Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.4 0.2 0.24 0.12 0.16 0.46 0.48 0.38 0.35 0.27 0.18 0.48 0.38 0.42 0.4 1.0 0.37 0.22 0.37 0.34 0.31 0.67 0.38 0.16 0.43 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.16 0.08 0.07 0.03 0.29 0.3 0.22 0.22 0.1 0.16 0.11 0.27 0.19 0.08 0.28 1.0 0.4 0.0 0.03 0.18 0.01 0.37 0.02 0.16 0.12 0.11
0.29 0.17 0.05 0.13 0.48 0.58 0.39 0.35 0.18 0.29 0.18 0.59 0.42 0.13 0.57 0.97 0.41 0.03 0.08 0.34 0.03 1.0 0.06 0.35 0.57 0.32
0.29 0.08 0.0 0.36 0.24 1.0 0.5 0.19 0.5 0.52 0.77 0.56 0.71 0.4 0.42 0.73 0.54 0.29 0.43 0.97 0.0 0.45 0.0 0.08 0.79 0.27
0.0 0.0 0.0 0.56 0.12 0.09 0.06 0.05 0.05 0.11 0.24 0.17 0.06 0.05 0.1 0.0 0.0 0.13 0.0 0.18 0.17 1.0 0.0 0.1 0.17 0.0
0.03 0.21 0.0 0.01 0.4 0.39 0.4 0.3 0.3 0.38 0.44 0.41 0.44 0.47 0.23 0.38 0.11 0.56 0.31 0.25 0.9 0.89 1.0 0.23 0.25 0.11
0.39 0.0 0.0 0.01 0.25 0.45 0.65 0.1 0.36 0.29 0.36 0.58 0.33 0.37 0.28 0.64 0.36 0.14 0.22 0.56 0.08 1.0 0.05 0.22 0.4 0.75
0.1 0.02 0.0 0.02 0.14 0.26 0.17 0.03 0.1 0.05 0.13 0.27 0.14 0.06 0.11 0.55 0.37 0.04 0.07 0.51 0.09 1.0 0.13 0.06 0.13 0.05
0.49 0.4 0.0 0.27 0.48 0.4 0.45 0.33 0.43 0.37 0.47 0.43 0.3 0.38 0.36 0.73 0.66 0.57 0.37 1.0 0.5 0.9 0.64 0.16 0.63 0.53
0.22 0.0 0.0 0.26 0.27 0.62 0.43 0.22 0.2 0.25 0.25 0.41 0.47 0.45 0.22 1.0 0.27 0.78 0.17 0.19 0.31 0.27 0.55 0.11 0.19 0.34
0.32 0.24 0.16 0.1 0.17 0.37 0.25 0.15 0.15 0.06 0.19 0.57 0.39 0.31 0.32 0.54 0.57 0.25 0.32 0.46 0.3 1.0 0.47 0.24 0.17 0.11
0.26 0.36 0.01 0.05 0.18 0.23 0.34 0.19 0.19 0.43 0.28 0.42 0.42 0.34 0.33 0.52 0.43 0.28 0.22 0.33 0.51 1.0 0.47 0.16 0.3 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.12 0.13 0.1 0.57 0.97 0.79 0.3 0.75 0.12 0.87 0.99 0.81 0.66 0.89 1.0 0.9 0.69 0.34 0.7 0.79 0.64 0.81 0.4 0.41 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.79 0.54 0.13 0.45 0.0 0.46 0.42 0.48 0.37 0.04 0.43 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.33 0.14 0.08 0.23
0.52 0.03 0.0 0.19 0.41 0.72 0.49 0.16 0.11 0.29 0.55 0.68 0.69 0.39 0.13 1.0 0.57 0.23 0.34 0.9 0.13 0.51 0.32 0.18 0.35 0.28
