	0.31	0.35	0.38	1.0	0.36	0.29	0.41	0.25	0.38	0.47	0.31	0.27	0.1	0.27	0.48	0.1	0.28	0.14	0.72	0.75
lcl\|BLLF01000239.1_cds_GFH09504.1_3981 (GFH09504)	0.0	0.65	0.0	1.0	0.07	0.21	0.17	0.04	0.18	0.0	0.12	0.12	0.02	0.05	0.08	0.02	0.61	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.28	0.4
lcl\|BLLF01000281.1_cds_GFH10016.1_4493 (GFH10016)	0.0	0.64	0.0	0.0	0.34	0.27	0.43	0.32	0.52	0.87	0.08	0.41	0.07	0.26	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.79
lcl\|BLLF01000287.1_cds_GFH10104.1_4581 (GFH10104)	0.14	0.81	0.01	0.35	0.23	0.3	1.0	0.08	0.68	0.62	0.24	0.24	0.67	0.12	0.5	0.2	0.54	0.53	0.34	0.03	0.37	0.0	0.34	0.2	0.77	0.56
lcl\|BLLF01000311.1_cds_GFH10387.1_4864 (GFH10387)	0.22	0.98	0.43	0.67	0.49	0.61	0.54	0.6	0.64	0.31	0.42	0.6	0.45	0.55	0.49	0.42	0.52	0.56	0.98	0.74	0.55	0.2	0.57	0.14	0.83	1.0
lcl\|BLLF01000385.1_cds_GFH11227.1_5704 (GFH11227)	0.27	0.9	0.13	0.18	0.12	0.26	0.67	0.08	0.55	1.0	0.18	0.24	0.69	0.08	0.37	0.21	0.15	0.09	0.29	0.03	0.18	0.29	0.05	0.09	0.6	0.73
lcl\|BLLF01000461.1_cds_GFH12033.1_6510 (GFH12033)	0.0	0.44	0.0	0.0	0.05	0.22	0.38	0.04	0.14	0.0	0.05	0.17	0.11	0.05	0.23	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	1.0
lcl\|BLLF01000465.1_cds_GFH12072.1_6549 (GFH12072)	0.11	0.61	0.28	0.01	0.12	0.22	0.29	0.08	0.32	0.8	0.13	0.12	0.27	0.13	0.16	0.98	0.11	0.2	0.08	0.05	0.36	0.25	0.25	0.09	0.45	1.0
lcl\|BLLF01000511.1_cds_GFH12513.1_6990 (GFH12513)	0.11	0.57	0.0	0.1	0.19	0.2	0.31	0.16	0.27	0.86	0.16	0.08	0.14	0.15	0.26	0.43	0.16	0.06	0.08	1.0	0.15	0.44	0.17	0.2	0.38	0.73
lcl\|BLLF01000532.1_cds_GFH12711.1_7188 (GFH12711)	0.43	0.94	0.27	0.63	0.48	0.22	0.29	0.14	0.39	0.4	0.38	0.29	0.38	0.21	0.25	0.45	0.69	0.08	0.0	0.09	0.23	0.23	0.12	0.06	0.45	1.0
lcl\|BLLF01000587.1_cds_GFH13214.1_7691 (GFH13214)	0.15	1.0	0.0	0.24	0.55	0.63	0.48	0.43	0.49	0.92	0.71	0.43	0.18	0.29	0.51	0.37	0.55	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.07	0.77	0.88
lcl\|BLLF01000588.1_cds_GFH13224.1_7701 (GFH13224)	0.02	0.65	0.02	0.01	0.17	0.28	0.53	0.1	0.44	0.33	0.13	0.17	0.37	0.07	0.22	0.1	0.08	0.03	0.08	0.03	0.05	0.03	0.04	0.06	0.45	1.0
lcl\|BLLF01000623.1_cds_GFH13530.1_8007 (GFH13530)	0.0	0.75	0.0	0.17	0.3	0.18	0.32	0.14	0.08	0.0	0.71	0.26	0.56	0.23	0.19	0.25	0.0	0.0	0.27	0.0	1.0	0.0	0.0	0.12	0.49	0.75
