Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000253.1_cds_GFH09684.1_4161 (GFH09684)	0.06	0.02	0.04	1.0	0.03	0.02	0.07	0.05	0.09	0.18	0.03	0.01	0.03	0.04	0.08	0.06	0.06	0.17	0.09	0.07	0.13	0.06	0.12	0.13	0.01	0.01
lcl\|BLLF01000270.1_cds_GFH09868.1_4345 (GFH09868)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.01	0.08	0.03	0.06	0.0	0.04	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.1	0.13	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000298.1_cds_GFH10237.1_4714 (GFH10237)	0.03	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05
lcl\|BLLF01000387.1_cds_GFH11252.1_5729 (GFH11252)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000419.1_cds_GFH11623.1_6100 (GFH11623)	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.18
lcl\|BLLF01000466.1_cds_GFH12076.1_6553 (GFH12076)	0.05	0.04	0.01	1.0	0.01	0.05	0.06	0.0	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02
lcl\|BLLF01000840.1_cds_GFH15352.1_9829 (GFH15352)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000898.1_cds_GFH15773.1_10250 (GFH15773)	0.02	0.04	0.12	1.0	0.09	0.09	0.07	0.12	0.09	0.04	0.09	0.1	0.07	0.1	0.1	0.05	0.05	0.06	0.04	0.08	0.07	0.06	0.03	0.06	0.11	0.16
lcl\|BLLF01000983.1_cds_GFH16351.1_10828 (GFH16351)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001095.1_cds_GFH17093.1_11570 (GFH17093)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001125.1_cds_GFH17295.1_11772 (GFH17295)	0.02	0.0	0.05	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.26	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02
lcl\|BLLF01001144.1_cds_GFH17415.1_11892 (GFH17415)	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06
lcl\|BLLF01001237.1_cds_GFH18023.1_12500 (GFH18023)	0.13	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
lcl\|BLLF01001339.1_cds_GFH18691.1_13168 (GFH18691)	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.04
lcl\|BLLF01001390.1_cds_GFH19000.1_13477 (GFH19000)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001460.1_cds_GFH19419.1_13896 (GFH19419)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001470.1_cds_GFH19482.1_13959 (GFH19482)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0
lcl\|BLLF01001474.1_cds_GFH19507.1_13984 (GFH19507)	0.0	0.09	0.0	1.0	0.08	0.04	0.08	0.09	0.08	0.09	0.02	0.06	0.02	0.05	0.08	0.04	0.16	0.0	0.05	0.03	0.0	0.05	0.0	0.06	0.11	0.11
lcl\|BLLF01001744.1_cds_GFH21018.1_15495 (GFH21018)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001942.1_cds_GFH21973.1_16450 (GFH21973)	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.22	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01
lcl\|BLLF01002253.1_cds_GFH23359.1_17836 (GFH23359)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.03	0.0	0.01	0.01	0.0	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.01
lcl\|BLLF01002261.1_cds_GFH23393.1_17870 (GFH23393)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002462.1_cds_GFH24168.1_18645 (GFH24168)	0.08	0.0	0.0	1.0	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.0	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.0	0.09	0.07	0.0	0.06	0.13	0.08	0.02	0.17	0.03	0.03
lcl\|BLLF01002538.1_cds_GFH24445.1_18922 (GFH24445)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002731.1_cds_GFH25142.1_19619 (GFH25142)	0.05	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.02	0.0	0.03	0.0	0.01	0.02	0.02	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002810.1_cds_GFH25422.1_19899 (GFH25422)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01002891.1_cds_GFH25690.1_20167 (GFH25690)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.01	0.11	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
lcl\|BLLF01003023.1_cds_GFH26109.1_20586 (GFH26109)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003097.1_cds_GFH26340.1_20817 (GFH26340)	0.05	0.0	0.0	1.0	0.11	0.09	0.11	0.1	0.13	0.1	0.1	0.08	0.09	0.06	0.13	0.07	0.04	0.07	0.03	0.12	0.1	0.11	0.07	0.1	0.04	0.04
lcl\|BLLF01003176.1_cds_GFH26597.1_21074 (GFH26597)	0.13	0.14	0.23	1.0	0.08	0.09	0.13	0.11	0.21	0.18	0.1	0.08	0.07	0.09	0.17	0.16	0.11	0.17	0.1	0.09	0.19	0.21	0.12	0.1	0.07	0.09
lcl\|BLLF01003518.1_cds_GFH27545.1_22022 (GFH27545)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003734.1_cds_GFH28085.1_22562 (GFH28085)	0.0	0.05	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02
lcl\|BLLF01004053.1_cds_GFH28821.1_23298 (GFH28821)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004344.1_cds_GFH29437.1_23914 (GFH29437)	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.06	0.0	0.0	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004422.1_cds_GFH29574.1_24051 (GFH29574)	0.03	0.0	0.0	1.0	0.08	0.04	0.04	0.08	0.09	0.07	0.04	0.09	0.05	0.05	0.08	0.0	0.01	0.01	0.18	0.17	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01
lcl\|BLLF01004600.1_cds_GFH29932.1_24409 (GFH29932)	0.01	0.11	0.16	1.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.0	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.21	0.0	0.05	0.03	0.02	0.06	0.0	0.05	0.12	0.04	0.06
lcl\|BLLF01004672.1_cds_GFH30042.1_24519 (GFH30042)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
lcl\|BLLF01004866.1_cds_GFH30378.1_24855 (GFH30378)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01005954.1_cds_GFH31799.1_26276 (GFH31799)	0.01	0.01	0.04	1.0	0.11	0.02	0.01	0.0	0.01	0.15	0.04	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.15
lcl\|BLLF01005974.1_cds_GFH31819.1_26296 (GFH31819)	0.0	0.0	0.14	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
lcl\|BLLF01006363.1_cds_GFH32184.1_26661 (GFH32184)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006548.1_cds_GFH32351.1_26828 (GFH32351)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03
lcl\|BLLF01006645.1_cds_GFH32440.1_26917 (GFH32440)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01007128.1_cds_GFH32783.1_27260 (GFH32783)	0.06	0.0	0.0	1.0	0.06	0.1	0.07	0.05	0.04	0.0	0.05	0.03	0.06	0.06	0.0	0.13	0.1	0.1	0.05	0.03	0.18	0.05	0.07	0.07	0.07	0.05
lcl\|BLLF01007273.1_cds_GFH32871.1_27348 (GFH32871)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)