0.28 0.02 0.02 0.1 0.17 0.25 0.29 0.22 0.22 0.24 0.14 0.36 0.34 0.22 0.31 0.41 0.41 0.14 0.37 0.43 0.19 1.0 0.25 0.29 0.16 0.13
0.16 0.1 0.13 0.06 0.17 0.12 0.1 0.22 0.08 0.08 0.11 0.14 0.14 0.14 0.11 0.17 0.2 0.06 0.21 0.15 0.06 1.0 0.09 0.16 0.08 0.06
0.07 0.1 0.06 0.13 0.33 0.41 0.43 0.07 0.27 0.23 0.31 0.47 0.32 0.14 0.34 0.86 0.68 0.04 0.07 0.31 0.05 1.0 0.09 0.16 0.39 0.14
0.47 0.09 0.0 0.38 0.42 0.52 0.53 0.22 0.46 0.12 0.71 0.56 0.53 0.38 0.37 0.93 0.56 0.68 0.82 0.77 1.0 0.65 0.67 0.15 0.63 0.21
0.26 0.19 0.28 0.3 0.36 0.41 0.3 0.34 0.31 0.5 0.28 0.28 0.3 0.27 0.28 0.82 0.75 0.17 0.46 0.64 0.25 1.0 0.53 0.1 0.23 0.41
0.25 0.29 0.05 0.16 0.59 0.77 0.75 0.27 0.45 0.39 0.55 0.62 0.58 0.41 0.46 0.85 0.62 0.78 0.21 0.44 0.69 0.59 1.0 0.34 0.24 0.14
0.31 0.36 0.09 0.13 0.53 0.67 0.67 0.29 0.53 0.33 0.53 0.55 0.64 0.41 0.43 0.74 0.54 0.68 0.22 0.44 0.85 1.0 0.84 0.2 0.22 0.17
0.3 0.03 0.12 0.1 0.48 0.55 0.62 0.34 0.51 0.31 0.36 0.41 0.48 0.45 0.37 0.32 0.69 0.55 0.46 0.3 0.36 1.0 0.49 0.21 0.15 0.17
0.36 0.04 0.14 0.18 0.31 0.67 0.5 0.1 0.21 0.16 0.31 0.65 0.29 0.14 0.33 0.58 0.68 0.28 0.2 0.61 0.23 1.0 0.42 0.4 0.23 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.54 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.16 0.41 0.27 0.69 0.91 0.72 0.33 0.63 0.43 0.77 0.82 0.77 0.58 0.64 0.87 0.87 0.45 0.39 0.97 0.69 1.0 0.73 0.37 0.49 0.24
0.01 0.53 0.0 0.02 0.45 0.55 0.43 0.38 0.4 0.55 0.5 0.46 0.56 0.64 0.34 0.76 0.63 0.66 0.15 0.21 0.89 1.0 0.71 0.3 0.12 0.15
0.01 0.02 0.0 0.04 0.37 0.62 0.3 0.23 0.15 0.16 0.47 0.5 0.53 0.29 0.14 0.19 1.0 0.31 0.23 0.06 0.38 0.47 0.18 0.03 0.1 0.04
0.07 0.0 0.0 0.04 0.41 0.64 0.31 0.22 0.16 0.04 0.43 0.47 0.44 0.3 0.12 0.22 1.0 0.29 0.12 0.04 0.27 0.33 0.2 0.05 0.14 0.07
0.0 0.0 0.0 0.05 0.36 0.4 0.26 0.2 0.13 0.07 0.39 0.33 0.33 0.2 0.16 0.18 1.0 0.15 0.28 0.11 0.11 0.2 0.12 0.05 0.06 0.03
0.15 0.17 0.0 0.22 0.59 0.71 0.46 0.26 0.26 0.14 0.81 0.47 0.78 0.62 0.14 0.29 1.0 0.15 0.34 0.51 0.52 0.24 0.75 0.08 0.31 0.33
0.48 0.13 0.08 0.5 0.32 0.31 0.39 0.19 0.32 0.18 0.52 0.47 0.49 0.35 0.6 0.68 0.77 0.48 0.12 0.61 0.43 1.0 0.47 0.3 0.35 0.35
0.16 0.12 0.31 0.23 0.6 0.64 0.45 0.29 0.38 0.59 0.57 0.49 0.29 0.33 0.29 0.89 0.7 0.22 0.33 0.96 0.2 1.0 0.15 0.61 0.47 0.31