lcl\|BLLF01000758.1_cds_GFH14716.1_9193 (GFH14716)	0.98	0.96	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0	0.0	0.06	0.21	0.0	0.11	0.0	0.0	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.06	0.51
lcl\|BLLF01000803.1_cds_GFH15073.1_9550 (GFH15073)	0.07	1.0	0.0	0.0	0.28	0.45	0.26	0.14	0.22	0.0	0.25	0.12	0.12	0.13	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.11	0.08	0.46	0.95
lcl\|BLLF01000905.1_cds_GFH15823.1_10300 (GFH15823)	0.08	1.0	0.01	0.06	0.74	0.54	0.45	0.41	0.51	0.2	0.55	0.36	0.31	0.42	0.41	0.97	0.55	0.4	0.44	0.97	0.59	0.33	0.31	0.38	0.73	0.8
lcl\|BLLF01000971.1_cds_GFH16266.1_10743 (GFH16266)	0.54	0.64	0.18	0.64	0.15	0.24	0.87	0.05	0.64	1.0	0.16	0.2	0.4	0.06	0.59	0.03	0.07	0.1	0.14	0.04	0.06	0.06	0.06	0.01	0.38	0.39
lcl\|BLLF01001023.1_cds_GFH16613.1_11090 (GFH16613)	0.0	0.61	0.0	0.49	0.14	0.2	0.17	0.13	0.21	1.0	0.22	0.16	0.18	0.11	0.25	0.0	0.1	0.08	0.34	0.14	0.27	0.2	0.02	0.11	0.89	0.77
lcl\|BLLF01001074.1_cds_GFH16945.1_11422 (GFH16945)	0.17	0.82	0.47	0.13	0.4	0.45	0.33	0.28	0.35	0.82	0.37	0.25	0.24	0.26	0.2	0.75	0.25	0.14	0.0	0.09	0.3	0.24	0.19	0.1	0.56	1.0
lcl\|BLLF01001134.1_cds_GFH17349.1_11826 (GFH17349)	0.17	0.76	0.0	0.05	0.57	0.67	0.1	0.28	0.28	0.59	0.35	0.2	0.21	0.15	0.04	0.28	0.0	0.44	0.33	0.28	0.0	0.0	0.11	0.05	0.76	1.0
lcl\|BLLF01001365.1_cds_GFH18837.1_13314 (GFH18837)	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.13	0.0	0.13	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.99
lcl\|BLLF01001485.1_cds_GFH19566.1_14043 (GFH19566)	0.25	0.57	0.0	0.3	0.34	0.5	0.09	0.47	0.25	1.0	0.35	0.35	0.25	0.22	0.18	0.37	0.13	0.49	0.58	0.12	0.53	0.0	0.43	0.09	0.87	0.43
lcl\|BLLF01001497.1_cds_GFH19652.1_14129 (GFH19652)	0.29	1.0	0.35	0.58	0.47	0.63	0.45	0.32	0.59	0.91	0.4	0.29	0.32	0.21	0.4	0.38	0.22	0.33	0.1	0.36	0.27	0.47	0.24	0.2	0.52	0.56
lcl\|BLLF01001675.1_cds_GFH20659.1_15136 (GFH20659)	0.24	1.0	0.22	0.22	0.21	0.21	0.49	0.16	0.59	0.65	0.27	0.19	0.47	0.18	0.41	0.36	0.21	0.48	0.28	0.15	0.47	0.38	0.38	0.11	0.38	0.55
lcl\|BLLF01001691.1_cds_GFH20752.1_15229 (GFH20752)	0.23	0.71	0.0	0.3	0.35	0.25	0.16	0.42	0.21	0.49	0.35	0.26	0.24	0.27	0.27	0.29	0.2	0.31	0.25	0.99	0.2	0.73	0.16	0.18	1.0	0.84