0.47 0.43 0.53 0.32 0.97 0.87 0.7 0.4 0.67 0.44 0.88 0.7 1.0 0.48 0.52 0.53 0.7 0.69 0.51 0.46 0.74 0.32 0.73 0.12 0.09 0.1
0.57 0.16 0.05 0.19 0.33 0.69 0.79 0.22 0.35 0.36 0.43 0.71 0.59 0.46 0.34 1.0 0.59 0.35 0.65 0.5 0.29 0.74 0.47 0.46 0.55 0.35
0.21 0.16 0.11 0.21 0.5 0.69 0.56 0.25 0.49 0.35 0.62 0.66 0.53 0.47 0.45 0.55 0.74 0.45 0.2 0.63 0.69 1.0 0.65 0.2 0.27 0.13
0.28 0.11 0.03 0.15 0.56 1.0 0.75 0.33 0.7 0.14 0.82 0.99 0.82 0.69 0.8 0.47 0.37 0.63 0.22 0.34 0.69 0.79 0.63 0.15 0.36 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.4 0.12 0.64 0.86 0.63 0.59 0.29 0.33 0.38 0.3 0.45 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.22
0.22 0.07 0.0 0.26 0.14 0.23 0.3 0.1 0.23 0.12 0.15 0.38 0.29 0.12 0.45 0.36 0.72 0.36 0.26 0.84 0.27 1.0 0.28 0.19 0.31 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 0.25 0.02 0.41 0.75 0.79 0.75 0.5 0.73 0.34 1.0 0.72 0.82 0.66 0.72 0.74 0.86 0.95 0.83 0.83 0.94 1.0 0.86 0.3 0.72 0.43
0.38 0.06 0.02 0.26 0.23 0.26 0.24 0.09 0.21 0.19 0.28 0.27 0.26 0.18 0.28 0.26 0.39 0.52 0.14 1.0 0.46 0.74 0.42 0.11 0.44 0.29
0.28 0.04 0.04 0.21 0.2 0.22 0.22 0.09 0.19 0.13 0.23 0.23 0.23 0.16 0.23 0.37 0.58 0.51 0.15 1.0 0.42 0.95 0.41 0.26 0.49 0.28
0.36 0.07 0.0 0.01 0.17 0.21 0.32 0.12 0.3 0.19 0.2 0.3 0.32 0.14 0.59 0.73 1.0 0.35 0.15 0.87 0.35 0.97 0.4 0.02 0.37 0.26
0.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.12 0.0 0.0 0.46 0.0 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.1 0.01 0.11 0.1 0.1 0.22 0.03 0.03 0.08 0.54 0.3 0.0 0.0 0.09 0.15 1.0 0.1 0.09 0.07 0.0
0.26 0.32 0.0 0.08 0.61 0.74 0.49 0.17 0.18 0.0 0.7 0.6 1.0 0.3 0.18 0.27 0.98 0.47 0.39 0.11 0.67 0.18 0.4 0.05 0.37 0.16
0.5 0.17 0.03 0.15 0.26 0.73 0.85 0.18 0.4 0.65 0.49 0.87 0.38 0.47 0.25 0.94 0.31 0.06 0.06 0.47 0.0 0.32 0.07 0.13 0.64 1.0
0.69 0.01 0.0 0.23 0.41 0.44 0.51 0.58 0.48 0.47 0.64 0.48 0.43 0.55 0.69 0.84 0.92 0.57 0.09 0.72 0.95 1.0 0.74 0.13 0.63 0.61
0.15 0.07 0.0 0.0 0.12 0.11 0.17 0.08 0.11 0.05 0.12 0.21 0.14 0.12 0.16 0.4 0.35 0.16 0.16 0.54 0.07 1.0 0.21 0.12 0.25 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.03 0.03 0.02 0.09 0.22 0.38 0.14 0.16 0.07 0.07 0.25 0.29 0.25 0.18 0.07 0.2 1.0 0.16 0.06 0.05 0.18 0.22 0.13 0.02 0.03 0.04
0.0 0.35 0.0 0.0 0.16 0.91 0.84 0.08 0.23 0.0 0.43 0.62 0.79 0.33 0.21 0.61 0.6 0.79 0.0 0.13 0.0 1.0 0.31 0.12 0.33 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.15 0.0 0.02 0.52 0.77 0.39 0.36 0.26 0.34 0.34 0.45 0.3 0.25 0.24 0.29 1.0 0.49 0.34 0.16 0.62 0.65 0.52 0.12 0.16 0.17
0.34 0.11 0.0 0.06 0.4 1.0 0.68 0.52 0.54 0.13 0.58 0.64 0.28 0.49 0.46 0.91 0.81 0.71 0.64 0.36 0.79 0.68 0.14 0.47 0.66 0.43
0.06 0.1 0.0 0.29 0.71 0.88 0.73 0.21 0.38 0.32 0.88 0.88 0.97 0.63 0.38 0.67 1.0 0.53 0.53 0.0 0.97 0.56 0.7 0.43 0.44 0.49
0.34 0.05 0.04 0.15 0.46 0.79 0.8 0.17 0.47 0.13 0.47 0.68 0.5 0.25 0.58 0.99 0.82 0.44 0.4 0.96 0.42 1.0 0.62 0.3 0.79 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.24 0.07 0.1 0.13 0.31 0.38 0.43 0.3 0.32 0.17 0.37 0.51 0.42 0.4 0.33 0.45 0.45 0.17 0.18 0.12 0.23 1.0 0.34 0.34 0.23 0.2
0.26 0.17 0.0 0.03 0.19 0.23 0.15 0.18 0.16 0.12 0.24 0.26 0.21 0.14 0.12 0.35 0.23 0.18 0.33 0.41 0.4 1.0 0.32 0.05 0.32 0.32
0.11 0.0 0.0 0.13 0.55 0.8 0.5 0.27 0.35 0.17 0.32 0.38 0.28 0.13 0.19 0.7 1.0 0.2 0.58 0.17 0.23 0.99 0.3 0.05 0.03 0.01
0.41 0.21 0.05 0.08 0.28 0.27 0.28 0.23 0.24 0.16 0.25 0.25 0.35 0.18 0.29 0.51 0.49 0.15 0.14 0.29 0.25 1.0 0.37 0.16 0.26 0.11
0.45 0.14 0.25 0.12 0.4 0.46 0.42 0.26 0.32 0.09 0.18 0.25 0.28 0.19 0.28 0.3 0.23 0.17 0.25 0.12 0.17 1.0 0.21 0.23 0.11 0.09
0.06 0.0 0.0 0.0 0.39 1.0 0.71 0.34 0.53 0.24 0.5 0.71 0.53 0.37 0.4 0.92 0.51 0.63 0.27 0.3 0.25 0.99 0.53 0.37 0.62 0.42
0.06 0.06 0.0 0.18 0.32 0.85 0.72 0.29 0.61 0.51 0.71 0.92 0.62 0.35 0.47 0.54 0.87 0.84 0.42 0.36 0.58 1.0 0.77 0.28 0.57 0.52
0.58 0.18 0.14 0.41 0.81 0.92 0.77 0.42 0.62 0.25 1.0 0.84 0.95 0.59 0.59 0.34 0.56 0.7 0.62 0.65 0.74 0.14 0.64 0.11 0.14 0.26
0.29 0.11 0.12 0.3 0.25 0.21 0.23 0.15 0.13 0.08 0.21 0.19 0.23 0.2 0.16 0.37 0.44 0.04 0.09 0.33 0.16 1.0 0.16 0.14 0.27 0.16
0.27 0.13 0.0 0.33 0.41 0.95 0.68 0.22 0.55 0.58 0.5 0.78 0.58 0.66 0.45 1.0 0.51 0.83 0.15 0.41 0.61 0.77 0.63 0.3 0.36 0.39