lcl\|BLLF01001705.1_cds_GFH20829.1_15306 (GFH20829)	0.0	0.97	0.0	1.0	0.45	0.62	0.38	0.36	0.51	0.1	0.56	0.53	0.48	0.57	0.14	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.71
lcl\|BLLF01001807.1_cds_GFH21335.1_15812 (GFH21335)	0.22	0.88	0.33	0.34	0.72	0.71	0.47	0.66	0.46	0.68	0.65	0.5	0.53	0.5	0.35	0.47	0.49	0.6	0.38	1.0	0.52	0.41	0.53	0.35	0.74	0.88
lcl\|BLLF01002399.1_cds_GFH23927.1_18404 (GFH23927)	0.48	0.72	0.07	0.16	0.07	0.08	0.22	0.13	0.45	0.8	0.15	0.19	0.27	0.12	0.41	1.0	0.04	0.03	0.16	0.03	0.02	0.07	0.04	0.02	0.41	0.69
lcl\|BLLF01002678.1_cds_GFH24956.1_19433 (GFH24956)	0.05	0.7	0.0	0.15	0.23	0.14	0.2	0.03	0.27	0.36	0.11	0.09	0.15	0.03	0.19	0.06	0.06	0.01	0.02	0.95	0.01	0.04	0.01	0.01	0.56	1.0
lcl\|BLLF01002683.1_cds_GFH24977.1_19454 (GFH24977)	0.76	0.78	0.25	0.3	0.23	0.34	0.41	0.18	0.37	0.59	0.3	0.42	0.47	0.29	0.37	0.28	0.33	0.62	0.28	0.38	0.62	0.5	0.47	0.22	0.36	1.0
lcl\|BLLF01002941.1_cds_GFH25871.1_20348 (GFH25871)	0.55	0.19	0.0	0.26	0.21	0.3	0.87	0.08	0.64	1.0	0.13	0.22	0.26	0.12	0.61	0.13	0.29	0.0	0.23	0.15	0.03	0.24	0.1	0.1	0.39	0.63
lcl\|BLLF01003284.1_cds_GFH26906.1_21383 (GFH26906)	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.75	0.49	0.0	0.64	0.23
lcl\|BLLF01003383.1_cds_GFH27187.1_21664 (GFH27187)	0.22	0.64	0.0	0.27	0.09	1.0	0.27	0.0	0.26	0.59	0.29	0.45	0.31	0.1	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.91
lcl\|BLLF01003440.1_cds_GFH27348.1_21825 (GFH27348)	0.0	0.58	0.0	0.0	0.19	0.31	0.14	0.33	0.12	1.0	0.16	0.34	0.2	0.13	0.12	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.31	0.46
lcl\|BLLF01003835.1_cds_GFH28335.1_22812 (GFH28335)	0.14	0.79	0.56	0.48	0.47	0.52	0.38	0.33	0.5	0.35	0.54	0.36	0.48	0.3	0.35	0.54	0.66	0.46	0.56	1.0	0.51	0.47	0.47	0.45	0.66	0.94
lcl\|BLLF01003865.1_cds_GFH28412.1_22889 (GFH28412)	0.11	0.47	0.28	0.2	0.08	0.21	0.23	0.13	0.32	0.78	0.13	0.41	0.34	0.11	0.39	0.14	0.09	0.22	0.8	0.6	0.36	0.18	0.26	0.07	1.0	0.89
lcl\|BLLF01004556.1_cds_GFH29843.1_24320 (GFH29843)	0.43	1.0	0.38	0.27	0.33	0.26	0.44	0.24	0.53	0.69	0.28	0.23	0.35	0.16	0.36	0.23	0.22	0.18	0.32	0.45	0.19	0.2	0.18	0.14	0.64	0.85