0.05 0.16 0.12 0.28 0.23 0.19 0.15 0.18 0.12 0.1 0.25 0.27 0.18 0.22 0.19 0.27 0.31 0.19 0.22 0.27 0.13 1.0 0.16 0.19 0.2 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.08 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.2 0.06 0.1 0.11 0.18 0.0 0.06 0.16 0.16 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.28 0.63 0.2 0.33 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.06 0.02 0.22 0.0 0.34 0.25 0.0 1.0 0.07 0.05 0.05 0.0
0.21 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 1.0 0.0 0.12 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.8 0.27 0.04 0.32 0.2 0.17 0.0 0.19 0.0 0.05 0.13 0.09 0.0 0.0 0.32 0.0 0.54 0.0 1.0 0.0 0.05 0.15 0.0
0.28 0.01 0.0 0.09 0.17 0.32 0.23 0.05 0.09 0.05 0.15 0.36 0.15 0.1 0.11 0.7 0.41 0.08 0.09 0.59 0.17 1.0 0.26 0.13 0.17 0.07
0.18 0.03 0.0 0.05 0.16 0.24 0.19 0.05 0.13 0.1 0.15 0.3 0.2 0.08 0.18 0.33 0.26 0.03 0.08 0.35 0.05 1.0 0.12 0.08 0.23 0.08
0.18 0.03 0.0 0.05 0.16 0.24 0.19 0.05 0.13 0.1 0.15 0.3 0.2 0.08 0.18 0.33 0.26 0.03 0.08 0.35 0.05 1.0 0.12 0.08 0.23 0.08
0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.03 0.03 0.16 0.03 0.0 0.26 0.03 0.28 0.16 0.3 0.0 0.0 1.0 0.75 0.85 0.35 0.79 0.0 0.35 0.0 0.0
0.04 0.02 0.0 0.02 0.12 0.2 0.12 0.02 0.09 0.06 0.09 0.19 0.1 0.05 0.11 0.32 0.25 0.03 0.02 0.21 0.05 1.0 0.12 0.06 0.13 0.05
0.22 0.25 0.0 0.0 0.29 0.39 0.4 0.09 0.2 0.17 0.35 0.51 0.32 0.12 0.31 0.54 0.36 0.06 0.12 0.35 0.18 1.0 0.3 0.07 0.31 0.12
0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.28 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.28 0.0 0.0 0.47 0.64 0.62 0.21 0.38 0.0 0.53 0.46 0.79 0.56 0.47 0.4 0.94 1.0 0.15 0.17 0.91 0.16 0.12 0.05 0.5 0.26
0.17 0.0 0.0 0.14 0.12 0.14 0.11 0.04 0.09 0.07 0.13 0.13 0.08 0.06 0.19 0.0 0.02 0.15 0.04 0.45 0.1 1.0 0.12 0.05 0.17 0.11
0.05 0.03 0.0 0.1 0.15 0.25 0.1 0.11 0.04 0.04 0.19 0.26 0.17 0.13 0.04 0.22 1.0 0.18 0.09 0.02 0.16 0.2 0.18 0.02 0.04 0.04
0.35 0.01 0.0 0.21 0.3 0.53 0.55 0.22 0.47 0.45 0.43 0.47 0.46 0.3 0.38 0.46 0.56 0.41 0.14 0.23 0.12 1.0 0.54 0.18 0.39 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)