lcl\|BLLF01004655.1_cds_GFH30018.1_24495 (GFH30018)	0.03	0.2	0.0	0.02	0.17	0.46	0.59	0.14	0.56	0.54	0.23	0.32	0.62	0.06	0.43	0.02	0.0	0.01	0.2	0.04	0.14	0.23	0.03	0.04	0.42	1.0
lcl\|BLLF01005068.1_cds_GFH30687.1_25164 (GFH30687)	0.11	0.94	0.45	0.27	0.48	0.67	0.48	0.41	0.64	0.98	0.4	0.41	0.41	0.39	0.44	1.0	0.32	0.16	0.02	0.13	0.37	0.17	0.25	0.12	0.53	0.95
lcl\|BLLF01005238.1_cds_GFH30928.1_25405 (GFH30928)	0.19	0.56	0.01	0.29	0.43	0.35	0.2	0.42	0.26	1.0	0.27	0.3	0.23	0.26	0.33	0.34	0.2	0.51	0.23	0.17	0.73	0.21	0.32	0.17	0.6	0.59
lcl\|BLLF01005603.1_cds_GFH31407.1_25884 (GFH31407)	0.16	0.84	0.0	1.0	0.78	0.78	0.52	0.37	0.86	0.54	0.77	0.77	0.41	0.38	0.59	0.32	0.82	0.21	0.37	0.26	0.22	0.0	0.43	0.25	0.38	0.66
lcl\|BLLF01005692.1_cds_GFH31522.1_25999 (GFH31522)	0.57	0.35	0.0	0.43	0.11	0.25	1.0	0.09	0.82	0.48	0.22	0.22	0.4	0.14	0.49	0.09	0.23	0.35	0.42	0.12	0.05	0.17	0.17	0.08	0.43	0.28
lcl\|BLLF01005708.1_cds_GFH31543.1_26020 (GFH31543)	0.37	1.0	0.26	0.18	0.51	0.44	0.26	0.28	0.28	0.18	0.33	0.24	0.2	0.19	0.18	0.58	0.19	0.2	0.14	0.44	0.28	0.14	0.19	0.3	0.46	0.64
lcl\|BLLF01005782.1_cds_GFH31626.1_26103 (GFH31626)	0.42	0.57	0.23	0.92	0.35	0.3	0.3	0.39	0.35	1.0	0.42	0.28	0.34	0.36	0.44	0.5	0.16	0.04	0.0	0.26	0.07	0.1	0.05	0.0	0.91	0.94
lcl\|BLLF01006730.1_cds_GFH32507.1_26984 (GFH32507)	0.1	1.0	0.0	0.12	0.34	0.47	0.29	0.26	0.37	0.44	0.26	0.22	0.18	0.17	0.17	0.58	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.42	0.73
lcl\|BLLF01007320.1_cds_GFH32898.1_27375 (GFH32898)	0.09	0.34	0.0	0.29	0.44	0.23	0.21	0.11	0.24	1.0	0.43	0.18	0.25	0.25	0.17	0.18	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.77
lcl\|BLLF01008565.1_cds_GFH33428.1_27905 (GFH33428)	0.54	1.0	0.0	0.49	0.25	0.2	0.27	0.13	0.24	0.79	0.19	0.08	0.09	0.04	0.18	0.37	0.28	0.0	0.66	0.25	0.0	0.46	0.29	0.06	0.44	0.88
lcl\|BLLF01008630.1_cds_GFH33461.1_27938 (GFH33461)	0.4	1.0	0.0	0.0	0.13	0.17	0.27	0.0	0.19	0.21	0.0	0.17	0.07	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.47	0.1	0.33	0.83
lcl\|BLLF01008715.1_cds_GFH33494.1_27971 (GFH33494)	0.19	0.56	0.17	0.15	0.33	0.26	0.12	0.31	0.22	0.39	0.23	0.13	0.18	0.15	0.13	0.25	0.22	0.23	0.19	1.0	0.43	0.29	0.23	0.1	0.64	0.95

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)